The influence of selected genes on sheep performance traits. Wpływ wybranych genów na cechy użytkowe owiec
|
|
- Zofia Adamczyk
- 9 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Journal of Central European Agriculture, 2014, 15(2), p The influence of selected genes on sheep performance traits DOI: /JCEA01/ Wpływ wybranych genów na cechy użytkowe owiec Magdalena KOLENDA 1*, Daria KARWOWSKA 2 Beata SITKOWSKA 1, Ewa GROCHOWSKA 1 and Dominika PIETRUSZYŃSKA 3 1 Zakład Genetyki i Podstaw Hodowli Zwierząt, Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy w Bydgoszczy, ul. Mazowiecka 28, Bydgoszcz, * correspondence kolenda@utp.edu.pl 2 Zakład Hodowli Owiec, Kóz i Zwierząt Futerkowych, Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy w Bydgoszczy, ul. Mazowiecka 28, Bydgoszcz 3 Zakład Fizjologii Zwierząt, Uniwersytet Technologiczno- Przyrodniczy w Bydgoszczy, ul. Mazowiecka 28, Bydgoszcz Abstract In order to enhance breeding progress, genes that affect the performance of sheep are being identified. In Poland, sheep breeding programs focus mainly on meat performance, therefore, it is important to identify genes that affect it. Moreover, studies on reproductive performance of sheep have been made. Myostatin (GDF8), calpastatin (CAST) and calpain have been identified as the candidate genes affecting meat quality. Whereas, BMP15 and GDF9, also called "fertility genes" (Fec), have been reported to affect reproduction traits. The knowledge of the association between the polymorphic forms of these genes and sheep performance traits may contribute to the determination of genetic markers that could be used in sheep breeding programs. The aim of this study is to gather the latest information about the use of genomic selection in breeding programs and the association between polymorphisms in BMP15, GDF8, GDF9 and CAST genes and sheep performance. Key words: BMP15, calpain, calpastatin, GDF9, genomic selection, myostatin Streszczenie Pomocna w celu zwiększenia postępu hodowlanego może być identyfikacja genów mających wpływ na użytkowość owiec. Obecnie w Polsce głównie użytkuje się owce w kierunku mięsnym dlatego też ważne jest zidentyfikowanie genów wpływających na użytkowość mięsną. Prowadzi się również badania nad użytkowością rozpłodową owiec. Geny kandydujące wpływające na jakość mięsa to m.in. geny kodujące miostatynę (GDF8), kalpainy i kalpastatynę (CAST). Z kolei geny odpowiedzialne za cechy reprodukcyjne nazwano genami płodności (Fec), do których zaliczono geny BMP15, GDF9. Rozpoznanie związku pomiędzy polimorficznymi formami tych genów 154
2 a cechami użytkowości owiec może przyczynić się do wyznaczeniem markerów genetycznych, które mogłyby zostać wykorzystywane w hodowli owiec. Celem niniejszej pracy jest zebranie najnowszych wiadomości na temat wykorzystania selekcji genomowej w hodowli owiec oraz związku polimorfizmów w genach BMP15, GDF8, GDF9 oraz CAST a użytkowością owiec. Słowa kluczowe: BMP15, GDF9, kalpaina, kalpastatyna, miostatyna, selekcja genomowa Detailed Abstract Researchers have been trying to identify genes that affect sheep performance and implement the knowledge into a commercial usage, for instance, in genetic evaluation and optimization of selection strategies used in breeding programs. This may help farmers to enhance breeding progress; however, they have to learn from the latest studies. Most popular amongst currently available databases that contain information about the sheep genome are presented in Table 1. In Poland, sheep breeding programs focus on meat performance. Therefore, it is important to identify genes that affect it. Myostatin (GDF8), calpastatin (CAST) and calpain have been identified as the candidate genes affecting meat quality. Myostatin gene (GDF8) encodes a protein that acts as a negative regulator of skeletal muscle growth. Polymorphism in GDF8 may affect the expression which in turn may cause abnormal muscle growth. A few polymorphisms have been described in the literature, among others, the c.*1232g>a SNP, a G> A substitution in 3 UTR, that decreases the amount of protein produced by the sheep and increases muscle yield. Another polymorphism that has been associated with the muscular hypertrophy is c.960delg, i.e. the deletion of guanine at the position 960. Animals diagnosed with such change produce biologically inactive protein and therefore, are characterized by the increased muscle yield. The third polymorphism is called c.120ina which stands for the insertion of adenine at the position 120. Individuals homozygous for the c.120ina mutation have a greater muscle yield. Calpastatin (CAST) and calpain genes have been associated with the sheep performance traits. Calpains are calcium dependent, intracellular cysteine proteases. They have an important role in myoblast fusion, cell growth, and the growth and degradation of muscle. The activity of the calpain system is regulated by a specific endogenous inhibitor, calpastatin. The gene encoding calpastatin has been called CAST. By inhibiting the calpain activity, calpastatin has an impact on the process of the post mortem meat tenderization. In the literature the associations between the polymorphism and meat performance traits of sheep have been reported, for instance, Palmer et al. (1998) have discovered two variants of the gene, M and N, which affect muscle quality. Furthermore, scientists have been trying to identify genes that may be responsible for the reproduction traits. The BMP15 gene has been described as one of the so called "fertility genes" (Fec) that affect reproduction traits. Some studies have shown that the formation of the bone morphogenetic protein BMP15 is linked to the activity of a single gene located on chromosome X. The BMP15 gene consists of two exons and an intron. The protein contributes to the regulation of ovarian function, and favorably affects sheep fertility. In Inverdale and Hanna sheep breeds gene mutations in 155
3 chromosome X have been detected. Individuals heterozygous for the BMP15 gene mutation release more ovum, while, sheep homozygous for the mutation have been diagnosed with ovarian hypoplasia. The GDF9 gene (growth differentiation factor 9) has been identified as one of the genes responsible for reproductive performance of sheep. The GDF9 gene consists of two exons and a single intron. Numerous studies have shown that the presence of the GDF9 gene is essential for the proper development of the primary ovarian, normal growth and differentiation of granulosa cells and formation of the cumulus oophorus. Moreover, some mutations in the GDF9 gene have been discovered. The identification of the relationship between the polymorphic forms of these genes and sheep performance traits may contribute to the determination of genetic markers that could be used in sheep breeding programs. Wstęp Lata świetności polskiego owczarstwa przeszły już do historii. Analizując pogłowie owiec po 1986 roku można dostrzec najpierw powolny, a po 1990 roku wręcz lawinowy spadek jego liczebności. W latach liczba tych zwierząt w Polsce utrzymywała się na stałym poziomie około 330 tys. sztuk, co stanowiło zaledwie 6.8% pogłowia z 1986 r. Według danych Głównego Urzędu Statystycznego (GUS) z grudnia 2012 roku w Polsce populacja owiec kształtuje się na poziomie tysiąca sztuk. Dane te wskazują na niewielką 2.7% tendencję wzrostową w skali roku. Na przestrzeni ostatnich lat, Polski Związek Owczarski (PZO), analizując m.in. procentowy udział maciorek wpisanych do ksiąg zwierząt zarodowych w 2010 roku, odnotował spadek liczebności pogłowia ras krajowych (merynosy, polskie owce nizinne, owce długowełniste) na korzyść importowanych ras mięsnych. W związku z czym potwierdza się dominacja użytkowania owiec w kierunku mięsnym (GUS 2013). Głównymi czynnikami warunkującymi poziom użytkowości mięsnej owiec są między innymi: genotyp, rasa, wiek, płeć, krzyżowanie towarowe, rodzaje tuczu i żywienie oraz metody oceny przyżyciowej i poubojowej (Klepacki and Rokicki, 2005). Dotychczasowa selekcja hodowlana na podstawie cech fenotypowych może być wspomagana metodami analizy molekularnej genów GDF8 i CAST, co pozwoli na wybór najlepszych osobników już w młodym wieku (Clop, et al., 2006; Palmer, et al., 1998). Wiele badań nad płodnością owiec w ostatnim czasie skoncentrowało się na grupie genów, które nazywane są genami płodności (Fec). Geny te są głównie odpowiedzialne za częstość owulacji i liczbę jagniąt w miocie. Na zwrócenie szczególnej uwagi zasługują geny białka morfogenetycznego kości BMP15 oraz czynnik wzrostu i różnicowania GDF9 (Polley, et al., 2010). Celem niniejszej pracy jest zebranie najnowszych wiadomości na temat wykorzystania selekcji genomowej w hodowli owiec oraz związku polimorfizmów w genach BMP15, GDF8, GDF9 oraz CAST a użytkowością owiec. Wykorzystanie selekcji genomowej w hodowli zwierząt Pomysł, żeby wykorzystać możliwości genetyki molekularnej, a zwłaszcza markery genetyczne w doskonaleniu różnych gatunków zwierząt gospodarskich, jest obecnie bardzo popularny (Marshalla, et al., 2011). Selekcja genomowa (Genomic Selection, GS) prowadzona jest na największą skalę w hodowli bydła, natomiast jak podkreśla 156
4 Van der Werf (2009) istnieje potrzeba bardziej szczegółowych badań i analiz statystycznych, aby ustalić odpowiedni model służący do selekcji genomowej owiec. Teoretyczne przewidywania muszą zostać rzetelnie poparte dowodami eksperymentalnymi ponadto, potrzebne są dalsze prace, aby selekcję genomową w hodowli owiec realizować w praktyce. Podkreślić należy, że na świecie główne zainteresowania i nadzieje związane z wykorzystaniem selekcji genomowej w hodowli owiec skupiają się na poprawie mięsności owiec oraz na produkcji wełny (Fadiel, et al., 2005; Marshalla, et al., 2011). Zaawansowane programy hodowli owiec z zastosowaniem selekcji wspomaganej markerami (Marker-Assisted Selection, MAS) stosowane są obecnie przede wszystkim w Australii i Nowej Zelandii (Harris, et al., 2008; Van der Werf, 2007). Skupiono się głównie na poprawie jakości mięsa i wełny oraz przeciwdziałaniu chorobom i poprawie rozrodczości zwierząt (Bishop, 1997). W badaniach uwzględniono ponad 1200 sekwencji mikrosatelitarnych, wykorzystano również polimorfizm pojedynczych nukleotydów (single nucleotide polymorphism, SNP) (Van der Werf, 2007). Badania wykorzystujące loci cech ilościowych (quantitative trait loci - QTL) powinny być na poziomie podobnym do badań przeprowadzonych na bydle, w przypadku owiec początkowo skupiono się głównie na działaniu w kierunku stwierdzenia efektu wpływu pojedynczych genów na cechy związane z umięśnieniem i występowaniem chorób (Walling, et al., 2004). Wyższą aktywność w przypadku mapowania genomu stwierdzono jedynie w przypadku mlecznych ras owiec. Jak podkreśla Van der Werf, (2007) więcej uwagi należy poświęcić połączeniu informacji genetycznych w komercyjnej ocenie genetyczne i zoptymalizowaniu strategii selekcyjnej w hodowli owiec. Marshalla, et al. (2011) sugerują, że zastosowanie MAS oraz GS może szczególnie pomóc mniejszym hodowcom w krajach rozwijających się. Muszą oni czerpać z najnowszych osiągnięć i wiedzy aby poprawić sytuację w rodzimej hodowli. Najpopularniejsze, dostępne obecnie, bazy danych dotyczące genomu owiec przedstawione zostały w tabeli 1. Table 1. Internet resources concerning the sheep genome. Tabela 1. Źródła internetowe dotyczące genomu owcy. Baza/ Database Sheep Genome Map The U.S. Sheep/Goat Genome Project International Sheep Genomics Consortium Australian Sheep Gene Mapping Web Site Zawartość/ Content Mapa genomu owcy Baza skupiająca informacje o różnych projektach dotyczących genomu owiec Przeszukuje genom owcy aby znaleźć geny odpowiedzialne za produkcję, rozród i występowaniem chorób u owiec Zawiera przekierowania do wielu baz zajmujących się genomem owcy Adres URL / URL address cs.csiro.au/sheep/mapcreat or/ rg/sheep/nagrp.html rg/ u.au/~jillm/jill.htm 157
5 NCBI Sheep Genome Biologiczna baza danych zawiera informacje o genomie owcy Project Borgn%5D UK Sheep Wykorzystanie osiągnięć nad Genome mapowianiem genomu owcy w Mapping hodowli i przemyśle Project /genome?term=txid9940%5 c.uk/sheepmap/front.html Polimorfizm genu kodującego miostatynę Jednym z genów opisanych w literaturze mających wpływ na użytkowość mięsną owiec jest gen GDF8 (growth differentiation factor 8), zwany również MSTN, który odpowiedzialny jest za kodowanie białka miostatyny. Białko to jest negatywnym regulatorem wzrostu mięśni szkieletowych (Te Paset al., 2004). Gen GDF8 zlokalizowany został u owiec w chromosomie 2, składa się on z 3 eksonów i 2 intronów, a białko kodowane przez ten gen posiada 375 aminokwasów (Lee, 2004). Białko miostatyny zaliczane jest do nadrodziny transformujących czynników wzrostu β (TGFβ) (Te Pas, et al., 2004). Zmiany w sekwencji genu GDF8 mogą powodować powstanie nieaktywnego biologicznie białka, a co za tym idzie powodować przyrost masy mięśniowej zwierzęcia. W 1999 roku Lee i McPherron opisali przypadek w którym myszy pozbawione genu GDF8 były nawet o 25-30% cięższe od myszy posiadających ten gen. Zmiany sekwencji tego genu wpływające na przyrost masy mięśniowej opisano u kilku ras owiec. Między innymi stwierdzono, że u owiec rasy Texel zmiany w genie kodującym miostatynę odpowiadają za wystąpienie fenotypu podwójnego umięśnienia. Zmianę tę opisano jako SNP c.*1232g>a czyli substytucję G>A w regionie 3 'UTR (Clop, et al.,2006; Boman, et al., 2009). Wystąpienie allela A (c.*1232a) powiązano ze zmniejszoną ilością produkowanego przez organizm owcy białka miostatyny i zwiększeniem masy mięśniowej zwierzęcia. Zwierzęta posiadające genotyp AA odznaczały się najwyższą masą ciała, a te posiadające tylko jeden allel A charakteryzowały się lepszym umięśnieniem od zwierząt o genotypie GG (Han, et al., 2010). Ponadto stwierdzono, że polimorfizm c.*1232g>a wpływa na zmniejszenie zawartości tłuszczu w mięsie (Hope, et al., 2013). Polimorfizm ten opisano m.in. u owiec rasy Australian Texel, White Suffolk, Poll Dorset i Lincoln (Kijas, et al., 2007), oraz u owiec rasy Charollais (Hadjipavlou, et al., 2008) i Welsh Mountain (Masri, et al., 2011). Z kolei u owiec rasy Norwegian White Sheep opisano polimorfizm c.960delg, czyli delecję guaniny w pozycji 960, w konsekwencji której ramka odczytu zostaje przesunięta i przedwcześnie powstaje kodon stop. Powstające białko miostatyny jest biologicznie nieaktywne, w związku z czym owce, u których stwierdzono taką zmianę, charakteryzują się zwiększoną masą mięśniową (Boman, et al., 2009). Kolejną rasą owiec u której stwierdzono wystąpienie polimorfizmu genu GDF8 jest rasa Norwegian Spælsau, u której opisano polimorfizm c.120ina. Zmiana ta polega na insercji adeniny w pozycji 120, co prowadzi do zmiany sekwencji i powstanie kodonu stop. Powstałe białko jest krótsze i nieaktywne, a osobniki homozygotyczne pod względem mutacji c.120ina charakteryzują się bardziej umięśnionym fenotypem (Boman and Vage, 2009). 158
6 Polimorfizm genu kodującego kalpastatynę i kalpainy Kolejnymi genami mającymi wpływ na cechy użytkowości owiec są geny kodujące kalpastatynę i kalpainy. Uważa się, że gen kodujący kalpainy wpływa na cechy jakości mięsa owczego. Kalpainy są zależnymi od jonów wapnia wewnątrzkomórkowymi proteazami cysteinowymi (Suzuki, et al., 1995). Do tej pory opisano kilka izoform kalpain, m.in. kalpainy 1 (CAPN1) i 2 (CAPN2) (Carragher and Frame, 2002; Lee, et al., 2008). Kalpainy pełnią ważną rolę podczas fuzji mioblastów, wzrostu oraz migracji komórek, oraz podczas wzrostu i degradacji mięśni (Goll, et al., 1998; Carragher and Frame, 2002). Ponadto stwierdzono, że dojrzewanie poubojowe mięsa może mieć związek z działaniem kalpainy 1 (Nowak, 2005). W literaturze opisano polimorfizm genu owczej kalpainy. Dzięki wykorzystaniu techniki SSCP zidentyfikowano między innymi dwa allele A i B oraz trzy możliwe genotypy (Dehnavi, et al., 2012). Czynnikiem wpływającym na aktywność systemu kalpainowego jest kalpastatyna, która jest specyficznym endogennym inhibitorem kalpain. Gen kodujący kalpastatynę, zwany inaczej CAST, zmapowany został u owiec w piątym chromosomie. Jak donosi Palmer, et al. (1998) gen ten pełni znaczącą rolę w formowaniu i rozpadzie mięśni. Kalpastatyna, hamując działanie kalpain, ma wpływ na proces kruszenia i dojrzewania mięsa (Delgado, et al., 2001). W literaturze opisano przypadki polimorfizmów genu kodującego kalpastatynę, które mogą wpływać na cechy użytkowości mięsnej owiec. Palmer, et al. (1998) zamplifikowali fragment genu CAST o długości 622pz, a następnie poddali go trawieniu enzymami restrykcyjnymi MspI i NcoI. W wyniku tego badania opisali dwa warianty M i N, które mają wpływ na jakość mięsa owczego. Stwierdzono również, że polimorfizm genu CAST może mieć wpływ na kruchość mięsa. Zhou, et al.(2006) z kolei, wykorzystując technikę PCR-SSCP, opisali pięć nowych wzorców SSCP w obrębie najdłuższego eksonu owczego genu CAST, czyli eksonu 6. Opisana w obrębie tego eksonu substytucja powoduje zmianę Gln/Leu w domenie L białka, zmiana ta może mieć wpływ na funkcje i ekspresję genu kodującego kalpastatynę. Nassiry, et al.(2006) opisali związek pomiędzy polimorfizmem genu kodującego kalpastatynę a średnimi dziennymi przyrostami masy ciała uzyskanymi przez owce rasy Kurdi. Co więcej, stwierdzono, że polimorfizm genu CAST ma wpływ na masę urodzeniową jagniąt (Byun, et al., 2008; Chung and Davis, 2012). Polimorfizm genu BMP15 Związkiem parakrynnym z rodziny TGFβ, który jest wytwarzany przez oocyt, jest białko morfogenetyczne kości, BMP15. Wykazano, że powstanie tego białka jest uwarunkowane działaniem pojedynczego genu położonego w chromosomie X. W badaniach wykazano, że odgrywa ono główną rolę w regulacji funkcji jajników u owiec ras Inverdale i Hanna, przez co wpływa korzystnie na ich plenność (Dube, et al., 1998). U ras tych występują mutacje genów położonych w chromosomie X. Osobniki heterozygotyczne pod względem genu BMP15 owulują więcej komórek jajowych. Natomiast w przypadku homozygot stwierdza się niedorozwój jajników. (Davis, et al., 1992). Charakteryzując białko BMP15 należy zauważyć, iż czwarta cysteina zostaje zastąpiona seryną, a dimery są tworzone poprzez połączenie pomiędzy podjednostkami BMP15. Trzy mostki disiarczkowe wchodzą w skład reszt cysteinowych, natomiast siódma odpowiedzialna jest za tworzenie homo- bądź 159
7 hetero dimerów (Rybak-Krzyszkowska, et al., 2004). W przypadku owiec gen BMP15 został zlokalizowany w chromosomie X. Zbudowany jest on z dwóch eksonów oddzielonych intronem, natomiast pełna długość kodującej sekwencji to 1179 pz. Aktywna forma peptydu BMP15 zawiera 125 aminokwasów. Peptydem sygnalnym o długości 25 aminokwasów poprzedzone jest niedojrzałe białko o długości 39 aminokwasów (Galloway, et al., 2000). Różnego rodzaju badania wykazały, iż gen BMP15 ma wpływ na wczesny wzrost i rozwój pęcherzyków jajnikowych. Zmiany w sekwencji nukleotydowej w genie BMP15 zostały jako pierwsze zaobserwowane u owiec rasy Romney w Nowej Zelandii. Jak dotąd, sześć niezależnych od siebie mutacji w genie BMP15 zostało powiązanych ze zwiększoną częstością owulacji u heterozygotycznych owiec oraz bezpłodnością u homozygot (Galloway, et al., 2000). Rozwój pęcherzyków jajnikowych zostaje zatrzymany w stadium pęcherzyka I-rzędu. BMP15 nie posiada bezpośredniego wpływu na produkcję steroidów przez komórki ziarniste, ma natomiast silny wpływ na hamowanie FSH-zależnej syntezy progesteronu, ale nie wpływa na indukowaną FSH syntezę estradiolu. Dowodzi to ważnej funkcji fizjologicznej, jaką pełni BMP15 w promowaniu wczesnego wzrostu i rozwoju pęcherzyków jajnikowych poprzez zapobieganie ich przedwczesnej luteinizacji (Davis, 2005). Polimorfizm genu GDF9 Cechy związane z rozrodem są zazwyczaj niskoodziedziczalne, dlatego badanie nad nimi są trudne do przeprowadzenia. Opłacalność produkcji owczarskiej oraz wydajność reprodukcyjna jest zależna od częstości owulacji oraz liczby jagniąt w miocie. W czasie ostatnich badań w przeciągu kilku lat odkryto mutacje w genie GDF9 znanym jako czynnik wzrostu i różnicowania 9 (Vacca, et al., 2010). Gen ten należy do rodziny TGFβ i w odróżnieniu od BMP15 jest autosomalnym genem, zlokalizowanym tak jak u ludzi w chromosomie 5. Wpływa on na wzrost częstości owulacji u owiec (Notter, 2008). Gen GDF9 ma długość 2.5 kpz i zawiera dwa eksony, które są od siebie oddzielone pojedynczym intronem o długości 1126pz. Gen GDF9 koduje peptyd o długości 453 aminokwasów, z którego po obróbce postranslacyjnej powstaje dojrzała forma białka zawierająca 135 aminokwasów (Hanrahan, et al., 2004). Liczne badania wykazały, że obecność genu GDF9 jest kluczowa do prawidłowego rozwoju pęcherza pierwotnego, prawidłowego rozwoju i różnicowania komórek ziarnistych i formowania wzgórka jajonośnego (Gui and Joyce, 2005). Ponadto uważa się, że wpływ genu GDF9 na częstość owulacji i ilość jagniąt w miocie jest większy niż w przypadku genu BMP15. Znajomość mutacji w głównych genach odpowiedzialnych za płodność może się przyczynić do wyznaczenia skutecznych markerów do poprawy płodności tego gatunku (Davis, 2004). Podsumowanie W celu zwiększenia postępu hodowlanego i zwiększenia rentowności hodowli owiec naukowcy starają się wytypować kolejne geny kandydujące mające wpływ na użytkowość tych zwierząt. Wykorzystanie wiedzy na temat związku polimorfizmu genu miostatyny i kalpastatyny z użytkowością mięsną może wpłynąć na poprawę cech mięsa w konkretnych rasach. Wprowadzenie do selekcji dodatkowego kryterium w postaci preferowanych wariantów genetycznych pod względem genów: BMP15, 160
8 GDF9 może wpłynąć na zwiększenie prawdopodobieństwa uzyskania ciąż bliźniaczych oraz jagniąt o wyższych przyrostach dobowych. Rozpoznanie związku pomiędzy polimorficznymi formami tych genów a cechami użytkowości owiec może przyczynić się do wyznaczeniem markerów genetycznych, które mogłyby zostać wykorzystywane w hodowli owiec. Piśmiennictwo Bishop, M. D., (1997) Marker Assisted Selection of Sheep. Journal of Animal Science, 75 (1), 142. Boman, I.A., Klemetsdal, G., Blichfeldt, T., Nafstad, O., Vage, D.I., (2009) A frameshift mutation in the coding region of the myostatin gene (MSTN) affects carcass conformation and fatness in Norwegian White Sheep (Ovis aries). Animal Genetics 40, Boman, I.A., Vage, D.I., (2009) An insertion in the coding region of the myostatin (MSTN) gene affects carcass conformation and fatness in the Norwegian Spælsau (Ovis aries). BMC Research Notes, 2 (98) DOI: / Byun, S.O., Zhou, H., Forrest, R.H., Frampton, C.M., Hickford, J.G., (2008) Association of the ovine calpastatin gene with birth weight and growth rate to weaning. Animal Genetics, 39 (5), Carragher, N.O., Frame, M.C., (2002) Calpain: a role in cell transformation and migration. The International Journal of Biochemistry & Cell Biology, 34 (12), Chung, H., Davis M., (2012) PCR-RFLP of the Ovine Calpastatin Gene and its Association with Growth. Asian Journal of Animal and Veterinary Advances, 7, Clop A., Marcq, F., Takeda, H., Pirottin, D., Tordoir, X., Bibe, B., Bouix, J., Caiment, F., Elsen, J.M., Eychenne, F., Larzul, C., Laville, E., Meish, F., Milenkovic, D., Tobin, J., Charlier, C., Georges, M., (2006) A mutation creating a potential illegitimate microrna target site in the myostatin gene affects muscularity in sheep. Nature Genetics, 38, Davis, G.H., McEwan, J.C., Fennessy, P.F., Dodds, K.D., McNatty, K.P., O, W.S. (1992) Infertility due to bilateral ovarian hypoplasia in sheep homozygous (FecXI FecXI) for the Inverdale prolificacy gene located on the X chromosome. Biology of Reproduction,46, Davis, G.H., (2004). Fecundity genes in sheep. Animal Reproduction Science, 82 83, Davis, G.H., (2005). Major genes affecting ovulation rate in sheep. Genetics Selection Evolution, 37, 11. Dehnavi, E., Azari, M.A., Hasani, S., Nassiry, M.R., Mohajer, M., Ahmadi, A.R.K., (2012) Genetic variability of calpastatin and calpain genes in Iranian Zel sheep using PCR-RFLP and PCR-SSCP methods. Iranian Journal of Biotechnology, 10 (2),
9 Delgado, E.F., Geesink, G.H., Marchello, J.A., Goll, D.E., Koohmaraie, M., (2001) The calpain system in three muscles of normal and callipyge sheep. Journal of Animal Science, 79 (2), Dube, J.L., Wang, P., Elvin, J., Lyons, K.M., Celeste, A.J., Matzuk, M.M., (1998) The bone morphogenetic protein 15 gene is X-linked and expressed in oocytes. Molecular Endocrinology,12, Fadiel, A., Anidi, I., Eichenbaum, K.D., (2005) Farm animal genomics and informatics: an update. Nucleic Acids Research, 33 (19), Galloway, S.M., McNatty, K.P., Cambridge, L.M., Laitinen, M.P., Juengel, J.L., Jokiranta, T.S., McLaren, R.J., Luiro, K., Dodds, K.G., Montgomery, G.W., Beattie, A.E., Davis, G.H., Ritvos, O., (2000) Mutations in an oocytederived growth factor gene (BMP15) cause increased ovulation rate and infertility in a dosage-sensitive manner. Nature Genetics, 25, Goll, D.E., Thompson, V.F., Taylor, R.G., Oualia, A., (1998) The calpain system and skeletal muscle growth. Canadian Journal of Animal Science,78 (4), Gui, L.M., Joyce, I.M., (2005) RNA interference evidence that growth differentiation Factor-9 mediates oocyte regulation of cumulus expansion in mice. Biology of Reproduction,72, GUS, Główny Urząd Statystyczny. Departament Rolnictwa Pogłowie bydła i owiec według stanu w grudniu 2012 r. Materiał na konferencję prasową w dniu r. Hadjipavlou, G., Matika, O., Clop, A., Bishop, S.C., (2008) Two single nucleotide polymorphisms in the myostatin (GDF8) gene have significant association with muscle depth of commercial Charollais sheep. Animal Genetics, 39, Han, J., Zhou, H., Forrest, R.H., Sedcole, J.R., Frampton, C.M., Hickford, J.G.H., (2010) Effect of Myostatin (MSTN) g+6223g>a on Production and Carcass Traits in New Zealand Romney Sheep. Asian-Aust. Journal of Animal Science, 23(7), Hanrahan, J.P., Gregan, S.M., Mulsant, P., Mullen, M., Davis, G.H., Powell, R., Galloway, S.M., (2004) Mutations in the genes for oocyte-derived growth factors GDF9 and BMP15 are associated with both increased ovulation rate and sterility in Cambridge and Belclare sheep (Ovis aries). Biology of Reproduction,70, Harris, B.L., Johnson, D.L., Spelman, R.J., (2008) Genomic selection in New Zealand and the implications for national genetic evaluation. Proceedings of the Interbull Meeting, Niagara Falls, Canada Hope, M., Haynes, F., Oddy, H., Koohmaraie, M., Al-Owaimer, A., Geesink, G., (2013) The effects of the myostatin g+6723g>a mutation on carcass and meat quality of lamb. Meat Science, 95, Kijas, J. W., McCulloch R., Edwards J. E., Oddy V. H., Lee S. H., van der Werf J., (2007) Evidence for multiple alleles effecting muscling and fatness at the Ovine GDF8 Locus. BMC Genetic, 8,
10 Klepacki, B., Rokicki, T., (2005) Produkcja owiec szansą zwiększenia dochodów dla gospodarstw rolnych. Wieś Jutra, 11(87). Lee, H.L., Sante- Lhoutellier, V., Vigouroux, S., Briand, Y., Briad, M., (2008) Role of calpains in postmortem proteolysis in chicken muscle. Poultry Science, 87 (10) Lee, S.J., (2004) Regulation of muscle mass by myostatin. Annual Review of Cell and Developmental Biology, 20, Lee, S.J., Mcpherron, A.C., (1999) Myostatin and the control of skeletal muscle mass: Commentary. Current Opinion in Genetics & Development, 9 (5), Marshalla, K., Quiros-Camposa, C., van der Werfb, J.H.J., Kinghornb, B., (2011) Marker-based selection within smallholder production systems in developing countries. Livestock Science, 136 (1), Masri, A.Y., Lambe, N.R., Macfarlane, J.M., Brotherstone, S., Haresign, W., Bünger, L., (2011) Evaluating the effects of a single copy of a mutation in the myostatin gene (c.*1232 GNA) on carcass traits in crossbred lambs. Meat Science, 87, Nassiry, M.R., Tahmoorespourm, M., Javadmanesh, A., Soltani, M., Far, S.F., (2006) Calpastatin polymorphism and its association with daily gain in Kurdi sheep. Iranian Journal of Biotechnology, 4 (3), Notter, D.R., (2008) Genetic aspects of reproductionin sheep. Reproduction in Domestic Animals, 43 (2), Nowak, M., (2005) Rola kalpain w procesie kruszenia mięsa. Żywność. Nauka. Technologia. Jakość, 1 (42), Palmer, B.R., Roberts, N., Hickford, J.G., Bickerstaffe R., (1998) Rapid communication: PCR-RFLP for MspI and NcoEt al. the ovine calpastatin gene. Journal of Animal Science, 76, Polley, S., De, S., Brahma, B., Mukherjee, A., Vinesh, P.V., Batabyal, S., Arora, J.S., Pan, S., Samanta, A.K., Datta, T.K., Goswami, S.L., (2010).Polymorphism of BMPR1B, BMP15 and GDF9fecundity genes in prolific Garola sheep. Tropical Animal Health and Production, 42 (5), Rybak-Krzyszkowska, M., Grzyb, A., Milewicz, T., Krzaczkowska-Sendrakowska, M., Krzysiek, J., (2004) Primary ovarian insufficiency in infertility clinic. Polish Journal of Endocrinology, 6, Suzuki, K., Spromachi, H., Yoshizawa, T., Kinbara, K., Ishiura, S., (1995) Calpain: novel family members, activation, and physiological function. Biological Chemistry, 376 (9), Te Pas, M.F.W., Everts, M.E., Haagsman, H.P., ( 2004) Role of myostatin in muscle growth. Muscle Development of Livestock Animals: Physiology, Genetics and Meat Quality. Cambridge, MA, USA, CABI Publishing, Vacca, G.M., Dhaouadi, A., Rekik, M., Carcangiu, V., Pazzola, M., Detto, M.L., (2010) Prolificacy genotypes at BMPR 1B, BMP15 and GDF9 genes in North African sheep breeds. Small Ruminant Research, 88 (1),
11 Van der Werf, J.H.J., (2007) Marker-assisted selection Current status and future perspectives in crops, livestock, forestry and fish. Chapter 13. Markerassisted selection in sheep and goats. Food And Agriculture Organization Of The United Nations Rome, Van der Werf, J.H.J., (2009) Potential benefit of genomic selection in sheep. Proc. Assoc. Advmt. Anim. Breed. Genet., 18, Walling, G.A., Visscher, P.M., Wilson, A.D., McTeir, B. L., Simm, G., Bishop, S.C., (2004) Mapping of quantitative trait loci for growth and carcass traits in commercial sheep populations. Journal of Animal Science, 82 (8), Zhou, H., Hickford, J.G.H., Gong, H., (2006) Polymorphism of the ovine calpastatin gene. Molecular and Cellular Probes, 21,
Polimorfizm wybranych genów a cechy użytkowości mięsnej owiec. Magdalena Kolenda, Anna Wojciechowska Ewa Grochowska, Sławomir Mroczkowski
Polimorfizm wybranych genów a cechy użytkowości mięsnej owiec Wiadomości Zootechniczne, R. LI (2013), 1: 101 106 Związek polimorfizmów wybranych genów z cechami użytkowości mięsnej owiec Magdalena Kolenda,
Polimorfizm genu kalpastatyny w populacji owiec rasy merynos polski*
Rocz. Nauk. Zoot., T. 38, z. 1 (2011) 29 34 Polimorfizm genu kalpastatyny w populacji owiec rasy merynos polski* * M a g d a l e n a S z k u d l a r e k - K o w a l c z y k, E w a W i ś n i e w s k a,
Polymorphisms of calpastatin gene in sheep
Polymorphisms of calpastatin gene in sheep Polimorfizm genu kalpastatyny owiec Magdalena Szkudlarek-Kowalczyk 1*, Ewa Wiśniewska 1, Sławomir Mroczkowski 1 1 Department of Genetics and General Animal Breeding,
Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec. Cz. I
Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec. Cz. I Wiadomości Zootechniczne, R. L (2012), 1: 21 26 Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec. Cz. I Grzegorz Smołucha, Agata Piestrzyńska-Kajtoch, Barbara
Dziedziczenie poligenowe
Dziedziczenie poligenowe Dziedziczenie cech ilościowych Dziedziczenie wieloczynnikowe Na wartość cechy wpływa Komponenta genetyczna - wspólne oddziaływanie wielu (najczęściej jest to liczba nieznana) genów,
Charakterystyka innych ras czerwonych w Europie zrzeszonych w ERDB
Wiadomości Zootechniczne, R. XLIII (2005), 2: 144-148 zrzeszonych w ERDB Lisbet Holm 1, Piotr Wójcik 2 1 European Red Dairy Breed, Udkaersovej 15, 8200 Aarhus N., Dania 2 Instytut Zootechniki, Dział Genetyki
INSTYTUT GENETYKI I HODOWLI ZWIERZĄT POLSKIEJ AKADEMII NAUK W JASTRZĘBCU. mgr inż. Ewa Metera-Zarzycka
INSTYTUT GENETYKI I HODOWLI ZWIERZĄT POLSKIEJ AKADEMII NAUK W JASTRZĘBCU mgr inż. Ewa Metera-Zarzycka Profil metaboliczny osocza krwi i wartość biologiczna mleka krów w gospodarstwach ekologicznych Praca
Sekwencjonowanie nowej generacji i rozwój programów selekcyjnych w akwakulturze ryb łososiowatych
Sekwencjonowanie nowej generacji i rozwój programów selekcyjnych w akwakulturze ryb łososiowatych Konrad Ocalewicz Zakład Biologii i Ekologii Morza, Instytut Oceanografii, Wydział Oceanografii i Geografii,
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
Jaki koń jest nie każdy widzi - genomika populacji polskich ras koni
Jaki koń jest nie każdy widzi - genomika populacji polskich ras koni Gurgul A., Jasielczuk I., Semik-Gurgul E., Pawlina-Tyszko K., Szmatoła T., Bugno-Poniewierska M. Instytut Zootechniki PIB Zakład Biologii
Nauka Przyroda Technologie
Nauka Przyroda Technologie 2013 Tom 7 Zeszyt 4 ISSN 1897-7820 http://www.npt.up-poznan.net #58 Dział: Zootechnika Copyright Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu ROMAN NIŻNIKOWSKI, GRZEGORZ
Autoreferat. (opis dorobku i osiągnięć naukowych) dr inż. Ewa Grochowska. Polimorfizm wybranych genów i możliwości jego wykorzystania w hodowli owiec
Autoreferat (opis dorobku i osiągnięć naukowych) Polimorfizm wybranych genów i możliwości jego wykorzystania w hodowli owiec Zakład Genetyki i Podstaw Hodowli Zwierząt Katedra Nauk o Zwierzętach Wydział
Możliwości i potencjalne zastosowania Zintegrowanego Systemu Analitycznego do innowacyjnych i kompleksowych badań molekularnych
Możliwości i potencjalne zastosowania Zintegrowanego Systemu Analitycznego do innowacyjnych i kompleksowych badań molekularnych Dzień Otwarty Klastra LifeScience 31 maj 2017, Kraków dr Agata Piestrzyńska-Kajtoch,
Depresja inbredowa i heterozja
Depresja inbredowa i heterozja Charles Darwin Dlaczego rośliny chronią się przed samozapyleniem? Doświadczenie na 57 gatunkach roślin! Samozapłodnienie obniża wigor i płodność większości z 57 gatunków
Tendencje rozwojowe w zakresie cech użytkowych wybranych ras owiec w Polsce w latach
Cechy użytkowe wybranych ras owiec w Polsce Wiadomości Zootechniczne, R. XLIX (2011), 3: 9 18 Tendencje rozwojowe w zakresie cech użytkowych wybranych ras owiec w Polsce w latach 1995 2009 Dariusz Piwczyński,
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
Diagnostyka neurofibromatozy typu I,
Diagnostyka neurofibromatozy typu I, czyli jak to się robi w XXI wieku dr n. biol. Robert Szymańczak Laboratorium NZOZ GENOMED GENOMED S.A. Neurofibromatoza typu I (choroba von Recklinghausena) częstość
Wykład 9: HUMAN GENOME PROJECT HUMAN GENOME PROJECT
Wykład 9: Polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) odrębność genetyczna, która czyni każdego z nas jednostką unikatową Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej HUMAN GENOME
GENOMIKA. MAPOWANIE GENOMÓW MAPY GENOMICZNE
GENOMIKA. MAPOWANIE GENOMÓW MAPY GENOMICZNE Bioinformatyka, wykład 3 (21.X.2008) krzysztof_pawlowski@sggw.waw.pl tydzień temu Gen??? Biologiczne bazy danych historia Biologiczne bazy danych najważniejsze
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (2) GENOMY I ICH ADNOTACJE. Podstawy Bioinformatyki wykład 4
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (2) GENOMY I ICH ADNOTACJE Podstawy Bioinformatyki wykład 4 GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC PODSTAWY BIOINFORMATYKI 2017/2018 MAGDA MIELCZAREK 2 GENOMY I ICH ADNOTACJE
Ekologia molekularna. wykład 14. Genetyka ilościowa
Ekologia molekularna wykład 14 Genetyka ilościowa Dziedziczenie mendlowskie wykład 14/2 Cechy wieloczynnikowe (ilościowe) wzrost masa ciała kolor skóry kolor oczu itp wykład 14/3 Rodzaje cech ilościowych
Podstawy pracy hodowlanej
Podstawy pracy hodowlanej Zwiększenie produkcyjności stada jest możliwe dzięki poprawie warunków środowiska, w jakim bytują zwierzęta, przede wszystkim żywienia i pielęgnacji, a także dzięki prowadzeniu
Polimorfizm genu miostatyny (MSTN) u zwierząt domowych MSTN gene polymorphism in livestock animals
Postepy Hig Med Dosw (online), 2014; 68: 633-639 e-issn 1732-2693 www.phmd.pl Review Received: 2013.09.12 Accepted: 2014.02.25 Published: 2014.05.20 Polimorfizm genu miostatyny (MSTN) u zwierząt domowych
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
PRZYGODY DGV. historia programu selekcji genomowej w Polsce. Joanna Szyda, Andrzej Żarnecki
PRZYGODY DGV historia programu selekcji genomowej w Polsce Joanna Szyda, Andrzej Żarnecki Co to DGV? DGV Direct Genomic Value bezpośrednia genomowa wartość hodowlana suma addytywnych efektów markerów SNP
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (1) GENOMY I ICH ADNOTACJE
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (1) GENOMY I ICH ADNOTACJE Podstawy Bioinformatyki wykład 2 PODSTAWY BIOINFORMATYKI 2018/2019 MAGDA MIELCZAREK 1 GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC PODSTAWY BIOINFORMATYKI
1Roman Niżnikowski, Grzegorz Czub, Marcin Świątek, Krzysztof Głowacz, Magdalena Ślęzak
ZESZYTY NAUKOWE UNIWERSYTETU PRZYRODNICZEGO WE WROCŁAWIU 2013 BIOLOGIA I HODOWLA ZWIERZĄT LXXI NR 600 1Roman Niżnikowski, Grzegorz Czub, Marcin Świątek, Krzysztof Głowacz, Magdalena Ślęzak WPŁYW GENOTYPU
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 6 BAZA DANYCH NCBI - II
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 6 BAZA DANYCH NCBI - II BAZA DANYCH NCBI 1. NCBI 2. Dane gromadzone przez NCBI 3. Przegląd baz danych NCBI: Publikacje naukowe Projekty analizy genomów OMIM: fenotypy człowieka
Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec Cz. II
Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec. Cz. II Wiadomości Zootechniczne, R. L (2012), 2: 5 10 Genetyczny aspekt wysokiej plenności u owiec Cz. II Grzegorz Smołucha, Agata Piestrzyńska-Kajtoch, Barbara
POLIMORFIZM W GENIE TYREOGLOBULINY U BYDŁA RASY JERSEY. Inga Kowalewska-Łuczak, Hanna Kulig, Katarzyna Szewczyk
Acta Sci. Pol., Zootechnica 9 (4) 2010, 129 134 POLIMORFIZM W GENIE TYREOGLOBULINY U BYDŁA RASY JERSEY Inga Kowalewska-Łuczak, Hanna Kulig, Katarzyna Szewczyk Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny
POLSKI ZWIĄZEK HODOWCÓW I PRODUCENTÓW BYDŁA MIĘSNEGO OCENA
POLSKI ZWIĄZEK HODOWCÓW I PRODUCENTÓW BYDŁA MIĘSNEGO OCENA WARTOŚCI UŻYTKOWEJ BYDŁA RAS MIĘSNYCH WYNIKI ZA ROK 2016 WARSZAWA 2017 Opracowanie: Wstęp Prezes PZHiPBM Jacek Zarzecki Rozdziały 2-7 Dział oceny
Wykład: HUMAN GENOME PROJECT HUMAN GENOME PROJECT
Wykład: Polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) odrębność genetyczna, która czyni każdego z nas jednostką unikatową Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej HUMAN GENOME
Nauka Przyroda Technologie
Nauka Przyroda Technologie 2015 Tom 9 Zeszyt 1 #2 ISSN 1897-7820 http://www.npt.up-poznan.net DOI: 10.17306/J.NPT.2015.1.2 Dział: Zootechnika Copyright Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu
Public gene expression data repositoris
Public gene expression data repositoris GEO [Jan 2011]: 520 k samples 21 k experiments Homo, mus, rattus Bos, sus Arabidopsis, oryza, Salmonella, Mycobacterium et al. 17.01.11 14 17.01.11 15 17.01.11 16
Cracow University of Economics Poland. Overview. Sources of Real GDP per Capita Growth: Polish Regional-Macroeconomic Dimensions 2000-2005
Cracow University of Economics Sources of Real GDP per Capita Growth: Polish Regional-Macroeconomic Dimensions 2000-2005 - Key Note Speech - Presented by: Dr. David Clowes The Growth Research Unit CE Europe
POLSKI ZWIĄZEK HODOWCÓW I PRODUCENTÓW BYDŁA MIĘSNEGO WYNIKI OCENY WARTOŚCI UŻYTKOWEJ BYDŁA RAS MIĘSNYCH ZA ROK 2017
POLSKI ZWIĄZEK HODOWCÓW I PRODUCENTÓW BYDŁA MIĘSNEGO WYNIKI OCENY WARTOŚCI UŻYTKOWEJ BYDŁA RAS MIĘSNYCH ZA ROK 2017 WARSZAWA 2018 Opracowanie Wstęp: Prezes PZHiPBM Jacek Zarzecki Rozdziały 2 7 : Dział
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 11 BAZA DANYCH HAPMAP
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 11 BAZA DANYCH HAPMAP WSTĘP 1. SNP 2. haplotyp 3. równowaga sprzężeń 4. zawartość bazy HapMap 5. przykłady zastosowań Copyright 2013, Joanna Szyda HAPMAP BAZA DANYCH HAPMAP - haplotypy
CHARAKTERYSTYKA PRZEDMIOTU Pracownia Informatyczna 1 PRACOWNIA INFORMATYCZNA 2018/2019 MAGDA MIELCZAREK 1
CHARAKTERYSTYKA PRZEDMIOTU Pracownia Informatyczna 1 PRACOWNIA INFORMATYCZNA 2018/2019 MAGDA MIELCZAREK 1 PRACOWNIA INFORMATYCZNA PROWADZĄCY: Dr Magda Mielczarek (biolog) Katedra Genetyki, pokój nr 21
Zarządzanie populacjami zwierząt. Parametry genetyczne cech
Zarządzanie populacjami zwierząt Parametry genetyczne cech Teoria ścieżki zależność przyczynowo-skutkowa X p 01 Z Y p 02 p 01 2 + p 02 2 = 1 współczynniki ścieżek miary związku między przyczyną a skutkiem
Przedmowa Wst p 1. Pochodzenie i udomowienie zwierz t gospodarskich 2. Genetyka ogólna
Spis treści Przedmowa Wstęp Znaczenie metod genetycznych w doskonaleniu produkcji zwierzęcej MoŜliwości produkcyjne współczesnych ras zwierząt gospodarskich Znaczenie gospodarcze produkcji zwierzęcej 1.
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA. Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi Mutacja Mutacja (łac. mutatio zmiana) - zmiana materialnego
Krytyczne czynniki sukcesu w zarządzaniu projektami
Seweryn SPAŁEK Krytyczne czynniki sukcesu w zarządzaniu projektami MONOGRAFIA Wydawnictwo Politechniki Śląskiej Gliwice 2004 SPIS TREŚCI WPROWADZENIE 5 1. ZARZĄDZANIE PROJEKTAMI W ORGANIZACJI 13 1.1. Zarządzanie
Biologia medyczna, lekarski Ćwiczenie ; Ćwiczenie 19
Ćwiczenie 19 Fenotyp sportowca. Geny warunkujące fenotyp sportowca. Testy DNA w ocenie predyspozycji sportowych i ich aspekty etyczne. Genetyka cech ilościowych. Prof. dr hab. Roman Zieliński 1. "Fenotyp
GLOBAL METHANE INITIATIVE PARTNERSHIP-WIDE MEETING 12-14.10.2011 Kraków, Poland
GLOBAL METHANE INITIATIVE PARTNERSHIP-WIDE MEETING 12-14.10.2011 Kraków, Poland INSTITUTE OF TECHNOLOGY AND LIVE SCIENCES POZNAŃ BRANCH Department of Environmental Management in Livestock Buildings and
1. Analiza asocjacyjna. Cechy ciągłe. Cechy binarne. Analiza sprzężeń. Runs of homozygosity. Signatures of selection
BIOINFORMATYKA 1. Wykład wstępny 2. Bazy danych: projektowanie i struktura 3. Równowaga Hardyego-Weinberga, wsp. rekombinacji 4. Analiza asocjacyjna 5. Analiza asocjacyjna 6. Sekwencjonowanie nowej generacji
POLSKI ZWIĄZEK HODOWCÓW I PRODUCENTÓW BYDŁA MIĘSNEGO OCENA
POLSKI ZWIĄZEK HODOWCÓW I PRODUCENTÓW BYDŁA MIĘSNEGO OCENA WARTOŚCI UŻYTKOWEJ BYDŁA RAS MIĘSNYCH WYNIKI ZA ROK 2014 WARSZAWA 2015 Opracowanie: Wstęp Prezes PZHiPBM Bogusław Roguś Rozdziały 2 7 dr inż.
CECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE
CECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE Zarządzanie populacjami zwierząt, ćwiczenia V Dr Wioleta Drobik Rodzaje cech Jakościowe o prostym dziedziczeniu uwarunkowane zwykle przez kilka genów Słaba podatność
Wstęp ARTYKUŁ REDAKCYJNY / LEADING ARTICLE
Dzieciństwo w cieniu schizofrenii przegląd literatury na temat możliwych form pomocy i wsparcia dzieci z rodzin, gdzie jeden z rodziców dotknięty jest schizofrenią Childhood in the shadow of schizophrenia
DOBÓR. Kojarzenie, depresja inbredowa, krzyżowanie, heterozja
DOBÓR Kojarzenie, depresja inbredowa, krzyżowanie, heterozja SELEKCJA grupa osobników obu płci, która ma zostać rodzicami następnego pokolenia DOBÓR OSOBNIKÓW DO KOJARZEŃ POSTĘP HODOWLANY następne pokolenie
Warszawa, r.
Warszawa, 11. 04. 2018 r. Dr hab. Joanna Gruszczyńska Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt Wydział Nauk o Zwierzętach Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie RECENZJA rozprawy doktorskiej
C elem1 niniejszego artykułu jest charakterystyka
Wiadomości Zootechniczne, R. LV (2017), 5: 14 34 A. Gurgul i in. Zarys problematyki badań z zakresu genetyki i genomiki prowadzonych u polskich zachowawczych ras zwierząt w ramach projektu BIOSTRATEG *
OCENA MOśLIWOŚCI WYKORZYSTANIA HODOWLI ŚWIŃ RASY ZŁOTNICKIEJ
ASSESSMENT OF POTENTIAL FOR ZŁOTNICKA SPOTTED PIG BREEDING IN ORGANIC FARMS OCENA MOśLIWOŚCI WYKORZYSTANIA HODOWLI ŚWIŃ RASY ZŁOTNICKIEJ PSTREJ W GOSPODARSTWACH EKOLOGICZNYCH Janusz Tomasz Buczyński (1),
Zarządzanie sieciami telekomunikacyjnymi
SNMP Protocol The Simple Network Management Protocol (SNMP) is an application layer protocol that facilitates the exchange of management information between network devices. It is part of the Transmission
SPRAWOZDANIE MERYTORYCZNE. z wykonanego zadania na rzecz postępu biologicznego w produkcji zwierzęcej
SPRAWOZDANIE MERYTORYCZNE z wykonanego zadania na rzecz postępu biologicznego w produkcji zwierzęcej zrealizowanego na podstawie decyzji Ministra Rolnictwa i Rozwoju Wsi nr 10/2016, znak: ŻWeoz/ek-8628-30/2016(1748),
SWPS Uniwersytet Humanistycznospołeczny. Wydział Zamiejscowy we Wrocławiu. Karolina Horodyska
SWPS Uniwersytet Humanistycznospołeczny Wydział Zamiejscowy we Wrocławiu Karolina Horodyska Warunki skutecznego promowania zdrowej diety i aktywności fizycznej: dobre praktyki w interwencjach psychospołecznych
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 12 MIKROMACIERZE
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 12 MIKROMACIERZE WSTĘP 1. Mikromacierze ekspresyjne tworzenie macierzy przykłady zastosowań 2. Mikromacierze SNP tworzenie macierzy przykłady zastosowań MIKROMACIERZE EKSPRESYJNE
Nauka Przyroda Technologie
Nauka Przyroda Technologie 2013 Tom 7 Zeszyt 4 ISSN 1897-7820 http://www.npt.up-poznan.net #59 Dział: Zootechnika Copyright Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu ROMAN NIŻNIKOWSKI, KRZYSZTOF
Uwarunkowania rozwoju produkcji owczarskiej w Polsce
Tomasz Rokicki Katedra Ekonomiki i Organizacji Przedsiębiorstw Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie Uwarunkowania rozwoju produkcji owczarskiej w Polsce Wstęp Produkcja owczarska w Polsce
Bioinformatyka wykład I.2009
Bioinformatyka wykład 13 20.I.2009 biologia systemów biologiczne dane wielowymiarowe Krzysztof Pawłowski Krzysztof_Pawlowski@sggw.pl 2009-01-22 1 Plan wykładu Biologia systemów Bazy danych ekspresji genów
Opracowanie metod genomowej oceny wartości
Wiadomości Zootechniczne, R. LVII (2019), 1: 109 113 Praktyczne wykorzystanie oceny genomowej w hodowli bydła mlecznego Monika Skarwecka Instytut Zootechniki Państwowy Instytut Badawczy, Zakład Hodowli
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI. Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI Fot. W. Wołkow Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt POPULACJA Zbiór organizmów żywych, które łączy
OCENA WARTOŚCI HODOWLANEJ I ROZPŁODOWEJ LOCH RASY WIELKIEJ BIAŁEJ POLSKIEJ I POLSKIEJ BIAŁEJ ZWISŁOUCHEJ Z REGIONU KUJAWSKO-POMORSKIEGO*
Rocz. Nauk. Zoot., T. 37, z. 2 (2010) 137 144 OCENA WARTOŚCI HODOWLANEJ I ROZPŁODOWEJ LOCH RASY WIELKIEJ BIAŁEJ POLSKIEJ I POLSKIEJ BIAŁEJ ZWISŁOUCHEJ Z REGIONU KUJAWSKO-POMORSKIEGO* * M a r i a B o c
Bioinformatyka. Rodzaje Mutacji
Bioinformatyka (wykład monograficzny) wykład 3. E. Banachowicz Zakład Biofizyki Molekularnej IF UAM http://www.amu.edu.pl/~ewas Rodzaje Mutacji zmienność sekwencji (sequence variation) mutacje polimorfizm
ZESZYTY NAUKOWE WE WROCŁAWIU. nr 603
ZESZYTY NAUKOWE uniwersytetu przyrodniczego WE WROCŁAWIU nr 603 Biologia i hodowla zwierząt biology and animal breeding LXXIV WROCŁAW 2014 Redaktor merytoryczny dr hab. inż. Wojciech Kruszyński Redaktor
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Nazwa kwalifikacji: Organizacja i nadzorowanie produkcji rolniczej Oznaczenie kwalifikacji: R.16 Numer zadania: 01
Arkusz zawiera informacje prawnie chronione do momentu rozpoczęcia egzaminu Układ graficzny CKE 2017 Nazwa kwalifikacji: Organizacja i nadzorowanie produkcji rolniczej Oznaczenie kwalifikacji: R.16 Numer
Badania asocjacyjne w skali genomu (GWAS)
Badania asocjacyjne w skali genomu (GWAS) Wstęp do GWAS Część 1 - Kontrola jakości Bioinformatyczna analiza danych Wykład 2 Dr Wioleta Drobik-Czwarno Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt Badania
Polimorfizm genu kodującego brązowe umaszczenie (TYRP1) w pozycji 215 u krajowych ras owiec i muflona europejskiego (Ovis aries musimon)*
Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego, t. 9 (2013), nr 4, 17-23 Polimorfizm genu kodującego brązowe umaszczenie (TYRP1) w pozycji 215 u krajowych ras owiec i muflona europejskiego (Ovis
Nauka Przyroda Technologie
Nauka Przyroda Technologie 2015 Tom 9 Zeszyt 2 #22 ISSN 1897-7820 http://www.npt.up-poznan.net DOI: 10.17306/J.NPT.2015.2.22 Dział: Zootechnika Copyright Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu
POLSKI ZWIĄZEK HODOWCÓW I PRODUCENTÓW BYDŁA MIĘSNEGO OCENA WARTOŚCI UŻYTKOWEJ BYDŁA RAS MIĘSNYCH WYNIKI ZA ROK 2013
POLSKI ZWIĄZEK HODOWCÓW I PRODUCENTÓW BYDŁA MIĘSNEGO OCENA WARTOŚCI UŻYTKOWEJ BYDŁA RAS MIĘSNYCH WYNIKI ZA ROK 2013 WARSZAWA 2014 OPRACOWANIE: WSTĘP Prezes PZHiPBM dr inż. Paweł Dakowski ROZDZIAŁY 2-7
Genomika funkcjonalna. Wielkoskalowe analizy genetyczne
Genomika funkcjonalna Wielkoskalowe analizy genetyczne Materiały z prezentacji http://www.igib.uw.edu.pl/ Genomika funkcjonalna Kolejny po poznaniu sekwencji (struktury) genomu etap Poznanie funkcji wszystkich
Genomika funkcjonalna. Wielkoskalowe analizy genetyczne
Genomika funkcjonalna Wielkoskalowe analizy genetyczne Materiały z prezentacji http://www.igib.uw.edu.pl/ Genomika funkcjonalna Kolejny po poznaniu sekwencji (struktury) genomu etap Poznanie funkcji wszystkich
Analiza wzrostu jagniąt syntetycznych linii plenno-mięsnych BCP i SCP
Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego, t. 11 (2015), nr 2, 9-16 Analiza wzrostu jagniąt syntetycznych linii plenno-mięsnych BCP i SCP Andrzej Junkuszew, Tomasz M. Gruszecki, Czesława Lipecka,
Składniki jądrowego genomu człowieka
Składniki jądrowego genomu człowieka Genom człowieka 3 000 Mpz (3x10 9, 100 cm) Geny i sekwencje związane z genami (900 Mpz, 30% g. jądrowego) DNA pozagenowy (2100 Mpz, 70%) DNA kodujący (90 Mpz ~ ok.
Postępy genomiki zwierząt domowych
NAUKA 1/2008 27-43 MAREK ŚWITOŃSKI Postępy genomiki zwierząt domowych Ogromny wzrost produkcyjności zwierząt gospodarskich, który miał miejsce w XX wieku, możliwy był dzięki zastosowaniu osiągnięć nauk
Identyfikacja QTL warunkujących długość liścia flagowego w dwóch populacjach mapujących żyta (Secale cereale L.)
NR 250 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2008 PAWEŁ MILCZARSKI Katedra Genetyki i Hodowli Roślin Akademia Rolnicza w Szczecinie Identyfikacja QTL warunkujących długość liścia flagowego
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH GENOMY I ICH ADNOTACJE. Pracownia Informatyczna 2
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH GENOMY I ICH ADNOTACJE Pracownia Informatyczna 2 WYBRANE BIOLOGICZNE BAZY DANYCH GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC NATIONAL CENTER FOR BIOTECHNOLOGY INFORMATION NCBI Utworzone
Zmienność. środa, 23 listopada 11
Zmienność http://ggoralski.com Zmienność Zmienność - rodzaje Zmienność obserwuje się zarówno między poszczególnymi osobnikami jak i między populacjami. Różnice te mogą mieć jednak różne podłoże. Mogą one
Polimorfizm genu białka prionowego PrP w stadach owiec rasy merynos polski i berrichone du cher
Med. Weter. 2016, 72 (1), 75-79 75 Praca oryginalna Original paper Polimorfizm genu białka prionowego PrP w stadach owiec rasy merynos polski i berrichone du cher ROMAN NIŻNIKOWSKI, ARTUR OPRZĄDEK*, GRZEGORZ
Daniel Polasik, Paulina Adamska, Katarzyna Wojdak-Maksymiec, Marek Kmieć, Arkadiusz Terman
Acta Sci. Pol., Zootechnica 9 (4) 2010, 199 206 POLIMORFIZM GENU IGF-1 U BYDŁA RASY POLSKA HOLSZTYŃSKO-FRYZYJSKA Daniel Polasik, Paulina Adamska, Katarzyna Wojdak-Maksymiec, Marek Kmieć, Arkadiusz Terman
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19
003 Uchwała RW Nr 136/2018 z dnia 24 maja 2018 r. zmiana w ofercie przedmiotów do wyboru dla II roku 2018/19 (zmiana Uchwały RW Nr 130/2017 z dnia 25 maja 2017 r.) Genetyka i biologia eksperymentalna studia
OSI Physical Layer. Network Fundamentals Chapter 8. Version Cisco Systems, Inc. All rights reserved. Cisco Public 1
OSI Physical Layer Network Fundamentals Chapter 8 Version 4.0 1 Warstwa fizyczna modelu OSI Network Fundamentals Rozdział 8 Version 4.0 2 Objectives Explain the role of Physical layer protocols and services
Selekcja materiału rozrodowego
https://www. Selekcja materiału rozrodowego Autor: prof. dr hab. inż. Damian Knecht Data: 28 kwietnia 2019 Doskonalenie genetyczne świń ma bardzo duży wpływ na produkcję trzody chlewnej. Polega ono na
EGZAMIN POTWIERDZAJĄCY KWALIFIKACJE W ZAWODZIE Rok 2018 CZĘŚĆ PRAKTYCZNA
Arkusz zawiera informacje prawnie chronione do momentu rozpoczęcia egzaminu Układ graficzny CKE 2017 Nazwa kwalifikacji: Organizacja i nadzorowanie produkcji rolniczej Oznaczenie kwalifikacji: R.16 Numer
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19/20
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19/20 002 SEMESTR 1 Biofizyka Biophysics 2 E 30 20 10 Chemia ogólna i analityczna General and analytical chemistry 6 E 90 30 60 Matematyka Mathematics
Postępy w realizacji polskiego programu selekcji genomowej buhajów MASinBULL Joanna Szyda
Postępy w realizacji polskiego programu selekcji genomowej buhajów MASinBULL Joanna Szyda Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu Katedra Genetyki, Pracownia Biostatystyki 1. MASinBULL 2. Metody oceny genomowej
PhD THESIS. mgr inż. Magdalena Kolenda. The polymorphism in GDF8 gene and its association with meat performance in the chosen sheep breeds
PhD THESIS mgr inż. Magdalena Kolenda The polymorphism in GDF8 gene and its association with meat performance in the chosen sheep breeds Polimorfizm genu GDF8 i jego powiązanie z cechami użytkowości mięsnej
POLSKI ZWIĄZEK HODOWCÓW I PRODUCENTÓW BYDŁA MIĘSNEGO OCENA WARTOŚCI UŻYTKOWEJ BYDŁA RAS MIĘSNYCH WYNIKI ZA ROK 2012
POLSKI ZWIĄZEK HODOWCÓW I PRODUCENTÓW BYDŁA MIĘSNEGO OCENA WARTOŚCI UŻYTKOWEJ BYDŁA RAS MIĘSNYCH WYNIKI ZA ROK 2012 WARSZAWA 2012 Spis treści 1. Wstęp... 4 2. Organizacja pracy Polskiego Związku Hodowców
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: 1. Otrzymanie pożądanego odcinka DNA z materiału genetycznego dawcy 2. Wprowadzenie obcego DNA do wektora 3. Wprowadzenie wektora, niosącego w sobie
2014-03-26. Analiza sekwencji promotorów
2014-03-26 Analiza sekwencji promotorów 1 2014-03-26 TFy tworzą zawiły układ regulacyjny, na który składają się różne oddziaływania białko białko poprzez wytworzenie PĘTLI Specyficzne TFy Ogólne TFy Benfey,
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1 1 Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Korzeniowych, Pracownia Biotechnologii, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji
SYSTEMY INFORMATYCZNE WSPOMAGAJĄCE HODOWLĘ MAGDALENA FRĄSZCZAK
SYSTEMY INFORMATYCZNE WSPOMAGAJĄCE HODOWLĘ Prowadzący: JOANNA SZYDA MAGDALENA FRĄSZCZAK WSTĘP 1. Systemy informatyczne w hodowli -??? 2. Katedra Genetyki 3. Pracownia biostatystyki - wykorzystanie narzędzi
POGŁOWIE ZWIERZĄT GOSPODARSKICH W WOJEWÓDZTWIE WIELKOPOLSKIM W II POŁOWIE 2012 R. 1
URZĄD STATYSTYCZNY W POZNANIU ul. Jana H. Dąbrowskiego 79, 60-959 Poznań Opracowania sygnalne Data opracowania: luty 2013 Kontakt: e-mail: SekretariatUSPOZ@stat.gov.pl tel. 61 27 98 200, fax 61 27 98 100
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2018/19/20/21
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2018/19/20/21 003 Uchwała RW Nr 141/2018 z dnia 28 czerwca 2018 r. NAZWA PRZEDMIOTU pkt ECTS E/Z suma godz wykł. konw. sem. ćw. lab. ćw. ter. SEMESTR
Podstawy genetyki człowieka. Cechy wieloczynnikowe
Podstawy genetyki człowieka Cechy wieloczynnikowe Dziedziczenie Mendlowskie - jeden gen = jedna cecha np. allele jednego genu decydują o barwie kwiatów groszku Bardziej złożone - interakcje kilku genów
Bliskie Spotkanie z Biologią. Genetyka populacji
Bliskie Spotkanie z Biologią Genetyka populacji Plan wykładu 1) Częstości alleli i genotypów w populacji 2) Prawo Hardy ego-weinberga 3) Dryf genetyczny 4) Efekt założyciela i efekt wąskiego gardła 5)
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT Ćwiczenia 1 mgr Magda Kaczmarek-Okrój magda_kaczmarek_okroj@sggw.pl 1 ZAGADNIENIA struktura genetyczna populacji obliczanie frekwencji genotypów obliczanie frekwencji alleli