Jerzy A. Moczko Katedra i Zakład Informatyki i Statystyki UM - Poznań ANALIZA ZJAWISK OKRESOWYCH W BADANIACH MEDYCZNYCH

Podobne dokumenty
Jerzy A. Moczko Katedra i Zakład Informatyki i Statystyki UM - Poznań INSTRUMENTACJA WIRTUALNA W BADANIACH MEDYCZNYCH

Analiza sygnałów biologicznych

Zestaw ćwiczeń laboratoryjnych z Biofizyki dla kierunku elektroradiologia w roku akademickim 2017/2018.

CYFROWE PRZETWARZANIE SYGNAŁÓW

Analizy Ilościowe EEG QEEG

2. Próbkowanie Sygnały okresowe (16). Trygonometryczny szereg Fouriera (17). Częstotliwość Nyquista (20).

Metodyka i system dopasowania protez słuchu w oparciu o badanie percepcji sygnału mowy w szumie

Zaawansowane algorytmy DSP

Egzamin / zaliczenie na ocenę*

DYSKRETNA TRANSFORMACJA FOURIERA

Zjawisko aliasingu. Filtr antyaliasingowy. Przecieki widma - okna czasowe.

Multimedialne Systemy Medyczne

Analiza i Przetwarzanie Biosygnałów

Teoria sygnałów Signal Theory. Elektrotechnika I stopień (I stopień / II stopień) ogólnoakademicki (ogólno akademicki / praktyczny)

Automatyczne rozpoznawanie mowy - wybrane zagadnienia / Ryszard Makowski. Wrocław, Spis treści

PL B1. Sposób i układ pomiaru całkowitego współczynnika odkształcenia THD sygnałów elektrycznych w systemach zasilających

5. Jako pokrycia tytanowych elementów sztucznej zastawki serca stosuje się. 6. Podstawowym parametrem opisującym skuteczność procesu membranowego jest

KARTA MODUŁU / KARTA PRZEDMIOTU

Zestaw ćwiczeń laboratoryjnych z Biofizyki dla kierunku Elektroradiologia w roku akademickim 2016/2017.

Przedmowa Wykaz oznaczeń Wykaz skrótów 1. Sygnały i ich parametry Pojęcia podstawowe Klasyfikacja sygnałów

Przekształcenie Fouriera obrazów FFT

Algorytmy detekcji częstotliwości podstawowej

Podstawy Przetwarzania Sygnałów

Ćwiczenie 3. Właściwości przekształcenia Fouriera

Informatyka w medycynie Punkt widzenia kardiologa

4 Zasoby językowe Korpusy obcojęzyczne Korpusy języka polskiego Słowniki Sposoby gromadzenia danych...

Kompresja dźwięku w standardzie MPEG-1

KATEDRA BIOSENSORÓW I PRZETWARZANIA SYGNAŁÓW BIOMEDYCZNYCH

Detekcja zespołów QRS w sygnale elektrokardiograficznym

IMPLEMENTATION OF THE SPECTRUM ANALYZER ON MICROCONTROLLER WITH ARM7 CORE IMPLEMENTACJA ANALIZATORA WIDMA NA MIKROKONTROLERZE Z RDZENIEM ARM7

FFT i dyskretny splot. Aplikacje w DSP

Prof. Stanisław Jankowski

Opis efektów kształcenia dla modułu zajęć

(L, S) I. Zagadnienia. 1. Potencjały czynnościowe komórek serca. 2. Pomiar EKG i jego interpretacja. 3. Fonokardiografia.

Politechnika Łódzka. Instytut Systemów Inżynierii Elektrycznej. Laboratorium cyfrowej techniki pomiarowej. Ćwiczenie 3

Zakres wymaganych wiadomości do testów z przedmiotu Metrologia. Wprowadzenie do obsługi multimetrów analogowych i cyfrowych

Kamil Jonak Zakład Bioinżynierii Instytut Technologicznych Systemów Informatycznych Politechnika Lubelska Paweł Krukow Zakład Neuropsychiatrii

Metody matematyczne w analizie danych eksperymentalnych - sygnały, cz. 2

Filtry cyfrowe procesory sygnałowe

Sygnały losowe i ich analiza. Paweł Strumiłło, Instytut Elektroniki Politechniki Łódzkiej

Politechnika Łódzka. Instytut Systemów Inżynierii Elektrycznej

efekty kształcenia dla kierunku Elektronika studia stacjonarne drugiego stopnia, profil ogólnoakademicki

Przekształcenie Fouriera i splot

Teoria Sygnałów. III rok Informatyki Stosowanej. Wykład 8

b n y k n T s Filtr cyfrowy opisuje się również za pomocą splotu dyskretnego przedstawionego poniżej:

Ćwiczenie 3,4. Analiza widmowa sygnałów czasowych: sinus, trójkąt, prostokąt, szum biały i szum różowy

9. Dyskretna transformata Fouriera algorytm FFT

Rozdział 1 PODSTAWOWE POJĘCIA I DEFINICJE

ĆWICZENIE nr 3. Badanie podstawowych parametrów metrologicznych przetworników analogowo-cyfrowych

Adaptacyjne Przetwarzanie Sygnałów. Filtracja adaptacyjna w dziedzinie częstotliwości

Ćwiczenie 4. Filtry o skończonej odpowiedzi impulsowej (SOI)

3. Przetwarzanie analogowo-cyfrowe i cyfrowo-analogowe... 43

Generowanie sygnałów na DSP

Akustyka muzyczna ANALIZA DŹWIĘKÓW MUZYCZNYCH

Przetwarzanie analogowo-cyfrowe sygnałów

Podstawowe funkcje przetwornika C/A

Analiza właściwości filtrów dolnoprzepustowych

Projektowanie układów regulacji w dziedzinie częstotliwości. dr hab. inż. Krzysztof Patan, prof. PWSZ

PL B1. POLITECHNIKA GDAŃSKA, Gdańsk, PL BUP 02/12

f = 2 śr MODULACJE

Spis treści. Przedmowa... XI. Rozdział 1. Pomiar: jednostki miar Rozdział 2. Pomiar: liczby i obliczenia liczbowe... 16

Elektrokardiografia dla informatyka-praktyka / Piotr Augustyniak. Kraków, Spis treści Słowo wstępne 5

Transformata Fouriera

1. Modulacja analogowa, 2. Modulacja cyfrowa

INSTRUKCJA DO ĆWICZENIA NR 7

TRANSFORMATA FALKOWA 2D. Oprogramowanie Systemów Obrazowania 2016/2017

Klasyfikacja metod przetwarzania analogowo cyfrowego (A/C, A/D)

Metody analizy zapisu EEG. Piotr Walerjan

Sposoby opisu i modelowania zakłóceń kanałowych

(1.1) gdzie: - f = f 2 f 1 - bezwzględna szerokość pasma, f śr = (f 2 + f 1 )/2 częstotliwość środkowa.

przedmiot kierunkowy (podstawowy / kierunkowy / inny HES) obieralny (obowiązkowy / nieobowiązkowy) polski semestr VI

CYFROWE PRZTWARZANIE SYGNAŁÓW (Zastosowanie transformacji Fouriera)

SYMULACJA KOMPUTEROWA SYSTEMÓW

Analiza sygnału EKG i modelowanie pracy serca

Akwizycja i przetwarzanie sygnałów cyfrowych

ĆWICZENIE III ANALIZA WIDMOWA SYGNAŁÓW DYSKRETNYCH. ver.3

Algorytm do rozpoznawania człowieka na podstawie dynamiki użycia klawiatury. Paweł Kobojek, prof. dr hab. inż. Khalid Saeed

Symulacja sygnału czujnika z wyjściem częstotliwościowym w stanach dynamicznych

Analiza zmienności rytmu serca (HRV). Analiza częstotliwościowa sygnałów próbkowanych niejednorodnie

Podstawy fizyki sezon 1 VII. Ruch drgający

Akwizycja i przetwarzanie sygnałów cyfrowych

Rys. 1. Wzmacniacz odwracający

Wydział Elektryczny Katedra Telekomunikacji i Aparatury Elektronicznej

Widmo akustyczne radia DAB i FM, porównanie okien czasowych Leszek Gorzelnik

Szereg i transformata Fouriera

Fal podłużna. Polaryzacja fali podłużnej

Teoria obwodów / Stanisław Osowski, Krzysztof Siwek, Michał Śmiałek. wyd. 2. Warszawa, Spis treści

KARTA PRZEDMIOTU. Techniki przetwarzania sygnałów, D1_3

CZWÓRNIKI KLASYFIKACJA CZWÓRNIKÓW.

STATYSTYKA MATEMATYCZNA

P R Z E T W A R Z A N I E S Y G N A Ł Ó W B I O M E T R Y C Z N Y C H

Algorytmy klasteryzacji jako metoda dyskretyzacji w algorytmach eksploracji danych. Łukasz Przybyłek, Jakub Niwa Studenckie Koło Naukowe BRAINS

Michał Strzelecki Metody przetwarzania i analizy obrazów biomedycznych (1)

Akwizycja i przetwarzanie sygnałów cyfrowych

DYSKRETNE PRZEKSZTAŁCENIE FOURIERA C.D.

POMIARY WYBRANYCH PARAMETRÓW TORU FONICZNEGO W PROCESORACH AUDIO

SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA Realizowany w roku akademickim 2016/2017

Przedmowa 11 Ważniejsze oznaczenia 14 Spis skrótów i akronimów 15 Wstęp 21 W.1. Obraz naturalny i cyfrowe przetwarzanie obrazów 21 W.2.

Ćwiczenie 11. Podstawy akwizycji i cyfrowego przetwarzania sygnałów. Program ćwiczenia:

POLITECHNIKA POZNAŃSKA

Transkrypt:

Jerzy A. Moczko Katedra i Zakład Informatyki i Statystyki UM - Poznań ANALIZA ZJAWISK OKRESOWYCH W BADANIACH MEDYCZNYCH

SPECYFIKA DANYCH MEDYCZNYCH

PODSTAWOWE TYPY INFORMACJI ALFANUMERYCZNA SYGNAŁY OBRAZY

INFORMACJA ALFANUMERYCZNA DANE REJESTRACYJNE HISTORIA CHOROBY WYNIKI LABORATORYJNE EPIKRYZA RECEPTY

INFORMACJA SYGNAŁOWA ELEKTROKARDIOGRAFIA ELEKTROENCEFALOGRAFIA ELEKTROMIOGRAFIA ELEKTRONYSTAGMOGRAFIA ELEKTROGASTROGRAFIA ELEKTROINTESTINOGRAFIA ELEKTROOKULOGRAFIA KARDIOTOKOGRAFIA

NATURA SYGNAŁÓW BIOLOGICZNYCH ELEKTRYCZNE MAGNETYCZNE MECHANICZNE AKUSTYCZNE CHEMICZNE CIEPLNE elektrokardiografia, elektroencefalografia, elektromiografia, elektroretinografia, elektrointestinografia, magnetokardiografia ciśnienie krwi, ruchy oddechowe, skurcze mięśnia macicy fonokardiografia fluktuacje stężenia gazów we krwi, gospodarka wodno-elektrolitowa temperatura

INFORMACJA OBRAZOWA KLASYCZNA TECHNIKA RENTGENOWSKA JĄDROWY REZONANS MAGNETYCZNY ULTRASONOGRAFIA MIKROSKOPIA OPTYCZNA I ELEKTRONOWA BADANIE DNA OKA TERMOGRAFIA

CYKLICZNOŚĆ ZJAWISK BIOLOGICZNYCH RYTMY MOGĄ MIEĆ ROZMAITY OKRES RYTMY BARDZO WOLNE OKRES DŁUŻSZY NIŻ 24 GODZINY (INFRADIAN) RYTMY OKOŁO DOBOWE (CIRCADIAN) RYTMY SZYBKIE OKRES KRÓTSZY NIŻ 24 GODZINY (ULTRADIAN)

CELE ANALIZY SYGNAŁU BIOLOGICZNEGO Wniknięcie w naturę systemu generującego sygnał (cel naukowy, poznawczy) ustalenie aktualnego stanu systemu (cel praktyczny - postawienie diagnozy)

WADY ANALIZY WZROKOWEJ SYGNAŁÓW BIOLOGICZNYCH wydobycie małego procentu zawartej w sygnale informacji zależność interpretacji zapisu od stopnia doświadczenia i zmęczenia osoby analizującej wpływ efektów psychologicznych ( stan emocjonalny osoby analizowanej i analizującej)

ETAPY PRZETWARZANIA SYGNAŁÓW PRZETWARZANIE WSTĘPNE PRÓBKOWANIE SYGNAŁU ANALIZA W DZIEDZINIE CZASU ANALIZA W DZIEDZINIE CZĘSTOTLIWOŚCI ANALIZA W POŁĄCZONEJ DZIE- DZINIE CZASU-CZĘSTOTLIWOŚCI KLASYFIKACJA I DIAGNOZA

TYPY SYGNAŁÓW sygnały ciągłe (szeregi czasowe, time series) - EKG, EEG, EMG procesy punktowe (sekwencje zdarzeń, time events) - częstość uderzeń serca, sekwencje wyładowań neuronowych

STANDARDY PODŁĄCZENIA APARATURY MEDYCZNEJ sprzętowe porty komunikacyjne ŁĄCZA SZEREGOWE EIA 485 (232) (Electronic Industry Association dawny standard RS Recomended Standard) ŁĄCZA RÓWNOLEGŁE ŁĄCZA USB ŁĄCZA VXI, PXI KARTY ANALOGOWO - CYFROWE

AKWIZYCJA SYGNAŁU ZBIERANIE SYGNAŁU PRZY UŻYCIU ROZMAITYCH SENSORÓW PRAWIDŁOWE PRZETWARZANIE WSTĘPNE (LINEARYZACJA, WZMOCNIENIE, FILTRACJA, KOMPENSACJA UPŁYWNOŚCI)

HARDWARE SOFTWARE

INSTRUMENTACJA WIRTUALNA

INSTRUMENTACJA WIRTUALNA

ANALIZA W DZIEDZINIE CZASU

ANALIZA CZĘSTOŚCI UDERZEŃ SERCA

190 DECELERATION PATTERN 190 180 180 170 170 160 160 FHR 150 150 140 140 130 130 120 120 110 110 0 50 100 150 200 250 300 350 400 TIME

-1-2 -3-4 -5 4 3 2 1 0 Analiza Cosinorowa Faza Amplituda Mesor 2 y( t) M Acos t T

y i M Acos( t ) i e i gdzie: M MESOR (ang. midline estimating statistic of rhythm) A amplituda funkcji cosinorowej - akrofaza przesunięcie fazowe e składnik losowy 2 T T badany okres Korzystając z tożsamości trygonometrycznej cos( t ) cos t cos sin t sin i i i y i M model cosinorowy można zapisać w postaci liniowej: xi cos ti Acos xi zi ei gdzie: z sin t Acos i i ˆ arctan n n n ˆ 1 1 ˆ 1 M y ˆ i xi z 2 2 i n i 1 n i 1 n Aˆ ˆ ˆ i 1 MESOR amplituda akrofaza ˆ ˆ

Zakładając normalność rozkładu parametrów, otrzymujemy elipsoidę równej gęstości postaci: 2 2 2 2 X ˆ 2 T ˆ ˆ Z ˆ F 1 (2, n 3) n A gdzie: 1 X n 1 Z n 1 T n Elipsoidę równej gęstości wykorzystujemy do testowania hipotezy: H H 0 i 1 n i 1 n n i 1 ( x ( z ( x : 0 : ~ H 1 0 i i i x ) i i 2 2 zi ) x )( z i z ) i - akrofaza, przesunięcie fazowe A - amplituda Test ten często nazywany jest zero amplitude test

Model cosinorowy można uogólnić na całą badaną populację Mając obliczone parametry modelu dla poszczególnych osobników: (,, ),(,, ),...,(,, ) M1 1 1 M 2 2 2 M k k k otrzymujemy parametry populacyjne postaci: MESOR M k k k 1 ˆ 1 ˆ 1 M ; ; ˆ k k k i i i i 1 i 1 i 1 amplituda A 2 2 akrofaza arctan

DESKRYPTORY W DZIEDZINIE CZASU

DESKRYPTORY W DZIEDZINIE CZASU

DESKRYPTORY W DZIEDZINIE CZASU

DESKRYPTORY W DZIEDZINIE CZASU

ANALIZA W DZIEDZINIE CZĘSTOTLIWOŚCI

65 55 SAYERS MODEL OF HEART RATE PSD BLOOD PRESSURE DYNAMIC CONTROL AMPLITUDE 45 BODY TEMPERATURE DYNAMIC CONTROL 35 25 15 RESPIRATORY MOVEMENTS 5-5

DESKRYPTORY W DZIEDZINIE CZĘSTOTLIWOŚCI

WYNIKI ANALIZY W DZIEDZINIE CZĘSTOTLIWOŚCI

DESKRYPTORY W DZIEDZINIE CZĘSTOTLIWOŚCI

ANALIZA SYGNAŁU W DZIEDZINIE CZĘSTOTLIWOŚCI METODY OPARTE NA FFT

ZALETY: NAJBARDZIEJ ROZPOWSZECHNIONA TECHNIKA UZYSKIWANIA WIDM (DOBRZE ZNANE I EFEKTYWNE OBLICZENIOWO ALGORYTMY) ŁATWA INTERPRETACJA UZYSKANYCH WYNIKÓW WADY: WŁAŚCIWOŚCI METOD FFT SILNA ZALEŻNOŚĆ ROZDZIELCZOŚCI CZĘSTOTLIWOŚCIOWEJ OD DŁUGOŚCI SYGNAŁU STOSUJE SIĘ WYŁĄCZNIE DO SYGNAŁÓW STACJONARNYCH SŁABA REDUKCJA LICZBY DANYCH WEJŚCIOWYCH (KLASYFIKACJA STATYSTYCZNA I INNE METODY ANALIZY) NISKA STABILNOŚĆ STATYSTYCZNA UZYSKANYCH ESTYMAT WIDMA MOCY LICZBA PRÓBEK MUSI BYĆ POTĘGĄ LICZBY 2

ANALIZA SYGNAŁU W DZIEDZINIE CZĘSTOTLIWOŚCI METODY OPARTE NA TECHNIKACH PARAMETRYCZNYCH

WŁAŚCIWOŚCI METOD PARAMETRYCZNYCH ZALETY WIDMO SYGNAŁU JEST GŁADKIE I STABILNE UZYSKUJE SIĘ MAŁĄ LICZBĘ PARAMETRÓW (JEST ONA NIEZALEŻNA OD DŁUGOŚCI SYGNAŁU) OPISUJĄCĄ W SPOSÓB JEDNOZNACZNY WIDMO ROZDZIELCZOŚĆ CZĘSTOTLIWOŚCIOWA JEST O KILKA RZĘDÓW WIELKOŚCI LEPSZA NIŻ W PRZYPADKU TECHNIK FFT NAWET DLA BARDZO KRÓTKICH SYGNAŁÓW WADY ZŁOŻONY ALGORYTM OBLICZENIOWY MOŻLIWOŚĆ ANALIZOWANIA SYGNAŁÓW WYŁĄCZNIE QUASI STACJONARNYCH PROBLEM WYBORU TYPU MODELU ORAZ PRAWIDŁOWE OSZACOWANIE JEGO RZĘDU

FHR W RÓŻNYCH STANACH ZACHOWANIA 180 170 SPOCZYNEK RUCHY CIAŁA 160 150 140 CZĘSTOŚĆ UDERZEŃ SERCA 130 120 0 100 200 300 400 500 CZAS (SEKUNDY)

ANALIZA W POŁĄCZONEJ DZIEDZINIE CZASU I CZĘSTOTLIWOŚCI

DESKRYPTORY W POŁĄCZONEJ DZIEDZINIE CZASU I ZĘSTOTLIWOŚCI

INSTANTANEOUS PSD (PHASE 1)

INSTANTANEOUS PSD (PHASE 2)

INSTANTANEOUS PSD (PHASE 3)

AVERAGED PSD

60.00 40.00 20.00 0.0 0 20.00 40.00 0.0 0 50.00 100.00

SKŁADOWE JEDNOCZESNE

KOLEJNO WYSTĘPUJĄCE SKŁADOWE

JTFA - ALGORYTM ADAPTACYJNY

ZAWARTOŚĆ INFORMACYJNA JTFA CZY SYGNAŁ MA STRUKTURĘ PROSTĄ CZY ZŁOŻONĄ JAKI JEST ZAKRES CZĘSTOTLIWOŚCI WYSTĘPUJĄCYCH W BADANYM SYGNALE CZY I W JAKI SPOSÓB CZĘSTOTLIWOŚCI ZMIENIAJĄ SIĘ W CZASIE JAKA MOC ZWIĄZANA JEST Z POSZCZEGÓLNYMI SKŁADOWYMI CZĘSTOTLIWOŚCIOWYMI

ŹRÓDŁA ZAKŁÓCEŃ ZAKŁÓCENIA CYKLICZNE (WĄSKOPASMOWE)

ŹRÓDŁA ZAKŁÓCEŃ ZAKŁÓCENIA NIECYKLICZNE (SZEROKOPASMOWE)

USUWANIE ZAKŁÓCEŃ CYKLICZNYCH FILTRY CYFROWE

USUWANIE ZAKŁÓCEŃ CYKLICZNYCH TRANSFORMATA FALKOWA DAUBECHIE6

PORÓWNANIE WYNIKÓW FILTRACJI

USUWANIE SZUMU SZEROKOPASMOWEGO METODĄ UWT (undecimated wavelet transform)

WYNIK FILTRACJI UWT

DETEKCJA KOMPLEKSÓW QRS METODĄ ANALIZY WIELOROZDZIELCZEJ OPARTEJ NA DWT

WYNIK ANALIZY WIELOROZDZIELCZEJ

Częstość uderzeń serca płodu - FHR EKG US FHR [ bpm] 60000 TRR [ ms] Obwiednia US

Metodyka Klasyczna analiza czynności skurczowej macicy analiza sygnału TOCO w dziedzinie czasu Detekcja skurczu 1. Wyznaczenie tonu podstawowego - TP 2. Określenie progu detekcji - PD 3. Detekcja wychyleń krzywej skurczowej powyżej progu detekcji 4. Klasyfikacja wychylenia jako skurczu jeśli spełnione są kryteria amplitudy oraz czasu trwania wychylenia Wyznaczenie podstawowych parametrów skurczu TOCO Amplituda Amplituda > 20 Czas trwania > 30 sek Powierzchnia Próg detekcji Czas max Czas rozpoczęcia Czas trwania Ton podstawowy Czas

Metodyka Analiza sygnału TOCO w dziedzinie czasu Surowy TOCO Filtracja dolnoprzepustowa 0,04 Hz Okno: szer. 5 min krok 1 min Histogram Wartość modalna = Próbka tonu podstawowego Ton podstawowy + 10 = Próg detekcji

KLASYFIKACJA DANYCH DIAGNOSTYCZNYCH METODY STATYSTYCZNE METODY SZTUCZNEJ INTELIGENCJI

METODY STATYSTYCZNE ANALIZA OPISOWA TESTOWANIE HIPOTEZ KORELACJA I REGRESJA METODY MODELOWANIA STATYSTYCZNEGO

METODY SZTUCZNEJ INTELIGENCJI SZTUCZNE SIECI NEURONOWE TEORIA ZBIORÓW ROZMYTYCH TEORIA ZBIORÓW PRZYBLIŻONYCH

DZIĘKUJĘ PAŃSTWU ZA UWAGĘ