KRYTYCZNE STUDIA TAKSONOMICZNE
|
|
- Wiktor Majewski
- 9 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 KRYTYCZNE STUDIA TAKSONOMICZNE NAD ELYMUS REPENS (L.) GOULD Magdalena Szczepaniak Instytut Botaniki Polskiej Akademii Nauk im. W. Szafera w Krakowie, Zakład Systematyki Roślin Naczyniowych Wstęp Elymus repens (L.) Gould [=Agropyron repens (L.) P. Beauv.] perz właściwy jest pospolitym i bardzo uciążliwym chwastem, dobrze znanym rolnikom i działkowiczom. Badany gatunek jest włączany do krytycznego kompleksu traw Agropyron-Elymus, należącego do plemienia Triticeae [6]. Podział taksonomiczny w obrębie plemienia Triticeae Dumort. jest skomplikowany i problematyczny przede wszystkim ze względu na brak wyraźnych różnic morfologicznych pomiędzy rodzajami, a także na istnienie intensywnych procesów hybrydyzacji międzyrodzajowej i międzygatunkowej. Z tego powodu różni autorzy stosowali rozmaitą systematykę tego plemienia. Wśród proponowanych klasyfikacji Triticeae, Stebbins [10] i Löve [4] przedstawili skrajnie przeciwne rozwiązania tego problemu. Stebbins stworzył jeden duży rodzaj, do którego włączył wszystkie znane gatunki, natomiast Löve rozdzielił plemię na 39 rodzajów. Dyskusja na temat systematyki Triticeae jest kontynuowana i generalnie przyjmowany jest podział plemienia na kilka rodzajów, z uwzględnieniem różnego rodzaju cech: morfologicznych, anatomicznych, cytologicznych oraz genetycznych [15]. W różnych ujęciach taksonomicznych Elymus repens zaliczany był do rodzajów: Triticum L., Agropyron Gaertn., Elytrigia Desv. oraz Elymus L. [1, 5]. Elymus repens charakteryzuje się bardzo dużą zmiennością cech morfologicznych [6, 7]. W związku z tym różnie jest stosowana jego systematyka wewnątrzgatunkowa. Wyróżnia się przeważnie podgatunki i odmiany [1, 4, 5] lub też nie wydziela się jednostek wewnątrzgatunkowych [3, 7]. W związku z rozbieżnościami w taksonomicznym ujęciu poziomu zmienności wewnątrzgatunkowej, celem niniejszej pracy była szczegółowa rewizja systematyczna Elymus repens w Polsce, dokonana głównie na podstawie analizy zmienności morfologicznej. Wyniki analizy zmienności genetycznej, przeprowadzonej za pomocą metody Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP), zostały zamieszczone w odrębnej pracy [13], 15
2 jednocześnie uwzględniono je w dyskusji i wnioskowaniu dotyczącym poziomu i charakteru zmienności morfologicznej perzu właściwego. Materiał i metody Materiał do badań zróżnicowania morfologicznego Elymus repens został zebrany w latach z obszaru całej Polski z 44 stanowisk (rys. 1). Próby zebrano ze zróżnicowanych ekologicznie siedlisk, począwszy od miejsc wilgotnych nad rzekami, poprzez skraje lasów sosnowych i mieszanych, wydmy nadmorskie aż po siedliska ruderalne. Zbioru dokonywano w pełni sezonu wegetacyjnego od początku lipca do końca sierpnia, co zapewniało w pełni rozwinięte źdźbła i kłosy. Perz właściwy rozmnaża się intensywnie za pomocą kłączy, które czasem mogą na przestrzeni kilku kilometrów podziemnie opanować dane siedlisko. Podczas zbioru prób populacji, za umowny okaz, spełniający określoną rolę ekologiczną w populacji i środowisku, uznawano każdy przestrzennie ograniczony pęd nadziemny, posiadający samodzielny system korzeniowy, nawet jeśli wykazywał on związek z innymi pędami poprzez organy podziemne. Na każdym stanowisku zebrano losowo po pędów generatywnych, w odległości co najmniej 5 6 m, w celu zminimalizowania prawdopodobieństwa zebrania ramet pochodzących z tego samego kłącza (tej samej genety), a więc nieróżniących się genetycznie. R 71 R 70 R 43 R 69 R 46 R 65 R 67 R 88 R 35 R 72 R 47 R 63 R 64 R 89 R 101 R 48 R 61 R 86 R 33 R 32 R 95 R 73 R 31 R 94 R 60 R 49 R 1 R 91 R 57 R 106r R 11 R 10* R 56 R 55 R 7 R 8 R 14 R 16 R 81 R 13 R 75 R 78 R 99 R > 1000 m a.s.l. Rys. 1. Rozmieszczenie stanowisk badanych prób populacji Elymus repens (L.) Gould. 16
3 DLem DPal Każdy okaz z populacji lokalnej został szczegółowo scharakteryzowany na podstawie 41 cech ilościowych i 20 jakościowych (szczegółowo opisanych w pracy Szczepaniak [12]). Badane cechy zostały wybrane na podstawie kluczy do oznaczania roślin, oryginalnych prac dotyczących badanych gatunków oraz własnych obserwacji w terenie, w kulturach eksperymentalnych i materiałów zielnikowych. Mierzone i oceniane cechy dotyczyły budowy części wegetatywnych i generatywnych poszczególnych okazów. Sposób wykonania pomiarów cech kłosa i kłoska przedstawiono na rysunku 2. Do analizy włączono rośliny w pełni rozwinięte i niezniszczone. Okazy z 44 prób populacji Elymus repens zostały przeanalizowane biometrycznie pod kątem powyższych cech makromorfologicznych i były następnie przedmiotem analiz statystycznych. Ogółem zmierzono i oceniono 1181 okazów E. repens. Pomiar długości kłosa wykonywany był przy użyciu linijki z dokładnością do 0,5 mm, natomiast kłoski, kwiatki plewy i plewki mierzono przy użyciu mikroskopu binokularnego firmy Nikon, z dokładnością do 0,01 mm. LKwi DKł DK DM PG PD DOPD DOLem DPD SzPD Rys. 2. Sposób wykonywania pomiarów cech morfologicznych budowy kłosa i kłoska okazów Elymus repens, z dokładnością do 0,01 mm. Skróty cech: DK długość kłosa, DM długość międzywęźla, DKł długość kłoska, LKwi liczba kwiatków w kłosku, PG plewa górna, PD plewa dolna, DPD długość plewy dolnej, SzPD szerokość plewy dolnej, DPD/SzPD długość plewy dolnej/szerokości plewy dolnej (kształt), DOPD długość ości plewy dolnej, DLem długość plewki dolnej, SzLem szerokość plewki dolnej, DOLem długość ości plewki dolnej, DPal długość plewki górnej, SzPal szerokość plewki górnej. SzLem SzPal 17
4 Analiza statystyczna danych morfologicznych Zgodnie z założeniami taksonomii numerycznej [8] punktem wyjścia do stworzenia klasyfikacji w obrębie badanego gatunku był zbiór dużej liczby cech morfologicznych, bez ich wstępnego wartościowania i wyróżniania lepszych i gorszych cech [12]. Następnie, w celu stworzenia końcowego, praktycznego podziału taksonomicznego, zastosowano metody analizy statystycznej. Na podstawie uzyskanych wyników pewne cechy, odpowiednie dla różnych poziomów analizowanej zmienności, zostały wyłączone z analiz, posłużyły jednak do szczegółowego opisu poszczególnych taksonów [12]. Każdy okaz z populacji stanowił roboczą jednostkę taksonomiczną (Operational Taxonomic Unit OTU) [8]. Po sprawdzeniu rozkładów poszczególnych cech morfologicznych (zmiennych), okazało się, że w większości przypadków są one mniej lub bardziej zgodne z rozkładem normalnym lub log-normalnym, co potwierdziły testy Shapiro-Wilka. Cechy odbiegające od rozkładu normalnego transformowano logarytmicznie w celu spełnienia założeń zastosowanych następnie analiz wielowymiarowych [8]. Nie uśredniano wartości cech w obrębie poszczególnych prób ze względu na częste zróżnicowanie wewnątrzpopulacyjne niektórych z nich, natomiast wszystkie wartości cech poddano standaryzacji (średnia cechy standaryzowanej jest równa 0, a odchylenie 1). Standaryzacja pozwala na przekształcenie zmiennej mianowanej w zmienną niemianowaną i dzięki niej różne cechy mogą być ze sobą porównywane. Analizę składowych głównych (Principal Component Analysis PCA) przeprowadzono wstępnie dla wszystkich cech ilościowych i oparto na macierzy korelacji tych cech [8]. Metoda ta została zastosowana w celu stwierdzenia związków wewnątrzgatunkowych E. repens, wzajemnego uporządkowania populacji oraz redukcji dużej liczby wyjściowych cech (zmiennych). Na podstawie PCA wybrano cechy, które były wysoko skorelowane z pierwszymi trzema głównymi składowymi (r 0,60). Cechy te najbardziej różnicowały poszczególne taksony i najpełniej wyjaśniały istniejącą zmienność, niezależnie od klasyfikacji taksonomicznej. Zastosowano rotację czynników varimax, aby otrzymać najprostszą i czytelną strukturę czynników. W PCA próby populacji E. repens zostały pogrupowane bez żadnych wstępnych założeń (a priori). Natomiast za pomocą jednoczynnikowej analizy wariancji (one-way Analysis of Variance one-way ANOVA) testowano hipotezę zerową, że różnice pomiędzy średnimi dla wybranych cech w analizie składowych głównych są statystycznie istotne pomiędzy taksonomicznymi jednostkami wewnątrzgatunkowymi [9]. Poziom istotności zmierzono testem najmniejszych istotnych różnic (NIR) oraz testem Tukeya. Cechy ilościowe, które istotnie różniły morfotypy E. repens, zostały w następnym etapie analizy statystycznej wprowadzone do kanonicznej analizy dyskryminacyjnej (Canonical Discriminant Analysis CDA) [8]. CDA (z użyciem procedury postępującej krokowej) przeprowadzono dla poszczególnych okazów jako OTUs, w celu sprawdzenia mocy dyskryminacyjnej i przydatności taksonomicznej zbioru cech wybranych w poprzednich analizach oraz do odróżniania predefiniowanych grup (jednostek wewnątrzgatunkowych). Rozrzut w układzie kanonicznych funkcji dyskryminacyjnych oparty jest na 18
5 maksymalizowaniu zmienności międzygrupowej do zmienności wewnątrzgrupowej i oparty jest na statystyce F (Fishera-Snedecora). Oprócz uporządkowania również użyto analizy dyskryminacyjnej jako metody klasyfikującej, pozwalającej ocenić procent poprawnych klasyfikacji indywidualnych okazów do wyróżnionych taksonów. Analizy numeryczne cech biometrycznych wykonano przy użyciu programu STATISTICA wersja 5.1 PL. Wyniki Analiza składowych głównych Wyniki PCA pozwoliły na wyodrębnienie 11 cech z całego zbioru danych biometrycznych, umożliwiających wyróżnienie trzech grup populacji (morfotypów) Elymus repens, oraz określenie wzajemnych relacji (podobieństw bądź różnic) pomiędzy nimi. 11 wyróżnionych generatywnych cech morfologicznych budowy źdźbła: DK, DM, DKł, LKwi, DPD, SzPD, DPD/SzPD, DOPD, DLem, DOLem i DPal było wysoko skorelowanych z trzema czynnikami, z których pierwszy wyjaśniał 46,93%, drugi 16,29%, a trzeci 14,40% całkowitej wariancji cech (łącznie 77,62%; tab. 1). Tabela 1. Wyniki analizy składowych głównych (PCA) dla okazów Elymus repens wyjaśniana wariancja oraz ładunki czynnikowe dla 11 cech i 3 czynników. Pogrubioną czcionką zaznaczono wartości korelacji cech z czynnikami o r 0,60. Skróty cech patrz rys. 2. Czynnik 1 Czynnik 2 Czynnik 3 Wyjaśniana wariancja (%) 46,93 16,29 14,40 Cechy Ładunki czynnikowe DK 0,76 0,06 0,01 DM 0,74 0,13 0,01 DKł 0,89 0,08 0,12 LKwi 0,74 0,04 0,34 DPD 0,88 0,16 0,10 SzPD 0,47 0,09 0,81 DPD/SzPD 0,42 0,08 0,88 DOPD 0,10 0,92 0,05 DLem 0,90 0,08 0,09 DOLem 0,01 0,93 0,06 DPal 0,84 0,08 0,04 Na diagramie rozrzutu okazów Elymus repens, z 20 wybranych prób populacji (w ten sposób, by reprezentowały wszystkie wyróżniające się morfotypy), w układzie trzech pierwszych czynników (rys. 3) nie wyróżniają się wyraźnie oddzielone grupy. Jednak 19
6 analiza położenia poszczególnych prób populacji i okazów wykazała pewien trend określony przez cechy związane z poszczególnymi czynnikami. Z czynnikiem 2 związana jest cecha długości ości na plewach (DOPD) i plewkach dolnych (DOLem), które to cechy wyodrębniają okazy bezostne i ościste oraz wszystkie okazy pośrednie pomiędzy nimi (tab. 1; rys. 3). Zarówno okazy ościste, jak i bezostne są znacznie zróżnicowane pod względem cech wielkości skorelowanych z czynnikiem 1 (tab. 1). Czynnik 3 był istotnie związany z dwoma cechami (DPD/SzPD i SzPD) (tab. 1) i pozwolił na wyodrębnienie grupy okazów o wąskich, wydłużonych plewach ( szydlastych ), bezostnych lub krótkoościstych (populacje R 14, R 46, R 47, R 69 i R 70 (rys. 3). CZYNNIK 3 (14,40%) 4 E. repens var. subulatus 3 2 E. repens var. aristatus E. repens var. repens CZYNNIK 2 (16,29%) R 32 R 33 R 56 R 61 R 78 R 86 R 89 R 101 R 35 R 60 R 65 R 67 R 75 R 88 R 106 R 14 R 46 R 47 R 69 R 47 R 14 R 75 R 88 R 70 var. subulatus var. aristatus var. repens Rys. 3. Analiza składowych głównych (PCA) diagram rozrzutu okazów z 20 wybranych prób populacji Elymus repens (L.) Gould względem czynnika 2 i 3. W celu uzyskania przejrzystości wykresu przedstawiono rozrzut okazów z wybranych populacji tak, aby reprezentowane były wszystkie typy morfologiczne (odmiany) występujące w granicach zakresu zmienności E. repens. Poszczególne próby zaznaczono odrębnymi symbolami graficznymi znajdującymi się w legendzie. Rozmieszczenie zbioru prób populacji na rys. 1. Podsumowując, można stwierdzić, że w PCA wyróżniają się trzy grupy morfotypów w obrębie Elymus repens: bezostny lub krótkoościsty, długoościsty oraz morfotyp o szydlastych plewach, które jednak tworzą continuum zmienności. Poprawność wyróżnienia tych grup była analizowana w dalszej części pracy za pomocą odpowiednich metod statystycznych. 20
7 Jednoczynnikowa analiza wariancji Istotność różnic pomiędzy średnimi cech wyróżnionych w PCA analizowano przy pomocy jednoczynnikowej analizy wariancji. W przypadku 10 z 11 cech hipoteza zerowa, mówiąca o braku różnic pomiędzy ich średnimi, została odrzucona, a zatem trzy grupy różniły się istotnie pod względem tych cech. Wartości statystyki F dla poszczególnych cech były znacznie wyższe niż krytyczne F (F 0,05;2; = 4,60; tab. 2). Wyróżnione trzy morfotypy nie różniły się istotnie tylko pod względem jednej cechy: ilości kwiatków w kłosku środkowym (LKwi). Tabela 2. Wyniki jednoczynnikowej analizy wariancji przeprowadzonej dla prób populacji Elymus repens; wartość F dla 3 grup (df = 2) i 1181 okazów (df = 1178). Różnice istotne z p < 0,05 zaznaczono *. Cechy F F0,05 DOLem 1 601,79 * 4,60 DPD/SzPD 698,29 * 4,60 DOPD 375,30 * 4,60 DPD 120,09 * 4,60 DLem 84,18 * 4,60 SzPD 77,58 * 4,60 DPal 52,27 * 4,60 DK 20,81 * 4,60 DKł 19,60 * 4,60 DM 15,56 * 4,60 LKwi 1,03 4,60 Na podstawie uzyskanych wyników nie stwierdzono wyraźnych nieciągłości w badanym zbiorze populacji, dlatego też odróżniającym się grupom okazów przypisano rangę odmian (varietas). Wyróżniono trzy odmiany w obrębie Elymus repens: E. repens (L.) Gould var. repens, E. repens var. aristatus (Schreb. ex Baumg.) Melderis & D.C. McClint. oraz E. repens var. subulatus (Roem. & Schult.) Szczepaniak, comb. nova. Elymus repens w odmianie typowej ma bezostne, ostro zakończone plewy, albo z ością o długości co najwyżej 1,5 mm. Pod względem tej cechy (DOPD) var. repens jest podobna do var. subulatus, która jednak ma większy jej zakres (rys. 4). Okazy należące do E. repens var. aristatus można od pozostałych odmian odróżnić na podstawie długości ości na plewce dolnej (DOLem) zakresy zmienności tej cechy wykluczają się w wartościach średniej i odchylenia standardowego dla poszczególnych odmian (rys. 4). Natomiast E. repens var. subulatus charakteryzuje się długimi oraz wąskimi plewami, o charakterystycznym szydlastym kształcie (DPD/SzPD) i wąskim błoniastym brzegu (rys. 4). 21
8 Zakres zmienności tej cechy dla E. repens var. subulatus nie wchodzi w granice wartości średniej oraz odchylenia standardowego dla pozostałych odmian. Pozostałe, wyróżnione w analizie wariancji cechy w mniejszym stopniu rozróżniają poszczególne odmiany. Można jedynie zwrócić uwagę na fakt, że E. repens var. aristatus ma generalnie dłuższe ości na plewach (DOPD), a E. repens var. subulatus zwykle dłuższe plewy (DPD) i w związku z tym dłuższe plewki (rys. 4). [mm] DOLem 12,0 11,5 11,0 10,5 10,0 9,5 9,0 8,5 8,0 7,5 7,0 6,5 6,0 5,5 5,0 4,5 4,0 3,5 3,0 2,5 2,0 1,5 1,0 0,5 0,0-0,5-1,0-1,5-2,0 maks. min. średnia; średnia + odch. std. średnia odch. std. var. aristatus var. repens var. subulatus DPD/SzPD 8,5 8,0 7,5 7,0 6,5 6,0 5,5 5,0 4,5 4,0 3,5 3,0 2,5 var. aristatus var. repens var. subulatus [mm] 5,5 DOPD 5,0 4,5 4,0 3,5 3,0 2,5 2,0 1,5 1,0 0,5 0,0-0,5 var. aristatus var. repens var. subulatus [mm] 14,0 13,5 13,0 12,5 12,0 11,5 11,0 10,5 10,0 9,5 9,0 8,5 8,0 7,5 7,0 6,5 6,0 5,5 5,0 4,5 4,0 DPD var. aristatus var. repens var. subulatus Rys. 4. Średnie arytmetyczne, odchylenia standardowe, minimum i maksimum dla 4 cech (DOLem, DPD/SzPD, DOPD, DPD) najlepiej odróżniających odmiany Elymus repens var. aristatus, var. repens i var. subulatus. Skróty cech patrz rys. 2. Kanoniczna analiza dyskryminacyjna Przeprowadzona kanoniczna analiza dyskryminacyjna (procedura krokowa) potwierdziła wybór 10 (z 11) cech ilościowych na podstawie PCA, które umożliwiają rozróżnienie odmian Elymus repens (tab. 3). 22
9 Tabela 3. Wyniki kanonicznej analizy dyskryminacyjnej (CDA) dla okazów Elymus repens jako OTUs; wartości mocy dyskryminacyjnej dla 10 wybranych cech ilościowych odróżniających odmiany, p < 0,05. Skróty cech patrz rys. 2. Cechy lambda Wilksa Cząstkowa lambda Wilksa DOLem 0,39 0,26 DPD/SzPD 0,12 0,83 SzPD 0,11 0,92 DPD 0,11 0,92 DK 0,11 0,96 DM 0,10 0,98 DKł 0,10 0,99 DPal 0,10 0,99 DLem 0,10 0,99 LKwi 0,10 1,00 Długość ości na plewie dolnej (DOPD) została na podstawie założeń wyłączona z analizy dyskryminacyjnej, jako cecha niewyróżniająca odmian Elymus repens. Wartości cząstkowej lambdy Wilksa wskazują, że cechami najlepiej dyskryminującymi odmiany są: długość ości na plewce dolnej (DOLem) oraz stosunek długości plewy dolnej do jej szerokości (DPD/SzPD) (tab. 3). Pozostałe cechy (oprócz LKwi) w mniejszym stopniu rozróżniają odmiany, ale są istotne statystycznie 1. Uzupełniając wyniki otrzymane w analizie wariancji, można stwierdzić, że liczba kwiatków w kłosku środkowym (LKwi) oraz długość ości na plewach (DOPD) nie różnią się istotnie u badanych odmian Elymus repens. Wartości współczynników struktury kanonicznej (tab. 4) wskazują, że z pierwszą kanoniczną funkcją dyskryminacyjną związana jest długość ości na plewce dolnej (DOLem), która wyraźnie wyodrębnia Elymus repens var. aristatus od E. r. var. repens i E. r. var. subulatus (rys. 5). Z drugą funkcją dyskryminacyjną wysoko, ujemnie skorelowany jest kształt plew (DPD/SzPD), który wyodrębnia E. repens var. subulatus. Wymienione cechy są również wysoko skorelowane z czynnikami w PCA oraz posiadają wysokie wartości statystyki F. Pozostałe cechy są słabiej skorelowane z funkcjami dyskryminacyjnymi, można je jednak traktować pomocniczo przy opisie E. repens var. subulatus, która charakteryzuje się długimi i wąskimi plewami oraz długimi plewkami. Dwie pierwsze funkcje dyskryminacyjne wyjaśniają 100% zmienności w badanym materiale populacyjnym. 1 Wartości cząstkowej lambdy Wilksa mieszczą się w zakresie od 1,0 (zmienna nie ma żadnej mocy dyskryminacyjnej) do 0,0 (zmienna całkowicie dyskryminuje dany model). 23
10 Tabela 4. Wyniki kanonicznej analizy dyskryminacyjnej (CDA) dla okazów Elymus repens jako OTUs; współczynniki struktury czynnikowej, reprezentujące korelacje pomiędzy cechami morfologicznymi a pierwszymi dwoma kanonicznymi funkcjami dyskryminacyjnymi (CAN 1 CAN 2). Skróty cech patrz rys. 2. Kanoniczna funkcja dyskryminacyjna CAN 1 CAN 2 Cechy DK 0,03 0,15 DM 0,00 0,14 DKł 0,04 0,14 LKwi 0,02 0,01 DPD 0,12 0,34 SzPD 0,03 0,31 DPD/SzPD 0,13 0,90 DOPD 0,44 0,12 DLem 0,04 0,32 DOLem 0,93 0,11 DPal 0,05 0, CAN CAN 1 Rys. 5. Kanoniczna analiza dyskryminacyjna (CDA) diagram rozrzutu 1181 okazów Elymus repens (L.) Gould jako OTUs względem funkcji dyskryminacyjnych (CAN 1 CAN 2); - E. repens var. repens, E. repens var. aristatus, + E. repens var. subulatus. Na podstawie wybranych wcześniej cech utworzono w analizie dyskryminacyjnej tzw. macierz klasyfikacji, która opisuje rzeczywistą klasyfikację okazów do wyróżnionych odmian (tab. 5). Stwierdzono, że poszczególne odmiany były w dużym procencie poprawnie klasyfikowane w grupie Elymus repens var. repens 616 okazów (co stanowi 94,04%) zostało poprawnie oznaczonych, zaś 36 zaliczono błędnie do E. r. var. subulatus, a 3 do E. r. var. 24
11 aristatus. Podobnie w przypadku E. r. var. subulatus, 161 okazów zaliczono poprawnie (93,06%), a błędnie 7 włączono do E. r. var. aristatus i 5 do E. r. var. repens. Natomiast 328 okazów (92,92%) E. r. var. aristatus było poprawnie zaliczonych, pozostałe zaklasyfikowano do E. r. var. repens (19 okazów) oraz do E. r. var. subulatus (6 okazów). Tabela 5. Wyniki kanonicznej analizy dyskryminacyjnej (CDA); macierz klasyfikacji okazów do poszczególnych odmian Elymus repens. Odmiana E. repens var. repens E. repens var. aristatus E. repens var. subulatus Klasyfikacja okazów (liczba okazów / % poprawnych klasyfikacji do danej odmiany) E. repens E. repens E. repens var. repens var. aristatus var. subulatus 616 / 94,04 3 / 0,46 36 / 5,50 19 / 5, / 92,92 6 / 1,70 5 / 2,89 7 / 4, / 93,06 Podobieństwo wyników uzyskanych w CDA i PCA potwierdza wybór cech diagnostycznych dla wydzielonych odmian Elymus repens (rys. 4, 5). Wysoki procent poprawnych oznaczeń również wskazuje, że poszczególne odmiany są odróżnialne i dobrze opisywane za pomocą wybranych cech morfologicznych (tab. 5). Okazy błędnie klasyfikowane potwierdzają dużą zmienność E. repens i brak wyraźnych nieciągłości pomiędzy zaobserwowanymi morfotypami. Dyskusja Elymus repens jest gatunkiem bardzo polimorficznym, przede wszystkim w wyniku szerokiego rozmieszczenia prawie na całej kuli ziemskiej. Melderis we Flora Europaea [5] w obrębie Elymus repens (L.) Gould wyróżnił 5 podgatunków, z których tylko E. repens subsp. repens występuje w Polsce. Pozostałe podgatunki występują w Europie południowej, na Ukrainie, w Rosji i dalej na wschód sięgają do Azji. Conert [1] w dziele Ilustrierte Flora von Mitteleuropa, oprócz podgatunku typowego, podaje również występowanie Elymus repens subsp. littoreus (F. C. Schumacher) Conert w Europie, na wybrzeżu Morza Śródziemnego oraz Bałtyku. W czasie przeprowadzonych badań biometrycznych stwierdzono wysoki poziom międzyi wewnątrzpopulacyjnej zmienności Elymus repens, wykazany za pomocą jedno- i wielowymiarowych analiz statystycznych. Stwierdzono, że zmienność morfologiczna E. repens ma charakter ciągły, skrajne morfotypy są dobrze odróżnialne, jednak pomiędzy nimi istnieje cała gama przejść, tworzących continuum zróżnicowania. Według Prokudina [7] E. repens jest taksonem młodym ewolucyjnie, tworzącym złożony kompleks, w obrębie którego ciągle przebiegają procesy mikroewolucyjne, i w związku z tym wyróżniane jednostki wewnątrzgatunkowe nie mają znaczenia taksonomicznego. Jednak ze względów 25
12 praktycznych wyróżnienie odmian na podstawie najbardziej odróżniających cech: długości ości na plewach i plewkach dolnych oraz kształtu plew, wydaje się być uzasadnione, co potwierdzono w analizie dyskryminacyjnej wysokim procentem poprawnych klasyfikacji okazów do poszczególnych morfotypów. Rezultaty uzyskane za pomocą AFLP odzwierciedlają niski poziom wewnątrzgatunkowej zmienności genetycznej Elymus repens [13]. Świadczy o tym także niska proporcja wyróżnialnych genet (średnia G/N dla E. repens wynosi 0,29 zakres: 0,10 0,50 [13]), a w szczególności także niski poziom zróżnicowania genetycznego (D: dla E. repens średnia wynosi 0,32 (0,00 0,78) [13]). Stwierdzono, że populacje E. repens składają się z jednego lub najwyżej kilku genotypów i różnią się znacznie między sobą. Nowe populacje są zakładane przez niewielką ilość nasion bądź fragmentów kłączy, które następnie rozmnażają się głównie wegetatywnie. Analiza wariancji molekularnej (AMOVA) wykazała, że pomiędzy morfologicznymi odmianami Elymus repens nie ma istotnych różnic genetycznych [13]. Również wyniki testu Mantela wykazały brak istotnej korelacji pomiędzy morfotypami a strukturą genetyczną (r = 0,58, P > 0,13). Te wyniki oraz niski poziom zróżnicowania AFLP mogą wskazywać, że przyczyną wyraźnego morfologicznego polimorfizmu jest plastyczność gatunku [3, 14]. E. repens tworzy ekokliny (ekotypy fizjologiczne) i wykazuje zmienność wzdłuż gradientu ekologicznego. Wykazano, że siedliska jego występowania w sposób ciągły przechodzą jedne w drugie, a lokalne populacje przystosowują się genetycznie do różnych warunków, co nie jest jednak skorelowane z określonym morfotypem [12]. Uzyskane wyniki zgadzają się z wcześniejszymi pracami dotyczącymi Elymus repens, w których wykazano, że plastyczność tego taksonu daje mu ogromne możliwości adaptacyjne do zmieniających się i nieprzewidywalnych czynników siedliskowych [14]. Gatunki o szerokiej amplitudzie ekologicznej tworzą mozaikę wielu cech osobniczych (morfologicznych oraz fizjologicznych), a także różnią się sposobem reprodukcji [7]. Naturalna selekcja może faworyzować bardziej plastyczne genotypy, które łatwo przystosowują się do zmian w środowisku [14]. U E. repens zdolność do ekspresji genotypu w postaci różnych fenotypów jest znacznie większa niż zróżnicowanie genetyczne. Taki wzór zmienności jest charakterystyczny również dla innych gatunków obcopylnych o szerokim zasięgu występowania [7]. Zróżnicowanie morfologiczne może być również skutkiem mutacji somatycznych zachodzących w rametach jednej genety, co również potwierdza dużą mobilność genomu Elymus repens [3]. U gatunków klonalnych często obserwuje się ograniczenie rozmnażania płciowego, a zróżnicowanie genetyczne spowodowane jest nagromadzeniem mutacji somaklonalnych w przeciągu wieloletniego życia poszczególnych genet. Ramety są bardzo ściśle genetycznie do siebie podobne, ale nie muszą być identyczne. AFLP jest wysoce powtarzalną techniką do wykrywania polimorfizmów, nawet u blisko spokrewnionych taksonów. Jest to odpowiednia metoda do identyfikacji różnych genotypów, jednak nie jest dosyć czuła dla wykrycia mutacji somatycznych pomiędzy indywiduami pochodzącymi z jednej genety. Zastosowanie markerów mikrosatelitarnych prawdopodobnie będzie bardziej użyteczne do dokładniejszej oceny poziomu zróżnicowania genetycznego E. repens, co zostało potwierdzone w badaniach nad innymi gatunkami rodzaju Elymus [11]. 26
13 Szczegółowa analiza morfologiczna jest niezbędna do oceny istotności poziomu zmienności w trudnych kompleksach gatunków, jakim niewątpliwie jest Elymus repens. Wielowymiarowe analizy statystyczne (np. PCA, ANOVA, CDA) są stosowane do określenia, czy zmienność ma charakter ciągły czy też nie. Odkrycie mniej lub bardziej ciągłej i przypadkowej zmienności cech morfologicznych pomiędzy spokrewnionymi gatunkami jest prawdopodobnie częstym wzorem w naturze, ponieważ fenotypowa ekspresja takich cech jest zwykle warunkowana wieloma genami [2]. Cechy, które przypadkowo zmieniają się w obrębie taksonu, ukrywają informację dostarczaną przez taksonomicznie istotne cechy. Zastosowanie jednocześnie szczegółowej analizy molekularnej i morfologicznej jest użytecznym narzędziem do rozwikłania problemów taksonomii wewnątrzgatunkowej. Gdy interpretuje się wspólnie te dwa rodzaje danych, niektóre problemy tradycyjnej morfometrii mogą zostać ominięte, np. takie jak kryteria wyboru odpowiedniej ilość cech. Znany jest również genetyczny składnik zmienności morfologicznej obserwowanej w naturze. W przypadku Elymus repens okazało się, że wspólne analizy biometryczne i genetyczne pozwoliły na wyjaśnienie podstaw i charakteru różnego rodzaju zmienności między- i wewnątrzgatunkowej. Wnioski Na podstawie zmienności cech morfologicznych (głównie), a także zmienności genetycznej oraz w oparciu o światowe trendy w systematyce i nomenklaturze kompleksu Agropyron-Elymus przedstawiono nową dla Polski systematykę Elymus repens: Elymus repens (L.) Gould var. repens var. aristatus (Schreb. ex Baumg.) Melderis & D.C. McClint. var. subulatus (Roem. & Schult.) Szczepaniak, comb. Nova. Zmienność morfologiczna Elymus repens ma charakter ciągły, można jednak wyodrębnić morfotypy, którym nadano rangę odmian. Cechami istotnie odróżniającymi odmiany E. repens są: długość ości na plewkach dolnych kształt plew Występowanie odmian Elymus repens na terenie Polski nie jest skorelowane z określonym typem siedliska ani też z położeniem geograficznym. Wykazano, że Elymus repens charakteryzuje się znacznie wyższym polimorfizmem morfologicznym niż zróżnicowaniem genetycznym, co może być spowodowane młodością ewolucyjną gatunku i zachodzącymi w nim procesami mikroewolucyjnymi. Odmienna ekspresja tego samego składu genomowego w różnych warunkach może być przyczyną ogromnej mozaiki morfologicznej gatunku. Jednoczesne stosowanie różnorodnych metod, rozszerzających zakres badań klasycznej taksonomii (a zwłaszcza analizy genomu), pozwala na uzyskanie odpowiedzi na pytania dotyczące istoty różnego poziomu zmienności i ich wzajemnych powiązań. 27
14 Bibliografia (wybrane pozycje) 1. Conert, H. J. (ed.) Gustav Hegi Illustrierte Flora von Mitteleuropa. Spermatophyta: Angiospermae: Monocotyledones 1 (2), Poaceae. Band I, teil 3. Parey Buchverlag, Berlin. 928 pp. 2. Fjellheim, S., Elven, R., Brochmann, C Molecules and morphology in concert. II. The Festuca brachyphylla complex (Poaceae) in Svalbard. Amer. J. Bot. 88(5): Kosina, R Comments on the variation of spike morphology in selected species of Elytrigia and Elymus (Triticeae). Acta Soc. Bot. Pol. 64(4): Löve, Á Conspectus of the Triticeae. Feddes Repert. 95(7/8): Melderis, A Taxonomic notes on the tribe Triticeae (Gramineae), with special reference to the genera Elymus L. sensu lato, and Agropyron Gaertner sensu lato. W: V. H. Heywood (ed.), Flora Europaea Notulae Systematicae ad Floram European spectantes No. 20. Bot. J. Linn. Soc. 76(4): Mizianty, M., Frey, L., Szczepaniak, M The Agropyron-Elymus complex (Poaceae) in Poland: biosystematics. W: L. Frey (ed.), Studies on grasess in Poland. pp W. Szafer Institute of Botany, Polish Academy of Sciences, Kraków. 7. Prokudin, Yu. N Itogi kompleksnovo biosystematicheskovo izucheniya Elytrigia repens (Poaceae). Bot. Žurn. 67(2): Sneath, P. H., Sokal, R. R Numerical taxonomy. W. H. Freeman, San Francisco. xv pp. 9. Sokal, R. R., Rohlf, F. J Biometry. 2nd Ed. W. H. Freeman, New York. 859 pp. 10. Stebbins, G. L Taxonomy and the evolution of genera, with special reference to the family Gramineae. Evolution 10: Sun, G. L., Diaz, O., Salomon, B., Bothmer, R. von Genetic diversity and structure in a natural Elymus caninus population from Denmark based on microsatellite and isozyme analyses. Pl. Syst. Evol. 227: Szczepaniak, M Biosystematyka Elymus repens (L.) Gould i Elymus hispidus (Opiz) Melderis w Polsce. Praca doktorska, Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN, Kraków. ss Szczepaniak, M., Cieślak, E., Bednarek, P. T morphological and AFLP variation of Elymus repens (L.) Gould (Poaceae). Cell. Mol. Biol. Letters 7(2A): Taylor, D. R., Aarssen, L. W An interpretation of phenotypic plasticity in Agropyron repens (Gramineae). Amer. J. Bot. 75(3): West, J. G., McIntyre, C. L., Appels, R Evolution and systematic relationships in the Triticeae (Poaceae). Pl. Syst. Evol. 160 (1/2):
Magdalena Szczepaniak
ZMIENNOŚĆ MORFOLOGICZNA ELYMUS HISPIDUS (OPIZ) MELDERIS Magdalena Szczepaniak Zakład Systematyki Roślin Naczyniowych, Instytut Botaniki Polskiej Akademii Nauk im. W. Szafera, Kraków 1 WSTĘP Perz siny Elymus
Wprowadzenie do analizy dyskryminacyjnej
Wprowadzenie do analizy dyskryminacyjnej Analiza dyskryminacyjna to zespół metod statystycznych używanych w celu znalezienia funkcji dyskryminacyjnej, która możliwie najlepiej charakteryzuje bądź rozdziela
Elementy statystyki wielowymiarowej
Wnioskowanie_Statystyczne_-_wykład Spis treści 1 Elementy statystyki wielowymiarowej 1.1 Kowariancja i współczynnik korelacji 1.2 Macierz kowariancji 1.3 Dwumianowy rozkład normalny 1.4 Analiza składowych
Wprowadzenie do analizy korelacji i regresji
Statystyka dla jakości produktów i usług Six sigma i inne strategie Wprowadzenie do analizy korelacji i regresji StatSoft Polska Wybrane zagadnienia analizy korelacji Przy analizie zjawisk i procesów stanowiących
Zmienne zależne i niezależne
Analiza kanoniczna Motywacja (1) 2 Często w badaniach spotykamy problemy badawcze, w których szukamy zakresu i kierunku zależności pomiędzy zbiorami zmiennych: { X i Jak oceniać takie 1, X 2,..., X p }
Zadania ze statystyki cz. 8 I rok socjologii. Zadanie 1.
Zadania ze statystyki cz. 8 I rok socjologii Zadanie 1. W potocznej opinii pokutuje przekonanie, że lepsi z matematyki są chłopcy niż dziewczęta. Chcąc zweryfikować tę opinię, przeprowadzono badanie w
Statystyczna analiza danych w programie STATISTICA (wykład 2) Dariusz Gozdowski
Statystyczna analiza danych w programie STATISTICA (wykład ) Dariusz Gozdowski Katedra Doświadczalnictwa i Bioinformatyki Wydział Rolnictwa i Biologii SGGW Weryfikacja (testowanie) hipotez statystycznych
Przykład 1. (A. Łomnicki)
Plan wykładu: 1. Wariancje wewnątrz grup i między grupami do czego prowadzi ich ocena 2. Rozkład F 3. Analiza wariancji jako metoda badań założenia, etapy postępowania 4. Dwie klasyfikacje a dwa modele
Zadania ze statystyki cz.8. Zadanie 1.
Zadania ze statystyki cz.8. Zadanie 1. Wykonano pewien eksperyment skuteczności działania pewnej reklamy na zmianę postawy. Wylosowano 10 osobową próbę studentów, których poproszono o ocenę pewnego produktu,
SCENARIUSZ LEKCJI. TEMAT LEKCJI: Zastosowanie średnich w statystyce i matematyce. Podstawowe pojęcia statystyczne. Streszczenie.
SCENARIUSZ LEKCJI OPRACOWANY W RAMACH PROJEKTU: INFORMATYKA MÓJ SPOSÓB NA POZNANIE I OPISANIE ŚWIATA. PROGRAM NAUCZANIA INFORMATYKI Z ELEMENTAMI PRZEDMIOTÓW MATEMATYCZNO-PRZYRODNICZYCH Autorzy scenariusza:
PDF created with FinePrint pdffactory Pro trial version http://www.fineprint.com
Analiza korelacji i regresji KORELACJA zależność liniowa Obserwujemy parę cech ilościowych (X,Y). Doświadczenie jest tak pomyślane, aby obserwowane pary cech X i Y (tzn i ta para x i i y i dla różnych
Analizy wariancji ANOVA (analysis of variance)
ANOVA Analizy wariancji ANOVA (analysis of variance) jest to metoda równoczesnego badania istotności różnic między wieloma średnimi z prób pochodzących z wielu populacji (grup). Model jednoczynnikowy analiza
Analiza wariancji. dr Janusz Górczyński
Analiza wariancji dr Janusz Górczyński Wprowadzenie Powiedzmy, że badamy pewną populację π, w której cecha Y ma rozkład N o średniej m i odchyleniu standardowym σ. Powiedzmy dalej, że istnieje pewien czynnik
METODY CHEMOMETRYCZNE W IDENTYFIKACJI ŹRÓDEŁ POCHODZENIA
METODY CHEMOMETRYCZNE W IDENTYFIKACJI ŹRÓDEŁ POCHODZENIA AMFETAMINY Waldemar S. Krawczyk Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Komendy Głównej Policji, Warszawa (praca obroniona na Wydziale Chemii Uniwersytetu
Testowanie hipotez statystycznych
9 października 2008 ...czyli definicje na rozgrzewkę n-elementowa próba losowa - wektor n zmiennych losowych (X 1,..., X n ); intuicyjnie: wynik n eksperymentów realizacja próby (X 1,..., X n ) w ω Ω :
Populacja generalna (zbiorowość generalna) zbiór obejmujący wszystkie elementy będące przedmiotem badań Próba (podzbiór zbiorowości generalnej) część
Populacja generalna (zbiorowość generalna) zbiór obejmujący wszystkie elementy będące przedmiotem badań Próba (podzbiór zbiorowości generalnej) część populacji, którą podaje się badaniu statystycznemu
JEDNOCZYNNIKOWA ANOVA
Analizę ANOVA wykorzystujemy do wykrycia różnic pomiędzy średnimi w więcej niż dwóch grupach/więcej niż w dwóch pomiarach JEDNOCZYNNIKOWA ANOVA porównania jednej zmiennej pomiędzy więcej niż dwoma grupami
Zadania ze statystyki, cz.7 - hipotezy statystyczne, błąd standardowy, testowanie hipotez statystycznych
Zadania ze statystyki, cz.7 - hipotezy statystyczne, błąd standardowy, testowanie hipotez statystycznych Zad. 1 Średnia ocen z semestru letniego w populacji studentów socjologii w roku akademickim 2011/2012
Weryfikacja hipotez statystycznych, parametryczne testy istotności w populacji
Weryfikacja hipotez statystycznych, parametryczne testy istotności w populacji Dr Joanna Banaś Zakład Badań Systemowych Instytut Sztucznej Inteligencji i Metod Matematycznych Wydział Informatyki Politechniki
Statystyka. #6 Analiza wariancji. Aneta Dzik-Walczak Małgorzata Kalbarczyk-Stęclik. rok akademicki 2015/ / 14
Statystyka #6 Analiza wariancji Aneta Dzik-Walczak Małgorzata Kalbarczyk-Stęclik rok akademicki 2015/2016 1 / 14 Analiza wariancji 2 / 14 Analiza wariancji Analiza wariancji jest techniką badania wyników,
Beata Paszko Zakład Systematyki Roślin Naczyniowych, Instytut Botaniki Polskiej Akademii Nauk im. W. Szafera, Kraków
ZRÓŻNICOWANIE MIĘDZYGATUNKOWE TRZCINNIKÓW [CALAMAGROSTIS] W OBRĘBIE SEKCJI DEYEUXIA Beata Paszko Zakład Systematyki Roślin Naczyniowych, Instytut Botaniki Polskiej Akademii Nauk im. W. Szafera, Kraków
STATYSTYKA MATEMATYCZNA
STATYSTYKA MATEMATYCZNA 1. Wykład wstępny. Teoria prawdopodobieństwa i elementy kombinatoryki 2. Zmienne losowe i ich rozkłady 3. Populacje i próby danych, estymacja parametrów 4. Testowanie hipotez 5.
Analiza wariancji - ANOVA
Analiza wariancji - ANOVA Analiza wariancji jest metodą pozwalającą na podział zmienności zaobserwowanej wśród wyników eksperymentalnych na oddzielne części. Każdą z tych części możemy przypisać oddzielnemu
Odchudzamy serię danych, czyli jak wykryć i usunąć wyniki obarczone błędami grubymi
Odchudzamy serię danych, czyli jak wykryć i usunąć wyniki obarczone błędami grubymi Piotr Konieczka Katedra Chemii Analitycznej Wydział Chemiczny Politechnika Gdańska D syst D śr m 1 3 5 2 4 6 śr j D 1
Testowanie hipotez statystycznych. Wnioskowanie statystyczne
Testowanie hipotez statystycznych Wnioskowanie statystyczne Hipoteza statystyczna to dowolne przypuszczenie co do rozkładu populacji generalnej (jego postaci funkcyjnej lub wartości parametrów). Hipotezy
Statystyka w pracy badawczej nauczyciela Wykład 4: Analiza współzależności. dr inż. Walery Susłow walery.suslow@ie.tu.koszalin.pl
Statystyka w pracy badawczej nauczyciela Wykład 4: Analiza współzależności dr inż. Walery Susłow walery.suslow@ie.tu.koszalin.pl Statystyczna teoria korelacji i regresji (1) Jest to dział statystyki zajmujący
OBLICZENIE PRZEPŁYWÓW MAKSYMALNYCH ROCZNYCH O OKREŚLONYM PRAWDOPODOBIEŃSTWIE PRZEWYŻSZENIA. z wykorzystaniem programu obliczeniowego Q maxp
tel.: +48 662 635 712 Liczba stron: 15 Data: 20.07.2010r OBLICZENIE PRZEPŁYWÓW MAKSYMALNYCH ROCZNYCH O OKREŚLONYM PRAWDOPODOBIEŃSTWIE PRZEWYŻSZENIA z wykorzystaniem programu obliczeniowego Q maxp DŁUGIE
Analiza wariancji - ANOVA
Analiza wariancji - ANOVA Analizę wariancji, często określaną skrótem ANOVA (Analysis of Variance), zawdzięczamy angielskiemu biologowi Ronaldowi A. Fisherowi, który opracował ją w 1925 roku dla rozwiązywania
1. Jednoczynnikowa analiza wariancji 2. Porównania szczegółowe
Zjazd 7. SGGW, dn. 28.11.10 r. Matematyka i statystyka matematyczna Tematy 1. Jednoczynnikowa analiza wariancji 2. Porównania szczegółowe nna Rajfura 1 Zagadnienia Przykład porównania wielu obiektów w
Szczegółowy program kursu Statystyka z programem Excel (30 godzin lekcyjnych zajęć)
Szczegółowy program kursu Statystyka z programem Excel (30 godzin lekcyjnych zajęć) 1. Populacja generalna a losowa próba, parametr rozkładu cechy a jego ocena z losowej próby, miary opisu statystycznego
ZASTOSOWANIE TECHNIK CHEMOMETRYCZNYCH W BADANIACH ŚRODOWISKA. dr inż. Aleksander Astel
ZASTOSOWANIE TECHNIK CHEMOMETRYCZNYCH W BADANIACH ŚRODOWISKA dr inż. Aleksander Astel Gdańsk, 22.12.2004 CHEMOMETRIA dziedzina nauki i techniki zajmująca się wydobywaniem użytecznej informacji z wielowymiarowych
Metody statystyczne wykorzystywane do oceny zróżnicowania kolekcji genowych roślin. Henryk Bujak
Metody statystyczne wykorzystywane do oceny zróżnicowania kolekcji genowych roślin Henryk Bujak e-mail: h.bujak@ihar.edu.pl Ocena różnorodności fenotypowej Różnorodność fenotypowa kolekcji roślinnych zasobów
Statystyka. Wykład 4. Magdalena Alama-Bućko. 19 marca Magdalena Alama-Bućko Statystyka 19 marca / 33
Statystyka Wykład 4 Magdalena Alama-Bućko 19 marca 2018 Magdalena Alama-Bućko Statystyka 19 marca 2018 1 / 33 Analiza struktury zbiorowości miary położenia ( miary średnie) miary zmienności (rozproszenia,
STATYSTYKA I DOŚWIADCZALNICTWO Wykład 4
STATYSTYKA I DOŚWIADCZALNICTWO Wykład 4 Inne układy doświadczalne 1) Układ losowanych bloków Stosujemy, gdy podejrzewamy, że może występować systematyczna zmienność między powtórzeniami np. - zmienność
Zad. 4 Należy określić rodzaj testu (jedno czy dwustronny) oraz wartości krytyczne z lub t dla określonych hipotez i ich poziomów istotności:
Zadania ze statystyki cz. 7. Zad.1 Z populacji wyłoniono próbę wielkości 64 jednostek. Średnia arytmetyczna wartość cechy wyniosła 110, zaś odchylenie standardowe 16. Należy wyznaczyć przedział ufności
W2. Zmienne losowe i ich rozkłady. Wnioskowanie statystyczne.
W2. Zmienne losowe i ich rozkłady. Wnioskowanie statystyczne. dr hab. Jerzy Nakielski Katedra Biofizyki i Morfogenezy Roślin Plan wykładu: 1. Etapy wnioskowania statystycznego 2. Hipotezy statystyczne,
Korelacja oznacza współwystępowanie, nie oznacza związku przyczynowo-skutkowego
Korelacja oznacza współwystępowanie, nie oznacza związku przyczynowo-skutkowego Współczynnik korelacji opisuje siłę i kierunek związku. Jest miarą symetryczną. Im wyższa korelacja tym lepiej potrafimy
Statystyczna analiza danych w programie STATISTICA 7.1 PL (wykład 3) Dariusz Gozdowski
Statystyczna analiza danych w programie STATISTICA 7.1 PL (wykład 3) Dariusz Gozdowski Katedra Doświadczalnictwa i Bioinformatyki Wydział Rolnictwa i Biologii SGGW Dwuczynnikowa analiza wariancji (2-way
Statystyka i Analiza Danych
Warsztaty Statystyka i Analiza Danych Gdańsk, 20-22 lutego 2014 Zastosowania analizy wariancji w opracowywaniu wyników badań empirycznych Janusz Wątroba StatSoft Polska Centrum Zastosowań Matematyki -
weryfikacja hipotez dotyczących parametrów populacji (średnia, wariancja)
PODSTAWY STATYSTYKI. Teoria prawdopodobieństwa i elementy kombinatoryki. Zmienne losowe i ich rozkłady 3. Populacje i próby danych, estymacja parametrów 4. Testowanie hipotez 5. Testy parametryczne (na
Wykład 3 Hipotezy statystyczne
Wykład 3 Hipotezy statystyczne Hipotezą statystyczną nazywamy każde przypuszczenie dotyczące nieznanego rozkładu obserwowanej zmiennej losowej (cechy populacji generalnej) Hipoteza zerowa (H 0 ) jest hipoteza
Próba własności i parametry
Próba własności i parametry Podstawowe pojęcia Zbiorowość statystyczna zbiór jednostek (obserwacji) nie identycznych, ale stanowiących logiczną całość Zbiorowość (populacja) generalna skończony lub nieskończony
Zmienność. środa, 23 listopada 11
Zmienność http://ggoralski.com Zmienność Zmienność - rodzaje Zmienność obserwuje się zarówno między poszczególnymi osobnikami jak i między populacjami. Różnice te mogą mieć jednak różne podłoże. Mogą one
Szczegółowy program kursu Statystyka z programem Excel (30 godzin lekcyjnych zajęć)
Szczegółowy program kursu Statystyka z programem Excel (30 godzin lekcyjnych zajęć) 1. Populacja generalna a losowa próba, parametr rozkładu cechy a jego ocena z losowej próby, miary opisu statystycznego
Statystyka. Rozkład prawdopodobieństwa Testowanie hipotez. Wykład III ( )
Statystyka Rozkład prawdopodobieństwa Testowanie hipotez Wykład III (04.01.2016) Rozkład t-studenta Rozkład T jest rozkładem pomocniczym we wnioskowaniu statystycznym; stosuje się go wyznaczenia przedziału
Idea. θ = θ 0, Hipoteza statystyczna Obszary krytyczne Błąd pierwszego i drugiego rodzaju p-wartość
Idea Niech θ oznacza parametr modelu statystycznego. Dotychczasowe rozważania dotyczyły metod estymacji tego parametru. Teraz zamiast szacować nieznaną wartość parametru będziemy weryfikowali hipotezę
Inżynieria biomedyczna, I rok, semestr letni 2014/2015 Analiza danych pomiarowych. Laboratorium X: Analiza dyskryminacyjna
1 Laboratorium X: Analiza dyskryminacyjna Spis treści Laboratorium X: Analiza dyskryminacyjna... 1 Wiadomości ogólne... 2 1. Wstęp teoretyczny.... 2 1.1. Wprowadzenie.... 2 1.2. Klasyfikacja.... 6 1.3.
3. Modele tendencji czasowej w prognozowaniu
II Modele tendencji czasowej w prognozowaniu 1 Składniki szeregu czasowego W teorii szeregów czasowych wyróżnia się zwykle następujące składowe szeregu czasowego: a) składowa systematyczna; b) składowa
Analiza wariancji jednej zmiennej (UNIANOVA)
UNIANOVA ocena BY pĺ eä szkoĺ a doĺ wiadczenie /METHOD=SSTYPE(3) /INTERCEPT=INCLUDE /POSTHOC=szkoĹ a(snk) /PLOT=PROFILE(szkoĹ a*doĺ wiadczenie*pĺ eä doĺ wiadczenie*szkoĺ a*pĺ eä szkoĺ a*pĺ eä *doĺ wiadczenie
Matematyka i statystyka matematyczna dla rolników w SGGW
Było: Testowanie hipotez (ogólnie): stawiamy hipotezę, wybieramy funkcję testową f (test statystyczny), przyjmujemy poziom istotności α; tym samym wyznaczamy obszar krytyczny testu (wartość krytyczną funkcji
STATYSTYKA I DOŚWIADCZALNICTWO Wykład 6
STATYSTYKA I DOŚWIADCZALNICTWO Wykład 6 Metody sprawdzania założeń w analizie wariancji: -Sprawdzanie równości (jednorodności) wariancji testy: - Cochrana - Hartleya - Bartletta -Sprawdzanie zgodności
STATYSTYKA - PRZYKŁADOWE ZADANIA EGZAMINACYJNE
STATYSTYKA - PRZYKŁADOWE ZADANIA EGZAMINACYJNE 1 W trakcie badania obliczono wartości średniej (15,4), mediany (13,6) oraz dominanty (10,0). Określ typ asymetrii rozkładu. 2 Wymień 3 cechy rozkładu Gauss
Budowanie macierzy danych geograficznych Procedura normalizacji Budowanie wskaźnika syntetycznego
Metody Analiz Przestrzennych Budowanie macierzy danych geograficznych Procedura normalizacji Budowanie wskaźnika syntetycznego mgr Marcin Semczuk Zakład Przedsiębiorczości i Gospodarki Przestrzennej Instytut
Testowanie hipotez statystycznych
Agenda Instytut Matematyki Politechniki Łódzkiej 2 stycznia 2012 Agenda Agenda 1 Wprowadzenie Agenda 2 Hipoteza oraz błędy I i II rodzaju Hipoteza alternatywna Statystyka testowa Zbiór krytyczny Poziom
Pomiary urodzeń według płci noworodka i województwa.podział na miasto i wieś.
Pomiary urodzeń według płci noworodka i województwa.podział na miasto i wieś. Województwo Urodzenia według płci noworodka i województwa. ; Rok 2008; POLSKA Ogółem Miasta Wieś Pozamałżeńskie- Miasta Pozamałżeńskie-
Statystyka od podstaw Janina Jóźwiak, Jarosław Podgórski
Statystyka od podstaw Janina Jóźwiak, Jarosław Podgórski Książka jest nowoczesnym podręcznikiem przeznaczonym dla studentów uczelni i wydziałów ekonomicznych. Wykład podzielono na cztery części. W pierwszej
Statystyka. Wykład 4. Magdalena Alama-Bućko. 13 marca Magdalena Alama-Bućko Statystyka 13 marca / 41
Statystyka Wykład 4 Magdalena Alama-Bućko 13 marca 2017 Magdalena Alama-Bućko Statystyka 13 marca 2017 1 / 41 Na poprzednim wykładzie omówiliśmy następujace miary rozproszenia: Wariancja - to średnia arytmetyczna
Matematyka - Statystyka matematyczna Mathematical statistics 2, 2, 0, 0, 0
Nazwa przedmiotu: Kierunek: Matematyka - Statystyka matematyczna Mathematical statistics Inżynieria materiałowa Materials Engineering Rodzaj przedmiotu: Poziom studiów: forma studiów: obowiązkowy studia
Metoda największej wiarygodności
Rozdział Metoda największej wiarygodności Ogólnie w procesie estymacji na podstawie prób x i (każde x i może być wektorem) wyznaczamy parametr λ (w ogólnym przypadku również wektor) opisujący domniemany
KORELACJE I REGRESJA LINIOWA
KORELACJE I REGRESJA LINIOWA Korelacje i regresja liniowa Analiza korelacji: Badanie, czy pomiędzy dwoma zmiennymi istnieje zależność Obie analizy się wzajemnie przeplatają Analiza regresji: Opisanie modelem
CECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE
CECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE Zarządzanie populacjami zwierząt, ćwiczenia V Dr Wioleta Drobik Rodzaje cech Jakościowe o prostym dziedziczeniu uwarunkowane zwykle przez kilka genów Słaba podatność
Statystyka. #5 Testowanie hipotez statystycznych. Aneta Dzik-Walczak Małgorzata Kalbarczyk-Stęclik. rok akademicki 2016/ / 28
Statystyka #5 Testowanie hipotez statystycznych Aneta Dzik-Walczak Małgorzata Kalbarczyk-Stęclik rok akademicki 2016/2017 1 / 28 Testowanie hipotez statystycznych 2 / 28 Testowanie hipotez statystycznych
Podstawowe pojęcia. Własności próby. Cechy statystyczne dzielimy na
Podstawowe pojęcia Zbiorowość statystyczna zbiór jednostek (obserwacji) nie identycznych, ale stanowiących logiczną całość Zbiorowość (populacja) generalna skończony lub nieskończony zbiór jednostek, które
Efekt główny Efekt interakcyjny efekt jednego czynnika zależy od poziomu drugiego czynnika Efekt prosty
ANOVA DWUCZYNNIKOWA testuje różnice między średnimi w grupach wyznaczonych przez dwa czynniki i ich kombinacje. Analiza pozwala ustalić wpływ dwóch czynników na wartości zmiennej zależnej (ilościowej!)
SYSTEMY UCZĄCE SIĘ WYKŁAD 10. PRZEKSZTAŁCANIE ATRYBUTÓW. Dr hab. inż. Grzegorz Dudek Wydział Elektryczny Politechnika Częstochowska.
SYSTEMY UCZĄCE SIĘ WYKŁAD 10. PRZEKSZTAŁCANIE ATRYBUTÓW Częstochowa 2014 Dr hab. inż. Grzegorz Dudek Wydział Elektryczny Politechnika Częstochowska INFORMACJE WSTĘPNE Hipotezy do uczenia się lub tworzenia
46 Olimpiada Biologiczna
46 Olimpiada Biologiczna Pracownia statystyczno-filogenetyczna Łukasz Banasiak i Jakub Baczyński 22 kwietnia 2017 r. Statystyka i filogenetyka / 30 Liczba punktów (wypełnia KGOB) PESEL Imię i nazwisko
Testy nieparametryczne
Testy nieparametryczne Testy nieparametryczne możemy stosować, gdy nie są spełnione założenia wymagane dla testów parametrycznych. Stosujemy je również, gdy dane można uporządkować według określonych kryteriów
Testowanie hipotez dla dwóch zmiennych zależnych. Moc testu. Minimalna liczność próby; Regresja prosta; Korelacja Pearsona;
LABORATORIUM 4 Testowanie hipotez dla dwóch zmiennych zależnych. Moc testu. Minimalna liczność próby; Regresja prosta; Korelacja Pearsona; dwie zmienne zależne mierzalne małe próby duże próby rozkład normalny
MODELE LINIOWE. Dr Wioleta Drobik
MODELE LINIOWE Dr Wioleta Drobik MODELE LINIOWE Jedna z najstarszych i najpopularniejszych metod modelowania Zależność między zbiorem zmiennych objaśniających, a zmienną ilościową nazywaną zmienną objaśnianą
10. Podstawowe wskaźniki psychometryczne
10. Podstawowe wskaźniki psychometryczne q analiza własności pozycji testowych q metody szacowania mocy dyskryminacyjnej q stronniczość pozycji testowych q własności pozycji testowych a kształt rozkładu
Wnioskowanie statystyczne i weryfikacja hipotez statystycznych
Wnioskowanie statystyczne i weryfikacja hipotez statystycznych Wnioskowanie statystyczne Wnioskowanie statystyczne obejmuje następujące czynności: Sformułowanie hipotezy zerowej i hipotezy alternatywnej.
STATYSTYKA I DOŚWIADCZALNICTWO Wykład 5
STATYSTYKA I DOŚWIADCZALNICTWO Wykład 5 Jednoczynnikowa analiza wariancji i porównania wielokrotne (układ losowanych bloków randomized block design RBD) Układ losowanych bloków Stosujemy, gdy podejrzewamy,
Zarządzanie populacjami zwierząt. Parametry genetyczne cech
Zarządzanie populacjami zwierząt Parametry genetyczne cech Teoria ścieżki zależność przyczynowo-skutkowa X p 01 Z Y p 02 p 01 2 + p 02 2 = 1 współczynniki ścieżek miary związku między przyczyną a skutkiem
LABORATORIUM 3. Jeśli p α, to hipotezę zerową odrzucamy Jeśli p > α, to nie mamy podstaw do odrzucenia hipotezy zerowej
LABORATORIUM 3 Przygotowanie pliku (nazwy zmiennych, export plików.xlsx, selekcja przypadków); Graficzna prezentacja danych: Histogramy (skategoryzowane) i 3-wymiarowe; Wykresy ramka wąsy; Wykresy powierzchniowe;
Błędy przy testowaniu hipotez statystycznych. Decyzja H 0 jest prawdziwa H 0 jest faszywa
Weryfikacja hipotez statystycznych Hipotezą statystyczną nazywamy każde przypuszczenie dotyczące nieznanego rozkładu badanej cechy populacji, o prawdziwości lub fałszywości którego wnioskuje się na podstawie
KARTA KURSU. (do zastosowania w roku akademickim 2015/16) Kod Punktacja ECTS* 3. Dr hab. Tadeusz Sozański
KARTA KURSU (do zastosowania w roku akademickim 2015/16) Nazwa Statystyka 2 Nazwa w j. ang. Statistics 2 Kod Punktacja ECTS* 3 Koordynator Dr hab. Tadeusz Sozański (koordynator, konwersatorium) Zespół
STATYSTYKA I DOŚWIADCZALNICTWO
STATYSTYKA I DOŚWIADCZALNICTWO Wykład 9 Analiza skupień wielowymiarowa klasyfikacja obiektów Metoda, a właściwie to zbiór metod pozwalających na grupowanie obiektów pod względem wielu cech jednocześnie.
Statystyka opisowa. Wykład I. Elementy statystyki opisowej
Statystyka opisowa. Wykład I. e-mail:e.kozlovski@pollub.pl Spis treści Elementy statystyku opisowej 1 Elementy statystyku opisowej 2 3 Elementy statystyku opisowej Definicja Statystyka jest to nauka o
ANALIZA CZYNNIKOWA Przykład 1
ANALIZA CZYNNIKOWA... stanowi zespół metod i procedur statystycznych pozwalających na badanie wzajemnych relacji między dużą liczbą zmiennych i wykrywanie ukrytych uwarunkowań, ktore wyjaśniają ich występowanie.
STATYSTYKA MATEMATYCZNA WYKŁAD 4. Testowanie hipotez Estymacja parametrów
STATYSTYKA MATEMATYCZNA WYKŁAD 4 Testowanie hipotez Estymacja parametrów WSTĘP 1. Testowanie hipotez Błędy związane z testowaniem hipotez Etapy testowana hipotez Testowanie wielokrotne 2. Estymacja parametrów
Przykład 2. Na podstawie książki J. Kowal: Metody statystyczne w badaniach sondażowych rynku
Przykład 2 Na podstawie książki J. Kowal: Metody statystyczne w badaniach sondażowych rynku Sondaż sieciowy analiza wyników badania sondażowego dotyczącego motywacji w drodze do sukcesu Cel badania: uzyskanie
Analiza regresji - weryfikacja założeń
Medycyna Praktyczna - portal dla lekarzy Analiza regresji - weryfikacja założeń mgr Andrzej Stanisz z Zakładu Biostatystyki i Informatyki Medycznej Collegium Medicum UJ w Krakowie (Kierownik Zakładu: prof.
STATYSTYKA wykład 8. Wnioskowanie. Weryfikacja hipotez. Wanda Olech
TATYTYKA wykład 8 Wnioskowanie Weryfikacja hipotez Wanda Olech Co nazywamy hipotezą Każde stwierdzenie o parametrach rozkładu lub rozkładzie zmiennej losowej w populacji nazywać będziemy hipotezą statystyczną
Tablica Wzorów Rachunek Prawdopodobieństwa i Statystyki
Tablica Wzorów Rachunek Prawdopodobieństwa i Statystyki Spis treści I. Wzory ogólne... 2 1. Średnia arytmetyczna:... 2 2. Rozstęp:... 2 3. Kwantyle:... 2 4. Wariancja:... 2 5. Odchylenie standardowe:...
Inżynieria biomedyczna, I rok, semestr letni 2014/2015 Analiza danych pomiarowych. Laboratorium VIII: Analiza kanoniczna
1 Laboratorium VIII: Analiza kanoniczna Spis treści Laboratorium VIII: Analiza kanoniczna... 1 Wiadomości ogólne... 2 1. Wstęp teoretyczny.... 2 Przykład... 2 Podstawowe pojęcia... 2 Założenia analizy
Statystyka w pracy badawczej nauczyciela
Statystyka w pracy badawczej nauczyciela Wykład 1: Terminologia badań statystycznych dr inż. Walery Susłow walery.suslow@ie.tu.koszalin.pl Statystyka (1) Statystyka to nauka zajmująca się zbieraniem, badaniem
Wszystkie wyniki w postaci ułamków należy podawać z dokładnością do czterech miejsc po przecinku!
Pracownia statystyczno-filogenetyczna Liczba punktów (wypełnia KGOB) / 30 PESEL Imię i nazwisko Grupa Nr Czas: 90 min. Łączna liczba punktów do zdobycia: 30 Czerwona Niebieska Zielona Żółta Zaznacz znakiem
WNIOSKOWANIE STATYSTYCZNE
STATYSTYKA WNIOSKOWANIE STATYSTYCZNE ESTYMACJA oszacowanie z pewną dokładnością wartości opisującej rozkład badanej cechy statystycznej. WERYFIKACJA HIPOTEZ sprawdzanie słuszności przypuszczeń dotyczących
ANALIZA WIELOPOZIOMOWA JAKO NARZĘDZIE WSPARCIA POLITYK PUBLICZNYCH
ANALIZA WIELOPOZIOMOWA JAKO NARZĘDZIE WSPARCIA POLITYK PUBLICZNYCH - Adrian Gorgosz - Paulina Tupalska ANALIZA WIELOPOZIOMOWA (AW) Multilevel Analysis Obecna od lat 80. Popularna i coraz częściej stosowana
WERYFIKACJA HIPOTEZ STATYSTYCZNYCH
WERYFIKACJA HIPOTEZ STATYSTYCZNYCH I. TESTY PARAMETRYCZNE II. III. WERYFIKACJA HIPOTEZ O WARTOŚCIACH ŚREDNICH DWÓCH POPULACJI TESTY ZGODNOŚCI Rozwiązania zadań wykonywanych w Statistice przedstaw w pliku
Korzystanie z podstawowych rozkładów prawdopodobieństwa (tablice i arkusze kalkulacyjne)
Korzystanie z podstawowych rozkładów prawdopodobieństwa (tablice i arkusze kalkulacyjne) Przygotował: Dr inż. Wojciech Artichowicz Katedra Hydrotechniki PG Zima 2014/15 1 TABLICE ROZKŁADÓW... 3 ROZKŁAD
Spis treści. Księgarnia PWN: Bruce M. King, Edward W. Minium - Statystyka dla psychologów i pedagogów. Wstęp Wprowadzenie...
Księgarnia PWN: Bruce M. King, Edward W. Minium - Statystyka dla psychologów i pedagogów Wstęp... 13 1. Wprowadzenie... 19 1.1. Statystyka opisowa.................................. 21 1.2. Wnioskowanie
WIELKA SGH-OWA POWTÓRKA ZE STATYSTYKI. Test zgodności i analiza wariancji Analiza wariancji
WIELKA SGH-OWA POWTÓRKA ZE STATYSTYKI Test zgodności i analiza wariancji Analiza wariancji Test zgodności Chi-kwadrat Sprawdza się za jego pomocą ZGODNOŚĆ ROZKŁADU EMPIRYCZNEGO Z PRÓBY Z ROZKŁADEM HIPOTETYCZNYM
Analiza składowych głównych. Wprowadzenie
Wprowadzenie jest techniką redukcji wymiaru. Składowe główne zostały po raz pierwszy zaproponowane przez Pearsona(1901), a następnie rozwinięte przez Hotellinga (1933). jest zaliczana do systemów uczących
Szacowanie wartości hodowlanej. Zarządzanie populacjami
Szacowanie wartości hodowlanej Zarządzanie populacjami wartość hodowlana = wartość cechy? Tak! Przy h 2 =1 ? wybitny ojciec = wybitne dzieci Tak, gdy cecha wysokoodziedziczalna. Wartość hodowlana genetycznie
Wnioskowanie statystyczne Weryfikacja hipotez. Statystyka
Wnioskowanie statystyczne Weryfikacja hipotez Statystyka Co nazywamy hipotezą Każde stwierdzenie o parametrach rozkładu lub rozkładzie zmiennej losowej w populacji nazywać będziemy hipotezą statystyczną
Regresja wielokrotna. PDF created with FinePrint pdffactory Pro trial version http://www.fineprint.com
Regresja wielokrotna Model dla zależności liniowej: Y=a+b 1 X 1 +b 2 X 2 +...+b n X n Cząstkowe współczynniki regresji wielokrotnej: b 1,..., b n Zmienne niezależne (przyczynowe): X 1,..., X n Zmienna
Zadania ze statystyki, cz.6
Zadania ze statystyki, cz.6 Zad.1 Proszę wskazać, jaką część pola pod krzywą normalną wyznaczają wartości Z rozkładu dystrybuanty rozkładu normalnego: - Z > 1,25 - Z > 2,23 - Z < -1,23 - Z > -1,16 - Z
MIARY KLASYCZNE Miary opisujące rozkład badanej cechy w zbiorowości, które obliczamy na podstawie wszystkich zaobserwowanych wartości cechy
MIARY POŁOŻENIA Opisują średni lub typowy poziom wartości cechy. Określają tą wartość cechy, wokół której skupiają się wszystkie pozostałe wartości badanej cechy. Wśród nich można wyróżnić miary tendencji
Wykład 4: Wnioskowanie statystyczne. Podstawowe informacje oraz implementacja przykładowego testu w programie STATISTICA
Wykład 4: Wnioskowanie statystyczne Podstawowe informacje oraz implementacja przykładowego testu w programie STATISTICA Idea wnioskowania statystycznego Celem analizy statystycznej nie jest zwykle tylko