BOŻENA WIECZOREK1, JADWIGA GNIOT-SZULŻYCKA I. Wstęp. Contents: Spis treści:
|
|
- Karol Nowak
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Niedobór cholesterolu sygnałem dla transdukcji informacji z endoplazmatycznego retikulum do jądra komórkowego procesy proteolitycznego odszczepienia czynników transkrypcyjnych z błon ER Depletion of cholesterol in signal transduction from endoplasmic reticulum to the cell nucleus the proteolytic cleavage of transcription factors from the ER membranes BOŻENA WIECZOREK1, JADWIGA GNIOT-SZULŻYCKA2 Spis treści: Contents: I. W stęp II. Sterolowe elem enty regulatorowe SRE i białka SREBP III. Budowa białek SREBP IV. M echanizm dw uetapowego procesu proteolizy białka SREBP IV -1.SC A P białko aktyw ujące proteolityczne rozszczepienie SREBP z udziałem proteaz S1P i S2P IV-2. Proces proteolizy białka SR EBP błon ER i uwolnienie czynnika transkrypcyjnego SREBP-68 I. Introduction II. SRE-steroł regulatory elem ents and SREBP-steroł regulatory elem ent binding proteins III. Structure of the SREBP proteins IV. M echanism of the proteolytic cleavage and release of SREBP IV-1. SCAP, the SREBP cleavage activating protein IV-2. The proteolytic cleavage process and release of the transcription factor SREBP-68 Wykaz stosowanych skrótów: ACAT acylotransferaza acylo-coa:cholesterol; AG aparat Golgiego; bhlh-zip motyw suwaka leucynowego (ang. b a sic-h elix-lo o p -h elix-leu cine-zipper)\ HDL lipoproteiny o dużej gęstości; LDL lipoproteiny o małej gęstości; SCAP białko aktywujące proteolityczne rozszczepienie SREBP (ang. SREBP c leava g e a ctiva tin g protein)', SIP proteaza miejsca 1 (ang. site- \ p ro tea se); S2P proteaza miejsca 2 (ang. site -2 p ro tea se)\ SRE sterolowy element regulatorowy (ang. sterol reg ula to ry elem en t); SREBP białka błon o m.cz. 125 kda podlegające proteolizie z uwolnieniem SREBP-68; SREBP-68 białka wiążące się ze sterolowym elementem regulatorowym (ang. stero l regulatory elem ent binding protein)', VLDL lipoproteiny o bardzo małej gęstości. 'Mgr, 2prof. dr hab., Zakład Biochemii, Instytut Biologii (Ogólnej i Molekularnej), Wydział Biologii i Nauk o Ziemi, Uniwersytet Mikołaja Kopernika, ul. Gagarina 7/9, Toruń; jgsz@ biol.uni.torun.pl I. Wstęp Cholesterol jest związkiem nieodzownym dla prawidłowego przebiegu wielu procesów metabolicznych zachodzących w komórkach i tkankach organizmów wyższych. Jako składnik błon biologicznych uczestniczy w regulacji ich struktury i funkcji. Cholesterol jest także wyjściowym substratem do biosyntezy wszystkich hormonów steroidowych, witaminy D3, kwasów żółciowych i oksysteroli [1-8]. W komórkach eukariotycznych cholesterol pochodzi z wewnątrzkomórkowej syntezy de novo oraz cholesterolu dostarczanego z zewnątrz. Rozprowadzanie cholesterolu zachodzi z udziałem jego szybko wymienialnej puli, którą stanowią lipoproteiny osocza (VLDL, LDL, HDL), a wychwytywany jest przez tkanki głównie poprzez receptorozależną endocytozę. U ssaków głównym miejscem biosyntezy chole POSTĘPY BIOCHEMII 48(3), 2002
2 sterolu są wątroba, jelito cienkie, mięśnie szkieletowe i skóra [1, 5, 8-10]. Synteza de novo w komórce zachodząca w błonach retikulum endoplazmatycznego (ER) podlega precyzyjnej regulacji na poziomie transkrypcji, translacji i bezpośredniej regulacji aktywności kluczowych enzymów szlaku biosyntezy cholesterolu. Nieprawidłowości metaboliczne wynikające z nadmiernej podaży cholesterolu ukierunkowały badania ostatnich trzydziestu lat głównie na poznanie mechanizmów ograniczających biosyntezę i zaangażowanych w utrzymaniu jego prawidłowego stężenia [ 1, 11-21], Modulacja aktywności kluczowych enzymów szlaku biosyntezy cholesterolu jest procesem stosunkowo dobrze poznanym i polega na modyfikacji kowalencyjnej przez fosforylację i defosforylację, zmianie konformacji niektórych enzymów przez cholesterol i metabolity pośrednie oraz inhibitory kompetycyjne. Stwierdzono ponadto, iż enzymy szlaku biosyntezy cholesterolu pozostają pod kontrolą statusu oksydacyjno-redukcyjnego komórki i aktywności enzymów proteolitycznych [ 1, 11-15]. Konstytutywna regulacja procesów transkrypcji enzymów biosyntezy cholesterolu, przemian mewa- lonianu i metabolizmu kwasów tłuszczowych polega na oddziaływaniu szeregu sygnałowych związków z czynnikami transkrypcyjnymi uczestniczącymi w regulacji odczytu promotorów z ramką E (CANNTG- 3').Takimi związkami sygnałowymi są np. cholesterol, oksysterole, malonylo-coa, kwasy tłuszczowe i kwasy żółciowe [16-19]. Transkrypcyjna regulacja syntezy enzymów szlaku biosyntezy przemian me- walonianu przez końcowy produkt cholesterol, była przedmiotem szczególnie intensywnych badań. Wymogiem strukturalnym, koniecznym dla wywarcia hamującego efektu przez cholesterol jest obecność niezestryfikowanej grupy hydroksylowej w pozycji 3 pierścienia steroidowego, a obecność grupy ketonowej lub hydroksylowej w pozycji 6, 7 lub 25 znacznie zwiększa efekt inhibitorowy. Wykazano również, że naturalne oksysterole, występujące w śladowych ilościach są skuteczniejszymi od cholesterolu inhibitorami transkrypcji [10, 17, 20, 21]. Oprócz mechanizmów regulujących homeostazę cholesterolu przy prawidłowej i nadmiernej jego podaży, istnieją również mechanizmy odbioru sygnału o jego niedoborze i konieczności uaktywnienia procesów biosyntezy. Mechanizmy te polegają na aktywacji genów z promotorami ze sterolowym elementem regulatorowym (SRE). Przedmiotem niniejszego artykułu będzie omówienie poznanych w ostatnich latach mechanizmów proteolitycznego odszczepienia czynników tran- skrypcyjnych z integralnych białek SREBP. Białka te zlokalizowane są głównie w błonach ER. II. Sterolowe elementy regulatorowe SRE i białka SREBP Za zależną od obniżonego poziomu steroli regulację transkrypcji odpowiedzialne są regiony promotorów ekspresji genów dla enzymów szlaku biosyntezy cholesterolu, receptora LDL i lipogenezy. Zawierają one jedną lub wiele kopii jednego z wariantów 10-nukleotydowej sekwencji: 3 -CATGAGATCA- C C C C A C TGCAA-5. Regiony te określane są mianem sterolowy element regulatorowy (SRE). Ich aktywacja jest niezbędna dla inicjacji transkrypcji w komórkach sygnalizujących zapotrzebowanie na cholesterol (Tabela 1) [17, 21, 22]. Aktywacja SRE nie zachodzi w warunkach konstytutywnej (podstawowej) ekspresji, gdy komórka nie sygnalizuje zapotrzebowania na cholesterol. Obniżenie się stężenia cholesterolu w komórce inicjuje proteolityczne procesy prowadzące do uwolnienia z integralnych białek błonowych, SREBP, retikulum endoplazmatycznego, rozpuszczalnych fragmentów SERBP-68. Uwolnione białka SRE- BP-68 transportowane są do jądra komórkowego, gdzie uczestniczą w aktywacji genów z promotorami SRE. Białka SREBP zostały wykryte w 1993 roku [25, 26] przez dwie odrębne grupy badaczy: H u a, Yokoyama, Wu, Briggs, Brown, Goldstein i Wang z University of Texas (Dallas), zajmujących się metabolizmem cholesterolu oraz T o n - tonoz, Kim, Graves i Spiegelman z Harvard Medical School (Boston), prowadzących badania nad metabolizmem cholesterolu i jego wpływem na procesy różnicowania [16-18, 21-23, 27, 28]. Białka SREBP są składnikiem błony retikulum endoplazmatycznego (ER). Ich obecność stwierdzono również w błonie jądrowej i błonach Aparatu Gol- giego (AG). Aktualnie znane są trzy izoformy białka SREBP: SREBP-la, SREBP-lc i SREBP-2. Białka te kodowane są przez dwa geny. Gen SREBP-1 z dwoma promotorami koduje białka SREBP-la i lc, różniące się tylko długościąn- końcowej domeny, SREBP-la zawiera dodatkowo w tej domenie 29 kwaśnych aminokwasów. Gen SREBP-2 koduje pojedyncze białko (Ryc. 1) [17,18, 28-30]. Nadekspresja SREBP-la wywołuje intensywną biosyntezę cholesterolu i kwasów tłuszczowych, na- POSTĘPY BIOCHEMII 48(3),
3 dekspresja SREBP-lc umiarkowany wzrost biosyntezy cholesterolu i kwasów tłuszczowych. Według najnowszych badań SREBP-lc, najprawdopodobniej reguluje głównie syntezę kwasów tłuszczowych i w mniejszym stopniu cholesterolu. SREBP-lc uczestniczy również w regulacji metabolizmu węglowodanów. Białko SREBP-2 wpływa głównie na biosyntezę cholesterolu i w pewnym stopniu również na biosyntezę kwasów tłuszczowych. Ekspresja białek SREBP jest kontrolowana na wielu poziomach i zachodzi w odpowiedzi na zmiany stężenia cholesterolu, oksysteroli, wielonienasyconych kwasów tłuszczowych, glukagonu, camp oraz stosunku insulina/glukoza (Tabela 2) [17, 28, 31]. mrna pozostaje w korelacji z ilością odpowiednich białek SREBP [28], III. Budowa białek SREBP SREBP to trójdomenowe białka (~ 1150 aminokwasów) o masie 125 kda, o orientacji szpilki do włosów, związane z błonami ER (Ryc. 2); ich N-terminalne domeny (~ 480 aminokwasów) i C-terminalne domeny (~ 590 aminokwasów) znajdują się w cytosolu. Białka SREBP zakotwiczone są w błonie domeną centralną (~ 80 aminokwasów). Ta unikalna domena odróżniająca SREBP od innych białek błonowych, zawiera dwa hydrofobowe 2 2 -amino- Tabela 1 Nukleotydowe sekwencje dla sterolowych elementów regulatorowych SRE [na podstawie 17] Geny odpowiedzialne za syntezę Sekwencja SRE O Receptora LDL U ATCACCCCAC t/5 Syntazy HMG-CoA CTCACCCCAC O -C o GCCACCCTAC o N O Reduktazy HMG-CoA ACCGCACCAT a CTCTCACCAC ts) Syntazy farnezylo-pp CTCACACGAG CJ 'c Syntazy skwalenu ATCACGCCAG.a CGATGCTGAG o Qh SREBP-2 ATCACCCCAC Karboksylazy acetylo-coa Syntazy kwasów tłuszczowych Desaturazy 1 stearylo-coa Desaturazy 2 stearylo-coa Acylotransferazy glicerylo-3-fosforanu GGAGGACCAT CTCACGTCGC ATCACCCCAC AGCAGATTGC AGCAGATTGT CTCAGCCTAG Inne Liaza ATP-cytrynian TCAGGCTAG Stężenie poszczególnych form SREBP jest odmienne w różnych tkankach. Dla przykładu w wątrobie i adopocytach ilość mrna dla SREBP-1 c przewyższa odpowiednio 9- i 3-krotnie zawartość mrna dla SREBP-la. Natomiast śledziona zawiera 10-krotnie więcej SREBP-la, aniżeli lc. W większości tkanek przeważa ekspresja białka SREBP-la. Zawartość kwasowe segmenty transmembranowe połączone krótką 31 -aminokwasową pętlą zwróconą do światła błon ER. N-końcowe partie białek SREBP zawierają sekwencje bogate w aminokwasy kwaśne. Sekwencje te są stosunkowo długie w SREBP-1a (42 aminokwasy) i SREBP-2 (48 aminokwasów), natomiast w SREBP-lc ten odcinek jest krótszy i zawiera 24 ami POSTĘPY BIOCHEMII 48(3), 2002
4 Ryc. 1. Domeny i homologia struktury białek SREBP-la I SREBP-2 wg [18]). nokwasy. Po odcinkach bogatych w aminokwasy kwaśne występują sekwencje bogate w prolinę, sery- nę, glicynę i glutaminę, z następującą po nich klasyczną sekwencją bhlh-zip. Kolejne odcinki białek SREBP to dwa hydrofobowe segmenty transbłonowe przedzielone krótką sekwencją łącznikową oraz regulatorowa domena C-końca (Ryc. 1). Stopień ho- mologii między SREBP-la i SREBP-2 jest następujący, procent identyczności dla sekwencji zawierających kwaśne aminokwasy wynosi 33 %, dla sekwencji bhlh-zip 71 % i dla C-końcowej domeny regulatorowej wynosi 49 % ( Ryc. 1) [ 18]. Domena N-końcowa SREBP po proteolitycznym odszczepieniu jest transkrypcyjnym czynnikiem rodziny suwaka leucynowego basic-helix-loop-he- lix-leucine-zipper (bhlh-zip) [17-19, 21-23, 27-29, 32-36], Motyw bhlh-zip pośredniczy w dimeryzacji i translokacji dimeru do jądra komórkowego oraz wiązaniu go z regionami SRE. IV. Mechanizm dwuetapowego procesu proteolizy białka SREBP IV-1. SCAP białko aktywujące proteolityczne rozszczepienie SREBP z udziałem proteaz SIP i S2P Proces proteolizy białek SREBP zachodzi z udziałem dwóch proteaz SIP i S2P (dane o specyficzności w dalszej części artykułu) oraz przy współudziale białka SCAP(ang. cleavage activating protein). Białko SCAP uczestniczy również w transporcie białka SREBP o masie cząsteczkowej 125 kda z błon ER do aparatu błon aparatu Golgiego. SCAP jest integralnym N-glikozylowanym białkiem błonowym, zbudowanym z około 1276 aminokwasów, recyklizującym między ER i AG (Ryc. 2) [18, 21]. Po N-terminalnej, zlokalizowanej w cytosolu domenie SCAP, występują na przemian hydrofobowe i hydrofilne odcinki, które tworzą osiem transmembranowych fragmentów rozdzielonych krótkimi hydrofilnymi pętlami. Hydrofilna C-końcowa domena SCAP, zlokalizowana również w cytosolu (546 aminokwasów), zawiera pięć powtarzających się sekwencji WD, które pośredniczą w interakcjach białko-białko. Odcinek obejmujący pięć z ośmiu transmembranowych sekwencji białka SCAP (domeny transbłonowe 2-6, pomiędzy aminokwasami ) jest domeną sensorową dla steroli. Domeny o podobnej strukturze występują również w takich białkach jak reduktaza HMG-CoA (pomiędzy aminokwasami białka zbudowanego z 887 aminokwasów), białka NPC-1 (Nieman-PicK typ 1, pomiędzy aminokwasami białka zbudowanego z 1278 aminokwasów) oraz receptorze morfo- genezy Patched (pomiędzy aminokwasami białka zawierającego 1434 aminokwasy). Wymienione odcinki sensorowe pozostają pod kontrolą steroidów, choć w reduktazie HMG-CoA nie wykazuje wrażliwości na sterole [17, 18,21-23,27-29, 32, 37]. Zamiana jednego aminokwasu asparaginy na argi- ninę w obrębie domeny sensorowej SCAP unieczyn- nia jej rolę jako sensora steroli w komórce [2 2 ], Wspomniana już zmiana asparaginy na argininę w SCAP znosi jego aktywujący wpływ na proteazę POSTĘPY BIOCHEMII 48(3),
5 Ryc. 2. Topologia struktury białka SREBP i SCAP w obrębie błon retikulum edoplazmatycznego (wg [21], zmodyfikowane). S1P, a w konsekwencji tej zmiany aktywność S1P utrzymuje się na stałym poziomie. Lipidy niesterolowe jak sfingomielina [38] oraz androgeny [39], oksysterole i nienasycone kwasy tłuszczowe [40] wpływają zarówno na proces transkrypcji białek SREBP jak i na aktywność proteazy S1P. Szczególnie ciekawe choć nie w pełni wyjaśnione są efekty wywołane przez sfingomielinazę w wyniku działania której następuje translokacja cholesterolu z błon plazmatycznych do ER. W odpowiedzi na potraktowanie komórek sfingomielinazą(w warunkach hodowli tkankowych) zaobserwowano podwyższenie stężenia estrów cholesterolu z powodu aktywacji ACAT oraz zahamowanie syntezy cholesterolu w wyniku zmniejszenia aktywności reduktazy HMG-CoA; oprócz tego stwierdzono obniżenie się ilości dojrzałych form SREBP-68 w jądrach komórkowych, co jest rezultatem hamowania proteazy S1P(38). Oksysterole w szczególności w obecności nienasyconych kwasów tłuszczowych są również silnymi inhibitorami procesu konwersji SREBP w czynniki transkrypcyjne SREBP-68 [40], Z badań nad wpływem stopnia nienasycenia kwasów tłuszczowych na proces uwalniania białek SREBP-68 wynika, iż bardzo skutecznym inhibitorem jest kwas oleinowy C l8:1 (A9) [40]. Według innych autorów [4 3] najefektywniejsze w hamowaniu uwalniania białek SREBP-68-lc są wielonienasycone kwasu tłuszczowe, jak np. kwas arachidonowy C20:4 (A5,8 n i4) [4 1 ]. Efekty nienasyconych kwasów tłuszczowych dotyczą również regulacji tkankowo specyficznej ekspresji białek SREBP. W hepatocy- tach wywierają wpływ na ekspresję, natomiast w adi- pocytach pozostają bez wpływu. Przypuszcza się również, iż proces proteolizy białek SREBC-lc pozostaje wyłącznie pod kontrolą nienasyconych kwasów tłuszowych i jest niezależny od steroli. Proces aktywacji białek SERBP-lc regulowany jest także poprzez proces modyfikacji kowalencyjnej z udziałem kinazy MAP [41]. SREBP-1 i SREBP-2 w komórkach apoptotycz- nych mogą również ulegać proteolizie nieregulowa- nej przez sterole z udziałem proteaz cysteinowych CPP-32 i Mch-3 [16]. Znaczenie tych procesów nie zostało jeszcze wyjaśnione. IV-2. Proces proteolizy białka SREBP błon ER I uwolnienie czynnika transkrypcyjnego SREBP-68 W warunkach niedoboru steroli w komórce białko SREBP błon ER wchodzi w interakcję z SCAP. Interakcja zachodzi pomiędzy C-końcową domeną regulatorową SREBP i domeną WD białka SCAP (Ryc. 3). Wytworzony kompleks SREBP-SCAP, według najnowszych doniesień [17] zostaje przetransportowany do błon AG, gdzie w dwuetapowym POSTĘPY BIOCHEMII 48(3), 2002
6 1 SREBP 3 S1P 5 SREBP-68 7 DNA 2 SCAP 4 S2P 6 SRE-1 8 m R NA Ryc. 3. Model mechanizmu proteolizy membranowego białka SREBP. Proteaza S 1P rozpoznająca kompleks SREBP-SCAP rozcina pętlę SREBP w luminamej części ER na dwa fragmenty. Druga proteaza S2P odcina N-terminalną partię SREBP z domeną bhlh (SREBP-68). Kolejnym etapem jest transport uwolnionego czynnika transkrypcyjnego SREBP-68 do jądra komórkowego. Dimer białka SREBP-68 aktywuje promotory SRE. procesie proteolizy następuje uwolnienie transkryp- cyjnie aktywnego N-końcowego fragmentu o masie 68 kda (SREBP-68). Pierwsze rozszczepienie następuje w środku pętli białka SREBP w obrębie sekwencji: Arg-Ser-Yal-Leu-Ser (RSYLS) (Ryc. 3) pomiędzy leucyną522 i seryną523, katalizowane jest przez proteazę S 1P, aktywowaną przez SCAP. Na tym etapie SREBP rozdzielone zostaje na dwie części, pozostaje jednak nadal związane z błoną Aparatu Golgie- go (Ryc. 3). Według niektórych autorów proces ten zachodzi również w ER [17, 18, 21, 28, 42], W kolejnym etapie, w błonach AG, druga proteaza - S2P uwalnia z połączenia z błoną N-końcowy fragment białka SREBP, tzn. właściwy, transkrypcyjnie czynny czynnik SREBP-68 (Ryc. 3). Cięcie następuje w segmencie trans-membranowym, w obrębie sekwencji: Asp-Arg-Ser-Arg-Ile-Leu-Leu-Cvs (DR- SRILLC) pomiędzy leucyną i cysteiną. S2P jest hydrofobową, cynkową metaloproteazą, natomiast SIP jest proteazą typu subtylizyn o strukturze i właściwościach podobnych do subtylizyn bakteryjnych. Obecność S1P stwierdzono również w regionie pre-golgi i jest ona proteazą odmienną od konwertaz prehormonów, które występują w obrębie AG i post-ag. Stąd możliwe jest, że pierwszy i drugi etap proteolizy zachodzi w regionie pre-golgi. W/g Browna i Goldsteina [21] proteaza S1P występuje w formie nieaktywnej w ER i ulega aktywacji w regionie pre-golgi (mechanizm aktywacji nieznany). Uwolniona, transkrypcyjnie aktywna N-końcowa domena o masie 68 kda (SREBP-68) zostaje przeniesiona do cytosolu, skąd migruje do jądra, gdzie jako dimer wiąże się z regionami SRE (Ryc. 3) i aktywuje szereg genów enzymów szlaku biosyntezy cholesterolu, lipogenezy, receptora LDL i metabolizmu węglowodanów, geny syntazy HMG-CoA (pierwszy POSTĘPY BIOCHEMII 48(3),
7 Tabela 2 Zmiany ekspresji i uczynniania białek SREBP pod wpływem metabolitów i hormonów [na podstawie 17, 28, 31]. SREBP Czynnik mrna Uczynnienie SREBP-la, lc, 2 cholesterol 4 4 SREBP-la, lc, 2 oksystcrole bz 4 SREBP-2 insulina/glukoza bz bz SREBP-lc insulina/glukoza T T SREBP-lc glukagon, camp 4 4 SREBP-2 hipolipidemiczne leki T T SREBP-1 hipolipidemiczne leki bz 4 SREBP-1 wielonienasycone kwasy tłuszczowe bz 4 SREBP-2 wielonienasycone kwasy tłuszczowe bz bz T wzrost, -i obniżenie, bz bez zmian wykryty), receptora LDL, reduktazy HMG-CoA, syntazy skwalenu, syntazy farnezylodifosforanu, syntazy kwasów tłuszczowych, karboksylazy-coa, glicerylo-3-fosfoacylotransferazy, lipazy lipoprote- inowej, kaweolin i leptyny [17, 24]. Aktywacja w/w genów wymaga jednak dodatkowo współdziałania SREBP-68 z innymi czynnikami transkrypcyjnymi [17, 21-23, 28], takimi jak NF-Y (ang. nuclear fa c to r Y), Spl lub CREB (ang. camp response elem ent binding protein). Dodatkowymi białkowymi koaktywatorami wymaganymi do aktywacji transkrypcji są CBP (ang. CREB binding p ro tein), P-300 oraz ARC (ang. activated recruited fa c tor) lub DRIP (ang. vitam in D receptor interacting protein) przy czym izoformy SREBP-la i lc oraz SREBP-2 wchodzą w interakcję z odrębnymi czynnikami transkrypcyjnymi [28], co daje możliwość specyficznych tkankowo modulacji ekspesji genów i precyzyjnej kontroli ich ekspresji przez czynniki wewnątrzkomórkowe. Transkrypcyjne czynniki z sekwencją suwaka le- ucynowego (bhlh-zip), takie jak: Myc, Max i USP (ang. upstream stim ulatory fa cto r) zawierają argini- nę w konserwatywnym regionie i wiążą się z ramką EDNA (5 -CANNTG -3 ) [43]. SREBP-68 są szczególnymi białkami typu bhlh-zip, ponieważ w miejscu argininy występuje tyrozyna [43] iw związku z tym wiążą się efektywnie tylko z SRE-1. Interesującym jest fakt, że choć SREBP-68 w warunkach in vivo wiążą się również z ramką E i wykazują wysokie powinowactwo do niej, jednak wszystkie promotory do tej pory opisane, wrażliwe na poziom steroli regulowane są tylko poprzez promotory zawierające SRE. Wynika to prawdopodobnie z faktu, iż interakcja z promotorami z ramką E, nie wywołuje dostatecznej zmiany konformacji wytworzonego kompleksu białko-dna, dla uczynnienia transkrypcji [23, 24]. Najnowsze poglądy o oddziaływaniu czynników transkrypcyjnych SREBP- 68 z promotorami z sekwencją typu SRE i ramką E przedstawione zostały w pracach szeregu pracach [22-24]. Wydaje się, iż ramka E-box jest rozpoznawana przez białka zawierające motyw suwaka leucynowe- go i uczynnia promotory odpowiedzialne za konstytutywną ekspresję genów szlaków biosyntezy niezależną od omawianych procesów regulowanych przez sterole z udziałem SREBP, SCAP, S1P i S2P. Czynniki transkrypcyjne SREBP-68 prawdopodobnie koewoluowały dla optymalizacji i uprecy- zyjnienia regulacji metabolizmu przemian cholesterolu, kwasów tłuszczowych i węglowodanów. W artykule przedstawiono niedawno poznane podstawowe mechanizmy odbioru sygnałów o niedoborze cholesterolu oraz konwersji integralnych białek błon retikulum endoplazmatycznego SREBP w czynniki transkrypcyje SREBP-68 uczestniczące w aktywacji genów z promotorami SRE. Piśmiennictwo: Artykuł otrzymano 12 grudnia 2001 Zaakceptowano do druku 20 maja Russell D (1992) Cardiovasc Drugs Ther 6: Hinson D D, Chamblis K L, Toth M J, Tanaka R D, Gibson K M (1997) J Lipid Res 38: Laufs U, La Fata V, Liao J K (1997) J Biol Chem 272: POSTĘPY BIOCHEMII 48(3), 2002
8 4. Bellosta S, Bernini F, Ferri N, Quaranto P, Canavaesi M, Arnaboldi L, Fumagalli R, Poaletti R, Corsini A (1998) Artherosclerosis 137: S I01- S I09 5. Farcse R V, Herz J (1998) Trends in Genetics 14: F u Q, Goodrum J F, Hayes C, Hostettler J D, Toews A D, Moreli P (1998) J Neurochem 71: Mann R K, Bcachy P A (2000) Biochim Biophys Acta 1529: YokoyamaS (2000) Biochim Biophys Acta 1529: Loirdighi N, Menard D, Delvin E, Levy E (1997) Am J Physiol 273: G62-G Accad M, Farese R V (1998) Current Biology 8: R 601-R Brown M S, Goldstein J L (1986) Science 232: Fielding Ch J, Fielding P E (1997) J Lipid Res 38: Lopez D, Chambers Ch M, Ness G C (1997) Arch Biochem Biophys 343: Griffin M, Frazer A, Johnson A, Collins P, Owens D, Tomkin G H (1998) Artherosclerosis 138: Wieczorek B, Gniot-Szulżycka J (2000) Kosmos 49: S c h o o n j a n s K, Brendel C, Mangelsdorf D, Auwerx J (2000) Biochim Biophys Acta 1529: Edwards P A, Tabor D, Kast H R, Venkateswaran A (2000) Biochim Biophys Acta 1529: Brown M S, Goldstein J L (1997) Cell 89: Nogalska A, Świerczyński J (2001) Postępy Biochemii 47: Christenson L K, McAllister J M, Martin K O Javit N B, Osborne T F, Strauss III J F (1998)J B io l Chem 273, B r o w n M S, Goldstein J L (1999) Proc Natl Acad Sci 96: Edwards P A, Ericsson J (1999) Annu Rev Biochem 68: Athanikar J N, Osborne T F (1998) Proc Natl Acad Sci 95: P a h 1 H L (1999) Physiological Reviews 79: Hua X, Yokoyama C, Wu J, Briggs M R, Brown M S, Goldstein J L, Wang X (1993) Proc Natl Acad Sci 90: T ontonoz P, Kim J B, Graves R A, Spiegelman B M (1993) Mol Cell Biol 13: Rawson R B, DeBose-Boyd R, Goldstein J L, Brown M S (1999) J Biol Chem 274: Osborne T F (2000) J Biol Chem 275: P a i J, Guryev O, Brown M S, Goldstein J L (1998)J Biol Chem 273: Magana M M, Koo S-H, Towle H C, Osborne T F (2000) J Biol Chem 275: Hannah V C, Ou J, Luong A, Goldstein J L, Brown M S (2001) J Biol Chem 276: Hua X, Sakai J, Brown M S, Goldstein J L (1996)J B io l Chem 271: H u a X, Sakai J, Ho Y K, Goldstein J L, Brown M S (1995) J Biol Chem 270: Cheng D, Espenshade P J, Slaughter C A, Jaen J C, Brown M S, Goldstein J L (1999) J Biol Chem 274: Yang T, Goldstein J L, Brown M S (2000) J Biol Chem 275: Sturley S L (2000) Biochim Biophys Acta 1529: Nohturfft A, DeBose-Boyd R A, Scheek S, Goldstein J L, Brown M S (1999) Proc Natl Acad Sci 96: Scheek S, Brown M S, Goldstein J L (1997) Proc Natl Acad Sci 94: Swinnen J V, Ulrix W, Heyns W, Verhoeven G (1997) Proc Natl Acad Sci 94: Thewke D P, Panini S R, Sinensky M (1998) J Biol Chem 273: Mater M K., Thelen A P, Pan D A, Jump D B (1999) J.Bio.Chem 274: Duncan E A, Brown M S, Goldstein J L, Sakai J (1997) J Biol Chem 272: Parraga A, Bellsolell L, Ferre-D Amare A R, Burley S K (1998) Structure 4 6: POSTĘPY BIOCHEMII 48(3),
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
Nukleotydy w układach biologicznych
Nukleotydy w układach biologicznych Schemat 1. Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy Schemat 2. Dinukleotyd NADP + Dinukleotydy NAD +, NADP + i FAD uczestniczą w procesach biochemicznych, w trakcie których
SEMINARIUM 8:
SEMINARIUM 8: 24.11. 2016 Mikroelementy i pierwiastki śladowe, definicje, udział w metabolizmie ustroju reakcje biochemiczne zależne od aktywacji/inhibicji przy udziale mikroelementów i pierwiastków śladowych,
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Integracja metabolizmu
Integracja metabolizmu 1 Kluczowe związki w metabolizmie Glukozo- 6 -fosforan Pirogronian AcetyloCoA 2 Glukoza po wejściu do komórki ulega fosforylacji Metaboliczne przemiany glukozo- 6-fosforanu G-6-P
Informacje. W sprawach organizacyjnych Slajdy z wykładów
Biochemia Informacje W sprawach organizacyjnych malgorzata.dutkiewicz@wum.edu.pl Slajdy z wykładów www.takao.pl W sprawach merytorycznych Takao Ishikawa (takao@biol.uw.edu.pl) Kiedy? Co? Kto? 24 lutego
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała Uwaga: tkanka tłuszczowa (adipose tissue) NIE wykorzystuje glicerolu do biosyntezy triacylogliceroli Endo-, para-, i autokrynna droga przekazu informacji biologicznej.
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
Hormony Gruczoły dokrewne
Hormony Gruczoły dokrewne Dr n. biol. Urszula Wasik Zakład Biologii Medycznej HORMON Przekazuje informacje między poszczególnymi organami regulują wzrost, rozwój organizmu efekt biologiczny - niewielkie
Przegląd budowy i funkcji białek
Przegląd budowy i funkcji białek Co piszą o białkach? Wyraz wprowadzony przez Jönsa J. Berzeliusa w 1883 r. w celu podkreślenia znaczenia tej grupy związków. Termin pochodzi od greckiego słowa proteios,
Komórka eukariotyczna
Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,
U grzybów i zwierząt synteza kwasów tłuszczowych zachodzi w multienzymatycznym kompleksie syntazy kwasów tłuszczowych (FAS)
U grzybów i zwierząt synteza kwasów tłuszczowych zachodzi w multienzymatycznym kompleksie syntazy kwasów tłuszczowych (FAS) U drożdży FAS (2.4x10 6 D) składa się z dwóch typów podjednostek (α - 213 kd,
TIENS L-Karnityna Plus
TIENS L-Karnityna Plus Zawartość jednej kapsułki Winian L-Karnityny w proszku 400 mg L-Arginina 100 mg Niacyna (witamina PP) 16 mg Witamina B6 (pirydoksyna) 2.1 mg Stearynian magnezu pochodzenia roślinnego
Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW. Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki
Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki Metabolizm całokształt przemian biochemicznych i towarzyszących
Zagadnienia seminaryjne w semestrze letnim I Błony biologiczne
Zagadnienia seminaryjne w semestrze letnim 2019 I Błony biologiczne 1. Budowa i składniki błon biologicznych - fosfolipidy - steroidy - białka - glikoproteiny i glikolipidy 2. Funkcje błony komórkowej
Joanna Bereta, Aleksander Ko j Zarys biochemii. Seria Wydawnicza Wydziału Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego
Joanna Bereta, Aleksander Ko j Zarys biochemii Seria Wydawnicza Wydziału Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego Copyright by Wydział Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii
Tłuszcze jako główny zapasowy substrat energetyczny
Tłuszcze jako główny zapasowy substrat energetyczny Utlenienie 1 g tłuszczy pozwala na wyprodukowanie 37 kj (9 kcal) energii, podczas gdy utlenienie 1 g węglowodanów lub białek dostarcza tylko 17 kj (4
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl
Ogół przemian biochemicznych, które zachodzą w komórce składają się na jej metabolizm. Wyróżnia się dwa antagonistyczne procesy metabolizmu: anabolizm i katabolizm. Szlak metaboliczny w komórce, to szereg
Program zajęć z biochemii dla studentów kierunku weterynaria I roku studiów na Wydziale Lekarskim UJ CM w roku akademickim 2013/2014
Program zajęć z biochemii dla studentów kierunku weterynaria I roku studiów na Wydziale Lekarskim UJ CM w roku akademickim 2013/2014 S E M E S T R II Tydzień 1 24.02-28.02 2 03.03-07.03 3 10.03-14.03 Wykłady
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011 DLACZEGO DOROSŁY CZŁOWIEK (O STAŁEJ MASIE BIAŁKOWEJ CIAŁA) MUSI SPOŻYWAĆ BIAŁKO? NIEUSTAJĄCA WYMIANA BIAŁEK
Źródła energii dla mięśni. mgr. Joanna Misiorowska
Źródła energii dla mięśni mgr. Joanna Misiorowska Skąd ta energia? Skurcz włókna mięśniowego wymaga nakładu energii w postaci ATP W zależności od czasu pracy mięśni, ATP może być uzyskiwany z różnych źródeł
Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego
Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki
Spis treści. 1. Wiadomości wstępne Skład chemiczny i funkcje komórki Przedmowa do wydania czternastego... 13
Przedmowa do wydania czternastego... 13 Częściej stosowane skróty... 15 1. Wiadomości wstępne... 19 1.1. Rys historyczny i pojęcia podstawowe... 19 1.2. Znaczenie biochemii w naukach rolniczych... 22 2.
Fizjologia nauka o czynności żywego organizmu
nauka o czynności żywego organizmu Stanowi zbiór praw, jakim podlega cały organizm oraz poszczególne jego układy, narządy, tkanki i komórki prawa rządzące żywym organizmem są wykrywane doświadczalnie określają
Podkowiańska Wyższa Szkoła Medyczna im. Z. i J. Łyko. Syllabus przedmiotowy 2016/ /2019
Podkowiańska Wyższa Szkoła Medyczna im. Z. i J. Łyko Syllabus przedmiotowy 2016/2017-2018/2019 Wydział Fizjoterapii Kierunek studiów Fizjoterapia Specjalność ----------- Forma studiów Stacjonarne / Niestacjonarne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne http://www.umass.edu/molvis/bme3d/materials/jtat_080510/exploringdna/ch_flex/chapter.htm czynniki transkrypcyjne (aktywatory/represory)
Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak
Katedra Fizjologii i Biochemii Roślin Uniwersytetu Łódzkiego Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak Plan wykładu Przykłady
Transport makrocząsteczek
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii, dzięki której organizm uzyskuje energię biosynteza białka i innych związków Transport
Bioinformatyka wykład 9
Bioinformatyka wykład 9 14.XII.21 białkowa bioinformatyka strukturalna krzysztof_pawlowski@sggw.pl 211-1-17 1 Plan wykładu struktury białek dlaczego? struktury białek geometria i fizyka modyfikacje kowalencyjne
Translacja i proteom komórki
Translacja i proteom komórki 1. Kod genetyczny 2. Budowa rybosomów 3. Inicjacja translacji 4. Elongacja translacji 5. Terminacja translacji 6. Potranslacyjne zmiany polipeptydów 7. Translacja a retikulum
etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy
Temat: Białka Aminy Pochodne węglowodorów zawierające grupę NH 2 Wzór ogólny amin: R NH 2 Przykład: CH 3 -CH 2 -NH 2 etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
46 i 47. Wstęp do chemii -aminokwasów
46 i 47. Wstęp do chemii -aminokwasów Chemia rganiczna, dr hab. inż. Mariola Koszytkowska-Stawińska, WChem PW; 2017/2018 1 21.1. Budowa ogólna -aminokwasów i klasyfikacja peptydów H 2 H H 2 R H R R 1 H
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
Do moich badań wybrałam przede wszystkim linię kostniakomięsaka 143B ze względu na jej wysoki potencjał przerzutowania. Do wykonania pracy
Streszczenie Choroby nowotworowe stanowią bardzo ważny problem zdrowotny na świecie. Dlatego, medycyna dąży do znalezienia nowych skutecznych leków, ale również rozwiązań do walki z nowotworami. Głównym
BIOENERGETYKA cz. I METABOLIZM WĘGLOWODANÓW I LIPIDÓW. dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny
BIOENERGETYKA cz. I METABOLIZM WĘGLOWODANÓW I LIPIDÓW dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny METABOLIZM/ENERGIA WĘGLOWODANY i LIPIDY WYKŁAD 6 Trawienie i wchłanianie WĘGLOWODANY TŁUSZCZE BIAŁKA Katabolizm
Chemiczne składniki komórek
Chemiczne składniki komórek Pierwiastki chemiczne w komórkach: - makroelementy (pierwiastki biogenne) H, O, C, N, S, P Ca, Mg, K, Na, Cl >1% suchej masy - mikroelementy Fe, Cu, Mn, Mo, B, Zn, Co, J, F
HORMONY STERYDOWE I PODOBNIE DZIAŁAJĄCE
HORMONY STERYDOWE I PODOBNIE DZIAŁAJĄCE Są to związki należące do grupy steroidów, które charakteryzują się wykazywaniem istotnych aktywności biologicznych typu hormonalnego. Docierając do komórki docelowej,
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych Dr hab. Marta Koblowska, prof. UW Zakład Biologii Systemów, Wydział Biologii UW Pracownia Analiz Mikromacierzy i Sekwencjonowania UW/IBB PAN Klasyczne wyobrażenie
W odpowiedzi na bodźce (histamina, adrenalina, bradykinina, angitensyna II, trombina) w komórce uruchamiany jest system degradacji lipidów (lipazy).
Biosynteza i funkcja eikozanoidów Eikozanoidy (ikozanoidy) pochodzą od 20:4 kwasu tłuszczowego (kwasu arachidonowego) Związki te nie są przechowywane w komórce a są szybko syntetyzowane i uwalniane (5-60
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
B) podział (aldolowy) na 2 triozy. 2) izomeryzacja do fruktozo-6-p (aldoza w ketozę, dla umoŝliwienia kolejnych przemian)
Glikoliza (Przegląd kluczowych struktur i reakcji) A) przygotowanie heksozy do podziału na dwie triozy: 1)fosforylacja glukozy (czyli przekształcenie w formę metabolicznie aktywną) 2) izomeryzacja do fruktozo-6-p
Sterydy (Steroidy) "Chemia Medyczna" dr inż. Ewa Mironiuk-Puchalska, WChem PW
Sterydy (Steroidy) Związki pochodzenia zwierzęcego, roślinnego i mikroorganicznego; pochodne lipidów, których wspólnącechą budowy jest układ czterech sprzężonych pierścieni węglowodorowych zwany steranem(cyklopentanoperhydrofenantren)
Przedziały wewnątrzkomórkowe siateczka śródplazmatyczna (ER)
Przedziały wewnątrzkomórkowe siateczka śródplazmatyczna (ER) Pochodzenie ER inwaginacja błony - (kanały trnslokacyjne) i rozrost cysterny spłaszczone woreczki tubule Siateczka śródplazmatyczna retikulum
Przedziały wewnątrzkomórkowe siateczka śródplazmatyczna (ER) Pochodzenie ER
Przedziały wewnątrzkomórkowe siateczka śródplazmatyczna (ER) Pochodzenie ER inwaginacja błony - (kanały trnslokacyjne) i rozrost cysterny spłaszczone woreczki tubule Siateczka śródplazmatyczna retikulum
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
21. Wstęp do chemii a-aminokwasów
21. Wstęp do chemii a-aminokwasów Chemia rganiczna, dr hab. inż. Mariola Koszytkowska-Stawińska, WChem PW; 2016/2017 1 21.1. Budowa ogólna a-aminokwasów i klasyfikacja peptydów H 2 N H kwas 2-aminooctowy
WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach
WYKŁAD: Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Białka Retrowirusy Białka Klasyczny
Zagadnienia do egzaminu z biochemii (studia niestacjonarne)
Zagadnienia do egzaminu z biochemii (studia niestacjonarne) Aminokwasy, białka, cukry i ich metabolizm 1. Aminokwasy, wzór ogólny i charakterystyczne grupy. 2. Wiązanie peptydowe. 3. Białka, ich struktura.
AKADEMIA MEDYCZNA W GDAŃSKU. Marek Szołkiewicz MOLEKULARNE PODSTAWY ZWIĘKSZONEJ BIOSYNTEZY LIPIDÓW W PRZEWLEKŁEJ NIEWYDOLNOŚCI NEREK
AKADEMIA MEDYCZNA W GDAŃSKU Marek Szołkiewicz MOLEKULARNE PODSTAWY ZWIĘKSZONEJ BIOSYNTEZY LIPIDÓW W PRZEWLEKŁEJ NIEWYDOLNOŚCI NEREK Rozprawa habilitacyjna Gdańsk 2007 Wydano za zgodą Senackiej Komisji
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Bliskie spotkania z biologią. METABOLIZM część II. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW
Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM część II dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki METABOLIZM KATABOLIZM - rozkład związków chemicznych
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 4 Jak działają geny?
Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW. Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki
Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki Metabolizm całokształt przemian biochemicznych i towarzyszących
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY d r i n ż. Magdalena Górnicka Zakład Oceny Żywienia Katedra Żywienia Człowieka WitaminyA, E i C oraz karotenoidy Selen Flawonoidy AKRYLOAMID Powstaje podczas przetwarzania
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Takao Ishikawa Faculty of Biology, University of Warsaw, Poland Performance of Polish students at IBO Gold Silver Bronze Merit
Biochemia zwierząt - A. Malinowska
Spis treści Biochemia zwierząt - A. Malinowska 1. Wstęp 1.1. Wpływ środowiska zewnętrznego na organizm zwierzęcy 1.2. Podstawowe składniki organizmu zwierzęcego 1.3. Woda 1.4. Składniki mineralne 1.4.1.
cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Jądro komórkowe
Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,
Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji?
WYKŁAD: 4 Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji? Prof. dr hab. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej 1 Dieta niskokaloryczna (calorie restriction,cr) 2 3 4 Zdjęcie 2. Stuletnia mieszkanka
Budowa i klasyfikacja lipidów
Budowa i klasyfikacja lipidów Klasyfikacja lipidów Lipidy Kwasy tłuszczowe Tłuszcze obojętne Woski Fosfolipidy Sfingolipidy Glikolipidy Steroidy Zawierające: - glicerol - grupę fosforanową - kwasy tłuszczowe
Przekazywanie sygnałów w mechanizmach działania fitohormonów. Przekazywanie sygnałów w komórkach zwierzęcych. Stężenie kinetyny (mg/litr)
Stężenie kinetyny (mg/litr) 2015-11-03 Przekazywanie sygnałów w komórkach zwierzęcych Przekazywanie sygnałów w mechanizmach działania fitohormonów Literatura: www.umk.pl/~kesy/mechanizmy_wzrostu/ligazy_ubikwitynowo-bialkowe.pdf
Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu Sylabus Przedmiotu. Biochemia ogólna
Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu Sylabus Przedmiotu Biochemia ogólna Wydział Kierunek Specjalność Kod przedmiotu Wydział Lekarski I Dietetyka - Wydział Lekarski I - DietWLI/S/P/1/42
Zawartość. Wstęp 1. Historia wirusologii. 2. Klasyfikacja wirusów
Zawartość 139585 Wstęp 1. Historia wirusologii 2. Klasyfikacja wirusów 3. Struktura cząstek wirusowych 3.1. Metody określania struktury cząstek wirusowych 3.2. Budowa cząstek wirusowych o strukturze helikalnej
Metody bioinformatyki. Ekspresja genów. prof. dr hab. Jan Mulawka
Metody bioinformatyki Ekspresja genów prof. dr hab. Jan Mulawka Genetyczny skład prawie wszystkich komórek somatycznych organizmów wielokomórkowych jest identyczny. Fenotyp (swoistość tkankowa lub komórkowa)
Wykład 2. Kinetyka reakcji enzymatycznych.
Wykład 2 Kinetyka reakcji enzymatycznych. Kofaktory enzymów wd_2 2 Ryboflawina witamina B 2 Ryboflawina wit. B 2 FAD dinukleotyd flawinoadeninowy wd_2 3 Niacyna witamina PP (B 3 ) NAD + dinukleotyd nikotynamidoadeninowy
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Geny i działania na nich
Metody bioinformatyki Geny i działania na nich prof. dr hab. Jan Mulawka Trzy królestwa w biologii Prokaryota organizmy, których komórki nie zawierają jądra, np. bakterie Eukaryota - organizmy, których
Geny, a funkcjonowanie organizmu
Geny, a funkcjonowanie organizmu Wprowadzenie do genów letalnych Geny kodują Białka Kwasy rybonukleinowe 1 Geny Występują zwykle w 2 kopiach Kopia pochodząca od matki Kopia pochodząca od ojca Ekspresji
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T Joanna Frąckowiak Rozprawa doktorska Praca wykonana w Katedrze i Zakładzie Fizjopatologii Gdańskiego
Transport pęcherzykowy
Transport pęcherzykowy sortowanie przenoszonego materiału zachowanie asymetrii zachowanie odrębności organelli precyzyjne oznakowanie Transport pęcherzykowy etapy transportu Transport pęcherzykowy przemieszczanie
LIPIDY. Slajd 1 WYKŁAD 5. Slajd 2. Slajd 3. LIPIDY: budowa lecytyny (fosfatydylocholina) AGNIESZKA ZEMBROŃ-ŁACNY. Struktura kwasów tłuszczowych
część hydrofobowa część hydrofilowa Slajd 1 WYKŁAD 5 LIPIDY AGNIESZKA ZEMBROŃ-ŁACNY Slajd 2 LIPIDY: budowa lecytyny (fosfatydylocholina) cholina fosforan azot wiązanie estrowe glicerol fosfor tlen węgiel
CHOLESTONE NATURALNA OCHRONA PRZED MIAŻDŻYCĄ. www.california-fitness.pl www.calivita.com
CHOLESTONE NATURALNA OCHRONA PRZED MIAŻDŻYCĄ Co to jest cholesterol? Nierozpuszczalna w wodzie substancja, która: jest składnikiem strukturalnym wszystkich błon komórkowych i śródkomórkowych wchodzi w
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski. Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul. Smętna 12, Kraków Plan prezentacji: Cel naukowy Podstawy teoretyczne Przyjęta metodyka
Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW. Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki
Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki Metabolizm całokształt przemian biochemicznych i towarzyszących
Lipoproteiny osocza. mgr Rafał Świechowski
Lipoproteiny osocza mgr Rafał Świechowski Lipidy Heterogenna grupa związków chemicznych, do których zalicza się: tłuszcze, woski, sterole, rozpuszczalne w tłuszczach witaminy (A, D, E, K), monoacyloglicerole,
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA SPIS TREŚCI: I. Wprowadzenie. II. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. III. Karty pracy. 1. Karta
Temat: Komórka jako podstawowa jednostka strukturalna i funkcjonalna organizmu utrwalenie wiadomości.
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII DLA KLASY I GIMNAZJUM Temat: Komórka jako podstawowa jednostka strukturalna i funkcjonalna organizmu utrwalenie wiadomości. Cele: Utrwalenie pojęć związanych z budową komórki;
Spis treści. Od Autora 9. Wprowadzenie 11 CZĘŚĆ A. MOLEKULARNE MENU 13
Spis treści Od Autora 9 Wprowadzenie 11 CZĘŚĆ A. MOLEKULARNE MENU 13 1. Białka 13 1.1. Budowa białek 13 1.1.1. Peptydy 15 1.1.2. Struktury przestrzenne łańcuchów polipeptydowych 16 1.1.2.1. Bioróżnorodność
Przedziały wewnątrzkomórkowe siateczka śródplazmatyczna (ER)
Przedziały wewnątrzkomórkowe siateczka śródplazmatyczna (ER) Pochodzenie ER inwaginacja błony - (kanały trnslokacyjne) i rozrost cysterny spłaszczone woreczki tubule Siateczka śródplazmatyczna retikulum
CYTOSZKIELET CYTOSZKIELET Cytoplazma podstawowa (macierz cytoplazmatyczna) Komórka eukariotyczna. cytoplazma + jądro komórkowe.
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe (układ wykonawczy) cytoplazma podstawowa (cytozol) Cytoplazma złożony koloid wodny cząsteczek i makrocząsteczek (centrum informacyjne) organelle i kompleksy
Priony. co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski
Priony co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski Choroba Kreutzfeldta-Jakoba Pierwsze opisy pochodzą z lat 30. XX wieku Zakaźna choroba, często rodzinna
mirna i zmiany faz wzrostu wegetatywnego
mirna i zmiany faz wzrostu wegetatywnego mir156 reguluje ekspresję genów SPL (SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN-LIKE) Defekty morfologiczne wywołane nadekspresją mirna w Arabidopsis" mirna156 mirna166
Składniki diety a stabilność struktury DNA
Składniki diety a stabilność struktury DNA 1 DNA jedyna makrocząsteczka, której synteza jest ściśle kontrolowana, a powstałe błędy są naprawiane DNA jedyna makrocząsteczka naprawiana in vivo Replikacja
Dr hab. Janusz Matuszyk. Ocena rozprawy doktorskiej. Pani mgr Hanny Baurskiej
Dr hab. Janusz Matuszyk INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ im. Ludwika Hirszfelda P OLSKIEJ A K A D E M I I N AUK Centrum Doskonałości: IMMUNE ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław tel. (+48-71)
Wykład 5. Remodeling chromatyny
Wykład 5 Remodeling chromatyny 1 Plan wykładu: 1. Przebudowa chromatyny 2. Struktura, funkcje oraz mechanizm działania kompleksów remodelujących chromatynę 3. Charakterystyka kompleksów typu SWI/SNF 4.
Regulacja ekspresji genów. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Regulacja ekspresji genów Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Problem: jak sprawić aby z jednej komórki powstał wielokomórkowy