Mutacje w genie kodującym białko sialofosforowe zębiny (DSPP) nie zawsze skutkujące fenotypem dentinogenesis imperfecta typu II bądź dysplazją zębiny*
|
|
- Stanisław Biernacki
- 6 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 PROTET. STOMATOL., 2013, LXIII, 1, 5-13 Mutacje w genie kodującym białko sialofosforowe zębiny (DSPP) nie zawsze skutkujące fenotypem dentinogenesis imperfecta typu II bądź dysplazją zębiny* Mutations in the DSPP coding sequence not always resulting in the phenotype of dentinogenesis imperfecta type II or dentin dysplasia Izabela Maciejewska 1, Paulina Bautembach-Koberda 1, Agnieszka Maciejewska 2, Ryszard Pawłowski 2 1 Katedra i Zakład Protetyki Stomatologicznej Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego Kierownik: dr hab. Z. Bereznowski, prof. nadzw. GUMed 2 Katedra i Zakład Medycyny Sądowej Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego Kierownik: dr hab. Z. Jankowski HASŁA INDEKSOWE: DSPP, analiza molekularna, dentinogenesis imperfecta typu II, dysplazja zębiny KEY WORDS: DSPP, molecular analysis, dentinogenesis imperfecta type II, dentin dysplasia Streszczenie Wprowadzenie. Dentinogenesis imperfecta typu II (DGI) oraz dysplazja zębiny (DD) są rzadkimi, izolowanymi wrodzonymi wadami rozwojowymi polegającymi na nieprawidłowym formowaniu zębiny zarówno w zębach mlecznych jak i stałych. Poza istotną zmianą koloru zębów dochodzi do ich szybkiego starcia, a następnie utraty. Leczenie zachowawcze jak i protetyczne pacjentów chorujących na DGI/DD niejednokrotnie jest nieskuteczne. Przy planowaniu leczenia pacjentów z DGI/DD niezbędnym jest potwierdzenie rozpoznania metodami diagnostyki molekularnej. Za fenotyp DGI/DD odpowiedzialne są mutacje w genie DSPP, który wykazuje wysoki stopień polimorfizmu oraz posiada długie sekwencje repetywne, co utrudnia jego sekwencjonowanie. Cel pracy. Analiza molekularna genu DSPP u przypadkowych osób nie wykazujących cech klinicznych fenotypu dentinogenesis imperfecta typu II bądź dysplazji zębiny. Summary Introduction. Both Dentinogenesis imperfecta (DGI) type II and dentin dysplasia (DD) are classified as infrequent, hereditary dentin disorders, resulting in the abnormal dentin formation of deciduous and permanent teeth. The phenotype DGI/DD is manifested by significant discoloration and rapid teeth abrasion, potentially leading to edentulism. Due to severely disordered anatomy of the pulp chamber and root canals, including shortened roots, the treatment of patients diagnosed with DGI/DD must start in youth and last a lifetime. However, it happens quite often that neither conservative nor prosthetic treatment in this group of patients brings about satisfactory results. Therefore, in planning the long-term treatment molecular diagnostic methods should be used to confirm preliminary diagnosis. The phenotype of DGI/DD reflects mutations in DSPP gene, which is highly polymorphic and has long repetitive sequence. This makes the DSPP analysis *Praca finansowana z grantu nr. N N IM. 5
2 I. Maciejewska i inni Materiał i metoda. Do analizy użyto DNA 10 probantów bez cech klinicznych dentinogenesis imperfecta typu II i/lub dysplazji zębiny. Wyniki. Analiza molekularna sekwencji genu DSPP u 10 przypadkowych probantów wykazała obecność 40 mutacji o charakterze SNP oraz 4 delecje bez zmiany odczytu sekwencji kodu genetycznego. W 10 przypadkach stwierdzono mutacje skutkujące zmianą kodowania sekwencji białka DSPP. W dziewięciu przypadkach zmiana kodowania sekwencji dotyczyła jednego z alleli, co pozwala wnioskować, że brak fenotypu był spowodowany powstawaniem funkcyjnego białka z jednego, zdrowego allela. W jednym przypadku stwierdzono zamianę kodu genetycznego w obydwu allelach. Wnioski. Diagnostyka molekularna sekwencji genu DSPP jednoznacznie potwierdza obecność mutacji skutkującej fenotypem DGI/DD, co ułatwia długoterminowe planowanie leczenia. Jednak istnieją mutacje, które nie powodują powstania fenotypu, dlatego celem lepszego poznania przyczyn dentinogenesis imperfecta typu II zasadnym wydaje się kontynuacja badań molekularnych. very challenging. Aim of the study. To analyse the coding sequence of DSPP in unrelated probants who do not present any clinical symptoms of DGI/DD. Material and methods. DNA of ten randomly selected probants was analysed by sequencing the DSPP gene. Results. The molecular analysis of ten randomly selected unrelated probants showed 40 SNP mutations and four deletions, which did not change the code reading. In the additional ten cases, SNP mutations resulted in the change of genetic code for a specific aminoacids; nine of them were classified as haplotypes since one allele coded the reference sequence and another allele coded the mutated codon. In one case the mutated codon appeared in both alleles. Conclusions. Our experiment proved that not every mutation in the DSPP gene results in phenotype of DGI/DD. Wstęp Dentinogenesis imperfecta typu II (DGI) (OMIM ) oraz dysplazja zębiny (DD) są izolowanymi wrodzonymi wadami rozwojowymi polegającymi na nieprawidłowym formowaniu zębiny zarówno w zębach mlecznych jak i stałych. Pomimo, iż DGI/DD należą do tzw. rzadkich wad rozwojowych, gdyż pojawiają się z częstotliwością 1:8000 żywych urodzeń (1, 2), to dla pacjentów obciążonych fenotypem, DGI/DD stanowią problem, z którym zmagają się przez całe życie. W ostatnim czasie zwrócono uwagę, iż dentinogenesis imperfecta typu II oraz dysplazja zębiny zostały pierwotnie sklasyfikowane jedynie na podstawie różnic w fenotypie, bez dogłębnej analizy molekularnej czynników genetycznych odpowiedzialnych za wystąpienie obu wad, podczas gdy obecnie dostępne metody badawcze związane z diagnostyką molekularną pozwalają przypuszczać, iż DGI oraz DD są jedną wadą rozwojową przejawiającą różny stopnień penetracji (3, 4). Fenotyp dentinogenesis imperfecta typu II objawia się opalizująco żółtym, błękitnym bądź bursztynowym zabarwieniem zębiny będącym bezpośrednim efektem zaburzeń procesu mineralizacji. W konsekwencji dochodzi do zmniejszenia właściwości amortyzacyjnych zębiny, co pomimo prawidłowej budowy pokrywającego ją szkliwa skutkuje jego intensywnym odpryskiwaniem, odsłonięciem zębiny na dużej powierzchni i następczym szybkim ścieraniem zębów. W skrajnych 6 PROTETYKA STOMATOLOGICZNA, 2013, LXIII, 1
3 Dentinogenesis imperfecta mutacje genowe przypadkach w dwa lata może dojść do starcia zębów do brzegu wyrostka zębodołowego. W badaniu klinicznym zęby maja kształt beczułkowaty, natomiast w badaniu radiologicznym wykazują zwężenie obwodu szyjek zębowych oraz obliterację komór zęba i kanałów korzeniowych (5, 6). Cechą charakterystyczną obrazu DGI jest także skrócenie i zwężenie korzeni zębów. Zbliżone cechy obserwowane są u osób z dysplazją zębiny, jednak dotyczą one głównie uzębienia mlecznego, podczas gdy uzębienie stałe wykazuje jedynie niewielkie zmiany koloru zębów bez zaznaczonych cech morfologiczno-histologicznych z wyjątkiem częściej występujących zębiniaków (7, 4, 6). Z powodu nieprawidłowej mineralizacji zębiny, a tym samym osłabienia jej funkcji ochronnych w stosunku do miazgi zęba, w zębach pacjentów obciążonych DGI typu II dochodzi do częstych powikłań w postaci zapaleń miazgi z następczym zapaleniem tkanek okołowierzchołkowych. Obliteracja komór miazgi i kanałów korzeniowych, liczne zębiniaki oraz skrajnie zaburzona anatomia korzeni zębów nie pozwalają zarówno na skuteczne leczenie zachowawcze jak i endodontyczne zębów z fenotypem DGI/DD, dlatego pacjenci wykazujący cechy kliniczne DGI/ DD od wczesnych lat życia wymagają interwencji protetycznej, początkowo w zakresie protetyki stałej, a w krótkim czasie protetyki ruchomej. Zastosowanie stałych uzupełnień protetycznych w postaci wkładów koronowo-korzeniowych, koron czy mostów protetycznych jest często niemożliwe ze względu na znaczące skrócenie korzeni zębów, a tym samym brak możliwości uzyskania właściwego stosunku długości części korzeniowej do części koronowej planowanego uzupełnienia. Natomiast szybkie starcie koron zębów z jednoczesnym zaburzeniem płaszczyzny zgryzowej nie pozwala na uzyskanie retencji wystarczającej dla utrzymania samodzielnych koron protetycznych. Uwzględniając dodatkowo młodociany wiek pacjentów nasuwa się wniosek potwierdzony własnymi obserwacjami, że niejednokrotnie około 25 roku życia pacjenci z fenotypem dentinogenesis imperfecta typu II użytkują już protezy całkowite. Różny stopień penetracji wady o charakterze DGI/DD może być mylnie diagnozowany jako próchnica kwitnąca lub zaburzenie mineralizacji szkliwa o charakterze hipoplazji. Jednak przez wzgląd na znacząco różne rokowanie związane z fenotypem DGI/DD istotnym wydaje się postawienie precyzyjnego rozpoznania potwierdzonego badaniem z użyciem metod diagnostyki molekularnej. Cel pracy Celem niniejszej pracy jest zaprezentowanie mutacji w genie DSPP wykrytych w grupie przypadkowych osób, u których nie występowała żadna z cech fenotypu o charakterze DGI/DD. Materiał i metody Materiał badawczy stanowił DNA pochodzący od 10 niespokrewnionych osób (20 alleli), obojga płci, przebadanych w projekcie mającym na celu znalezienie mutacji przyczynowej fenotypu dentinogenesis imperfecta typu II i/ lub dysplazji zębiny. W badaniu klinicznym u żadnego z badanych nie stwierdzono ani jednej cechy fenotypu dentinogenesis imperfecta typu II i/lub dysplazji zębiny. DNA pobierano od pacjentów z użyciem sterylnych wymazówek poprzez pocieranie błony śluzowej policzków i warg. Standardowa izolacja DNA Materiał genetyczny izolowano klasyczną metodą organiczną z zastosowaniem proteinazy K oraz ekstrakcją zbuforowaną mieszaniną fenol chloroform alkohol izoamylowy wg metody Sambrooka i wsp. (8). Próbki PROTETYKA STOMATOLOGICZNA, 2013, LXIII, 1 7
4 I. Maciejewska i inni oczyszczano, zagęszczano, a następnie mierzono stężenie DNA przy użyciu standardowej metody fluorymetrycznej DNA z wykorzystaniem aparatu Fluoroskan Ascent FL oraz barwnika PicoGreen. Amplifikacja fragmentów genu DSPP Amplifikacja poszczególnych eksonów DSPP (eksony 1, 2, 3, 4.1, 4.2, 5.1, 5.2) prowadzona była z zastosowaniem sekwencji starterów opisanych przez McKnight i wsp. (9) natomiast eksony 5.4, 5.5 i 5.6 amplifikowano stosując startery opisane przez Bai i wsp. (10). Reakcję PCR prowadzono w termocyklerach firmy Perkin Elemer z serii Celem sprawdzenia poprawności procesu amplifikacji produkty rozdzielano elektroforetycznie w 2,6% żelu agarozowym w buforze TBE, a następnie wybarwiano fluorescencyjnym barwnikiem interkalującym SybrGreen. Kolejno produkty amplifikacji poddawano oczyszczaniu ze składników mieszaniny reakcyjnej PCR oraz soli z wykorzystaniem mikrokolumienek Microcon 100 (Millipore, USA) lub przy użyciu zestawu ExoSap (USB, USA). Sekwencjonowanie produktów amplifikacji Powielone fragmenty poddano sekwencjonowaniu metodą cyklicznego sekwencjonowania ze znakowanymi fluorescencyjnie terminatorami, wykorzystując komercyjnie dostępny zestaw firmy Applied Biosystems, BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit v Reakcję sekwencjonowania amplikonów prowadzono dla obu nici DNA. Następnie produkty reakcji sekwencjonowania zostały poddane elektroforezie kapilarnej wykorzystując do tego celu dwa automatyczne analizatory DNA typu ABI Prism 310 oraz Urządzenia te pracują w oparciu o metodę elektroforezy kapilarnej rozdziału fragmentów DNA oraz metodę laserowo wzbudzanej fluorescencji, która służy detekcji znakowanych fluorescencyjnie cząsteczek DNA. Uzyskane wyniki analizowano przy pomocy oprogramowania ABI PRISM Sequencing Analysis Software 5.2. Dodatkowo każda uzyskana sekwencja została sprawdzona metodą manualną pod kątem poprawności odczytów poszczególnych nukleotydów. Uzyskane sekwencje importowano i analizowano za pomocą programu Sequence Navigator 2.5 umożliwiającego porównywanie uzyskanych sekwencji do sekwencji referencyjnej. Do oceny istotności oznaczonych mutacji użyto bazy danych Ensembl. (www. ensembl.com). Celem potwierdzenia uzyskanych wyników każde badanie wykonano trzykrotnie. Wyniki Analiza sekwencji DNA w zakresie genu DSPP wykazała obecność mutacji zarówno w sekwencji kodującej białko DSP jak i DPP (tab. I). Ponadto w sekwencji kodującej białko DSP wykryto 2 mutacje typu SNP o cechach polimorfizmu polegające na zamianie ostatniego nukleotydu w sekwencji kodonu. W sekwencji kodującej białko DPP tego samego typu polimorfizm wykryto w 38 kodonach zlokalizowanych w eksonie 5. Poza polimorfizmem o charakterze SNP u czterech z badanych osób (40%) wykryto polimorfizm polegający na delecjach fragmentów DNA w obrębie eksonu 5 w zakresie sekwencji kodującej białko DPP. Wykryte delecje dotyczyły fragmentów odpowiednio: u dwóch osób 75 nukleotydowej (g ), u jednej osoby 22 nukleotydowej (g ) oraz u jednej osoby 171 nukleotydowej (g ). Wszystkie delecje dotyczyły całych kodonów (były podzielne przez 3) i nie powodowały przesunięcia ramki odczytu. Dyskusja DGI/DD spowodowane są mutacją w genie DSPP kodującym główne, niekolagenowe 8 PROTETYKA STOMATOLOGICZNA, 2013, LXIII, 1
5 Dentinogenesis imperfecta mutacje genowe T a b e l a I. Mutacje w obrębie sekwencji kodujących białka DSP i DPP Mutacje w sekwencji kodującej DSP 33,3% Rodzaj mutacji ddna g.235a>t lub A/T Odsetek osob z mutacja polimorfizmem Aminokwas Sekwencja Ekson Haplotyp* Arg>Try CCA>TCA Ekson 4 1/2 20% g.2006a>g Lys>Arg AAA>AGA Ekson % g.2024a>a/g Asp>Gly GAC>GGC Ekson % g.3567c>c/t Glu>Asp GAC> GAT Ekson 5 2 Mutacje w sekwencji kodującej DPP 20% 50% 50% g.3568a>a/g Ser>Gly AGC>GGC Ekson 5 2 g.3598a>t (A/T) g.3615c>a (C/A) Ser>Cys AGT>TGT Ekson 5 1/2 Ser>Arg AGC>AGA Ekson 5 1/2 33,3% g.3728a>g (A/G) Asp>Gly GAT>GGT Ekson 5 1/2 10% g.3768c>c/a Ser>Arg AGC>AGA Ekson ,3% g.3805a>a/t Ser>Gly AGT>TGT Ekson 5 2 * 1 grupa z mutacją w obydwu allelach, ½ grupa z mutacją w obydwu allelach lub jednym z alleli, 2 grupa z mutacją w jednym z alleli. białko organicznej macierzy zębiny, które jest odpowiedzialne za proces nukleacji, a następnie wzrostu kryształów hydroksyapatytów zębiny. Ludzkie białko DSPP składa się z 1301 aminokwasów (aa) i natychmiast po translacji podlega modyfikacjom polegającym na przecięciu białka macierzystego na białka potomne o różnych właściwościach biochemicznych (11, 12). Pierwsze białko pochodne DSP powstaje z aa (13). Pomimo, iż struktura DSP była bardzo szczegółowo badana to rola białka w mineralizacji zębiny nie została dotąd precyzyjnie określona, jednak fosforylacja oraz glikozylacja DSP sugeruje, iż pośredniczy ono w procesie mineralizacji zębiny oraz konwersji prezębiny w zębinę (14-17). Sekwencja drugiego białka potomnego zwanego DPP liczy około 500 aminokwasów. (4, 13, 18, 19). Wysoka zawartość reszt kwasu asparaginowego, glutaminowego oraz seryny nadaje białku DPP silnie PROTETYKA STOMATOLOGICZNA, 2013, LXIII, 1 9
6 I. Maciejewska i inni hydrofilny oraz kwaśny charakter, co bezpośrednio wpływa na jego funkcję promineralizacyjną. Duża ilość reszt seryny ulega bowiem fosforylacji, a budowa przestrzenna DPP sprawia, że rdzeń białka tworzy strukturę przypominającą wstęgę, na obrzeżach której gromadzą się grupy fosforanowe, co w konsekwencji ułatwia wiązanie wolnych jonów wapniowych znajdujących się w otaczającym środowisku (20). Ciekawym pozostaje fakt, iż DPP działa promineralizująco jedynie w niskich stężeniach, podczas gdy wysokie stężenia białka hamują mineralizację, zapobiegając tym samym hipermineralizacji zębiny (15, 21, 22). Gen kodujący DSPP liczy 8343 pary zasad, zlokalizowany jest na chromosomie 4q22.1 i składa się z 5 eksonów i 4 intronów (15). Pierwszy ekson genu DSPP jest eksonem niekodującym, natomiast ekson drugi koduje sekwencję peptydu sygnalizacyjnego oraz trzech pierwszych aminokwasów białka DSP. Sekwencja DSP jest kodowana w eksonie trzecim i czwartym oraz w niewielkiej ilości w eksonie piątym, podczas gdy całość sekwencji białka DPP kodowana jest w eksonie piątym i wykazuje wysoki stopień polimorfizmu (3, 9, 23, 24). Badania naukowe wskazują jednoznacznie, że za powstanie fenotypu DGI/DD odpowiedzialne są wyłącznie mutacje występujące w genie DSPP, jednak okazuje się, że nie każda mutacja powoduje powstanie wady wrodzonej, a dotychczas opisano jedynie około 30 mutacji przyczynowych. Jednak ku zaskoczeniu badaczy gen DSPP wykazuje duży stopień polimorfizmu, co objawia się faktem istnienia licznych odmienności (mutacji o charakterze SNP Single Nucleotide Polimorphism, oraz insercji i delecji bez przesunięcia ramki odczytu) w sekwencji DNA nie powodujących wystąpienia fenotypu DGI/DD. W prowadzonych w ramach obecnego projektu badaniach molekularnych kodu genetycznego sekwencji genu DSPP kodującego niekolagenowe białko zębiny DSPP stwierdzono obecność licznych mutacji typu SNP oraz delecji bez przesunięcia ramki odczytu. Fakt, iż u żadnej z przebadanych osób nie stwierdzono ani jednej cechy fenotypu o charakterze dentinogenesis imperfecta typu II bądź dysplazji zębiny, świadczy, że wykryte mutacje miały charakter polimorfizmu. Zgodnie z zasadami diagnostyki molekularnej za polimorfizm uznaje się mutację, która występuje co najmniej w 1% populacji i nie skutkuje powstaniem fenotypu jednostki chorobowej przypisywanej mutacjom w danym genie. Gen kodujący białko DSPP jest oceniany jako gen wysoce polimorficzny (4, 10, 15, 16). Szczególną uwagę zwrócono na liczne delecje sekwencji kodującej białko DPP w rejonie repetytywnych powtórzeń sekwencji SSD (seryna-seryna-kwas asparaginowy) (3, 22). Autorzy podkreślają, że w tym rejonie genu może dochodzić do utraty nawet 225 nukleotydów. W przypadku naszych pacjentów zaobserwowaliśmy utratę 171 nukleotydów u jednego z przebadanych pacjentów, przy czym podobnie jak to miało miejsce we wcześniejszych badaniach każda delecja dotyczyła całych kodonów, co w budowie białka skutkuje jedynie jego skróceniem, a nie zmianą odczytu kodu genetycznego. W konsekwencji mutacja taka pomimo, że dotyczy długiej sekwencji aminokwasowej (w tym przypadku wypadło 57 aminokwasów) nie powoduje zaburzeń w funkcjonowaniu białka i tym należy tłumaczyć brak cech klinicznych dentinogenesis imperfecta typu II lub dysplazji zębiny u przebadanych pacjentów. Nieco większe trudności sprawia wytłumaczenie braku fenotypu u osób, u których stwierdziliśmy mutacje typu SNP zarówno w sekwencji kodującej białko DSP jak i DPP. Przez wzgląd na degenerację kodu genetycznego zamiana ostatniego nukleotydu w kodonie, w znamienitej większości przypadków nie skutkuje zmianą kodowania aminokwasu. Wyjątkiem jest jedynie kodon ATG wybiórczo kodujący metioninę oraz kodon TGG kodujący 10 PROTETYKA STOMATOLOGICZNA, 2013, LXIII, 1
7 Dentinogenesis imperfecta mutacje genowe tryptofan. W naszych badaniach oznaczyliśmy łącznie czterdzieści przypadków zmiany trzeciego nukleotydu w kodonie, dwa w sekwencji kodującej białko DSP (ekson 4) oraz trzydzieści osiem w sekwencji kodującej białko DPP (ekson 5). Istotnym jednak wydaje się fakt, iż pomimo wykrycia 10 mutacji skutkujących zmianą kodowania pojedynczych aminokwasów, probanci nie posiadali cech fenotypu DGI/ DD. U dziewięciu badanych osób, z dużym prawdopodobieństwem należy rozważać fakt istnienia tzw. haplotypów. Oznacza to, że każdy z dwóch alleli koduje odmienną sekwencję danego kodonu, a brak fenotypu wynika z faktu, iż białko DSP/DPP aktywne w przestrzeni zewnątrzkomórkowej odontoblasta powstało z dominującego, zdrowego allela. Teorię tę potwierdzają również badania innych autorów (22, 25). Jednak na chwilę obecną trudno wytłumaczyć cztery przypadki mutacji, w których osoba badana posiadała zmieniony kod genetyczny w obu allelach (1 haplotyp), nie wykazując przy tym żadnych cech klinicznych dentinogenesis imperfecta typu II lub dysplazji zębiny. Mutacje w tym obszarze powinny powodować zmiany fenotypowe, jednak nie wiadomo na ile właśnie te, prowadzą do zmian w strukturze białka owocujących pojawieniem się cech fenotypowych charakterystycznych dla dentinogenesis imperfecta typu II. Omawianych mutacji jak dotąd nie zgłoszono również jako polimorfizmu w międzynarodowej bazie Ensembl. W dalszym ciągu nie wiadomo dlaczego mutacja jednego nukleotydu typu zmiana u niektórych pacjentów skutkuje fenotypem, a mutacja tego samego typu ale innego nukleotydu nie powoduje żadnych objawów klinicznych. Przyczyna prawdopodobnie tkwi w budowie białka kodowanego przez zmutowaną sekwencję. W przypadku zmiany aminokwasu kluczowego dla funkcji lub konformacji przestrzennej białka, fenotyp się pojawia, podczas gdy zamiana mniej ważnego aminokwasu w danym pokoleniu pozostaje tzw. mutacją utajoną i wykrywana jest przypadkowo jak to miało miejsce u naszych probantów. Jednak ogromne koszty jakie niesie za sobą leczenie stomatologiczne, a szczególnie protetyczne pacjentów z wadą dentinogensis imperfecta typu II oraz dysplazją zębiny powinno skłaniać do jak najbardziej skrupulatnego diagnozowania chorych i ich rodzin, celem jednoznacznego potwierdzenia rozpoznania oraz określenia prawdopodobieństwa dotknięcia tym schorzeniem przyszłych pokoleń. Diagnostyka molekularna sekwencji genu DSPP jednoznacznie potwierdza obecność mutacji skutkujących fenotypem DGI/DD, co ułatwia stworzenie długoplanowego, wielospecjalistycznego leczenia. Jednak poczynione w obecnej pracy obserwacje pozwalają wnioskować, że nie wszystkie mutacje w genie DSPP, powodują powstanie fenotypu, dlatego celem lepszego poznania przyczyn dentinogenesis imperfecta typu II zasadnym wydaje się kontynuacja, a nawet intensyfikacja badań molekularnych w zakresie sekwencji genu DSPP. Piśmiennictwo 1. Bixler D., Conneally P. M., Christen G.: Dentinogenesis imperfecta: genetic variations in a six-generation family. J. Dent. Res., 1969, 48: Witkop C. J., Maclean P. J., Schmidt J. L.: Medical and dental findings in the Brandywine isolate. Ala. J. Med. Sci., 1966, 3, Beattie M. L., Kim J. W., Gong S. G., Murdoch-Kinach C. A., Simmer J. P., Hu J. C.: Phenotypic variation in dentinogenesis imperfecta/dentin dysplasia linked to 4q21. J. Dent. Res., 2006, 85,3x Kim J. W., Simmer J. P.: Hereditary dentin defects. J. Dent. Res., 2007, 86, Acevedo A. C., Santos L. J., Paula L. M., Dong J., McDougall M.: Phenotype characterization and DSPP mutational analysis of three Brazilian dentinogenesis imperfecta PROTETYKA STOMATOLOGICZNA, 2013, LXIII, 1 11
8 I. Maciejewska i inni type II families. Cells Tissues Organs, 2009, 189, McDougall M., Dong J., Acevedo A. C.: Molecular basis of human dentin diseases. Am. J. Med. Genet., 2006, 140, Mcdonnell S. T., Mackie I., Dixon M. J.: Hereditary dentine disorders: dentinogenesis imperfecta and dentine dysplasia. Orphanet. J. Rare Dis., 2008, 3, Sambrook J., Fritsch E. F., Maniatis T.: Molecular Cloning: A laboratory manual, 2nd Edition. Cold Spring Harbor Press, New York, McKnight D. A., Hart P. S., Hart T. C., Hartsfield J. K., Wilson A., Wright J. T., Fisher L. W.: A comprehensive analysis of normal variation and disease-causing mutations in the human DSPP gene. Hum. Mutat., 2008, 29, Bai H., Agula H., Wu Q., Zhou W., Sun Y.: A novel DSPP mutation causes dentinogenesis imperfecta type II in a large Mongolian family. BMC Med. Genet., 2010, 11, von Marshall Z., Fisher L. W.: Dentin sialophosphoprotein (DSPP) is cleaved into its two natural dentin matrix products by three isoforms of bone morphogenetic protein-1 (BMP1). Matrix. Biol., 2010, 29, Suzuki S.: Dentin sialoprotein and dentin phosphoprotein have distinct roles in dentin mineralization. Matrix. Biol., 2009, 28, Yamakoshi Y., Hu J. C., Fukae M., Zhang H., Simmer J. P.: Dentin glycoprotein: the protein in the middle of the dentin sialophosphoprotein chimera. J. Biol. Chem., 2005, 280, Milan A. M., Sugars R.V., Embery G., Waddington R. J.: Modulation of collagen fibrillogenesis by dentinal proteoglycans. Calcif. Tissue Int., 2005, 76, McDoguall M., Simmons D., Luan X., Gu T. T., Dupont B. R.: Assignment of dentin sialophosphoprotein (DSPP) to the critical DGI 2 locus on human chromosome 4 band q21.3 by in situ hybridization. Cytogenet. Cell Genet., 1997, 79, Song Y., Wang C., Peng B., Ye X., Zhao G., Fan M., Fu Q., Bian Z.: Phenotypes and genotypes in 2 DGI families with different DSPP mutations. Oral Surgery Oral Medicine, Oral Pathology, Oral Radiolology and Endodontics, 2006, 102, Xiao S., Yu C., Chou X., Yuan W., Wang Y., Bu L., Fu G., Qian M., Yang J., Shi Y., Hu L., Han B., Wang Z., Huang W., Liu J., Chen Z., Zhao G., Kong X.: Dentinogenesis imperfecta 1 with or without progressive hearing loss is associated with distinct mutations in DSPP. Nat. Genet., 2001, 27, Nieminen P., Papagiannoulis-Lascarides L., Waltimo-Siren J., Ollila P., Karjalainen S., Arte S., Veerkamp J., Walton V., Kustner E. C., Siltanen T., Holappa H., Lukinmaa P. L., Alaluusua S.: Frameshift mutations in dentin phosphoprotein and dependence of dentin disease phenotype on mutation location. J. Bone. Miner. Res., 2011, 26, Yamakoshi Y.: Dentinogenesis and Dentin Sialophosphoprotein (DSPP). J. Oral Biosci., 2009, 51, George A., Bannon L., Sabsay B., Dillon J. W., Malone J., Veis A., Jenkins N. A., Gilbert D. J., Copeland N. D.: The carboxyl-terminal domain of phosphophoryn contains unique extended triplet amino acid repeat sequences forming ordered carboxyl-phosphate interaction ridges that may be essential in the biomineralization process. J. Biol. Chem., 1996, 271, Boskey A., Spevak L., Tan M., Doty S. B., Butler W. T.: Dentin Sialoprotein (DSP) has limited effects on in vitro apatite formation and growth. Calcif. Tissue Int., 2000, 67, Butler W. T., Rietchie H. H., Bronckers A. L.: Extracellular matrix proteins of dentine. Ciba Found Symp., 1997, 205, Fedarko N. S, Jain A., Karadag A., Fisher 12 PROTETYKA STOMATOLOGICZNA, 2013, LXIII, 1
9 Dentinogenesis imperfecta mutacje genowe L. W.: Three small integrin binding ligand N-linked glycoproteins (SIBLINGs) bind and activate specific matrix metalloproteinases. FASEB J., 2004, 18, Fisher L. W., Fedarko N. S.: Six genes expressed in bones and teeth encode the current members of the SIBLING family of proteins. Connect Tissue Res., 2003, 44 Suppl., 1, McKnight D. A., Simmer J. P., Hart P. S., Hart T. C., Fisher L. W.: Overlapping DSPP mutations cause dentin dysplasia and dentinogenesis imperfecta. J. Dent. Res., 2008, 87, Zaakceptowano do druku 25.XI.2012 r. Adres autorów: Gdańsk, ul. E. Orzeszkowej 18 Zarząd Główny PTS PROTETYKA STOMATOLOGICZNA, 2013, LXIII, 1 13
ANALIZA MOLEKULARNA WRODZONYCH ZABURZEŃ BUDOWY ZĘBINY O CHARAKTERZE DENTINOGENESIS IMPERFECTA I DYSPLAZJI ZĘBINY PRZEGLĄD PIŚMIENNICTWA
POSTĘPY BIOLOGII KOMÓRKI TOM 39 2012 NR 4 (575 588) ANALIZA MOLEKULARNA WRODZONYCH ZABURZEŃ BUDOWY ZĘBINY O CHARAKTERZE DENTINOGENESIS IMPERFECTA I DYSPLAZJI ZĘBINY PRZEGLĄD PIŚMIENNICTWA MOLECULAR ANALYSIS
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
PAULINA BAUTEMBACH-KOBERDA
PAULINA BAUTEMBACH-KOBERDA POLIMORFIZM W GENIE DSPP W POPULACJI OSÓB NIE PREZENTUJĄCYCH FENOTYPU DENTINOGENESIS IMPERFECTA TYPU II I/LUB III ORAZ DYSPLAZJI ZĘBINY PRACA NA STOPIEŃ DOKTORA NAUK MEDYCZNYCH
IWONA ORDYNIEC-KWAŚNICA
IWONA ORDYNIEC-KWAŚNICA ANALIZA MUTACJI W GENIE DSPP SKUTKUJĄCYCH POWSTANIEM FENOTYPU DENTINOGENESIS IMPERFECTA TYPU II I/LUB III ORAZ DYSPLAZJI ZĘBINY. BADANIE POLSKIEJ POPULACJI PRACA NA STOPIEŃ DOKTORA
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA. Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi Mutacja Mutacja (łac. mutatio zmiana) - zmiana materialnego
INTERPRETACJA WYNIKÓW BADAŃ MOLEKULARNYCH W CHOROBIE HUNTINGTONA
XX Międzynarodowa konferencja Polskie Stowarzyszenie Choroby Huntingtona Warszawa, 17-18- 19 kwietnia 2015 r. Metody badań i leczenie choroby Huntingtona - aktualności INTERPRETACJA WYNIKÓW BADAŃ MOLEKULARNYCH
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym
Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym mgr Magdalena Brzeskwiniewicz Promotor: Prof. dr hab. n. med. Janusz Limon Katedra i Zakład Biologii i Genetyki Gdański Uniwersytet Medyczny
Bioinformatyka. Rodzaje Mutacji
Bioinformatyka (wykład monograficzny) wykład 3. E. Banachowicz Zakład Biofizyki Molekularnej IF UAM http://www.amu.edu.pl/~ewas Rodzaje Mutacji zmienność sekwencji (sequence variation) mutacje polimorfizm
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
AmpliTest Babesia spp. (PCR)
AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Metody odczytu kolejności nukleotydów - sekwencjonowania DNA
Metody odczytu kolejności nukleotydów - sekwencjonowania DNA 1. Metoda chemicznej degradacji DNA (metoda Maxama i Gilberta 1977) 2. Metoda terminacji syntezy łańcucha DNA - klasyczna metoda Sangera (Sanger
DHPLC. Denaturing high performance liquid chromatography. Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko
DHPLC Denaturing high performance liquid chromatography Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko Mini-słowniczek SNP (Single Nucleotide Polymorphism) - zmienność sekwencji DNA; HET - analiza heterodupleksów; HPLC
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
Diagnostyka neurofibromatozy typu I,
Diagnostyka neurofibromatozy typu I, czyli jak to się robi w XXI wieku dr n. biol. Robert Szymańczak Laboratorium NZOZ GENOMED GENOMED S.A. Neurofibromatoza typu I (choroba von Recklinghausena) częstość
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Test BRCA1. BRCA1 testing
Test BRCA1 BRCA1 testing 2 Streszczenie Za najczęstszą przyczynę występowania wysokiej, genetycznie uwarunkowanej predyspozycji do rozwoju raka piersi i/lub jajnika w Polsce uznaje się nosicielstwo trzech
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny Zadanie 1 1 pkt. za prawidłowe podanie typów dla obydwu zwierząt oznaczonych literami A oraz B. A. ramienionogi, B. mięczaki A.
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
Ćwiczenie 12. Diagnostyka molekularna. Poszukiwanie SNPs Odczytywanie danych z sekwencjonowania. Prof. dr hab. Roman Zieliński
Ćwiczenie 12 Diagnostyka molekularna. Poszukiwanie SNPs Odczytywanie danych z sekwencjonowania Prof. dr hab. Roman Zieliński 1. Diagnostyka molekularna 1.1. Pytania i zagadnienia 1.1.1. Jak definiujemy
Analiza częstości mutacji w parach ojciec-syn w wybranych
ARCH. MED. SĄD. KRYMINOL., 2012, LXII, 147-151 PRACE ORYGINALNE / ORIGINAL PAPERS Joanna Wysocka, Aneta Stasiewicz 1, Krzysztof Rębała, Ewa Kapińska, Lidia Cybulska, Zofia Szczerkowska Analiza częstości
Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...
1. Zadanie (0 2 p. ) Porównaj mitozę i mejozę, wpisując do tabeli podane określenia oraz cyfry. ta sama co w komórce macierzystej, o połowę mniejsza niż w komórce macierzystej, gamety, komórki budujące
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR)
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA terminatora NOS techniką Real Time PCR Nr kat.: GMO03-50 GMO03-100 Wielkość zestawu: 50 reakcji 100 reakcji Objętość pojedynczej
Podstawy genetyki człowieka. Cechy wieloczynnikowe
Podstawy genetyki człowieka Cechy wieloczynnikowe Dziedziczenie Mendlowskie - jeden gen = jedna cecha np. allele jednego genu decydują o barwie kwiatów groszku Bardziej złożone - interakcje kilku genów
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan Klasyczna metoda PCR jest metodą jakościową, nie ilościową co np.
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane
Analiza mutacji p.d36n i p.n318s oraz polimorfizmu p.s474x genu lipazy lipoproteinowej u chorych z hipercholesterolemią rodzinną.
Analiza mutacji p.d36n i p.n318s oraz polimorfizmu p.s474x genu lipazy lipoproteinowej u chorych z hipercholesterolemią rodzinną. Monika śuk opiekun: prof. dr hab. n. med. Janusz Limon Katedra i Zakład
Wprowadzenie do genetyki sądowej. Materiały biologiczne. Materiały biologiczne: prawidłowe zabezpieczanie śladów
Wprowadzenie do genetyki sądowej 2013 Pracownia Genetyki Sądowej Katedra i Zakład Medycyny Sądowej Materiały biologiczne Inne: włosy z cebulkami, paznokcie możliwa degradacja - tkanki utrwalone w formalinie/parafinie,
GRADIENT TEMPERATUR TOUCH DOWN PCR. Standardowy PCR RAPD- PCR. RealTime- PCR. Nested- PCR. Digital- PCR.
Standardowy PCR RAPD- PCR Nested- PCR Multipleks- PCR Allelospecyficzny PCR Touchdown- PCR RealTime- PCR Digital- PCR In situ (slide)- PCR Metylacyjno specyficzny- PCR Assembly- PCR Inverse- PCR GRADIENT
S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Stacjonarne (s)
Załącznik Nr 3 do Uchwały Senatu PUM 14/2012 S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne Kod modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Nazwa
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Składniki jądrowego genomu człowieka
Składniki jądrowego genomu człowieka Genom człowieka 3 000 Mpz (3x10 9, 100 cm) Geny i sekwencje związane z genami (900 Mpz, 30% g. jądrowego) DNA pozagenowy (2100 Mpz, 70%) DNA kodujący (90 Mpz ~ ok.
Glimmer umożliwia znalezienie regionów kodujących
Narzędzia ułatwiające identyfikację właściwych genów GLIMMER TaxPlot Narzędzia ułatwiające amplifikację tych genów techniki PCR Primer3, Primer3plus PrimerBLAST Reverse Complement Narzędzia ułatwiające
GENOMIKA. MAPOWANIE GENOMÓW MAPY GENOMICZNE
GENOMIKA. MAPOWANIE GENOMÓW MAPY GENOMICZNE Bioinformatyka, wykład 3 (21.X.2008) krzysztof_pawlowski@sggw.waw.pl tydzień temu Gen??? Biologiczne bazy danych historia Biologiczne bazy danych najważniejsze
Zmienność genu UDP-glukuronozylotransferazy 1A1 a hiperbilirubinemia noworodków.
Zmienność genu UDP-glukuronozylotransferazy 1A1 a hiperbilirubinemia noworodków. Katarzyna Mazur-Kominek Współautorzy Tomasz Romanowski, Krzysztof P. Bielawski, Bogumiła Kiełbratowska, Magdalena Słomińska-
Rok akademicki: 2014/2015 Kod: EIB-2-206-BN-s Punkty ECTS: 3. Kierunek: Inżynieria Biomedyczna Specjalność: Bionanotechnologie
Nazwa modułu: Genetyka molekularna Rok akademicki: 2014/2015 Kod: EIB-2-206-BN-s Punkty ECTS: 3 Wydział: Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Inżynierii Biomedycznej Kierunek: Inżynieria Biomedyczna
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: 1. Otrzymanie pożądanego odcinka DNA z materiału genetycznego dawcy 2. Wprowadzenie obcego DNA do wektora 3. Wprowadzenie wektora, niosącego w sobie
Bezpośrednia embriogeneza somatyczna
Bezpośrednia embriogeneza somatyczna Zarodki somatyczne formują się bezpośrednio tylko z tych komórek roślinnych, które są kompetentne już w momencie izolowania z rośliny macierzystej, czyli z proembriogenicznie
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA
DNA 28SRNA 18/16S RNA 5SRNA mrna Ilościowa analiza mrna aktywność genów w zależności od wybranych czynników: o rodzaju tkanki o rodzaju czynnika zewnętrznego o rodzaju upośledzenia szlaku metabolicznego
Rocz. Nauk. Zoot., T. 37, z. 2 (2010) 145 149. Identyfikacja sekwencji genu kodującego dehydrogenazę NADH 1 u sarny
Rocz. Nauk. Zoot., T. 37, z. 2 (2010) 145 149 Identyfikacja sekwencji genu kodującego dehydrogenazę NADH 1 u sarny M a ł g o r z a t a N a t o n e k - W i ś n i e w s k a, E w a S ł o t a Instytut Zootechniki
Polimorfizm genu mitochondrialnej polimerazy gamma (pol γ) w populacjach ludzkich Europy
Polimorfizm genu mitochondrialnej polimerazy gamma (pol γ) w populacjach ludzkich Europy Praca wykonana pod kierunkiem dr hab. Tomasza Grzybowskiego w Katedrze Medycyny Sądowej w Zakładzie Genetyki Molekularnej
Analysis of infectious complications inf children with acute lymphoblastic leukemia treated in Voivodship Children's Hospital in Olsztyn
Analiza powikłań infekcyjnych u dzieci z ostrą białaczką limfoblastyczną leczonych w Wojewódzkim Specjalistycznym Szpitalu Dziecięcym w Olsztynie Analysis of infectious complications inf children with
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR)
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzaju Salmonella techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
Skojarzone leczenie ortodontyczne i implantoprotetyczne jako rehabilitacja hipodoncji i mikrodoncji
Skojarzone leczenie ortodontyczne i implantoprotetyczne jako rehabilitacja hipodoncji i mikrodoncji Autorzy _ Jan Pietruski i Małgorzata Pietruska Ryc. 1 Ryc. 2 _Wrodzone wady zębów, dotyczące ich liczby
2 RAMOWY PROGRAM STAŻU PODYPLOMOWEGO LEKARZA DENTYSTY
Załącznik nr 2 RAMOWY PROGRAM STAŻU PODYPLOMOWEGO LEKARZA DENTYSTY Cel stażu: pogłębienie wiedzy teoretycznej oraz doskonalenie i utrwalenie praktycznych umiejętności z zakresu promocji zdrowia oraz zapobiegania,
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 6 BAZA DANYCH NCBI - II
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 6 BAZA DANYCH NCBI - II BAZA DANYCH NCBI 1. NCBI 2. Dane gromadzone przez NCBI 3. Przegląd baz danych NCBI: Publikacje naukowe Projekty analizy genomów OMIM: fenotypy człowieka
DZIENNIK PRAKTYK PRAKTYCZNE NAUCZANIE KLINICZNE KIERUNEK LEKARSKO-DENTYSTYCZNY
DZIENNIK PRKTYK PRKTYCZNE NUCZNIE KLINICZNE KIERUNEK LEKRSKO-DENTYSTYCZNY DZIENNIK PRKTYK kierunek lekarsko-dentystyczny Imię i nazwisko studenta PESEL Numer albumu zdjęcie Nazwa uczelni Data wystawienia
Wykład 9: HUMAN GENOME PROJECT HUMAN GENOME PROJECT
Wykład 9: Polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) odrębność genetyczna, która czyni każdego z nas jednostką unikatową Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej HUMAN GENOME
Podłoże molekularne NF1 i RASopatii. Możliwości diagnostyczne.
Podłoże molekularne NF1 i RASopatii. Możliwości diagnostyczne. MONIKA G O S Z AKŁAD G ENETYKI MEDYCZ NEJ, I N STYTUT MATKI I DZIECKA SYMPOZJUM A LBA - JULIA WARSZAWA, 2-3.12.2017 Czym jest gen? Definicja:
OCENA WYSTĘPOWANIA ANOMALII ZĘBOWYCH I MORFOLOGII WYROSTKA ZĘBODOŁOWEGO U PACJENTÓW Z ZATRZYMANYMI KŁAMI
Lek. Dent. Joanna Abramczyk OCENA WYSTĘPOWANIA ANOMALII ZĘBOWYCH I MORFOLOGII WYROSTKA ZĘBODOŁOWEGO U PACJENTÓW Z ZATRZYMANYMI KŁAMI STRESZCZENIE WSTĘP W praktyce ortodontycznej zatrzymane stałe kły, szczególnie
Dysplazja zębiny typu I opis przypadku
Borgis Dysplazja zębiny typu I opis przypadku Izabela Tkacz 1, Maria Mielnik-Błaszczak 1, *Elżbieta Pels 1, Jerzy Błaszczak 2 1 Katedra i Zakład Stomatologii Wieku Rozwojowego Uniwersytetu Medycznego w
Opieka nad chorymi z Dystrofią Mięśniową Duchenne a
Opieka nad chorymi z Dystrofią Mięśniową Duchenne a Opis potrzeb i koniecznych usprawnień w procesach badawczych i diagnostycznoterapeutycznych. Jolanta Wierzba Ośrodek Chorób Rzadkich UCK Gdańsk Gdański
GENETYKA POPULACYJNA LOCUS D19S433 W REGIONIE POLSKI PÓŁNOCNEJ POPULATION GENETICS OF THE D19S433 LOCUS IN THE NORTHERN POLAND
Ann. Acad. Med. Gedan., 2005, 35, 181 185 JOANNA WYSOCKA, EWA KAPIŃSKA, KRZYSZTOF RĘBAŁA, ZOFIA SZCZERKOWSKA, LIDIA CYBULSKA GENETYKA POPULACYJNA LOCUS D19S433 W REGIONIE POLSKI PÓŁNOCNEJ POPULATION GENETICS
Ampli-LAMP Babesia canis
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400
S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Biologia medyczna. Nie dotyczy
Załącznik Nr 3 do Uchwały enatu PUM 14/2012 YLABU MODUŁU (PRZEDMIOTU) Kod modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów pecjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Nazwa modułu I nformacje
Skrypt Bioinformatyka DRAFT Strona 67
Spis treści 5 Budowa kwasów nukleinowych... 68 5.1 Nukleotydy... 68 5.2 Łaocuch polinukleotydowy... 71 5.3 Nić komplementarna... 71 6 Centralny dogmat Biologii Molekularnej... 74 7 Przepływ informacji
STOMATOLOGIA ZACHOWAWCZA
STOMATOLOGIA ZACHOWAWCZA Stomatologia zachowawcza- zajmuje się metodami zachowania naturalnych właściwości zębów, które zostały utracone na skutek działania bodźców zewnętrznych. Najgroźniejszym z nich
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 11 BAZA DANYCH HAPMAP
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 11 BAZA DANYCH HAPMAP WSTĘP 1. SNP 2. haplotyp 3. równowaga sprzężeń 4. zawartość bazy HapMap 5. przykłady zastosowań Copyright 2013, Joanna Szyda HAPMAP BAZA DANYCH HAPMAP - haplotypy
WYJAŚNIENIA DO TREŚCI SPECYFIKACJI ISTOTNYCH WARUNKÓW ZAMÓWIENIA
Katowice, dn. 04.05.2016r. WYJAŚNIENIA DO TREŚCI SPECYFIKACJI ISTOTNYCH WARUNKÓW ZAMÓWIENIA Dotyczy: postępowania o udzielenie zamówienia publicznego prowadzonego w trybie przetargu nieograniczonego na
Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów
Załącznik nr 1 do SIWZ Nazwa i adres Wykonawcy Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Przedmiot zamówienia; automatyczny system do diagnostyki molekularnej:
leczenia personalizowanego
Diagnostyka molekularna jako podstawa leczenia personalizowanego Dorota Nowakowska Poradnia Genetyczna CO-I Warszawa medycyna personalizowana Definicja wg Polskiej Koalicji Medycyny Personalizowanej: Kluczowe
TECHNIKI WYKORZYSTYWANE W DIAGNOSTYCE MOLEKULARNEJ CHORÓB JEDNOGENOWYCH TECHNIQUES USED IN MOLECULAR DIAGNOSTICS OF MONOGENIC DISORDERS
Nowiny Lekarskie 2006, 75, 5, 486 490 ALINA LICZBAŃSKA, ANNA WOŹNIAK, ANNA WAWROCKA, MACIEJ R. KRAWCZYŃSKI TECHNIKI WYKORZYSTYWANE W DIAGNOSTYCE MOLEKULARNEJ CHORÓB JEDNOGENOWYCH TECHNIQUES USED IN MOLECULAR
ZALEŻNOŚĆ MIĘDZY WYSOKOŚCIĄ I MASĄ CIAŁA RODZICÓW I DZIECI W DWÓCH RÓŻNYCH ŚRODOWISKACH
S ł u p s k i e P r a c e B i o l o g i c z n e 1 2005 Władimir Bożiłow 1, Małgorzata Roślak 2, Henryk Stolarczyk 2 1 Akademia Medyczna, Bydgoszcz 2 Uniwersytet Łódzki, Łódź ZALEŻNOŚĆ MIĘDZY WYSOKOŚCIĄ
PODSTAWY BIOINFORMATYKI WYKŁAD 4 ANALIZA DANYCH NGS
PODSTAWY BIOINFORMATYKI WYKŁAD 4 ANALIZA DANYCH NGS SEKWENCJONOWANIE GENOMÓW NEXT GENERATION METODA NOWEJ GENERACJI Sekwencjonowanie bardzo krótkich fragmentów 50-700 bp DNA unieruchomione na płytce Szybkie
This copy is for personal use only - distribution prohibited.
Kwart. Ortop. 20, 4, str. 34, ISSN 2083-8697 - - - - - REHABILITACJA STAWU BIODROWEGO I KOLANOWEGO, FINANSOWANA PRZEZ NARODOWY FUNDUSZ ZDROWIA W LATACH 2009 200 REHABILITATION OF THE HIP AND KNEE JOINTS
Mgr Paweł Musiał. Promotor Prof. dr hab. n. med. Hanna Misiołek Promotor pomocniczy Dr n. med. Marek Tombarkiewicz
Mgr Paweł Musiał Porównanie funkcjonowania podstawow-ych i specjalistycznych Zespołów Ratownictwa Medycznego na przykładzie Samodzielnego Publicznego Zespołu Zakładów Opieki Zdrowotnej w Staszowie Rozprawa
S YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma c j e ogólne. Biologia molekularna
Załącznik Nr 3 do Uchwały Senatu PUM 14/2012 S YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma c j e ogólne Kod modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR)
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii Borrelia burgdorferi, Anaplasma, Ehrlichia oraz pierwotniaków rodzaju Babesia (B. canis, B. gibsoni,
PL 217144 B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego
PL 217144 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 217144 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 391926 (22) Data zgłoszenia: 23.07.2010 (51) Int.Cl.
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków)
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków) Celem ćwiczenia jest wprowadzenie mutacji punktowej do genu
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR)
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzajów Chlamydia i Chlamydophila techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC18-50 BAC18-100 Wielkość
Wprowadzenie do genetyki medycznej i sądowej
Genetyka medyczno-sądowa Wprowadzenie do genetyki medycznej i sądowej Kierownik Pracowni Genetyki Medycznej i Sądowej Ustalanie tożsamości zwłok Identyfikacja sprawców przestępstw Identyfikacja śladów
LIDIA CYBULSKA, EWA KAPIŃSKA, JOANNA WYSOCKA, KRZYSZTOF RĘBAŁA, ZOFIA SZCZERKOWSKA
ANNALES ACADEMIAE MEDICAE STETINENSIS ROCZNIKI POMORSKIEJ AKADEMII MEDYCZNEJ W SZCZECINIE 2007, 53, SUPPL. 2, 170174 LIDIA CYBULSKA, EWA KAPIŃSKA, JOANNA WYSOCKA, KRZYSZTOF RĘBAŁA, ZOFIA SZCZERKOWSKA Badanie
Napisz, który z przedstawionych schematycznie rodzajów replikacji (A, B czy C) ilustruje replikację semikonserwatywną. Wyjaśnij, na czym polega ten
Napisz, który z przedstawionych schematycznie rodzajów replikacji (A, B czy C) ilustruje replikację semikonserwatywną. Wyjaśnij, na czym polega ten proces. Na schemacie przedstawiono etapy przekazywania
S YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma cje ogólne. Ortodoncja
S YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma cje ogólne Kod modułu Rodzaj modułu/przedmiotu Kod modułu/przedmiotu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Semestr
Leczenie protetyczne pacjentki z hipodoncją. Opis przypadku
PROTET. STOMATOL., 2006, LVI, 4, 295-299 Leczenie protetyczne pacjentki z hipodoncją. Opis przypadku Prosthetic treatment of the patient with hipodontia. A case report Jacek Kasperski 1, Przemysław Rosak
Czynniki warunkujące proces gojenia. Uwaga! Badanie podmiotowe. Badanie przedmiotowe. Wywiad. Urazy zębów mlecznych. Utrata przytomności
Urazy zębów mlecznych Czynniki warunkujące proces gojenia zależne od pacjenta wiek i stopień rozwoju korzenia stan higieny jamy ustnej i uzębienia ogólny stan zdrowia czas zgłoszenia się do lekarza Emil
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów:
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów: dobór warunków samej reakcji PCR (temperatury, czas trwania cykli, ilości cykli itp.) dobór odpowiednich starterów do reakcji amplifikacji
ASPEKTY POWSTAWANIA ORGANICZNEJ MACIERZY MINERALIZOWANYCH TKANEK ZÊBA.CZ.II 671 POSTÊPY BIOLOGII KOMÓRKI TOM 32 2005 NR 4 (671 678)
ASPEKTY POWSTAWANIA ORGANICZNEJ MACIERZY MINERALIZOWANYCH TKANEK ZÊBA.CZ.II 671 POSTÊPY BIOLOGII KOMÓRKI TOM 32 2005 NR 4 (671 678) WYBRANE ASPEKTY POWSTAWANIA ORGANICZNEJ MACIERZY MINERALIZOWANYCH TKANEK
Database resources of the National Center for Biotechnology Information. Magdalena Malczyk
Database resources of the National Center for Biotechnology Information Magdalena Malczyk NCBI NCBI = National Center for Biotechnology Information Założone w 1998 r. Cel: rozwijanie systemów informatycznych
Gen choroby Huntingtona, dwadzieścia lat później
Wiadomości naukowe o chorobie Huntingtona. Prostym językiem. Napisane przez naukowców. Dla globalnej społeczności HD. Czy nowa technika zrewolucjonizuje testy genetyczne na chorobę Huntingtona? Zaprezentowano
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 4 Jak działają geny?
WYBRANE RODZAJE REAKCJI PCR. RAPD PCR Nested PCR Multipleks PCR Allelo-specyficzny PCR Real Time PCR
RAPD PR Nested PR Allelo-specyficzny PR Real Time PR RAPD PR (Random Amplification of Polymorphic DNA) wykorzystywany gdy nie znamy sekwencji starterów; pozwala namnożyć losowe fragmenty o różnej długości;
Is there a relationship between age and side dominance of tubal ectopic pregnancies? A preliminary report
Is there a relationship between age and side dominance of tubal ectopic pregnancies? A preliminary report Czy istnieje zależność pomiędzy wiekiem i stroną, po której umiejscawia się ciąża ektopowa jajowodowa?
Zachorowalność na próchnicę dzieci łódzkich w wieku przedszkolnym zakwalifikowanych do zabiegów profilaktyki fluorkowej
Czas. Stomat., 2005, LVIII, 5 Zachorowalność na próchnicę dzieci łódzkich w wieku przedszkolnym zakwalifikowanych do zabiegów profilaktyki fluorkowej Incidence of caries in preschool children living in
ANALIZA DANYCH POCHODZĄCYCH Z SEKWENCJONOWANIA NASTĘPNEJ GENERACJI
ANALIZA DANYCH POCHODZĄCYCH Z SEKWENCJONOWANIA NASTĘPNEJ GENERACJI JOANNA SZYDA MAGDALENA FRĄSZCZAK MAGDA MIELCZAREK WSTĘP 1. Katedra Genetyki 2. Pracownia biostatystyki 3. Projekty NGS 4. Charakterystyka
Promocje. jesienne 01.09-15.12.2011. nowość. Evetric. Światłoutwardzalny, nanohybrydowy, uniwersalny materiał złożony
Promocje jesienne 01.09-15.12.2011 Evetric Światłoutwardzalny, nanohybrydowy, uniwersalny materiał złożony Zestaw Evetric 8 x 3,5g (A1, A2, A3, A3.5, B2, C2, T, A3.5 Dentin, kolornik) nowość Cena: 650
Stomatologia. Chirurgia szczękowa
WU Stomatologia. Chirurgia szczękowa WU 1-49 Wydawnictwa informacyjne i ogólne WU 50-95 Etyka. Praktyka zawodowa i personel. Dokumentacja WU 100-113.7 Anatomia. Fizjologia. Higiena WU 140-166 Choroby.
ANALIZA DANYCH POCHODZĄCYCH Z SEKWENCJONOWANIA NASTĘPNEJ GENERACJI
ANALIZA DANYCH POCHODZĄCYCH Z SEKWENCJONOWANIA NASTĘPNEJ GENERACJI Joanna Szyda Magdalena Frąszczak Magda Mielczarek WSTĘP 1. Katedra Genetyki 2. Pracownia biostatystyki 3. Projekty NGS 4. Charakterystyka
Badanie podatności na łysienie androgenowe u mężczyzn
Badanie podatności na łysienie androgenowe u mężczyzn RAPORT GENETYCZNY Wyniki testu dla Pacjent Testowy Pacjent Pacjent Testowy ID pacjenta 0999900004136 Imię i nazwisko pacjenta Pacjent testowy Rok urodzenia
Agata Kodroń, Edyta Rychlicka, Iwona Milewska, Marcin Woźniak, Tomasz Grzybowski WSTĘP
ARCH. MED. SĄD. KRYMINOL., 2010, LX, 243-247 PRACE ORYGINALNE / ORIGINALS Agata Kodroń, Edyta Rychlicka, Iwona Milewska, Marcin Woźniak, Tomasz Grzybowski Analiza danych populacyjnych loci ministr: D10S1248,
dr Przemysław Bury Centrum Stomatologii Uniwersytetu Medycznego im. K. Marcinkowskiego w Poznaniu
Projekt badań profilaktycznych z zakresu zdrowia jamy ustnej, skierowany do dzieci uczęszczających w roku szkolnym 2010/2011 do klas I i VI szkół podstawowych prowadzonych przez Gminę Śrem Opracowanie: