NIEZNANA STRUKTURA H 18

HTML
DOWNLOAD

Wielkość: px

Rozpocząć pokaz od strony:

Download "NIEZNANA STRUKTURA H 18"

Sabina Nawrocka
7 lat temu
Przeglądów:

2 NIEZNANA STRUKTURA N 3 N 3 N 3 Me Me Me Ph I I 2, K 3 P 4, 50 o C,C 2 Cl X? Ph I Ph Analiza elementarna i MS C IN 1, 13 C NMR 2D NMR CSY, SQC, 13 C MBC, 15 N MBC, NESY spektroskopia IR X ray BRAK G. Kummerlowe, B. Crone, M. Kretschmer, S. F. Kirsch and B. Luy, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50,

3 NMR W RZTWRZE Parametry NMR wykorzystywane do określania struktury cząsteczki (w roztworze): przesunięcie chemiczne δ stałe sprzężenia skalarnego 3 J, 1 J C, 2 J C efekty NE (RE) Parametr NIEWYKRZYSTYWANY m in. dipolarna stała sprzężenia D

4 Co to jest dipolarna stała sprzężenia i jak przejawia się w widmach NMR? G. Kummerlowe, B. Crone, M. Kretschmer, S. F. Kirsch and B. Luy, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, Ch. M. Thiele, Eur. J. rg. Chem. 2008, G. Kummerlowe, B. Luy, A.W. Graham, Annual Reports on NMR Spectr., 68, 2009,

5 RDCs Kąt magiczny CP MAS NMR NMR w roztworze = 54.7 o => D IS = 0 NMR w ciele stałym Uśrednione oddziaływanie dipolarne subtelna struktura NMR Dipolarne stałe sprzężenia rzędu kz silnie poszerzone sygnały RESZTKWE DIPLARNE STAŁE SPRZĘŻENIA RDC M. Potrzebowski, A. Jeziorna, S. Kaźmierski, Concepts in Magnetic Resonance Part A, 2008 Ch.M. Thiele and Stefan Berger, rg. Lett., Vol. 5, No. 5, 2003,

6 RDCs a struktura Ch. M. Thiele, Eur. J. rg. Chem. 2008,

7 WARUNKI WYKRZYSTANIA RDCS D KREŚLANIA STRUKTURY CZĄSTECZKI: 1. RDC J należy dobrać odpowiednie MEDIUM 2. Pomiar RDCs odpowiednie SEKWENCJE NMR 3. INTERPRETACJA: dane eksperymentalne struktura ZASTSWANIE RDCS i.knstytucja ii.knfiguracja

8 KNSTYTUCJA C IN 1, 13 C NMR CSY, SQC N 3 Me N 3 N 3 Me I 2, K 3 P 4, 50 o C,C 2 Cl X? Me 13 C MBC (63 korelacje!) 15 N MBC (7 korelacji!) Ph I Ph I Ph 1,1 ADEQUATE 11 FRAGMENTÓW 6 FRAGMENTÓW G.Kummerlowe, B. Crone, M. Kretschmer, S.F. Kirsch and B. Luy, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50,

9 KNSTYTUCJA G.Kummerlowe, B. Crone, M. Kretschmer, S.F. Kirsch and B. Luy, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50,

10 KNSTYTUCJA G.Kummerlowe, B. Crone, M. Kretschmer, S.F. Kirsch and B. Luy, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50,

11 KNSTYTUCJA N C 2 Et Br 1. tbuli 2. AcCl N CMe C 2 Me? Me N + Cu N + N + N N

12 BRAK EFEKTÓW NE; PRBLEMY Z KREŚLENIEM KNFIGURACJI R R N N R R R R Me N N Bn Bn Bn Bn Bn Bn N Bn N N TBDS R R R N Ph Ph

13 MENTL D calc = D obs 0.02z R (2) = L. Verdier, P. Sakhaii, M. Zweckstetter and C. Griesinger, Communication / Journal of Magnetic Resonance 163, 2003,

14 MENTL ax eq D calc = D obs 0.02z R (2) = D calc = 0.72D obs + 0.1z R (2) = D calc = 0.88D obs z R (2) = L. Verdier, P. Sakhaii, M. Zweckstetter and C. Griesinger, Communication / Journal of Magnetic Resonance 163, 2003,

15 DIYDRPIRYDN N Ph Ph Ph N Ph Ch. Aroulanda, V. Boucard, F. Guibe, J. Courtieu and D. Merlet, Chem. Eur. J. 2003, 9,

16 PCDNA GLUKZY J. Yan, A.D. Kline,. Mo, M. J. Shapiro and E. R. Zartler, J. rg. Chem. 2003, 68,

17 IS α ACID cis trans D. Intelmann, G. Kummerlowe, G. aseleu, N. Desmer, K. Schulze, R. Frohlich,. Frank, B. Luy, T. ofmann, Chem. Eur. J. 2009, 15,

18 IS α ACID Acknowledgements We are grateful to the Bitburger brewery (Germany) for their financial support and for providing beer samples. D. Intelmann, G. Kummerlowe, G. aseleu, N. Desmer, K. Schulze, R. Frohlich,. Frank, B. Luy, T. ofmann, Chem. Eur. J. 2009, 15,

19 N Me Strychnina N Me Me Sferopsydyna A Norbornen Pochodna 2 N glutaminianu F Ludartin Spiroinden Na + Sól sodowa kwasu cholowego Me Me Me Ibuprofen Archazolid A N N S Ac Ac Ac N N 2 N Ac Sagittamid A Ac Ac C Butyrolakton

20 WARUNKI WYKRZYSTANIA RDCS D KREŚLANIA STRUKTURY CZĄSTECZKI: 1. RDC J należy dobrać odpowiednie MEDIUM 2. Pomiar RDCs odpowiednie SEKWENCJE NMR 3. INTERPRETACJA: dane eksperymentalne struktura

21 Poly benzyl L glutamate (PBLG) B. Luy. Journal of the Indian Institute of Science 2010, 90(1),

1002/cmr.a, 65 80 Ch. M. Thiele, Eur. J. rg. Chem.

22 MEDIUM: ŻELE I CIEKŁE KRYSZTAŁY Ch. M. Thiele, Concepts in Magnetic Resonance Part A, 2006, DI /cmr.a, Ch. M. Thiele, Eur. J. rg. Chem. 2008, G. Kummerlowe, B. Luy, Trends in Analitycal Chemistry, 28, 2009,

23 2 NMR, KNTRLA PRÓBKI 13 C 1D Strychnina w PBLG: zbyt duże uporządkowanie; artefakty z Ch. Thiele und S. Berger, rg. Lett. 2003, 5, 705 De Lange et al., Chem. Phys. Lett. 441, 2007, 342

24 2 NMR, KNTRLA PRÓBKI Ch. M. Thiele, Concepts in Magnetic Resonance Part A, 2006, 65 80

25 2. MŻLIWŚCI ZMIERZENIA RDCS DPWIEDNIE SEKWENCJE NMR Do analizy RDCs wykorzystuje się 1 D C 2 D C 2 D 1 D N i inne dostępne stałe sprzężenia WADY: poszerzenie sygnałów sprzężenia z wieloma protonami niska czułość długi czas akwizycji

26 PRBLEM FAZY SQC Delay for 1 J C =150z Delay for 1 J C =100z A. Enthart, J.Ch. Freudenberger, J. Furrer,. Kessler, B. Luy, J. Magn. Reson. 192, 2008,

27 A. Enthart, J.Ch. Freudenberger, J. Furrer,. Kessler, B. Luy, J. Magn. Reson. 192, 2008, RDCs NMR PRBLEM FAZY SQC CLIP SQC SQC

28 SQC Fragment korelacji 1 13 C SQC strychniny w CDCl 3 i w PS żelu/cdcl3. Ze śladu dla 13 C przy 37.8 ppm można łatwo odczytać 1 J C + 1 D C K. Kobzar, PhD thesis ptimal Control, Partial Alignment and More: The Design f Novel Tools for NMR Spectroscopy of Small Molecules, 2007

29 INTERPRETACJA WARUNKI WYKRZYSTANIA RDCS D KREŚLANIA STRUKTURY CZĄSTECZKI: 1. RDC J należy dobrać odpowiednie MEDIUM 2. Pomiar RDCs odpowiednie SEKWENCJE NMR 3. INTERPRETACJA: dane eksperymentalne struktura

30 INTERPRETACJA M. Zweckstetter, Nature Protocols, 3, 2008, Ch. M. Thiele, Concepts in Magnetic Resonance Part A, 2006, 65 80

31 1 J C +2 1 D C 1 J C

32 It is just a matter of time before the use of RDCs will become an everyday laboratory technique for the routine determination of the constitution, configuration, and conformation of small organic molecules. R.R. Gil, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50,

36 Bo Bo (t) z L y L x L i r (t) j z i y x r j P z P Px Py Pz P x P y P is the Probability Tensor

37 Lyotropic Liquid Crystalline Solutions of omopolypeptides in rganic Solvents Weak Alignment Media The first compound to be aligned in NMR was a SMALL MLECULE It was in 1963, it was BENZENE Physical Review Letter 1963, 11, NMR Spectrum of benzene in nematic solution Very strong alignment

38 N 3 N 3 N 3 Me Me I 2, K 3 P 4, 50,C 2 Cl X? Me Ph I I 1 Ph 2 Ph 3 4

39 Spiroinden RDCs dwa tensory dla dwóch diastereoizomerów 12 out of 16 possible experimental DC couplings Figure 2. Top: Structures of the two possible diastereomers of 1. The RDCs determined in a PDMS/CDCl3 gel are color coded to the structures (red, negative RDCs; blue, positive RDCs; green, no RDCs or RDCs not used in analysis). The axis systems to the left of each structure represent the corresponding alignment tensors. Bottom: Correspondence of experimental, vs back calculated RDC values for structures 1a and 1b. J. Christoph Freudenberger, Peter Spiteller, Reinhard Bauer, orst Kessler, and Burkhard Luy, J. AM. CEM. SC. 2004, 126,

40 P Gels Polyacrylamide based gels(pam) Aligning matrix compatible with DMS, DMF and Water 1 NMR spectra (400 Mz, 298 K) of (+) menthol in a) DMS, b) P gel/dms, and c) PBLG/CDCl 3. P. aberz, J. Farjon, C. Griesinger. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, Corrigenda: Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46,

41 Gel Stretching Apparatus silicone tube + gelatin gel stretched inside NMR tube P.W. Kuchel P.W. Kuchel et al., J. Magn. Reson. 180, 256 (2006) G. Kummerlöwe, F. albach, B. Luy, The pen Spectrosc. J. 2, 29 (2008)

Podobne dokumenty

Impulsy selektywne selektywne wzbudzenie

Impulsy selektywne selektywne wzbudzenie Impuls prostokątny o długości rzędu mikrosekund ( hard ): cały zakres 1 ( 13 C) Fala ciągła (impuls o nieskończonej długości): jedna częstość o Impuls prostokątny