I NUKLEOTYDY H C 4 5 6 C H HC 1 C H. pirymidyna



Podobne dokumenty
Nukleozydy, Nukleotydy i Kwasy Nukleinowe

Nukleotydy w układach biologicznych

Właściwości chemiczne nukleozydów pirymidynowych i purynowych

Związki heterocykliczne o znaczeniu biologicznym

Metody fosforylacji. Schemat 1. Powstawanie trifosforanu nukleozydu

Badanie składników kwasów nukleinowych

Cele kształcenia. Zapoznanie ze strukturą i funkcjami kwasów nukleinowych Zapoznanie z procesami leżącymi u podstaw biosyntezy białka

Spis treści. 1. Wiadomości wstępne Skład chemiczny i funkcje komórki Przedmowa do wydania czternastego... 13

CHARAKTERYSTYKI SPEKTRALNE UTLENIONEJ I ZREDUKOWANEJ FORMY CYTOCHROMU C

Biochemiczne i chemiczne metody syntezy nukleozydów

Reakcje zachodzące w komórkach

Widma UV charakterystyczne cechy ułatwiające określanie struktury pirydyny i pochodnych

Znaczenie nukleotydów:

Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl

DNA - niezwykła cząsteczka. Tuesday, 21 May 2013

Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW. Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki

WŁASNOŚCI SPEKTRALNE NUKLEOTYDÓW PIRYDYNOWYCH (NAD +, NADP + ) OZNACZANIE AKTYWNOŚCI TRANSAMINAZY ALANINOWEJ

11. Związki heterocykliczne w codziennym życiu

Kwasy Nukleinowe. Rys. 1 Struktura typowego dinukleotydu

Węglowodany (Cukry) Część 3. Związki wielofunkcyjne

Rys. 1. Podstawowy koncept nukleozydów acyklicznych. a-podstawienie nukleofilowe grupy nukleofugowej w czynniku alkilującycm

Nukleozydy o znaczeniu terapeutycznym

Rys. 1. C-nukleozydy występujące w trna

CORAZ BLIŻEJ ISTOTY ŻYCIA WERSJA A. imię i nazwisko :. klasa :.. ilość punktów :.

Wykład 12 Kwasy nukleinowe: budowa, synteza i ich rola w syntezie białek

Scenariusz lekcji przyrody/biologii (2 jednostki lekcyjne)

Czy żywność GMO jest bezpieczna?

Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW. Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki

Oddychanie komórkowe. Pozyskiwanie i przetwarzanie energii w komórkach roślinnych. Oddychanie zachodzi w mitochondriach Wykład 7.

Oznaczanie zasad purynowych i pirymidynowych z zastosowaniem spektrofotometrii UV/VIS oraz spektroskopii magnetycznego rezonansu jądrowego

Synteza TAG TAG. Glukoza. 3-fosforan dihydroksyacetonu. Glicerol. Glicerolo-3-fosforan + Acylo-CoA. CoA + Acylo-CoA. CoA.

Spis treści. Fotosynteza. 1 Fotosynteza 1.1 WĘGLOWODANY 2 Cykl Krebsa 2.1 Acetylokoenzym A

Spis treści. Od Autora 9. Wprowadzenie 11 CZĘŚĆ A. MOLEKULARNE MENU 13

Repetytorium z wybranych zagadnień z chemii

Witaminy rozpuszczalne w tłuszczach

20. STRUKTURĘ DNA. Chemiczne czynniki modyfikujące DNA. Iwona śak, Paweł Niemiec

Chemiczne składniki komórek

Bliskie spotkania z biologią. METABOLIZM część II. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW

Związki heterocykliczne w codziennym życiu

Wykład 1. Od atomów do komórek

Mechanizmy działania i regulacji enzymów

6. Z pięciowęglowego cukru prostego, zasady azotowej i reszty kwasu fosforowego, jest zbudowany A. nukleotyd. B. aminokwas. C. enzym. D. wielocukier.

Koenzymy oksydoreduktaz

Związki heterocykliczne o znaczeniu biologicznym oraz związki organiczne zawierające siarkę

wielkość, kształt, typy

SPIS TREŚCI OD AUTORÓW... 5

Podstawy mikrobiologii. Wirusy bezkomórkowe formy materii oŝywionej

Generator testów Biochemia wer / Strona: 1

Lek od pomysłu do wdrożenia

Metabolizm komórkowy i sposoby uzyskiwania energii

Biochemia zwierząt - A. Malinowska

Program zajęć z biochemii dla studentów kierunku weterynaria I roku studiów na Wydziale Lekarskim UJ CM w roku akademickim 2013/2014

Woda. Najpospolitsza czy najbardziej niezwykła substancja Świata?

prof. dr hab. Maciej Ugorski Efekty kształcenia 2 Posiada podstawowe wiadomości z zakresu enzymologii BC_1A_W04

etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy

Ćwiczenie VII. Reaktywne formy tlenu (RFT)

Spis treści 1. Struktura elektronowa związków organicznych 2. Budowa przestrzenna cząsteczek związków organicznych

Slajd 1. Związki aromatyczne

Cukry właściwości i funkcje

Dominika Stelmach Gr. 10B2

Wykład 14 Biosynteza białek

Biochemia SYLABUS A. Informacje ogólne

Zagadnienia do egzaminu z biochemii (studia niestacjonarne)

pobrano z

SEMINARIUM 8:

Elementy chemii obliczeniowej i bioinformatyki Zagadnienia na egzamin

Materiały dodatkowe węglowodany

Wykład 2. Kinetyka reakcji enzymatycznych.

Ćwiczenie nr 5 - Reaktywne formy tlenu

Na początek przyjrzymy się więc, jak komórka rośliny produkuje ATP, korzystając z energii światła w fazie jasnej fotosyntezy.

ZWIĄZKI FOSFOROORGANICZNE

Wykazanie obecności oksydoreduktaz w materiale biologicznym

Badanie oddziaływania polihistydynowych cyklopeptydów z jonami Cu 2+ i Zn 2+ w aspekcie projektowania mimetyków SOD

Biochemia Oddychanie wewnątrzkomórkowe

ATP. Slajd 1. Slajd rok Nagroda Nobla: P.D. Boyer (USA), J.E. Walker (GB) i J.C. Skou (D) Slajd 3. BIOENERGETYKA KOMÓRKI oddychanie i energia

Makrocząsteczki. Przykłady makrocząsteczek naturalnych: -Polisacharydy skrobia, celuloza -Białka -Kwasy nukleinowe

Profil metaboliczny róŝnych organów ciała

Plan działania opracowała Anna Gajos

B) podział (aldolowy) na 2 triozy. 2) izomeryzacja do fruktozo-6-p (aldoza w ketozę, dla umoŝliwienia kolejnych przemian)

Budowa atomu Poziom: rozszerzony Zadanie 1. (2 pkt.)

Biochemia: Ćw. Kwasy nukleinowe

Otrzymany w pkt. 8 osad, zawieszony w 2 ml wody destylowanej rozpipetować do 4 szklanych probówek po ok. 0.5 ml do każdej.

Kwasy nukleinowe. Replikacja

Metabolizm białek. Ogólny schemat metabolizmu bialek

TEORIA KOMÓRKI (dlaczego istnieją osobniki?)

(węglowodanów i tłuszczów) Podstawowym produktem (nośnikiem energii) - ATP

Spis treści. Budowa i nazewnictwo fenoli

Addycje Nukleofilowe do Grupy Karbonylowej

CF 3. Praca ma charakter eksperymentalny, powstałe produkty będą analizowane głównie metodami NMR (1D, 2D).

Antyoksydanty pokarmowe a korzyści zdrowotne. dr hab. Agata Wawrzyniak, prof. SGGW Katedra Żywienia Człowieka SGGW

Aminy. - Budowa i klasyfikacja amin - Nazewnictwo i izomeria amin - Otrzymywanie amin - Właściwości amin

Zadanie 5. (2 pkt) Schemat procesu biologicznego utleniania glukozy.

Oznaczanie RNA w materiale roślinnym

LNA i metody jego syntezy

Enzymy katalizatory biologiczne

Biologia Molekularna Podstawy

data ĆWICZENIE 7 DYSTRYBUCJA TKANKOWA AMIDOHYDROLAZ

Ćwiczenie 14. Maria Bełtowska-Brzezinska KINETYKA REAKCJI ENZYMATYCZNYCH

Laboratoria.net Innowacje Nauka Technologie

Plan dydaktyczny z chemii klasa: 2TRA 1 godzina tygodniowo- zakres podstawowy. Dział Zakres treści

Transkrypt:

18. ZASADY AZTWE I UKLETYDY Iwona śak Zasady azotowe naleŝą do dwóch grup związków heterocyklicznych, pirymidyn i puryn. irymidyna jest przedstawicielem diazyn, czyli sześcioczłonowych aromatycznych heterocykli, które zawierają dwa atomy azotu w pierścieniu, zajmujące pozycje 1 i 3. 3 2 C 4 5 6 C C 1 C pirymidyna W pirymidynie kaŝdy z czterech atomów węgla o hybrydyzacji sp 2 ma takŝe niezhybrydyzowany orbital p, prostopadły do płaszczyzny pierścienia z jednym elektronem π. KaŜdy atom węgla dostarcza ten elektron do sekstetu elektronów π, który odpowiedzialny jest za aromatyczność pierścienia pirymidynowego. odobnie, oba atomy azotu pirymidyny mają hybrydyzację sp 2 i kaŝdy z nich oddaje do sekstetu elektronów π po jednym elektronie na orbitalu p. Wolna para elektronowa zajmująca zhybrydyzowany orbital sp 2 w obu atomach azotu usytuowana jest w płaszczyźnie pierścienia. bie wolne pary elektronowe nie są zaangaŝowane w oddziaływania z orbitalami p, lecz odpowiedzialne za charakter zasadowy pierścienia pirymidynowego. WaŜnymi pochodnymi pirymidyny są zasady azotowe występujące w kwasach nukleinowych, mianowicie cytozyna, tymina i uracyl. Tautomeria keto-enolowa, wynikająca z przemieszczania się protonów, sprawia, Ŝe zasady pirymidynowe występują w róŝnych postaciach tautomerycznych, mianowicie w formie laktamu (postać ketonowa, =) lub laktymu (postać enolowa, -). W warunkach fizjologicznych dominującą ilościowo postacią tautomeryczną tyminy i uracylu jest laktam, natomiast cytozyny laktym. 307

Mutagenny efekt tautomerii zasad pirydynowych wynika z faktu, Ŝe laktym tyminy tworzy komplementarną parę z guaniną, a nie z adeniną. 2 laktam laktam laktam C 3 2 laktym laktym laktym C 3 cytozyna [Cyt] uracyl [Ura] tymina [Thy] Zmodyfikowane zasady pirymidynowe, np. metylowane, występują w kwasach nukleinowych zarówno u prokariota, jak i eukariota, w tym takŝe u człowieka (np. 5-metylocytozyna), niektóre obecne są tylko u wirusów np. 5-hydroksymetylocytozyna. 2 C 3 2 C 2 5-metylocytozyna 5-hydroksymetylocytozyna uryny zawierają pierścień pirymidynowy skondensowany z pierścieniem imidazolowym. W pięcioczłonowym heterocyklicznym pierścieniu imidazolowym z dwoma atomami azotu, jeden z nich (7) jest zasadowy ze względu na obecność wolnej pary elektronowej, która nie wchodzi do aromatycznego sekstetu elektronów π, ten atom azotu moŝe być uprotonowany. Drugi atom azotu pierścienia imidazolowego (9) nie jest zasadowy, poniewaŝ jego wolna para elektronowa wcho- C 6 1 5C 7 8 C 2 4 C 3 C 9 puryna 308

dzi w skład sekstetu elektronów π, podobnie jak atom azotu w pierścieniu pirolowym. W przyrodzie puryna nie występuje w wolnej postaci, lecz głównie w formie aminowych i ketonowych (lub hydroksylowych) pochodnych. Grupy aminowe przyłączone do aromatycznego pierścienia purynowego zachowują się podobnie jak grupy aminowe aminokwasów, mogą przechodzić w formę kationową po przyłączeniu jonu +. ajwaŝniejsze główne zasady purynowe to adenina i guanina, które są obecne we wszystkich kwasach nukleinowych. W niektórych moŝe występować równieŝ hipoksantyna, będąca jednocześnie metabolitem pośrednim przemian adeniny. 2 laktym 2 laktam laktam laktam laktym laktym 2 adenina [Ade] guanina [Gua] hipoksantyna [yp] W warunkach fizjologicznych głównymi formami tautomerycznymi guaniny i hipoksantyny są tautomery laktamowe, natomiast dominującą formą adeniny jest laktym. Laktamowa forma tautomeryczna adeniny tworzy parę z cytozyną, co mo- Ŝe leŝeć u podłoŝa mutagenezy. Ksantyna jest metabolitem pośrednim przemian guaniny oraz adeniny, powstaje z niej kwas moczowy, końcowy produkt katabolizmu puryn u człowieka. Jest on obecny w moczu człowieka i zwierząt mięsoŝernych. Kwas moczowy i ksantyna są bardzo trudno rozpuszczalne w wodzie, szczególnie w roztworach o niskich wartościach p, jakie panują w moczu, dlatego związki te mogą być składnikami kamieni moczowych. W środowisku alkalicznym kwas moczowy tworzy moczany, czyli sole kwasu moczowego. Moczany sodowe są rozpuszczalne w roztworach wodnych, równieŝ o odczynie obojętnym, a podwyŝszone ich stęŝenie w pewnych stanach patologicznych (dna moczanowa) prowadzi do odkładania ich w stawach i ścięgnach. 309

ksantyna W kwasach nukleinowych, zarówno pochodzenia eukariotycznego, jak i prokariotycznego, występują zmodyfikowane zasady purynowe, głównie metylowane. kwas moczowy 3 C 3 C 2-dimetyloguanina C 3 2 7 -metyloguanina 3 C C 3 6, 6 -dimetyloadenina Reakcje metylowania zasad azotowych u prokariota są jednym z waŝniejszych elementów systemu zabezpieczającego DA przed negatywnymi skutkami działania endogennych enzymów restrykcyjnych. Metylowane puryny są obecne u roślin, równieŝ poza kwasami nukleinowymi jako tzw. zasady roślinne (alkaloidy). aleŝą do nich między innymi kofeina, teofilina i teobromina. Kofeina, zwana teŝ teiną, obficie występuje w ziarnach kawy, teofilina w liściach herbaty, teobromina w owocach kakaowych. Wszystkie mają zastosowanie farmakologiczne. 3 C C 3 teofilina (1,3-dimetyloksantyna) 3 C C 3 C 3 kofeina (1,3,7-trimetyloksantyna) C 3 C 3 teobromina (3,7-dimetyloksantyna) eterocykliczne zasady azotowe, zarówno pirymidynowe, jak i purynowe, wykazują silną absorpcję promieniowania nadfioletowego, z maksimum pochłaniania przypadającym na około 260 nm. Fakt ten znalazł zastosowanie w analityce chemicznej. Właściwości absorpcyjne światła wynikają z obecności w zasadach azotowych wiązań podwójnych w pozycji sprzęŝonej oraz heteroatomów. Widma 310

absorpcyjne zasad azotowych są podobne, lecz puryny silniej pochłaniają światło od pirymidyn. W najwyŝszym stopniu pochłania światło adenina a w najniŝszym tymina i cytozyna. Widma absorpcyjne nukleozydów i nukleotydów są podobne, poniewaŝ na intensywność, a takŝe charakter pochłaniania światła nie mają wpływu reszty monocukrowe oraz grupy fosforanowe. Molowy współczynnik absorbancji (x10-3 ) 10 8 6 4 2 Cytozyna Uracyl irymidyny (p 7) Tymina Molowy współczynnik absorbancji (x10-3 ) 14 12 10 8 6 4 2 Guanina Adenina uryny (p 7) 230 260 300 λ nm 230 260 300 λ nm ukleozydy ukleozydy są -glikozydami, z wyjątkiem pseudourydyny, która jest C- -glikozydem. Składnikiem cukrowym jest albo β-d-rybofuranoza albo β-d-2-deoksyrybofuranoza. Atomy węgla w cząsteczkach monocukrów są oznaczane numerem z primem (np. 2 ' ), dla odróŝnienia pozycji atomu w obrębie reszty cukrowej od pozycji w zasadowym fragmencie cząsteczki. Wiązanie β--glikozydowe w nukleozydach pirymidynowych łączy anomeryczny atom węgla (C1) rybozy lub deoksyrybozy z pierwszym atomem azotu (1) zasady pirymidynowej. Zasada tworzenia nazw nukleozydów opiera się na rodzaju zasady azotowej, występującej w nukleozydzie. Mianowicie, nazwy nukleozydów pirymidynowych tworzy się, dodając do początkowego członu nazwy zasady, końcówkę -dyna, np. cyty-dyna, ury-dyna, tymi-dyna. Tymidyna zawiera deoksyrybozę i jest nukleozydem przede wszystkim charakterystycznym dla DA. W niektórych kwasach rybonukleinowych (tra) moŝe występować rybotymina, ale jest to nietypowy nukleozyd. 311

2 C 3 C 2 C 2 cytydyna (C) tymidyna (dt) 5 C 3 C 2 C 2 C 2 urydyna (U) pseudourydyna rybotymina Inny nietypowy nukleozyd to pseudourydyna (oznaczana grecką literą ψ [psi]), która róŝni się od urydyny pozycją wiązania glikozydowego. W pseudourydynie wiązanie β-c-glikozydowe łączy anomeryczny atom węgla (C1) rybozy z piątym atomem węgla (C5) uracylu. ukleozyd cytydyna, obecny w DA i RA, występuje w dwóch formach, tj. 1--β-D-2-deoksyrybofuranozylocytozyny (dc) i 1--β-D-rybofuranozylocytozyny (C). Wiązanie β--glikozydowe w nukleozydach purynowych łączy anomeryczny atom węgla (C1) rybozy lub deoksyrybozy z dziewiątym atomem azotu (9) zasady purynowej. azwy nukleozydów purynowych tworzy się, dodając do początkowego członu nazwy zasady, końcówkę -zyna, np. adeno-zyna, guano-zyna. ukleozyd hipoksantyny nazywa się inozyna. 312

2 C 2 C 2 guanozyna (G) inozyna (I) Wiązania β--glikozydowe w nukleozydach i nukleotydach mogą występować w dwóch konformacjach, syn i anty. W naturalnych nukleozydach dominuje konformacja anty, natomiast syn jest niekorzystna energetycznie. 2 2 C 2 C 2 syn anty Konformacje syn i anty adenozyny (A) ukleotydy ukleotydy są estrami fosforanowymi nukleozydów. azwy nukleotydów tworzy się od nazw nukleozydów, np. cytydynomonofosforan. owszechnie stosowane skróty trójliterowe nukleotydów, np. CM, pochodzą od nazw angielskich (np. cytidine monophosphate). W nazwie zazwyczaj zamieszcza się cyfrę wskazującą na pozycję związanej grupy fosforanowej. rtofosforan zastępuje przede wszystkim grupę - przy piątym atomie węgla (C5 ' ) rybozy lub deoksyrybozy. Tylko nukleozydo-5 ' -fosforany są wykorzystywane w organizmie do biosyntezy kwasów nukleinowych. rtofosforan moŝe zastępować równieŝ grupę - przy trzecim atomie węgla (C3 ' ) rybozy lub deoksyrybozy. aturalne nukleozydo-3 ' -fosforany są produktami rozpadu kwasów nukleinowych w organizmie. 313

2 - - C 2 2 C 2 - - adenozyno- 5'-monofosforan [AM] adenozyno- 3'-monofosforan ukleotyd tyminowy występuje w formie 2 ' -deoksytymidyno-5 ' -monofosforanu (dtm), poniewaŝ przede wszystkim jest składnikiem DA, wyjątkowo natomiast w formie fosforybotyminy (TM) w cząsteczce tra. Fosforybotymina powstaje dopiero posttranskrypcyjnie w wyniku reakcji metylacji urydynomonofosforanu. C 3 - - - - C 2 C 2 2'-deoksytymidyno-5'-monofosforan [dtm] urydyno-5'-monofosforan [UM] ukleotyd uracylowy występuje wyłącznie w formie rybourydyno-5 ' -monofosforanu. ukleotydy adeninowe, guaninowe i cytozynowe istnieją zarówno w formie rybonukleotydów, jak i deoksyrybonukleotydów. 314

2 - - C 2 2 - - C 2 guanidyno-5'-monofosforan [GM] cytydyno-5'-monofosforan [CM] Rzadkim nukleotydem jest inozyno-5 ' -monofosforan (IM), będący nie tylko składnikiem kwasów rybonukleinowych, lecz takŝe koenzymem. - - C 2 inozyno-5'-monofosforan [IM] Grupy fosforanowe nukleotydów mają charakter kwasowy i w fizjologicznym p około 7 występują w postaci dianionów. Wiązanie estrowe w nukleotydach moŝe ulegać hydrolizie z uwolnieniem nukleozydu i nieorganicznego fosforanu 4 2-, który oznacza się skrótem i. Inne waŝne biologicznie nukleotydy Adenozyna moŝe występować w kilku róŝnych formach fosforanowych, poza adenozyno-5 ' -monofosforanem, istnieje równieŝ jako adenozyno-5 ' -difosforan (AD) i adenozyno-5 ' -trifosforan (AT). W związkach tych zarówno β-ortofosforan, jak i γ-ortofosforan przyłączone są słabym wiązaniem bezwodnikowym, zwanym wiązaniem makroergicznym, które oznaczane jest linią falistą ~. 315

2 adenina - γ - β - α - C 2 ryboza adenozyno-5'-monofosforan [AM] adenozyno-5'-difosforan [AD] adenozyno-5'-trifosforan [AT] Wiązanie bezwodnikowe jest bogate w energię, poniewaŝ jego hydrolityczne rozszczepienie wyzwala znacznie większą ilość energii (około 30 kj/mol) niŝ zwykłe wiązanie fosfoestrowe (śr. 12 kj/mol). Rozszczepienie wiązania bezwodnikowego przy atomie fosforu γ w AT uwalnia fosforan nieorganiczny i adenozynodifosforan. W organizmie AT i AD przekształcają się w siebie wzajemnie i stanowią waŝny układ w reakcjach fosforylacji katalizowanych enzymatyczne. Adenozynodifosforan moŝe być dalej hydrolizowany do adenozynomonofosforanu i nieorganicznego fosforanu z uwolnieniem energii. AT AD + i AD AM + i AD w reakcjach fosforylacji substratowej lub oksydacyjnej jest przekształcany w AT. Rozszczepienie wiązania bezwodnikowego przy atomie fosforu β w AT uwalnia adenozynomonofosforan i difosforan, a spadek entalpii swobodnej hydrolizy jest rzędu -34,5 kj/mol. AT AM + ~ ~ 2 i Difosforan jest równieŝ związkiem makroergicznym, jego hydrolizie do dwóch nieorganicznych fosforanów towarzyszy spadek entalpii swobodnej reakcji rzędu -33,4 kj/mol. W Ŝywej komórce silnie egzoergiczna hydroliza związków makroergicznych jest utrudniona, zazwyczaj grupa związana makroergicznie zostaje przeniesiona na cząsteczkę akceptora, np. glukozę, dlatego lepiej mówić o potencjale przenoszenia 316

grup. Adenozynotrifosforan charakteryzuje się wysokim potencjałem przenoszenia grup fosforanowych i jest zasadniczym przenośnikiem energii w wielu przemianach chemicznych, dzięki temu umoŝliwia przebieg reakcji endoergicznych w organizmie. ozostałe nukleozydy równieŝ występują w formie di- i trifosforanów, poniewaŝ tylko trifosforany nukleozydów mogą być bezpośrednimi aktywnymi substratami, albo mogą uaktywniać inne substraty w reakcjach przekształcających je w niezwykle reaktywne połączenia chemiczne, które są zdolne do bezpośredniego uczestnictwa w procesach biosyntezy biopolimerów, takich jak kwasy nukleinowe, białka, polisacharydy i inne. Trifosforany nukleozydów uczestniczą równieŝ w reakcjach przekształcających jedne związki w inne. gólnie, uczestniczą w reakcjach, w których tworzone są wiązania kowalencyjne. Adenozyna występuje równieŝ w formie adenozyno-3 ' -5 ' -monofosforanu (cam), czyli cyklicznego nukleotydu, podobnie jak guanozyno-3 ' -5 ' -monofosforan (cgm). Cykliczne nukleotydy (fosfodiestry) działają wewnątrz komórki jako regulatory niektórych procesów biochemicznych. Cykliczny AM jest wewnątrzkomórkowym wtórnym przekaźnikiem działania wielu hormonów poprzez receptory w błonie komórkowej. ormon obecny w przestrzeni pozakomórkowej (np. adrenalina), oddziaływując ze specyficznym receptorem błonowym stymuluje w komórce syntezę cam, dzięki aktywacji błonowej cyklazy adenylanowej. cam aktywuje wielofunkcyjną kinazę białkową A, co powoduje zmiany w metabolizmie komórki. 2 2 - C 2 - C 2 cykliczny 3'-5'-AM cykliczny 3'-5'-G M Cykliczny GM jest pobudzającym informatorem w procesie widzenia. Cząsteczka ta tworzona jest przez cyklazę guanylanową, a rozkładana przez specyficzną fosfodiesterazę. W komórkach pręcikowych siatkówki znajdują się błonowe kanały specyficzne wobec kationów, które są bramkowane przez cgm. Związanie przynajmniej trzech cząsteczek cgm otwiera pojedynczy kanał, co ma miejsce wówczas, gdy wzrasta stęŝenie cgm w cytoplazmie (w ciemności). Zmniejszenie poziomu cgm bezpośrednio zamyka kanały specyficzne wobec kationów w błonie komórkowej, co ma miejsce na świetle, dzięki działaniu specyficznej fosfodie- 317

sterazy. Istnieją równieŝ podobne kanały bramkowane przez cam, odgrywające kluczową rolę w powstawaniu wraŝeń węchowych. ukleotydy współtworzą strukturę waŝnych koenzymów, mianowicie: koenzymu A (CoA-S), dinukleotydów nikotynamidoadeninowych (AD lub AD) oraz dinukleotydów flawinoadeninowych (FAD). Koenzym A odgrywa podstawową rolę w aktywowaniu grup acylowych w komórkach. Jest on tiolem, którego cząsteczka składa się z difosforanu adenozyny (AD) i pantoteiny, zawierającej kwas pantotenowy i cysteaminę (czyli 2-aminoetanotiol). Grupa tiolowa cysteaminy jest odpowiedzialna za najwaŝniejsze funkcje koenzymu A, poniewaŝ dzięki obecności tej grupy funkcjonalnej koenzym moŝe być przekształcany w tioester, aktywny czynnik transferu acylowego w komórce. 2 S C 2 C 2 C C 2 C 2 C C C 3 C C 2 C 3 - - C 2 cys team ina β alanina kwas pantoinowy kwas pantotenowy - - pantoteina Kluczową pozycję w metabolizmie zajmuje acetylo~s-coa, który reaguje z wieloma nukleofilami, przekazując im grupę acetylową, dlatego teŝ jest najwaŝniejszy wśród tioestrów koenzymu A. W metabolizmie tłuszczów waŝne są teŝ inne jego tioestry tj.: malonylo~s-coa, acetoacetylo~s-coa, bursztynylo~s-coa, palmitoilo~s-coa i inne. Grupy -SR tioestrów w nukleofilowej substytucji są zdecydowanie lepszymi grupami odchodzącymi niŝ grupy estrów -R, dlatego tioestry są znacznie lepszymi czynnikami transferu acylowego niŝ typowe estry. Dinukleotydy nikotynamidoadeninowe i flawinoadeninowe uczestniczą w wielu biologicznych procesach oksydacyjno-redukcyjnych. Dinukleotyd nikotynamidoadeninowy (AD) i jego ester fosforanowy (AD) są koenzymami, uczestniczącymi w reakcjach odwodorowywania (utleniania) alkoholi do aldehydów lub ketonów, w wyniku których pierścień pirydynowy nukleotydu nikotynamidowego ulega redukcji do dihydropirydyny, przekształcając te dinukleotydy w formy zredukowane, mianowicie AD + + lub AD + +. W komórce cykl Krebsa jest głównym dostarczycielem zredukowanych form koenzymu AD + +, będących bezpośrednimi dostarczycielami protonów i elektronów do łańcucha oddechowego. Łańcuch oddechowy stanowi zasadnicze 318

miejsce regeneracji utlenionych form tego koenzymu (AD), tym samym dostarcza je enzymom cyklu Krebsa. amid kwasu nikotynowego C 2 2 C 2 - - C 2 AD (forma utleniona) C 2 2 C 2 - - C 2 AD + + (forma zredukowana) C 2 2 C 2 - - C 2 AD (forma utleniona) C 2 2 C 2 - - C 2 A D + + (fo rm a zred uko w an a) 319

Strukturalnie AD róŝni się od AD jedynie obecnością ortofosforanu przy drugim atomie węgla (C2 ' ) rybozy nukleotydu adeninowego. Formy zredukowane tych koenzymów uczestniczą w reakcjach redukcji związków karbonylowych do alkoholi. Zredukowane formy koenzymu AD + + uczestniczą m.in. w procesie syntezy kwasów tłuszczowych w cytoplazmie komórki. Głównym dostarczycielem tych zredukowanych dinukleotydów w komórce jest cykl fosfopentozowy. Wszystkie koenzymy nikotynamidoadeninowe w swej strukturze zawierają witaminę, mianowicie niacynę, czyli kwas nikotynowy, dlatego witamina ta potrzebna jest do ich syntezy. Brak witaminy wywołuje chorobę zwaną pelagrą. Formy zredukowane dinukleotydów nikotynamidoadeninowych wykazują dodatkowe maksimum absorpcji przy 340 nm, poza absorpcją światła przy 260 nm, która jest charakterystyczna dla obu form, zredukowanej i utlenionej. Fakt ten wykorzystuje się do śledzenia procesu redukcji dinukleotydów nikotynamidoadeninowych metodami optycznymi. ukleotydy flawinowe biorą udział w wielu biologicznych reakcjach utlenienia i redukcji. W ich strukturze występuje witamina B 2, czyli ryboflawina (nukleozyd), związek o barwie Ŝółtej. Fosforyboflawina (FM) jest mononukleotydem, składającym się z zasady azotowej zwanej izoalloksazyną (policykliczny heterocykl) i z rybitolu, zestryfikowanego ortofosforanem. FM jest grupą prostetyczną niektórych oksydoreduktaz, uczestniczących w reakcjach utlenienia biologicznego. Formy zredukowane nukleotydów flawinowych zawierają dwa protony i dwa elektrony, które przyłączone są do dwóch atomów azotu (1 i 10) heterocyklicznych pierścieni izoalloksazyny. W wyniku redukcji stają się bezbarwne. Fakt zmiany barwy Ŝółtej na bezbarwną moŝe być wykorzystany do śledzenia redukcji flawin metodami optycznymi, szczególnie przy długości fali 450 nm, przy której zanika absorpcja światła przez zredukowane flawiny. izoalloksazyna 3 C 3 C rybitol C 2 C C C C 2 - - ortofosforan FM (forma utleniona) 320

3 C 3 C C 2 C C C C 2 C 2 - - 2 F A D (form a utleniona) 3 C 3 C C 2 C C C C 2 - - C 2 2 F A D 2 (form a zredukow ana) Dinukleotyd flawinoadeninowy (FAD), poza fosforyboflawiną (FM) składa się z nukleotydu adeninowego. odobnie jak dinukleotyd nikotynamidoadeninowy przenosi protony i elektrony, dlatego występuje w dwóch formach utlenionej (FAD) i zredukowanej (FAD 2 ). Koenzym flawinowy moŝe uczestniczyć w reakcjach utleniania bezpośredniego substratu, np. bursztynianu do fumaranu, redukując się do FAD 2. Zredukowany FAD 2 jest dostarczycielem protonów i elektronów na bezpośrednie akceptory, takie jak cytochromy. MoŜe teŝ dostarczać je na tlen cząsteczkowy, np. w reakcji katalizowanej przez oksydazę ksantynową, której produktem jest nadtlenek wodoru, poza kwasem moczowym. Koenzymy flawinowe (zarówno FM lub FAD) mogą teŝ pośredniczyć w przenoszeniu protonów i elektronów z koenzymów nikotynamidoadeninowych na akceptory. Koenzymy flawinowe tworzą stosunkowo silne połączenia nukleotydoproteinowe z apoenzymem, dlatego są raczej grupami prostetycznymi, a nie typowymi koenzymami zdolnymi do oddysocjowywania od apoenzymu. Adenozyno-3 ' -fosfo-5 ' -fosfosiarczan (AS) jest aktywnym donorem grup siarczanowych w reakcjach siarczanowania (sulfonowania) róŝnych akceptorów, 321

w tym endogennych np. heteroglikanów, lub egzogennych np. związków toksycznych lub hydrofobowych, w procesach detoksykacji wewnątrzkomórkowej. 2 - S - C 2 - - adenozyno- 3'-fosfo- 5'- fosfosiarczan Adenozylometionina jest nukleozydową formą aktywnego metylu wykorzystywaną w rekcjach metylacji róŝnorodnych substratów do waŝnych biologicznie produktów, np. choliny, adrenaliny, kreatyny i in. 2 C - C + 3 2 C + 2 C S 3 C C 2 Syntetyczne analogi nukleozydów Syntetycznymi analogami są pochodne pirymidyn, puryn i ich nykleozydy, w których została zmieniona struktura heterocyklicznego pierścienia lub cząsteczki cukru w celu uzyskania zmiany działania biologicznego związku na inne, które moŝe być wykorzystane terapeutycznie w medycynie doświadczalnej i klinicznej. Zasadniczo, biologiczne działanie analogów nukleozydów w komórce moŝna sprowadzić do 1) hamowania enzymów wykorzystujących ich fizjologiczne odpowiedniki jako substraty oraz 2) konsekwencji wbudowywania analogów nukleozydów w DA lub RA, wynikających z nieprawidłowego parowania zasad oraz wstrzymania replikacji lub transkrypcji. rzykładem hamowania enzymów przez analogi zasad azotowych, np. allopurynol (4-hydroksypirazolopirymidyna), jest oksydaza ksantynowa i enzymy szla- 322

ku biosyntezy de novo puryn w organizmie. Fakt ten leŝy u podstaw terapeutycznego zastosowania allopurynolu w leczeniu hiperurykemii (wzrost we krwi stęŝenia kwasu moczowego) i dny moczanowej. W ostatnich latach syntetyczne analogi nukleozydów wprowadza się do leczenia zakaźnych chorób wirusowych, w tym AIDS, które osiągnęło rozmiary światowej epidemii. Syntetycznym analogiem naturalnego nukleozydu 2 ' -deoksyguanozyny jest 9-(2-hydroksyetoksymetylo)guanina, określana skrótem ACV i znana pod nazwą acyklowir. Strukturalnie róŝni się od naturalnego odpowiednika tylko brakiem fragmentu cząsteczki monocukru, obejmującego dwa atomy węgli (C2 ' i C3 ' ) rybozy. 2 9-(2-hydroksyetoksymetylo)guanina (ACV) d lat osiemdziesiątych ACV jest skutecznie stosowany klinicznie jako lek przeciw wirusowi opryszczki (erpes simplex), szczególnie narządów płciowych. aleŝy on do wirusów typu DA, dlatego jego powielanie w komórkach organizmu poddanego terapii ACV zatrzymuje się w momencie wbudowania leku do łańcucha DA wirusa. ACV staje się elementem kończącym łańcuch polinukleotydowy replikującego DA faga, ze względu na brak w ACV grupy 3 ' -hydroksylowej, dlatego niemoŝliwe jest przyłączenie następnego nukleotydu. C 3 C 2 3 3'-azydo-2'-deoksytymidyna AZT 323

a tym samym mechanizmie opiera się działanie innego analoga nukleozydu 3 ' -azydo-2 ' -deoksytymidyny (AZT), zwanego równieŝ zidowudyną, który najdłuŝej stosowany jest w terapii osób zakaŝonych IV. Wirus ten naleŝy do typu RA ze stadium profaga typu DA, dlatego w jego cyklu Ŝyciowym ma miejsce odwrotna transkrypcja katalizowana przez odwrotną transkryptazę. odczas terapii zidowudyną, po wbudowaniu przez odwrotną transkryptazę AZT zamiast naturalnego fosforanu 2 ' -deoksytymidyny do de novo syntetyzowanego DA, jego synteza zostaje zatrzymana, poniewaŝ analog ten ma grupę azydową zamiast grupy - w pozycji 3 ' deoksyrybozy i niemoŝliwe jest przyłączenie następnego nukleotydu. Ujemne działanie zidowudyny w organizmie polega na jego wysokiej toksyczności wobec szpiku kostnego. iekorzystną stroną stosowanych syntetycznych analogów nukleozydów w terapii antywirusowej jest szybkie nabywanie oporności na te leki przez wirusy. DuŜe nadzieje budzi chemioterapia złoŝona, polegająca przykładowo na zastosowaniu kombinacji analogów nukleozydów z syntetycznymi inhibitorami proteaz (mimetykami peptydów). Mutagenny efekt analogów zasad azotowych został przedstawiony w rozdziale 20. 324