Tom Numer 4 (269) Strony
|
|
- Zofia Wieczorek
- 9 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Tom Numer 4 (269) Strony Piotr Koprowski, Wojciech Grajkowski, Andrzej Kubalski Zakład Biologii Komórki Instytut Biologii Doświadczalnej PAN Pasteura 3, Warszawa a.kubalski@nencki.gov.pl BAKTERYJNE KANAŁY JONOWE JAKO STRUKTURY MODELOWE Wstęp Kanały jonowe to wyspecjalizowane białka błonowe umożliwiające przepływ jonów w poprzek błony komórkowej zgodnie z gradientem stężeń. W stanie zamkniętym kanały nie przewodzą jonów, a ich otwarcie może nastąpić pod wpływem zmiany elektrycznego potencjału błonowego (kanały napięciowozależne), ligandów (receptory jonotropowe) bądź też naprężeń mechanicznych błony (kanały mechanoczułe). W trakcie otwierania element kanału zwany bramką zmienia swoje położenie odsłaniając por kanału i umożliwiając przepływ jonów. Czasy otwarcia kanałów są bardzo krótkie (kilka milisekund), a ruch jonów następuje z prędkością rzędu 10 6 jonów/s. Kanały jonowe mogą przewodzić określone jony, mówimy wtedy, że kanały takie posiadają filtry selektywności. W zależności od rodzaju przewodzonych jonów możemy wyróżnić kanały kationowe i anionowe, a wśród tych pierwszych kanały potasowe, sodowe lub wapniowe. Przepływ jonów przez kanały odbywa się zgodnie z gradientem stężeń po obu stronach błony komórkowej, a ponieważ gradienty poszczególnych rodzajów jonów są w zasadzie dla wszystkich komórek takie same (patrz Tabela 1, w której przykładowo podano stężenia jonów wewnątrz i na zewnątrz aksonu kałamarnicy i komórki ssaczej), więc po otwarciu kanałów jony sodowe i wapniowe będą wpływały do wnętrza komórki, podczas gdy jony potasowe będą z niej wypływały. Istnienie kanałów jonowych postulowali w swoich pionierskich badaniach Hodgkin i Huxley (1952 a, b), ale prawdziwy przełom w badaniu tych białek dokonał się dzięki wynalezieniu w 1981 r. metody elektrofizjologicznej, pozwalającej na rejestrację prądów jonowych płynących przez pojedyncze białka kanałowe, nazwanej metodą patch clamp (Hamill i współaut. 1981). Za wynalezienie tej metody i pionierskie badania wykonane z jej użyciem Erwin Neher i Bert Sakmann otrzymali w 1991 r. Nagrodę Nobla. Drugim bardzo ważnym wydarzeniem w dziedzinie badań kanałów jonowych było opublikowanie pierwszej struktury krystalicznej kanału selektywnego dla jonów potasowych przez Roderica MacKinnona w 1998 r. Za opublikowanie tej i innych struktur kanałowych otrzymał on wspólnie z Peterem Agre Nagrodę Nobla w dziedzinie chemii w 2003 r. Wszystkie opublikowane do tej pory struktury kanałów jonowych są strukturami kanałów bakteryjnych. Okazało się, że budowa tych białek, a zwłaszcza te elementy struktu Tabela 1. Porównanie składów jonowych wewnątrz i na zewnątrz komórek aksonu kałamarnicy i typowej komórki ssaczej. Jon Akson kałamarnicy Komórka ssacza Krew Aksoplazma Plazma Cytoplazma Na K Ca , Mg ,5 0,8 Cl
2 374 Piotr Koprowski i współaut. Tabela 2. Znane struktury krystaliczne kanałów bakteryjnych Kanał potasowy KcsA z Streptomyces lvidans Doyle i współaut Kanał potasowy MthK z Methanobacterium thermautotrophicum Jiang i współaut Kanał potasowy KvAP z Aeropyrum pernix Jiang i współaut Kanał potasowy KirBac z Burkholderia pseudomellei Kuo i współaut Kanały chlorkowe ClC z Escherichia coli i Salmonella typhimurium Dutzler i współaut Kanał mechanoczuły MscL z Mycobacterium tuberculosis Chang i współaut Kanał mechanoczuły MscS z Escherichia coli Bass i współaut ralne, które są odpowiedzialne za takie ich podstawowe właściwości jak selektywność dla określonych jonów, mechanizm aktywacji czy mechanizm inaktywacji, mogą być używane do tworzenia funkcjonalnych modeli kanałów eukariotycznych. W związku z tym, od momentu skrystalizowania pierwszego jonowego kanału bakteryjnego w 1998 r. kanały bakteryjne stały się białkami modelowymi. Jest pewną ironią historii nauki, że kanały bakteryjne służą obecnie do tworzenia uniwersalnych modeli kanałów jonowych, chociaż jeszcze stosunkowo niedawno uważano bakterie za komórki pozbawione tych białek. Listę kanałów bakteryjnych, których struktura krystaliczna jest obecnie poznana zamieszczono w Tabeli 2, zaś dwa inne kanały o znanych sekwencjach aminokwasowych będą prawdopodobnie skrystalizowane w najbliższej przyszłości. Są to: kanał sodowy NaChBac z Bacillus halodurans (Durell i Guy 2001, Ren i współaut. 2001) oraz receptor glutaminianu GluR0 z Synechocystis PCC 6803 (Chen i współaut. 1999). W artykule tym przedstawiamy wybrane problemy z zakresu badań prowadzonych na kanałach jonowych, których rozwiązanie stało się możliwe dzięki poznaniu struktur kanałów bakteryjnych. Kanały potasowe aktywacja i selektywność Metodą patch clamp możemy rejestrować aktywności pojedynczych kanałów, określać wielkość prądów płynących przez nie, mierzyć ich przewodności, czasy otwarć i zamknięć, a także charakteryzować je farmakologicznie. Na podstawie tych danych tworzy się modele kinetyczne kanałów. Modele te określają ilość funkcjonalnych stanów kanału, tzn. dają odpowiedź na następujące pytania: czy kanał otwierając się przechodzi przez fazy (tzw. podstany), w których jest otwarty tylko częściowo, czy kanał może się otworzyć bezpośrednio po zamknięciu, tzn. czy występuje faza inaktywacji, oraz czy kanał adaptuje się do bodźca tzn. czy zamyka się pomimo działania bodźca. Jednak odpowiedzi na podstawowe pytania dotyczące budowy kanałów i zmian konformacyjnych w poszczególnych stanach funkcjonalnych, molekularnych podstaw aktywacji, czy też mechanizmu selektywności trzeba szukać z pomocą modeli tworzonych w oparciu o znane sekwencje aminokwasowe białek kanałowych. Kanały zależne od napięcia błonowego, a zwłaszcza kanały sodowe i potasowe, były od dawna szczególnym obiektem zainteresowania badaczy. Są one odpowiedzialne za generowanie i propagację potencjału czynnościowego i, w związku z tym, aktywność neuronalną. Na początku lat 90. ubiegłego wieku oczyszczono białko kanału sodowego i sklonowano gen kanału potasowego, co pozwoliło na ustalenie, że funkcjonalne kanały zależne od napięcia błonowego są tetramerami, a każda podjednostka takiego kanału składa się z 6 domen transbłonowych nazwanych S1 S6 (schemat podjednostki stworzony na podstawie sekwencji przedstawiony jest na Ryc. 1A). Domeny S5 S6, z pętlą pomiędzy nimi zwaną regionem P, tworzą por kanału. Domena S4, która ma dodatnio naładowane reszty argininy rozmieszczone w odstępach co trzy aminokwasy, jest sensorem napięcia błonowego. W modelu aktywacji kanału zależnego od napięcia błonowego zmiana potencjału błonowego komórki powodowałaby ruch sensora w poprzek błony, a to z kolei inicjowałoby otwarcie bramki kanału umożliwiając przepływ jonów. Opublikowanie struktury krystalicznej bakteryjnego kanału potasowego aktywowanego napięciem KvAP z Aeropyrum pernix (Jiang i współau. 2003)
3 Bakteryjne kanały jonowe jako struktury modelowe 375 Ryc. 1. Budowa podjednostki kanału zależnego od napięcia błonowego. A. Przewidywany model jednej z czterech podjednostek kanału. S1 S6 oznaczają domeny transbłonowe. Domeny S5 i S6 wyścielają por kanału. Domena S4 z naładowanymi resztami argininy stanowi sensor napięcia. B. Rzeczywisty układ helis na podstawie struktury krystalicznej kanału potasowego zależnego od napięcia błonowego KvAP z Aeropyrum pernix. Po lewej stronie obraz jednej z czterech podjednostek skrystalizowanego kanału. Na czarno zaznaczono helisę S4. Po prawej stronie schemat układu domen transbłonowych wykonany na podstawie struktury pokazanej po lewej stronie. nieoczekiwanie skomplikowało ten stosunkowo prosty model funkcjonalny. Na Ryc. 1B przedstawiony jest rzut boczny jednej z czterech podjednostek kanału oraz schemat rozkładu jej poszczególnych domen. Układ helis S1 S4, a szczególnie położenie domeny S4, znajdującej się poza błoną, bardzo zaskoczyło badaczy. Jeśli ruch helisy S4 inicjuje aktywację kanału, to jej przemieszczenie będzie się wiązało z przejściem ze środowiska hydrofilowego cytozolu do środowiska hydrofobowego jakim jest wnętrze błony. Jest to proces energetycznie niekorzystny i według badaczy mało realny. Obecnie trwają intensywne próby stworzenia nowego modelu aktywacji kanału napięciowo-zależnego w oparciu o istniejące dane strukturalne (więcej na ten temat w artykule przeglądowym Guy i Shrivastava 2005). W procesie aktywacji kanału zależnego od napięcia, oprócz ruchu sensora istotne jest również badanie ruchu helis S5 S6 wyścielających por kanału. Ruch ten umożliwia otwarcie się bramki kanału, a można go prześledzić porównując ze sobą dwie struktury potasowych kanałów prokariotycznych KcsA i MthK, z których pierwszy skrystalizowany został w stanie zamkniętym, a drugi w stanie otwartym. Wśród kanałów potasowych jest wiele przykładów na to, że funkcjonalny kanał może składać się z podjednostek zawierających tylko dwie helisy transbłonowe, a nie sześć, jak zostało pokazane na Ryc. 1A. Kanały takie posiadają jedynie helisy M1 i M2, odpowiadające helisom S5 S6, które stanowią niejako rdzeń przewodzący kanału, nie mają naładowanej domeny S4, a zatem nie są kanałami zależnymi od napięcia błonowego. Do tej klasy należy bardzo ważna pod względem funkcji fizjologicznej grupa kanałów biorących udział w wyrównywaniu potencjału błonowego podczas fazy hiperpolaryzacji potencjału czynnościowego (ang. inward rectifiers). Przykładami takich kanałów są też bakteryjne kanały KcsA ze S. lividans i MthK z M. thermoautotrophicum, a rzuty boczne ich struktur pokazane są na Ryc. 2. Rysunek, dla uproszczenia, przedstawia jedynie po dwie z czterech podjednostek każdego kanału. Kanał potasowy KcsA został skrystalizowany w stanie zamkniętym (Doyle i współau. 1998) i ułożenie helis TM2 może służyć jako modelowe dla stanu zamkniętego kanału potasowego. Bramkę kanału stanowią trzy hydrofobowe zamknięcia na poziomach T107, A111 i V115, których grupy metylowe są usytuowane tak ściśle, że nie pozwalają na przejście nawet nieuhydratyzowanego atomu potasu. Jak przebiega otwarcie bramki? Szczęśliwie się składa, że znana jest struktura innego kanału potasowego MthK skrystalizowanego w stanie otwartym (Jiang i współaut. 2002) i na jej podstawie można prześledzić przemieszczenie helis TM2 podczas otwierania kanału. Helisy TM2 ulegają zagięciu i odchyleniu powodując otwarcie poru
4 376 Piotr Koprowski i współaut. Ryc. 2. Struktury krystaliczne dwóch prokariotycznych kanałów potasowych KcsA i MthK. Kanał KcsA został skrystalizowany w stanie zamkniętym, a kanał MthK w stanie otwartym. Położenie helis TM2 (zaznaczonych na czarno) w strukturze KcsA obrazuje stan zamkniętej bramki, a w strukturze MthK stan otwartej bramki. Obie struktury pokazane są jako rzuty boczne i w każdej z nich pokazano dwie spośród czterech podjednostek. kanału. Należy tutaj zaznaczyć, że aktualny model otwierania się kanałów potasowych przewiduje, że domeny tworzące por kanału przechodzą taką samą lub bardzo podobną zmianę konformacyjną niezależnie od tego w jaki sposób kanał jest aktywowany, tzn. czy jest to napięcie błonowe, jony Ca 2+ lub inny ligand, czy np. ph. Struktura KcsA, pierwszego skrystalizowanego kanału potasowego, posłużyła do stworzenia modelu filtru selektywności kanału potasowego. Badacze od dawna zastanawiali się jak to się dzieje, że filtr ten przewodzi większy kation potasowy (K + o średnicy 1.33 Å), a nie przewodzi mniejszego kationu sodowego (Na + o średnicy 0.95 Å). Z porównania energii potrzebnej do dehydratacji jonu potasu i jonu sodu wynika, że energia wydatkowana na dehydratację jonu potasu jest mniejsza niż sodu i jeszcze przed poznaniem struktury KcsA uznano, że musi to mieć wpływ na organizację filtra selektywności. Założono, że jon potasowy przechodziłby przez filtr w stanie zdehydratyzowanym, a strukturalna organizacja poru powinna ułatwiać jonom potasowym zrzucenie otoczki wodnej. Wiedziano również z porównania licznych znanych sekwencji kanałów potasowych pochodzących z różnych organizmów od bakterii po ssaki, że w regionie P znajduje się wysoce charakterystyczny dla kanałów potasowych i silnie konserwowany region TVGYG, będący prawdopodobnie filtrem selektywności. Jednak dopiero opublikowanie struktury krystalicznej KcsA w pełni potwierdziło te przypuszczenia i pozwoliło na wymodelowanie procesu przechodzenia jonów potasowych przez filtr kanału. W centralnej części kanału wypełnionej wodą oraz jonami sodu i potasu (aniony zostały odepchnięte przez dodatnio naładowane reszty znajdujące się w pobliżu bramki cytoplazmatycznej), obecność kationów jest dodatkowo stabilizowana, a ich ruch ukierunkowany przez ujemnie naładowane końce helis z regionu P (Ryc. 3, helisy zaznaczone czarnym kolorem). Kluczem do przejścia jonów potasowych przez filtr TVGYG jest zdolność atomów tlenu z grup karbonylowych tych reszt do zastąpienia tlenu z cząsteczek wody warstwy hydratacyjnej. Ze względu na geometrię filtra, którą pokazała struktura krystaliczna, dla jonów potasowych jest to proces znacznie bardziej korzystny energetycznie i dlatego jony sodowe nie ulegają dehydratacji i pozostają w przestrzeni centralnej kanału. Kanały mechanoczułe Jonowe kanały mechanoczułe (MC) są aktywowane poprzez naprężenia mechaniczne błony komórkowej i ich obecność została stwierdzona w komórkach zwierzęcych, roślinnych i bakteryjnych. Kanały MC, obok kanałów jonowych aktywowanych napięciem elektrycznym błony i kanałów aktywowanych i modulowanych ligandami, stanowią trzecią, podstawową klasę kanałów jonowych. Kanały MC są detektorami wszelkich bodźców mechanicznych odgrywających rolę w procesach dotyku, słyszenia, zachowania równowagi czy regulacji naczyń włosowatych. Kanały MC mogą reagować na naprężenia błony wywołane przez siły generowane przez samą komórkę w procesach podziału, morfogenezy i wzrostu komórki i mogą być uniwersalną ochroną wszystkich komórek przed szokami osmotycznymi (nagłymi zmianami osmolarności w środowisku) i właśnie ta ich ce
5 Bakteryjne kanały jonowe jako struktury modelowe 377 Ryc. 3. Struktura krystaliczna bakteryjnego kanału potasowego KcsA opublikowana w 1998 r. po raz pierwszy pokazała organizację filtru selektywności kanału potasowego. Po lewej stronie rzut boczny uwzględniający dwie spośród czterech podjednostek, po prawej stronie rzut z góry. Region P wraz filtrem selektywności TVGYG jest zaznaczony na czarno. cha wydaje się tłumaczyć ich występowanie u bakterii (Hamill i Martinac 2001). Dwa bakteryjne kanały MC pochodzące z błony cytoplazmatycznej Escherichia coli: MscS (kanał MC o małej przewodności) i MscL (kanał MC o dużej przewodności), są, jak do tej pory, najlepiej poznanymi białkami mechanoczułymi i to zarówno pod względem struktury jak i funkcji. Struktura krystaliczna kanału MscL pokazała, że jest to pentamer, a każda jego podjednostka składa się z dwóch helis transbłonowych TM1 i TM2 (Ryc. 4) (Chang i współaut. 1998). Struktura potwierdziła wcześniejsze ustalenia wynikające z analiz elektrofizjologicznych mutantów punktowych, że bramkę kanału tworzą fragmenty helis TM1. Zamknięcie poru stanowią dwa hydrofobowe pierścienie złożone z reszt waliny w pozycjach 16 i 23, których rozwarcie może nastąpić pod wpływem siły mechanicznej (Batiza i współau. 1999). Mutacje w rejonie bramki, zastąpienie reszt niepolarnych przez aminokwasy polarne, prowadzi do obniżenia progu pobudzenia kanału (kanał można otworzyć mniejszym ciśnieniem hydrostatycznym) oraz do zahamowania lub zredukowania wzrostu komórek z powodu nieszczelności kanału i niekontrolowanego wycieku elektrolitów z komórki (Ou i współaut. 1998, Yoshimura i współaut. 1999). W oparciu o strukturę krystaliczną, która przedstawia kanał w stanie zamkniętym, stworzono model otwierania się kanału, a następnie zweryfikowano go eksperymentalnie. Przejściu do stanu otwartego towarzyszy rozchylenie się helis w taki sposób, że kąt nachylenia helis TM1 do osi kanału zmienia się z 32º w stanie zamkniętym do 71º w stanie otwartym. Helisy rozsuwają się zajmując położenie w płaszczyźnie błony w taki sposób, że przekrój poru kanału zwiększa się do około 10 nm 2 (tworzenie modeli i ich eksperymentalne weryfikowanie zostało opisane w pracy przeglądowej Sukharev i współaut. 2005). Struktura krystaliczna bakteryjnego kanału MC o małej przewodności pokazała, że funkcjonalny kanał jest heptamerem (Ryc. 5) (Bass i współaut. 2002). Każda z jego siedmiu podjednostek składa się z trzech helis transbłonowych TM1, TM2 i TM3, przy czym helisy TM3 tworzą por kanału i formują bramkę. Zasada działania bramki jest Ryc. 4. Struktura krystaliczna bakteryjnego kanału mechanoczułego MscL. Z lewej strony rzut boczny pokazujący dwie spośród pięciu podjednostek, po prawej stronie rzut z góry. Region bramki kanału utworzonej przez fragmenty helis TM1 zaznaczony na czarno. Struktura przedstawia kanał w stanie zamkniętym
6 378 Piotr Koprowski i współaut. Ryc. 5. Struktura krystaliczna bakteryjnego kanału mechanoczułego MscS. podobna jak w przypadku MscL tworzą ją pierścienie złożone z hydrofobowych aminokwasów. W przypadku MscS zwracają uwagę bardzo rozbudowane części cytoplazmatyczne kanału, których rola nie jest obecnie całkiem jasna. Wiadomo jedynie, że nie tworzą one struktury statycznej, a ich położenie zmienia się wraz ze zmianą stanu funkcjonalnego kanału (Koprowski i Kubalski 2003, Miller i współaut. 2003). Modele funkcjonalne otwierania się kanału MscS zakładają, że ruch helis TM3 przy przechodzeniu od stanu zamkniętego do otwartego jest bardzo podobny do ruchu helis TM1 u kanału MscL (Edwards i współau. 2005), a domena cytoplazmatyczna zwiększa swoją objętość (Grajkowski i współaut. 2005). Bakteryjne kanały MC charakteryzują się dużymi przewodnościami i dużymi wartościami naprężeń wywołujących aktywację. Są to cechy, które odróżniają je od eukariotycznych kanałów MC, przewodność kanału MscL jest około 100-krotnie większa niż średniego kanału eukariotycznego (przewodność MscS około 30-krotnie). Ponadto mogą być rekonstytuowane funkcjonalnie w sztucznych błonach lipidowych, co oznacza, że są one aktywowane naprężeniami mechaniczny Z lewej strony rzut boczny z zaznaczoną na czarno jedną z siedmiu podjednostek, z prawej rzut z góry. Bramkę kanału tworzą fragmenty helis TM3. mi błony i obecność peptydoglikanu nie jest konieczna do ich otwarcia. Nie jest to w zgodzie z większością doniesień na temat eukariotycznych kanałów MC, u których stwierdzono udział cytoszkieletu w aktywacji. Nie przesądza to jednak o tym, że modele mechanotransdukcji opracowane dla bakteryjnych kanałów MC nie mogą być zastosowane do eukariotycznych kanałów MC (Kung 2005). MscS ma przynajmniej trzy homologi eukariotyczne z Arabidopsis thaliana, Saccharomyces pombe i Drosophila melanogaster, z którymi wykazuje podobieństwo w około 30% (Koprowski i Kubalski 2001). Największy stopień podobieństwa wśród tych homologów występuje w domenie TM3 i sąsiadującym z nią fragmencie domeny C-końcowej, co może wskazywać na istotność tego regionu również u tych homologów (Koprowski i Kubalski 2001, Pivetti i współau. 2003). Brak homologii na poziomie sekwencji aminokwasowej nie oznacza jednak braku podobieństwa na poziomie struktur i dlatego poznanie mechanizmów funkcjonowania tego kanału może mieć duże znaczenie dla przyszłych studiów nad kanałami mechanoczułymi z organizmów eukariotycznych, gdy ich struktury zostaną poznane. BACTERIAL ION CHANNELS AS THE MODEL STRUCTURES S u m m a r y Eukaryotic ion channels have been studied over the last fifty years and an extensive knowledge has been accumulated on their function. We know little, however, about their molecular structures. Most of the structural information on eukaryotic ion channels currently available results from homology modeling based on the structures of their bacterial homologues. The crystal structures of two prokaryotic potassium channels from S. lividans and M. thermau-
7 Bakteryjne kanały jonowe jako struktury modelowe 379 totrophicum served as good models for determining the molecular principles of gating in potassium channels. The channel from S. lividans provides also the best model of K + selectivity. Based on the structure of another potassium channel that from Aeropyrum pernix, several models of voltage sensing have been proposed. LITERATURA The two bacterial mechanosensitive channels from E. coli are to date the best-characterized mechanosensitive channel molecules in terms of structure and function and they may provide an excellent model for understanding the general principles of mechanotransduction in biological membranes. Bass R. B., Strop P. Barclay M. Rees D. C., Crystal structure of Escherichia coli MscS, a voltage-modulated and mechanosensitive channel. Science 298, Batiza A. f., Rayment I., Kung C., Channel gate! Tension, leak and disclosure. Structure Fold. Des. 7, Chang G., Spencer R. h., Lee A. T., Barclay M. T., Rees D. C., Structure of the MscL homolog from Mycobacterium tuberculosis: a gated mechanosensitive ion channel. Science 282, Chen G. q., Cui C., Mayer M. l., Gouaux E., Functional characterization of a potassium-selective prokaryotic glutamate receptor. Nature 402, Doyle D. A., Morais Cabral J., Pfuetzner R. A., Kuo A., Gulbis J. M., Cohen S. L., Chait B. T., Mackinnon R., The structure of the potassium channel: molecular basis of K+ conduction and selectivity. Science 280, Durell S. R., Guy H. R., A putative prokaryote voltage-gated Ca(2+) channel with only one 6TM motif per subunit. Biochem. Biophys. Res. Commun. 281, Dutzler R., Campbell E. B., Mackinnon R., Gating the selectivity filter in ClC chloride channels. Science 300, Edwards M. D., Li Y., Kim S., Miller S., Bartlett W., Black S., Dennison S., Iscla I., Blount P., Bowie J. U., Booth I. R., Pivotal role of the glycine-rich TM3 helix in gating the MscS mechanosensitive channel. Nat. Struct. Mol. Biol. 12, Grajkowski W., Kubalski A., Koprowski P., Surface changes of the mechanosensitive channel MscS upon its activation, inactivation, and closing. Biophys. J. 88, Guy H. R., Shrivastava I. H., Voltage-gated K + channels. [W:] Bacterial ion channels and their eukaryotic homologs. Kubalski A., Martinac B. (red.). ASM Press, Washington D.C., Hamill O. P., Martinac B., Molecular basis of mechanotransduction in living cells. Physiol. Rev. 81, Hamill O. P., Marty A., Neher E., Sakmann B., Sigworth F. J., Improved patch-clamp techniques for high-resolution current recording from cells and cell-free membrane patches. Pflügers Arch. 391, Hodgkin A. L., Huxley A. F., 1952a. Currents carried by sodium and potassium ions through the membrane of the giant axon of Loligo. J. Physiol. (Lond.) 116, Hodgkin A. L., Huxley A. F., 1952b. The components of membrane conductance in the giant axon of Loligo. J. Physiol. (Lond.) 116, Jiang Y., Lee A., Chen J., Cadene M., Chait B. T., Mackinnon R., Crystal structure and mechanism of a calcium-gated potassium channel. Nature 417, Jiang Y., Lee, A. Chen, J. Ruta, V. Cadene, M. Chait, B. T. Mackinnon R., X-ray structure of a voltage-dependent K+ channel. Nature 423, Koprowski P., Kubalski A., Bacterial ion channels and their eukaryotic homologues. Bioessays 23, Koprowski P., Kubalski A., C-termini of the Escherichia coli mechanosensitive ion channel (MscS) move apart upon the channel opening. J. Biol. Chem. 278, Kung C., A possible unifying principle for mechanosensation. Nature 436, Kuo A., Gulbis J. M., Antcliff J. F., Rahman T., Lowe, E. D. Zimmer, J. Cuthbertson, J. Ashcroft F. M., Ezaki T., Doyle D. A., Crystal structure of the potassium channel KirBac1.1 in the closed state. Science 300, Miller S., Edwards M. D., Ozdemir C., Booth I. R., The closed structure of the MscS mechanosensitive channel. Cross-linking of single cysteine mutants. J. Biol. Chem. 278, Ou X., Blount P., Hoffman R. J., Kung C., One face of a transmembrane helix is crucial in mechanosensitive channel gating. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, Pivetti C. D., Yen M. R., Miller S., Busch W., Tseng Y. H., Booth I. R., Saier M. H. Jr., Two families of mechanosensitive channel proteins. Microbiol. Mol. Biol. 67, Ren D., Navarro B., Xu H., Yue L., Shi Q., Clapham D. E., A prokaryotic voltage-gated sodium channel. Science 294, Sukharev S., Anishkin A., Chiang C.-s., Betanzos M., Guy H. R., MscL, a bacterial mechanosensitive channel. [W:] Bacterial ion channels and their eukaryotic homologs. KUBALSKI A., MAR TINAC B. (red.). ASM Press, Washington D.C., Yoshimura K., Batiza A., Schroeder M., Blount P., Kung C., Hydrophilicity of a single residue within MscL correlates with increased channel mechanosensitivity. Biophys. J. 77,
Transportowane cząsteczki CO O, 2, NO, H O, etanol, mocznik... Zgodnie z gradientem: stężenia elektrochemicznym gradient stężeń
Transportowane cząsteczki Transport przez błony Transport bierny szybkość transportu gradien t stężeń kanał nośnik Transport z udziałem nośnika: dyfuzja prosta dyfuzja prosta CO 2, O 2, NO,, H 2 O, etanol,
Właściwości błony komórkowej
Właściwości błony komórkowej płynność asymetria selektywna przepuszczalność Transport przez błony Cząsteczki < 150Da Błony - selektywnie przepuszczalne RóŜnice składu jonowego między wnętrzem komórki ssaka
Potencjał spoczynkowy i czynnościowy
Potencjał spoczynkowy i czynnościowy Marcin Koculak Biologiczne mechanizmy zachowania https://backyardbrains.com/ Powtórka budowy komórki 2 Istota prądu Prąd jest uporządkowanym ruchem cząstek posiadających
Właściwości błony komórkowej
Właściwości błony komórkowej płynność asymetria selektywna przepuszczalność Transport przez błony Współczynnik przepuszczalności [cm/s] RóŜnice składu jonowego między wnętrzem komórki ssaka a otoczeniem
Właściwości błony komórkowej
Właściwości błony komórkowej płynność asymetria selektywna przepuszczalność Glikokaliks glikokaliks cytoplazma jądro błona komórkowa Mikrografia elektronowa powierzchni limfocytu ludzkiego (wybarwienie
Właściwości błony komórkowej
Właściwości błony komórkowej płynność asymetria selektywna przepuszczalność szybka dyfuzja: O 2, CO 2, N 2, benzen Dwuwarstwa lipidowa - przepuszczalność Współczynnik przepuszczalności [cm/s] 1 Transport
c stężenie molowe, V średnia prędkość molekuł
Elektrodyfuzja, prąd jonowy i biopotencjały elektryczne.. Zjawiska elektryczne towarzyszące dyfuzji jonów oraz różnice ich stężeń powodują, że potencjały elektryczne roztworów po obu stronach błony są
Elektrofizjologia neuronu
Spis treści Co to jest neuron? 2008-11-13 Spis treści Co to jest neuron? Wstęp Rola jonów w działaniu neronu Potencjał membranowy Stan równowagi Bramki jonowe Dynamika bramek jonowych Model Hodgkina-Huxley
Z47 BADANIA WŁAŚCIWOŚCI ELEKTROFIZJOLOGICZNYCH BŁON KOMÓRKOWYCH
Z47 BADANIA WŁAŚCIWOŚCI ELEKTROFIZJOLOGICZNYCH BŁON KOMÓRKOWYCH I. Cel ćwiczenia Celem ćwiczenia jest zapoznanie się z podstawową wiedzą na temat pomiarów elektrofizjologicznych żywych komórek metodą Patch
Budowa i zróżnicowanie neuronów - elektrofizjologia neuronu
Budowa i zróżnicowanie neuronów - elektrofizjologia neuronu Neuron jest podstawową jednostką przetwarzania informacji w mózgu. Sygnał biegnie w nim w kierunku od dendrytów, poprzez akson, do synaps. Neuron
Transport przez błony
Transport przez błony Transport bierny Nie wymaga nakładu energii Transport aktywny Wymaga nakładu energii Dyfuzja prosta Dyfuzja ułatwiona Przenośniki Kanały jonowe Transport przez pory w błonie jądrowej
Wstęp do sieci neuronowych, wykład 15, Neuron Hodgkina-Huxleya
Wstęp do sieci neuronowych, wykład 15, Neuron Hodgkina-Huxleya Maja Czoków, Jarosław Piersa, Andrzej Rutkowski Wydział Matematyki i Informatyki, Uniwersytet Mikołaja Kopernika 2019-01-21 Projekt pn. Wzmocnienie
INHIBICJA KANAŁÓW JONOWYCH POSZUKIWANIE NOWYCH LEKÓW.
INHIBICJA KANAŁÓW JONOWYCH POSZUKIWANIE NOWYCH LEKÓW. Dariusz Matosiuk Katedra i Zakład Syntezy i Technologii Chemicznej Środków Leczniczych, Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Analityki Medycznej Uniwersytet
Droga impulsu nerwowego w organizmie człowieka
Droga impulsu nerwowego w organizmie człowieka Impuls nerwowy Impuls nerwowy jest zjawiskiem elektrycznym zachodzącym na powierzchni komórki nerwowej i pełni podstawową rolę w przekazywaniu informacji
Błona komórkowa grubość od 50 do 100 A. Istnieje pewna różnica potencjałów, po obu stronach błony, czyli na błonie panuje pewne
Błona komórkowa grubość od 50 do 100 A Istnieje pewna różnica potencjałów, po obu stronach błony, czyli na błonie panuje pewne napięcie elektryczne, zwane napięciem na błonie. Różnica potencjałów to ok.
Błona komórkowa grubość od 50 do 100 A. Istnieje pewna różnica potencjałów, po obu stronach błony, czyli na błonie panuje pewne
Błona komórkowa grubość od 50 do 100 A Istnieje pewna różnica potencjałów, po obu stronach błony, czyli na błonie panuje pewne napięcie elektryczne, zwane napięciem na błonie. Różnica potencjałów to ok.
Funkcje błon biologicznych
Funkcje błon biologicznych Tworzenie fizycznych granic - kontrola składu komórki Selektywna przepuszczalność - transport ograniczonej liczby cząsteczek Stanowienie granic faz przekazywanie sygnałów chemicznych
Transport przez błonę komórkową cd. Modelowanie
Transport przez błonę komórkową cd. Modelowanie Kanały jonowe posiadają zdolność do kontrolowanego przepuszczania jonów. występowanie w nich tzw. pora wodna hydrofilowa przestrzeń wewnątrz białka, przez
Tom 53, 2004 Numer 3 4 ( ) Strony WODA MORSKA I DZIURY W BŁONACH NAGRODA NOBLA Z CHEMII ZA ROK 2003
Tom 53, 2004 Numer 3 4 (264 265) Strony 243 249 SŁAWOMIR PIKUŁA Zakład Biochemii Komórki Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN Pasteura 3, 02-093 Warszawa e-mail: s.pikula@nencki.gov.pl
Zadanie 1. (2 pkt) Określ, na podstawie różnicy elektroujemności pierwiastków, typ wiązania w związkach: KBr i HBr.
Zadanie 1. (2 pkt) Określ, na podstawie różnicy elektroujemności pierwiastków, typ wiązania w związkach: KBr i HBr. Typ wiązania w KBr... Typ wiązania w HBr... Zadanie 2. (2 pkt) Oceń poprawność poniższych
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
Bioinformatyka wykład 9
Bioinformatyka wykład 9 14.XII.21 białkowa bioinformatyka strukturalna krzysztof_pawlowski@sggw.pl 211-1-17 1 Plan wykładu struktury białek dlaczego? struktury białek geometria i fizyka modyfikacje kowalencyjne
Badanie oddziaływań związków biologicznie aktywnych z modelowymi membranami lipidowymi
UNIWERSYTET JAGIELLOŃSKI W KRAKOWIE WYDZIAŁ CHEMII STRESZCZENIE ROZPRAWY DOKTORSKIEJ Badanie oddziaływań związków biologicznie aktywnych z modelowymi membranami lipidowymi Marcelina Gorczyca Promotorzy:
Procesy stochastyczne w kardiologii od elektrofizjologii do zmienności rytmu serca cz. 1. Monika Petelczyc Wydział Fizyki Politechnika Warszawska
Procesy stochastyczne w kardiologii od elektrofizjologii do zmienności rytmu serca cz. 1 Monika Petelczyc Wydział Fizyki Politechnika Warszawska Od poziomu makro do komórki http://www.myofilament.org/photosandmovies/movies.htm
Praktyczne aspekty modelowania układu nerwowego
Praktyczne aspekty modelowania układu nerwowego Ćwiczenia 2 Model Hodgkina-Huxleya dr Daniel Wójcik na podstawie The Book of GENESIS Wprowadzenie do interfejsu graficznego GENESIS Przećwiczymy obsługę
Błony biologiczne. 1.Rola błon komórkowych. 2. Budowa błon biologicznych. 3. Kanały.
Błony biologiczne 1.Rola błon komórkowych. 2. Budowa błon biologicznych. 3. Kanały. Cechy błon biologicznych Struktury warstwowe (6-10 nm) Zbudowane są głównie z lipidów i białek (lip. : biał. od 4:1 do
Właściwości błony komórkowej
płynność asymetria Właściwości błony komórkowej selektywna przepuszczalność Płynność i stan fazowy - ruchy rotacyjne: obrotowe wokół długiej osi cząsteczki - ruchy fleksyjne zginanie łańcucha alifatycznego
Przewidywanie struktury kanału białkowego z wykorzystaniem probabilistycznych gramatyk formalnych oraz modelu ciągłego przepływu jonów
Przewidywanie struktury kanału białkowego z wykorzystaniem probabilistycznych gramatyk formalnych oraz modelu ciągłego przepływu jonów Witold Dyrka Instytut Inżynierii Biomedycznej i Pomiarowej, Politechnika
Opis zjawisk transportu masy w kanałach wybranych membran naturalnych i syntetycznych.
POLITECHNIKA ŚLĄSKA WYDZIAŁ CHEMICZNY KATEDRA FIZYKOCHEMII I TECHNOLOGII POLIMERÓW ` Krzysztof Pawełek PRACA DOKTORSKA Opis zjawisk transportu masy w kanałach wybranych membran naturalnych i syntetycznych.
Kanały jonowe i pompy błonowe
Kanały jonowe i pompy błonowe Jak badad przepływ jonów? Patch-clamp -zassanie powoduje ścisłe połączenie błony komórkowej z kapilarą (opornośd miedzy wnętrzem pipety a otaczającym roztworem = 10^9 omów)
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Takao Ishikawa Faculty of Biology, University of Warsaw, Poland Performance of Polish students at IBO Gold Silver Bronze Merit
Tkanka nerwowa. Komórki: komórki nerwowe (neurony) sygnalizacja komórki neurogleju (glejowe) ochrona, wspomaganie
Komórki: komórki nerwowe (neurony) sygnalizacja komórki neurogleju (glejowe) ochrona, wspomaganie Tkanka nerwowa Substancja międzykomórkowa: prawie nieobecna (blaszki podstawne) pobudliwość przewodnictwo
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski michal.michalowski@uwr.edu.pl michaladamichalowski@gmail.com michal.michalowski@uwr.edu.pl https://mmichalowskiuwr.wordpress.com/
Fizjologia człowieka
Akademia Wychowania Fizycznego i Sportu w Gdańsku Katedra: Promocji Zdrowia Zakład: Biomedycznych Podstaw Zdrowia Fizjologia człowieka Osoby prowadzące przedmiot: Prof. nadzw. dr hab. Zbigniew Jastrzębski
DHPLC. Denaturing high performance liquid chromatography. Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko
DHPLC Denaturing high performance liquid chromatography Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko Mini-słowniczek SNP (Single Nucleotide Polymorphism) - zmienność sekwencji DNA; HET - analiza heterodupleksów; HPLC
Krwiobieg duży. Krwiobieg mały
Mięsień sercowy Budowa serca Krązenie krwi Krwiobieg duży Krew (bogata w tlen) wypływa z lewej komory serca przez zastawkę aortalną do głównej tętnicy ciała, aorty, rozgałęzia się na mniejsze tętnice,
Ćwiczenie 1: Wyznaczanie warunków odporności, korozji i pasywności metali
Ćwiczenie 1: Wyznaczanie warunków odporności, korozji i pasywności metali Wymagane wiadomości Podstawy korozji elektrochemicznej, wykresy E-pH. Wprowadzenie Główną przyczyną zniszczeń materiałów metalicznych
Priony. co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski
Priony co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski Choroba Kreutzfeldta-Jakoba Pierwsze opisy pochodzą z lat 30. XX wieku Zakaźna choroba, często rodzinna
Komputerowe wspomaganie projektowanie leków
Komputerowe wspomaganie projektowanie leków wykład II Prof. dr hab. Sławomir Filipek Grupa BIOmodelowania Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii oraz Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych Cent-III www.biomodellab.eu
Spis treści. Właściwości fizyczne. Wodorki berylowców. Berylowce
Berylowce Spis treści 1 Właściwości fizyczne 2 Wodorki berylowców 3 Tlenki berylowców 4 Nadtlenki 5 Wodorotlenki 6 Iloczyn rozpuszczalności 7 Chlorki, fluorki, węglany 8 Siarczany 9 Twardość wody 10 Analiza
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
Pole elektryczne w ośrodku materialnym
Pole elektryczne w ośrodku materialnym Ryszard J. Barczyński, 2017 Politechnika Gdańska, Wydział FTiMS, Katedra Fizyki Ciała Stałego Materiały dydaktyczne do użytku wewnętrznego Stała dielektryczna Stała
BADANIA MODELOWE OGNIW SŁONECZNYCH
POZNAN UNIVE RSITY OF TE CHNOLOGY ACADE MIC JOURNALS No 70 Electrical Engineering 2012 Bartosz CERAN* BADANIA MODELOWE OGNIW SŁONECZNYCH W artykule przedstawiono model matematyczny modułu fotowoltaicznego.
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny Zadanie 1 1 pkt. za prawidłowe podanie typów dla obydwu zwierząt oznaczonych literami A oraz B. A. ramienionogi, B. mięczaki A.
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
Przybliżone algorytmy analizy ekspresji genów.
Przybliżone algorytmy analizy ekspresji genów. Opracowanie i implementacja algorytmu analizy danych uzyskanych z eksperymentu biologicznego. 20.06.04 Seminarium - SKISR 1 Wstęp. Dane wejściowe dla programu
Badanie oddziaływania polihistydynowych cyklopeptydów z jonami Cu 2+ i Zn 2+ w aspekcie projektowania mimetyków SOD
Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Analityki Medycznej Badanie oddziaływania polihistydynowych cyklopeptydów z jonami Cu 2+ i Zn 2+ w aspekcie projektowania mimetyków SOD Aleksandra Kotynia PRACA DOKTORSKA
UNIWERSYTET W BIAŁYMSTOKU WYDZIAŁ BIOLOGICZNO CHEMICZNY. Joanna Kotyńska
UNIWERSYTET W BIAŁYMSTOKU WYDZIAŁ BIOLOGICZNO CHEMICZNY Joanna Kotyńska RÓWNOWAGI ADSORPCYJNE POMIĘDZY BŁONĄ LIPOSOMALNĄ A JONAMI ELEKTROLITU O RÓŻNEJ WARTOŚCIOWOŚCI (streszczenie) Praca doktorska wykonana
Zadania powtórkowe do egzaminu maturalnego z chemii Wiązania chemiczne, budowa cząsteczek
strona 1/11 Zadania powtórkowe do egzaminu maturalnego z chemii Wiązania chemiczne, budowa cząsteczek Monika Gałkiewicz Zad. 1 () Podaj wzory dwóch dowolnych kationów i dwóch dowolnych anionów posiadających
Eukariota - błony wewnątrzkomórkowe. Błony wewnętrzne stanowiące granice poszczególnych. przedziałów komórki i otaczające organelle komórkowe
Błona komórkowa (błona plazmatyczna, plazmolema) Występuje u wszystkich organizmów żywych (zarówno eukariota, jak i prokariota) Stanowią naturalną barierę między wnętrzem komórki a środowiskiem zewnętrznym
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski. Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul. Smętna 12, Kraków Plan prezentacji: Cel naukowy Podstawy teoretyczne Przyjęta metodyka
Transport makrocząsteczek
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii, dzięki której organizm uzyskuje energię biosynteza białka i innych związków Transport
Kompleks sorpcyjny gleby frakcja gleby zawierająca naładowane elektrycznie cząstki koloidalne (glinokrzemiany, krzemiany, próchnicę).
Pobieranie i dystrybucja jonów Kompleks sorpcyjny gleby frakcja gleby zawierająca naładowane elektrycznie cząstki koloidalne (glinokrzemiany, krzemiany, próchnicę). Cząstki gleby stale tworzą kompleks
26 Okresowy układ pierwiastków
26 Okresowy układ pierwiastków Przyjmując procedurę Hartree ego otrzymujemy poziomy numerowane, jak w atomie wodoru, liczbami kwantowymi (n, l, m) z tym, że degeneracja ze względu na l na ogół już nie
SPIS TREŚCI CZĘŚĆ LITERATUROWA OBJAŚNIENIE STOSOWANYCH W PRACY SKRÓTÓW... 6 OBJAŚNIENIE STOSOWANYCH W PRACY OZNACZEŃ... 8.
SPIS TREŚCI OBJAŚNIENIE STOSOWANYCH W PRACY SKRÓTÓW... 6 OBJAŚNIENIE STOSOWANYCH W PRACY OZNACZEŃ... 8 Rozdział 1 CEL PRACY 1.1. Przedmiot prowadzonych badań... l1 1.2. Cel pracy... 15 CZĘŚĆ LITERATUROWA
Dywergencja/konwergencja połączeń między neuronami
OD NEURONU DO SIECI: MODELOWANIE UKŁADU NERWOWEGO Własności sieci, plastyczność synaps Stefan KASICKI SWPS, SPIK wiosna 2007 s.kasicki@nencki.gov.pl Dywergencja/konwergencja połączeń między neuronami 1
POLITECHNIKA ŁÓDZKA INSTRUKCJA Z LABORATORIUM W ZAKŁADZIE BIOFIZYKI. Ćwiczenie 3 ANALIZA TRANSPORTU SUBSTANCJI NISKOCZĄSTECZKOWYCH PRZEZ
POLITECHNIKA ŁÓDZKA INSTRUKCJA Z LABORATORIUM W ZAKŁADZIE BIOFIZYKI Ćwiczenie 3 ANALIZA TRANSPORTU SUBSTANCJI NISKOCZĄSTECZKOWYCH PRZEZ BŁONĘ KOMÓRKOWĄ I. WSTĘP TEORETYCZNY Każda komórka, zarówno roślinna,
Zalety przewodników polimerowych
Zalety przewodników polimerowych - Giętkie, otrzymywane w postaci folii - Lekkie (wysoka gęstość energii/kg) - Bezpieczne (przy przestrzeganiu zaleceń użytkowania) Wady - Degradacja na skutek starzenia,
Budowa anatomiczna liścia roślin okrytonasiennych.
Organy wegetatywne roślin nasiennych: liście, pędy, korzenie. Budowa anatomiczna liścia roślin okrytonasiennych. Budowa morfologiczna liścia. Przekrój przez blaszkę liściową. Budowa anatomiczna liścia.
Roztwory buforowe (bufory) (opracowanie: dr Katarzyna Makyła-Juzak)
Roztwory buforowe (bufory) (opracowanie: dr Katarzyna Makyła-Juzak) 1. Właściwości roztworów buforowych Dodatek nieznacznej ilości mocnego kwasu lub mocnej zasady do czystej wody powoduje stosunkowo dużą
Fizjologia nauka o czynności żywego organizmu
nauka o czynności żywego organizmu Stanowi zbiór praw, jakim podlega cały organizm oraz poszczególne jego układy, narządy, tkanki i komórki prawa rządzące żywym organizmem są wykrywane doświadczalnie określają
Biologiczne mechanizmy zachowania
Biologiczne mechanizmy zachowania Przekaźnictwo chemiczne w mózgu mgr Monika Mazurek IPs UJ Odkrycie synaps Ramon y Cajal (koniec XIX wieku) neurony nie łączą się między sobą, między nimi jest drobna szczelina.
Wprowadzenie do pulsujących sieci neuronowych
Zakład Algebry i Kombinatoryki Wydział Matematyki i Nauk Informacyjnych 31 maja 2017 Wstęp Plan prezentacji Biologiczna inspiracja modeli neuronów. Modelowe neuronów naturalnych. Neurony trzeciej generacji
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
Fizjologia czlowieka seminarium + laboratorium. M.Eng. Michal Adam Michalowski
Fizjologia czlowieka seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski michal.michalowski@uwr.edu.pl michaladamichalowski@gmail.com michal.michalowski@uwr.edu.pl https://mmichalowskiuwr.wordpress.com/
Podział komórkowy u bakterii
Mitoza Podział komórkowy u bakterii Najprostszy i najszybszy podział komórkowy występuje u bakterii, które nie mają jądra komórkowego, lecz jedynie pojedynczy chromosom tzw. chromosom bakteryjny. Podczas
Opracowała: mgr inż. Ewelina Nowak
Materiały dydaktyczne na zajęcia wyrównawcze z chemii dla studentów pierwszego roku kierunku zamawianego Inżynieria Środowiska w ramach projektu Era inżyniera pewna lokata na przyszłość Opracowała: mgr
n liczba moli elektronów E siła elektromotoryczna ogniwa F = en A stała Faradaya C/mol
Zmiana entalpii swobodnej G podczas reakcji w której zachodzi przepływ elektronów jest pracą nieobjętościową i może być wyrażona jako iloczyn napięcie i ładunku. na przykład procesy oksydo-redukcyjne zachodzące
Model Poissona-Nernsta-Plancka w predykcji struktury kanałów białkowych
Model Poissona-Nernsta-Plancka w predykcji struktury kanałów białkowych mgr inż. Witold Dyrka Opiekun: dr hab. inż. Małgorzata Kotulska Instytut Inżynierii Biomedycznej i Pomiarowej Plan wystąpienia Nanopory
Czynności komórek nerwowych. Adriana Schetz IF US
Czynności komórek nerwowych Adriana Schetz IF US Plan wykładu 1. Komunikacja mędzykomórkowa 2. Neurony i komórki glejowe jedność architektoniczna 3. Czynności komórek nerwowych Komunikacja międzykomórkowa
dr hab. Mikołaj Olejniczak, prof. UAM Zakład Biochemii 16 grudnia 2018, Poznań
dr hab. Mikołaj Olejniczak, prof. UAM Zakład Biochemii 16 grudnia 2018, Poznań Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Michała Rażewa zatytułowanej Badania strukturalne drożdżowego degradosomu mitochondrialnego
Temat 7. Równowagi jonowe w roztworach słabych elektrolitów, stała dysocjacji, ph
Temat 7. Równowagi jonowe w roztworach słabych elektrolitów, stała dysocjacji, ph Dysocjacja elektrolitów W drugiej połowie XIX wieku szwedzki chemik S.A. Arrhenius doświadczalnie udowodnił, że substancje
Część I: Błony biologiczne. Biofizyka II przedmiot obieralny Materiały pomocnicze do wykładów prof. dr hab. inż. Jan Mazerski
Biofizyka II przedmiot obieralny Materiały pomocnicze do wykładów prof. dr hab. inż. Jan Mazerski C Z ĘŚĆ I: BŁ NY BILGICZNE 1. BUDWA I F UNKCJE B Ł NY K MÓRKWEJ Błona komórkowa oddziela komórkę od środowiska
Tkanka nerwowa. neurony (pobudliwe) odbieranie i przekazywanie sygnałów komórki glejowe (wspomagające)
Tkanka nerwowa neurony (pobudliwe) odbieranie i przekazywanie sygnałów komórki glejowe (wspomagające) Sygnalizacja w komórkach nerwowych 100 tys. wejść informacyjnych przyjmowanie sygnału przewodzenie
Plan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy. Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję
Nukleosomy 1 Plan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję Metody pozwalające na wyznaczanie miejsc wiązania nukleosomów Charakterystyka obsadzenia nukleosomów
Biologiczne mechanizmy zachowania - fizjologia. zajecia 8 :
Biologiczne mechanizmy zachowania - fizjologia zajecia 8 : 19.11.15 Kontakt: michaladammichalowski@gmail.com https://mmichalowskiuwr.wordpress.com/ I gr 08:30 10:00 II gr 10:15 11:45 III gr 12:00 13:30
Komórka eukariotyczna
Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,
Wewnętrzna budowa materii - zadania
Poniższe zadania rozwiąż na podstawie układu okresowego. Zadanie 1 Oceń poprawność poniższych zdań, wpisując P, gdy zdanie jest prawdziwe oraz F kiedy ono jest fałszywe. Stwierdzenie Atom potasu posiada
KONKURS PRZEDMIOTOWY Z FIZYKI dla uczniów szkół podstawowych. Schemat punktowania zadań
KONKURS PRZEDMIOTOWY Z FIZYKI dla uczniów szkół podstawowych lutego 09 r. etap rejonowy Schemat punktowania zadań Maksymalna liczba punktów 40. Uwaga!. Za poprawne rozwiązanie zadania metodą, która nie
Homeostaza DR ROBERT MERONKA ZAKŁAD EKOLOGII INSTYTUT ZOOLOGII WYDZIAŁ BIOLOGII UNIWERSYTET WARSZAWSKI
Homeostaza DR ROBERT MERONKA ZAKŁAD EKOLOGII INSTYTUT ZOOLOGII WYDZIAŁ BIOLOGII UNIWERSYTET WARSZAWSKI Różnorodność środowisk Stałość warunków w organizmie Podstawy procesów fizjologicznych Procesy zachodzące
SKRYPT DO ĆWICZEŃ Z BIOFIZYKI. dla studentów biologii i biotechnologii UMCS w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Marii Curie-Skłodowskiej
SKRYPT DO ĆWICZEŃ Z BIOFIZYKI dla studentów biologii i biotechnologii UMCS w Lublinie Wydawnictwo Uniwersytetu Marii Curie-Skłodowskiej SKRYPT DO ĆWICZEŃ Z BIOFIZYKI dla studentów biologii i biotechnologii
Chemia - B udownictwo WS TiP
Chemia - B udownictwo WS TiP dysocjacja elektrolityczna, reakcje w roztworach wodnych, ph wykład nr 2b Teoria dys ocjacji jonowej Elektrolity i nieelektrolity Wpływ polarnej budowy cząsteczki wody na proces
Różne dziwne przewodniki
Różne dziwne przewodniki czyli trzy po trzy o mechanizmach przewodzenia prądu elektrycznego Przewodniki elektronowe Metale Metale (zwane również przewodnikami) charakteryzują się tym, że elektrony ich
Komputerowe wspomaganie projektowanie leków
Komputerowe wspomaganie projektowanie leków wykład V Prof. dr hab. Sławomir Filipek Grupa BIOmodelowania Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii oraz Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych Cent-III www.biomodellab.eu
O elektryczności neuronalnej i kanałach jonowych nieco więcej
O elektryczności neuronalnej i kanałach jonowych nieco więcej 4.13 Molecular structure of the Na + /K + pump. (Part 1) 4.11 Ionic movements due to the Na + /K + pump. (Part 1) Np. przez dinitrofenol blokujący
Natężenie prądu elektrycznego
Natężenie prądu elektrycznego Wymuszenie w przewodniku różnicy potencjałów powoduje przepływ ładunków elektrycznych. Powszechnie przyjmuje się, że przepływający prąd ma taki sam kierunek jak przepływ ładunków
Geometria wiązania hemu w oksymioglobinie
Białka wiążące tlen Geometria wiązania hemu w oksymioglobinie Hem Hb A tetrametr zbudowany z dwóch identycznych łańcuchów α (141 reszt aminokwasowych, N koniec stanowi walina, a C koniec arginina) i dwóch
Pytania z Wysokosprawnej chromatografii cieczowej
Pytania z Wysokosprawnej chromatografii cieczowej 1. Jak wpłynie 50% dodatek MeOH do wody na retencję kwasu propionowego w układzie faz odwróconych? 2. Jaka jest kolejność retencji kwasów mrówkowego, octowego
Czym jest prąd elektryczny
Prąd elektryczny Ruch elektronów w przewodniku Wektor gęstości prądu Przewodność elektryczna Prawo Ohma Klasyczny model przewodnictwa w metalach Zależność przewodności/oporności od temperatury dla metali,
Przewodnictwo elektryczne roztworów wodnych. - elektrolity i nieelektrolity.
1 Przewodnictwo elektryczne roztworów wodnych - elektrolity i nieelektrolity. Czas trwania zajęć: 45 minut Pojęcia kluczowe: - elektrolit, - nieelektrolit, - dysocjacja elektrolityczna, - prąd, - jony.
Transport jonów: kryształy jonowe
Transport jonów: kryształy jonowe Jodek srebra AgI W 420 K strukturalne przejście fazowe I rodzaju do fazy α stopiona podsieć kationowa. Fluorek ołowiu PbF 2 zdefektowanie Frenkla podsieci anionowej, klastry
ĆWICZENIE NR 1. Część I (wydanie poprawione_2017) Charakterystyka licznika Geigera Műllera
ĆWICZENIE NR 1 Część I (wydanie poprawione_2017) Charakterystyka licznika Geigera Műllera 1 I. Cel doświadczenia Wykonanie charakterystyki licznika Geigera-Müllera: I t N min 1 Obszar plateau U V Przykładowy
Bioinformatyka wykład 10.I.2008
Bioinformatyka wykład 10.I.2008 Przewidywanie struktur białek krzysztof_pawlowski@sggw.pl 2008-01-10 1 Plan wykładu pole siłowe - opis energetyczny struktur białka proces zwijania się białek przewidywanie
Błona komórkowa - model płynnej mozaiki
System błon w komórkach eukariotycznych Transport przez błony plazmatyczne dr n. biol. Ewa Kilańczyk Zakład Biologii Medycznej Pomorskiego Uniwersytetu Medycznego Błona komórkowa - model płynnej mozaiki
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
TEORIA PASMOWA CIAŁ STAŁYCH
TEORIA PASMOWA CIAŁ STAŁYCH Skolektywizowane elektrony w metalu Weźmy pod uwagę pewną ilość atomów jakiegoś metalu, np. sodu. Pojedynczy atom sodu zawiera 11 elektronów o konfiguracji 1s 2 2s 2 2p 6 3s
Szkło. T g szkła używanego w oknach katedr wynosi ok. 600 C, a czas relaksacji sięga lat. FIZYKA 3 MICHAŁ MARZANTOWICZ
Szkło Przechłodzona ciecz, w której ruchy uległy zamrożeniu Tzw. przejście szkliste: czas potrzebny na zmianę konfiguracji cząsteczek (czas relaksacji) jest rzędu minut lub dłuższy T g szkła używanego
(12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) (13) B1
RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 170013 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 297079 (22) Data zgłoszenia: 17.12.1992 (51) IntCl6: H01L 29/792 (
Opracowała: mgr inż. Ewelina Nowak
Materiały dydaktyczne na zajęcia wyrównawcze z chemii dla studentów pierwszego roku kierunku zamawianego Inżynieria Środowiska w ramach projektu Era inżyniera pewna lokata na przyszłość Opracowała: mgr