Katedra Biochemii Klinicznej UJ CM Zakład Biochemii Klinicznej (nr KIDL 2213) Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Patogenów, Zakładu Biochemii Klinicznej (nr KIDL: 2660) Pracownia Diagnostyki i Biochemii Zaburzeń Lipidów Zakładu Biochemii Klinicznej (nr KIDL 2659) Pracownia Immunochemii Zakładu Biochemii Klinicznej (nr KIDL: 2661) Zakład Diagnostyki Genetycznej i Nurigenomiki Pracownia Biologii Molekularnej i Diagnostyki Genetycznej Zakładu Diagnostyki (nr KIDL: 2214) Zakład Diagnostyki ( Medycyna Laboratoryjna) ) Pracownia Biochemii Zakładu Diagnostyki (nr KIDL: 2951)
JUMC Chair and Department of Clinical Biochemistry The Jagiellonian University Medical College (JUMC) Prof. dr hab. med. Aldona Dembińska-Kieć Office: Joanna Rusek Cell Culture and Immunofluorescence Microscopy Labs Urszula Razny Urszula Cialowicz Urszula Czech Anna Knapp Magdalena Korczynska Biochemistry Labs Anna Gruca Anna Zdzienicka Joanna Góralska Malgorzata Kwasniak Agnieszka Sliwa Outpatient Clinic of Lipid Disorders and Obesity Malgorzata Malczewska-Malec Malec Julita Stancel-Mozwillo Iwona Leszczynska-Golabek Dominika Siedlecka Molecular Biology and Genetics Lab Iwona Wybranska Barbara Nowak Anna Polus Beata Kiec-Wilk Teresa Staszel Magdalena Mikolajczyk Lukasz Kaczynski Dept and Chair of Metabolic Disease JUMC Dept and Chair of Endocrinology JUMC Dept.of Pathology JUMC MAŁOPOLSKIE CENTRUM BIOTECHNOLIOGII UJ LIP GENE Bioclaims consortium
Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Patogenów, Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL: 2660 Hodowle pierwotnych komórek oraz linii komórek nowotworowych Obrazowanie przyżyciowe procesów komórkowych (BIOIMAGER) Izolacja DNA, RNA, białek Badanie ekspresji genów techniką Real-Time PCR (7900HT Fast system) Badanie ekspresji genów w technice mikromacierzowej w oparciu o 7900 HF Fast System Wykrywanie zakażeń wirusowych, bakteryjnych lub grzybowych w oparciu o techniki RT-PCR Oznaczenia ilościowe i identyfikacja mikroorganizmów w lekach i żywności w oparciu o techniki RT-PCR Oznaczanie białek metodą western-blot Pracownia Diagnostyki i Biochemii Zaburzeń Lipidów Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL 2659 Oznaczenia ilościowe wolnych kwasów tłuszczowych Oznaczenia parametrów stresu oksydacyjnego Badanie funkcji metabolicznej mitochondriów (poziom zużycia tlenu elektroda tlenowa (OROBOROS), produkcja ATP) Pracownia Immunochemii Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL: 2661 Analiza cytokin, czynników wzrostu i hormonów metodami RIA i ELISA Wykonanie oznaczeń z wykorzystaniem cytofluorymetru przepływowego CANTO II Becton Dickinson (np. badanie apoptozy, badanie funkcji mitochondriów) Pracownia Biologii Molekularnej i Diagnostyki Genetycznej Zakładu Diagnostyki Genetycznej i Nurigenomiki nr KIDL: 2214 Wykrywanie mutacji punktowych za pomocą metody RFLP Wykrywanie mutacji punktowych za pomocą techniki Real-Time PCR Wykrywanie nowych lub znanych mutacji/polimorfizmów metodą sekwencjonowania Pracownia Biochemii Zakładu Diagnostyki nr KIDL: 2951 Markery i parametry związane z obrotem kostnym, interleukiny i chemokiny, czynniki wzrostowe, selektyny, proteazy i ich inhibitory; hormony, markery krzepnięcia i fibrynolizy, cząsteczki adhezyjne i in. Istnieje też możliwość wykonania podstawowych badań biochemicznych.
METODY BILOGII MOLEKULARNEJ: Sekwencjonowanie metodą cykliczną : 3130xl Genetic Analyzer, Applied Biosystems Badanie ekspresji genów: TaqMan Applied microarray system (TLDA) oparty na reakcji Real time Reakcja amplifikacji PCR (LabCycler), ocena jakości materiału genetycznego(spectrophotometer NanoDrop)
Analiza wybranych parametrów komórek z wykorzystaniem cytometrii przepływowej: p FACS Canto II firmy Becton Dickinson Pracownia hodowli komórek
Metody obrazowania komórek przy użyciu: mikroskopu BD Pathway 855 barwienie komórek utrwalonych ilościowe obrazowanie zmian ekspresji białek PAT, białek stresu ER, kropli lipidowych ADRP Koneksyna 43 Krople lipidowe Kalregulina Hoechst Białko Bodipy Wizualizacja ekspresji wybranych białek w komórkach SVF pod wpływem TNFα barwienie komórek przyżyciowe BD Pathway 855 High-Content Cell Analysis Workflow ilościowe obrazowanie zmian w potencjale błon mitochondrialnych (MMP, ΔΨ) ctrl CCCP Hoechst MMP EPA PA Zmiany MMP(ΔΨ) w komórkach SVF pod wpływem kwasów tłuszczowych
BADANIE FUNKCJI ENERGETYCZNYCH MITOCHONDRIÓW: Pomiar procesów oddechowych mitochondriów: elektroda tlenowrażliwa Oxygraph-2k OROBOROS Pomiar generacji ATP: metoda luminescencji z wykorzystaniem kitu: g j j y y ATP Lite,Parkin Elmer Kit oraz czytnika GENios TECAN Reader
Projekty Katedry Biochemii Klinicznej (2000-2009) zrealizowane w latach 2000-2008: INCO-COPERNICUS; POLONIUM. COST-918 Action: Body Weight and Energy Expenditure, Functional Food and Energy Expenditure COST-B17 action Insulin resistance, obesity and diabetes mellitus in the elderly COST -926 Impact of new technologies on the health benefits and safety of bioactive plant compounds DLARFID Dietary lipids as Risk Factors in Development. Mechanistic Issues QLK1-CT-2001-00183 Stem Cells Excellence Center in Poland, QLK3-CT-2002-30307 acronym STEC, Integrated project SC&CR RTD: "Application and Process Optimization of Stem Cell Products for Myocardial Repair" (Contract no: 502988). LIPGEN: Diet, genomics and the metabolic syndrome: an integrated nutrition, agro-food, social and economic analysis dietary fat modification, genotype and the metabolic syndrome (contract nr. FOOD-CT-2003-505944).
Projekty Katedry Biochemii Klinicznej (realizowane 2009/2010): COST- FA 0602- BIOACTVE FOOD COMPONENTS, MITOCHONDRIAL FUNCTION AND HEALTH COST BM 0602 Adipose tissue: A key target for prevention of the metabolic syndrome The European Network of Excellence: " The European Nutrigenomics Organisation linking genomics, nutrition and health research" NuGO (contract nr FP6-2004-506360) Lipid droplets as dynamic organelles connecting influx, efflux, and storage of lipids: Translational research towards human disease Lipid droplets LipidomicNet Ochrona przed zwyrodnieniem układu nerwowego: rola peptydów endogennych, L-argininy i kwasów tłuszczowych jako potencjalnych czynników modulujących czynność mitochondriów, zwiększających żywotność mózgu poddanego działaniu bodźców stresowych (PNRF-104-AI-1/07) BIOmarkers of Robustness of Metabolic Homeostasis for Nutrigenomics-derived Health CLAIMS Made on Food (FP7-KBBE-2009-3 nr 244995) Bioclaims
Zapraszamy do współdziałania z Katedrą Biochemii Klinicznej CM UJ w ramach projektu I t d li St di D kt ki Interdyscyplinarne Studia Doktoranckie Nauki molekularne dla medycyny