Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec. Cz. I
|
|
- Gabriela Kalinowska
- 9 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec. Cz. I Wiadomości Zootechniczne, R. L (2012), 1: Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec. Cz. I Grzegorz Smołucha, Agata Piestrzyńska-Kajtoch, Barbara Rejduch Instytut Zootechniki Państwowy Instytut Badawczy, Dział Cytogenetyki i Genetyki Molekularnej Zwierząt, Balice k. Krakowa C echy produkcyjne u zwierząt gospodarskich to generalnie cechy ilościowe, dziedziczone poligenicznie. W konsekwencji, postęp genetyczny w polepszaniu produkcyjności zwierząt hodowlanych może być powolny. Z tego względu, identyfikacja genów głównych dla cech produkcyjnych ma istotne znaczenie i może przyczynić się do zwiększenia tempa genetycznego ulepszania tych cech. Poszukiwania genów kandydujących, odpowiedzialnych za cechy produkcyjne u owiec, koncentrują się głównie wokół płodności (Davis i in., 1991). W ostatnich latach wiele badań nad płodnością owiec (Ovis aries) wykazało, że częstość owulacji i liczba młodych w miocie mogą być genetycznie regulowane przez grupę różnych genów, nazywanych ogólnie genami płodności (z ang. fecundity Fec genes) (Davis, 2004, 2005; Polley i in., 2010). Szczególną uwagę naukowców zwróciły trzy geny: receptor białka morfogenetycznego kości (ang. bone morphogenetic protein receptor type 1B BMPR1B), nazywany też activin-like kinase 6 (ALK6), białko morfogenetyczne kości (ang. bone morphogenetic protein 15 BMP15), znany również jako czynnik wzrostu i różnicowania 9B (ang. growth differentiation factor 9B GDF9B) oraz czynnik wzrostu i różnicowania 9 (ang. growth differentiation factor 9 GDF9), których produkty wpływały znacząco, poprzez różne mechanizmy, na częstość owulacji i liczbę młodych w miocie (Vacca i in., 2010). Geny te kodują białka należące do rodziny transformujących czynników wzrostu beta (ang. transforming growth factor β TGFβ) (Fabre i in., 2006). Białka pochodzące z tej rodziny odgrywają znaczącą rolę podczas embriogenezy u ssaków, płazów i owadów; biorą również udział w rozwoju kości, gojeniu ran, hematopoezie i wywoływaniu stanów zapalnych (Winnier i in., 1995; Hogan, 1996; Letterio i Roberts, 1998; Massague, 1998). Pełnią one istotną rolę w procesach rozrodczych u ssaków razem z czynnikami wzrostu GDF9 i GDF9b (BMP15) (wykazującymi ekspresję w oocytach) (Laitinen i in., 1998; Aaltonen i in., 1999; Elvin i in., 2000) oraz receptorami BMP (podlegającymi ekspresji w jajnikach) (Shimasaki i in., 1999). Cechą charakterystyczną białek należących do rodziny TGF-β jest konserwatyzm w budowie protein prekursorowych (rys. 1). Każde białko prekursorowe zawiera peptyd sygnalny, prodomenę oraz sekwencję dojrzałą, w której skład wchodzi 7 reszt cysteinowych (za wyjątkiem białka BMP15, gdzie czwarta cysteina zostaje zastąpiona seryną a dimery są tworzone przez niekowalencyjne połączenie pomiędzy podjednostkami BMP15). Reszty cysteinowe tworzą trzy mostki disiarczkowe, natomiast siódma reszta cysteinowa pozostaje wolna i odpowiada za parowanie z drugą cząsteczką białka i tworzenie homo- bądź heterodimerów (Rybak-Krzyszkowska i in., 2004; Shimasaki i in., 2004). Prace przeglądowe 21
2 G. Smołucha i in. Rys. 1. Struktura prekursorowego białka, należącego do rodziny TGF-β, zawierającego sekwencję sygnalną, prodomenę z motywem RXXR (rozpoznawany przez enzymy proteolityczne) i sekwencję dojrzałą, zawierającą siedem konserwatywnych cystein (z wyjątkiem białek BMP15 i GDF9) (wg Bottner i in., 2000; Lin i in., 2003) Fig. 1. Structure of TGF-β precursor protein containing a signal sequence, prodomain with the RXXR motif (recognized by proteolytic enzymes) and a mature domain with seven conserved cysteines (except the BMP15 and GDF9 proteins) (after Bottner at al., 2000; Lin at al., 2003) BMPs (bone morphogenetic proteins) są wielofunkcyjnymi białkami, kontrolującymi w tkankach rozrodczych ważne biologicznie procesy, takie jak proliferacja, różnicowanie komórek i apoptoza (Shimasaki i in., 2004). U ludzi (Dube i in., 1998; Aaltonen i in., 1999), myszy (Dube i in., 1998; Laitinen i in., 1998) i owiec gen BMP-15 został zlokalizowany na chromosomie X (Galloway i in., 2000). Kodujący region tego genu jest homologiczny w 82,9% z ludzkim, w 78,8% z mysim i w 78,4% ze szczurzym genem BMP15. Owczy gen BMP15 składa się z 2 egzonów oddzielonych od siebie intronem o długości około 5,4 kpz (Galloway i in., 2000), a pełna długość kodującej sekwencji to 1179 pz. Gen BMP15 koduje niedojrzałe białko o długości 393 aminokwasów, poprzedzone peptydem sygnalnym o długości 25 aminokwasów, natomiast aktywna forma peptydu BMP15 zawiera 125 aminokwasów (Galloway i in., 2000). Potranslacyjna obróbka jest ważna dla sekrecji biologicznie aktywnej formy peptydu, dlatego wszystkie geny należące do rodziny TGFβ podlegają translacji jako duże prepropeptydy. Po usunięciu peptydu sygnalnego propeptyd podlega dimeryzacji. W miarę trwania procesu, specyficzne enzymy proteolityczne rozdzielają zdimeryzowane proproteiny w miejscu, w którym znajduje się motyw RXXR, oddzielający proregion od dojrzałego biologicznie aktywnego regionu. W rezultacie otrzymujemy dojrzałe, biologicznie czynne białko (Shimasaki i in., 2004). Badania przeprowadzone przez Galloway i in. (2000) na różnych tkankach pochodzących od owiec, mające na 22 celu oznaczenie ekspresji genu BMP15 metodą northern-blot, dowiodły występowania 2,7 kpz transkryptu tylko w tkankach pochodzących z jajników. W dalszych badaniach w oparciu o metodę hybrydyzacji in-situ ten sam autor ujawnił, że mrna genu BMP15, pobrane z wnętrza jajników, znajduje się wyłącznie w oocytach, a do ekspresji dochodzi już w stadium pęcherzyków pierwotnych (Galloway i in., 2000). Badania nad reprodukcją skoncentrowały się na roli oocytu w regulacji folikulogenezy, a w szczególności na identyfikacji czynnika wytwarzanego przez oocyty, który moduluje wzrost i rozwój pęcherzyków jajnikowych. W tym kontekście Otsuka i in. (2000 a,b, 2001, 2002), badając rekombinowany ludzki gen BMP15 odkryli, że pełni on ważną biologiczną rolę w komórkach ziarnistych szczura. Jest silnym stymulatorem mitozy, proliferacji i w komórkach ziarnistych działa silnie stymulująco na ekspresję mrna KITLG (KIT ligand), który jest niezbędny do wczesnego wzrostu pęcherzyka jajnikowego. BMP15 jest częścią ujemnego sprzężenia zwrotnego pomiędzy oocytem a komórkami ziarnistymi. Promuje ekspresję kit ligandu, a kit ligand działa z kolei jako supresor ekspresji BMP15 w oocycie. Prawdopodobnie dysfunkcja jajników, obserwowana u owiec, noszących homozygotyczną mutację w genie BMP15 i kobiet, noszących tę samą mutację, jest związana z utratą aktywności BMP15 w regulowaniu niezbędnych i ważnych procesów we wczesnym wzroście i rozwoju pęcherzyków jajnikowych. BMP15 nie posiada bezpośredniego wpływu na produkcję steroidów przez komórki ziarniste, ma Prace przeglądowe
3 Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec. Cz. I silne działanie na hamowanie FSH zależnej syntezy progesteronu, ale nie wpływa na indukowaną FSH syntezę estradiolu. Dowodzi to ważnej fizjologicznej funkcji, jaką pełni BMP15 w promowaniu wczesnego wzrostu i rozwoju pęcherzyków jajnikowych poprzez zapobieganie ich przedwczesnej luteinizacji. Późniejsze badania dowiodły, że komórkowy mechanizm inhibicji syntezy progesteronu zależnej od FSH jest prowadzony przez supresję ekspresji mrna receptora FSH przez BMP15. Konsekwentnie, indukowana FSH ekspresja mrna białka wrażliwego na steroidy (StAR), P450scc, dehydrogenazy 3β hydroksysteroidowej, receptora LH i podjednostki inhibiny i aktywiny jest również blokowana przez BMP15. Zmiany w sekwencji nukleotydowej w powiązanym ze sprzężonym chromosomem X genie BMP15 zostały jako pierwsze zaobserwowane u owiec rasy Romney w Nowej Zelandii. Występują one również u innych ras, jak np. Belclare i Cambridge w Irlandii i Wielkiej Brytani (Davis, 2005). Jak dotąd, sześć niezależnych od siebie mutacji w genie BMP-15 (tab. 1) zostało powiązanych ze zwiększoną częstotliwością owulacji u heterozygotycznych owiec oraz bezpłodnością u homozygot (Galloway i in., 2000; Hanrahan i in., 2004; Bodin i in., 2007). Owce heterozygotyczne pod względem genu FecX, noszące mutację FecX I (Inverdale, V31*D), FecX H (Hanna, Q23*Ter), FecX B (Belclare, S99*I), FecX G (Q239 + Ter) czy FecX L (Lacaune, C53*Y), wykazują jedną do dwóch dodatkowych owulacji w porównaniu z osobnikami nie posiadającymi tej mutacji. Mutacje występujące w allelach FecX I, FecX L, FecX B powodowały nie konserwatywną substytucję w sekwencji aminokwasów, odpowiednio w pozycji 31., 53. i 99. dojrzałej proteiny BMP-15. Osobniki posiadające mutacje w allelach FecX I i FecX B wykazują taki sam fenotyp (*-pozycja aminokwasów w sekwencji dojrzałego białka, +pozycja aminokwasów w niedojrzałej sekwencji białka) jak owce z allelami FecX G i FecX H, pomimo że mutacje w allelach FecX G i FecX H wprowadzają kodon stop w pozycji 239 lub 291 niedojrzałego białka BMP-15 i oczywiście nierówność w produkcji biologicznie aktywnych form (Bodin i in., 2007). W kodującym regionie genu BMP-15 tranzycja G>A (pozycja 1196 w ORF) odpowiada za powstanie allelu FecX L. U homozygot FecX L / FecX L, podobnie jak u owiec z allelem Inverdale, pęcherzyki jajnikowe zatrzymywały się na pierwotnym stadium rozwoju. Allel Allele Zmiana nukleotydów Base change Tabela 1. Polimorfizm w genie BMP15 (wg McNatty i in., 2005) Table 1. Polymorphisms in the BMP15 gene (after McNatty i in., 2005) Pozycja w niedojrzałym białku (aa) Coding residue (aa) Pozycja w dojrzałym białku (aa) Mature peptide residue (aa) Zmiana aminokwasu Amino acid change FecX G C T 239 Q stop FecX B G T S I FecX I T A V N FecX H C T E stop FecX L G A C Y FecX R del 17pz del WVQKSP Prace przeglądowe 23
4 G. Smołucha i in. Ostatnio udokumentowaną, szóstą mutacją FecX R w genie BMP15 jest 17-nukleotydowa delecja w 2 egzonie, która prowadzi do zmiany sekwencji aminokwasów i powstania kodonu stop (Martinez-Royo i in., 2008). Z dostępnych danych wynika, że obecność tych wszystkich mutacji indukuje utratę aktywności BMP-15. Prowadzi to do zwiększenia częstości owulacji lub może powodować bezpłodność. Brak obecności mutacji FecX I u plennej owcy olkuskiej wykazał Davis (2004). W badaniach tych nie znalazł on mutacji Inverdale w obrębie genu BMP15. Konieczne jest przeprowadzenie kolejnych badań w celu wykrycia polimorfizmów SNP, które dodatnio wpływają na płodność u owiec tej rasy. Kolejnym genem, należącym do białkowej rodziny TGF-β jest BMPR 1B (bone morphogenetic protein receptor 1B) FecB. Fenotyp Booroola, charakteryzujący się zwiększoną liczbą jagniąt w miocie, został po raz pierwszy wyselekcjonowany ze specyficznej linii Merynosa australijskiego. Późniejsze badania, przeprowadzone na owcach posiadających gen FecB potwierdziły, że podlega on segregacji jak pojedyncze autosomalne locus (Davis i in., 1982; Piper i Bindon, 1982). Gen FecB jest zlokalizowany na chromosomie 6 u owcy (Montgomery i in., 1993), pomiędzy genami SPP1 i EGF. Region ten jest homologiczny do ludzkiego chromosomu 4q22-23 (Montgomery i in., 1993), który zawiera gen bone morphogenetic protein receptor 1B (BMPR1B). BMPR1B składa się z 10 egzonów i był pierwszym genem głównym odpowiedzialnym za płodność, zidentyfikowanym u owiec. Allel FecB B został po raz pierwszy zanotowany u Merynosa Booroola i powstaje w wyniku mutacji punktowej w pozycji 746 genu receptora białka morfogenetycznego kości (BMPR1B). Mutacja ta prowadzi do zastąpienia argininy kwasem glutaminowym (Q249R) w wysoko konserwatywnym regionie wewnątrzkomórkowej domeny kinazy 6. Stąd, w literaturze operuje się nazwą ALK-6 (activin like kinase 6) (Young i in., 2008). Owce dziedziczące jeden allel genu FecB B /FecB Booroola od któregokolwiek z rodziców produkują około 1,5 oocytu więcej i dają jedno dodatkowe jagnię w miocie. Osobniki, będące homozygotami FecB B /FecB B produkują dodatkowo około 3 dodatkowe oocyty, czego rezultatem jest dodatkowo około 1,5 jagnięcia na wykot (Davis, 2005). Wzrost częstości owulacji u osobników noszących mutacje w genie FecB, przeciwieństwie do owiec nie posiadających mutacji, jest powiązany z wczesnym dojrzewaniem dużej liczby pęcherzyków antralnych, które owulują z mniejszych pęcherzyków (Fabre i in., 2006). Mutacja w genie BMPR1B jest rozpowszechniona u owiec azjatyckich, włączając w to Indian Garole, Javanese, Thin-tail i Chinese Hu i Han, jak również Merynosa Booroola, lecz wydaje się być nieobecna u płodnych ras europejskich (Notter, 2008). Dowodzą tego badania, mające na celu poszukiwanie mutacji w genie FecB, przeprowadzone przez Davisa (2005) na plennej owcy olkuskiej. Poszukiwania nie wykazały mutacji w obrębie genu FecB. W ostatnich latach zbadano wiele aspektów funkcjonowania genu FecB, w tym: endokrynologię reprodukcji (Smith i in., 1993), rozwój jajników (Cognie i in., 1998), wielkość miotu, rozwój organów i masę ciała zwierząt nosicieli tej mutacji (Smith i in., 1993). Gen ten ma dodatni wpływ na wielkość miotu i częstość owulacji, a negatywny na wzrost i rozwój płodu owcy oraz na masę ciała podczas dojrzewania (McNatty i in., 1995). Identyfikacja mutacji FecB jest znacząca dla hodowli owiec i jest również obiektem zainteresowania naukowców zajmujących się płodnością u ssaków. Podsumowanie Badania prowadzone na wysokoplennych rasach owiec dowodzą, że cechy reprodukcyjne tych zwierząt mają podłoże genetyczne. Znane mutacje w głównych genach odpowiedzialnych za płodność mogą być skutecznym markerem do poprawy płodności u tego gatunku. Wzrost ilości jagniąt w miocie może przyczynić się do wzrostu opłacalności hodowli owiec zarówno w Polsce, jak i na świecie. Poprzez przeprowadzenie badań i określoną selekcję jesteśmy w stanie kontrolować cechy reprodukcyjne pożądane przez hodowców. Jednakże, nie we wszystkich rasach owiec znane mutacje w genach odpowiadają za płodność i plenność, dlatego wciąż poszukuje się genów kandydujących, które mogą regulować cechy reprodukcyjne u owiec. 24 Prace przeglądowe
5 Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec. Cz. I Literatura Aaltonen J., Laitinen M.P., Vuojolainen K., Jaatinen R., Horelli-Kuitunen N., Seppa L., Louhio H., Tuuri T., Sjoberg J., Butzow R., Hovatta O., Dale L., Ritvos O. (1999). Human growth differentiation factor 9 (GDF-9) and its novel homolog GDF-9B are expressed in oocytes during early folliculogenesis. J. Clin Endocrinol. Metab., 84: Bodin L., Pasquale E. di, Fabre S., Bontoux M., Monget P., Persani L., Mulsant P. (2007). A novel mutation in the bone morphogenetic protein 15 gene causing defective protein secretion is associated with both increased ovulation rate and sterility in Lacaune sheep. Endocrinology, 148: Bottner M., Krieglstein K., Unsicker K. (2000). The transforming growth factor-bs: structure, signaling, and roles in nervous system development and functions. J Neurochem., 75: Cognie Y., Benoit F., Poulin N., Khatir H., Driancourt M.A. (1998). Effect of follicle size and of the FecB Booroola gene on oocyte function in sheep. J. Reprod. Fertil., 2 : Davis G.H. (2004). Fecundity genes in sheep. Anim. Reprod. Sci., 82 83: Davis G.H. (2005). Major genes affecting ovulation rate in sheep. Gen. Sel. Evol., 37: p. 11. Davis G.H., Montgomery G.W., Allison A.J., Kelly R.W., Bray A.R. (1982). Segregation of a major gene influencing fecundity in progeny of Booroola sheep. NZ J. Agric Res., 25: Dube J.L., Wang P., Elvin J., Lyons K.M., Celeste A.J., Matzuk M.M. (1998). The bone morphogenetic protein 15 gene is X-linked and expressed in oocytes. Mol. Endocrinol., 12: Elvin J.A., Yan C., Matzuk M.M. (2000). Oocyteexpressed TGF-beta superfamily members in female fertility. Mol. Cell Endocrinol., 159: 1 5. Fabre S., Pierre A., Mulsant P., Bodin L., Pasquale E. di i in. (2006). Regulation of ovulation rate in mammals: Contribution of sheep genetic models. Reprod. Biol. Endocrin., 4: 20. Galloway S.M., McNatty K.P., Cambridge L.M. i in. (2000). Mutations in an oocyte-derived growth factor gene (BMP15) cause increased ovulation rate and infertility in a dosage-sensitive manner. Nat Genet., 25: Hanrahan J.P., Gregan S.M., Mulsant P., Mullen M., Davis G.H., Powell R., Galloway S.M. (2004). Mutations in the genes for oocyte-derived growth factors GDF9 and BMP15 are associated with both increased ovulation rate and sterility in Cambridge and Belclare sheep (Ovis aries). Biol Reprod., 70: Hogan B.L. (1996). Bone morphogenetic proteins: multifunctional regulators of vertebrate development. Gene Dev., 10: Laitinen M., Vuojolainen K., Jaatinen R., Ketola I., Aaltonen J., Lehtonen E., Heikinheimo M., Ritvos O. (1998). A novel growth differentiation factor-9 (GDF-9) related factor is co-expressed with GDF-9 in mouse oocytes during folliculogenesis. Mech. Devevelop., 78: Letterio J.J., Roberts A.B. (1998). Regulation of immune responses by TGF-beta. Ann. Rev. Immunol., 16: Lin S.Y., Morrison J.R., Phillips D.J., Kretser D.M. de (2003). Regulation of ovarian function by the TGF-beta superfamily and follistatin. Reproduction, 126: Martinez-Royo A., Jurado J.J., Smulders J.P., Marti J.I., Alabart J.L., Roche A., Fantova E., Bodin L., Mulsant P., Serrano M., Folch J., Calvo J.H. (2008). A deletion in the bone morphogenetic protein 15 gene causes sterility and increased prolificacy in Rasa Aragonesa sheep. Anim. Genet., 39 (3): Massague J. (1998). TGF-beta signal transduction. Ann. Rev. Biochem., 67: McNatty K.P., Smith P., Hudson N.L., Heath D.A., Tisdall D.J.S., Brawtal R. (1995). Development of the sheep ovary during fetal and early neonatal life and the effect of fecundity genes. J. Reprod. Fertil., S., 49: McNatty K.P., Smith P., Moore L.G., Reader K., Lun S., Hanrahan J.P., Groome N.P., Laitinen M., Ritvos O., Juengel J.L. (2005). Oocyte-expressed genes affecting ovulation rate. Mol. Cell Endocrinol., 234 (1 2): Montgomery G.W., Crawford A.M., Penty J.M., Prace przeglądowe 25
6 G. Smołucha i in. Dodds K.G., Ede A.J., Henry H.M., Pierson C.A., Lord E.A., Galloway S.M., Schmack A.E., Sise J.A., Swarbrick P.A., Hanrahan V., Buchanan F.C., Hill D.F. (1993). The ovine Booroola fecundity gene (FecB) is linked to markers from a region of human chromosome 4q. Nat. Genet., 4: Notter D.R. (2008). Genetic aspects of reproduction in sheep. Reprod. Domest. Anim., 43 (2): Otsuka F., Yamamoto S., Erickson G.F., Shimasaki S. (2000 a). Bone morphogenetic protein-15 inhibits follicle-stimulating hormone (FSH) action by suppressing FSH receptor expression. J. Biol. Chem., 276 (14): Otsuka F., Yao Z., Lee T., Yamamoto S., Erickson G.F., Shimasaki S. (2000 b). Bone morphogenetic protein-15- identification of target cells and biological functions. J. Biol. Chem., 275 (50): Otsuka F., Moore R.K., Shimasaki S. (2001). Biological function and cellular mechanism of bone morphogenetic protein-6 in the ovary. J. Biol. Chem., 276 (35): Otsuka F., Shimasaki S. (2002). A negative feedback system between oocyte bone morphogenetic protein 15 and granulosa cell kit ligand: its role in regulating granulosa cell mitosis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99 (12): Piper L.R., Bindon B.M. (1982). The Booroola Merino and the performance of medium non-peppin crosses at Armidale. In: Piper L.R., Bindon B.M., Nethery R.D., The Booroola Merino; Melbourne, Australia: CSIRO; pp Polley H.W. i in. (2010). Polymorphism of BMPR1B, BMP15 and GDF9 fecundity genes in prolific Garola sheep. Trop. Anim. Health Prod., 42 (5): Rybak-Krzyszkowska M., Grzyb A., Milewicz T., Krzaczkowska-Sendrakowska M., Krzysiek J. (2004). Primary ovarian insufficiency in infertility clinic. Pol. J. Endocrin., 6: Shimasaki S., Zachow R.J., Li D., Kim H., Iemura S., Ueno N., Sampath K., Chang R.J., Erickson G.F. (1999). A functional bone morphogenetic protein system in the ovary. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 96: Shimasaki S., Moore R.K., Otsuka F., Erickson G.F. (2004). The bone morphogenetic protein system in mammalian reproduction. Endocr. Rev., 25 (1): Smith P., Hudson N.L., Shaw L., Heath D.A., Condell L., Phillips D.J., McNatty K.P. (1993). Effects of the Booroola gene (FecB) on body weight, ovarian development and hormone concentrations during fetal life. J. Reprod. Fertil., 1: Vacca G.M., Dhaouadi A., Rekik M., Carcangiu V., Pazzola M., Detto M.L. (2010). Prolificacy genotypes at BMPR 1B, BMP15 and GDF9 genes in North African sheep breeds. Small Ruminant Res., 88 (1): Winnier G., Blessing M., Labosky P.A., Hogan B.L. (1995). Bone morphogenetic protein-4 is required for mesoderm formation and patterning in themouse. Gene. Dev., 9: Young J.M., Juengel J.L., Dodds K.G., Laird M., Dearden P.K., McNeilly A.S., McNatty K.P., Wilson T. (2008). The activin receptor-like kinase 6 Booroola mutation enhances suppressive effects of bone morphogenetic protein 2 (BMP2), BMP4, BMP6 and growth and differentiation factor-9 on FSH release from ovine primary pituitary cell cultures. J. Endocrinol., 196: GENETIC ASPECT OF HIGH PROLIFICACY IN SHEEP. PART I Summary Genetic studies in sheep have indicated that ovulation rate and litter size can be genetically regulated by the action of single genes with major effect known as fecundity (Fec) genes, or alternatively by a set of different genes each having a small effect. Polymorphisms of several genes belonging to the transforming growth factor β superfamily (BMPR1B, GDF9, BMP15) can increase ovulation rates in heterozygous ewes and cause infertility in homozygous ewes. Additionally, we described two genes (MTNR1A, PRLR) which can have an effect on increased litter size in sheep. In this review we focus on the characteristic genes affecting ovulation rate, litter size in sheep and candidate genes which can be involved in mechanisms controlling prolificacy in sheep. 26 Prace przeglądowe
Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec Cz. II
Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec. Cz. II Wiadomości Zootechniczne, R. L (2012), 2: 5 10 Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec Cz. II Grzegorz Smołucha, Agata Piestrzyńska-Kajtoch, Barbara
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
The influence of selected genes on sheep performance traits. Wpływ wybranych genów na cechy użytkowe owiec
Journal of Central European Agriculture, 2014, 15(2), p.154-164 The influence of selected genes on sheep performance traits DOI: 10.5513/JCEA01/15.2.1466 Wpływ wybranych genów na cechy użytkowe owiec Magdalena
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Przewidywanie słabej odpowiedź na kontrolowaną hiperstymulację jajników na podstawie polimorfizmów genu GDF-9 opis przypadku
Przewidywanie słabej odpowiedź na kontrolowaną hiperstymulację jajników na podstawie polimorfizmów genu GDF-9 Prediction of poor response to controlled ovarian hyperstimulation based on GDF-9 polymorphism
Jaki koń jest nie każdy widzi - genomika populacji polskich ras koni
Jaki koń jest nie każdy widzi - genomika populacji polskich ras koni Gurgul A., Jasielczuk I., Semik-Gurgul E., Pawlina-Tyszko K., Szmatoła T., Bugno-Poniewierska M. Instytut Zootechniki PIB Zakład Biologii
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT Ćwiczenia 1 mgr Magda Kaczmarek-Okrój magda_kaczmarek_okroj@sggw.pl 1 ZAGADNIENIA struktura genetyczna populacji obliczanie frekwencji genotypów obliczanie frekwencji alleli
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
Wykład 9: HUMAN GENOME PROJECT HUMAN GENOME PROJECT
Wykład 9: Polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) odrębność genetyczna, która czyni każdego z nas jednostką unikatową Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej HUMAN GENOME
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (2) GENOMY I ICH ADNOTACJE. Podstawy Bioinformatyki wykład 4
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (2) GENOMY I ICH ADNOTACJE Podstawy Bioinformatyki wykład 4 GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC PODSTAWY BIOINFORMATYKI 2017/2018 MAGDA MIELCZAREK 2 GENOMY I ICH ADNOTACJE
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,
C elem1 niniejszego artykułu jest charakterystyka
Wiadomości Zootechniczne, R. LV (2017), 5: 14 34 A. Gurgul i in. Zarys problematyki badań z zakresu genetyki i genomiki prowadzonych u polskich zachowawczych ras zwierząt w ramach projektu BIOSTRATEG *
Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...
1. Zadanie (0 2 p. ) Porównaj mitozę i mejozę, wpisując do tabeli podane określenia oraz cyfry. ta sama co w komórce macierzystej, o połowę mniejsza niż w komórce macierzystej, gamety, komórki budujące
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (1) GENOMY I ICH ADNOTACJE
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (1) GENOMY I ICH ADNOTACJE Podstawy Bioinformatyki wykład 2 PODSTAWY BIOINFORMATYKI 2018/2019 MAGDA MIELCZAREK 1 GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC PODSTAWY BIOINFORMATYKI
DOBÓR. Kojarzenie, depresja inbredowa, krzyżowanie, heterozja
DOBÓR Kojarzenie, depresja inbredowa, krzyżowanie, heterozja SELEKCJA grupa osobników obu płci, która ma zostać rodzicami następnego pokolenia DOBÓR OSOBNIKÓW DO KOJARZEŃ POSTĘP HODOWLANY następne pokolenie
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Diagnostyka neurofibromatozy typu I,
Diagnostyka neurofibromatozy typu I, czyli jak to się robi w XXI wieku dr n. biol. Robert Szymańczak Laboratorium NZOZ GENOMED GENOMED S.A. Neurofibromatoza typu I (choroba von Recklinghausena) częstość
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,
Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego. Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa
Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego raka jajnika Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa Sześć diabelskich mocy a komórka rakowa (Gibbs
Wykład: HUMAN GENOME PROJECT HUMAN GENOME PROJECT
Wykład: Polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) odrębność genetyczna, która czyni każdego z nas jednostką unikatową Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej HUMAN GENOME
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
PODSTAWY GENETYKI. Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk
PODSTAWY GENETYKI Prawa Mendla (jako punkt wyjścia) Epistaza (interakcje między genami) Sprzężenia genetyczne i mapowanie genów Sprzężenie z płcią Analiza rodowodów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław
Możliwości i potencjalne zastosowania Zintegrowanego Systemu Analitycznego do innowacyjnych i kompleksowych badań molekularnych
Możliwości i potencjalne zastosowania Zintegrowanego Systemu Analitycznego do innowacyjnych i kompleksowych badań molekularnych Dzień Otwarty Klastra LifeScience 31 maj 2017, Kraków dr Agata Piestrzyńska-Kajtoch,
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI. Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI Fot. W. Wołkow Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt POPULACJA Zbiór organizmów żywych, które łączy
Depresja inbredowa i heterozja
Depresja inbredowa i heterozja Charles Darwin Dlaczego rośliny chronią się przed samozapyleniem? Doświadczenie na 57 gatunkach roślin! Samozapłodnienie obniża wigor i płodność większości z 57 gatunków
Disruption of c-mos causes parthenogenetic develepment of unfertilized mouse eggs. W.H Colledge, M.B.L. Carlton, G.B. Udy & M.J.
Disruption of c-mos causes parthenogenetic develepment of unfertilized mouse eggs. W.H Colledge, M.B.L. Carlton, G.B. Udy & M.J.Evans Partenogeneza-dzieworództwo, to sposób rozmnażania polegający na rozwoju
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
Selekcja, dobór hodowlany. ESPZiWP
Selekcja, dobór hodowlany ESPZiWP Celem pracy hodowlanej jest genetyczne doskonalenie zwierząt w wyznaczonym kierunku. Trudno jest doskonalić zwierzęta już urodzone, ale można doskonalić populację w ten
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 1 Biologia I MGR /
GENETYKA POPULACJI Ćwiczenia 1 Biologia I MGR 1 ZAGADNIENIA struktura genetyczna populacji obliczanie frekwencji genotypów obliczanie frekwencji alleli przewidywanie struktury następnego pokolenia przy
Hormony Gruczoły dokrewne
Hormony Gruczoły dokrewne Dr n. biol. Urszula Wasik Zakład Biologii Medycznej HORMON Przekazuje informacje między poszczególnymi organami regulują wzrost, rozwój organizmu efekt biologiczny - niewielkie
Nauka Przyroda Technologie
Nauka Przyroda Technologie 2015 Tom 9 Zeszyt 2 #22 ISSN 1897-7820 http://www.npt.up-poznan.net DOI: 10.17306/J.NPT.2015.2.22 Dział: Zootechnika Copyright Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu
Podstawy genetyki. ESPZiWP 2010
Podstawy genetyki ESPZiWP 2010 Genetyka - nauka o dziedziczności i zmienności organizmów, wyjaśniająca prawa rządzące podobieństwami i różnicami pomiędzy osobnikami spokrewnionymi przez wspólnego przodka
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt do wykładu
HUMAN GENOME PROJECT
Wykład : Polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) odrębność genetyczna, która czyni każdego z nas jednostką unikatową Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej HUMAN GENOME
DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro
DNA- kwas deoksyrybonukleinowy: DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro RNA- kwasy rybonukleinowe: RNA matrycowy (mrna) transkrybowany
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Charakterystyka innych ras czerwonych w Europie zrzeszonych w ERDB
Wiadomości Zootechniczne, R. XLIII (2005), 2: 144-148 zrzeszonych w ERDB Lisbet Holm 1, Piotr Wójcik 2 1 European Red Dairy Breed, Udkaersovej 15, 8200 Aarhus N., Dania 2 Instytut Zootechniki, Dział Genetyki
Temat 6: Genetyczne uwarunkowania płci. Cechy sprzężone z płcią.
Temat 6: Genetyczne uwarunkowania płci. Cechy sprzężone z płcią. 1. Kariotyp człowieka. 2. Determinacja płci u człowieka. 3. Warunkowanie płci u innych organizmów. 4. Cechy związane z płcią. 5. Cechy sprzężone
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Ekologia molekularna. wykład 14. Genetyka ilościowa
Ekologia molekularna wykład 14 Genetyka ilościowa Dziedziczenie mendlowskie wykład 14/2 Cechy wieloczynnikowe (ilościowe) wzrost masa ciała kolor skóry kolor oczu itp wykład 14/3 Rodzaje cech ilościowych
DLACZEGO WARTO POZNAĆ GENOTYP SWOICH ŚWIŃ?
DLACZEGO WARTO POZNAĆ GENOTYP SWOICH ŚWIŃ? HANNA JANKOWIAK Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy w Bydgoszczy Wydział Hodowli i Biologii Zwierząt IV Pomorskie Forum Trzodziarskie 14.11.2016, Borzechowo
Gonocyty komórki prapłciowe
GAMETOGENEZA Gametogeneza Gametogeneza (z grec. gamete żona, gametes mąż) Proces powstawania oraz rozwoju specjalnej populacji komórek, które nazywa się gametami lub komórkami rozrodczymi. Mejoza i różnicowanie
Promotor: prof. dr hab. Katarzyna Bogunia-Kubik Promotor pomocniczy: dr inż. Agnieszka Chrobak
INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ IM. LUDWIKA HIRSZFELDA WE WROCŁAWIU POLSKA AKADEMIA NAUK mgr Milena Iwaszko Rola polimorfizmu receptorów z rodziny CD94/NKG2 oraz cząsteczki HLA-E w patogenezie
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Połączenia komórek
Dziedziczenie poligenowe
Dziedziczenie poligenowe Dziedziczenie cech ilościowych Dziedziczenie wieloczynnikowe Na wartość cechy wpływa Komponenta genetyczna - wspólne oddziaływanie wielu (najczęściej jest to liczba nieznana) genów,
Ekspresja i funkcja receptora progesteronu w jajniku u ptaków
Rocz. Nauk. Zoot., T. 38, z. 2 (2011) 127 135 Ekspresja i funkcja receptora progesteronu w jajniku u ptaków S y l w i a O r c z e w s k a - D u d e k 1, M a r i a M i k a 2 1 Instytut Zootechniki Państwowy
Materiał i metody. Wyniki
Abstract in Polish Wprowadzenie Selen jest pierwiastkiem śladowym niezbędnym do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Selen jest wbudowywany do białek w postaci selenocysteiny tworząc selenobiałka (selenoproteiny).
Pokrewieństwo, rodowód, chów wsobny
Pokrewieństwo, rodowód, chów wsobny Pokrewieństwo Pokrewieństwo, z punktu widzenia genetyki, jest podobieństwem genetycznym. Im osobniki są bliżej spokrewnione, tym bardziej są podobne pod względem genetycznym.
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
Konkurs szkolny Mistrz genetyki etap II
onkurs szkolny istrz genetyki etap II 1.W D pewnego pierwotniaka tymina stanowi 28 % wszystkich zasad azotowych. blicz i zapisz, jaka jest zawartość procentowa każdej z pozostałych zasad w D tego pierwotniaka.
GENETYCZNE PODSTAWY ZMIENNOŚCI ORGANIZMÓW ZASADY DZIEDZICZENIA CECH PODSTAWY GENETYKI POPULACYJNEJ
GENETYCZNE PODSTAWY ZMIENNOŚCI ORGANIZMÓW ZASADY DZIEDZICZENIA CECH PODSTAWY GENETYKI POPULACYJNEJ ZMIENNOŚĆ - występowanie dziedzicznych i niedziedzicznych różnic między osobnikami należącymi do tej samej
BIOINFORMATYKA. edycja 2016 / wykład 11 RNA. dr Jacek Śmietański
BIOINFORMATYKA edycja 2016 / 2017 wykład 11 RNA dr Jacek Śmietański jacek.smietanski@ii.uj.edu.pl http://jaceksmietanski.net Plan wykładu 1. Rola i rodzaje RNA 2. Oddziaływania wewnątrzcząsteczkowe i struktury
Imię i nazwisko...kl...
Gimnazjum nr 4 im. Ojca Świętego Jana Pawła II we Wrocławiu SPRAWDZIAN GENETYKA GR. A Imię i nazwisko...kl.... 1. Nauka o regułach i mechanizmach dziedziczenia to: (0-1pkt) a) cytologia b) biochemia c)
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE. Ewa Waszkowska ekspert UPRP
WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE Ewa Waszkowska ekspert UPRP Źródła informacji w biotechnologii projekt SLING Warszawa, 9-10.12.2010 PLAN WYSTĄPIENIA Umocowania prawne Wynalazki biotechnologiczne Statystyka
FOLIKULOGENEZA I STEROIDOGENEZA JAJNIKOWA U ŚWIŃ
ZN TD UJ NAUKI ŚCISŁE, NR 1 / 2010 RITA BŁOCIŃSKA FOLIKULOGENEZA I STEROIDOGENEZA JAJNIKOWA U ŚWIŃ ABSTRACT Folliculogenesis is the process in which the basic structure of ovaries is created; it is required
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny Zadanie 1 1 pkt. za prawidłowe podanie typów dla obydwu zwierząt oznaczonych literami A oraz B. A. ramienionogi, B. mięczaki A.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski. Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul. Smętna 12, Kraków Plan prezentacji: Cel naukowy Podstawy teoretyczne Przyjęta metodyka
Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca
Tytuł pracy: Autor: Promotor rozprawy: Recenzenci: Funkcje białek ELAC2 i SUV3 u ssaków i ryb Danio rerio. Praca doktorska wykonana w Instytucie Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii UW Lien Brzeźniak
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
o cechach dziedziczonych decyduje środowisko, a gatunki mogą łatwo i spontanicznie przechodzić jedne w drugie
Iwan Miczurin (1855-1935) Trofim Denisowicz Łysenko (1898-1976) przy interwencji człowieka możliwe jest zmuszenie każdej formy zwierzęcia lub rośliny do znacznie szybszych zmian, w kierunku pożądanym przez
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
Czy grozi nam seksmisja? Renata Gontarz
Czy grozi nam seksmisja? Renata Gontarz Dominujący Y TDF (ang. testisdetermining factor) = SRY (ang. Sexdetermining region Y) Za Aitken, J.R. & Krausz, C. Reprod. 122, 497-506 (2001) Determinacja płci
GENOMIKA. MAPOWANIE GENOMÓW MAPY GENOMICZNE
GENOMIKA. MAPOWANIE GENOMÓW MAPY GENOMICZNE Bioinformatyka, wykład 3 (21.X.2008) krzysztof_pawlowski@sggw.waw.pl tydzień temu Gen??? Biologiczne bazy danych historia Biologiczne bazy danych najważniejsze
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 6 BAZA DANYCH NCBI - II
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 6 BAZA DANYCH NCBI - II BAZA DANYCH NCBI 1. NCBI 2. Dane gromadzone przez NCBI 3. Przegląd baz danych NCBI: Publikacje naukowe Projekty analizy genomów OMIM: fenotypy człowieka
Bioinformatyka. Rodzaje Mutacji
Bioinformatyka (wykład monograficzny) wykład 3. E. Banachowicz Zakład Biofizyki Molekularnej IF UAM http://www.amu.edu.pl/~ewas Rodzaje Mutacji zmienność sekwencji (sequence variation) mutacje polimorfizm
mikrosatelitarne, minisatelitarne i polimorfizm liczby kopii
Zawartość 139371 1. Wstęp zarys historii genetyki, czyli od genetyki klasycznej do genomiki 2. Chromosomy i podziały jądra komórkowego 2.1. Budowa chromosomu 2.2. Barwienie prążkowe chromosomów 2.3. Mitoza
Modyfikacje epigenetyczne w czasie wzrostu oocytów związane z rozszerzeniem rozwoju partenogenetycznego u myszy. Małgorzata Karney
Modyfikacje epigenetyczne w czasie wzrostu oocytów związane z rozszerzeniem rozwoju partenogenetycznego u myszy. Małgorzata Karney Epigenetyka Epigenetyka zwykle definiowana jest jako nauka o dziedzicznych
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Bioinformatyka wykład 9
Bioinformatyka wykład 9 14.XII.21 białkowa bioinformatyka strukturalna krzysztof_pawlowski@sggw.pl 211-1-17 1 Plan wykładu struktury białek dlaczego? struktury białek geometria i fizyka modyfikacje kowalencyjne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne http://www.umass.edu/molvis/bme3d/materials/jtat_080510/exploringdna/ch_flex/chapter.htm czynniki transkrypcyjne (aktywatory/represory)
Geny i działania na nich
Metody bioinformatyki Geny i działania na nich prof. dr hab. Jan Mulawka Trzy królestwa w biologii Prokaryota organizmy, których komórki nie zawierają jądra, np. bakterie Eukaryota - organizmy, których
ROZPORZĄDZENIE KOMISJI (UE) / z dnia r.
KOMISJA EUROPEJSKA Bruksela, dnia 29.5.2018 C(2018) 3193 final ROZPORZĄDZENIE KOMISJI (UE) / z dnia 29.5.2018 r. zmieniające rozporządzenie (WE) nr 847/2000 w odniesieniu do definicji pojęcia podobnego
Dopasowanie sekwencji (sequence alignment)
Co to jest alignment? Dopasowanie sekwencji (sequence alignment) Alignment jest sposobem dopasowania struktur pierwszorzędowych DNA, RNA lub białek do zidentyfikowanych regionów w celu określenia podobieństwa;
Biologia medyczna, lekarski Ćwiczenie ; Ćwiczenie 19
Ćwiczenie 19 Fenotyp sportowca. Geny warunkujące fenotyp sportowca. Testy DNA w ocenie predyspozycji sportowych i ich aspekty etyczne. Genetyka cech ilościowych. Prof. dr hab. Roman Zieliński 1. "Fenotyp
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: 1. Otrzymanie pożądanego odcinka DNA z materiału genetycznego dawcy 2. Wprowadzenie obcego DNA do wektora 3. Wprowadzenie wektora, niosącego w sobie
Disruption of c-mos causes parthenogenetic development of unfertilized mouse eggs
Disruption of c-mos causes parthenogenetic development of unfertilized mouse eggs W. H. Colledge, M. B. L. Carlton, G. B. Udy & M. J. Evans przygotowała Katarzyna Czajkowska 1 Dysrupcja (rozbicie) genu
1Roman Niżnikowski, Grzegorz Czub, Marcin Świątek, Krzysztof Głowacz, Magdalena Ślęzak
ZESZYTY NAUKOWE UNIWERSYTETU PRZYRODNICZEGO WE WROCŁAWIU 2013 BIOLOGIA I HODOWLA ZWIERZĄT LXXI NR 600 1Roman Niżnikowski, Grzegorz Czub, Marcin Świątek, Krzysztof Głowacz, Magdalena Ślęzak WPŁYW GENOTYPU
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
MARKERY MIKROSATELITARNE
MARKERY MIKROSATELITARNE Badania laboratoryjne prowadzone w Katedrze Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt SGGW w ramach monitoringu genetycznego wykorzystują analizę genetyczną markerów mikrosatelitarnych.
Problemy inbredu w populacji owiec olkuskich uczestniczących w programie ochrony zasobów genetycznych zwierząt*
Problemy inbredu w populacji owiec olkuskich Wiadomości Zootechniczne, R. XLV (2007), 4: 29-39 Problemy inbredu w populacji owiec olkuskich uczestniczących w programie ochrony zasobów genetycznych zwierząt*
Składniki jądrowego genomu człowieka
Składniki jądrowego genomu człowieka Genom człowieka 3 000 Mpz (3x10 9, 100 cm) Geny i sekwencje związane z genami (900 Mpz, 30% g. jądrowego) DNA pozagenowy (2100 Mpz, 70%) DNA kodujący (90 Mpz ~ ok.
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją).
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją). Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) 2 Cząsteczki organiczne mog y powstać w atmosferze pierwotnej
Porównywanie i dopasowywanie sekwencji
Porównywanie i dopasowywanie sekwencji Związek bioinformatyki z ewolucją Wraz ze wzrostem dostępności sekwencji DNA i białek pojawiła się nowa możliwość śledzenia ewolucji na poziomie molekularnym Ewolucja
WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach
WYKŁAD: Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Białka Retrowirusy Białka Klasyczny
BLISKIE SPOTKANIA Z BIOLOGIĄ
BLISKIE SPOTKANIA Z BIOLOGIĄ Instytutu Biologii Eksperymentalnej Instytut Biologii Środowiska Katedra Biologii Ewolucyjnej UNIWERSYTET KAZIMIERZA WIELKIEGO Wykłady Środy, 15.45, Aula Biblioteki UKW Czas
Wykład 5. Remodeling chromatyny
Wykład 5 Remodeling chromatyny 1 Plan wykładu: 1. Przebudowa chromatyny 2. Struktura, funkcje oraz mechanizm działania kompleksów remodelujących chromatynę 3. Charakterystyka kompleksów typu SWI/SNF 4.
Molekuły Miłości. Borys Palka Katarzyna Pyzik. www.agh.edu.pl
Molekuły Miłości Borys Palka Katarzyna Pyzik www.agh.edu.pl Zakochanie Przyczyną Hormonalnych Zmian Grupa zakochanych, 24 osoby (12 mężczyzn, 12 kobiet ) Grupa kontrolna, 24 osoby (12 mężczyzn, 12 kobiet)
Badanie predyspozycji do łysienia androgenowego u kobiet (AGA)
Badanie predyspozycji do łysienia androgenowego u kobiet (AGA) RAPORT GENETYCZNY Wyniki testu dla Pacjent Testowy Pacjent Pacjent Testowy ID pacjenta 0999900004112 Imię i nazwisko pacjenta Pacjent Testowy
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH GENOMY I ICH ADNOTACJE. Pracownia Informatyczna 2
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH GENOMY I ICH ADNOTACJE Pracownia Informatyczna 2 WYBRANE BIOLOGICZNE BAZY DANYCH GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC NATIONAL CENTER FOR BIOTECHNOLOGY INFORMATION NCBI Utworzone
Test BRCA1. BRCA1 testing
Test BRCA1 BRCA1 testing 2 Streszczenie Za najczęstszą przyczynę występowania wysokiej, genetycznie uwarunkowanej predyspozycji do rozwoju raka piersi i/lub jajnika w Polsce uznaje się nosicielstwo trzech
KOŁO NAUKOWE IMMUNOLOGII. Mikrochimeryzm badania w hodowlach leukocytów in vitro
KOŁO NAUKOWE IMMUNOLOGII Mikrochimeryzm badania w hodowlach leukocytów in vitro Koło Naukowe Immunolgii kolo_immunologii@biol.uw.edu.pl kolo_immunologii.kn@uw.edu.pl CEL I PRZEDMIOT PROJEKTU Celem doświadczenia
Biologiczne podstawy ewolucji. Informacja genetyczna. Co to jest ewolucja.
Biologiczne podstawy ewolucji. Informacja genetyczna. Co to jest ewolucja. Historia } Selekcja w hodowli zwierząt, co najmniej 10 000 lat temu } Sztuczne zapłodnienie (np. drzewa daktylowe) 1000 lat temu
Mechanochemiczny przełącznik między wzrostem i różnicowaniem komórek
Mechanochemiczny przełącznik między wzrostem i różnicowaniem komórek Model tworzenia mikrokapilar na podłożu fibrynogenowym eksponencjalny wzrost tempa proliferacji i syntezy DNA wraz ze wzrostem stężenia