Siły mezoskopowe Oddziaływania w układach biologicznych

Podobne dokumenty
Informacje. Danuta Kruk. Pokój: D2/20. Telefon:

Guma Guma. Szkło Guma

ZJAWISKA ELEKTROMAGNETYCZNE

Chemia - laboratorium

Model wiązania kowalencyjnego cząsteczka H 2

Elementy teorii powierzchni metali

Fizyka dla Informatyki Stosowanej

FIZYKA 2. Janusz Andrzejewski

Roztwory buforowe (bufory) (opracowanie: dr Katarzyna Makyła-Juzak)

Fizyka 1- Mechanika. Wykład 10 7.XII Zygmunt Szefliński Środowiskowe Laboratorium Ciężkich Jonów

6. ph i ELEKTROLITY. 6. ph i elektrolity

- substancje zawierające swobodne nośniki ładunku elektrycznego:

Elektrostatyka. + (proton) - (elektron)

Obliczenia chemiczne. Zakład Chemii Medycznej Pomorski Uniwersytet Medyczny

PODSTAWY CHEMII INŻYNIERIA BIOMEDYCZNA. Wykład 2

Repetytorium z wybranych zagadnień z chemii

- w nawiasach kwadratowych stężenia molowe.

Reguły Paulinga. Krzysztof Burek Michał Oleksik

Podstawowe prawa opisujące właściwości gazów zostały wyprowadzone dla gazu modelowego, nazywanego gazem doskonałym (idealnym).

ogromna liczba małych cząsteczek, doskonale elastycznych, poruszających się we wszystkich kierunkach, tory prostoliniowe, kierunek ruchu zmienia się

dla której jest spełniony warunek równowagi: [H + ] [X ] / [HX] = K

cz. 1. dr inż. Zbigniew Szklarski

Ć W I C Z E N I E N R C-2

Wykład Półprzewodniki

PRZYKŁADOWE ROZWIĄZANIA ZADAŃ

Opis kwantowy cząsteczki jest bardziej skomplikowany niż atomu. Hamiltonian przy zaniedbaniu oddziaływań związanych ze spinem ma następującą postać:

EFEKT SOLNY BRÖNSTEDA

WARSZTATY olimpijskie. Co już było: Atomy i elektrony Cząsteczki i wiązania Stechiometria Gazy, termochemia Równowaga chemiczna Kinetyka

GRAWITACJA. przyciągają się wzajemnie siłą proporcjonalną do iloczynu ich mas i odwrotnie proporcjonalną do kwadratu ich odległości r.


INŻYNIERIA BIOMEDYCZNA

Kwas HA i odpowiadająca mu zasada A stanowią sprzężoną parę (podobnie zasada B i kwas BH + ):

Dodatkowe zagadnienia (dla zainteresowanych)


Podział ciał stałych ze względu na strukturę atomowo-cząsteczkową

Wykład Pojemność elektryczna. 7.1 Pole nieskończonej naładowanej warstwy. σ-ładunek powierzchniowy. S 2 E 2 E 1 y. ds 1.

KRYTERIA OCENIANIA ODPOWIEDZI Próbna Matura z OPERONEM. Chemia Poziom rozszerzony

20 ELEKTROSTATYKA. PRAWO COULOMBA.

Konkurs Chemiczny dla gimnazjalistów województwa zachodniopomorskiego w roku szkolnym 2014/2015. Etap wojewódzki

Atomy wieloelektronowe i cząsteczki

1 Hydroliza soli. Hydroliza soli 1

WIĄZANIA. Co sprawia, że ciała stałe istnieją i są stabilne? PRZYCIĄGANIE ODPYCHANIE

Chemia Nieorganiczna ćwiczenia CHC012001c Powtórzenie materiału II

Jądra atomowe jako obiekty kwantowe. Wprowadzenie Potencjał jądrowy Spin i moment magnetyczny Stany energetyczne nukleonów w jądrze Prawo rozpadu

NaOH HCl H 2 SO 3 K 2 CO 3 H 2 SO 4 NaCl CH 3 COOH

2. Oblicz gęstość pary wodnej w normalnej temperaturze wrzenia wody. (Odp. 0,588 kg/m 3 )

Zadania dodatkowe z konwersatorium z podstaw chemii Semestr letni, rok akademicki 2012/2013

Wiązania chemiczne. Związek klasyfikacji ciał krystalicznych z charakterem wiązań atomowych. 5 typów wiązań

Zasady obsadzania poziomów

Elektrodynamika Część 2 Specjalne metody elektrostatyki Ryszard Tanaś Zakład Optyki Nieliniowej, UAM

Temat 7. Równowagi jonowe w roztworach słabych elektrolitów, stała dysocjacji, ph

2. Właściwości kwasowo-zasadowe związków organicznych

29 Rozpraszanie na potencjale sferycznie symetrycznym - fale kuliste

POLITECHNIKA POZNAŃSKA ZAKŁAD CHEMII FIZYCZNEJ ĆWICZENIA PRACOWNI CHEMII FIZYCZNEJ

S. Baran - Podstawy fizyki materii skondensowanej Wiązania chemiczne w ciałach stałych. Wiązania chemiczne w ciałach stałych

Fizyka statystyczna Fenomenologia przejść fazowych. P. F. Góra

Elektrostatyka, cz. 1

Czy równowaga jest procesem korzystnym? dr hab. prof. nadzw. Małgorzata Jóźwiak

prof. dr hab. Małgorzata Jóźwiak

Elektrostatyka ŁADUNEK. Ładunek elektryczny. Dr PPotera wyklady fizyka dosw st podypl. n p. Cząstka α

ĆWICZENIE NR 4 PEHAMETRIA. Poznanie metod pomiaru odczynu roztworów wodnych kwasów, zasad i soli.

Stany skupienia materii

1 Kinetyka reakcji chemicznych

Układy zdyspergowane. Wykład 6

Wykład 15. Reinhard Kulessa 1

Mechanizm działania buforów *

VIII Podkarpacki Konkurs Chemiczny 2015/2016

Jak mierzyć i jak liczyć efekty cieplne reakcji?

Wykład 11 Równowaga kwasowo-zasadowa

Zadanie: 1 (1 pkt) Oblicz stężenie molowe jonów OH w roztworze otrzymanym przez rozpuszczenie 12g NaOH w wodzie i rozcieńczonego do 250cm 3

Atom (cząsteczka niepolarna) w polu elektrycznym

Równowagi jonowe - ph roztworu

Chemia I Semestr I (1 )

Równowagi w roztworach wodnych

Wykład z Chemii Ogólnej

RÓWNOWAGI W ROZTWORACH ELEKTROLITÓW

Inżynieria Środowiska

Za poprawną metodę Za poprawne obliczenia wraz z podaniem zmiany ph

Fizyka 1 Wróbel Wojciech. w poprzednim odcinku

Zadania dodatkowe z konwersatorium z podstaw chemii Semestr zimowy, rok akademicki 2018//2019 Część II Gazy.

Kryteria samorzutności procesów fizyko-chemicznych

1. Od czego i w jaki sposób zależy szybkość reakcji chemicznej?

Konkurs Chemiczny dla uczniów szkół podstawowych województwa zachodniopomorskiego w roku szkolnym 2018/2019. Etap wojewódzki

WIĄZANIA. Co sprawia, że ciała stałe istnieją i są stabilne? PRZYCIĄGANIE ODPYCHANIE

Fizyka 1- Mechanika. Wykład 5 2.XI Zygmunt Szefliński Środowiskowe Laboratorium Ciężkich Jonów

SZYBKOŚĆ REAKCJI CHEMICZNYCH. RÓWNOWAGA CHEMICZNA

HYDROLIZA SOLI. 1. Hydroliza soli mocnej zasady i słabego kwasu. Przykładem jest octan sodu, dla którego reakcja hydrolizy przebiega następująco:

Temat Ocena dopuszczająca Ocena dostateczna Ocena dobra Ocena bardzo dobra Ocena celująca. Uczeń:

LICEALIŚCI LICZĄ PRZYKŁADOWE ZADANIA Z ROZWIĄZANIAMI

KONDUKTOMETRIA. Konduktometria. Przewodnictwo elektrolityczne. Przewodnictwo elektrolityczne zaleŝy od:

Fizyka współczesna Co zazwyczaj obejmuje fizyka współczesna (modern physics)

Dysocjacja kwasów i zasad. ponieważ stężenie wody w rozcieńczonym roztworze jest stałe to:

AKADEMIA GÓRNICZO-HUTNICZA im. Stanisława Staszica w Krakowie OLIMPIADA O DIAMENTOWY INDEKS AGH 2017/18 CHEMIA - ETAP I

Konkurs Chemiczny dla gimnazjalistów województwa zachodniopomorskiego w roku szkolnym 2018/2019. Etap wojewódzki

Odp.: F e /F g = 1 2,

Elektrochemia jest to dział chemii fizycznej, obejmuje (wg. klasycznego podziału): Elektrodykę zajmuje się prawami chemicznymi, które powodują

ROZWIĄZUJEMY PROBLEM RÓWNOWAŻNOŚCI MASY BEZWŁADNEJ I MASY GRAWITACYJNEJ.

26 Okresowy układ pierwiastków

Transkrypt:

Siły mezosopowe Oddziaływania w uładach biologicznych Van de Waalsa wiązania wodoowe oddziaływania eletostatyczne flutuacje oddziaływania hydodynamiczne

Siły ohezyjne (spoistości) siły Van de Waalsa (dipole induowane) enegie ~ 1 J/mol zawsze obecne Siły pzyciągania wyniające z oddziaływania pomiędzy oscylującymi dipolami. Potencjał Van de Waalsa: V 1 n 1 1 n m E A, E 1 1 4( ) 1 6 n, ( E n 1 n m E 1 1 ) ( E m E ) moment dipolowy pzejścia ze stanu n do swantowane enegie stanów n i dla cząsteczi 1 i odległość między cząsteczą 1 i stała Hamaea A 1 6

Enegia oddziaływania (cm -1 ) Siły Van de Waalsa oddziaływują na odległościach > 1 nm i <.1 nm. Mogą być pzyciągające i odpychające. Nie są addytywne. Symulacje dynamii moleulanej poazują, że Oddziaływania między biomoleułami dobze opisuje Potencjał Lennada-Jones a : 1 E( ) R (Å) W optyce są to siły dyspesji (np. mm cząsteczi oloidalne w oztwoze). 6 odległość ównowagi sepaacji chaateystyczna stała enegii Np. (1): butan CH 3 CH CH CH 3 Temp. wzenia -.5 o C - metylopopan CH 3 CH CH 3 Temp. wzenia -11.7 o C CH 3 Siły dyspesji dla butanu > -metylopopanu (mogą być gęściej upaowane)

Atoms i- j eqm,ij ----------/ Å Eij / cal mol- 1 C1 / cal mol-1å1 C6 / cal mol-1å6 C-C 4..15 51658.4 18.8 C-N 3.75.155 119866.49 861.634784 C-O 3.6.173 8711.7 754.5951 C-S 4..173 95899.5 1418.896 C-H 3..55 918. 79.857949 N-C 3.75.155 119866.49 861.634784 N-N 3.5.16 54675.81 588.45 N-O 3.35.179 357365.541 55.67779 N-S 3.75.179 138347.74 994.93149 N-H.75.57 1581.989 48.939 O-C 3.6.173 8711.7 754.5951 O-N 3.35.179 357365.541 55.67779 O-O 3.. 3584.31 49.49673 O-S 3.6. 947676.68 87.71934 O-H.6.63 635.457 39.7598 S-C 4..173 95899.5 1418.896 S-N 3.75.179 138347.74 994.93149 S-O 3.6. 947676.68 87.71934 S-S 4.. 3355443. 1638.4 S-H 3..63 33611.8 9.117 H-C 3..55 918. 79.857949 H-N.75.57 1581.989 48.939 H-O.6.63 635.457 39.7598 H-S 3..63 33611.8 9.117 H-H.. 81.9.56 Stąd głeboość potencjału wzasta według olejności: HH << CH < NH < OH << CC < CN < CO < NN < NO < O

Np. () hel -69 C neon -46 C agon ypton -186 C -15 C neon xenon xenon -18 C adon -6 C Więsze moleuły są silniej związane: - więcej eletonów - więsze pzeywanie wyinduowanych dipoli

Enegia w oddziaływaniach Van de Waalsa zależy od geometii powiezchni. R1 D R w A R1R 6D ( R1 R ) w C 6 D D w Cp 3 6D A w 1D

R Wiązania wodoowe. (enegie ~ 1-4 J/mol Wiązania wodoowe O=C O H O H NH O=C Udział w twozeniu - micelli - błon biologicznych - stutuy białe R Wiązanie bifuacyjne Wiązania wodoowe: -donoowe: F H - aceptoowe: O H, N H, S H Cząsteczi wody twozą lasty. Enegia odpychania: W W e / Stefa hydatacyjna wymienna i uchoma, t ~ 1 ps. ~ nm

Oddziaływania eletostatyczne A. Nieeanowane q 1 q p Q q p 1 p jon - jon dipol - jon dipol - dipol Pawo Coulomb a (enegia E c pomiędzy dwoma puntowymi ładunami q i ): q1q 4 E c pzenialność dieletyczna

Oddziaływanie eletostatyczne pomiędzy dipolem a jonem: p q E p ( 4 ) 3T T enegia temiczna Oddziaływanie eletostatyczne pomiędzy dwoma dipolami: p1 pk E pp 3 4 K stała Oddziaływania wyższych zędów znacznie mniej pawdopodobne! Wiązania jonowe pomiędzy moleułami ~ 5 J/mol i są odpowiedzialne za oddziaływania daleozasięgowe.

Oddziaływania eletostatyczne B. Eanowane + - - - + - + - + + - - Rozład ładunu woół powiezchni negatywnie naładowanej. woda Idea eanowania pozwala spowadzić złożony poblem wielu ciał do poblemu oddziaływania dwóch ciał o zmodyfiowanym potencjale. Powiezchnie mogą aumulować ładune wsute: - adsopcji jonów do powiezchni - dysocjacji gup powiezchniowych. -COOH -COO - + H + (uwolniona enegia o.14t) m potencjał chemiczny (całowita enegia swobodna pzypadająca na moleułę) dla podwójnej wastwy otaczającej naładowany uł. wodny wynosi: m ze T log T ze enegia temiczna ładune zgomadzony na moleule gęstośc jonów podlegająca ozładowi Boltzmanna e e ze / T potencjał eletyczny m / T

Koncentacja jonów Równanie Poisson a (łączy gęstość swobodnego jonu z potencjałem eletostatycznym): d dx Równanie Poisson a-boltzmanna: ze d ze / T e dx O pzeciwnym ładunu O podobnym ładunu Odległość Oganiczenia stosowania tego pzybliżenia: - efety oelacji (pzeywanie się obitali eletonowych), - jony nie są puntami - chopowatość powiezchni - siły solwentu - siły obazowania (nieciągłości oddziaływań)

Ciśnienie pomiędzy dwoma naładowanymi powiezchniami w wodzie wynosi: ) ( ) ( ) ( ) ( S S S B T P odległość między powiezchniami oncentacja jonów w oztwoze Zależność ta obowiązuje, gdy nie ma dodatowych oddziaływań jonów z powiezchnią.

Zadanie: Rozwiązaniem ównania Pissona-Boltzmanna w odległości x od naładowanej powiezchni błony jest potencjał: 1 T ze log(cos x) chaateystyczna długość salowania definiująca eanowanie dana jest wzoem: ( ze) T Jeśli dwie powiezchnie o gęstości ładunu powiezchniowego.4 Cm - są od siebie odległe o D = nm, a odwócona długość eanowania Debye a wynosi 1.34x1 9 m -1, to ile wynosi powstałe między nimi ciśnienie odpychające?

Enegia oddziaływania Siły oddziaływania pomiędzy naładowanymi sfeami w oztwoze. Zasaująco doby opis cząstecze oloidalnych powstał w opaciu o teoię DLVO (Dejaguin, Landau, Vewey i Ovebee). Opisuje ompetencyjność sił pzyciągających Van de Waalsa i odpychających podwójnych powiezchni opis wielu uładów oloidalnych. Model załada addytywność potencjału Van de Waalsa i eletostatycznego dla sfeycznych cząstecze: Oddziaływania eletostatyczne Baiea enegetyczna V ( ) A11 B 1 A 11 B 64Tc e stała Hamaea dla siły Van de Waalsa pole powiezchni cząsteczi Siły Van de Waalsa Odległość Wtóne minimum c 1 tan( ze / 4 B T ) potencjał powiezchni długość eanowania Debye a oncentacja jonów soli w oztwoze

W wielu uładach oloidalnych zauważono, że stężenie oagulacyjne w niesończoności zależy od walencyjności pzeciwnych jonów, ja: 1/z 6. Potencjał oddziaływania pomiędzy dwoma sfeycznymi cząstami oddziałującymi pzy ustalonym potencjale powiezchniowym wynosi: 64TR W ( ) R pomień oloidu e AR 6 Wauni ytycznej oagulacji: W = i dw/d = (to = 1) z 6 3 T 5 A 4 i Y jest stałe dla dużego potencjału Czyli teoia DLVO opisuje espeymentalnie obsewowane maosopowo zjawiso oagulacji.

Ciśnienie Siły steyczne i flutuacje R Odległość między powiezchniami F upaowania ( ) Acos R e / R

Polimey na powiezchni mogą uzysiwać dodatowe siły steycznej entopii wyniające z entopii onfomacyjnej łańcucha (np. uchliwosc białe oddziałujących z błonami, DNA adsobowane w histonie, działanie enzymów). W uładach stabilizowanych polimeycznie, enegia odpychania pomiędzy powiezchniami na jednostę powiezchni wynosi: W ( ) R g 36Te / R g niezabuzony pomień polimeu odległość sepaacji powiezchni Ruchliwe polimey wpływają na siły steyczne oddziaływania tych powiezchni.

Siła/ pomień mn/m Odpychanie Doby ozpuszczalni Pzyciąganie 5 1 15 5 odległość [nm] Słaby ozpuszczalni Siła pomiędzy dwoma powiezchniami adsobującymi polimey. Siła entopii na jednostę powiezchni x R ( ) 1/ x P( ) ( ) B T ( ) ( ) odległość między powiezchniami gęstość objętościowa ontatów moleulanych

R x S R R S E b b b ) ( / x R 3 ) ( ) ( ) ( 4 T R T x T T P R R x T b B B B B B b b B pomień zywizny stała siłowa pole powiezchni stała Boltzmanna Siła oddziaływania pomiędzy dwoma błonami na jednostę powiezchni: Taie oddziaływania pomiędzy błonami występują np. podczas uchów peystaltycznych.