ROZPOZNAWANIE IZOLOWANYCH OD LUDZI NICIENI Z RODZAJU DIROFILARIA PRZY ZASTOSOWANIU TECHNIK BIOLOGII MOLEKULARNEJ
|
|
- Helena Czarnecka
- 8 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: Aleksander Masny 1, Hanna Żarnowska-Prymek 2,3, Danuta Cielecka 4, Ruslan Salamatin 4,5, Elżbieta Gołąb 1 ROZPOZNAWANIE IZOLOWANYCH OD LUDZI NICIENI Z RODZAJU DIROFILARIA PRZY ZASTOSOWANIU TECHNIK BIOLOGII MOLEKULARNEJ 1 Zakład Parazytologii Lekarskiej NIZP-PZH Kierownik: prof. dr hab. T.H. Dzbeński 2 Klinika Chorób Odzwierzęcych i Tropikalnych WUM w Warszawie p.o. Kierownika Kliniki: dr n. med. M. Olszyńska-Krowicka 3 Wojewódzki Szpital Zakaźny w Warszawie 4 Zakład Biologii Ogólnej i Parazytologii WUM w Warszawie Kierownik: B. Grytner-Zięcina 5 Instytut Zoologii im. I.I. Schmalhausena NAN Ukrainy, Kijów Przedstawiono opis procedur zaadaptowanych do izolacji i wykrywania DNA pasożytów z rodzaju Dirofilaria w materiale izolowanym od ludzi i przechowywanym w: etanolu (24 tygodnie), formalinie (46 tygodni) lub zatopionym w bloczkach parafinowych (25 tygodni). Najwyższą czułość PCR obserwowano dla próbek DNA uzyskanych z robaków przechowywanych w etanolu, a najniższą dla próbek pochodzących z materiału przechowywanego w formalinie. Izolacja DNA z pasożyta utrwalonego w formalinie była trudniejsza niż w wypadku pozostałych preparatów, a produkty jego powielania były wykrywalne tylko w Real Time PCR. Uzyskane wyniki pokazują, że metody molekularne są stosunkowo łatwym w użyciu sposobem identyfikacji nicieni z rodzaju Dirofilaria obecnych w materiale klinicznym utrwalonym na różne sposoby. Wskazane jest niestosowanie formaliny do przechowywania materiału, który ma być użyty do diagnostyki opartej o PCR. Dirofilarioza jest chorobą odzwierzęcą wywoływaną przez nicienie pasożytnicze z rodzaju Dirofilaria. W rodzaju tym znajduje się obecnie 27 gatunków, spośród których największe znaczenie dla medycyny ludzkiej i weterynaryjnej mają D. repens i D. immitis. Psy stanowią główny rezerwuar tych nicieni, a wektorem przenoszącym zarażenie również na ludzi są komary, u których dochodzi do rozwoju larw inwazyjnych (L3) (4). Przez wiele lat uważano, że występowanie Dirofilaria w Europie jest ograniczone do obszarów leżących w strefie klimatu śródziemnomorskiego. W ostatnim dziesięcioleciu zaobserwowano jednak rozprzestrzenianie się zarażeń tymi pasożytami także w krajach o klimacie umiarkowanym, np. w Holandii (12), Słowacji (1, 11), oraz na Ukrainie (8, 9).
2 182 A. Masny i inni Nr 2 U ludzi objawy dirofilariozy, w postaci guzków podskórnych i narządowych, są czasem klasyfikowane jako zmiany o charakterze nowotworowym, a podwyższone ryzyko błędnych rozpoznań jest szczególnie wysokie w krajach uznawanych za wolne od inwazji wywoływanych przez Dirofilaria (5). Polska należy do tej grupy krajów, ponieważ dopiero w 2008 roku, po raz pierwszy opisano 5 przypadków dirofilariozy D. repens u polskich pacjentów (15) natomiast w 2009 roku pojawiło się pierwsze doniesienie o występowaniu dirofilariozy u psów (6). Wprawdzie udowodnione rodzime zarażenia wykryto tylko u psów, jednak przy występowaniu w naszym kraju komarów należących do wektorów dirofilarii można założyć, że inwazje te obejmują także ludzi. W tej sytuacji niezbędna wydaje się akcja informacyjna, efektem której byłoby uwzględnianie dirofilariozy jako jednego z możliwych etiologicznych czynników guzków podskórnych i narządowych. Istotne znaczenie ma również opracowanie i wprowadzenie do laboratoriów, właściwych dla rozpoznania dirofilariozy, procedur badawczych. Celem niniejszej pracy była adaptacja procedur molekularnego rozpoznawania nicieni z rodzaju Dirofilaria. MATERIAŁ I METODY Izolaty uzyskane od ludzi. Zbadano trzy utrwalone nicienie pobrane w 2009 roku z tkanek trzech pacjentów z podejrzeniem choroby pasożytniczej (Tabela I). Na podstawie cech morfologicznych takich jak: długość i średnica ciała, ułożenie włókien i komórek mięśniowych, wygląd hypodermy i jej bocznych listewek, grubość i urzeźbienie wielowarstwowego oskórka określono, że nicienie te należą do gatunku Dirofilaria repens. Kontrola dodatnia. Do badań wykorzystano izolat DNA z krwi psa zarażonego D. repens. Intensywność inwazji wynosiła 3 larwy na 10 μl krwi. Kontrola ujemna. DNA wyizolowane z krwi zdrowego psa. Izolacja DNA. DNA izolowano z materiału utrwalonego w: alkoholu, formalinie lub utrwalonego w formalinie i zatopionego w bloczku parafinowym (Tabela I). Tabela I. Opis próbek nicieni wyizolowanych od ludzi. Nicień nr. Data izolacji z tkanek pacjenta Sposób przechowywania Czas przechowywania (tygodnie) r. Alkohol etylowy r. Bloczek parafinowy r. Formalina 46 Fragment robaka o długości około 6 mm utrwalony w 70% etanolu, suszono przez 20 minut w wirówce próżniowej w temperaturze 60ºC, po czym przy użyciu QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen) izolowano DNA zgodnie z zaleceniami producenta po 3 godzinnym trawieniu próbki proteinazą K. Z bloczka parafinowego z zatopionym robakiem ścięto 40 skrawków o grubości 20 µm. Skrawki odparafinowywano poprzez dwukrotne wytrząsanie w 1,5 ml ksylenu przez 10 min., w temp. pokojowej, a następnie dwukrotnie próbkę inkubowano przez 5 minut, kolejno w etanolu o stężeniu: 96%, 70%, 50% i płukano trzykrotnie, przez 10 min, wodą
3 Nr 2 Techniki genetyczne w diagnostyce dirofilariozy 183 destylowaną. Z tak przygotowanego materiału DNA izolowano za pomocą QIAamp Mini Kit (Qiagen) tak jak opisano powyżej. Próbkę robaka długości około 6-7 mm, przechowywanego w formalinie płukano trzykrotnie przez 30 min w wodzie destylowanej. Tak przygotowany materiał trawiono przez noc proteinazą K w buforze załączonym do zestawu QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen). Ponieważ w próbce wciąż widoczne były niestrawione fragmenty robaka, DNA izolowano z zebranej fazy ciekłej zgodnie z protokołem producenta zestawu Qiagen. Pozostałe fragmenty robaka, ponownie poddawano izolacji DNA używając zawiesiny ziemi okrzemkowej przygotowanej wg Boom i wsp. (2, 3), z następującymi modyfikacjami własnymi: 20μl zawiesiny ziemi okrzemkowej przemywano w 500μl buforu lizującego, w celu osiągnięcia odpowiedniego ph, a następnie wirowano 1 min przy obrotów na min. Do tak uzyskanego osadu dodawano fragmenty robaka pozostałe po trawieniu proteinazą K i ucierano je przy użyciu zasklepionej końcówki do pipety automatycznej. Dalsze etapy izolacji przebiegały zgodnie z protokołem opisanym przez Boom i wsp. (2). Amplifikacja DNA. W tradycyjnym PCR do powielania trzech różnych markerów genetycznych użyto trzech par starterów: DIDR-F1 AGT GCG AAT TGC AGA CGC ATT GAG i DIDR-R1 AGC GGG TAA TCA CGA CTG AGT TGA komplementarna do regionu 5.8S-ITS2-28S co najmniej dziewięciu gatunków filarii (produkt długości 484 pz dla D. repens), D.rep-F1 TGT TTC GGC CTA GTG TTT CGA CCA i D.rep-R1 ACG AGA TGT CGT GCT TTC AAC GTG otaczająca fragment 5SrRNA D. repens (dwa produkty o długości 247 pz i 153 pz), DR COI-F1 AGT GTT GAT GGT CAA CCT GAA TTA i DR COI-R1 GCC AAA ACA GGA ACA GAT AAA ACT komplementarna do mitochondrialnego genu podjednostki pierwszej oksydazy cytochromowej D. repens (produkt wielkości 208 par zasad) (14). Reakcje przebiegały w warunkach opisanych uprzednio (14), przy zwiększonej liczbie cykli do: 40 dla starterów DIDR-F1 i DIDR-R1 oraz D.rep-r1 i D.rep-F1, oraz do 45 cykli dla starterów DR COI-R1 i DR COI-F1. Do wszystkich reakcji PCR dodawano 1μl roztworu wyizolowanego DNA. Produkty PCR poddawano elektroforezie w żelach agarozowych z bromkiem etydyny, wyniki odczytywano w świetle UV. Real Time PCR przeprowadzono w objętości 25 μl mieszaniny, która zawierała: 500 nm startery DR COI-F1 AGT GTT GAT GGT CAA CCT GAA TTA i DR COI-R1 GCC AAA ACA GGA ACA GAT AAA ACT, jednokrotnie stężony roztwór KAPA SYBR qpcr Universal kit (KAPA Biosystems) zawierający polimerazę, deoksynukleotydy oraz barwnik Sybr Green (KAPA Biosystems) i 1μl DNA. Reakcję i odczyt wyników prowadzono w termocyklerze Corbett 6000 w następujących warunkach: 95ºC / 10 min, i 45 cykli: 95ºC / 30 s, 58ºC / 30 s, 72ºC / 40 s. W celu identyfikacji produktów uzyskano krzywą topnienia DNA inkubując produkty PCR po 5 s w temperaturach rosnących od 58ºC do 90ºC co 0.5ºC, z odczytem fluorescencji po każdej inkubacji. Za pomocą oprogramowania termocyklera Corbett obliczono stężenie DNA względem nierozcieńczonego preparatu izolowanego z materiału przechowywanego w etanolu (EtOH) ponieważ stężenie preparatu referencyjnego (etanol) było zbyt małe by uzyskać wiarygodny wynik pomiaru w spektrometrii UV. Przygotowano szereg dziesięciokrotnych rozcieńczeń materiału EtOH od 10-1 do Krzywą standardową wykonano dla zakresu rozcieńczeń od materiału nierozcieńczonego do rozcieńczonego 10-4 (wszystkie reakcje zduplikowane) i na jej podstawie dokonano obliczeń stężeń względnych (Tab. II).
4 184 A. Masny i inni Nr 2 Tabela II. Względne stężenie DNA w badanych próbkach. Próbka Stężenie względne Etanol 1 Bloczek 4,19 x 10-4 Formalina / krzemionka 2,78 x 10-5 K+ 1,24 x 10-2 WYNIKI W wyniku przeprowadzonych badań wszystkie zbadane próbki nicieni zakwalifikowano do gatunku Dirofilaria repens przy użyciu metod klasycznych i molekularnych. W tradycyjnym PCR z użyciem starterów DIDR-F1 i DIDR-R1, na matrycy DNA wyizolowanego z fragmentu robaka utrwalonego w etanolu, uzyskano produkt wielkości 484 pz charakterystyczny dla D. repens (Ryc. 1). Przy użyciu starterów D.rep-R1 i D.rep-F1 w tradycyjnym PCR dwa produkty oczekiwanej wielkości uzyskano amplifikując DNA izolowane z nicienia przechowywanego w etanolu; jeden produkt wielkości 153 par zasad uzyskano po amplifikacji DNA izolowanego z robaka zatopionego w bloczku parafinowym, co uznano za wynik wątpliwie dodatni (Ryc. 1). Dodatnie wyniki tradycyjnego PCR z parą starterów DR COI-R1 DR COI-F1 uzyskano dla DNA izolowanego z materiału utrwalonego w etanolu i bloczku parafinowym powielając fragment o długości 208 pz charakterystyczny dla D. repens (Ryc. 2). Próbki DNA izolowane z materiału przechowywanego w formalinie, niezależnie od metody użytej do izolacji, ze wszystkimi parami starterów dawały wynik ujemny w tradycyjnym PCR (Ryc. 1). Ryc. 1. Amplifikacja markerów rybosomalnych D. repens DIDR F1 / R1 startery dla genu 5.8S-ITS2-28S; D.rep F1/R1 startery dla fragmentu 5SrRNA D. repens; M marker wielkości fragmentów DNA Vivantis Technlogies VC 100bp Plus DNA Ladder, rozmiary fragmentów w parach zasad podane z boku zdjęcia; K+ kontrola dodatnia; K- kontrola ujemna; DNA izolowane z robaka przechowywanego w: E etanolu, B bloczku parafinowym, Fs formalinie (izolacja zestawem firmy Qiagen), Fq - formalinie (izolacja na ziemi okrzemkowej).
5 Nr 2 Techniki genetyczne w diagnostyce dirofilariozy 185 W Real Time PCR, po użyciu starterów DR COI-R1 DR COI-F1 uzyskano wynik dodatni dla preparatów z wszystkich robaków, chociaż amplifikacja DNA wyizolowanego zestawem Qiagen z robaka przechowywanego w formalinie dała wynik ujemny (Ryc. 3). Ryc. 2. Amplifikacja fragmentu genu podjednostki pierwszej oksydazy cytochromowej D. repens. M marker wielkości fragmentów DNA Vivantis Technlogies VC 100bp Plus DNA Ladder, rozmiary fragmentów w parach zasad podane z boku zdjęcia; K+, kontrola dodatnia; K-, kontrola ujemna; DNA izolowane z robaka przechowywanego w : E etanolu, B bloczku parafinowym, Fs formalinie (izolacja na ziemi okrzemkowej), Fq - formalinie (izolacja zestawem Qiagen). Na podstawie krzywej standardowej, o współczynniku korelacji R 2 =0.997, uzyskanej przy wydajności reakcji wynoszącej 0.97, i obliczonej za pomocą oprogramowania termocyklera oceniono, że materiał uzyskany z robaka zatopionego w bloczku parafinowym zawierał 4.19 x 10-4 razy mniej DNA niż próbka uzyskana z robaka przechowywanego w etanolu, a materiał uzyskany z robaka utrwalonego z formalinie za pomocą zmodyfikowanej metody Booma i innych (1999) 2.78 x 10-5 razy mniej (Tabela II). Pojawianie się niespecyficznego produktu oraz spadek wydajności i powtarzalności PCR obserwowano przy rozcieńczeniu 1 x 10-5 stężenia wyjściowego DNA uzyskanego z robaka utrwalonego etanolem (Ryc. 3). Ryc. 3. Krzywe topnienia produktów Real Time PCR z parą starterów DR COI-R1 i DR COI-F1. Oś pionowa: ujemna pochodna fluorescencji (F) po czasie (T); 1, 5, 9 - fluorescencja podana w jednostkach umownych. Oś pozioma: temperatura w stopniach Celsjusza; K+, kontrola dodatnia. K-, kontrola ujemna. DNA izolowane z robaka przechowywanego w: EtOH etanolu (podano rozcieńczenia), Bloczek bloczku parafinowym, F Q formalinie (izolacja zestawem Qiagen), F krzem. - formalinie (izolacja na ziemi okrzemkowej). Obok symboli próbek podano temperatury topnienia (Tm) szczytów znajdujących się powyżej krzywej odcięcia (linia równoległa do osi temperatury). Zakres Tm dla wyników dodatnich: od ºC (EtOH) do ºC (EtOH 10-5 ).
6 186 A. Masny i inni Nr 2 DYSKUSJA Inwazje D. repens u ludzi najczęściej objawiają się w postaci podskórnych guzków zawierających pojedyncze pasożyty. Guzki te mogą być umiejscowione w różnych okolicach ciała; czasami inwazje mogą dotyczyć także gałki ocznej. Wywoływane przez dirofilarie zmiany mogą być mylone ze zmianami nowotworowymi (5, 13). Rozpoznanie stawiane jest zwykle na podstawie wyników histopatologicznego badania materiału biopsyjnego. Rzadko możliwa jest morfologiczna ocena pasożyta wypreparowanego z tkanek. Identyfikacja mikroskopowa dirofilarii zawartych w skrawkach histopatologicznych jest trudna, gdyż uwidaczniane są różne przekroje ciała pasożytów będących w różnym stadium destrukcji. W przeprowadzonych dla celów obecnej pracy badaniach wykorzystano reakcję łańcuchową polimerazy do amplifikacji fragmentów genów dirofilarii rozpoznając nicienie, które wypreparowano z tkanek ludzkich. Zbadane pasożyty zakwalifikowano do gatunku D. repens, potwierdzając wyniki uprzednio przeprowadzonych badań parazytologicznych opartych na ocenie cech morfologicznych. Dwa ze zbadanych nicieni utrwalone były w formalinie, przy czym jeden był w niej przechowywany od czasu wypreparowania do czasu przeprowadzenia badań, a drugi bezpośrednio po utrwaleniu został zatopiony w bloczku parafinowym (Tabela I). Formaldehyd pozwala zachować morfologię tkanek, a także większość antygenów powierzchniowych jednak ogranicza wydajność reakcji amplifikacji. Reaguje on z zasadami azotowymi w cząsteczce DNA i RNA w wyniku czego dochodzi do modyfikacji i fragmentacji kwasów nukleinowych (7). W trakcie przeprowadzonych badań niepowodzeniem zakończyła się próba izolacji DNA z nicienia przechowywanego w formalinie, przeprowadzona za pomocą zestawu QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen), chociaż przy jego użyciu wyizolowano DNA z dwu pasożytów inaczej utrwalanych. Ponieważ w procedurze zestawu QIAamp DNA Mini Kit etap główny stanowi liza enzymatyczna, postanowiono zastosować metodę zawierającą etapy mechanicznej destrukcji i lizy chemicznej (2, 3). Agresywna homogenizacja przy użyciu ziemi okrzemkowej i liza chemiczna pozwoliły uwolnić DNA z utrwalonych w formalinie komórek chociaż wydajność procesu była zbyt niska by umożliwić wykrycie DNA za pomocą klasycznego PCR. Niekorzystny wpływ formaliny na cząsteczki DNA przekłada się na wyniki PCR (10) dlatego niska wydajność amplifikacji DNA próbki nicienia utrwalonego formaldehydem przed zatopieniem w bloczku parafinowym była spodziewana. Zaobserwowano tylko bardzo mało wydajne powielanie mniejszego (153 pz) z dwóch produktów i brak produktu większego (247 pz) w tradycyjnym PCR ze starterami D.rep-R1 i D.rep-F1 (Ryc. 1), co prawdopodobnie wynikało z fragmentacji DNA. Ponieważ liczba kopii DNA mitochondrialnego w organizmach jest większa niż liczba kopii rybosomalnego RNA, aby zwiększyć prawdopodobieństwo uzyskania dodatnich wyników amplifikacji DNA wyizolowanego z próbek utrwalonych w formalinie wykorzystano startery komplementarne do genu mitochondrialnego DR COI-F1 i DR COI-R1 powielając produkt wielkości 208 pz w Real Time PCR. Ilość DNA była wystarczająca do uzyskania produktu PCR tą metodą, jednak znajdowała się w pobliżu granicy wykrywalności. Ze względu na niską powtarzalność reakcji i pojawienie się niespecyficznego szczytu na wykresie krzywej topnienia za granicę czułości metody Real Time PCR przyjęto rozcieńczenie 10-5 próbki DNA nicienia utrwalonego w etanolu (Ryc. 3). Wartości uzyskane z krzywej
7 Nr 2 Techniki genetyczne w diagnostyce dirofilariozy 187 wzorcowej pozwalają ocenić różnice stężenia DNA w poszczególnych próbkach (Tabela II), wykazując najniższą czułość detekcji dla próbek przechowywanych w formalinie. W wyniku przeprowadzonych badań stwierdzono, że PCR w wersji tradycyjnej i Real Time mogą być użytecznymi metodami rozpoznawania nicieni Dirofilaria. Uzyskane wyniki pokazują, że materiał przeznaczony do badań molekularnych w kierunku dirofilariozy nie powinien być przechowywany w roztworach formaldehydu. W przypadku takich preparatów uzyskanie dodatniego wyniku badania jest możliwe, jednak wymaga zastosowania wydajnych metod izolacji DNA i wyższej czułości wykrywania produktów amplifikacji niż ta, którą zapewnia tradycyjny PCR z detekcją w żelu agarozowym barwionm bromkiem etydyny - warunki te spełnia Real Time PCR. A.Masny, H. Żarnowska-Prymek, D. Cielecka, R. Salamatin, E.Gołąb PROCEDURES FOR SPECIES IDENTIFICATION OF THE NEMATODES BELONGING TO DIROFILARIA GENUS PRESENT IN THE CLINICAL MATERIAL ISOLATED FROM HUMANS. SUMMARY Procedures for DNA extraction and amplification were modified to allow identification of Dirofilaria nematodes surgically removed from human tissues. Worm samples stored in: ethanol (24 weeks), formalin (46 weeks) or paraffin blocks (25weeks) were examined. Fragments of two ribosomal DNA regions (5.8S-ITS2-28S, 5SrRNA) and mitochondrial cytochrome oxidase subunit I gene were used as diagnostic markers. The highest PCR sensitivity was observed for DNA obtained from the worm preserved in ethanol, while the nucleic acid extracted form the parasite stored in formalin yielded the lowest PCR sensitivity. DNA extraction from the parasite preserved in formalin was more time consuming than DNA extraction from the remaining samples. Furthermore, the amplification of DNA isolated from the formaldehyde preserved worm allowed for identification of the parasite species only when the mitochondrial marker was used in Real Time PCR, and the amount of the obtained product was close to the detection limit. Species identification of the worms stored in the paraffin block and in ethanol was possible with both traditional and Real Time PCR. All analyzed worms were identified as D. repens which confirmed the species identification based on morphological features. The results show that molecular methods are relatively simple to use and suitable for identification of Dirofilaria sp. nematodes present in clinical material. Formalin is not suitable for storing material intended for molecular tests. PIŚMIENNICTWO 1. Babal P, Kobzova D, Novak I, Dubinsky P i inni. First case of cutaneous human dirofilariosis in Slovak Republic. Bratisl Lek Listy 2008; 109: Boom R, Sol C, Beld M i inni. Improved silica-guanidinium thiocyanate DNA isolation procedure based on selective binding of bovine alpha-casein to silica particles. J Clin Microbiol 1999; 37: Boom R, Sol CJ, Salimans MM i inni. Rapid and simple method for purification of nucleic acids. J Clin Microbiol 1990; 28: Cancrini G, Scaramozzino P, Gabrielli S i inni Aedes albopictus and Culex pipiens implicated as natural vectors of Dirofilaria repens in central Italy. J Med Entomol 2007; 44:1064-6
8 188 A. Masny i inni Nr 2 5. Cordonnier C, Chatelain D, Nevez G i inni. Difficulties in diagnosis of human dirofilariasis outside known enzootic areas. Rev Med Interne 2002; 23: Demiaszkiewicz AW, Polańczyk G, Pyziel AM i inni. Pierwsze ogniska dirofilariozy psów wywołanej przez Dirofilaria repens Railliet et Henry,1911 w centralnej Polsce. Wiad Parazytol 2009; 55: Do H, Dobrovic A. Limited copy number-high resolution melting (LCN-HRM) enables the detection and identification by sequencing of low level mutations in cancer biopsies. Mol Cancer 2009; 8:82 8. Korolev VA, Romashova MF. Dirofilariasis in the Autonomous Republic of Crimea Med Parazitol (Mosk). 2005; 1: Kuzmin Y, Varodi E, Vasylyk i inni. Experimental infection of mosquitoes with Dirofilaria repens (Nematoda, Filarioidea) larvae. Vestn Zool 2005;39: Miething F, Hering S, Hanschke B i inni. Effect of fixation to the degradation of nuclear and mitochondrial DNA in different tissues. J Histochem Cytochem 2006; 54: Miterpáková M, Antolová D, Hurníková Z i inni. Dirofilaria infections in working dogs in Slovakia. J Helminthol 2010; 84: Overgaauw PA, van Dijk EP. A worm infection in the skin of a dog. First autochthonous Dirofilaria repens infection of a dog in the Netherlands. Tijdschr Diergeneeskd 2009; 134: Pampiglione S, Rivasi F. Human dirofilariasis due to Dirofilaria (Nochtiella) repens: an update of world literature from 1995 to Parassitologia 2000; 42: Rishniw M, Barr SC, Simpson KW i inni. Discrimination between six species of canine microfilariae by a single polymerase chain reaction. Vet Parasitol : Żarnowska-Prymek H, Cielecka D, Salamatin R. Dirofilarioza - Dirofilaria repens, po raz pierwszy opisana u polskich pacjentów. Przegl Epidemiol 2008; 62: Otrzymano: 20 V 2010 Adres Autora: Warszawa, ul. Chocimska 24, Zakład Parazytologii Lekarskiej NIZP-PZH
Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego Państwowy Zakład Higieny Zakład Parazytologii Chocimska Warszawa
Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego Państwowy Zakład Higieny Zakład Parazytologii Chocimska 24 00-791 Warszawa Autoreferat dr n. biol. Aleksander Masny Warszawa 2017 1 1. Imię i Nazwisko: Aleksander
ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ
ŻYW NO ŚĆ 3(20)Supl 1999 JOANNA CHMIELEWSKA, JOANNA KAWA-RYGIELSKA ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ S t r e s z c z e n i e W pracy podjęto próbę wykorzystania metody
DIROFILARIOZA DIROFILARIA REPENS - PO RAZ PIERWSZY OPISANA U POLSKICH PACJENTÓW
PRZEGL EPIDEMIOL 2008; 62: 547-551 Hanna Żarnowska-Prymek 1,3, Danuta Cielecka 2, Rusłan Salamatin 2,4 DIROFILARIOZA DIROFILARIA REPENS - PO RAZ PIERWSZY OPISANA U POLSKICH PACJENTÓW 1 Klinika Chorób Odzwierzęcych
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa IZOLACJA DNA Z HODOWLI KOMÓRKOWEJ.
Ampli-LAMP Babesia canis
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400
AmpliTest Babesia spp. (PCR)
AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK25N Wersja zestawu: 1.2012 Zestaw do wykrywania spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Zestaw
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK24N Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Detekcja
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa tel. 22 572 0735, 606448502
Ćwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO
Ćwiczenie numer 6 Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO 1. Informacje wstępne -screening GMO -metoda CTAB -qpcr 2. Izolacja DNA z soi metodą CTAB 3. Oznaczenie ilościowe i jakościowe DNA
OPRACOWANIE WYDAJNYCH PROCEDUR IZOLACJI DNA CRYPTOSPORIDIUM SP. I TRICHINELLA SPIRALIS Z PRÓBEK KAŁU
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 259-265 Aleksander Masny, Wioletta Rożej, Elżbieta Gołąb 1 OPRACOWANIE WYDAJNYCH PROCEDUR IZOLACJI DNA CRYPTOSPORIDIUM SP. I TRICHINELLA SPIRALIS Z PRÓBEK KAŁU Narodowy
POLISH PARASITOLOGY AT THE TURN OF THE 21 st CENTURY
POLISH PARASITOLOGICAL SOCIETY COMMITTEE ON PARASITOLOGY OF THE POLISH ACADEMY OF SCIENCES W. STEFAŃSKI INSTITUTE OF PARASITOLOGY PAS POLISH PARASITOLOGY AT THE TURN OF THE 21 st CENTURY Book of Abstracts
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR)
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzaju Salmonella techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
Novabeads Food DNA Kit
Novabeads Food DNA Kit Novabeads Food DNA Kit jest nowej generacji narzędziem w technikach biologii molekularnej, umożliwiającym izolację DNA z produktów spożywczych wysoko przetworzonych. Metoda oparta
TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R
TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków)
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków) Celem ćwiczenia jest wprowadzenie mutacji punktowej do genu
MATERIAŁY SZKOLENIOWE DLA ZAKŁADÓW HIGIENY WETERYNARYJNEJ W ZAKRESIE LABORATORYJNEJ DIAGNOSTYKI AFRYKAŃSKIEGO POMORU ŚWIŃ
MATERIAŁY SZKOLENIOWE DLA ZAKŁADÓW HIGIENY WETERYNARYJNEJ W ZAKRESIE LABORATORYJNEJ DIAGNOSTYKI AFRYKAŃSKIEGO POMORU ŚWIŃ Puławy 2013 Opracowanie: Prof. dr hab. Iwona Markowska-Daniel, mgr inż. Kinga Urbaniak,
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR)
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA terminatora NOS techniką Real Time PCR Nr kat.: GMO03-50 GMO03-100 Wielkość zestawu: 50 reakcji 100 reakcji Objętość pojedynczej
TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925
TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów:
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów: dobór warunków samej reakcji PCR (temperatury, czas trwania cykli, ilości cykli itp.) dobór odpowiednich starterów do reakcji amplifikacji
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR)
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzajów Chlamydia i Chlamydophila techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC18-50 BAC18-100 Wielkość
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 26/11
PL 214501 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 214501 (13) B1 (21) Numer zgłoszenia: 391458 (51) Int.Cl. C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/29 (2006.01) Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Zestawy do izolacji DNA i RNA
Syngen kolumienki.pl Gotowe zestawy do izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych Zestawy do izolacji DNA i RNA Katalog produktów 2012-13 kolumienki.pl Syngen Biotech Sp. z o.o., 54-116 Wrocław, ul. Ostródzka
Ampli-LAMP Goose Parvovirus
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego parwowirusa GPV u gęsi techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-GPV-200 AML-GPV-400 Wydanie
Parametr Wymagany parametr Oferowany parametr 1. 2. 3. a) z wbudowaną pompą membranową PTEE, b) kondensorem par, System
Załącznik nr 1A do SIWZ. PARAMETRY TECHNICZNE PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA Zadanie nr 1. TERMOSTAT CYRKULACYJNY Termostat cyrkulacyjny Z grzaniem i chłodzeniem Zakres temperatury roboczej 25 o C do + 200 o C
Pakiet 3 Zestawy do izolacji, detekcji i amplifikacji badań grypy i Borrelia met. real time PCR część 67
Pakiet 3 Zestawy do izolacji, detekcji i amplifikacji badań grypy i Borrelia met. real time część 7 L.p. Przedmiot zamówienia Wymagania jakościowe Producent i nr katalogowy dla produktu równowaŝnego Ilość
Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO. Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB
Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB Walidacja Walidacja jest potwierdzeniem przez zbadanie i przedstawienie
Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów
Załącznik nr 1 do SIWZ Nazwa i adres Wykonawcy Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Przedmiot zamówienia; automatyczny system do diagnostyki molekularnej:
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR)
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii Borrelia burgdorferi, Anaplasma, Ehrlichia oraz pierwotniaków rodzaju Babesia (B. canis, B. gibsoni,
fix RNA Roztwór do przechowywania i ochrony przed degradacją próbek przeznaczonych do izolacji RNA kat. nr. E0280 Sierpień 2018
Sierpień 2018 fix RNA Roztwór do przechowywania i ochrony przed degradacją próbek przeznaczonych do izolacji RNA kat. nr. E0280 EURx Ltd. 80-297 Gdansk Poland ul. Przyrodnikow 3, NIP 957-07-05-191 KRS
RT31-020, RT , MgCl 2. , random heksamerów X 6
RT31-020, RT31-100 RT31-020, RT31-100 Zestaw TRANSCRIPTME RNA zawiera wszystkie niezbędne składniki do przeprowadzenia syntezy pierwszej nici cdna na matrycy mrna lub całkowitego RNA. Uzyskany jednoniciowy
ANALIZA MOLEKULARNA BIOCENOZ BAKTERYJNYCH Ćwiczenia 2017/18
ANALIZA MOLEKULARNA BIOCENOZ BAKTERYJNYCH Ćwiczenia 2017/18 A. Rybotypowanie bakterii w osadzie czynnym techniką ARDRA (ang. Amplified rdna Restriction Analysis) Informacje dotyczące analizowanych prób:
Program kursu specjalizacyjnego z mikrobiologii medycznej (dla uczestników)
Program kursu specjalizacyjnego z mikrobiologii medycznej (dla uczestników) Tytuł kursu: Etiologia, obraz kliniczny i diagnostyka zarażeń pasożytniczych Kierownik kursu: dr Agata Pietrzyk Liczba godzin
PathogenFree DNA Isolation Kit Zestaw do izolacji DNA Instrukcja użytkownika
PathogenFree DNA Isolation Kit Zestaw do izolacji DNA Instrukcja użytkownika Spis treści 1. Zawartość 2 1.1 Składniki zestawu 2 2. Opis produktu 2 2.1 Założenia metody 2 2.2 Instrukcja 2 2.3 Specyfikacja
Techniki molekularne ćw. 1 1 z 6
Techniki molekularne ćw. 1 1 z 6 Instrukcja do ćwiczeń Nr 1. Temat: Izolacja całkowitego DNA z tkanki ssaczej metodą wiązania DNA do kolumny krzemionkowej oraz spektrofotometryczna ocena jego czystości
Metody badania ekspresji genów
Metody badania ekspresji genów dr Katarzyna Knapczyk-Stwora Warunki wstępne: Proszę zapoznać się z tematem Metody badania ekspresji genów zamieszczonym w skrypcie pod reakcją A. Lityńskiej i M. Lewandowskiego
2. Przedmiot zamówienia: Odczynniki chemiczne do izolacji DNA i reakcji PCR, wymienione w Tabeli 1. Nazwa odczynnika Specyfikacja Ilość*
Poznao, 6 lutego 2012 r. Zapytanie ofertowe nr 001 /2012 dotyczące zakupu odczynników chemicznych do izolacji DNA i reakcji PCR GENESIS Polska Sp. z o.o Ul. Za Cytadelą 19, 61-659 Poznao NIP 778 13 56
Diagnostyka parazytoz jak sprawdzić z kim mamy do czynienia?
https://www. Diagnostyka parazytoz jak sprawdzić z kim mamy do czynienia? Autor: Anna Bartosik Data: 24 kwietnia 2019 W poprzedniej części naszego kompendium wiedzy o pasożytach świń odpowiedzieliśmy na
Applied Biosystems 7500 Fast Real Time PCR System, czyli Mercedes wśród termocyklerów do analizy PCR w czasie rzeczywistym
Applied Biosystems 7500 Fast Real Time PCR System, czyli Mercedes wśród termocyklerów do analizy PCR w czasie rzeczywistym Rynek aparatury laboratoryjnej pęka w szwach od ilości różnych aparatów przeznaczonych
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane
Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16
Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16 Ćwiczenie 3 Identyfikacja genetycznie modyfikowanych roślin w produktach spożywczych - jakościowe badanie obecności
Prowadzący: dr Lidia Boss znacznik fluorescencyjny (np. SYBR Green II)
Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii Biologia i Biologia Medyczna II rok Katedra Biologii Molekularnej Przedmiot: Biologia Molekularna z Biotechnologią ============================================================================
PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 04/14. SYLWIA OKOŃ, Dąbrowica, PL KRZYSZTOF KOWALCZYK, Motycz, PL
PL 220315 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 220315 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 400252 (22) Data zgłoszenia: 06.08.2012 (51) Int.Cl.
lutego 2012
Dlaczego mikrodysekcja laserowa? Agnieszka Łoboda Zakład Biotechnologii Medycznej Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ, Kraków Mikrodysekcja laserowa szybka metoda izolacji komórek z preparatów
Gel-Out. 50 izolacji, 250 izolacji. Nr kat , Zestaw do izolacji DNA z żelu agarozowego. wersja 0617
Gel-Out Zestaw do izolacji DNA z żelu agarozowego. wersja 0617 50 izolacji, 250 izolacji Nr kat. 023-50, 023-250 Pojemność kolumny do izolacji DNA - do 20 µg DNA, minimalna pojemność - 2 µg DNA (przy zawartości
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Wstęp teoretyczny Technika RAPD (ang. Random Amplification of Polymorphic DNA) opiera się na prostej reakcji PCR, przeprowadzanej na genomowym
Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9
Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów Rozdział 9 Wykrywanie jakościowe kukurydzy MON810, kukurydzy Bt-176 i soi Roundup Ready metodą PCR M. Querci, M. Maretti, M. Mazzara
Genetyka, materiały dla studentów Pielęgniarstwa
Markery genetyczne: definicja Marker genetyczny jest to cecha, która może być wykorzystana do identyfikacji osobników lub gatunków. Cechy markerów genetycznych Monogeniczny: warunkowany przez jeden gen
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan Klasyczna metoda PCR jest metodą jakościową, nie ilościową co np.
Genomic Maxi AX zestaw do izolacji genomowego DNA wersja 0616
Genomic Maxi AX zestaw do izolacji genomowego DNA wersja 0616 10 izolacji Nr kat. 995-10 Pojemność kolumny do oczyszczania DNA wynosi 500 µg 1 Skład zestawu Składnik Ilość Temp. Przechowywania Kolumny
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie, PCR-RLFP, PCR-Multiplex, PCR-ASO
Diagnostyka molekularna Dr n.biol. Anna Wawrocka Strategia diagnostyki genetycznej: Aberracje chromosomowe: Metody:Analiza kariotypu, FISH, acgh, MLPA, QF-PCR Gen(y) znany Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie,
Autor: dr Mirosława Staniaszek
Zakład Hodowli Roślin Ogrodniczych Pracownia Genetyki i Hodowli Roślin Warzywnych Fot. J. Sobolewski Procedura identyfikacji genu Frl warunkującego odporność pomidora na Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici
SKUTECZNOŚĆ IZOLACJI JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI? JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI?
SKUTECZNOŚĆ IZOLACJI Wydajność izolacji- ilość otrzymanego kwasu nukleinowego Efektywność izolacji- jakość otrzymanego kwasu nukleinowego w stosunku do ilości Powtarzalność izolacji- zoptymalizowanie procedury
Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych
Cat. No. EM07.1 Wersja: 1.2017 NOWA WERSJA Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych EXTRACTME jest zarejestrowanym znakiem towarowym BLIRT S.A. www.blirt.eu Nr kat. EM07.1 I. PRZEZNACZENIE
SPECYFIKACJA TECHNICZNA AGAROZ
SPECYFIKACJA TECHNICZNA AGAROZ D1 LOW EEO i D1 MEDIUM EEO, D1 HIGH EEO D1 LOW EEO GQT; (Genetic Quality Tested) D2 HIGH GELLING TEMPERATURE D5 HIGH STRENGTH GEL Agaroza LM Agaroza LM GQT; (Genetic Quality
Izolacja RNA metodą kolumienkową protokół
Izolacja RNA metodą kolumienkową protokół Istnieją dwa główne sposoby izolacji RNA. Izolacja przez ekstrakcję odczynnikiem zawierającym fenol i izotiocyjanian guanidyny oraz izolacja wykorzystująca powinowactwo
Genomic Midi AX. 20 izolacji
Genomic Midi AX Uniwersalny zestaw o zwiększonej wydajności do izolacji genomowego DNA z różnych materiałów. Procedura z precypitacją DNA. wersja 0517 20 izolacji Nr kat. 895-20 Pojemność kolumny do oczyszczania
Procedura pobrania i transportu materiału do badania
Procedura pobrania i transportu materiału do badania A. Do badań cytogenetycznych - hematoonkologia A1. KARIOTYP - żywe komórki A2. FISH - żywe komórki A3. FISH materiał z bloczków parafinowych B. Do badań
Zestaw dydaktyczny. genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP
2014-07-17 Zestaw dydaktyczny EasyGenotyping PCR-RFLP - S. aureus genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP Celem ćwiczenia jest przeprowadzenie typowania genetycznego dostarczonych
WALIDACJA TECHNIKI PCR dr inż. Krystyna Pappelbaum WSSE Bydgoszcz
WALIDACJA TECHNIKI PCR dr inż. Krystyna Pappelbaum WSSE Bydgoszcz ZASADY TECHNIKI PCR Technika PCR (ang. Polymerase Chain Reaction) opiera się na prowadzeniu łańcuchowej reakcji polimerazy DNA (temostabilnego
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca
Laboratorium Wirusologiczne
Laboratorium Wirusologiczne Krzysztof Pyrd Pracownia wirusologiczna: Powstanie i wyposażenie całkowicie nowego laboratorium w ramach Zakładu Mikrobiologii WBBiB Profil: laboratorium molekularno-komórkowe
Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych. Nr kat. EM08 Wersja zestawu:
Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych Nr kat. EM08 Wersja zestawu: 1.2012 www.dnagdansk.com Nr kat. EM08 I. PRZEZNACZENIE ZESTAWU Zestaw EXTRACTME DNA GEL OUT przeznaczony jest do szybkiej i wydajnej
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1 1 Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Korzeniowych, Pracownia Biotechnologii, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji
JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI? JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI?
Podstawowe miary masy i objętości stosowane przy oznaczaniu ilości kwasów nukleinowych : 1g (1) 1l (1) 1mg (1g x 10-3 ) 1ml (1l x 10-3 ) 1μg (1g x 10-6 ) 1μl (1l x 10-6 ) 1ng (1g x 10-9 ) 1pg (1g x 10-12
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Analityka Medyczna 2016
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Analityka Medyczna 2016 Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa Analiza
Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych. Nr kat. EM03 Wersja zestawu:
Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych Nr kat. EM03 Wersja zestawu: 1.2012 I. PRZEZNACZENIE ZESTAWU Zestaw EXTRACTME DNA CLEAN-UP przeznaczony jest do szybkiego i wydajnego oczyszczania
PathogenFree RNA Isolation Kit Zestaw do izolacji RNA
PathogenFree RNA Isolation Kit Zestaw do izolacji RNA Instrukcja użytkownika Spis treści 1. Zawartość 2 1.1 Składniki zestawu 2 2. Opis produktu 2 2.1 Założenia metody 2 2.2 Specyfikacja zestawu 2 2.3
Monitoring genetyczny populacji wilka (Canis lupus) jako nowy element monitoringu stanu populacji dużych drapieżników
Monitoring genetyczny populacji wilka (Canis lupus) jako nowy element monitoringu stanu populacji dużych drapieżników Wojciech Śmietana Co to jest monitoring genetyczny? Monitoring genetyczny to regularnie
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa tel. 22 572 0735, 606448502
Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych. Nr kat. EM08 Wersja zestawu:
Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych Nr kat. EM08 Wersja zestawu: 1.2014 www.dnagdansk.com 2 Nr kat. EM08 I. PRZEZNACZENIE ZESTAWU Zestaw EXTRACTME DNA GEL OUT przeznaczony jest do szybkiej i wydajnej
AmpliTest TBEV (Real Time PCR)
AmpliTest TBEV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla TBEV (Tick-borne encephalitis virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV03-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość pojedynczej
ROCZN. PZH, 1998, 49, 73-86
ROCZN. PZH, 1998, 49, 73-86 74 wane narzędzia i sprzęt medyczny. Przeniesienie grzybów Candida m oże nastąpić przez ręce personelu, bieliznę, pościel, sprzęt do pielęgnacji i leczenia. C elem pracy było
AmpliTest BVDV (Real Time PCR)
AmpliTest BVDV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla wirusa BVD (Bovine Viral Diarrhea Virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
PL 217144 B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego
PL 217144 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 217144 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 391926 (22) Data zgłoszenia: 23.07.2010 (51) Int.Cl.
bi ~ Zestaw dydal<tyczny umożliwiający przeprowadzenie izolacji genomowego DNA z bakterii EasyLation Genomie DNA INSTRUI<CJA DLA STUDENTÓW
Zestaw dydaktyczny EasyLation Genomie DNA Nr kat. DY80 Wersja zestawu: 1.2014 Zestaw dydal
PYTANIE Pakiet nr 1- Pozycja nr 52 Czy Zamawiający akceptuje kuwetę plastikową UV o pomiarze zawierającym się pomiędzy nm?
Poznań, dnia 16.06.2014 EZ/350/51/2014/780 Wg rozdzielnika: do wszystkich zainteresowanych i uczestników postępowania o zamówienie publiczne.nr EZ/350/51/2014 dotyczy: Zakup i dostawa odczynników, materiałów
Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych
Nr kat. EM07 Wersja zestawu: 1.2014 Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych EXTRACTME jest zastrzeżonym znakiem towarowym firmy BLIRT S.A. www.dnagdansk.com Nr kat. EM07 I. PRZEZNACZENIE
Genomic Maxi AX Direct
Genomic Maxi AX Direct Uniwersalny zestaw o zwiększonej wydajności do izolacji genomowego DNA z różnych materiałów. Procedura bez etapu precypitacji. wersja 0517 10 izolacji Nr kat. 995-10D Pojemność kolumny
Ilość TAK TAK TAK TAK TAK TAK
Postępowanie WB.2420.6.2013.NG ZAŁĄCZNIK NR 5 L.p. Nazwa asortymentu parametry techniczne Ilość Nazwa wyrobu, nazwa producenta, określenie marki, modelu, znaku towarowego Cena jednostkowa netto (zł) Wartość
Syngen Gel/PCR Mini Kit
Syngen Gel/PCR Mini Kit Syngen Gel/PCR ME Mini Kit Zestawy do oczyszczania DNA: - z żelu agarozowego - po reakcji PCR i innych reakcjach enzymatycznych - z żelu agarozowego z małą objętością elucji - po
Polimeraza Taq (1U/ l) 1-2 U 1 polimeraza Taq jako ostatni składniki mieszaniny końcowa objętość
Ćwiczenie 6 Technika PCR Celem ćwiczenia jest zastosowanie techniki PCR do amplifikacji fragmentu DNA z bakterii R. leguminosarum bv. trifolii TA1 (RtTA1). Studenci przygotowują reakcję PCR wykorzystując
W związku z wydzieleniem pakietów i dodaniem nowych zmianie ulegają zapisy SIWZ.
Poznań, dnia 06.06.2016 EZ/350/30/2016/928 Wg rozdzielnika: do wszystkich zainteresowanych i uczestników postępowania o zamówienie publiczne. dotyczy: przetargu nieograniczonego nr EZ/350/30/2016 Zakup
Izolowanie DNA i RNA z komórek hodowlanych. Ocena jakości uzyskanego materiału
II ROK KIERUNEK WETERYNARIA UJCM INSTRUKCJA DO ĆWICZEŃ LABORATORYJNYCH VIII Izolowanie DNA i RNA z komórek hodowlanych. Ocena jakości uzyskanego materiału 2013/2014 2 ĆWICZENIE VIII Preparatyka całkowitego
Klub Młodego Wynalazcy - Laboratoria i wyposażenie. Pracownia genetyki
Klub Młodego Wynalazcy - Laboratoria i wyposażenie Zadbaliśmy o to, żeby wyposażenie w Klubie Młodego Wynalazcy było w pełni profesjonalne. Ważne jest, aby dzieci i młodzież, wykonując doświadczenia korzystały
Gorączka Q epidemiologia, patogeneza oraz diagnostyka laboratoryjna. Wskazówki dla lekarzy weterynarii i hodowców
Gorączka Q epidemiologia, patogeneza oraz diagnostyka laboratoryjna. Wskazówki dla lekarzy weterynarii i hodowców Agnieszka Warda-Sporniak Główny Inspektorat Weterynarii gorączka Q tabela 4 choroby rejestrowane
(Akty o charakterze nieustawodawczym) DECYZJE
19.7.2019 PL L 193/1 II (Akty o charakterze nieustawodawczym) DECYZJE DECYZJA WYKONAWCZA KOMISJI (UE) 2019/1244 z dnia 1 lipca 2019 r. zmieniająca decyzję 2002/364/WE w odniesieniu do wymogów dotyczących
Dr Anna Linkiewicz Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin - PIB LAB-GMO Maj 2015
Genetycznie modyfikowana żywność i pasze Streszczenie zajęć Blisko 50 różnych GMO jest dopuszczonych do stosowania w Unii Europejskiej jako żywność lub pasza. Podczas zajęć wyizolowane zostanie DNA z produktów
Mikrosatelitarne sekwencje DNA
Mikrosatelitarne sekwencje DNA Małgorzata Pałucka Wykorzystanie sekwencji mikrosatelitarnych w jądrowym DNA drzew leśnych do udowodnienia pochodzenia materiału dowodowego w postępowaniu sądowym 27.09.2012
Sherlock AX. 25 izolacji, 100 izolacji
Sherlock AX Zestaw do izolacji genomowego DNA z materiałów o jego śladowej zawartości (plamy krwi, nasienia i śliny, włosy i sierść, tkanki zakonserwowane w parafinie i formalinie, tkanki świeże, krew