Platforma Genie II. innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification

Transkrypt

1 1 Platforma Genie II innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification 1

2 2 Charakterystyka platformy Genie II Genie II jest innowacyjnym urządzeniem umożliwiającym wysoce czułą detekcję materiału genetycznego na poziomie molekularnym. Ta niezwykle elastyczna, kompaktowa i przenośna platforma pozwala na izotermiczną amplifikację DNA i RNA, a tym samym umożliwia otrzymanie wyniku izotermicznej amplifikacji próbki zainfekowanej obcym DNA/RNA w terenie już po 15 minutach! Do obsługi urządzenia stworzono specjalne akcesoria, tj. 8-probówkowe stripy oraz wysoce efektywne zestawy odczynników, które to akcesoria zapewniają przeprowadzenie łatwej i błyskawicznej identyfikacji materiału genetycznego w systemie zamkniętym, minimalizując ryzyko kontaminacji prób. Kluczowe cechy platformy Genie II IZOTERMICZNA AMPLIFIKACJA: identyfikacja DNA/RNA na poziomie molekularnym w izotermicznej amplifikacji w czasie 15 minut CZUŁOŚC ANALIZ: wysoce czuły układ optyczny do wykrywania zjawiska fluorescencji i luminescencji DWA NIEZALEŻNE BLOKI: dwa niezależne od siebie bloki grzewcze z precyzyjną kontrolą temperatury do 99 C GRADIENT TEMPERATUROWY: przeprowadzenie gradientu temperaturowego w ramach jednego lub dwóch bloków pozwala na precyzyjną optymalizację reakcji ELASTYCZNOŚĆ: kompaktowe, lekkie i całkowicie przenośne urządzenie z zasilane akumulatorem umożliwiającym całodzienną pracę bez podłączania do sieci elektrycznej NIEZLEŻNOŚĆ: praca bez komputera, za pomocą dużego panelu dotykowego AKCESORIA: specjalnie zaprojektowane 8-probówkowe plastikowe stripy OPROGRAMOWANIE: oprogramowanie jest intuicyjne i bardzo proste w obsłudze ODCZYNNIKI: wygodne zestawy odczynników gotowych do użycia są zoptymalizowane pod aparat Genie II NISKIE KOSZTY: niska cena oraz koszty eksploatacji urządzenia 2

3 3 Genie II czyni analizę molekularną w czasie rzeczywistym prawdziwie mobilną, czułą i błyskawicznie szybką Genie II umożliwia przeprowadzenie izotermicznej amplifikacji z detekcją w czasie rzeczywistym na zasilanym akumulatorem urządzeniu o niskim poborze energii, nawet podczas pracy w terenie. Wbudowany w urządzenie akumulator umożliwia pracę przez cały dzień bez konieczności podłączania do sieci elektrycznej. Prowadzenie reakcji w systemie zamkniętym zapobiega jakiejkolwiek poamplifikacyjnej kontaminacji produktami reakcji LAMP. Oprogramowanie i optymalizacja Sterowanie urządzeniem przez 7 ekran dotykowy bez konieczności korzystania z komputera Prostota i intuicyjność oprogramowania Całkowicie zautomatyzowana interpretacja wyników Dołączone do urządzenia oprogramowanie do komputera Analiza w czasie rzeczywistym Obserwacja wyniku izotermicznej amplifikacji w czasie rzeczywistym Detekcja fluorescencji dzięki bardzo czułemu systemowi optycznemu LED Monitorowanie wszystkich barwników fluorescencyjnych o wzbudzeniu falą o długości 470 nm, a emisji powyżej 510 nm Analiza topnienia produktu amplifikacji Precyzyjna kontrola temperatury podczas poamplifikacyjnej analizy produktów LAMP Ocena specyficzności reakcji 3

4 4 Identyfikacja materiału genetycznego Deinococcus radiodurans na platformie Genie II Ustawienie parametrów reakcji LAMP 5-10 minut na przygotowanie mieszaniny reakcyjnej dla 8 prób 30 minut na amplifikację w stałej temperaturze 65 C 7 minut na topienie produktów W zakresie temperatur C z zachowaniem spadku temperatury na poziomie 0,05 C/sekundę 47 minut od przygotowania reakcji do uzyskania wyniku analizy molekularnej! Krzywa amplifikacji LAMP Amplifikacja DNA Deinococcus radiodurans [0.2 ng/µl] Do kolejnych reakcji podano , oraz kopii plazmidu zawierającego amplifikowaną sekwencję DNA analizowanej bakterii Kontrole negatywne (NTC) są wolne od DNA bakteryjnego Analiza topnienia produktów LAMP Analiza temperatury topnienia produktów amplifikacji LAMP Jeden pik oznacza powstanie jednego specyficznego produktu reakcji, który topi się w temp. 90 C W kontrolach negatywnych NTC nie powstaje produkt amplifikacji 4

5 5 Firma NOVAZYM Polska pomaga we wdrożeniu techniki LAMP APARATURA AKCESORIA ODCZYNNIKI OptiGene Platforma Genie II Licencja programu LAMP Designer do projektowania starterów LAMP Izotermalne MasterMixy Enzymy PROJEKTOWANIE STARTERÓW NA INDYWIDUALNE ZAMÓWIENIE Startery dla pojedynczej sekwencji Startery dla alignmentu kilku sekwencji (wspólne lub różnicujące) PROJEKTOWANIE TESTÓW NA INDYWIDUALNE ZAMÓWIENIE TESTY DO SZYBKIEJ IDENTYFIKACJI PATOGENÓW TECHNIKĄ LAMP Bakterie (Salmonella spp, Bacillus anthracis) Wirusy (MDV, GCV, GPV) Pierwotniaki (Babesia canis, Toxoplasma gondii) TESTY DO IDENTYFIKACJI POSZCZEGÓLNYCH SKŁADNIKÓW W ŻYWNOŚCI Analiza składu mięsnych produktów spożywczych Analiza gatunkowa mięsa, umożliwiająca identyfikację: - koniny - dziczyzny - wołowiny - wieprzowiny - drobiu 5