Wpływ mutacji w genach regulatorowych nfxb klinicznych szczepów Pseudomonas aeruginosa na oporność na fluorochinolony
|
|
- Julian Orłowski
- 8 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 diagnostyka laboratoryjna Journal of Laboratory Diagnostics 2009 Volume 45 Number Praca oryginalna Original Article Wpływ mutacji w genach regulatorowych nfxb klinicznych szczepów Pseudomonas aeruginosa na oporność na fluorochinolony Zenobia Wydmuch 1, Marta Adamek 2, Olga Skowronek-Ciołek 3 1 Laboratorium Analityczne Szpitala Specjalistycznego w Chorzowie; 2 Instytut Fizjologii Człowieka Akademii Wychowania Fizycznego im. Bronisława Czecha w Krakowie; 3 Katedra i Zakład Mikrobiologii Wydziału Farmaceutycznego z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Śląskiego Uniwersytetu Medycznego w Katowicach Streszczenie Cel badań: Niepokojący jest narastający rozwój oporności szczepów Pseudomonas aeruginosa na fluorochinolony. Z badań genetycznych wynika, iż istotnym mechanizmem oporności są mutacje w genach regulatorowych, prowadzące do nadekspresji pomp MDR (ang. multi drug resistant) i powstawania oporności na wiele grup leków przeciwbakteryjnych. Celem pracy było wykrycie mutacji w genach regulatorowych nfxb klinicznych szczepów P. aeruginosa, odpowiedzialnych za oporność na fluorochinolony. Materiał i metody: Badaniem objęto 44 izolaty P. aeruginosa wyizolowane z materiałów klinicznych od pacjentów hospitalizowanych i ambulatoryjnych. Metodą E-testów oznaczono MIC fluorochinolonów dla badanych drobnoustrojów. Wyizolowany DNA chromosomalny pałeczek ropy błękitnej poddano reakcji amplifikacji, produkty reakcji PCR sekwencjonowano. Wyniki: Analiza sekwencyjna części kodującej fragmentu genu nfxb badanych pałeczek pozwoliła na wykrycie 3 typów mutacji punktowych w 24/44 izolaty (Glu-124 Ala, Arg-82 Leu, Ala-15 Val) i 7 typów mutacji cichych. W 10/24 szczepy, w których w genie nfxb występowała mutacja Glu-124 Ala, stwierdzono oporność na wszystkie użyte do badań fluorochinolony. Szczep posiadający podwójną mutację punktową: Ala-15 Val, Glu-124 Ala, również wykazywał całkowitą oporność. Najczęściej wykrywaną mutacją w badanym fragmencie genu była mutacja punktowa Glu-124 Ala, którą zidentyfikowano w 24/44 badane izolaty, wykazywały one wysoką oporność na fluorochinolony. Wnioski: Przedstawione wyniki badań wskazują na znaczący wpływ mutacji w genie nfxb pałeczek P. aeruginosa w nabywaniu oporności na fluorochinolony. nfxb genes mutations and their impact on resistance to fluoroquinolones of Pseudomonas aeruginosa clinical strains Summary Aim: The growing concern is rising resistance to fluoroquinolones of Pseudomonas aeruginosa strains. The genetic testing shows that an important mechanism of resistance is due to mutations in the analyzed ntxb regulatory genes, leading to overexpression of mutidrug resistance MDR pumps and to formation of resistance to many groups of antibacterial drugs. The purpose of this study was to detect mutations in nfxb regulatory genes of P. aeruginosa clinical strains, responsible for resistance to fluoroquinolones. Materials and methods: The study included 44 isolates of P. aeruginosa taken from patients hospitalized or from ambulatory patients. E-test method was used to determine MICs for all the fluoroquinolones tested. Bacterial DNA isolates were amplified, and subsequently the PCR reaction products were sequenced. Results: Sequencing analysis of the nfxb genes revealed 3 types of point mutations in the 24 of 44 isolates and 7 types of silent mutations. In 10 of 24 strains in which the nfxb genes mutations were detected, mutations at Glu-124-Ala were found to code resistance to all fluoroquinolones used in our research. The strain bearing the double point mutation: at Ala-15-Val, and Glu-124-Ala, also showed the total drug resistance. The most frequently detected nfxb gene mutation was point mutation described at Glu-124-Ala, which was identified in 24 of 44 isolates tested, and also showed high resistance to fluoroquinolones. Conclusions: Our results indicate a significant impact of nfxb genes mutations on the aquisition of Pseudomonas aeruginosa resistance to fuoroquinolones. Słowa kluczowe: Pseudomonas aeruginosa, oporność, geny regulatorowe, mutacja cicha, mutacja punktowa, nfxb, sekwencjonowanie, fluorochinolony 285
2 Wpływ mutacji w genach regulatorowych nfxb klinicznych szczepów Pseudomonas aeruginosa na oporność... Key words: Pseudomonas aeruginosa, resistance, regulatory genes, silent mutation, point mutation, nfxb, sequence analysis, fluoroquinolones Wstęp Pałeczki P. aeruginosa należą do bakterii szeroko rozpowszechnionych w przyrodzie. Występują pospolicie w wodzie, glebie, ściekach i żywności. Stanowią również fizjologiczną florę przewodu pokarmowego ludzi i zwierząt. Szczepy tego gatunku mogą być także czynnikiem etiologicznym zakażeń układu oddechowego, dróg moczowych, zapalenia ucha środkowego i zatok, zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych, kości i szpiku kostnego, zapalenia osierdzia i wsierdzia, zapalenia spojówek oka oraz zatrucia pokarmowego [4, 14]. Chemioterapia zakażeń wywołanych pałeczką P. aeruginosa stanowi jedno z najtrudniejszych zagadnień lecznictwa. Wynika to z faktu istnienia szczepów opornych na wiele antybiotyków oraz łatwości pojawiania się oporności na antybiotyki aktualnie stosowane. Pałeczka ropy błękitnej wykazuje wysoką naturalną oporność na penicylinę G, ampicylinę, cefalosporyny I i II generacji, tetracykliny, linkosamidy i stare chinoliny. Aktywność wobec tego gatunku mogą wykazywać karbenicylina, tykarcylina, ureidopenicyliny, aztreonam, cefalosporyny III i IV generacji, karbapenemy, aminoglikozydy i fluorochinoliny [2, 3, 10, 16, 18]. Fluorochinolony to grupa leków przeciwbakteryjnych, które w odróżnieniu od starych chinolonów charakteryzują się aktywnością wobec pałeczek niefermentujących (P. aeruginosa, Acinetobacter sp.), a także niektórych ziarenkowców Gramdodatnich. Rozwój oporności na fluorowane chinolony ogranicza skuteczność stosowania tych względnie nowych chemioterapeutyków. Niepokojący jest zwłaszcza niespodziewanie szybki rozwój oporności szczepów P. aeruginosa. Oporność na fluorochinolony u tych drobnoustrojów może wynikać z modyfikacji miejsca w komórce, będącego punktem uchwytu leku mutacje w genach gyra i parc, zmniejszonego przenikania leku przez zewnętrzną błonę komórkową oraz mutacji w genach regulatorowych prowadzących do nadekspresji pomp MDR (ang. multi drug resistant), skutecznie usuwających chinoliny z komórki bakteryjnej. Wymienione powyżej mechanizmy uwarunkowane są chromosomalnie [1, 8, 11]. Kodowana chromosomalnie oporność nie jest przenoszona horyzontalnie, a pojedyncza mutacja nie powoduje powstania oporności o znaczeniu klinicznym. Fenotyp oporności nadaje kombinacja mutacji w silnie konserwatywnym regionie chromosomu, tak zwanym regionie warunkującym oporność na chinolony QRDR (ang. Quinolone Resistant Determination Region) i dodatkowo w regulatorowym locus mar, które jest zaangażowane w aktywne wydalanie leku z komórki oraz zmniejszone jego pobieranie, przez redukcję syntezy powierzchniowego białka OmpF. U P. aeruginosa za ten mechanizm odpowiedzialny jest operon kodowany przez geny mex (ang. multiple efflux). Pompy te zwykle współdziałają z systemami wspomagającymi. U P. aeruginosa zidentyfikowano 5 pomp efflux: MexAB-OprM, MexCD-OprJ, MexEF-OprN, MexXY-OprM i ostatnio odkryta MexVM-OprM. Cztery pierwsze pompy efflux są regulowane m.in. przez geny: nfxb, mexr, mext i mexz. Mutacje występujące w obrębie któregoś z wyżej wymienionych genów regulatorowych są odpowiedzialne za zwiększenie ekspresji odpowiednich pomp efflux, wyrzut fluorochinolonu z komórki i rozwój oporności. Proces ten przyczynia się do spadku stężenia wewnątrzkomórkowego leku i wzrostu wartości MIC [1, 8, 9, 13, 15, 17, 20]. Celem niniejszej pracy było poszukiwanie mutacji w genach regulatorowych nfxb klinicznych szczepów P. aeruginosa odpowiedzialnych za oporność na fluorochinolony. Materiał i metody Przedmiotem badań były 44 szczepy pałeczek P. aeruginosa, które wyizolowano z materiału klinicznego (wymazy z gardła, z rany, z ucha, przetoki, mocz), pochodzącego od pacjentów hospitalizowanych i ambulatoryjnych, w Zakładzie Mikrobiologii Wojewódzkiego Szpitala Specjalistycznego Nr 5 im. Św. Barbary w Sosnowcu. Metodą E-testów wykonano badanie lekowrażliwości szczepów P. aeruginosa, oznaczając MIC 5. fluorochinolonów: ciprofloksacyny (CI), ofloksacyny (OF), pefloksacyny (PE), sparfloksacyny (SO) i norfloksacyny (NX). Do badania wykorzystano podłoże agar Hinton-Müller (HMA) oraz paski E-test (firmy AB Biodisk), posiewy inkubowano w temperaturze 35 C h, następnie odczytywano wartości MIC użytych do badań antybiotyków, zgodnie z zalecanymi NCCLS (National Committee for Clinical Laboratory Standards) (tab. I). Wykonano również badanie kontrolne z użyciem szczepu wzorcowego P. aeruginosa ATCC [5]. Tabela I. Zakresy wrażliwości szczepów P. aeruginosa na wybrane do badań fluorochinolony. Stopień wrażliwości Zakresy wartości stężeń (μg/ml) fluorochinolonów na pasku E-testu CI OF PE SO NX Wrażliwy ,5 4 Średnio wrażliwy Oporny
3 Z. Wydmuch, M. Adamek i O. Skowronek-Ciołek Kolejnym etapem badania była izolacja chromosomalnego DNA z komórek badanych szczepów, przy użyciu zestawu QIAmp DNA Mini Kit(QIAGEN), zgodnie z załączonym protokołem. W celu potwierdzenia obecności wyizolowanego DNA wykonano elektroforezę w 1,5% żelu agarozowym. Następnie dobrano odpowiednie startery i warunki reakcji PCR do identyfikacji fragmentów genu nfxb. Sekwencję genu nfxb (GB:X65646) P. aeruginosa wyszukano w bazie GenBank ( następnie dobrano właściwe startery komplementarne do amplifikowanej sekwencji badanego genu, które przedstawiono w tabeli II. Potwierdzenie sekwencji nukleotydowej starterów dla genu nfxb uzyskano z danych literaturowych [20] i potwierdzono w GenBank. Ustalone doświadczalnie warunki reakcji PCR programowano w termocyklerze Personal Thermocycler (BIOMETRA). Do reakcji amplifikacji wykorzystano zestaw 2xPCR Master Mix (Fermentas) oraz startery robocze o stężeniu 5 pmol/μl. Doświadczalnie ustalono profil temperaturowy reakcji PCR dla amplifikowanego fragmentu genu nfxb: I etap: Termiczna aktywacja polimerazy DNA Taq (95 C 3 min) II etap: Denaturacja (94 C 1 min) Przyłączenie starterów (56 C 1 min) Wydłużanie starterów (72 C 1 min) 35 cykli reakcji PCR (I i II etap) dla amplifikowanego fragmentu genu nfxb III etap: Końcowe wydłużanie (72 C 10 min). Produkty amplifikacji badanego fragmentu genu uzyskano dla 24 szczepów. Potwierdzeniem obecności genu nfxb był prążek na żelu agarozowym o wielkości 584 pz. Fragmenty genu nfxb poddawano reakcji sekwencjonowania, badanie to przeprowadzono w Pracowni Sekwencjonowania DNA i Syntezy Oligonukleotydów IBB PAN w Warszawie. PCR sekwencyjny produktów amplifikacji genu nfxb wykonano z wykorzystaniem komercyjnego zestawu DNA Sequencing Kit Big Dye Terminator Cycle Sequencing v3.1. Badany fragment genu nfxb amplifikowano w warunkach przedstawionych w tabeli III. Analizę uzyskanych wyników dotyczących sekwencji nukleotydowej i aminokwasowej przeprowadzono z zastosowaniem programów: FinchTV oraz GenDoc A.zip. Przy użyciu wyżej wymienionych programów przeprowadzono porównanie sekwencji genu nfxb szczepu dzikiego (GB:X65646) ( z genami nfxb badanych izolatów. Wyniki Szczegółową ocenę wrażliwości 44 klinicznych szczepów P. aeruginosa oraz szczepu wzorcowego przedstawiono w tabeli IV. Analizując wyniki badań, zaobserwowano, iż pałeczki ropy błękitnej wykazują najwyższą wrażliwość na norfloksacynę: 25/44 szczepy (56,82%) i ciprofloksacynę: 21/44 szczepy (47,73%), natomiast badane izolaty najbardziej oporne były na sparfloksacynę: 33/44 szczepy (75%), pefloksacynę: 27/44 (61,36%) i ofloksacynę: 24/44 szczepy (54,54%). W badaniach stwierdzono, że szczepy kliniczne izolowane z materiału od pacjentów hospitalizowanych charakteryzowały się dużo wyższą opornością niż te wyhodowane od pacjentów z poradni. Wszystkie badane szczepy, w których wykryto gen nfxb (24/44 szczepy), poddano sekwencjonowaniu. Wyniki uzyskanych fragmentów genu nfxb 24 badanych izolatów przedstawiono w tabeli V w zestawieniu z wartościami MIC fluorochinolonów. Wykonując sekwencjonowanie fragmentu genu nfxb badanych pałeczek ropy błękitnej, wykryto 3 typy mutacji punktowych ze zmianą w sekwencji nukleotydowej i aminokwasowej: GAA GCC(Glu-124 Ala), CGC CTC(Arg- 82 Leu) i GCA GTA( Ala-15 Val) oraz 7 typów mutacji cichych, wyłącznie ze zmianą w sekwencji nukleotydowej, w 13 badanych szczepach. Na rycinie 1 pokazano miejsce mutacji punktowej w kodonie 82, którą porównano z sekwencją fragmentu genu nfxb szczepu POA. Mutację punktową Glu-124 Ala wykryto we wszystkich poddanych analizie sekwencyjnej szczepach, zmianę aminokwasową Arg-82 Leu w 8 izolatach, zaś mutację Ala15 Val stwier- Tabela II. Startery użyte w reakcji PCR. Nazwa Sekwencja nukleotydowa ( 5-3 ) Stężenie μm μg/μl Długość fragmentu genu nfxb 1F nfxb 2R 5 -AAAACCAACCGGGACCCATC-3 (20 nukleotydów) 5 -CAGGAGCGAGCCGGATT-3 (17 nukleotydów) 313 1, , pz Tabela III. Profil temperaturowy i czasowy amplifikacji sekwencyjnej genu nfxb (ilość cykli 25). Temperatura Czas 94 C 10 s 52 C 20 s 60 C 4 min dzono u 1 mutanta pałeczki ropy błękitnej. Spośród 24 badanych szczepów mutację cichą posiadało: 10 izolatów w kodonie 160. (Arg-160 Arg), 8 w kodonach 13. (Ala-13 Ala), 61. (Val-61 Val), 141. (Ala-141 Ala) i 162. (Gly-162 Gly) oraz 1 szczep w dwóch kodonach: 42. (Arg-42 Arg) i 129. (Gly-129 Gly). Stwierdzono, że szczepy P. aeruginosa posiadające mutację w genie regulatorowym nfxb izolowane 287
4 Wpływ mutacji w genach regulatorowych nfxb klinicznych szczepów Pseudomonas aeruginosa na oporność... Tabela IV. Wrażliwość (MIC) badanych szczepów P. aeruginosa oraz szczepu wzorcowego ATCC na fluorochinolony (CI, OF, PE, SO, NX). Wrażliwość na fluorochinolony [MIC (μg/ml)] Numer szczepu CI OF PE SO NX MIC a MIC a MIC a MICª MIC a 288 W b S b O b W b S b O b W b S b O b W b S b O b W b S b O b 2 3 >32 32 > > , > ,125 0,75 1 0,5 0, >32 24 > , ,64 0,75 1 0,5 0, ,94 0,5 1 0,5 0, ,95 0,75 1 0,38 0, >32 >32 >256 >32 > ,94 0,75 1 0,5 0, ,94 0,5 1 0,5 0, >32 >32 >256 >32 > , , >32 >32 >256 >32 > , , >32 >32 >256 >32 > >32 >32 >256 >32 > >32 >32 >256 >32 > >32 >32 >256 >32 > >32 >32 >256 >32 > ,094 0,75 0,75 0,5 0,25 91 >32 >32 >256 >32 > >32 >32 >256 >32 > >32 >32 >256 >32 > >32 >32 >256 >32 > ,25 1 1,5 0,5 0,5 102 >32 >32 >256 >32 > ,064 0,5 1 0,25 0, , , ,5 0, ,094 0,5 0,75 0,38 0, , , , , ATCC ,25 1,5 2 0,5 1 A MIC w μg/ml B stopień wrażliwości: W wrażliwy, S średnio wrażliwy, O oporny
5 Z. Wydmuch, M. Adamek i O. Skowronek-Ciołek Tabela V. Zestawienie MIC fluorochinolonów ze zmianami w genach regulatorowych nfxb zmutowanych szczepów P. aeruginosa. Numer szczepu MIC(µg/ml) CI OF PE SO NX Zmiany w sekwencji nukleotydowej i aminokwaowej w genie nfxb ATCC ,25 1,5 2 0,5 1 - a 2 3 >32 32 > > > > >32 >32 >256 >32 > , , >32 >32 >256 >32 > , >32 >32 >256 >32 > >32 >32 >256 >32 > >32 >32 >256 >32 >256 Gly(GGA)129 Gly(GGC) c a brak mutacji c mutacja cicha 289
6 Wpływ mutacji w genach regulatorowych nfxb klinicznych szczepów Pseudomonas aeruginosa na oporność... Tabela V. cd. Numer szczepu MIC(µg/ml) CI OF PE SO NX Zmiany w sekwencji nukleotydowej i aminokwaowej w genie nfxb ATCC ,25 1,5 2 0,5 1 - a 76 >32 >32 >256 >32 > >32 >32 >256 >32 > >32 >32 >256 >32 >256 Arg(CGT)160 Arg(CGC) c 94 >32 >32 >256 >32 >256 Arg(CGT)160 Arg(CGC) c 102 >32 >32 >256 >32 >256 Ala(GCA)15 Val(GTA) Arg(CGT)160 Arg(CGC) c , , ,5 Arg(CGC)42 Arg(CGA) c a brak mutacji c mutacja cicha były w większości z materiału klinicznego pochodzącego od pacjentów hospitalizowanych. W 10/24 badane izolaty, w których występowała mutacja punktowa Glu-124 Ala w badanym fragmencie genu nfxb: stwierdzono oporność na wszystkie użyte do badań fluorochinolony. Mutanty posiadające jednocześnie 2 zmiany aminokwasowe: Glu-124 Ala i Arg-82 Leu w większości wykazywały oporność na 3 chemioterapeutyki (SO, PE, OF), podczas gdy jeden szczep nr 102, posiadający podwójną mutację: Ala-15 Val i Glu-124 Ala, był oporny na wszystkie wykorzystane do badań fluorochinolony. Dyskusja Chemioterapia zakażeń wywołanych pałeczką P. aeruginosa stanowi obecnie jedno z najtrudniejszych zagadnień lecznictwa. Wynika to z faktu istnienia szczepów opornych na wiele antybiotyków oraz łatwości pojawiania się oporności na antybiotyki aktualnie stosowane. Zagadnienie to dotyczy także, jednej z najnowszych grup leków przeciwbakteryjnych fluorowanych chinolonów. Z badań genetycznych wynika, że za oporność na tę grupę chemioterapeutyków u P. aeruginosa jest odpowiedzialnych kilka mechanizmów. Jeden z nich dotyczy występowania mutacji w genach regulatorowych P. aeruginosa prowadzących do nadekspresji pomp efflux [6, 12, 19]. W niniejszej pracy zajęto się poszukiwaniem mutacji w genach regulatorowych nfxb odpowiedzialnych za oporność na fluorochinolony klinicznych szczepów P. aeruginosa. Przeprowadzona przez nas analiza sekwencyjna fragmentu genu nfxb pałeczek ropy błękitnej pozwoliła na wykrycie 3 typów mutacji punktowych: Glu-124 Ala (24 szcz.), Arg-82 Leu (8 szcz.) i Ala-15 Val (1 szcz.) oraz 7 typów mutacji cichych w 13 badanych szczepach. Podobne badania w swojej pracy przeprowadzili Jalal i Wretling [8]. Spośród 16 poddanych analizie sekwencyjnej szczepów P. aeruginosa w pracy badaczy 2 izolaty posiadały mutację punktową z wymianą aminokwasu w genie nfxb. Jeden ze szczepów posiadał substytucję aminokwasu w kodo- 290
7 Z. Wydmuch, M. Adamek i O. Skowronek-Ciołek Rycina 1. Zmiana sekwencji nukleotydowej i aminokwasowej w genie nfxb szczepu badanego Pseudomonas aeruginosa nr 2: CGC CTC (Arg-82 Leu), w odniesieniu do genu nfxb szczepu dzikiego PAO (GB X 65646). nie 30 (Ala-30 Thr), zaś drugi w kodonie 62 (Leu-62 Val). Identyczne zmiany w przeprowadzonych przez siebie badaniach uzyskali Oh i wsp. [13]. Wykryli oni obecność tych samych mutacji punktowych w genie nfxb co Jalal i Wretling. Badacze zaobserwowali także, iż mutacje w genie nfxb występowały najczęściej w szczepach o wysokim poziomie oporności na norfloksacynę (MIC>64μg/ml) i ciprofloksacynę (MIC>32 μg/ml). W celu zidentyfikowania mutacji punktowych w genach gyra, gyrb, parc, pare, nfxb oraz mexr Kugelberg i wsp. [9] wykonali sekwencjonowanie produktów PCR wymienionych fragmentów genów szczepów P. aeruginosa. Uzyskane przez badaczy wyniki wykazały obecność 2 nowych mutacji punktowych w genie nfxb: Leu-40 Gln, Gln-131 stop w 2 badanych izolatach. Oba zmutowane szczepy charakteryzowały się wysoką opornością na norfloksacynę (MIC>256 μg/ml). Jalal i wsp. [7] badali 20 szczepów P. aeruginosa pobranych od pacjentów ze zwłóknieniem torbielowatym. Izolaty badano pod kątem mutacji punktowych w genach gyra, parc, nfxb i mexr związanych z opornością na fluorochinolony. 16 szczepów P. aeruginosa posiadało mutacje w genie nfxb w pozycji 82 (Arg 82 Leu). Średnie wartości MIC ciproflkosacyny dla tych szczepów wyniosły 4-8 μg/ml. Dla porównania w naszych badaniach mutację w kodonie 82 wykryliśmy w 8/24 izolaty. Wartości MIC CI dla zmutowanych szczepów wyniosły od 0,25 do 3 μg/ml. Przedstawione wyniki badań wskazują na znaczący udział mutacji w genie nfxb w nabywaniu oporności na fluorochinolony. Nadmierna ekspresja pompy bakteryjnej MexCD-OprJ spowodowana mutacjami w badanym genie regulatorowym doprowadza do redukcji wewnątrzkomórkowego stężenia leku i obniżenia wartości stężenia hamującego MIC antybiotyków. Lomovskaya i wsp. [11] twierdzą w swojej pracy, iż hamowanie pomp wypływu P. aeruginosa może znacząco zwiększyć kliniczne zastosowanie fluorochinolonów. Można się spodziewać, że hamowanie pomp bakteryjnych spowoduje zmniejszenie poziomu wewnętrznej oporności, znaczą- 291
8 Wpływ mutacji w genach regulatorowych nfxb klinicznych szczepów Pseudomonas aeruginosa na oporność... co cofnie nabytą oporność i zmniejszy częstość występowania mutantów wysoce opornych na chinolony. Dlatego też należy prowadzić dalsze badania dotyczące pomp bakteryjnych, a także innych mechanizmów oporności pałeczek ropy błękitnej na fluorochinolony, które pozwolą zwiększyć skuteczność tych leków w leczeniu zakażeń bakteryjnych. Wnioski Analiza sekwencyjna fragmentu genu nfxb pałeczek Pseudomonas aeruginosa opornych na fluorochinolony (CI, OF, PE, SO, NX) pozwoliła na wykrycie 3 typów mutacji punktowych:,, Ala(GCA)15 Val(GTA) oraz 7 typów mutacji cichych. Najczęściej wykrywaną mutacją w badanym genie nfxb pałeczek ropy błękitnej była mutacja punktowa: Glu-124 Ala, którą stwierdzono u wszystkich poddanych sekwencjonowaniu szczepów. Stwierdzono, że szczepy pałeczki ropy błękitnej wykazujące obecność mutacji w genie nfxb izolowane były w większości z materiału klinicznego pochodzącego od pacjentów hospitalizowanych niż leczonych ambulatoryjnie. Nabywanie oporności na antybiotyki, może odbywać się na drodze mutacji w bakteryjnym genomie. Ze względu na szybki cykl replikacyjny drobnoustrojów, spontaniczne mutacje punktowe oraz rearanżacje materiału genetycznego, mogą być przyczyną powstawania szczepów opornych, a stosowany antybiotyk może odgrywać rolę selekcjonera, pozwalającego na wzrost jedynie tym komórkom, które prezentują oporność. Piśmiennictwo 1. Bedearden DT, Danziger LH. Mechanizm of action of and resis- tance to quinolones. Pharmacotherapy 2001; 21 (10): Betlejewska-Kielak K, Fiett J. Nowe fluorochinolony w leczeniu bakteryjnych zakażeń układu oddechowego. Nowa Klinika Antybiotykoterapia 2001; 8: Carewicz R. Fluorochinolony w zakażeniach układu oddechowego. Nowa Klinika 1999; 6(3): Gniadkowski M, Gryko R, Grzybowski J i wsp. Pałeczki Gram-ujemne niefermentujące glukozy (rodzaje: Pseudomonas, Burkholderia, Stenotrophomonas i Acinetobacter) Grzybowski J, Reiss J. Praktyczna bakteriologia lekarska i sanitarna. Dom Wydawniczy Bellona. Warszawa Hryniewicz W, Sulikowska A, Szczypa K i wsp. Rekomendacje doboru testów do oznaczania wrażliwości bakterii na antybiotyki i chemioterapeutyki. Diagn Lab 2004; 40: Hryniewicz W, Mészáros J. Antybiotyki w profilaktyce i leczeniu zakażeń. Wydawnictwo Lekarskie PZWL. Warszawa Jalal S, Ciofu O, Hoiby N i wsp. Molecular mechanisms of fluoro- quinolone resistance in Pseudomonas aeruginosa isolates from cystic fibrosis patients. Antimicrob Agents Chemother 2000; 44: Jalal S, Wretling B. Mechanisms of quinolone resistance in clinical strains of Pseudomonas aeruginosa. Microb Drug Resist 1998; 4(4): Kugelberg E, Löfmark S, Wretlind B i wsp. Reduction of the fit- ness burden of quinolone resistance in Pseudomonas aeruginosa. J Antimicrob Chemother 2005; 55: Laudy AE, Starościak BJ. ß laktamazy pałeczek z rodziny Pseudomonadaceae. Postępy Mikrobiol 2000; 39: Lomovskaya O, Warren MS, Lee A i wsp. Identyfication and char- acterization of inhibitors of multidrug resistance efflux pumps in Pseudomonas aeruginosa: novel agents for combination therapy. Antimicrob Agents Chemother 2001; 45(1): Nowak K, Suryło P, Kowalski P. Chinolony przeciwbakteryjne chemioterapeutyki. Farmacja Pol 2002; 58(7): Oh H, Stenhoff J, Jalal S i wsp. Role of efflux pumps and muta- tions in genes for topoisomerases II and IV in fluoroquinolone resistant Pseudomonas aeruginosa strains. Microb Drug Resist 2003; 9: Romaniszyn D. Pałeczki Gram(-) w zakażeniach szpitalnych. Zakażenia. Antybiotykoterapia 2005; 5: Schweitzer HP. Efflux as a mechanizm of resistance to antimicrobials in Pseudomonas aeruginosa and related bacteria: unanswerd questions. Genetics and Molecular Research 2003; 2(1): Steciwko A, Kurpas D. Chinolony w praktyce lekarza rodzinnego. Standardy Med 2003; 2(38): Wydmuch Z, Pacha J, Kępa M i wsp. Oporność na chinolony wybranych ziarenkowców Gram-dodatnich izolowanych z materiału klinicznego w szpitalu regionu śląskiego. Diagn Lab 2003; 39: Wydmuch Z, Pacha J, Kępa M i wsp. Wrażliwość na fluorochinolony szczepów Pseudomonas aeruginosa izolowanych z materiału klinicznego. Med Dośw i Mikrob 2003; 55: Wydmuch Z, Skowronek-Ciołek O, Cholewa K i wsp. Gyr A mutations in ciprofloxacin-resistant clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in a Silesian Hospital in Poland. Polish J Microb 2005; 54(3): Ziha-Zarifi I, LLanes C, Kohler T i wsp. In vivo emergence of multidrug-resistant mutants of Pseudomonas aeruginosa overexpressing the active efflux system MexA-MexB-OprM. Antimicrob Agents and Chemother 1999; 43(2): Adres Autorów: Laboratorium Analityczne Szpitala Specjalistycznego w Chorzowie ul. Zjednoczenia Chorzów szpital_lab_zwydmuch@wp.pl (Praca wpłynęła do Redakcji: ) (Praca przekazana do opublikowania: ) 292
PROBLEMY TERAPEUTYCZNE WTÓRNYCH ZAKAŻEŃ KRWI POWODOWANE PRZEZ PAŁECZKI Enterobacterales W PRAKTYCE ODDZIAŁÓW ZABIEGOWYCH I ZACHOWAWCZYCH
PROBLEMY TERAPEUTYCZNE WTÓRNYCH ZAKAŻEŃ KRWI POWODOWANE PRZEZ PAŁECZKI Enterobacterales W PRAKTYCE ODDZIAŁÓW ZABIEGOWYCH I ZACHOWAWCZYCH DOROTA ROMANISZYN KATEDRA MIKROBIOLOGII UJCM KRAKÓW Zakażenie krwi
ĆWICZENIE I BADANIE WRAŻLIWOŚCI BAKTERII NA ANTYBIOTYKI I CHEMIOTERAPEUTYKI
ĆWICZENIE I BADANIE WRAŻLIWOŚCI BAKTERII NA ANTYBIOTYKI I CHEMIOTERAPEUTYKI Autor i główny prowadzący dr Dorota Korsak Wstęp Jednym z najważniejszych etapów rutynowej diagnostyki mikrobiologicznej zakażeń
Narodowy Instytut Leków ul. Chełmska 30/34, 00-725 Warszawa Tel. 022 851-46-70, Fax. 022 841-29-49 www.korld.edu.pl Warszawa, dn. 21.10.2009r.
Narodowy Instytut Leków ul. Chełmska 30/34, 00-725 Warszawa Tel. 022 851-46-70, Fax. 022 841-29-49 www.korld.edu.pl Warszawa, dn. 21.10.2009r. Wytyczne postępowania w przypadku wykrycia szczepów pałeczek
Oporność na antybiotyki w Unii Europejskiej Dane zaprezentowane poniżej zgromadzone zostały w ramach programu EARS-Net, który jest koordynowany przez
Informacja o aktualnych danych dotyczących oporności na antybiotyki na terenie Unii Europejskiej Październik 2013 Główne zagadnienia dotyczące oporności na antybiotyki przedstawione w prezentowanej broszurze
Dane opracowane ze środków finansowych będących w dyspozycji Ministra Zdrowia w ramach realizacji programu polityki zdrowotnej pn.
Dane opracowane ze środków finansowych będących w dyspozycji Ministra Zdrowia w ramach realizacji programu polityki zdrowotnej pn. Narodowy Program Ochrony Antybiotyków na lata 2016-2020 EARS-Net (do 2010
PAŁECZKI Z RODZAJU KLEBSIELLA IZOLOWANE OD PACJENTÓW ŁÓDZKICH SZPITALI W 2006 ROKU
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 41-46 Izabela Szczerba, Katarzyna Gortat, Karol Majewski PAŁECZKI Z RODZAJU KLEBSIELLA IZOLOWANE OD PACJENTÓW ŁÓDZKICH SZPITALI W 2006 ROKU Zakład Mikrobiologii Lekarskiej
Badanie mikrobiologiczne płynów z jam ciała
Badanie mikrobiologiczne płynów z jam ciała Dorota Olszańska Zakład Diagnostyki Mikrobiologicznej i Immunologii Infekcyjnej USK w Białymstoku Kierownik Prof. Dr hab. n. med. Elżbieta Tryniszewska Cel badań
Odpowiedzi ekspertów EUCAST na pytania najczęściej zadawane przez lekarzy klinicystów i mikrobiologów
Odpowiedzi ekspertów EUCAST na pytania najczęściej zadawane przez lekarzy klinicystów i mikrobiologów Interpretacja klinicznych wartości granicznych oznaczania lekowrażliwości drobnoustrojów zgodnie z
OCENA STOPNIA WRAŻLIWOŚCI NA AMINOGLIKOZYDY SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH IZOLOWANYCH OD CHORYCH Z ZAKAŻENIAMI UKŁADOWYMI I UOGÓLNIONYMI.
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 8, 6: 5-4 Beata Kowalska - Krochmal, Izabela Dolna, Agata Dobosz, Ewa Wrzyszcz, Grażyna Gościniak OCENA STOPNIA WRAŻLIWOŚCI NA AMINOGLIKOZYDY SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH IZOLOWANYCH OD
Podsumowanie najnowszych danych dotyczących oporności na antybiotyki w krajach Unii Europejskiej Dane z monitorowania sieci EARS-Net
EUROPEJSKI DZIEŃ WIEDZY O ANTYBIOTYKACH A European Health Initiative EUROPEJSKIE CENTRUM DS. ZAPOBIEGANIA Podsumowanie najnowszych danych dotyczących oporności na antybiotyki w krajach Unii Europejskiej
Charakterystyka wzorów lekowrażliwości szpitalnych szczepów Clostridium difficile w Polsce oraz badanie mechanizmów oporności na wybrane leki
STRESZCZENIE W JĘZYKU POLSKIM Charakterystyka wzorów lekowrażliwości szpitalnych szczepów Clostridium difficile w Polsce oraz badanie mechanizmów oporności na wybrane leki Clostridium difficile to Gram-dodatnia,
Zalecenia rekomendowane przez Ministra Zdrowia. KPC - ang: Klebsiella pneumoniae carbapenemase
Zalecenia dotyczące postępowania w przypadku identyfikacji w zakładach opieki zdrowotnej szczepów bakteryjnych Enterobacteriaceae wytwarzających karbapenemazy typu KPC * * KPC - ang: Klebsiella pneumoniae
Numer 3/2018. Oporność na antybiotyki w Polsce w 2017 roku dane sieci EARS-Net
AktualnoŚci Narodowego Programu Ochrony Antybiotyków Numer 3/2018 Oporność na antybiotyki w Polsce w 2017 roku dane sieci EARS-Net Opracowanie: dr n. med. Dorota Żabicka, Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
Projekt Alexander w Polsce w latach
Projekt Alexander w Polsce w latach 1996-2008 NaduŜywanie antybiotyków i chemioterapeutyków oraz ich niewłaściwe stosowanie doprowadziło do globalnego zagroŝenia, jakim jest powstawanie i szerzenie się
Oporność na antybiotyki w Unii Europejskiej
Podsumowanie danych z 2014 roku o oporności na antybiotyki w Unii Europejskiej Dane z monitorowania sieci EARS-Net Listopad 2015 Poważne zagrożenie: oporność na antybiotyki w Unii Europejskiej Oporność
Wpływ racjonalnej antybiotykoterapii na lekowrażliwość drobnoustrojów
WOJSKOWY SZPITAL KLINICZNY Wpływ racjonalnej BYDGOSZCZ antybiotykoterapii na lekowrażliwość drobnoustrojów 10 Wojskowy Szpital Kliniczny z Polikliniką SP ZOZ w Bydgoszczy dr n. med. Joanna Sierzputowska
Ochrony Antybiotyków. AktualnoŚci Narodowego Programu. Podsumowanie aktualnych danych nt. oporności na antybiotyki w Unii Europejskiej.
AktualnoŚci Narodowego Programu Ochrony Antybiotyków Numer 3/2016 Podsumowanie aktualnych danych nt. oporności na antybiotyki w Unii Europejskiej. Dane z monitorowania sieci EARS-Net (listopad 2016) Opracowanie:
ESBL-DODATNIE I ESBL-UJEMNE SZCZEPY KLEBSIELLA PNEUMONIAE I KLEBSIELLA OXYTOCA WYSTĘPOWANIE W MATERIALE KLINICZNYM I WRAŻLIWOŚĆ NA WYBRANE ANTYBIOTYKI
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 39-44 Alicja Sękowska, Joanna Wróblewska, Eugenia Gospodarek ESBL-DODATNIE I ESBL-UJEMNE SZCZEPY KLEBSIELLA PNEUMONIAE I KLEBSIELLA OXYTOCA WYSTĘPOWANIE W MATERIALE KLINICZNYM
I. Wykaz drobnoustrojów alarmowych w poszczególnych jednostkach organizacyjnych podmiotów leczniczych.
Instrukcja Głównego Inspektora Sanitarnego dotycząca raportowania występowania zakażeń zakładowych i drobnoustrojów alarmowych z dnia 02 stycznia 2012 r. W celu zapewnienia jednolitego sposobu sporządzania
Monitorowanie oporności w Polsce dane sieci EARS-Net
Monitorowanie oporności w Polsce dane sieci EARS-Net Dorota Żabicka Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii Klinicznej Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. LekowrażliwościDrobnoustrojów, Narodowy Instytut Leków,
Detekcja i identyfikacja drobnoustrojów. oznaczanie lekowrażliwości bakterii
STRESZCZENIE W medycznych laboratoriach mikrobiologicznych do oznaczania lekowrażliwości bakterii stosowane są systemy automatyczne oraz metody manualne, takie jak metoda dyfuzyjno-krążkowa i oznaczanie
Zakład Bakteriologii Narodowego Instytutu Zdrowia Publicznego Państwowego Zakładu Higieny 2
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2013, 65: 39-46 Występowanie i charakterystyka genu aac(6 )-Ib-cr kodującego enzym modyfikujący fluorochinolony u opornych na ciprofloksacynę szczepów Enterobacteriaceae wyizolowanych
Analysis of infectious complications inf children with acute lymphoblastic leukemia treated in Voivodship Children's Hospital in Olsztyn
Analiza powikłań infekcyjnych u dzieci z ostrą białaczką limfoblastyczną leczonych w Wojewódzkim Specjalistycznym Szpitalu Dziecięcym w Olsztynie Analysis of infectious complications inf children with
ZMIANY DO TEKSTU. Rekomendacje doboru testów do oznaczania wraŝliwości bakterii na antybiotyki i chemioterapeutyki 2006 WPROWADZONE W ROKU 2007
Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. LekowraŜliwości Drobnoustrojów Narodowego Instytutu Leków ZMIANY DO TEKSTU Rekomendacje doboru testów do oznaczania wraŝliwości bakterii na antybiotyki i chemioterapeutyki
METODY OZNACZANIA AKTYWNOŚCI ANTYBIOTYKÓW. Podstawowe pojęcia:
METODY OZNACZANIA AKTYWNOŚCI ANTYBIOTYKÓW Zakład Biotechnologii i Inżynierii Genetycznej SUM Podstawowe pojęcia: Antybiotyk substancja o aktywności przeciwdrobnoustrojowej, wytwarzana przez mikroorganizmy,
CENTRALNY OŚRODEK BADAŃ JAKOŚCI
W CENTRALNY OŚRODEK BADAŃ JAKOŚCI W DIAGNOSTYCE MIKROBIOLOGICZNEJ 01-793 Warszawa, ul. Rydygiera 8 bud. 20A, tel./fax (22) 841 58 34; Księgowość-Kadry tel. (22) 841 00 90 fax. (22) 851 52 06 NIP 5212314007
Dane opracowane ze środków finansowych będących w dyspozycji Ministra Zdrowia w ramach realizacji programu polityki zdrowotnej pn.
Dane opracowane ze środków finansowych będących w dyspozycji Ministra Zdrowia w ramach realizacji programu polityki zdrowotnej pn. Narodowy Program Ochrony Antybiotyków na lata 2016-2020 W sieci EARS-Net
18 listopada. Europejski Dzień Wiedzy o Antybiotykach
18 listopada Europejski Dzień Wiedzy o Antybiotykach Dlaczego obchodzimy Europejski Dzień Wiedzy o Antybiotykach? Antybiotyki stały się ofiarą własnego sukcesu. Ich powszechne nadużywanie w leczeniu i
DOTYCZY REGULAMINU OCENY WYNIKÓW SPRAWDZIANÓW POLMICRO
OŚR.ZM.442.1.201.2.00.ES Warszawa, luty 201r. DOTYCZY REGULAMINU OCENY WYNIKÓW SPRAWDZIANÓW POLMICRO Poniżej przedstawiono przykłady ilustrujące ocenę punktową: przykłady I-III - przedstawiają wyniki uzyskane
Harmonogram zajęć z Mikrobiologii z parazytologią i Immunologii dla studentów II roku kierunku lekarskiego WL 2018/2019 GRUPA 5
Harmonogram zajęć z Mikrobiologii z parazytologią i Immunologii dla studentów II roku kierunku lekarskiego WL 2018/2019 GRUPA 5 GRUPY ĆWICZENIOWE 51, 52 : 8.00-10.30 Wtorek: 17.00-19.30 Data Godzina Rodzaj
Nowe definicje klinicznych kategorii wrażliwości wprowadzone przez EUCAST w 2019 roku
Nowe definicje klinicznych kategorii wrażliwości wprowadzone przez EUCAST w 2019 roku Dorota Żabicka Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. LekowrażliwościDrobnoustrojów (KORLD) Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii
Zakład Bakteriologii Narodowego Instytutu Zdrowia Publicznego Państwowego Zakładu Higieny 2
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2012, 64: 211-219 Występowanie genów qnr u niewrażliwych na fluorochinolony pałeczek z rodziny Enterobacteriaceae izolowanych z materiału klinicznego Prevalence of qnr genes in clinical
SHL.org.pl SHL.org.pl
Kontrakty na usługi dla szpitali SIWZ dla badań mikrobiologicznych Danuta Pawlik SP ZOZ ZZ Maków Mazowiecki Stowarzyszenie Higieny Lecznictwa Warunki prawne dotyczące konkursu ofert Ustawa z dnia 15 kwietnia
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
RAPORT 1.1/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA R.
RAPORT 1.1/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA 25.04.2017 R. OCENA SKUTECZNOŚCI MIKROBIOBÓJCZEJ URZĄDZENIA INDUCT 750 FIRMY ACTIVTEK WOBEC PAŁECZEK KLEBSIELLA PNEUMONIAE W POWIETRZU Wykonawcy:
Zakład Mikrobiologii Klinicznej [1]
Zakład Mikrobiologii Klinicznej [1] Dane kontaktowe: Tel. 41 36 74 710, 41 36 74 712 Kierownik: dr n. med. Bonita Durnaś, specjalista mikrobiologii Personel/Kadra: Diagności laboratoryjni: mgr Dorota Żółcińska
1. Wykonanie preparatów bezpośrednich i ich ocena: 1a. Wykonaj własny preparat bezpośredni ze śliny Zinterpretuj i podkreśl to co widzisz:
Ćwiczenie 2 2018/19 1. Wykonanie preparatów bezpośrednich i ich ocena: 1a. Wykonaj własny preparat bezpośredni ze śliny Zinterpretuj i podkreśl to co widzisz: obecność nabłonków, leukocytów, pałeczek Gram(+),
Ampli-LAMP Salmonella species
Novazym Products Novazym Polska ul. Żywokostowa 23, 61-680 Poznań, tel. +48 0 61 610 39 10, fax +48 0 61 610 39 11, email info@novazym.com Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego bakterii z rodzaju
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Wstęp teoretyczny Technika RAPD (ang. Random Amplification of Polymorphic DNA) opiera się na prostej reakcji PCR, przeprowadzanej na genomowym
METODY OZNACZANIA LEKOWRAŻLIWOŚCI DROBNOUSTROJÓW I WYKRYWANIA MECHANIZMÓW OPORNOŚCI NA LEKI MOŻLIWOŚCI TERAPII ZAKAŻEŃ PRZEWODU POKARMOWEGO
WNOZ- DIETETYKA SEMINARIUM 4 METODY OZNACZANIA LEKOWRAŻLIWOŚCI DROBNOUSTROJÓW I WYKRYWANIA MECHANIZMÓW OPORNOŚCI NA LEKI MOŻLIWOŚCI TERAPII ZAKAŻEŃ PRZEWODU POKARMOWEGO Mechanizmy działania chemioterapeutyków
Ocena flory bakteryjnej izolowanej od chorych hospitalizowanych w Szpitalu Wojewódzkim nr 2 w Rzeszowie w latach
Wydawnictwo UR 28 ISSN 173-3524 Przegląd Medyczny Uniwersytetu Rzeszowskiego Rzeszów 29, 1, 7 77 Krzysztof Golec, Łukasz Golec, Jolanta Gruszecka Ocena flory bakteryjnej izolowanej od chorych hospitalizowanych
Wrażliwość pałeczek Klebsiella oxytoca na wybrane antybiotyki
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 59-64 Alicja Sękowska, Kamila Buzała, Justyna Pluta, Eugenia Gospodarek Wrażliwość pałeczek Klebsiella oxytoca na wybrane antybiotyki Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium
WYSTĘPOWANIE I ZRÓŻNICOWANIE GENÓW ODPOWIEDZIALNYCH ZA OPORNOŚĆ NA TETRACYKLINĘ SZCZEPÓW ENTEROCOCCUS FAECALIS IZOLOWANYCH W REGIONIE GDAŃSKIM.
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 13-17 Tomasz Jarzembowski 1), Aleksandra Dybikowska 2) Maria Dąbrowska-Szponar 1) WYSTĘPOWANIE I ZRÓŻNICOWANIE GENÓW ODPOWIEDZIALNYCH ZA OPORNOŚĆ NA TETRACYKLINĘ SZCZEPÓW
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
OPORNOŚĆ NA CIPROFLOKSACYNĘ I TETRACYKLINĘ SZCZEPÓW CAMPYLOBACTER SPP. IZOLOWANYCH Z PRODUKTÓW DROBIARSKICH
BROMAT. CHEM. TOKSYKOL. XLII, 2009, 3, str. 588 592 Elżbieta Maćkiw 1, Katarzyna Rzewuska 1, Katarzyna Tomczuk 1, Dorota Korsak 1,2 OPORNOŚĆ NA CIPROFLOKSACYNĘ I TETRACYKLINĘ SZCZEPÓW CAMPYLOBACTER SPP.
CZĘŚĆ TEORETYCZNA. Pseudomonas sp. Rodzaj Pseudomonas obejmuje 200 gatunków najważniejszy Pseudomonas aerugonosa.
Ćwiczenie 3 CZĘŚĆ TEORETYCZNA 1. Pseudomonas sp. Rodzaj Pseudomonas obejmuje 200 gatunków najważniejszy Pseudomonas aerugonosa. Pseudomonas aeruginosa Epidemiologia - szeroko rozpowszechniony w przyrodzie
- podłoża transportowo wzrostowe..
Ćw. nr 2 Klasyfikacja drobnoustrojów. Zasady pobierania materiałów do badania mikrobiologicznego. 1. Obejrzyj zestawy do pobierania materiałów i wpisz jakie materiały pobieramy na: - wymazówki suche. -
Ćwiczenie 1. Oznaczanie wrażliwości szczepów na metycylinę
XI. Antybiotyki i chemioterpeutyki ćwiczenia praktyczne W przedstawionych ćwiczeniach narysuj i zinterpretuj otrzymane wyniki badań mechanizmów oporności. Opisz rodzaje krążków użytych do badań oraz sposób
S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Diagnostyka mikrobiologiczna. Nie dotyczy. 13 Wykłady: 30 h, ćwiczenia 120h;
Załącznik Nr 3 do Uchwały Senatu PUM 14/2012 S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne Kod modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Nazwa
ETIOLOGIA ZAKAŻEŃ SZPITALNYCH REJESTROWANYCH W SZPITALU UNIWERSYTECKIM NR 2 W BYDGOSZCZY W LATACH
PRACA ORYGINALNA ETIOLOGIA ZAKAŻEŃ SZPITALNYCH REJESTROWANYCH W SZPITALU UNIWERSYTECKIM NR 2 W BYDGOSZCZY W LATACH 2015 2017 ETIOLOGY OF HOSPITAL INFECTIONS REGISTERED IN UNIVERSITY HOSPITAL NO. 2 IN BYDGOSZCZ
Obszar niepewności technicznej oznaczania lekowrażliwościatu w rekomendacjach EUCAST 2019
Obszar niepewności technicznej oznaczania lekowrażliwościatu w rekomendacjach EUCAST 19 Dorota Żabicka Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. LekowrażliwościDrobnoustrojów (KORLD) Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii
STRESZCZENIE CEL PRACY
STRESZCZENIE W ostatnich dekadach nastąpił ogromny wzrost występowania zakażeń szpitalnych wywołanych przez Acinetobacter baumannii. Zdecydowany postęp medycyny wraz ze stosowanymi inwazyjnymi zabiegami
Instytut Genetyki i Mikrobiologii UW we Wrocławiu Kierownik: prof. dr hab. W. Doroszkiewicz 2
MED. DOŚW. MIKOBIOL., 28, 6: - Kamila Korzekwa,2, Dorota Wojnicz 3, Włodzimierz Doroszkiewicz, Stanisław Jankowski 3 WYSTĘPOWANIE I LEKOOPONOŚĆ PAŁECZEK NIEFEMENTUJĄCYCH IZOLOWANYCH OD PACJENTÓW HOSPITALIZOWANYCH
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji
Justyna Krystyna Ciepły Nr albumu 41624. Charakterystyka lekoopornych szczepów wirusa HIV 1 izolowanych w Polsce w 2008 roku
Warszawski Uniwersytet Medyczny Wydział Farmaceutyczny Oddział Analityki Medycznej Justyna Krystyna Ciepły Nr albumu 41624 Charakterystyka lekoopornych szczepów wirusa HIV 1 izolowanych w Polsce w 2008
Podsumowanie europejskiego badania nt. rozpowszechnienia bakterii opornych na karbapenemy. Podsumowanie. Projekt EuSCAPE
Podsumowanie europejskiego badania nt. rozpowszechnienia bakterii opornych na karbapenemy Październik 2013 Podsumowanie Celem Europejskiego Badania nt. Rozpowszechnienia Pałeczek Enteriobacteriaceae Wytwarzających
Znaczenie pomp efflux w wielolekowej oporności Gram-ujemnych bakterii. Significance of efflux pumps in multidrug resistance of Gram-negative bacteria
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2015, 67: 55-62 Znaczenie pomp efflux w wielolekowej oporności Gram-ujemnych bakterii Significance of efflux pumps in multidrug resistance of Gram-negative bacteria Olga Wiercińska
Ocena lekowrażliwości szczepów Enterobacter sp. izolowanych z moczu
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 225-233 Anna Michalska, Paulina Dziurkowska, Eugenia Gospodarek Ocena lekowrażliwości szczepów Enterobacter sp. izolowanych z moczu Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium
Oporność na ciprofloksacynę szczepów Neisseria gonorrhoeae izolowanych w Polsce w latach
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: 99-104 Oporność na ciprofloksacynę szczepów Neisseria gonorrhoeae izolowanych w Polsce w latach 2012-2013 Resistance to ciprofloxacin of Neisseria gonorrhoeae strains isolated
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków)
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków) Celem ćwiczenia jest wprowadzenie mutacji punktowej do genu
Nowoczesna diagnostyka mikrobiologiczna
Nowoczesna diagnostyka mikrobiologiczna 1 2 Nowoczesne laboratorium mikrobiologiczne połączenie metod manualnych i automatyzacji Nowoczesne laboratorium mikrobiologiczne To nie tylko sprzęt diagnostyczny,
SZCZEPY SALMONELLA SP. OPORNE NA LEKI PRZECIWBAKTERYJNE
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 37-42 Agata Białucha, Sylwia Kożuszko, Eugenia Gospodarek SZCZEPY SALMONELLA SP. OPORNE NA LEKI PRZECIWBAKTERYJNE Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium Medicum im. L.
z dnia 11 marca 2005 r. (Dz. U. z dnia 3 kwietnia 2005 r.)
Dz.U.05.54.484 ROZPORZĄDZENIE MINISTRA ZDROWIA z dnia 11 marca 2005 r. w sprawie rejestrów zakażeń zakładowych oraz raportów o występowaniu tych zakażeń (Dz. U. z dnia 3 kwietnia 2005 r.) Na podstawie
Wkwietniu 2011 r. Europejski Urząd
Oporność na antybiotyki wybranych bakterii zoonotycznych i wskaźnikowych izolowanych w krajach Unii Europejskiej w 2009 r. Kinga Wieczorek, Jacek Osek z Zakładu Higieny Żywności Pochodzenia Zwierzęcego
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane
Słowa kluczowe: żółć, złogi żółciowe, kamica żółciowa, zakażenie żółci, bakterie.
\ =fi /ą4-* f f l.ui.m9 hi#oad Streszczenie Słowa kluczowe: żółć, złogi żółciowe, kamica żółciowa, zakażenie żółci, bakterie. Wstęp Kamica żółciowa jest szeroko rozpowszechnioną chorobą. Szacuje się, że
AmpliTest Babesia spp. (PCR)
AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:
OCENA AKTYWNOŚCI DORIPENEMU WOBEC PAŁECZEK Z RODZAJÓW PSEUDOMONAS SP. I ACINETOBACTER SP.
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 367-374 Tomasz Bogiel, Aleksander Deptuła, Eugenia Gospodarek OCENA AKTYWNOŚCI DORIPENEMU WOBEC PAŁECZEK Z RODZAJÓW PSEUDOMONAS SP. I ACINETOBACTER SP. Katedra i Zakład
AKTUALNOÂCI BINET. Nr 10/ Drogie Koleżanki i Koledzy. Inwazyjna choroba meningokokowa w 2015 roku
www.koroun.edu.pl Drogie Koleżanki i Koledzy Witamy serdecznie, oddajemy w Państwa ręce kolejny numer Aktualności BINet. Jest on poświęcony epidemiologii inwazyjnych zakażeń wywoływanych przez Neisseria
OPORNOŚĆ SZCZEPÓW PSEUDOMONAS AERUGINOSA NA KARBAPENEMY PO INKUBACJI Z SUBINHIBICYJNYMI STĘŻENIAMI IMIPENEMU I MEROPENEMU
Nowiny Lekarskie 2011, 80, 4, 258 265 PAWEŁ SACHA 1, PIOTR WIECZOREK 1, DOMINIKA OJDANA 1, SŁAWOMIR CZABAN 2, DOROTA OLSZAŃ- SKA 3, ELŻBIETA TRYNISZEWSKA 1, 3 OPORNOŚĆ SZCZEPÓW PSEUDOMONAS AERUGINOSA NA
Pałeczki jelitowe Enterobacteriaceae wytwarzające karbapenemazy (CPE) w Polsce sytuacja w 2016
Pałeczki jelitowe Enterobacteriaceae wytwarzające karbapenemazy (CPE) w Polsce sytuacja w 206 Autorzy Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii Klinicznej NIL: Dorota Żabicka Katarzyna Bojarska Małgorzata Herda
Nazwa i typ aparatu:.. Lp. Opis parametru Kryterium Parametr wymagany
Załącznik nr 3. Aparat do detekcji wzrostu drobnoustrojów z krwi i płynów ustrojowych Parametry graniczne. Nazwa i typ aparatu:.. Lp. Opis parametru Kryterium Parametr wymagany Parametr oferowany 1 Hodowla
Elżbieta Arłukowicz Streszczenie rozprawy doktorskiej
Elżbieta Arłukowicz Streszczenie rozprawy doktorskiej Analiza zmienności ilościowej i jakościowej tlenowej flory bakteryjnej izolowanej z ran przewlekłych kończyn dolnych w trakcie leczenia tlenem hiperbarycznym
Zadanie pytania klinicznego (PICO) Wyszukanie i selekcja wiarygodnej informacji. Ocena informacji o metodzie leczenia
Praktykowanie EBM Krok 1 Krok 2 Krok 3 Krok 4 Zadanie pytania klinicznego (PICO) Wyszukanie i selekcja wiarygodnej informacji Ocena informacji o metodzie leczenia Podjęcie decyzji klinicznej na podstawie
PL 217144 B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego
PL 217144 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 217144 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 391926 (22) Data zgłoszenia: 23.07.2010 (51) Int.Cl.
Ampli-LAMP Babesia canis
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400
RAPORT 1.2/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA R.
RAPORT 1.2/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA 25.04.2017 R. OCENA SKUTECZNOŚCI MIKROBIOBÓJCZEJ URZĄDZENIA INDUCT 750 FIRMY ACTIVTEK WOBEC BAKTERII Z RODZAJU ENTEROCOCCUS W POWIETRZU Wykonawcy:
SHL.org.pl SHL.org.pl
Polityka antybiotykowa w oddziale pediatrycznym Adam Hermann Zespół Kontroli Zakażeń Szpitalnych Stowarzyszenie Higieny Lecznictwa Fundacja Instytut Profilaktyki Zakażeń Adam Hermann Stare Jabłonki 05-07.10.2014r.
ENTEROCOCCUS SP. OPORNE NA WANKOMYCYNĘ
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 351-357 Sylwia Kożuszko, Tomasz Bogiel, Eugenia Gospodarek ENTEROCOCCUS SP. OPORNE NA WANKOMYCYNĘ Katedra i Zakład Mikrobiologii Collegium Medicum w Bydgoszczy Uniwersytetu
Warszawa, dnia 3 sierpnia 2016 r. Poz. 1173
Warszawa, dnia 3 sierpnia 2016 r. Poz. 1173 ROZPORZĄDZENIE MINISTRA ŚRODOWISKA 1) z dnia 18 lipca 2016 r. w sprawie określenia wzorów wniosków oraz zgłoszeń związanych z zamkniętym użyciem mikroorganizmów
Strategia zapobiegania lekooporności
Strategia zapobiegania lekooporności Dorota Żabicka Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. Lekowrażliwości Drobnoustrojów, Narodowy Instytut Leków, Warszawa Oporność na antybiotyki wyzwanie naszych czasów Deklaracja
MOLEKULARNE PODSTAWY ODPORNOŚCI MIOTŁY ZBOŻOWEJ (APERA SPICA-VENTI L.) NA HERBICYDY SULFONYLOMOCZNIKOWE
Progress in Plant Protection / Postępy w Ochronie Roślin, 47 (3) 2007 MOLEKULARNE PODSTAWY ODPORNOŚCI MIOTŁY ZBOŻOWEJ (APERA SPICA-VENTI L.) NA HERBICYDY SULFONYLOMOCZNIKOWE MICHAŁ KRYSIAK 1, MAGDALENA
Zagadnienia egzaminacyjne z przedmiotu Mikrobiologia kosmetologiczna dla studentów II roku kierunku Kosmetologia
Zagadnienia egzaminacyjne z przedmiotu Mikrobiologia kosmetologiczna dla studentów II roku kierunku Kosmetologia I. Zagadnienia omawiane na wykładach. Uzupełnieniem zagadnień omawianych na wykładach są
Genetyka, materiały dla studentów Pielęgniarstwa
Markery genetyczne: definicja Marker genetyczny jest to cecha, która może być wykorzystana do identyfikacji osobników lub gatunków. Cechy markerów genetycznych Monogeniczny: warunkowany przez jeden gen
Assessment of susceptibility of strictly anaerobic bacteria originated from different sources to fluoroquinolones and other antimicrobial drugs
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2012, 64: 115-122 Ocena wrażliwości szczepów bezwzględnych beztlenowców pochodzących z różnych źródeł na fluorochinolony oraz inne leki stosowane w lecznictwie szpitalnym Assessment
Zakład Mikrobiologii Stosowanej RUPA BADAWCZA FIZJOLOGIA BAKTERII
http://zms.biol.uw.edu.pl/ Zakład Mikrobiologii Stosowanej RUPA BADAWCZA FIZJOLOGIA BAKTERII 2018-2019 LIDERZY ZESPOŁÓW dr hab. Magdalena Popowska, prof. UW (p. 420A), IV Piętro, Instytut Mikrobiologii
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
Mutacje w genie pnca jako główny mechanizm oporności na pirazynamid wśród prątków gruźlicy**
Postępy Nauk Medycznych, t. XXVIII, nr 4, 05 Borgis *Agnieszka Napiórkowska, Zofia Zwolska, Ewa Augustynowicz-Kopeć Mutacje w genie pnca jako główny mechanizm oporności na pirazynamid wśród prątków gruźlicy**
Mikrobiologia - Bakteriologia
Mikrobiologia - Bakteriologia 5050 Bezpośrednie barwienie bakteriologiczne (sprawdzian wirtualny) Kwiecień, październik 3-9 zdjęć cyfrowych preparatów bezpośrednio wybarwionych, prezentowane na stronie
Wrażliwość na antybiotyki bakterii izolowanych z moczu chorych leczonych w oddziale dziecięcym
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 231-236 Elżbieta Justyńska 1,Anna Powarzyńska 1,Jolanta Długaszewska 2 Wrażliwość na antybiotyki bakterii izolowanych z moczu chorych leczonych w oddziale dziecięcym 1
PRACE ORYGINALNE. Centralne Laboratorium Mikrobiologiczne Szpitala Klinicznego im. H. Święcickiego w Poznaniu Kierownik: dr nauk farm. H.
PRACE ORYGINALNE Narastanie oporności Pseudomonas aeruginosa Problematyka narastania oporności Pseudomonas aeruginosa u pacjentów hospitalizowanych w Klinice Otolaryngologii i Onkologii Laryngologicznej
Ochrony Antybiotyków. AktualnoŚci Narodowego Programu
AktualnoŚci Narodowego Programu Ochrony Antybiotyków Numer 2/2014 Raport Światowej Organizacji Zdrowia nt. Oporności Drobnoustrojów (kwiecień 2014) wybrane najważniejsze wnioski nt. monitorowania antybiotykooporności
Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
HARMONOGRAM ZAJĘĆ dla studentów Uniwersyteckiego Centrum Medycyny Weterynaryjnej UJ-UR Mikrobiologia weterynaryjna II rok 2016/2017 semestr letni
HARMONOGRAM ZAJĘĆ dla studentów Uniwersyteckiego Centrum Medycyny Weterynaryjnej UJ-UR Mikrobiologia weterynaryjna II rok 2016/2017 semestr letni Seminaria sala wykładowa Katedry Mikrobiologii (II piętro),
HARMONOGRAM ZAJĘĆ dla studentów Uniwersyteckiego Centrum Medycyny Weterynaryjnej UJ-UR Mikrobiologia weterynaryjna II rok 2017/2018 semestr letni
HARMONOGRAM ZAJĘĆ dla studentów Uniwersyteckiego Centrum Medycyny Weterynaryjnej UJ-UR Mikrobiologia weterynaryjna II rok 2017/2018 semestr letni GRUPA I Poniedziałek: 14.30-16.45 (z wyjątkiem 4.06.2018
Antybiotykooporno szczepów bakteryjnych izolowanych od ryb ososiowatych z gospodarstw na terenie Polski
Antybiotykooporno szczepów bakteryjnych izolowanych od ryb ososiowatych z gospodarstw na terenie Polski AGNIESZKA P KALA Zak ad Chorób Ryb Pa stwowy Instytut Weterynaryjny - Pa stwowy Instytut Badawczy
10) istotne kliniczne dane pacjenta, w szczególności: rozpoznanie, występujące czynniki ryzyka zakażenia, w tym wcześniejsza antybiotykoterapia,
Załącznik nr 2 Standardy jakości w zakresie mikrobiologicznych badań laboratoryjnych, w tym badań technikami biologii molekularnej, oceny ich jakości i wartości diagnostycznej oraz laboratoryjnej interpretacji