Rzędy wiązań chemicznych

Podobne dokumenty
Entropowe indeksy wiązań chemicznych na gruncie teorii informacji

1 i 2. Struktura elektronowa atomów, tworzenie wiązań chemicznych

Orbitale typu σ i typu π

Wiązania. w świetle teorii kwantów fenomenologicznie

Modelowanie molekularne

Wykład 5: Cząsteczki dwuatomowe

Cząsteczki. 1.Dlaczego atomy łącz. 2.Jak atomy łącz. 3.Co to jest wiązanie chemiczne? Jakie sąs. typy wiąza

Elektronowa struktura atomu

Temat Ocena dopuszczająca Ocena dostateczna Ocena dobra Ocena bardzo dobra Ocena celująca. Uczeń:

Inne koncepcje wiązań chemicznych. 1. Jak przewidywac strukturę cząsteczki? 2. Co to jest wiązanie? 3. Jakie są rodzaje wiązań?

WYKŁAD 3 CZĄSTECZKI WIELOATOMOWE ZWIĄZKI WĘGLA

Lokalizacja Orbitali Molekularnych

CZĄSTECZKA. Do opisu wiązań chemicznych stosuje się najczęściej jedną z dwóch metod (teorii): metoda wiązań walencyjnych (VB)

CZĄSTECZKA. Do opisu wiązań chemicznych stosuje się najczęściej metodę (teorię): metoda wiązań walencyjnych (VB)

Wykład z Chemii Ogólnej

Atomy wieloelektronowe

Teoria VSEPR. Jak przewidywac strukturę cząsteczki?

Wiązania chemiczne. Związek klasyfikacji ciał krystalicznych z charakterem wiązań atomowych. 5 typów wiązań

Różne typy wiązań mają ta sama przyczynę: energia powstającej stabilnej cząsteczki jest mniejsza niż sumaryczna energia tworzących ją, oddalonych

TEORIA ORBITALI MOLEKULARNYCH (MO) dr Henryk Myszka - Uniwersytet Gdański - Wydział Chemii

Modelowanie molekularne

Wykład przygotowany w oparciu o podręczniki:

Elementy teorii powierzchni metali

3. Cząsteczki i wiązania

Geometria cząsteczek wieloatomowych. Hybrydyzacja orbitali atomowych.

Model wiązania kowalencyjnego cząsteczka H 2

Inżynieria Biomedyczna. Wykład XII

Podstawy chemii. dr hab. Wacław Makowski. Wykład 1: Wprowadzenie

CZ STECZKA. Do opisu wi za chemicznych stosuje si najcz ciej jedn z dwóch metod (teorii): metoda wi za walencyjnych (VB)

H H 2.5 < H H CH 3 N O O H C N ŁADUNEK FORMALNY. 2.5 dla atomu węgla C C 2.5 H 2.1. Li 1.0. liczba e - walencyjnych w atomie wolnym C 2.5 H 2.

S. Baran - Podstawy fizyki materii skondensowanej Wiązania chemiczne w ciałach stałych. Wiązania chemiczne w ciałach stałych

WIĄZANIA. Co sprawia, że ciała stałe istnieją i są stabilne? PRZYCIĄGANIE ODPYCHANIE

Elementy chemii obliczeniowej i bioinformatyki Zagadnienia na egzamin

Podstawy chemii obliczeniowej

Modelowanie molekularne

Hybrydowe materiały organiczno-nieorganiczne: od struktury do wyznaczania eksperymentalnych rozkładów gęstości elektronowej i ich analizy.

Ćwiczenie 4: Modelowanie reakcji chemicznych. Stan przejściowy.

3. Cząsteczki i wiązania

Cz. I Materiał powtórzeniowy do sprawdzianu dla klas II LO - Wiązania chemiczne + przykładowe zadania i proponowane rozwiązania

Ligand to cząsteczka albo jon, który związany jest z jonem albo atomem centralnym.

c) prawdopodobieństwo znalezienia cząstki między x=1.0 a x=1.5 jest równe

Teoria Orbitali Molekularnych. tworzenie wiązań chemicznych

Cz. I Materiał powtórzeniowy do sprawdzianu dla klas I LO - Wiązania chemiczne + przykładowe zadania i proponowane rozwiązania

Teorie wiązania chemicznego i podstawowe zasady mechaniki kwantowej Zjawiska, które zapowiadały nadejście nowej ery w fizyce i przybliżały

Wykład V Wiązanie kowalencyjne. Półprzewodniki

Opis korelacji elektronowej w dużych układach molekularnych. Implementacja metodologii LT-AO-MP2

Modelowanie molekularne

Wiązania kowalencyjne

zaprezentowana w 1940 roku (Sidgwick i Powell). O budowie przestrzennej cząsteczki decyduje łączna liczba elektronów walencyjnych wokół atomu

Ocena aromatyczności cząsteczek w oparciu o orbitale rzędów wiązań

Mechanika kwantowa. Jak opisać atom wodoru? Jak opisać inne cząsteczki?

RJC. Wiązania Chemiczne & Slides 1 to 39

Opracowała: mgr inż. Ewelina Nowak

Spis treści. Metoda VSEPR. Reguły określania struktury cząsteczek. Ustalanie struktury przestrzennej

UKŁAD OKRESOWY PIERWIASTKÓW

Zasady obsadzania poziomów

Temat 1: Budowa atomu zadania

teoria informacji Kanały komunikacyjne, kody korygujące Mariusz Różycki 25 sierpnia 2015

Wiązania chemiczne z teorii informacji Fishera

Czym jest prąd elektryczny

Symetria w obliczeniach molekularnych

Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 1 Wydział Matematyki, Fizyki i Chemii

że w wyniku pomiaru zmiennej dynamicznej A, której odpowiada operator αˆ otrzymana zostanie wartość 2.41?

Struktura elektronowa σ-kompleksu benzenu z centrum aktywnym Fe IV O cytochromu P450

CHEMIA. Wymagania szczegółowe. Wymagania ogólne

Zadania powtórkowe do egzaminu maturalnego z chemii Wiązania chemiczne, budowa cząsteczek

Wykład 16: Atomy wieloelektronowe

Układ okresowy. Przewidywania teorii kwantowej

Estymacja gęstości prawdopodobieństwa metodą selekcji modelu

Analizy populacyjne i rzedy

Modelowanie molekularne

Konwersatorium 1. Zagadnienia na konwersatorium

Świat chemii cz. 1, rok szkolny 2016/17 Opis założonych osiągnięć ucznia

Wykład 9 Wprowadzenie do krystalochemii

Fizyka atomowa r. akad. 2012/2013

CHEMIA WARTA POZNANIA

Wewnętrzna budowa materii

I. Substancje i ich przemiany

PODSTAWY CHEMII INŻYNIERIA BIOMEDYCZNA. Wykład 2

Chemia nieorganiczna. Copyright 2000 by Harcourt, Inc. All rights reserved.

Struktura elektronowa

Mechanika kwantowa. Jak opisać atom wodoru? Jak opisać inne cząsteczki?

III Podkarpacki Konkurs Chemiczny 2010/2011. ETAP I r. Godz Zadanie 1

Podział ciał stałych ze względu na strukturę atomowo-cząsteczkową

Pasmowa teoria przewodnictwa. Anna Pietnoczka

Analizy populacyjne, ªadunki atomowe

Elektrodynamika. Część 5. Pola magnetyczne w materii. Ryszard Tanaś. Zakład Optyki Nieliniowej, UAM

Liczby kwantowe n, l, m l = 0 l =1 l = 2 l = 3

3. Jaka jest masa atomowa pierwiastka E w następujących związkach? Który to pierwiastek? EO o masie cząsteczkowej 28 [u]

Chemia nieorganiczna. Pierwiastki. niemetale Be. 27 Co. 28 Ni. 26 Fe. 29 Cu. 45 Rh. 44 Ru. 47 Ag. 46 Pd. 78 Pt. 76 Os.

Elektronowa struktura atomu

Wymagania programowe na poszczególne oceny chemia kl. I

b) Pierwiastek E tworzy tlenek o wzorze EO 2 i wodorek typu EH 4, a elektrony w jego atomie rozmieszczone są na dwóch powłokach elektronowych

Projekt Era inżyniera pewna lokata na przyszłość jest współfinansowany przez Unię Europejską w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego

Elementy Modelowania Matematycznego Wykład 4 Regresja i dyskryminacja liniowa

Przepustowość kanału, odczytywanie wiadomości z kanału, poprawa wydajności kanału.

Anna Grych Test z budowy atomu i wiązań chemicznych

Fizyka Ciała Stałego. Struktura krystaliczna. Struktura amorficzna

Stany skupienia materii

Atom wodoru w mechanice kwantowej. Równanie Schrödingera

Transkrypt:

Seminarium Magisterskie Rzędy wiązań chemicznych w ujęciu Teorii Komunikacji Opracowanie Dariusz Szczepanik Promotor Dr hab. Janusz Mrozek

Rzędy wiązań chemicznych w ujęciu Teorii Komunikacji Plan prezentacji 1. Fizyczny kanał informacyjny modelu 2-AO 2. Stopień jonowości informacyjnej wiązania 3. Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł 4. Wnioski i plany

1 Fizyczny kanał informacyjny modelu 2-AO

Fizyczny kanał informacyjny modelu 2-AO Fizyczny kanał promocyjny 2-AO MO wiążący : MO antywiążący : Macierz prawdopodobieństw warunkowych w stanie podstawowym przyjmuje postać:

Fizyczny kanał informacyjny modelu 2-AO Entropia warunkowa S(B A0) określa średnią ilość informacji rozproszonej w kanale komunikacyjnym. Informacja przesyłana w kanale komunikacyjnym dotyczy przypisania elektronów do OAO budujących daną molekułę. S(B A0) mierzy stopień delokalizacji elektronów, czyli tzw. kowalencyjność układu. Wzajemna informacja I(A:B) określa średnią ilość informacji przepływającej przez kanał komunikacyjny. Informacja przesyłana w kanale komunikacyjnym dotyczy przypisania elektronów do OAO budujących daną molekułę. Mierzy stopień podobieństwa rozkładów P(A0) i P(B), tzw. jonowość układu.

Fizyczny kanał informacyjny modelu 2-AO Fizyczny kanał promocyjny 2-AO Brak polaryzacji Czysto kowalencyjne wiązanie (w sensie informacyjnym) Pełna polaryzacja Brak wiązania (w sensie informacyjnym)

Fizyczny kanał informacyjny modelu 2-AO Fizyczny kanał promocyjny 2-AO Brak polaryzacji Czysto koordynacyjne wiązanie (w sensie informacyjnym) Pełna polaryzacja Wolna para na atomie A (w sensie informacyjnym)

Fizyczny kanał informacyjny modelu 2-AO Fizyczny kanał promocyjny 2-AO Entropia warunkowa S i wzajemna informacja I w funkcji polaryzacji P dla różnych prawdopodobieństw na wejściu kanału komunikacyjnego W obszarze niewielkiej polaryzacji wiązania wszystkie Wzajemna informacja I(x=0.5) funkcje S(x) przyjmują wartości bliskie S(x=0.5). Ujemne maksymalną wartości S(x) mogą okazać się niewygodne w przypadku Funkcja I(x=1.0) przyjmuje wartość 0 niezależnie od bardziej skomplikowanych układów molekularnych polaryzacji P. (Brak niepewności w rozkładzie prawdopodobieństw na przepustowość kanału odzwierciedla promocyjnego. wejściu sprawia, że żadna informacja nie przepływa przez układ. BRAK MOŻLIWOŚCI SEPARACJI JONOWOŚCI I KOWALENCYJNOŚCI POCHODZĄCYCH OD EFEKTU TRANSFERU ŁADUNKU POMIĘDZY ATOMAMI.

Fizyczny kanał informacyjny modelu 2-AO Fizyczny kanał promocyjny 2-AO Całkowity rząd wiązania N w funkcji polaryzacji P dla różnych wartości x. Funkcja entropii binarnej : W obszarze niewiążącym (lewa strona) funkcje N(x) Indeksy informacyjne modelu 2-AO z jednorodnym wykazują znaczne odstępstwa od N(x=0.5). W obszarze rozkładem prawdopodobieństw na wejściu (x=y) są wiążącym (prawa strona) w przypadku niewielkiej prostymi funkcjami binarnej entropii. polaryzacji P funkcje N(x) przyjmują wartości bliskie N(x=0.5)

Fizyczny kanał informacyjny modelu 2-AO Fizyczny kanał promocyjny 2-AOx=y Prawdopodobieństwa warunkowe są jednoznacznie określone przez prawdopodobieństwa na wyjściu fizycznego kanału informacyjnego! Zależą jedynie od prawdopodobieństw na wyjściu! Wprowadzone nowe indeksy nawiązują do klasycznej interpretacji entropowego rzędu wiązania, pozwalając na wyznaczenie wkładu kowalencyjnego i jonowego. Nowe indeksy nie pozwalają na diagnostykę wiązania koordynacyjnego.

2 Stopień jonowości informacyjnej wiązania

Stopień jonowości informacyjnej wiązania Dysponując macierzą ładunków i rzędów wiązań, CBO, z typowych obliczeń HF : dla każdej pary ab-ao orbitali w zadanej bazie funkcyjnej oblicza się odpowiednie prawdopodobieństwa znalezieniu elektronu : Indeks kowalencyjności orbitali atomowych ma postać : i jonowości informacyjnej dla każdej pary ab-ao

Stopień jonowości informacyjnej wiązania Całkowite indeksy kowalencyjności i jonowości informacyjnej wiązania A-B otrzymuje się przez zsumowanie po wszystkich orbitalach AO należących do atomów A i B z wagami określonymi przez kwadraty odpowiednich elementów macierzy gęstości : Przy takiej definicji wkładów jonowych i kowalencyjnych całkowity rząd wiązania odtwarza rzędy wiązań Wiberga :

Stopień jonowości informacyjnej wiązania Posługiwanie się indeksami jonowości i kowalencyjności ma sens jedynie w przypadku wiązań w dużym stopniu kowalencyjnych. Dzieje się tak dlatego, że tak zdefiniowane indeksy entropowe dziedziczą w pewnym stopniu wady indeksów Wiberga, które w przypadku wysokiej polaryzacji wiązania przyjmują ułamkowe, małe wartości. W przypadku wiązań o dużym udziale składowej jonowej wygodniej posługiwać się stopniem kowalencyjności wiązania : lub alternatywnie stopniem jonowości wiązania

3 Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Wszystkie obliczenia wykonane zostały przy użyciu oprogramowania GAMESS do obliczeń kwantowo-chemicznych metodą RHF w bazach : STO-3G, 3-21G oraz 631G*. Dla porównania użyte zostały indeksy różnicowe Nalewajskiego-Mrozka :

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Wstępne obliczenia dla wybranych molekuł w bazie minimalnej STO-3G

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Charakter wiązania H-X dla X = F, Cl, Br, I Obliczenia w bazie 3-21G Entropowe indeksy rzędów wiązań Różnicowe indeksy rzędów wiązań

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Charakter wiązania Me-F dla Me = Li, Na, K Obliczenia w bazie 3-21G Entropowe indeksy rzędów wiązań Różnicowe indeksy rzędów wiązań

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Charakter wiązania Li-X dla X = F, Cl, Br, I Obliczenia w bazie 3-21G Entropowe indeksy rzędów wiązań Różnicowe indeksy rzędów wiązań

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Charakter wiązania Na-X dla X = F, Cl, Br, I Obliczenia w bazie 3-21G Entropowe indeksy rzędów wiązań Różnicowe indeksy rzędów wiązań

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Wpływ bazy na stopień jonowości wiązania

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Rzędy wiązań w etanie, etylenie i acetylenie Obliczenia w bazie 3-21G Entropowe indeksy rzędów wiązań (kowalencyjność, jonowość) Rzędy wiązań Nalewajskiego - Mrozka (czerwony) i Mayera (niebieski)

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Rzędy wiązań w benzenie i fenolu Obliczenia w bazie 3-21G Entropowe indeksy rzędów wiązań (kowalencyjność, jonowość)

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Rzędy wiązań w propelanach Obliczenia w bazie 3-21G Entropowe indeksy rzędów wiązań (kowalencyjność, jonowość) Odległość informacyjna Kullbacka-Leiblera N= 0,792 Mapa zaczerpnięta z pracy doktorskiej dr E. Broniatowskiej. Obliczenia DFT prowadzone przy użyciu potencjału LDA, geometrie optymalizowane w bazie 3-21G metodą UHF. Propelan[1.1.1] Propelan[1.1.1]

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Rzędy wiązań w propelanach Obliczenia w bazie 3-21G Entropowe indeksy rzędów wiązań (kowalencyjność, jonowość) Odległość informacyjna Kullbacka-Leiblera N= 0,841 Mapa zaczerpnięta z pracy doktorskiej dr E. Broniatowskiej. Obliczenia DFT prowadzone przy użyciu potencjału LDA, geometrie optymalizowane w bazie 3-21G metodą UHF. Propelan[2.1.1] Propelan[2.1.1]

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Rzędy wiązań w propelanach Obliczenia w bazie 3-21G Entropowe indeksy rzędów wiązań (kowalencyjność, jonowość) Odległość informacyjna Kullbacka-Leiblera N= 0,924 Mapa zaczerpnięta z pracy doktorskiej dr E. Broniatowskiej. Obliczenia DFT prowadzone przy użyciu potencjału LDA, geometrie optymalizowane w bazie 3-21G metodą UHF. Propelan[2.2.1] Propelan[2.2.1]

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Rzędy wiązań w propelanach Obliczenia w bazie 3-21G Entropowe indeksy rzędów wiązań (kowalencyjność, jonowość) Odległość informacyjna Kullbacka-Leiblera N= 1,006 Mapa zaczerpnięta z pracy doktorskiej dr E. Broniatowskiej. Obliczenia DFT prowadzone przy użyciu potencjału LDA, geometrie optymalizowane w bazie 3-21G metodą UHF. Propelan[2.2.2] Propelan[2.2.2]

Wyniki obliczeń metodą RHF dla wybranych molekuł Stopień jonowości wiązań w Li2C2O2 Obliczenia w bazie 3-21G Forma liniowa Forma cykliczna

4 Wnioski i plany

Wnioski i plany Wnioski : wyniki zgodne z intuicją chemiczną prostota interpretacyjna i implementacyjna metody niewielki koszt obliczeniowy oparta na 1-elektronowej macierzy gęstości brak jawnie zdefiniowanej promolekuły referencyjnej zgodność trendów zmian wartości z momentem dipolowym Plany : przetestowanie większej grupy molekuł kompleksowa analiza porównawcza