Potencjał naukowo-badawczy Działu Genomiki i Biologii Molekularnej Zwierząt IZ PIB dr Agata Piestrzyńska-Kajtoch Laboratorium Genetyki Molekularnej Dział Genomiki i Biologii Molekularnej Instytut Zootechniki PIB Dzień Otwarty Klastra LifeScience 16 czerwiec 2016, Kraków
Dział Genomiki i Biologii Molekularnej Zwierząt Kierownik: Prof. dr hab. Monika Bugno-Poniewierska Laboratorium Genomiki Laboratorium Genetyki Molekularnej Projekty naukowo-badawcze NCN Projekty badawczo-rozwojowe NCBiR Usługi dla podmiotów zewnętrznych Ekspertyzy sądowe Współpraca krajowa i międzynarodowa Kształcenie doktorantów i magistrantów Wolontariaty i praktyki studenckie
Laboratorium Genomiki Doskonaleniem metod oceny genomowej Ustalanie genotypów dla genomowego panelu markerów SNP w ramach programu selekcji genomowej Identyfikacja podłoża genetycznego cech produkcyjnych z zastosowaniem wysokowydajnych technik analiz genomu Identyfikacja zmian strukturalnych oraz funkcjonalnych w genomach zwierząt Analiza metylacji genomów Ocena profilu ekspresji oraz zmian w transkryptomie zachodzących pod wpływem różnych czynników Ocena profilu ekspresji mirna oraz identyfikacja nieznanych cząstek mirna występujących w różnych tkankach
Laboratorium Genetyki Molekularnej Wykorzystanie polimorfizmu sekwencji mikrosatelitarnych DNA do charakterystyki struktury genetycznej różnych ras zwierząt gospodarskich oraz oceny zmienności genetycznej populacji Kontrola rodowodów zwierząt gospodarskich Identyfikacja komponentów zwierzęcych w mięsie, paszach i produktach spożywczych na podstawie polimorfizmu mitochondrialnego DNA Analiza polimorfizmu genów w aspekcie poszukiwania markerów powiązanych z różnymi cechami m.in. chorobami genetycznymi zwierząt gospodarskich Analiza ekspresji genów i białek Analiza kariotypu zwierząt gospodarskich Hodowle kultur tkankowych oraz linii komórkowych pierwotnych i immortalizowanych LGM jest laboratorium akredytowanym przez Polskie Centrum Akredytacji (PCA) certyfikat AB1587 oraz przez International Committee for Animal Recording (ICAR).
Projekty i Współpraca NCBiR - Projekt w ramach programu BIOSTRATEG pt. Kierunki wykorzystania zasobów genetycznych zwierząt gospodarskich w warunkach zrównoważonego rozwoju NCN nr 2014/15/B/NZ9/01933 pt. "Epidemiologia afrykańskiego pomoru świń (ASF) w populacji dzika (Sus scrofa) - rola struktury przestrzennej, socjalnej i genetycznej populacji gospodarza" Instytut Biologii Ssaków PAN w Białowieży 2014/13/B/NZ9/02134 Ocena wpływu żywienia rożnymi rodzajami tłuszczu na zmiany transkryptomu, poziomu metylacji wysp CpG oraz profil mikrorna w tkankach świni NCN 2014/15/D/NZ9/05256 Analiza zmian profilu transkryptomicznego mięśni szkieletowych i krwi u koni czystej krwi arabskiej, pod wpływem treningu wyścigowego, w oparciu o metodę sekwencjonowania następnej generacji RNA-seq FBW - 07-4.01.7 - Charakterystyka genetyczna wybranych ras koni z zastosowaniem polimorfizmu sekwencji mikrosatelitarnych i markerów SNP Statut - 04-010.1 - Opracowanie metody skanowania genomu zwierząt gospodarskich w oparciu o sekwencjonowanie następnej generacji 04-008.1 Identyfikacja zmian na poziomie genomu w komórkach sarkoidowych koni NCN - N N311 406339 - Geny związane z metabolizmem białka prionowego i ocena ich wpływu na zmiany neurodegeneracyjne mózgu owiec współpraca z Państwowym Instytutem Weterynaryjnym PIB 07-4.06.7 Diagnostyka mikrorearanżacji kariotypu koni z wykorzystaniem techniki mikromacierzy CGH
Aparatura badawcza: HiScanSQ (Illumina) - sekwenator genomowy oraz skaner mikromacierzy Microarray Scanner System G2565CA (Agilent) - skanowanie mikromacierzy ekspresyjnych i CGH cbot (Illumina) - generacja klastrów biblioteki genomowej QuantStudio 12K Flex (Life Technologies) - wysoko przepustowa analiza SNP, HRM, oraz ekspresja genów QuantStudio 7 (Life Technologies) Sekwenatory kapilarne: GeneticAnalyzer 3130xl oraz 3500xL (Applied Biosystems) - sekwencjonowanie, analiza markerów mikrosatelitarnych i polimorfizmu typu SNP 14 Termocyklerów m.in.: Veriti, SimpliAmp, GeneAmp 9700 (Life Technologies), T300 (Biometra). StepOnePlus Real-Time PCR System, Real-time 7500 (Life Technologies) oraz Eco Real-time PCR System (Illumina) - analiza SNP i ekspresji genów NanoDrop2000, Qubit (ThermoFisher Scientific) oraz TapeStation 2200 (Agilent) Spektrofotometr do analizy białek ELISA EL808 (BIOTEK) Cieplarka z wytrząsarką Innova 42Shaker M1335-0012 (Eppendorf) 6 Mikroskopów m.in.: Axioskop Opton EL-Einsalz 451485, Axio Imager D2 (Carl Zeiss), ECLIPSE WLA Ci-S (NIKON)
Zapraszamy do współpracy