Lista potencjalnych promotorów SD BioMedChem i tematyka badawcza

Transkrypt

1 Imię i nazwisko pracownika naukowego Obszar zainteresowań naukowych i badawczych Proponowana tematyka pracy doktorskiej Dr hab. Aneta Balcerczyk, Prof. UŁ aneta.balcerczyk@biol.uni.lodz.pl ORCID Prof. dr hab. Grzegorz Bartosz grzegorz.bartosz@biol.uni.lodz.pl ORCID Prof. dr hab. Janusz Błasiak janusz.blasiak@biol.uni.lodz.pl ORCID Dr hab. Dominika Drzewiecka dominika.drzewiecka@biol.uni.lodz.pl ORCID Epigenetyczna regulacja metabolizmu komórek śródbłonka naczyniowego i komórek nowotworowych. Potranslacyjne modyfikacje białek histonowych (acetylacja, metylacja, cytrulinacja). Reorganizacja chromatyny. Epigenetyczny potencjał naturalnych komponentów diet. Regulacja procesu angiogenezy. Homeaostaza redoks komórki. Biochemia/biofizyka reaktywnych form tlenu i antyoksydantów, biochemia/biofizyka błon, biologia/biofizyka procesu starzenia, elektroforeza komórek Struktura i funkcje DNA i RNA, uszkodzenia i naprawa DNA, transformacja nowotworowa, epigenetyka, komórki macierzyste, ekspresja genów, mitochondrium, autofagia. Bakterie z rodzaju Proteus; ich cech serologiczne, antygenowe i biologiczne, ułatwiające rozprzestrzenianie się tych pałeczek w środowisku, np. wśród chorych. Przyczyny przewagi i sukcesu ekologicznego określonych szczepów i serotypów. Konkurencja i antagonizm wewnątrzgatunkowy oraz w stosunku do innych gatunków. Zjawisko Dienesa, zachowania terytorialne, dominacja i uległość. Zjawisko wytwarzania pęcherzyków błonowych przez pałeczki Proteus spp. Funkcje pęcherzyków, transport określonych substancji związanych ze zjawiskiem fuzji do komórek biorców, działanie cytotoksyczne. Potencjalne możliwości wykorzystania pęcherzyków błonowych, np. w konstrukcji szczepionek. Analiza epigenetycznego profilu modyfikacji wybranych arginin histonów rdzeniowych i wynikające z nich konsekwencje dla innych modyfikacji potranslacyjnych oraz funkcjonowania śródbłonka naczyniowego (w ramach Diamentowego Grantu) Nowe zastosowania elektroforezy dla analizy i rozdziału komórek Rola autofagii i mechanizmów mitochondrialnej kontroli jakości w ochronnym działaniu PGC-1alfa przed indukowanymi przez stres oksydacyjny zmianami zwyrodnieniowymi w starzejącej się siatkówce (w ramach Projektu NCN 2017/27/B/NZ3/00872) Pałeczki Proteus spp.: wirulencja, zjawisko wytwarzania pęcherzyków błonowych, zachowania społeczne, konkurencja i antagonizm, przyczyny przewagi i sukcesu ekologicznego określonych szczepów i serotypów.

2 Dr hab. Justyna Gatkowska ORCID Doświadczenia zmierzające do opracowania skutecznej immunoprofilaktyki toksoplazmozy u ludzi i zwierząt, obejmujących ocenę właściwości immunogennych i immunoprotekcyjnych potencjalnych preparatów szczepionkowych, opartych na rekombinowanych antygenach i plazmidach DNA kodujących białka chimeryczne i fuzyjne T. gondii, przy użyciu doświadczalnego modelu zwierzęcego. Badanie właściwości immunogennych i protekcyjnych rekombinowanych antygenów i plazmidów DNA kodujących białka chimeryczne i fuzyjne T. gondii. Dr hab. Maksim Ionov, prof. UŁ maksim.ionov@biol.uni.lodz.pl ORCID Oddziaływania nanocząstek różnego typu z kwasami nukleinowymi, białkami oraz błonami modelowymi i biologicznymi; Zastosowanie nanocząstek (dendrymerów) w medycynie, a w szczególności jako czynników przenoszących leki przeciwnowotworowe i czynników rozbijających białkowe agregaty występujące w chorobach neurodegeneracyjnych; Określenie stopnia hemolizy indukowanej dendrymerami i wybranymi dendrypleksami oraz określenie wydajności transfekcji; Badania toksyczności nanocząstek i ich kompleksów (cytotoksyczność w stosunku do wybranych linii komórkowych in vivo). 1. Nanocząstki jako nośniki leków przez barierę śródbłonkowa (w ramach Projektu M-ERA.NET Call 2018 NANOTENDO, ) 2. Fosforowe dendrymery jako nośniki leków i kwasów nukleinowych Dr hab. Anna Janaszewska anna.janaszewska@biol.uni.lodz.pl ORCID Dr hab. Agnieszka Krupa agnieszka.krupa@biol.uni.lodz.pl ORCID Biofizyka, systemy transportujące leki/materiał genetyczny, badania in vitro i in vivo Choroba niedokrwienna serca - zakażenia Helicobacter pylori - stan zapalny w płucach - dysfunkcja śródbłonka naczyniowego - przekaźnictwo sygnałów w komórkach Polimerowe nośniki materiału genetycznego potencjalne zastosowanie w biologii i medycynie. Modulacja śródbłonkowej reakcji zapalnej przez modyfikowane biologicznie biokompozyty kostne w kontekście rozwoju chorób naczyniowych. (w ramach Projektu TEAM NET -POIR D7/18)

3 Prof. dr hab. Magdalena Mikołajczyk- Chmiela ORCID Dr hab. Małgorzata Rogalińska, prof. UŁ ORCID Prof. dr hab. Elżbieta Żądzińska ORCID Reakcje odpornościowe regulujące wzajemne odziaływania gospodarz-drobnoustroje chorobotwórcze. Czynniki zjadliwości drobnoustrojów chorobotwórczych warunkujące przebieg zakażeń i powstawanie odporności swoistej. Podłoże genetyczne warunkujące podatność na zakażenia i rozwój chorób zakaźnych. Zastosowanie drobnoustrojów oraz produktów pochodzenia naturalnego jako biologicznych komponentów o potencjalnym zastosowaniu diagnostycznym, leczniczym i profilaktycznym. Ocena i optymalizacja metod diagnostycznych: serologicznych, molekularnych oraz komórkowych. Opracowanie nowych strategii ograniczania występowania chorób zakaźnych. Specjalizacja w zakresie badań dotyczących patogenezy zakażeń wywołanych przez pałeczki Helicobacter pylori będące przyczyną zapalenia błony śluzowej żołądka, wrzodów żołądka i dwunastnicy oraz raka żołądka u ludzi; badania dotyczące roli tych zakażeń w rozwoju chorób spoza układu pokarmowego m.in. choroby niedokrwiennej serca. Personalizacja leczenia białaczek, nowe sposoby leczenia nowotworów, naturalne związki antynowotworowe, molekularne podstawy działania leków, zmiany metabolizmu, naturalne związki antynowotworowe, molekularne podstawy działania leków, zmiany metabolizmu w nowotworach i komórkach prawidłowych, regulacja hormonalna metabolizmu, wpływ diety oraz aktywności fizycznej na długość życia człowieka, szkodliwe dla zdrowia składniki żywności. Antropologia biologiczna, biologia populacji ludzkich współczesnych i pradziejowych. Piomelaninowe systemy aktywne biologicznie do zastosowań medycznych (w ramach Projektu TEAM NET -POIR D7/18) Poszukiwanie szlaków i miejsc decyzyjnych związanych z przeżyciem lub śmiercią komórki. Związek między prenatalnym poziomem ekspozycji na hormony płciowe a aktywnością fizyczną, behawiorem, morfologią w trakcie dorosłej fazy ontogenezy.

4 Dr hab. Anna Brzostek Polska Akademia Nauk, IMB ORCID Dyscyplina wiodąca - nauki medyczne Szybko- i wolno- rosnące prątki gruźlicy (M. smegmatis i M. tuberculosis). Poszukiwanie czynników patogenności prątków, badania metabolizmu cholesterolu prątków, a także identyfikacja miejsc docelowych w genomie prątków dla nowych leków przeciwgruźliczych. W ramach realizacji pracy doktorskiej będą prowadzone badania na modelu prątków gruźlicy zmierzające do funkcjonalnej charakterystyki nowo zidentyfikowanych białek należących do rodziny peptydaz, związanych z odpowiedzią komórki (odpowiedź typu SOS) na uszkodzenia DNA. Postawiona hipoteza badawcza zakłada, że białka te są potrzebne do rozpoznania specyficznych rodzajów uszkodzeń DNA, powodujących blokadę procesu replikacji DNA (z ang. DNA replication stalling). Badania będą wymagały konstrukcji i analizy rekombinowanych szczepów Mycobacterium smegmatis oraz Mycobacterium tuberculosis. Konieczne będzie uzyskanie preparatów rekombinowanych białek oraz przeprowadzenie szeregu badań in vitro z ich wykorzystaniem. Prof. dr hab. Jarosław Dziadek jdziadek@cbm.pan.pl Polska Akademia Nauk, IMB ORCID X Dyscyplina wiodąca - nauki medyczne Molekularne podstawy transdukcji sygnału, naprawy i replikacji DNA, metabolizmu RNA, biosyntezy cholesterolu, biosyntezy ściany komórkowej w aspekcie patogenności prątków gruźlicy oraz poszukiwania nowych celów molekularnych dla leków przeciwprątkowych nowej generacji. Molekularne podstawy lekooporności prątków gruźlicy. Głównym celem pracy doktorskiej będzie określenie znaczenia poszczególnych mutacji punktowych identyfikowanych w klinicznych szczepach Mycobacterium tuberculosis, w genach kodujących tarcze dla leków przeciwgruźliczych. Realizacja projektu obejmować będzie 1) badania in silico zmierzające do identyfikacji poszczególnych mutacji w populacji na podstawie analizy sekwencji tysięcy genomów prątków, 2) określenie znaczenia poszczególnych mutacji dla bakterii w warunkach laboratoryjnych z wykorzystaniem genetycznie modyfikowanych prątków gruźlicy, 3) analizy z zakresu ekologii mikrobiologicznej i ewolucji molekularnej. Oceniony zostanie potencjał wykorzystania informacji o znaczeniu poszczególnych mutacji punktowych dla skuteczniejszej chemoterapii i kontroli gruźlicy.

5 Prof. dr hab. Zbigniew Leśnikowski Polska Akademia Nauk, IMB ORCID Dyscyplina wiodąca - nauki medyczne Dr hab. Melania Bednarek bednarek@cbmm.lodz.pl ORCID Dr hab. Arkadiusz Chworoś, prof. CBMM PAN achworos@cbmm.lodz.pl ORCID Prof. dr hab. Andrzej Gałęski andgal@cbmm.lodz.pl ORCID Chemia biologiczna, chemia kwasów nukleinowych. Polimeryzacja z otwarciem pierścienia cyklicznych estrów i eterów; synteza biodegradowalnych poliestrów z wykorzystaniem kombinatoryki chemicznej; funkcjonalizacja otrzymanych poliestrów/polieterów; badanie procesów agregacji poliestrów Strukturalne kwasy nukleinowe, bionanomateriały, RNA. Struktura i włąsciowści polimerów częściowo krystalicznych, plastyczna deformacja polimerów krystalizujących, nowe homo-/kopolimery otrzymywane z surowców odnawialnych Chemia medyczna klasterów boru stwarza niedostępne dotąd możliwości projektowania związków biologicznie aktywnych. W ramach pracy doktorskiej opracowane zostaną nowe metody funkcjonalizacji klasterów boru, które zostaną następnie wykorzystane do syntezy związków o potencjalnych właściwościach przeciwwirusowych, przeciwbakteryjnych i przeciwpasożytniczych. Wykorzystanie kowalencyjnych wiązań o charakterze odwracalnym do otrzymywania kopolimerów laktydu z monomerami winylowymi. Strukturalnie zdefiniowane nano-obiekty zbudowane z RNA i ich zastosowanie do wyciszania genów. Mikromechanizmy deformacji polimerów krystalizujących przy niewielkich odkształceniach. (w ramach grantu NCN - Sonata Bis) Mechaniczne właściwości fazy amorficznej polimerów krystalizujących. (w ramach grantu NCN - Sonata Bis)

6 Prof. dr hab. Piotr Kaszyński ORCID Prof. dr hab. Ewa Piórkowska-Gałęska ORCID Prof. dr hab. Stanisław Słomkowski ORCID X dr hab. Magdalena Małecka Uniwersytet Łódzki, WCh ORCID Organiczne materiały molekularne, chemia heterocykliczna, metodologia syntezy organicznej, stabilne rodniki i układy wielospinowe, klatki boranowe, samoorganizujące się materiały molekularne, paramagnetyczne, jonowe i polarne ciekłe kryształy, badania fizyko-organiczne (SPEKTOSKOPIA I ELEKTROCHEMIA), MAGNATYCZNE (EPR i SQUID), FOTOWOLTAICZNE. Krystalizacja, struktura i właściwości materiałów polimerowych, w tym nanokompozytów i polimerów biodegradowalnych. Synteza i właściwości polimerów do zastosowań biomedycznych, żele polimerowe (makroskopowe i nanożele), nano i mikrocząstki polimerowe, nośniki związków bioaktywnych ich wiązanie z nośnikami i uwalnianie. Badania strukturalne związków o potencjalnej aktywności farmakologicznej. Chemia stabilnych rodników organicznych i nowoczesne materiały molekularne. Nanokompozyty polipropylenu krystalizowane pod wysokim ciśnieniem. (w ramach grantu NCN - Opus) Hydrożele o odwracalnych węzłach sieci do dostarczania leków przeciwnowotworowych w terapii ginekologicznej. (w ramach grantu NCN - Sonata Bis) Hydrożele o odwracalnych węzłach sieci do dostarczania leków o działaniu przeciwdrobnoustrojowym w terapii ginekologicznej. (w ramach grantu NCN - Sonata Bis) Modyfikacje strukturalne związków o właściwościach fluorescencyjnych.

7 Dr hab. Sławomira Skrzypek, prof. UŁ Uniwersytet Łódzki, WCh ORCID Dr hab. Michał Rachwalski, prof. UŁ Uniwersytet Łódzki, WCh ORCID Prof. dr hab. Grzegorz Mlostoń Uniwersytet Łódzki, WCh ORCID Elektrochemia, elektroanaliza, sensory i biosensory elektrochemiczne elektrody stałe modyfikowane nanomateriałami węglowymi, nanoczastkami. Synteza organiczna ze szczególnym uwzględnieniem reakcji katalitycznych prowadzących zarówno do chiralnych, optycznie czynnych produktów, jak i substancji znajdujących potencjalne zastosowanie w elektronice organicznej. Chemia organiczna, chemia związków heterocyklicznych, chemia związków heteroatomowych, związki fluoroorganiczne, reaktywne związki przejściowe, mechanizmy reakcji organicznych, synteza organiczna, bioaktywność związków organicznych. Zminiaturyzowane sensory elektrochemiczne dla zastosowań kryminalistycznych. (w ramach grantu NCN - Sonata) Tematyka planowanej rozprawy doktorskiej mieści się w obszarze chemii związków heterocyklicznych oraz reaktywnych związków przejściowych. Celem badań będzie opracowanie wannie wytwarzania wysoce nukleofliowych karbenów (NHCs) pochodnych imidazolu (imidazol-2-ylideny), funkcjonalizownych grupami alkoksylowymi w pozycjach N(1) oraz N(3), przy wykorzystaniu 2-niepodstawionych N-tlenków imidazolu. Generowanie in situ karbeny (NHCs) będą przeprowadzane w związki kompleksowe z takimi metalami jak srebro, złoto, ruten, osm oraz rad. Otrzymane kompleksy będą badane pod względem wykrywanej aktywności biologicznej. Planowane jest włączenie do badań rzadko dotychczas opisywanych imidazol-2-ylidenów wykazujących czynność optyczną. ORCID WBiOŚ - Wydział Biologii i Ochrony Środowiska Uniwersytetu Łódzkiego, IBM - Instytut Biologii Medycznej Polskiej Akademii Nauk w Łodzi, CBMM - Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych Polskiej Akademii Nauk w Łodzi,

8 WCh Wydział Chemii Uniwersytetu Łódzkiego