Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii

Transkrypt

1 Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii dr hab. Piotr Ziółkowski Przegląd prac dyplomowych w Zakładach Instytutu Biologii Molekularnej i Biotechnologii

2 Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii IBMiB Finansowanie badań

3 BIOLOGIA MOLEKULARNA BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Biochemii Z. Biotechnologii Z. Biologii Genomu Z. Ekspresji Genów Z. Biotechnologii Z. Biologii Genomu Z. Eskpresji Genów Z. Biochemii Z. Bioenergetyki Z. Genetyki Mol. Człowieka Z. Biologii Obliczeniowej Z. Ekspresji Genów Z. Biologii Mol. i Komórk. Z. Genetyki Mol. Człowieka

4 Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Przemysław Wojtaszek

5 Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Przemysław Wojtaszek Skład osobowy: dr hab. Krzysztof Leśniewicz dr hab. Michał Rurek dr Anna Kasprowicz-Maluśki dr Tomasz Skrzypczak Kontakt tel przemow@amu.edu.pl Lokalizacja Pokoje:

6 Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej Tematyka badań: słowa kluczowe

7 Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej Przykładowe tematy prac dyplomowych Udział kompleksu gamma-sekretazy w regulacji endocytozy zwierzęcych receptorów błonowych Transformacja genetyczna organelli- osiągnięcia i perspektywy Lokalizacja tkankowa wybranych roślinnych nukleaz S1/P1

8 Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Hans Bluijssen

9 Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Hans Bluijssen Skład osobowy: Prof. dr hab. Joanna Wesoły dr Katarzyna Kluzek dr Adrian Paul Silesian Kontakt tel u.edu.pl Lokalizacja Pokoje:

10 Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka Tematyka badań: słowa kluczowe

11 Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka Przykładowe tematy pracy dyplomowych Mutacje w guzach jasnokomórkowego raka nerki Podstawy genetyczne pierwotnego nadciśnienia tętniczego Ekspresja genów STAT i SOCS u pacjentów z pierwotnym nadciśnieniem tętniczym

12 Zakład Bioenergetyki Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Wiesława Jarmuszkiewicz

13 Zakład Bioenergetyki Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Wiesława Jarmuszkiewicz Skład osobowy: prof. dr hab. Hanna Kmita dr Nina Antos-Krzemińska dr Andonis Karachitos dr Małgorzata Wojtkowska dr Andrzej Woyda-Płoszczyca Kontakt tel Lokalizacja Pokoje:

14 Zakład Bioenergetyki Tematyka badań: słowa kluczowe

15 Zakład Bioenergetyki Przykładowe tematy prac dyplomowych Konstrukcja kontroli metabolicznej dla komórek drożdżowego modelu choroby Huntingtona Elementy różnicujące funkcjonowanie komórek drożdżowego modelu choroby Huntingtona z ekspresją izoform ludzkiego białka VDAC Rola mitochondriów w procesie tanatozy

16 Zakład Biochemii Kierownik Zakładu: dr hab. Mikołaj Olejniczak, prof. UAM

17 Zakład Biochemii Kierownik Zakładu: dr hab. Mikołaj Olejniczak Skład osobowy: dr Joanna Wojtera dr Zuzanna Wróblewska Kontakt tel Lokalizacja Pokoje:

18 Zakład Biochemii Tematyka badań: słowa kluczowe

19 Zakład Biochemii Przykładowe tematy prac dyplomowych Regulacja translacji białek błonowych przez niekodujące RNA bakterii Klonowanie, nadekspresja i oczyszczanie bakteryjnych białek opiekuńczych oraz ich mutantów Struktura niekodujących RNA oraz ich oddziaływania z regulowanymi mrna u E.coli

20 Zakład Biotechnologii Kierownik Zakładu: dr hab. Agnieszka Ludwików, prof. UAM

21 Zakład Biotechnologii Kierownik Zakładu: dr hab. Agnieszka Ludwików, prof. UAM Skład osobowy: Prof. Jan Sadowski dr Agata Cieśla dr Arleta Małecka Kontakt tel Lokalizacja Pokoje: 1.90 i

22 Zakład Biotechnologii Tematyka badań: słowa kluczowe

23 Zakład Biotechnologii Przykładowe tematy prac dyplomowych Mechanizmy degradacji kinazy kaskady MAP- MAPKKK18 przez proteasom 26S Rola modyfikacji potranslacyjnych w regulacji stabilności białek Charakterystyka procesu formowania łańcuchów poliubikwitynowych

24 Zakład Biologii Genomu Kierownik Zakładu: dr hab. Piotr Ziółkowski

25 Zakład Biologii Genomu Kierownik Laboratorium: dr hab. Piotr Ziółkowski Skład osobowy: dr Tomasz Bieluszewski dr Anna Bieluszewska dr Małgorzata Jakubowicz dr Aneta Piechalak Kontakt tel Lokalizacja Pokoje: 1.92 i

26 Zakład Biologii Genomu Tematyka badań: słowa kluczowe

27 Zakład Biologii Genomu Przykładowe tematy prac dyplomowych Edycja genomu przy wykorzystaniu techniki CRISPR/Cas9 do pozyskania mutantów w genach związanych z rekombinacją mejotyczną Mapowanie czynników kontrolujących częstość rekombinacji mejotycznej u Arabidopsis thaliana Antyrekombinacyjna funkcja genów systemu MMR (mismatch repair)

28 Zakład Ekspresji Genów Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Zofia Szweykowska-Kulińska

29 Laboratorium Ekspresji Genów Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Zofia Szweykowska- Kulińska Skład osobowy: prof. dr hab. Artur Jarmołowski dr hab. Andrzej Pacak dr hab. Dorota Raczyńska dr Katarzyna Kruszka dr Izabela Sierocka dr Aleksandra Świda-Barteczka dr Dawid Bielewicz dr Michał Taube dr Jakub Dolata Kontakt tel Lokalizacja Pokoje:

30 Laboratorium Ekspresji Genów Tematyka badań: słowa kluczowe

31 Zakład Ekspresji Genów Przykładowe tematy prac dyplomowych Badania nad mechanizmem regulującym alternatywny splicing Rola splicingu w regulacji poziomu mikrorna znajdujących się w egzonach i intronach Oddziaływaniami wiążących RNA w regulacji biogenezy mikrorna

32 Laboratorium Terapii Genowej Kierownik Laboratorium: dr hab. Krzysztof Sobczak, prof. UAM Skład osobowy: dr Ewa Stępniak-Konieczna dr Agnieszka Piasecka dr Patryk Konieczny dr Katarzyna Taylor Kontakt tel Lokalizacja Pokoje:

33 Laboratorium Terapii Genowej Tematyka badań: słowa kluczowe

34 Laboratorium Systemów Ewolucyjnych Kierownik Laboratorium: prof. dr hab. Borys Wróbel Kontakt tel

35 Laboratorium Systemów Ewolucyjnych Przykładowe tematy prac dyplomowych Stworzenie oprogramowania pozwalającego na analizę czynności elektrycznej mięśni Wykorzystanie sztucznych sieci genowych w robotyce ewolucyjnej Wykorzystanie analizy czynności elektrycznej mięśni w rehabilitacji Kontakt tel

36 Laboratorium Biomolekularnych Interakcji i Transportu Kierownik Laboratorium: dr Jan Brezovský, prof. UAM Kontakt tel janbre@amu.edu.pl Lokalizacja Pokoje: & 1.126

37 Laboratorium Biomolekularnych Interakcji i Transportu Tematyka badań: słowa kluczowe

38 Laboratorium Biomolekularnych Interakcji i Transportu Przykładowe tematy prac dyplomowych Study of molecular mechanisms of mutations in biologically relevant enzymes underlying disease development Identification of bioactive small molecules of biomedically important proteins Computational protein engineering towards improved enzymes for biotechnologies

39 Laboratorium Bioinformatyki Strukturalnej Kierownik Laboratorium: prof. dr hab. Janusz Bujnicki Kontakt tel

40 Laboratorium Bioinformatyki Strukturalnej Tematyka badań: słowa kluczowe

41 Laboratorium Bioinformatyki Strukturalnej Przykładowe tematy prac dyplomowych Rozbudowa narzędzi bioinformatycznych do wizualizacji modelowania struktur kompleksów makromolekularnych Rozwój i zastosowanie metod komputerowego modelowania struktur kompleksów białek i kwasów nukleinowych Kontakt tel iamb@genesilico.pl

42 ZAKŁAD BIOLOGII OBLICZENIOWEJ kierownik zakładu: prof. dr hab. Wojciech Karłowski

43 Pracownicy P R O F. D R H A B. W O J C I EC H K A R Ł O W S K I D R M A R E K Z Y W I C K I D R M A C I E J S Z Y MA N S K I D R A N D R Z E J Z I E L E Z I NS K I Doktoranci A G N I E S Z K A T H O M PS O N M A R I AN N A P L U C I N S K A A G N I E S Z K A R A S I N S K A M E D HAT H E L M Y

44 PRZYKŁADOWE TEMATY PRAC DYPLOMOWYCH: Wykorzystanie technologii nowej generacji do analizy transkryptomów #06 Identyfikacja genów uzyskanych na drodze Horyzontalnego Transferu Biologia strukturalna cząsteczek RNA Nowoczesne metody porównywania sekwencji

45 RNA-SEQ GENY SIEROCE APLIKACJE INTERNETOWE ANALIZA SEKWENCJI BIOINFORMATYKA GENOMIKA HORYZONTALNY TRANSFER GENÓW NGS DOMENY BIAŁKOWE SEKWENCJONOWANIE STRUKTURA RNA BAZY DANYCH trna EWOLUCJA GENÓW

46 Strona domowa IBMiB:

47 PREZENTACJE ZNAJDZIESZ: