* Praca sfinansowana częściowo ze środków na badania własne (KNW-2-133/08) oraz statutowe ŚUM (KNW-1-145/08).

Wielkość: px
Rozpocząć pokaz od strony:

Download "* Praca sfinansowana częściowo ze środków na badania własne (KNW-2-133/08) oraz statutowe ŚUM (KNW-1-145/08)."

Transkrypt

1 Streszczenie Metaloproteazy macierzy pozakomórkowej (MMP) należą do enzymów biorących udział w licznych procesach zarówno o charakterze fizjologicznym (np. jak gojenie się ran), jak również patologicznym, w tym przede wszystkim w onkogenezie. Ze względu na swój wielostronny wpływ na rozwój i progresję nowotworów złośliwych, nadekspresja genów kodujących MMP - zwłaszcza żelatynazę A i B (MMP-2 i MMP-9) - jest uważana za jeden z głównych czynników prognozujących nasiloną inwazyjność nowotworu. W pracy przedstawiono wyniki analizy wpływu wybranych tetracyklin (doksycykliny, oksytetracykliny, tetracykliny i limecykliny), które wykazują zdolność do modulacji ekspresji i aktywności MMP, na inwazyjność komórek nowotworowych raka płuc oraz raka pęcherza in vitro (linie komórkowe A549 i T24). Do wyznaczenia optymalnych stężeń i czasu traktowania zastosowano test MTT. Następnie zbadano wpływ tetracyklin na ekspresję żelatynazy A i B na poziomie mrna i białka. Wykazano zależność ekspresji mrna genów kodujących żelatynazy od stężenia badanych modulatorów, choć różnice w zależności od użytego związku oraz linii komórkowej były dość istotne. Na poziomie białka, za pomocą zymografii, wykazano zależny od dawki spadek ekspresji obu żelatynaz we wszystkich badanych hodowlach. W kolejnym etapie badań analizowano wpływ badanych modulatorów MMP na efekty fenotypowe w hodowlach komórek nowotworowych. Wykazano istotny spadek potencjału inwazyjnego komórek obu linii po traktowaniu tetracyklinami - ruchliwość i migracja komórek nowotworowych w teście wound healing assay malała wraz ze wzrostem stężenia danego modulatora. Badanie adhezji komórek do białek matriżelu wykazało, iż proces ten jest silnie hamowany głównie przez tetracyklinę, jednak tylko w przypadku komórek raka płuc. Ogólnie najsilniejszy wpływ modulacyjny, zarówno na ekspresję żelatynaz, jak i na inwazyjność komórek nowotworowych, wykazała doksycyklina, co znajduje odzwierciedlenie w doniesieniach innych autorów. Słowa kluczowe: metaloproteazy macierzy pozakomórkowej (MMP), żelatynaza A i B (MMP-2 i MMP-9), tetracykliny, inwazyjność nowotworów, rak płuca, rak pęcherza. Abstract Matrix metalloproteinases (MMPs) are enzymes involved in numerous physiological (e.g. wound healing), as well as pathological processes where oncogenesis is the most significant one. Due to their multifunctionality in tumour promotion and progression, MMPs - especially gelatinase A and B (MMP-2, MMP-9) - overexpression is considered to be the major prognostic factor in cancer invasiveness. In this study we performed analysis of the influence of selected tetracyclines (doxycycline, oxytetracycline, tetracycline, and limecycline), which were postulated to be capable of modulating MMPs expression, on the lung cancer and bladder cancer cells invasiveness in vitro (A549 and T24 cell lines). MTT test was used to determine optimal concentrations and treatment intervals in the experiments. Then, we analysed the influence of the tetracyclines on gelatinase A and B expression both at mrna, and protein level. Generally, mrna expression depended on the concentration of the modulators, although there were significant differences depending on the cell line or modulator type. At the protein level there was a concentration-dependent decrease in the gelatinases expression in all studied cultures, as was ascertained zymographically. Further research was focused on the problem how MMP modulators effected cancer cells phenotype. Obtained results indicate there was a decrease in invasive potential of both cell lines after tetracyclines treatment; cell motility and migration decreased as the concentration of the certain modulator increased, as was shown in wound healing assay. Cell adhesion to matrigel proteins showed that only tetracycline performed significant inhibitory effect on that process in lung cancer cell cultures. Taken together our results indicated that the strongest inhibition on both gelatinases expression, and on cancer invasiveness was performed by doxycycline. These results are in concordance with other papers. Key words: matrix metalloproteinases (MMPs), gelatinase A and B (MMP-2 and MMP-9), tetracyclines, cancer invasiveness, lung cancer, bladder cancer. * Praca sfinansowana częściowo ze środków na badania własne (KNW-2-133/08) oraz statutowe ŚUM (KNW-1-145/08).

2 Wykaz skrótów: DPBS (Dulbecco s phosphate buffered saline) sól fizjologiczna buforowana fosforanami, EGF (epidermal growth factor) naskórkowy czynnik wzrostu, FBS (fetal bovine serum) bydlęca surowica płodowa, MMP (matrix metalloproteinases) metaloproteazy macierzy pozakomórkowej, MTT - bromek 3-(4,5-dimetylotiazol-2-ilo)-2,5-difenylotetrazoliowy, RNAi (RNA interference) interferencja RNA, TIMP (tissue inhibitors of matrix metalloproteinases) tkankowe inhibitory metaloproteaz macierzy pozakomórkowej. Badania nad białkami z grupy metaloproteaz macierzy pozakomórkowej (MMPs matrix metalloproteinases) prowadzone są od ponad dwudziestu lat. Na ich podstawie wykazano, iż podstawowa funkcja tych enzymów, jaką jest proteolityczna degradacja i przebudowa białek macierzy zewnątrzkomórkowej, wpływa zarówno na przebieg procesów fizjologicznych, takich jak gojenie ran, przebudowa i wzrost kości, apoptoza, jak i zjawisk patologicznych, z których szczególnie ważnym jest proces nowotworzenia. Udział MMP w rozwoju nowotworu jest szczególnie ważny, gdyż uczestniczą one we wszystkich jego etapach począwszy od wzrostu guza pierwotnego, angiogenezy, poprzez etap związany z przerwaniem integralności bariery błony podstawnej, naciekaniem okolicznych tkanek i przerzutowaniem mechanizmy związane z inwazyjnością komórek nowotworowych - aż po rozwój guzów wtórnych [1, 2, 3]. Równocześnie prowadzone są badania dotyczące inhibitorów MMP, mające na celu wprowadzenie ich do lecznictwa w terapii chorób nowotworowych. Istotą działania terapeutycznego inhibitorów MMP ma być zahamowanie funkcji enzymatycznej docelowych metaloproteaz, a w rezultacie zahamowanie rozwoju nowotworów [4, 5, 6]. Ekspresję i aktywność MMP reguluje wiele czynników o charakterze endogennym, jak też coraz liczniej opisywane czynniki zewnętrzne [7]. Badania nad inhibitorami MMP o zastosowaniu terapeutycznym dotyczą małocząsteczkowych związków niebiałkowych, w tym bifosfonianów i tetracyklin, naturalnych inhibitorów o budowie peptydowej (np. TIMP tissue inhibitors of matrix metalloproteinases), jak też prób wykorzystania metod terapii genowej (np. interferencyjnego RNA RNAi, czy też aptamerów). Ponieważ prowadzone do tej pory próby wprowadzenia do lecznictwa leków z grupy białkowych, niebiałkowych inhibitorów oraz bifosfonianów zakończyły się niepowodzeniem, głównie z powodu poważnych działań niepożądanych występujących po zastosowaniu tych preparatów, w ostatnich latach szczególną uwagę skupiono na tetracyklinach, zarówno naturalnych, jak i ich półsyntetycznych pochodnych [8, 9]. Podstawową zaletą tej grupy leków jest szerokie spektrum działania inhibitorowego - odpowiadają za hamowanie aktywności zarówno kolagenaz, jak i żelatynaz oraz działanie na poziomie zarówno ekspresji genów, jak i aktywacji latentnych form MMPs. Istotną cechą tej grupy modulatorów jest też wysoka biodostępność po podaniu doustnym (wchłaniają się z przewodu pokarmowego w około 80%) oraz dobra penetracja tkanek - tetracykliny przenikają przez barierę krew-mózg, przez łożysko, do dróg oddechowych, moczowo-płciowych, wątroby, a nawet zębów i kości [10]. Z uwagi na wielokierunkowy udział MMP w procesach nowotworzenia istnieje konieczność dokładnej charakterystyki mechanizmów ich roli w wyżej wymienionych procesach. Celem badań przedstawionych w pracy była analiza udziału metaloproteaz macierzy pozakomórkowej w inwazyjności i progresji nowotworów w modelu in vitro. W tym celu zaprojektowano schemat badań służących ocenie wpływu wybranych modulatorów z grupy tetracyklin, hamujących aktywność metaloproteaz macierzy pozakomórkowej, na efekty fenotypowe związane z inwazyjnością komórek nowotworowych niedrobnokomórkowego raka płuc (linia A549) i raka pęcherza (linia T24). Warunki hodowli in vitro Badania przeprowadzono na hodowlach in vitro ludzkich linii nowotworowych A549 (ATCC: CCL-185) oraz T24 (ATCC: HTB-4) wywodzących się odpowiednio z raka płuc oraz raka pęcherza. Hodowle prowadzone były w standardowych warunkach (37 C, 5% wysycenie atmosfery CO 2 ), w pożywce hodowlanej RPMI-1640 (PAA) z dodatkiem 10% bydlęcej surowicy płodowej (FBS) (PAA) oraz gentamycyny (2 μg/ml) (PAA), w inkubatorze Hera-Cell (Heraeus). Monitoring prowadzonych hodowli (liczba komórek żywych i martwych, morfologia komórek) prowadzono metodą mikroskopii świetlnej z użyciem 0,4% roztworu błękitu trypanu w soli fizjologicznej (Sigma-Aldrich) w komorze hemocytometrycznej Neubauera przy użyciu mikroskopu odwróconego Axiovert 40CFL (Zeiss). Warunki traktowania hodowli komórkowych badanymi modulatorami ekspresji żelatynaz Komórki nowotworowe w prowadzonych hodowlach in vitro poddawano działaniu wybranych modulatorów ekspresji MMP z grupy tetracyklin: hyklatu doksycykliny (Sigma- Aldrich), chlorowodorku oksytetracykliny (Sigma-Aldrich), chlorowodorku tetracykliny (Polfa Tarchomin) i limecykliny (Galderma). Odpowiednią liczbę komórek wysiewano na płytki hodowlane 96-dołkowe lub 24-dołkowe i inkubowano przez noc. Następnego dnia usuwano pożywkę, przepłukiwano płytki 2-krotnie roztworem Dulbecco PBS (DPBS), po czym dodawano świeżo przygotowaną pożywkę bez surowicy zawierającą odpowiednie stężenia badanych modulatorów. Zastosowano następujące stężenia badanych tetracyklin w kolejnych procedurach badawczych: testy MTT - 200μM, 100μM, 50μM, 25μM, 12,5μM, 6μM, 3μM; zymografia, RT-PCR - 50μM, 12,5μM, 3μM; badanie adhezji komórek do matriżelu, wound healing assay - 50μM, 25μM, 12,5μM, 6μM, 3μM. Czas traktowania hodowli w teście cytotoksyczności (MTT) wynosił 6h, 12h i 24h; dla pozostałych badań - 24 godziny. Wyniki badań odnoszono do odpowiednich hodowli kontrolnych prowadzonych w identycznych warunkach jak hodowle badane, jednak bez dodatku żadnego z badanych modulatorów. Badanie cytotoksyczności testem MTT Liczbę żywych komórek w badanych hodowlach oceniano za pomocą testu cytotoksyczności MTT (Sigma-Aldrich). Komórki badanych linii wysiewano na płytki hodowlane 96- dołkowe (20 tys. kom./dołek). Po przeprowadzeniu inkubacji

3 w pożywce zawierającej odpowiedni modulator w badanym stężeniu, pożywkę usuwano, przepłukiwano hodowle roztworem DPBS, po czym dodawano do każdego dołka po 100 μl RPMI-1640 bez czerwieni fenolowej zawierające substrat bromek 3-(4,5-dimetylotiazol-2-ilo)-2,5-difenylotetrazoliowy (MTT) w stężeniu 0,5 mg/ml. Płytki inkubowano przez 2 godziny, a następnie dodawano po 100 μl mieszaniny etanol- DMSO (1:1) w celu rozpuszczenia barwnych kryształów produktu redukcji MTT (formazanów). Po 2-godzinnej inkubacji dokonywano pomiarów spektralnych w czytniku mikropłytek Triad LT (Dynex) przy fali długości 570 nm. Oznaczanie ekspresji mrna żelatynaz techniką Real-Time RT-PCR Ekspresję genów kodujących żelatynazy: MMP-2 i MMP-9 na poziomie mrna określono stosując ilościową technikę RT-PCR z detekcją w czasie rzeczywistym (Real-Time RT-PCR) z użyciem barwnika fluorescencyjnego SYBR Green I. W skład mieszaniny reakcyjnej wchodziło: 2 μl 10x buforu A, 2 μl (4 μl w przypadku MMP-2) 25 mm MgCl 2, po 1,35 μl 3 μm roztworów starterów F i R, 0,7 μl 1x SYBR Green I, 0,1 μl odwrotnej transkryptazy Multiscribe RT (50 U/μl), 0,1 μl polimerazy DNA Ampli TaqGold (5 U/μl), 160 ng matrycowego RNA oraz wodę do 20 μl. Wszystkie odczynniki zakupiono w Applied Biosystems, z wyjątkiem starterów (IBB PAN, Warszawa) oraz SYBR Green I (Invitrogen). Skład mieszaniny reakcyjnej dla każdego badanego transkryptu był identyczny z wyjątkiem starterów, których sekwencje były specyficzne dla danego mrna badanego genu. Zastosowano następujące sekwencje starterów: do detekcji mrna MMP-2 starter F (forward, sensowy): 5 CAGGGAGCGCTACGATGGAG3, starter R (reverse, antysensowy): 5 TCCTTGGGGCAGC- CATAGAA 3 (sekwencje zaprojektowane w programie EMBOSS); dla mrna MMP-9 starter F: 5 GCTCAC- CTTCACTCGCGTG3, starter R: 5 CGCGACACCA- AACTGGATG3 [11]. Równocześnie, w każdej próbce prowadzono detekcję mrna genu kontrolnego - β-aktyny stosując dostępny komercyjnie zestaw starterów o sekwencjach: F: 5 TCACCCACACTGTGCCCATCTACGA3, R: 5 CAGCGGAACCGCTCATTGCCAATGG3. Matrycę w reakcjach RT-PCR stanowiły ekstrakty RNA z komórek badanych hodowli in vitro uzyskane metodą fenolowo-chloroformową przy użyciu odczynnika Tri-Reagent (Sigma-Aldrich). Profil termiczny reakcji był następujący: 48ºC przez 30 minut (RT), 95ºC 10 min., następnie 40 cykli złożonych z 30-sekundowej inkubacji w 95ºC i 1-minutowej inkubacji w 60ºC, po czym przeprowadzano końcową elongację przez 10 min., w 72ºC. Wszystkie analizy przeprowadzono w aparacie Mx3000P (Stratagene). Zmianę ekspresji MMP-2 i MMP-9 określano metodą ΔΔCt w odniesieniu do poziomu mrna genu β-aktyny jako kontroli endogennej. Jako kalibrator w metodzie ΔΔCt posłużyły hodowle kontrolne (nie traktowane żadnym z modulatorów). Zymograficzna detekcja żelatynaz Ekspresję żelatynaz MMP-2 i MMP-9 na poziomie białka określono wykorzystując elektroforezę w żelu poliakrylamidowym z dodatkiem żelatyny. Do studzienek 10% żeli poliakrylamidowych z SDS i żelatyną (2 mg/ml) nakładano po 30 μl mieszaniny złożonej z równych ilości 2x roztworu obciążającego (0,125 M Tris-HCl, ph=6,8; 20% glicerol; 4% SDS; 0,01% błękit bromofenolowy) i supernatantów z badanych hodowli uprzednio zagęszczonych za pomocą kolumienek chromatograficznych Vivaspin 500 (Sigma-Aldrich). Po przeprowadzeniu rozdziału elektroforetycznego w buforze elektroforetycznym (1% SDS, 20 mm Tris, 190 mm glicyna; ph=8,3), żele 3-krotnie płukano w buforze renaturującym (2,5% Triton X-100), a następnie żele te inkubowano w buforze rozwijającym (50 mm Tris-HCl, ph=7,5; 200 mm NaCl; 5 mm CaCl 2 ; 2 μm ZnSO 4 ; 0,02% Brij-35) w temp. 37 C przez 48 godzin. Po inkubacji żele barwiono przez noc w 0,5% roztworze błękitu Coomassie. Następnego dnia żele odbarwiano w mieszaninie metanolu, kwasu octowego i wody (5:4:1). Zymogramy rejestrowano w systemie dokumentacji żelowej LabWorks 4.0 (Cambridge, UK). Badanie adhezji komórek nowotworowych do podłoża matrigel Do badania adhezji wykorzystano płytki hodowlane 96- dołkowe pokryte matriżelem (BD Matrigel Cellware Basement Membrane, Becton-Dickinson). Warstwa macierzy pozakomórkowej wynosiła 100μg/cm 2. Po 24 h stymulacji modulatorami w podanym zakresie stężeń (od 50μM do 3μM), komórki odklejano, wirowano, a następnie zawieszano w 2% RPMI. Do każdej studzienki dodawano po 0,1 ml zawiesiny komórek (w stężeniu 200 tys/100μl). Płytki inkubowano przez 2 godziny w temp. 37 C. Po inkubacji 2 razy przepłukiwano studzienki roztworem DPBS. Komórki utrwalano w roztworze Cytofix (0,05 ml 4% paraformaldehydu w DPBS na każdą studzienkę) przez 30 min. Następnie usuwano utrwalacz i przeprowadzano barwienie (0,05 ml 0,1% roztworu fioletu krystalicznego w DPBS) przez 30 min. Po wybarwieniu przepłukiwano każdą studzienkę dwukrotnie roztworem DPBS. Płytki analizowano w mikroskopie odwróconym Axiovert 40CFL (Zeiss). Badanie migracji i ruchliwości komórek nowotworowych testem Wound Healing Assay Komórki badanych linii wysiewano na 24-dołkowe płytki i prowadzono hodowlę przez około 48 godzin do uzyskania konfluentnych hodowli. Następnie w każdej studzience wykonywano rysę o szerokości 1 mm, po czym dwukrotnie intensywnie przepłukiwano płytkę roztworem PBS. Bezpośrednio po wykonaniu rysy rozpoczęto traktowanie komórek badanymi modulatorami w podanym zakresie stężeń (50-3 μm). Po 24 godzinach usuwano pożywkę i dodawano świeże, pełne medium. Obserwacje prowadzono przez kolejne 24 godziny prowadząc dokumentację za pomocą mikroskopu odwróconego Axiovert 40CFL (Zeiss). Analiza statystyczna Dane ilościowe porównano za pomocą analizy wariancji (ANOVA). Do obliczeń wykorzystano program STATISTI- CA 6,0. Po przeanalizowaniu wyników testów MTT dla badanych tetracyklin w zakresie stężeń 200 μm - 3 μm, nie prowadzono dalszych badań z zastosowaniem stężenia 200 μm

4 Ryc. 1. Wykres zależności absorbancji od stężenia doksycykliny, oksytetracykliny, tetracykliny i limecykliny po 24 godzinach w hodowlach komórek linii A549 i T24. przedstawiono wartości średnie +/- odchylenie standardowe. * - istotna statystycznie różnica w odniesieniu do hodowli kontrolnej. i 100 μm, ponieważ stężenia te powodowały zbyt silny efekt cytotoksyczny w stosunku do hodowli komórkowych linii A549 i T24, co uniemożliwiałoby wiarygodną analizę badań inwazyjności. Wybrano także optymalny czas traktowania hodowli badanymi tetracyklinami (24 godziny). Zakres działania cytotoksycznego obserwowany w testach MTT dość istotnie różnił się pomiędzy poszczególnymi badanymi modulatorami (Ryc. 1). Badania poziomu ekspresji genów MMP-2 i MMP-9 na poziomie mrna dokonano za pomocą ilościowej techniki RT-PCR z detekcją w czasie rzeczywistym. Zastosowano metodę relatywnej oceny ekspresji genów (ΔΔCt) w odniesieniu do ekspresji genu β-aktyny. W przypadku linii A549 wykazano spadek poziomu ekspresji genu MMP-2 po stymulacji wszystkimi z zastosowanych tetracyklin przy niemal wszystkich stężeniach (Ryc. 2). Obniżenie ekspresji genu MMP-9 na poziomie istotnym statystycznie wykazano po zastosowaniu limecykliny w stężeniu 3 μm (p<0,001) oraz oksytetracykliny w stężeniu 50 μm (p<0,001). Oksytetracyklina w stężeniu 12,5 μm powodowała wzrost ekspresji genu MMP-9 (p=0,021). Doksycyklina i tetracyklina nie wpłynęły w istotnym stopniu na ekspresję genu MMP-9. Po traktowaniu komórek linii T24 oksytetracykliną w stężeniu 12,5 μm oraz tetracykliną w stężeniach 50 μm i 3 μm wykazano istotne statystycznie zahamowanie ekspresji genu MMP-2. Doksycyklina i limecyklina nie wpłynęły w istotnym stopniu na ekspresję genu MMP-2. Obniżenie ekspresji genu MMP-9 w komórkach linii T24 wykazano po zastosowaniu wszystkich badanych modulatorów, przy czym był to spadek na poziomie istotnym statystycznie w przypadku doksycykliny i oksytetracykliny 2a 2b we wszystkich stosowanych stężeniach (z wyjątkiem oksytetracykliny w stężeniu 3 μm);. tetracyklina i limecyklina nie obniżyły ekspresji MMP-9 w istotny sposób. Uzyskane wyniki wskazują na wpływ tetracyklin na ekspresję żelatynaz na poziomie mrna (transkrypcji), przy czym efekt ich działania jest różny w zależności do rodzaju żelatynazy oraz stężenia, w jakim stosowano tetracykliny. Badania ekspresji genów MMP-2 i MMP-9 na poziomie białka dokonano za pomocą zymografii. Analiza otrzymanych zymogramów obrazujących aktywność MMP-2 i MMP-9 w hodowlach obu linii komórkowych wykazała obecność produktów odpowiadających żelatynazie A i żelatynazie B (Ryc. 3). W przypadku linii A549 zdecydowanie bardziej intensywny prążek obserwowano w przypadku MMP-2, co wskazuje na wyższą aktywność tej żelatynazy w badanej linii. W przeci- Ryc. 2. Zmiany aktywności transkrypcyjnej genów kodujących MMP-2 i MMP-9 w hodowlach komórek linii A549 (ryc. 2a) i T24 (ryc. 2b) wyznaczone metodą ΔΔCt po traktowaniu doksycykliną, oksytetracykliną, tetracykliną i limecykliną przez 24 godzinyw odniesieniu do hodowli nietraktowanych (kontrolnych). Przedstawiono wartości średnie dla równania 2 -ΔΔCt +/- odchylenie standardowe. * - zmiana istotna statystycznie w odniesieniu do kontroli.

5 Ryc. 3. Zymogramy przedstawiające aktywność proteolityczną żelatynaz MMP-2 i MMP-9 w supernatantach z hodowli komórkowych linii A549 (ryc. A) i T24 (ryc. B) po 24 godzinach traktowania doksycykliną, oksytetracykliną, tetracykliną i limecykliną. Ryc. 4. Wykres zależności ilości komórek ulegających adhezji po podłoża matriżel od stężenia doksycykliny, oksytetracykliny, tetracykliny i limecykliny po 24 godzinach hodowli komórek linii A549 i T24 (* - istotna statystycznie różnica w odniesieniu do hodowli kontrolnej). wieństwie do linii A549, w komórkach linii T24 obie metaloproteazy wykazywały podobną aktywność. W przypadku obu badanych linii komórkowych obserwowano obniżenie intensywności prążków wraz ze wzrostem stężenia zastosowanych modulatorów. Opisana zależność miała charakter krokowy (gradacyjny), co wskazuje na zmiany aktywności MMP w sposób zależny od dawki stosowanego modulatora. Bardzo słabo widoczne były prążki odpowiadające metaloproteazom MMP-2 i MMP-9 przy 50 μm stężeniu doksycykliny. Wskazuje to bądź na działanie cytotoksyczne doksycykliny w stosowanym stężeniu - co dodatkowo znalazło odzwierciedlenie w badaniach za pomocą testu MTT - lub bardzo wysokie zahamowanie ekspresji MMP. Do oceny wpływu badanych modulatorów na fenotyp komórek linii A459 i T24 posłużono się badaniem adhezji komórek nowotworowych do podłoża matriżel testu stosowanego w badaniach adhezji, propagacji, wzrostu oraz podziałów komórkowych - oraz testem Wound Healing Assay stosowanego w analizie migracji i ruchliwości komórek nowotworowych. Badanie adhezji komórek do podłoża matriżel po traktowaniu komórek oksytetracykliną wykazało, że nie ma ona wpływu na adhezję komórek linii A549 (p=0,078) i T24 (p=0,196) do podłoża, bądź różnica w stopniu adhezji w porównaniu z kontrolą jest na granicy istotnych statystycznie różnic; jedynie w stężeniu 3 μm wykazano spadek adhezyjności komórek linii A549 (p=0,016). Doksycyklina indukowała wzrost adhezyjności w stężeniu 3 μm w hodowlach komórek linii T24 (p=0,040). Limecyklina w największym użytym stężeniu (50 μm) indukowała istotne obniżenie adhezyjności komórek linii A549 (p=0,003), natomiast w pozostałych stężeniach nie wykazano istotnego wpływu na komórki obu badanych linii. Co ciekawe, zaobserwowano wzrost stopnia przylegania komórek linii T24 do powierzchni matrigelu po stymulacji tetracykliną w najniższych użytych w badaniu stężeniach, tj. 6 μm i 3 μm. Natomiast w stosunku do komórek linii A549 wykazano istotne obniżenie adhezyjności w stężeniach 12,5 μm (p=0,028), 6 μm (p=0,022) i 3 μm (p=0,008) (Ryc. 4). Badanie za pomocą Wound Healing Assay wykazało zmiany, jakie zaszły w adherentnych hodowlach komórek linii A549 i T24 po stymulacji zastosowanymi modulatorami. W trakcie prowadzonego badania zaobserwowano brak całkowitego zarastania rysy przez komórki linii A549 o niskim potencjale migracyjnym, a po 24 godzinach obumieranie hodowanych komórek tworzących zbyt gęste skupiska (Ryc. 5). W hodowlach obu linii komórkowych zaobserwowano cytotoksyczne działanie doksycykliny w stężeniu 50 μm (obserwacje mikroskopowe). W przypadku pozostałych antybiotyków zauważono wyraźną zależność stopnia zarastania rysy od stężenia badanego modulatora - im większe stężenie tetracyklin, tym mniejszy stopień zarastania rysy. Zauważono również różnicę w potencjale migracyjnym i inwazyjności komórek linii A549, które nie zarastały całkowicie rysy, a po 24 godzinach hodowli obumierały, a komórkami linii T24, które po prowadzeniu hodowli przez 72 godziny całkowicie zarastały rysę. Rak płuc i rak pęcherza moczowego są jednymi z najczęściej występujących nowotworów charakteryzującymi się wysokim potencjałem przerzutowym oraz inwazyjnością [12, 13]. Stąd też do badań opisanych w pracy wykorzystano ustalone linie komórkowe A549 i T24 stanowiące modele eksperymentalne in vitro wymienionych nowotworów. Hodowle badanych linii posłużyły do oceny wpływu wybranych tetracyklin na procesy związane z inwazyjnością komórek nowotworowych. W pierwszej kolejności przeprowadzono testy cytotoksyczności (MTT), pozwalające na wyznacze-

6 5a 5b Ryc. 5. Zdjęcia przedstawiające zmiany, jakie zaszły w przeciągu 72 godzin w hodowli komórek linii T24 (ryc. 5a) oraz 24 godzin hodowli komórek linii A549 (ryc. 5b) po stymulacji doksycykliną. Na zdjęciach z hodowli po traktowaniu doksycykliną w stężeniu 50μM dostrzegalny jest wyraźny efekt cytotoksyczny (potwierdzony testem MTT). W przypadku pozostałych stężeń widać wyraźną zależność stopnia zarastania wolnej powierzchni naczynia hodowlanego od stężenia modulatora. W trakcie prowadzonego badania zaobserwowano brak całkowitego zarastania powierzchni przez komórki linii A549, a po 24 godzinach obumieranie hodowanych komórek tworzących zbyt gęste skupiska. nie optymalnych stężeń oraz czasu ekspozycji komórek na badane tetracykliny, a także na opisanie ogólnego wpływu badanych modulatorów na proliferację i apoptozę komórek nowotworowych linii raka płuc i raka pęcherza. Szczególnie wysoki efekt cytotoksyczny w stosunku do badanych linii nowotworowych wykazywała doksycyklina, co znajduje potwierdzenie w danych literaturowych [14, 15, 16]. Przedstawione wyniki w części dotyczącej wpływu doksycykliny na ekspresję genu MMP-9 dla linii T24 znalazły odzwierciedlenie w badaniach prowadzonych przez Hanemaaijer i wsp. na komórkach śródbłonka (HUVEC) oraz fibroblastach izolowanych z torebki stawowej [17]. Z kolei inne badania dotyczące ekspresji mrna MMP-2 i MMP-9 w tętniaku aorty brzusznej wykazał trzykrotne obniżenie ekspresji MMP-2 i czterokrotne obniżenie ekspresji MMP-9 w ścianie aorty po zastosowaniu doksycykliny [18]. Analogię w stosunku do prowadzonych badań znaleziono również w analizie wpływu doksycykliny na komórki czerniaka linii B16, w których wykazano obniżenie ekspresji genów MMP-2 i MMP-9 po zastosowaniu tego modulatora aktywności w porównaniu z kontrolą. Łączyło się to z zahamowaniem wzrostu guza o 35,63% [15]. Inne badania pokazały, że doksycyklina w farmakologicznie dostępnych, nietoksycznych dawkach hamuje syntezę mrna, produkcję i aktywację MMP-9 stymulowaną przez TGF-β w komórkach nabłonka rogówki [19]. Wyniki te korespondują z badaniami przeprowadzonymi przez szereg ośrodków dotyczących wpływu doksycykliny i jej modyfikowanych analogów na aktywność MMP-2 i MMP-9 z zastosowaniem różnych linii komórkowych [15, 16, 19, 20]. Wpływ pozostałych tetracyklin (oksytetracyklina, tetracyklina i limecyklina) nie jest praktycznie opisywany w literaturze w kontekście nowotworów. Głównym problemem badawczym w przedstawionej pracy stanowiła analiza wpływu badanych modulatorów ekspresji MMP na inwazyjność komórek nowotworowych. Zjawisko inwazyjności warunkują przede wszystkim takie cechy, jak potencjał metastatyczny i proangiogenny guzów pierwotnych. Są one wynikiem aktywacji szlaków molekularnych uczestniczących w procesie pokonywania bariery błony podstawnej oraz śródbłonka sąsiadujących naczyń krwionośnych przez komórki nowotworowe, a z drugiej strony zwiększenia ekspresji białek powierzchniowych związanych z adhezją, co zapewnia komórkom nowotworu zagnieżdżenie w nowym miejscu organizmu i utworzenie guza wtórnego [21]. Niedostateczna siła oddziaływania komórek nowotworu z otaczającym środowiskiem zewnętrznym nie tylko uniemożliwia rozwój powstającego przerzutu, ale także śmierć komórek nowotworowych na drodze opisanej jako anoikis, czyli zależnej od adhezji. Uzyskane wyniki wskazują przede wszystkim na inhibitorowy wpływ tetracyklin w procesach migracji komórek nowotworowych linii A549 i T24. natomiast w przypadku analizy adhezji komórek do białek macierzy pozakomórkowej (matrigel) wpływ tetracyklin nie jest jednoznaczny wykazano zarówno hamowanie, jak i stymulację adhezji. Wykazano, iż wpływ tetracyklin na opisane procesy związany był z wyciszeniem ekspresji metaloproteaz MMP-2 i MMP-9 (zarówno na poziomie mrna, jak i białka). Należy podkreślić, iż w badaniach przeanalizowano wpływ badanych tetracyklin na ekspresję najczęściej opisywanych w literaturze metaloproteaz żelatynazy A i B - o najszerzej opisanym związku z rozwojem nowotworów złośliwych. Jednak badane modulatory z grupy tetracyklin wpływają także na ekspresję i/lub aktywność również wielu innych enzymów z tej grupy, co podkreślono we wstępie. Badane efekty wyciszenia ekspresji MMPs są więc z pewnością sumarycznym efektem wpływu tetracyklin na wiele różnych metaloproteaz. Otrzymane wyniki potwierdzają doniesienia innych autorów. Chetty i wsp. wykazali, że genowo-specyficzne wyciszenie ekspresji MMP-2 za pomocą RNAi powoduje obniżenie migracji komórek raka płuc A549 przez matrigel oraz angiogenezy in vitro, a in vivo (u myszy) obniżenie tempa przerzutowania [22]. Wpływ doksycykliny na różne aspek-

7 ty nowotworzenia jest opisany w literaturze najlepiej ze wszystkich tetracyklin. Wykazano między innymi, iż hamuje ona o 28% stopień zagnieżdżania się komórek raka piersi w kościach u myszy [23], a także w istotny sposób hamuje rozwój przerzutów czerniaka u myszy poprzez obniżenie ekspresji MMP-2 i MMP-9 i związane z tym zahamowanie angiogenezy [15]. Według Franco i wsp. doksycyklina (31 i 104 μm) hamuje o 20% migrację komórek mięśniowych in vitro w teście wound healing assay, a także adhezyjność tych komórek do podłoża pokrytego białkami macierzy pozakomórkowej [24]. Inhibitory metaloproteaz - Col-3 (Metastat - modyfikowana pochodna doksycykliny) i AG1478 (bloker receptora EGF) - wykazują istotny wpływ hamujący inwazyjność komórek raka tarczycy in vitro poprzez zahamowanie ekspresji MMP-2 [16]. Col-3 oraz inne modyfikowane pochodne tetracyklin wpływają także hamująco na inwazyjność komórek raka prostaty in vitro oraz stopień ich przerzutowania [14]. Potwierdzono hamujący wpływ doksycykliny na ekspresję żelatynazy A i B na poziomie mrna i białka. Podobny, choć słabszy efekt wykazały inne tetracykliny (oksytetracyklina, tetracyklina, limecyklina). Badane tetracykliny hamowały migrację komórek nowotworowych A549 i T24 w sposób zależny od dawki. Wpływ badanych tetracyklin na procesy adhezji komórek nowotworowych A549 i T24 nie był wyraźny i istotnie różnił się w zależności od typu badanego związku oraz jego stężenia. Dziękujemy pracownikom Katedry Analizy Instrumentalnej za udostępnienie czytnika mikropłytek. Piśmiennictwo 1. Deryugina E, Quigley J. Matrix metalloproteinases and tumor metastasis. Cancer Metastasis Rev 2006; 25: Jodele S i wsp. Modifying the soil to affect the seed: role of stromal-derived matrix metalloproteinases in cancer progression. Cancer Metastasis Rev 2006; 25: Stefanidakis M, Koivunen E. Cell-surface association between matrix metalloproteinases and integrins: role of the complexes in leukocyte migration and cancer progression. Blood 2006; 108: Pavlaki M, Zucker S. Matrix metalloproteinases inhibitors(m- MPIs): the beginning of phase I or the termination of phase III clinical trials. Cancer Metastasis Rev 2003; 22: Ramnath N, Creaven P. Matrix metalloproteinases inhibitors. Curr Oncol Rep 2004; 6: Pirard B. Insight into the structural determinants for selective inhibition of matrix metalloproteinases. Drug Discover Today 2007; 12: Chakraborti S i wsp. Regulation of matrix metalloproteinases: an overview. Mol Cell Biochem 2003; 253: Chu Q i wsp. A phase II and pharmacological study of the matrix metalloproteinase inhibitor (MMPI) COL-3 in patients with advanced soft tissue sarcomas. Invest New Drugs 2007; 25: Syed S i wsp. A phase I and pharmacokinetic study of Col-3 (Metastat), an oral tetracycline derivative with potent matrix metalloproteinase and antitumor properties. Clin Cancer Res 2004; 10: Reese R, Betts R, Gumustop B. Handbook of antibiotics. Lippincott Williams & Wilkins. Philadelphia Quintero M i wsp. Nitric oxide is a factor in the stabilization of hypoxia-inducible factor-1α in cancer: role of free radical formation. Cancer Res 2006; 66: Goodman G. Lung cancer 1: prevention of lung cancer. Thorax 2002; 57: Pashos C i wsp. Bladder cancer: epidemiology, diagnosis, and management. Cancer Pract 2002; 10: Lokeshwar B i wsp. Inhibition of cell proliferation, invasion, tumor growth and metastasis by an oral non-antimicrobial tetracycline analog (Col-3) in a metastatic prostate cancer model. Int J Cancer 2002; 98: Sun B i wsp. Doxycycline influences microcirculation patterns in B16 melanoma. Exp Biol Med 2007; 232: Yeh M i wsp. Differentiated thyroid cancer cell invasion is regulated through epidermal growth factor receptor-dependent activation of matrix metalloproteinase (MMP)-2/gelatinase A. Endocrine-Related Cancer 2006; 13: Hanemaaijer R i wsp. Inhibition of MMP synthesis by doxycycline and chemically modified tetracyclines (CMTs) in human endothelial cells. Adv Dent Res 1998; 12: Thompson R, Baxter B. MMP inhibition in abdominal aortic aneurysm. Rationale for a prospective randomized clinical trial. Ann N Y Acad Sci 1999; 878: Kim H i wsp. Doxycycline inhibits TGF-β1-induced MMP-9 via Smad and MAPK pathways in human corneal epithelial cells. Invest Ophtalmol Vis Sci 2005; 46: Fiotti N i wsp. Short term effects of doxycycline on matrix metalloproteinases 2 and 9. Cardiovasc Drugs Ther 2009; 23: Ziober L, Silverman S, Kramer R. Adhesive mechanisms regulating invasion and metastasis in oral cancer. Crit Rev Oral Biol Med 2001; 12: Chetty C i wsp. Adenovirus-mediated small interfering RNA against matrix metalloproteinase-2 suppresses tumor growth and lung metastasis in mice. Mol Cancer Ther 2006; 5: Duivenvoorden W i wsp. Doxycycline decreases tumor burden in a bone metastasis model of human breast cancer. Cancer Res 2002; 62: Franco C i wsp. Doxycycline alters vascular smooth muscle cell adhesion, migration, and reorganization of fibrillar collagen matrices. Am J Pathol 2006; 168: Adres do korespondencji: Dr n. farm. Daniel Sypniewski Zakład Biotechnologii i Inżynierii Genetycznej ŚUM ul. Narcyzów 1; Sosnowiec tel. (032) , dsypniewski@sum.edu.pl

Temat ćwiczenia: Techniki stosowane w badaniach toksyczności in vitro

Temat ćwiczenia: Techniki stosowane w badaniach toksyczności in vitro Temat ćwiczenia: Techniki stosowane w badaniach toksyczności in vitro Miarą aktywności cytotoksycznej badanej substancji jest określenie stężenia hamującego, IC 50 (ang. inhibitory concentration), dla

Bardziej szczegółowo

Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF

Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Agnieszka Gładysz Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Katedra i Zakład Biochemii i Chemii Klinicznej Akademia Medyczna Prof.

Bardziej szczegółowo

Sprawozdanie z wykonania projektu badawczego:

Sprawozdanie z wykonania projektu badawczego: Sprawozdanie z wykonania projektu badawczego: ODDZIAŁYWANIE POLA MAGNETYCZNEGO GENEROWANEGO PRZEZ STYMULATOR ADR NA CZYNNOŚĆ LUDZKICH KOMÓREK IMMUNOKOMPETENTNYCH in vitro Celem przeprowadzonych badań była

Bardziej szczegółowo

Materiał i metody. Wyniki

Materiał i metody. Wyniki Abstract in Polish Wprowadzenie Selen jest pierwiastkiem śladowym niezbędnym do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Selen jest wbudowywany do białek w postaci selenocysteiny tworząc selenobiałka (selenoproteiny).

Bardziej szczegółowo

Wskaźniki włóknienia nerek

Wskaźniki włóknienia nerek Wskaźniki włóknienia nerek u dzieci z przewlekłą chorobą nerek leczonych zachowawczo Kinga Musiał, Danuta Zwolińska Katedra i Klinika Nefrologii Pediatrycznej Uniwersytetu Medycznego im. Piastów Śląskich

Bardziej szczegółowo

Techniki oznaczania aktywności cytotoksycznej związków chemioterapeutycznych in vitro

Techniki oznaczania aktywności cytotoksycznej związków chemioterapeutycznych in vitro Fizjologiczne techniki badań Techniki oznaczania aktywności cytotoksycznej związków chemioterapeutycznych in vitro Wstęp: Oznaczanie cytotoksyczności związków chemioterapeutycznych wobec komórek w hodowlach

Bardziej szczegółowo

Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego. Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa

Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego. Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego raka jajnika Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa Sześć diabelskich mocy a komórka rakowa (Gibbs

Bardziej szczegółowo

1. Oznaczanie aktywności lipazy trzustkowej i jej zależności od stężenia enzymu oraz żółci jako modulatora reakcji enzymatycznej.

1. Oznaczanie aktywności lipazy trzustkowej i jej zależności od stężenia enzymu oraz żółci jako modulatora reakcji enzymatycznej. ĆWICZENIE OZNACZANIE AKTYWNOŚCI LIPAZY TRZUSTKOWEJ I JEJ ZALEŻNOŚCI OD STĘŻENIA ENZYMU ORAZ ŻÓŁCI JAKO MODULATORA REAKCJI ENZYMATYCZNEJ. INHIBICJA KOMPETYCYJNA DEHYDROGENAZY BURSZTYNIANOWEJ. 1. Oznaczanie

Bardziej szczegółowo

Metody badania ekspresji genów

Metody badania ekspresji genów Metody badania ekspresji genów dr Katarzyna Knapczyk-Stwora Warunki wstępne: Proszę zapoznać się z tematem Metody badania ekspresji genów zamieszczonym w skrypcie pod reakcją A. Lityńskiej i M. Lewandowskiego

Bardziej szczegółowo

OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA ARKUSZ KALKULACYJNY OKREŚLAJĄCY CENĘ OFERTY. zestaw 4

OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA ARKUSZ KALKULACYJNY OKREŚLAJĄCY CENĘ OFERTY. zestaw 4 . Pieczęć nagłówkowa ZAŁĄCZNIK NR 1A.1 DO SIWZ Data... OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA ARKUSZ KALKULACYJNY OKREŚLAJĄCY CENĘ OFERTY Część nr 1 Odczynniki do hodowli komórkowych Wartość 1 Zestaw uzupełniający

Bardziej szczegółowo

Doktorantka: Żaneta Lewandowska

Doktorantka: Żaneta Lewandowska Doktorantka: Żaneta Lewandowska Główny opiekun naukowy: Dr hab. Piotr Piszczek, prof. UMK Katedra Chemii Nieorganicznej i Koordynacyjnej, Wydział Chemii Dodatkowy opiekun naukowy: Prof. dr hab. Wiesław

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa tel. 22 572 0735, 606448502

Bardziej szczegółowo

BIOLOGIA KOMÓRKI KOMÓRKI EUKARIOTYCZNE W MIKROSKOPIE ŚWIETLNYM JASNEGO POLA I KONTRASTOWO- FAZOWYM; BARWIENIA CYTOCHEMICZNE KOMÓREK

BIOLOGIA KOMÓRKI KOMÓRKI EUKARIOTYCZNE W MIKROSKOPIE ŚWIETLNYM JASNEGO POLA I KONTRASTOWO- FAZOWYM; BARWIENIA CYTOCHEMICZNE KOMÓREK BIOLOGIA KOMÓRKI KOMÓRKI EUKARIOTYCZNE W MIKROSKOPIE ŚWIETLNYM JASNEGO POLA I KONTRASTOWO- FAZOWYM; BARWIENIA CYTOCHEMICZNE KOMÓREK KOMÓRKI EUKARIOTYCZNE W MIKROSKOPIE ŚWIETLNYM JASNEGO POLA I KONTRASTOWO-FAZOWYM;

Bardziej szczegółowo

Mgr Mayank Chaturvedi

Mgr Mayank Chaturvedi Mgr Mayank Chaturvedi Dziedzina: nauki biologiczne Dyscyplina: biologia Otwarcie: 12.04.2013 r. Temat: Nanoparticles mediated delivery of Tissue Inhibitor of Matrix Metalloproteinases -1 (TIMP-1) to the

Bardziej szczegółowo

1. Znaczenie podjętych badań

1. Znaczenie podjętych badań Ocena rozprawy doktorskiej mgr analityki medycznej Natalii Koniecznej pt. Badanie wpływu hamowania telomerazy za pomocą TMPyP4 na skuteczność leków przeciwnowotworowych w komórkach raka piersi in vitro,

Bardziej szczegółowo

ZEWNĄTRZKOMÓRKOWEJ U PACJENTÓW OPEROWANYCH Z POWODU GRUCZOLAKA PRZYSADKI

ZEWNĄTRZKOMÓRKOWEJ U PACJENTÓW OPEROWANYCH Z POWODU GRUCZOLAKA PRZYSADKI Daniel Babula AKTYWNOŚĆ WYBRANYCH METALOPROTEINAZ MACIERZY ZEWNĄTRZKOMÓRKOWEJ U PACJENTÓW OPEROWANYCH Z POWODU GRUCZOLAKA PRZYSADKI ROZPRAWA NA STOPIEŃ DOKTORA NAUK MEDYCZNYCH - streszczenie Promotor:

Bardziej szczegółowo

Rola wybranych metaloproteinaz macierzy zewnątrzkomórkowej i tkankowych inhibitorów metaloproteinaz w raku pęcherza moczowego.

Rola wybranych metaloproteinaz macierzy zewnątrzkomórkowej i tkankowych inhibitorów metaloproteinaz w raku pęcherza moczowego. Rola wybranych metaloproteinaz macierzy zewnątrzkomórkowej i tkankowych inhibitorów metaloproteinaz w raku pęcherza moczowego Edyta Wieczorek Praca doktorska wykonana pod kierunkiem Dr hab. Edyty Reszki,

Bardziej szczegółowo

1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy

1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy 1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy a) Toma A, Widłak W, Vydra N (2012) Rola czynnika transkrypcyjnego HSF1 w procesie nowotworzenia. Postępy Biologii Komórki 39(2):269 288 b) Vydra N, Toma

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Farmacja 2016

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Farmacja 2016 Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Farmacja 2016 Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa farmacjamolekularna@wum.edu.pl

Bardziej szczegółowo

Pro apoptotyczne właściwości ekstraktów z kory Cochlospermum angolense Welw.

Pro apoptotyczne właściwości ekstraktów z kory Cochlospermum angolense Welw. Pro apoptotyczne właściwości ekstraktów z kory Cochlospermum angolense Welw. Paulina Wdowiak 1, Tomasz Baj 2, Magdalena Wasiak 1, Piotr Pożarowski 1, Jacek Roliński 1, Kazimierz Głowniak 2 1 Katedra i

Bardziej szczegółowo

Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska

Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska Dane mikromacierzowe Mateusz Markowicz Marta Stańska Mikromacierz Mikromacierz DNA (ang. DNA microarray) to szklana lub plastikowa płytka (o maksymalnych wymiarach 2,5 cm x 7,5 cm) z naniesionymi w regularnych

Bardziej szczegółowo

Wpływ zdeklastrowanego medium hodowlanego RPMI na żywotność i zdolność proliferacji komórek nowotworowych układu hematopoetycznego człowieka.

Wpływ zdeklastrowanego medium hodowlanego RPMI na żywotność i zdolność proliferacji komórek nowotworowych układu hematopoetycznego człowieka. Wpływ zdeklastrowanego medium hodowlanego RPMI na żywotność i zdolność proliferacji komórek nowotworowych układu hematopoetycznego człowieka. Anna Och 1,2, Marek Och 1,2, Igor Elkin 3, Zdzisław Oszczęda

Bardziej szczegółowo

Ocena rozprawy doktorskiej mgr Sudipta Das

Ocena rozprawy doktorskiej mgr Sudipta Das C Centrum Badań Translacyjnych i Biologii Molekularnej Nowotworów O Centrum Onkologii - Instytut im. Marii Skłodowskiej-Curie, Oddział w Gliwicach ul. Wybrzeże Armii Krajowej 15, 44-101 Gliwice; tel. 32

Bardziej szczegółowo

Oznaczanie aktywności cytotoksycznej chemoterapeutyków wobec komórek nowotworowych

Oznaczanie aktywności cytotoksycznej chemoterapeutyków wobec komórek nowotworowych Wydział Chemiczny Politechniki Gdańskiej Katedra Technologii Leków i Biochemii Kultury tkankowe i komórkowe roślin i zwierząt Oznaczanie aktywności cytotoksycznej chemoterapeutyków wobec komórek nowotworowych

Bardziej szczegółowo

TERAPIA GENOWA. dr Marta Żebrowska

TERAPIA GENOWA. dr Marta Żebrowska TERAPIA GENOWA dr Marta Żebrowska Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki, Zakładu Biochemii Farmaceutycznej, Uniwersytetu Medycznego w Łodzi Źródło zdjęcia: httpblog.ebdna.plindex.phpjednoznajwiekszychzagrozenludzkosciwciazniepokonane

Bardziej szczegółowo

Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej

Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek

Bardziej szczegółowo

ĆWICZENIE 5 MECHANIZMY PROMUJĄCE WZROST ROŚLIN

ĆWICZENIE 5 MECHANIZMY PROMUJĄCE WZROST ROŚLIN ĆWICZENIE 5 MECHANIZMY PROMUJĄCE WZROST ROŚLIN CZĘŚĆ TEORETYCZNA Mechanizmy promujące wzrost rośli (PGP) Metody badań PGP CZĘŚĆ PRAKTYCZNA 1. Mechanizmy promujące wzrost roślin. Odczyt. a) Wytwarzanie

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa Ćwiczenie 3 Izolacja i rozdział

Bardziej szczegółowo

Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych

Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych Nr kat. PK24N Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Detekcja

Bardziej szczegółowo

RT31-020, RT , MgCl 2. , random heksamerów X 6

RT31-020, RT , MgCl 2. , random heksamerów X 6 RT31-020, RT31-100 RT31-020, RT31-100 Zestaw TRANSCRIPTME RNA zawiera wszystkie niezbędne składniki do przeprowadzenia syntezy pierwszej nici cdna na matrycy mrna lub całkowitego RNA. Uzyskany jednoniciowy

Bardziej szczegółowo

ĆWICZENIA Z BIOCHEMII

ĆWICZENIA Z BIOCHEMII ĆWICZENIA Z BIOCHEMII D U STUDENTfiW WYDZIAŁU LEKARSKIEGO Pod redakcją Piotra Laidlera, Barbary Piekarskiej, Marii Wróbel WYDAWNICTWO UNIWERSYTETU JAGIELLOŃSKIEGO ĆWICZENIA Z BIOCHEMII DLA STUDENTÓW WYDZIAŁU

Bardziej szczegółowo

TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925

TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA

Bardziej szczegółowo

Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego

Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki

Bardziej szczegółowo

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa IZOLACJA DNA Z HODOWLI KOMÓRKOWEJ.

Bardziej szczegółowo

EDYTA KATARZYNA GŁAŻEWSKA METALOPROTEINAZY ORAZ ICH TKANKOWE INHIBITORY W OSOCZU OSÓB CHORYCH NA ŁUSZCZYCĘ LECZONYCH METODĄ FOTOTERAPII UVB.

EDYTA KATARZYNA GŁAŻEWSKA METALOPROTEINAZY ORAZ ICH TKANKOWE INHIBITORY W OSOCZU OSÓB CHORYCH NA ŁUSZCZYCĘ LECZONYCH METODĄ FOTOTERAPII UVB. Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Uniwersytet Medyczny w Białymstoku EDYTA KATARZYNA GŁAŻEWSKA METALOPROTEINAZY ORAZ ICH TKANKOWE INHIBITORY W OSOCZU OSÓB CHORYCH NA ŁUSZCZYCĘ

Bardziej szczegółowo

KOŁO NAUKOWE IMMUNOLOGII. Mikrochimeryzm badania w hodowlach leukocytów in vitro

KOŁO NAUKOWE IMMUNOLOGII. Mikrochimeryzm badania w hodowlach leukocytów in vitro KOŁO NAUKOWE IMMUNOLOGII Mikrochimeryzm badania w hodowlach leukocytów in vitro Koło Naukowe Immunolgii kolo_immunologii@biol.uw.edu.pl kolo_immunologii.kn@uw.edu.pl CEL I PRZEDMIOT PROJEKTU Celem doświadczenia

Bardziej szczegółowo

Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych

Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych Nr kat. PK25N Wersja zestawu: 1.2012 Zestaw do wykrywania spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Zestaw

Bardziej szczegółowo

Katarzyna Durda STRESZCZENIE STĘŻENIE KWASU FOLIOWEGO ORAZ ZMIANY W OBRĘBIE GENÓW REGULUJĄCYCH JEGO METABOLIZM JAKO CZYNNIK RYZYKA RAKA W POLSCE

Katarzyna Durda STRESZCZENIE STĘŻENIE KWASU FOLIOWEGO ORAZ ZMIANY W OBRĘBIE GENÓW REGULUJĄCYCH JEGO METABOLIZM JAKO CZYNNIK RYZYKA RAKA W POLSCE Pomorski Uniwersytet Medyczny Katarzyna Durda STRESZCZENIE STĘŻENIE KWASU FOLIOWEGO ORAZ ZMIANY W OBRĘBIE GENÓW REGULUJĄCYCH JEGO METABOLIZM JAKO CZYNNIK RYZYKA RAKA W POLSCE Promotor: dr hab. prof. nadzw.

Bardziej szczegółowo

prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie

prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca

Bardziej szczegółowo

wyizolowanych z roślin jadalnych i leczniczych, zarówno w chemoprewencji, jak i w terapii

wyizolowanych z roślin jadalnych i leczniczych, zarówno w chemoprewencji, jak i w terapii STRESZCZENIE Badania ostatnich lat wskazują na możliwość wykorzystania naturalnych polifenoli wyizolowanych z roślin jadalnych i leczniczych, zarówno w chemoprewencji, jak i w terapii przeciwnowotworowej.

Bardziej szczegółowo

Inżynieria Genetyczna ćw. 3

Inżynieria Genetyczna ćw. 3 Materiały do ćwiczeń z przedmiotu Genetyka z inżynierią genetyczną D - blok Inżynieria Genetyczna ćw. 3 Instytut Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski, rok akad. 2018/2019

Bardziej szczegółowo

woda do 1000 ml ph=6,9-7,1. Po sterylizacji dodać nystatynę (końcowe stężenie ok. 50 μg/ml). Agar z wyciągiem glebowym i ekstraktem drożdżowym (YS)

woda do 1000 ml ph=6,9-7,1. Po sterylizacji dodać nystatynę (końcowe stężenie ok. 50 μg/ml). Agar z wyciągiem glebowym i ekstraktem drożdżowym (YS) Ćwiczenie 1, 2, 3, 4 Skrining ze środowiska naturalnego: selekcja promieniowców zdolnych do produkcji antybiotyków. Testowanie zdolności do syntezy antybiotyków przez wyselekcjonowane szczepy promieniowców

Bardziej szczegółowo

Instrukcja ćwiczeń Biologia molekularna dla II roku Analityki Medycznej. Reakcja odwrotnej transkrypcji. Projektowanie starterów do reakcji PCR.

Instrukcja ćwiczeń Biologia molekularna dla II roku Analityki Medycznej. Reakcja odwrotnej transkrypcji. Projektowanie starterów do reakcji PCR. INSTRUKCJA Ćwiczenie nr 5 Odczynniki: Sprzęt: 1. 5xNG cdna Buffer 2. 50 µm oligo(dt)20 3. NG dart RT mix l 4. Probówki typu Eppendorf 0,2 ml 5. Woda wolna od RNaz 6. Lód 1. Miniwirówka 2. Termocykler 3.

Bardziej szczegółowo

MMP-9, TIMP-1 i VEGF u chorych na drobnokomórkowego raka płuca

MMP-9, TIMP-1 i VEGF u chorych na drobnokomórkowego raka płuca diagnostyka laboratoryjna Journal of Laboratory Diagnostics 2010 Volume 46 Number 3 299-305 Praca oryginalna Original Article MMP-9, TIMP-1 i VEGF u chorych na drobnokomórkowego raka płuca MMP-9, TIMP-1

Bardziej szczegółowo

BIOLOGIA KOMÓRKI. Testy witalności komórek

BIOLOGIA KOMÓRKI. Testy witalności komórek BIOLOGIA KOMÓRKI Testy witalności komórek WSTĘP Każda komórka jest układem termodynamicznie otwartym wymieniającym ze swym otoczeniem materię i energię. Wymiana ta odbywa się poprzez błonę komórkową, której

Bardziej szczegółowo

Uniwersytet Łódzki. Wydział Biologii i Ochrony Środowiska. Katedra Cytobiochemii O C E N A

Uniwersytet Łódzki. Wydział Biologii i Ochrony Środowiska. Katedra Cytobiochemii O C E N A Uniwersytet Łódzki Wydział Biologii i Ochrony Środowiska Katedra Cytobiochemii Łódź, 4 września 2015 Prof. dr hab. Wanda M. Krajewska O C E N A pracy doktorskiej mgr. Mariusza Łukasza Hartmana pt. Molecular

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)

Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego

Bardziej szczegółowo

TERMOSTABILNOŚĆ PEPTYDAZ I INHIBITORÓW PEPTYDAZ NASION ROŚLIN SPOŻYWANYCH PRZEZ CZŁOWIEKA

TERMOSTABILNOŚĆ PEPTYDAZ I INHIBITORÓW PEPTYDAZ NASION ROŚLIN SPOŻYWANYCH PRZEZ CZŁOWIEKA BROMAT. CHEM. TOKSYKOL. XLV, 2012, 3, str. 654 658 Marta Siergiejuk, Marek Gacko TERMOSTABILNOŚĆ PEPTYDAZ I INHIBITORÓW PEPTYDAZ NASION ROŚLIN SPOŻYWANYCH PRZEZ CZŁOWIEKA Klinika Chirurgii Naczyń i Transplantacji,

Bardziej szczegółowo

Ocena. wykonanej pod kierunkiem prof. dr hab. med. Małgorzaty Polz-Docewicz

Ocena. wykonanej pod kierunkiem prof. dr hab. med. Małgorzaty Polz-Docewicz UNIWERSYTET MEDYCZNY IM. KAROLA MARCINKOWSKIEGO W POZNANIU KATEDRA I ZAKŁAD MIKROBIOLOGII LEKARSKIEJ Kierownik: prof. dr hab. Andrzej Szkaradkiewicz ul. Wieniawskiego 3 tel. 61 8546 138 61-712 Poznań fax

Bardziej szczegółowo

Do moich badań wybrałam przede wszystkim linię kostniakomięsaka 143B ze względu na jej wysoki potencjał przerzutowania. Do wykonania pracy

Do moich badań wybrałam przede wszystkim linię kostniakomięsaka 143B ze względu na jej wysoki potencjał przerzutowania. Do wykonania pracy Streszczenie Choroby nowotworowe stanowią bardzo ważny problem zdrowotny na świecie. Dlatego, medycyna dąży do znalezienia nowych skutecznych leków, ale również rozwiązań do walki z nowotworami. Głównym

Bardziej szczegółowo

BIOLOGIA KOMÓRKI. Analiza żywotności komórek w warunkach in vitro

BIOLOGIA KOMÓRKI. Analiza żywotności komórek w warunkach in vitro BIOLOGIA KOMÓRKI Analiza żywotności komórek w warunkach in vitro Wstęp Każda komórka jest układem termodynamicznie otwartym wymieniającym ze swym otoczeniem materię i energię. Wymiana ta odbywa się poprzez

Bardziej szczegółowo

starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg

starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia

Bardziej szczegółowo

PL 213132 B1. POLITECHNIKA WROCŁAWSKA, Wrocław, PL 14.11.2005 BUP 23/05

PL 213132 B1. POLITECHNIKA WROCŁAWSKA, Wrocław, PL 14.11.2005 BUP 23/05 PL 213132 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 213132 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 367760 (22) Data zgłoszenia: 06.05.2004 (51) Int.Cl.

Bardziej szczegółowo

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza dr hab. Beata Schlichtholz Gdańsk, 20 października 2015 r. Katedra i Zakład Biochemii Gdański Uniwersytet Medyczny ul. Dębinki 1 80-211 Gdańsk Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza pt.

Bardziej szczegółowo

TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R

TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej, Wydział Farmaceutyczny, WUM.

Zakład Biologii Molekularnej, Wydział Farmaceutyczny, WUM. Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: TERAPIA GENOWA Plan ćwiczeń Ćwiczenie 1: Przygotowanie warsztatu terapii genowej 1. Kontrola jakościowa preparatów plazmidowych paav/lacz,

Bardziej szczegółowo

Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi

Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi Marta Klimczak Studium Medycyny Molekularnej Warszawski Uniwersytet Medyczny Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi Praca wykonana w Zakładzie Biologii Molekularnej

Bardziej szczegółowo

Sylabus Biologia molekularna

Sylabus Biologia molekularna Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Program kształcenia Farmacja, jednolite studia magisterskie, forma studiów: stacjonarne

Bardziej szczegółowo

PL B1. Płyn celomatyczny dżdżownicy Dendrobaena veneta do zastosowania w leczeniu raka płuc

PL B1. Płyn celomatyczny dżdżownicy Dendrobaena veneta do zastosowania w leczeniu raka płuc RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 227923 (13) B1 (21) Numer zgłoszenia: 411346 (51) Int.Cl. A61K 35/56 (2015.01) A61P 35/00 (2006.01) Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (22)

Bardziej szczegółowo

Instrukcje do ćwiczeń oraz zakres materiału realizowanego na wykładach z przedmiotu Inżynieria bioprocesowa na kierunku biotechnologia

Instrukcje do ćwiczeń oraz zakres materiału realizowanego na wykładach z przedmiotu Inżynieria bioprocesowa na kierunku biotechnologia 1 Zakład Mikrobiologii UJK Instrukcje do ćwiczeń oraz zakres materiału realizowanego na wykładach z przedmiotu Inżynieria bioprocesowa na kierunku biotechnologia 2 Zakład Mikrobiologii UJK Zakres materiału

Bardziej szczegółowo

Techniki immunoenzymatycznego oznaczania poziomu hormonów (EIA)

Techniki immunoenzymatycznego oznaczania poziomu hormonów (EIA) Techniki immunoenzymatycznego oznaczania poziomu hormonów (EIA) Wstęp: Test ELISA (ang. Enzyme-Linked Immunosorbent Assay), czyli test immunoenzymatyczny (ang. Enzyme Immunoassay - EIA) jest obecnie szeroko

Bardziej szczegółowo

Biologiczne podstawy radioterapii Wykład 4 podstawy radioterapii

Biologiczne podstawy radioterapii Wykład 4 podstawy radioterapii Biologiczne podstawy radioterapii Wykład 4 podstawy radioterapii czyli dlaczego komórki nowotworowe są bardziej wrażliwe na działanie promieniowania jonizującego od komórek prawidłowych? A tumor is a conglomerate

Bardziej szczegółowo

Udział metaloproteinaz macierzy pozakomórkowej (MMPs) w progresji czerniaka

Udział metaloproteinaz macierzy pozakomórkowej (MMPs) w progresji czerniaka Borgis Udział metaloproteinaz macierzy pozakomórkowej (MMPs) w progresji czerniaka *Aleksandra Zielińska, Małgorzata Latocha, Dariusz Kuśmierz, Elektra Sliupkas-Dyrda Zakład Biologii Komórki, Wydział Farmaceutyczny

Bardziej szczegółowo

Recenzja. Ocena merytoryczna pracy

Recenzja. Ocena merytoryczna pracy Dr hab. Joanna Jakubowicz-Gil Lublin, 21.12.2017 Zakład Anatomii Porównawczej i Antropologii Uniwersytet Marii Curie-Skłodowskiej w Lublinie ul. Akademicka 19 20-033 Lublin Recenzja rozprawy doktorskiej

Bardziej szczegółowo

PL B1. Zastosowanie kwasów bifenylo-4,4'-diaminobis(metylidenobisfosfonowych) do wytwarzania preparatu farmaceutycznego

PL B1. Zastosowanie kwasów bifenylo-4,4'-diaminobis(metylidenobisfosfonowych) do wytwarzania preparatu farmaceutycznego PL 218140 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 218140 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 398409 (22) Data zgłoszenia: 12.03.2012 (51) Int.Cl.

Bardziej szczegółowo

EWA PIĘTA. Streszczenie pracy doktorskiej

EWA PIĘTA. Streszczenie pracy doktorskiej EWA PIĘTA Spektroskopowa analiza struktur molekularnych i procesu adsorpcji fosfinowych pochodnych pirydyny, potencjalnych inhibitorów aminopeptydazy N Streszczenie pracy doktorskiej wykonanej na Wydziale

Bardziej szczegółowo

2. Przedmiot zamówienia: Odczynniki chemiczne do izolacji DNA i reakcji PCR, wymienione w Tabeli 1. Nazwa odczynnika Specyfikacja Ilość*

2. Przedmiot zamówienia: Odczynniki chemiczne do izolacji DNA i reakcji PCR, wymienione w Tabeli 1. Nazwa odczynnika Specyfikacja Ilość* Poznao, 6 lutego 2012 r. Zapytanie ofertowe nr 001 /2012 dotyczące zakupu odczynników chemicznych do izolacji DNA i reakcji PCR GENESIS Polska Sp. z o.o Ul. Za Cytadelą 19, 61-659 Poznao NIP 778 13 56

Bardziej szczegółowo

PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific

PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji

Bardziej szczegółowo

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:

Bardziej szczegółowo

BIOLOGIA KOMÓRKI. Mikroskopia fluorescencyjna -2 Przyżyciowe barwienia organelli wewnątrzkomórkowych

BIOLOGIA KOMÓRKI. Mikroskopia fluorescencyjna -2 Przyżyciowe barwienia organelli wewnątrzkomórkowych BIOLOGIA KOMÓRKI Mikroskopia fluorescencyjna -2 Przyżyciowe barwienia organelli Wstęp Komórki eukariotyczne, w odróżnieniu od komórek prokariotycznych (bakterie, archeony) posiadają wysoce skomplikowaną

Bardziej szczegółowo

Prezentuje: Magdalena Jasińska

Prezentuje: Magdalena Jasińska Prezentuje: Magdalena Jasińska W którym momencie w rozwoju embrionalnym myszy rozpoczyna się endogenna transkrypcja? Hipoteza I: Endogenna transkrypcja rozpoczyna się w embrionach będących w stadium 2-komórkowym

Bardziej szczegółowo

AmpliTest Babesia spp. (PCR)

AmpliTest Babesia spp. (PCR) AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej, Wydział Farmaceutyczny, WUM.

Zakład Biologii Molekularnej, Wydział Farmaceutyczny, WUM. Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: TERAPIA GENOWA Plan ćwiczeń Ćwiczenie 1: Przygotowanie warsztatu terapii genowej 1. Kontrola jakościowa preparatów plazmidowych paav/lacz,

Bardziej szczegółowo

Oznaczanie aktywności proteolitycznej trypsyny metodą Ansona

Oznaczanie aktywności proteolitycznej trypsyny metodą Ansona Oznaczanie aktywności proteolitycznej trypsyny metodą Ansona Wymagane zagadnienia teoretyczne 1. Enzymy proteolityczne, klasyfikacja, rola biologiczna. 2. Enzymy proteolityczne krwi. 3. Wewnątrzkomórkowa

Bardziej szczegółowo

Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych

Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine

Bardziej szczegółowo

Biologia molekularna

Biologia molekularna Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Program kształcenia Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Analityka Medyczna, studia jednolite magisterskie, studia stacjonarne i niestacjonarne

Bardziej szczegółowo

Wydłużenie życia chorych z rakiem płuca - nowe możliwości

Wydłużenie życia chorych z rakiem płuca - nowe możliwości Wydłużenie życia chorych z rakiem płuca - nowe możliwości Pulmonologia 2015, PAP, Warszawa, 26 maja 2015 1 Epidemiologia raka płuca w Polsce Pierwszy nowotwór w Polsce pod względem umieralności. Tendencja

Bardziej szczegółowo

Technika fluorescencyjnego oznaczania aktywności enzymów. Wstęp:

Technika fluorescencyjnego oznaczania aktywności enzymów. Wstęp: Technika fluorescencyjnego oznaczania aktywności enzymów Wstęp: Wśród technik biologii molekularnej jedną z najczęściej stosowanych jest technika fluorescencyjna. Stosując technikę fluorescencyjną można

Bardziej szczegółowo

Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca

Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca Tytuł pracy: Autor: Promotor rozprawy: Recenzenci: Funkcje białek ELAC2 i SUV3 u ssaków i ryb Danio rerio. Praca doktorska wykonana w Instytucie Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii UW Lien Brzeźniak

Bardziej szczegółowo

UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W POZNANIU KATEDRA BIOTECHNOLOGII I MIKROBIOLOGII ŻYWNOŚCI

UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W POZNANIU KATEDRA BIOTECHNOLOGII I MIKROBIOLOGII ŻYWNOŚCI UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W POZNANIU KATEDRA BIOTECHNOLOGII I MIKROBIOLOGII ŻYWNOŚCI dr hab. inż. Anna Olejnik Katedra Biotechnologii i Mikrobiologii Żywności ul. Wojska Polskiego 48 60-627 Poznań Poznań,

Bardziej szczegółowo

KREW: 1. Oznaczenie stężenia Hb. Metoda cyjanmethemoglobinowa: Zasada metody:

KREW: 1. Oznaczenie stężenia Hb. Metoda cyjanmethemoglobinowa: Zasada metody: KREW: 1. Oznaczenie stężenia Hb Metoda cyjanmethemoglobinowa: Hemoglobina i niektóre jej pochodne są utleniane przez K3 [Fe(CN)6]do methemoglobiny, a następnie przekształcane pod wpływem KCN w trwały związek

Bardziej szczegółowo

ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków)

ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków) ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków) Celem ćwiczenia jest wprowadzenie mutacji punktowej do genu

Bardziej szczegółowo

Fenotyp komórek warunkuje antyproliferacyjne działanie PAI-1 hamujący wpływ na aktywność proliferacyjną komórek raka płuca

Fenotyp komórek warunkuje antyproliferacyjne działanie PAI-1 hamujący wpływ na aktywność proliferacyjną komórek raka płuca PRACA POGLĄDOWA Joanna Chorostowska-Wynimko, Marta Kędzior, Radosław Struniawski, Paulina Jaguś, Ewa Skrzypczak-Jankun 2, Jerzy Jankun 2 Samodzielna Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Immunologii, Instytut

Bardziej szczegółowo

Próba kontrolna (PK) 1000 l 1000 l

Próba kontrolna (PK) 1000 l 1000 l Ćwiczenie 10. A. Oznaczanie stężenia bilirubiny całkowitej w surowicy krwi. Wymagane zagadnienia teoretyczne 1. Biosynteza hemu - metabolity pośrednie syntezy hemu. 2. Katabolizm hemu - powstawanie barwników

Bardziej szczegółowo

Biologiczna ocena wyrobów medycznych Testy in vitro

Biologiczna ocena wyrobów medycznych Testy in vitro Specjalistyczne metody badań materiałów, 2014 Biologiczna ocena wyrobów medycznych Testy in vitro Bogdan Walkowiak Zakład Biofizyki IIM PŁ in vitro vs in vivo i ex vivo http://sexymammy.fotolog.pl/in-vitro-wedlug-disy,1370470

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, Warszawa. Zakład Biologii Molekularnej

Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, Warszawa. Zakład Biologii Molekularnej Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa 1 Ćwiczenie 1 Izolacja oraz

Bardziej szczegółowo

Biochemia: Ćw. 11 Metoda RT-PCR

Biochemia: Ćw. 11 Metoda RT-PCR Ćwiczenie 11 METODA RT-PCR Wyciąg z kart charakterystyki substancji niebezpiecznych: bromek etydyny T+ EDTA Xi etanol, 96% F kwas octowy, 96% C -merkaptoetanol N, T Tris Xi UWAGI WSTĘPNE Praca z kwasami

Bardziej szczegółowo

Technika hodowli komórek leukemicznych

Technika hodowli komórek leukemicznych Fizjologiczne Techniki Badań Technika hodowli komórek leukemicznych Zasady prowadzenia hodowli komórek leukemicznych, pasażowania, mrożenia, rozmrażania i przechowywania komórek leukemicznych Warunki wstępne:

Bardziej szczegółowo

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny

Bardziej szczegółowo

ELEKTROFOREZA BIAŁEK W ŻELU POLIAKRYLAMIDOWYM W WARUNKACH DENATURUJĄCYCH

ELEKTROFOREZA BIAŁEK W ŻELU POLIAKRYLAMIDOWYM W WARUNKACH DENATURUJĄCYCH ELEKTROFOREZA BIAŁEK W ŻELU POLIAKRYLAMIDOWYM W WARUNKACH DENATURUJĄCYCH WPROWADZENIE Elektroforeza od ponad 60 lat pozostaje najczęściej stosowaną metodą izolacji makrocząstek w układach biologicznych

Bardziej szczegółowo

Identyfikacja mikroorganizmów systemem firmy Biolog

Identyfikacja mikroorganizmów systemem firmy Biolog Identyfikacja mikroorganizmów systemem firmy Biolog Główne zalety systemu Ilość mikroorganizmów w bazie danych : Biolog ponad 2500 Vitek 2 ponad 330 Bez barwienia metodą Grama ( Vitek wymaga wstępnego

Bardziej szczegółowo

Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16

Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16 Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16 Ćwiczenie 3 Identyfikacja genetycznie modyfikowanych roślin w produktach spożywczych - jakościowe badanie obecności

Bardziej szczegółowo

CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek

CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,

Bardziej szczegółowo

Ampli-LAMP Babesia canis

Ampli-LAMP Babesia canis Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400

Bardziej szczegółowo

Znaczenie metaloproteinaz i ich inhibitorów tkankowych w procesie nowotworowym

Znaczenie metaloproteinaz i ich inhibitorów tkankowych w procesie nowotworowym 410 Prz. Med. Uniw. Rzesz. Inst. Leków, 2013, 3, 410 417 Wydawnictwo UR 2013 ISSN 2082-369X Przegląd Medyczny Uniwersytetu Rzeszowskiego i Narodowego Instytutu Leków w Warszawie Rzeszów 2013, 3, 410 417

Bardziej szczegółowo

ĆWICZENIA Z MECHANIZMÓW DZIAŁANIA WYBRANYCH GRUP LEKÓW

ĆWICZENIA Z MECHANIZMÓW DZIAŁANIA WYBRANYCH GRUP LEKÓW UNIWERSYTET MARII CURIE-SKŁODOWSKIEJ WYDZIAŁ BIOLOGII I BIOTECHNOLOGII ZAKŁAD BIOLOGII MOLEKULARNEJ ĆWICZENIA Z MECHANIZMÓW DZIAŁANIA WYBRANYCH GRUP LEKÓW dla studentów I roku II 0 biotechnologii medycznej

Bardziej szczegółowo

PL 212748 B1. GDAŃSKI UNIWERSYTET MEDYCZNY, Gdańsk, PL SKRZYPSKI MARCIN, Sopot, PL JASSEM JACEK, Gdańsk, PL 31.01.2011 BUP 03/11 30.11.

PL 212748 B1. GDAŃSKI UNIWERSYTET MEDYCZNY, Gdańsk, PL SKRZYPSKI MARCIN, Sopot, PL JASSEM JACEK, Gdańsk, PL 31.01.2011 BUP 03/11 30.11. PL 212748 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 212748 (21) Numer zgłoszenia: 388681 (22) Data zgłoszenia: 30.07.2009 (13) B1 (51) Int.Cl.

Bardziej szczegółowo

STRESZCZENIE PRACY DOKTORSKIEJ

STRESZCZENIE PRACY DOKTORSKIEJ mgr Bartłomiej Rospond POSZUKIWANIE NEUROBIOLOGICZNEGO MECHANIZMU UZALEŻNIENIA OD POKARMU - WPŁYW CUKRÓW I TŁUSZCZÓW NA EKSPRESJĘ RECEPTORÓW DOPAMINOWYCH D 2 W GRZBIETOWYM PRĄŻKOWIU U SZCZURÓW STRESZCZENIE

Bardziej szczegółowo