ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁODOWSKA LUBLIN POLONIA

Podobne dokumenty
A N N A L E S U N I V E R S I T A T I S M A R I A E C U R I E - S K Ł O D O W S K A L U B L I N P O L O N I A

Autor: dr Mirosława Staniaszek

PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 26/11

PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 04/14. SYLWIA OKOŃ, Dąbrowica, PL KRZYSZTOF KOWALCZYK, Motycz, PL

Wykorzystanie krajowych i światowych zasobów genowych w pracach badawczych oraz hodowlanych pszenicy

Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)

ANNALES UMCS. Opracowanie multiplex PCR do detekcji genów odporności Lr21 i Pm4b w pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.)

WYKORZYSTANIE MARKERÓW MOLEKULARNYCH W HODOWLI ODPORNOŚCIOWEJ POMIDORA NA CHOROBY POWODOWANE PRZEZ FUSARIUM OXYSPORUM

Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV

WYSTĘPOWANIE WYBRANYCH GENÓW ODPORNOŚCI NA PARCH JABŁONI U ODMIAN I GATUNKÓW DZIKICH UŻYWANYCH W PROGRAMACH HODOWLANYCH JABŁONI.

FOLIA POMERANAE UNIVERSITATIS TECHNOLOGIAE STETINENSIS Folia Pomer. Univ. Technol. Stetin., Agric., Aliment., Pisc., Zootech. 2014, 309 (29),

SPRAWOZDANIE O STANIE REALIZACJI ZADANIA z wykonania badań podstawowych na rzecz postępu biologicznego w produkcji roślinnej w 2011 roku

Analiza zmienności allelicznej w locus Xgwm261 w odmianach pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.) zarejestrowanych w Polsce w latach

Ampli-LAMP Babesia canis

IDENTYFIKACJA GENÓW ODPORNOŚCI NA RDZĘ BRUNATNĄ LR19 I LR50 W POLSKICH MATERIAŁACH HODOWLANYCH PSZENICY OZIMEJ

Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1

Identification of the resistance gene to leaf rust (Puccinia recondita) using the Xgdm87 marker in the Polish wheat varieties

TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925

Genetyka, materiały dla studentów Pielęgniarstwa

ANNALES UMCS VOL. LXX (4) SECTIO E AGRICULTURA 2015

ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków)

ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ

Charakterystyka materiałów hodowlanych pszenicy ozimej pod względem odporności na rdzę brunatną (Puccinia triticina)

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R

Zad. 2.2 Poszerzenie puli genetycznej jęczmienia

Ocena zróżnicowania genetycznego materiałów kolekcyjnych pszenżyta ozimego. stabilny pod względem cech plonotwórczych,

WYKRYWANIE MICRODOCHIUM NIVALE VAR. NIVALE I M. NIVALE VAR. MAJUS W PSZENICY OZIMEJ UPRAWIANEJ W RÓŻNYCH SYSTEMACH PRODUKCJI

Biologia medyczna, materiały dla studentów

Poszukiwanie źródeł odporności u pszenic na wirus odglebowej mozaiki zbóż (Soil-borne cereal mosaic virus, SBCMV)

Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16

Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych

Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych

Źródła odporności na rdzę żółtą, rdzę brunatną i rdzę źdźbłową w polskich materiałach hodowlanych pszenicy

Zadanie 2.4. Dr inż. Anna Litwiniec Dr inż. Barbara Skibowska Dr inż. Sandra Cichorz

31 SPRAWOZDANIE MERYTORYCZNE

Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych

Wykorzystanie markerów RAPD do oceny zróżnicowania genotypowego polskich odmian pszenżyta ozimego

Zadanie 2.4 Poszerzanie puli genetycznej buraka cukrowego przez doskonalenie procesu gynogenezy oraz podnoszenie odporno

Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Wydział Agrobioinżynierii Katedra Ekologii Rolniczej ul. Akademicka Lublin tel.

Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9

Program Wieloletni Sprawozdanie za okres r.

Halina Wiśniewska, Michał Kwiatek, Magdalena Gawłowska, Marek Korbas, Maciej Majka, Jolanta Belter oraz 2 pracowników pomocniczych

WPROWADZENIE MATERIAŁ BADAWCZY I CEL BADAŃ

Identification of leaf rust (Puccinia triticina) resistance genes Lr11, Lr13 and Lr16 in wheat cultivars with different origins

Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych

Zadanie nr Kierownik tematu: prof. dr hab. Anna Nadolska-Orczyk

Zastosowanie markerów RAPD do określenia podobieństwa genetycznego odmian jęczmienia ozimego (Hordeum vulgare L.)

Piramidyzacja genów powszechne narzędzie używane w programach hodowlanych

Charakterystyka wybranych odmian i linii Triticum durum pod względem odporności na rdzę brunatną (Puccinia recondita f. sp.

SPRAWOZDANIE O STANIE REALIZACJI ZADANIA z wykonania badań podstawowych na rzecz postępu biologicznego w produkcji roślinnej w 2012 roku

ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁODOWSKA LUBLIN POLONIA

SPRAWOZDANIE O STANIE REALIZACJI ZADANIA z wykonania badań podstawowych na rzecz postępu biologicznego w produkcji roślinnej w 2013 roku

Ampli-LAMP Goose Parvovirus

PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific

Analiza podobieństwa genetycznego odmian orkiszu (Triticum aestivum ssp. spelta L.) za pomocą markerów RAPD

Nauka Przyroda Technologie

Zadanie 2.4. Cel badań:

Genetyczne uwarunkowania mrozoodporności pszenicy i jej współdziałanie z wybranymi cechami użytkowymi

Ocena podatnoœci pszenicy ozimej na rdzê brunatn¹ oraz poszukiwanie Ÿróde³ odpornoœci JERZY CHE KOWSKI, UKASZ STÊPIEÑ*, ANNA STRZEMBICKA**

IDENTYFIKACJA GENÓW PM2, PM3A, PM4B I PM6 W WYBRANYCH ODMIANACH I LINII PSZENICY ZWYCZAJNEJ

SPRAWOZDANIE MERYTORYCZNE

PL B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego

Reakcja odmian pszenżyta ozimego na długoterminowe przechowywanie w banku genów

Acta Agrophysica, 2009,14(3),

Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu

Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:

Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów:

57 (2): , 2017 Published online: ISSN

Zastosowanie markerów DNA do badań odmian składników mieszańcowych rzepaku

Zastosowanie nowych technologii genotypowania w nowoczesnej hodowli i bankach genów

A N N A L E S U N I V E R S I T A T I S M A R I A E C U R I E - S K Ł O D O W S K A L U B L I N P O L O N I A

ANALIZA MOLEKULARNA BIOCENOZ BAKTERYJNYCH Ćwiczenia 2017/18

NR 256 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2010

Prof. zw. dr hab. Daniela Gruszecka Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie

AmpliTest Babesia spp. (PCR)

Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu

Rozdział 8 Pszenżyto jare

Fizjologiczne i molekularne markery tolerancji buraka cukrowego na suszę. Dr Danuta Chołuj

7. Owies W 2012 roku owies zajmował 6,7 % ogólnej powierzchni zasiewów zbóż w Polsce. W województwie łódzkim uprawiany był na powierzchni blisko 50

Analiza podobieństwa genetycznego wybranych gatunków w rodzaju Secale

Kilka Nowych Translokacji. Adam Lukaszewski University of California, Riverside

Prof. dr hab. Helena Kubicka- Matusiewicz Prof. dr hab. Jerzy PuchalskI Polska Akademia Nauk Ogród Botaniczny Centrum Zachowania Różnorodności

Wirulencja populacji Puccinia striiformis sprawcy rdzy żółtej na pszenżycie w Polsce

Tabela 46. Pszenżyto jare odmiany badane w 2016 r.

Wprowadzenie do genetyki sądowej. Materiały biologiczne. Materiały biologiczne: prawidłowe zabezpieczanie śladów

Ampli-LAMP Salmonella species

Zadanie 2.4. Wykonawcy: Dr hab. inż. Maria Gośka, prof. IHAR PIB Dr inż. Anna Litwiniec Dr inż. Barbara Skibowska Mgr inż.

Zestaw dydaktyczny. genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP

Owies. 1. Bingo 2. Komfort

Wirulencja Puccinia triticina sprawcy rdzy brunatnej pszenicy w Polsce w latach

Chromosomowa lokalizacja markerów tolerancyjności na glin u żyta

SPRAWOZDANIE MERYTORYCZNE

Pszenżyto jare. Uwagi ogólne

WALIDACJA TECHNIKI PCR dr inż. Krystyna Pappelbaum WSSE Bydgoszcz

PRZEGLĄD CHORÓB OWSA

ZMIENNOŚĆ ALLELICZNA W LOCUS XGWM 261 W POLSKICH ODMIANACH PSZENICY ZWYCZAJNEJ ZAREJESTROWANYCH DO 1975 ROKU Krzysztof Kowalczyk

Transkrypt:

ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁODOWSKA LUBLIN POLONIA VOL. LXVIII (3) SECTIO E 2013 Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie ul. Akademicka 15, 20-950 Lublin e-mail: justyna.lesniowska@up.lublin.pl JUSTYNA LEŚNIOWSKA-NOWAK, AGNIESZKA GRĄDZIELEWSKA, MARZENA MAJEK Identyfikacja genów odporności na rdzę brunatną w wybranych europejskich odmianach pszenicy zwyczajnej oraz opracowanie warunków Multiplex PCR Identification of the gene resistant to leaf rust in selected European wheat cultivars and Multiplex PCR development Streszczenie. Rdza brunatna powodowana przez grzyb Puccinia triticina jest jedną z najpoważniejszych chorób pszenicy zwyczajnej. Najskuteczniejszym sposobem ograniczania występowania tego patogenu jest wprowadzanie do uprawy odmian z genetycznie uwarunkowaną odpornością. Celem pracy była identyfikacja genów Lr9, Lr10 i Lr19 w europejskich odmianach pszenicy zwyczajnej oraz opracowanie warunków Multiplex PCR w celu jednoczesnej identyfikacji genów Lr9 i Lr19. Opracowanie takiej reakcji umożliwi zmniejszenie kosztów i skrócenie czasu potrzebnego do przeprowadzenia analiz. Słowa kluczowe: pszenżyto, geny karłowatości, wyleganie, komponenty plonu WSTĘP Rdza brunatna obok mączniaka prawdziwego oraz rdzy żółtej jest jedną z najgroźniejszych chorób pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.) powodowaną przez grzyb Puccinia triticina. Najskuteczniejszą metodą kontrolowania i ograniczania skutków porażenia przez ten patogen jest wprowadzenie do uprawy odmian z genetycznie uwarunkowaną odpornością [Kolmer i in. 2007, Lind i Gultyaeva 2007]. Większość genów odporności na rdzę brunatną ma poznaną lokalizację chromosomową, a niemal połowa została przeniesiona z dzikich przodków i gatunków pokrewnych, takich jak: Aegilops speltoides, Aegilops umbellulata, Aegilops tauschii, Aegilops ventricosa, Aegilops elongatum, Aegilops intermedium, Triticum monococcum, Triticum spelta [Błaszczyk i Chełkowski 2010]. Do tej pory opisano ponad 60 genów odporności na rdzę brunatną. Do najbardziej skutecznych należą m.in. geny Lr9, Lr10 i Lr19.

Identyfikacja genów odporności na rdzę brunatną w wybranych europejskich odmianach pszenicy... 21 Gen Lr9 został przeniesiony do pszenicy Chinese Spring z Ae. umbellulata. Cztery lata po jego wprowadzeniu do pszenicy ozimej w USA stwierdzono przełamanie odporności niesionej przez ten gen. Pszenice z genem Lr9 zajmują mniej niż 2% powierzchni uprawy pszenic na świecie [Gupta i in. 2006]. Stosunkowo często występującym w materiałach hodowlanych genem jest Lr10, który znajduje się na krótkim ramieniu chromosomu 1A. Po raz pierwszy został on wykryty w australijskich odmianach pszenic Lee i Timstein. Występuje dość powszechnie w pszenicach uprawianych na terenie Ameryki Północnej i Południowej, w Europie, Afryce oraz Azji Południowej i Wschodniej. Lr10, działając pojedynczo, nie jest skuteczny, jednak w połączeniu z innymi genami może dawać bardzo dobre rezultaty [Cherukuri i in. 2003, Li i in. 2006, 2007]. Lr19 jest natomiast genem zlokalizowanym na długim ramieniu chromosomu 7D. Został przeniesiony z Agropyron elongatum. Zapewnia pełną ochronę przed patotypami rdzy brunatnej. Nie jest on jednak powszechnie używany w programach hodowlanych ze względu na sprzężenie z czynnikiem warunkującym żółte zabarwienie mąki, co nie jest cechą pożądaną [Woźniak-Strzembicka 1997]. Identyfikacja genów odporności w materiałach hodowlanych i odmianach możliwa jest dzięki wykorzystaniu testów żywiciel-patogen lub markerów molekularnych. Selekcja MAS umożliwia identyfikację pożądanych genotypów na wczesnych etapach rozwoju rośliny i w dość krótkim czasie. Opracowanie zaś warunków reakcji Multiplex PCR umożliwiającej jednoczesną identyfikację dwóch lub trzech genów pozwoli na dodatkowe skrócenie czasu i ograniczenie kosztów prowadzonych analiz. Celem prezentowanej pracy była identyfikacja genów Lr9, Lr10 i Lr19 w wybranych europejskich odmianach pszenicy zwyczajnej oraz opracowanie warunków Multiplex PCR do identyfikacji dwóch z nich (Lr9 i Lr19) w pojedynczej reakcji. MATERIAŁ I METODY Przedmiot badań stanowiło 12 odmian pszenicy zwyczajnej pochodzących z krajów Europy Środkowej i Wschodniej (tab. 1). W pracy wykorzystywano również linie izogeniczne odmiany Thatcher zawierające odpowiednie geny Lr oraz linię pozbawioną genetycznie warunkowanej odporności na rdzę brunatną. DNA wyizolowano z liści 5-dniowych siewek przy użyciu zestawu GeneMATRIX Plant & Fungi DNA Purification Kit. Stężenie DNA określono, wykorzystując spektrofotometr NanoDrop 2000. Próbki doprowadzono do jednakowego stężenia DNA 20 ng/µl. PCR przeprowadzono na termocyklerze T Professional (Biometra). Identyfikację genu Lr9 przeprowadzono z wykorzystaniem starterów SCS5 550 -F i SCS5 550 -R o sekwencjach: F: 5 -TGC GCC CTT CAA AGG AAG-3 R: 5 -TGC GCC CTT CTG AAC TGT AT-3 [Gupta i in. 2005]. W skład mieszaniny reakcyjnej o objętości 20 ml wchodziły: 1 bufor do PCR (10 mm Tris ph 8,8, 50 mm KCl, 0,08% Nonidet P40) (Fermentas), 0,1 mm każdego dntp, 10 nm każdego ze starterów, 2 mm MgCl 2, 60 ng genomowego DNA, 0,5 U Taq DNA Polymerase (Fermentas, Litwa). Zastosowano następujący profil termiczny: wstępna denaturacja przez 2 min w 95 C, 35 cykli: 94 C 1 min, 62 C 1 min, 72 C 2 min z końcową inkubacją 7 min w temp. 72 C.

22 J. LEŚNIOWSKA-NOWAK, A. GRĄDZIELEWSKA, M. MAJEK Tabela 1. Badany materiał roślinny Table 1. Analyzed plant material Lp. No. Odmiana pszenicy Cultivare Kraj pochodzenia Country of origin 1 Mobela Polska 2 Tortija Polska 3 Berezina Białoruś 4 Kolhoznaya Białoruś 5 Dar Zaporozhya Ukraina 6 Dniepryanka Ukraina 7 Faktor Rosja 8 Charovnitca Rosja 9 Angelina Rosja 10 Basianka Rosja 11 Lyutestcens Łotwa 12 Priekulskaya Łotwa Gen Gene Kontrola pozytywna Positive control Kontrola negatywna Negative control Lr9 Thatcher z genem Lr9 Thatcher Lr10 Thatcher z genem Lr10 Thatcher Lr19 Thatcher z genem Lr19 Thatcher Identyfikację genu Lr10 rozpoczęto od przeprowadzenia amplifikacji wstępnej z użyciem pary starterów Lrk 10 6 R i F o sekwencjach: F: 5 -AAG ATC AAG TAC CAC TGC-3 R: 5 -TGG AAC CCG AGA AAC CGT CC-3 [Schachermayr i in. 1997]. W skład mieszaniny reakcyjnej o objętości 20 ml wchodziły: 1 bufor do PCR (10 mm Tris ph 8,8, 50 mm KCl, 0,08% Nonidet P40) (Fermentas), 0,1 mm każdego dntp, 5 nm każdego ze starterów, 1,5 mm MgCl 2, 60 ng genomowego DNA, 0,5 U Taq DNA Polymerase (Fermentas, Litwa). Zastosowano następujący profil termiczny: wstępna denaturacja przez 5 min w temp. 95 C, 35 cykli: 94 C 45, 60 C 45, 72 C 90 z końcową inkubacją 10 min w temp. 72 C. Następnie dokonano amplifikacji właściwej z zastosowaniem pary starterów Lrk10 D R i F o sekwencjach: F: 5 -GAA GCC CTT CGT CTC ATC TG-3 R: 5 -TTG ATT CAT TGC AGA TGA GAT CAC-3 [Schachermayr i in. 2001]. Skład mieszaniny reakcyjnej był analogiczny jak przy amplifikacji wstępnej. Zastosowano tylko inny profil termiczny: wstępna denaturacja przez 5 min w temp. 95 C, 40 cykli: 94 C 45, 60 C 45, 72 C 45 z końcową inkubacją 7 min w temp. 72 C. Identyfikację genu Lr19 przeprowadzono z wykorzystaniem starterów GbF i GbR o sekwencjach: F: 5 -CAT CCT TGG GGA CCT C-3 R: 5 -CCA GCT CGC ATA CAT CCA-3 [Prins i in. 2001]. W skład mieszaniny reakcyjnej o objętości 20 ml wchodziły: 1 bufor do PCR (10 mm Tris ph 8,8, 50 mm KCl, 0,08% Nonidet P40) (Fermentas), 0,2 mm każdego dntp, 12,5 nm każdego ze starterów, 2 mm MgCl 2, 100 ng genomowego DNA, 0,625 U Taq DNA Polymerase (Fermentas, Litwa). Zastosowano następujący profil termiczny:

Identyfikacja genów odporności na rdzę brunatną w wybranych europejskich odmianach pszenicy... 23 wstępna denaturacja przez 4 min w temp. 95 C, 35 cykli: 94 C 30, 60 C 30, 72 C 30 z końcową inkubacją 5 min w 72 C. Jednoczesną identyfikację genów odporności na rdzę brunatną Lr9 i Lr19 w pszenicy zwyczajnej przeprowadzono, stosując równocześnie dwie pary starterów specyficznych dla tych genów. Reakcję prowadzono w dwóch powtórzeniach, stosując jako matrycę DNA pochodzące z linii kontrolnych Thatcher Lr9 i Thatcher Lr19. Końcowa objętość mieszaniny reakcyjnej wynosiła 20 µl, a jej skład był następujący: 1 bufor do PCR (10 mm Tris ph 8,8, 50 mm KCl, 0,08% Nonidet P40) (Fermentas), 0,2 mm każdego dntp, 12,5 nm każdego ze starterów, 2 mm MgCl 2, 100 ng genomowego DNA, 1,5 U Taq DNA Polymerase (Fermentas, Litwa). W reakcji tej wykorzystano profil termiczny specyficzny dla identyfikacji genu Lr10. W celu wizualizacji otrzymanych wyników produkty amplifikacji rozdzielano elektroforetycznie w 1,5% żelu agarozowym, zawierającym 0,01% bromku etydyny, w buforze 1 TBE przez 1,5 h przy napięciu 100 V. Po tym czasie żel przeniesiono na transiluminator UV i zarchiwizowano za pomocą systemu DigiGenius (SynGene). Identyfikacja genu Lr9 WYNIKI Po włączeniu do PCR starterów SCS 550 -F i SCS5 550 -R uzyskano produkty o wielkości 550 pz świadczące o obecności genu Lr9. Wyraźny amplikon o tej wielkości zaobserwowano tylko w odmianie Dar Zaporozhya. W pozostałych odmianach nie zaobserwowano produktów o podobnej wielkości (fot. 1). M 1 1 2 2 3 3 4 4 5 5 6 6 7 7 8 8 9 9 10 10 11 11 12 12 P P N N Fot. 1. Obraz elektroforetyczny produktów PCR w 1,5% żelu agarozowym po włączeniu do reakcji pary starterów SCS 550 -F i SCS5 550 -R. M Gene Ruler 100 bp DNA Ladder Plus (Fermentas), 1, 1 Mobela, 2, 2 Tortija, 3, 3 Berezina, 4, 4 Kolhoznaya, 5, 5 Dar Zaporozhya, 6, 6 Dniepryanka, 7, 7 Faktor, 8, 8 Chorovnitca, 9, 9 Angelina, 10, 10 Basianka, 11, 11 Lyutestcens, 12, 12 Priekulskaya, P, P kontrola pozytywna, N, N kontrola negatywna Phot. 1. PCR products separated in 1,5% agarose gel after using of SCS 550 -F and SCS5 550 -R primers. M Gene Ruler 100 bp DNA Ladder Plus (Fermentas), 1, 1 Mobela, 2, 2 Tortija, 3, 3 Berezina, 4, 4 Kolhoznaya, 5, 5 Dar Zaporozhya, 6, 6 Dniepryanka, 7, 7 Faktor, 8, 8 Chorovnitca, 9, 9 Angelina, 10, 10 Basianka, 11, 11 Lyutestcens, 12, 12 Priekulskaya, P, P positive control, N, N negative control Identyfikacja genu Lr10 Po włączeniu do PCR starterów Lrk10D1 i Lrk10D2 otrzymano produkty o wielkości 282 pz świadczące o obecności genu Lr10. Wyraźny amplikon o tej wielkości zaob-

24 J. LEŚNIOWSKA-NOWAK, A. GRĄDZIELEWSKA, M. MAJEK serwowano w odmianach: Mobela, Tortija, Berezina, Kolhoznava, Dniepryanka, Angelina, Basianka, Lyutestcens, Priekulskaya, natomiast w pozostałych odmianach nie zaobserwowano produktów o podobnej wielkości (fot. 2). M 1 1 2 2 3 3 4 4 5 5 6 6 7 7 8 8 9 9 10 10 11 11 12 12 P P N N M Fot. 2. Obraz elektroforetyczny produktów PCR w 1,5% żelu agarozowym po włączeniu do reakcji pary starterów Lrk10D1 i Lrk10D2. M Gene Ruler 100 bp DNA Ladder Plus (Fermentas), 1, 1 Mobela, 2, 2 Tortija, 3, 3 Berezina, 4, 4 Kolhoznaya, 5, 5 Dar Zaporozhya, 6, 6 Dniepryanka, 7, 7 Faktor, 8, 8 Chorovnitca, 9, 9 Angelina, 10, 10 Basianka, 11, 11 Lyutestcens, 12, 12 Priekulskaya, P, P kontrola pozytywna, N, N kontrola negatywna Phot. 2. PCR products separated in 1,5% agarose gel after using of Lrk10D1 and Lrk10D2 primers. M Gene Ruler 100 bp DNA Ladder Plus (Fermentas), 1, 1 Mobela, 2, 2 Tortija, 3, 3 Berezina, 4, 4 Kolhoznaya, 5, 5 Dar Zaporozhya, 6, 6 Dniepryanka, 7, 7 Faktor, 8, 8 Chorovnitca, 9, 9 Angelina, 10, 10 Basianka, 11, 11 Lyutestcens, 12, 12 Priekulskaya, P, P positive control, N, N negative control Identyfikacja genu Lr19 Po włączeniu do PCR starterów GbF i GbR otrzymano produkty o wielkości 130 pz świadczące o obecności genu Lr19. Wyraźny produkt o tej wielkości zaobserwowano w odmianie Angelina, natomiast w pozostałych odmianach nie zaobserwowano produktów o podobnej wielkości (fot. 3). M 1 1 2 2 3 3 4 4 5 5 6 6 7 7 8 8 9 9 10 10 11 11 12 12 P P N N M Fot. 3. Obraz elektroforetyczny produktów PCR w 1,5% żelu agarozowym po włączeniu do reakcji pary starterów GbF i GbR. M Gene Ruler 100 bp DNA Ladder Plus (Fermentas), 1, 1 Mobela, 2, 2 Tortija, 3, 3 Berezina, 4, 4 Kolhoznava, 5, 5 Dar Zaporozhya, 6, 6 Dniepryanka, 7, 7 Faktor, 8, 8 Chorovnitca, 9, 9 Angelina, 10, 10 Basianka, 11, 11 Lyutestcens, 12, 12 Priekulskaya, P, P kontrola pozytywna, N, N kontrola negatywna Phot. 3. PCR products separated in 1,5% agarose gel after using of GbF and GbR. -R primers. M Gene Ruler 100 bp DNA Ladder Plus (Fermentas), 1, 1 Mobela, 2, 2 Tortija, 3, 3 Berezina, 4, 4 Kolhoznaya, 5, 5 Dar Zaporozhya, 6, 6 Dniepryanka, 7, 7 Faktor, 8, 8 Chorovnitca, 9, 9 Angelina, 10, 10 Basianka, 11, 11 Lyutestcens, 12, 12 Priekulskaya, P, P positive control, N, N negative control

Identyfikacja genów odporności na rdzę brunatną w wybranych europejskich odmianach pszenicy... 25 Amplifikacja DNA metodą Multipleks PCR dla genów Lr9 i Lr19 Po włączeniu do PCR dwóch par starterów SCS 550 -F i SCS5 550 -R oraz GbF i GbR otrzymano produkty o wielkościach 550 pz i 130 pz świadczące o obecności odpowiednio genów Lr9 i Lr19. W badanych próbach kontrolnych wyraźnie zaobserwowano oba prążki o tych wielkościach, natomiast w kontrolach negatywnych nie otrzymano żadnych produktów. Dodatkowo nie zauważono innych prążków, które mogą świadczyć o obecności produktów niespecyficznych (fot. 4). M N N 1 2 M Fot. 4. Obraz elektroforetyczny produktów PCR w 1,5% żelu agarozowym po włączeniu do reakcji dwóch par starterów SCS 550 -F i SCS5 550 -R oraz GbF i GbR. M Gene Ruler 100 bp DNA Ladder Plus (Fermentas), 1, 2, próba kontrolna z linii Thatcher Lr9 i Thatcher Lr19, N, N kontrola negatywna Phot. 4. PCR products separated in 1.5% agarose gel after using of SCS 550 -F and SCS5 550 -R as well as GbF and GbR. -R primers. M Gene Ruler 100 bp DNA Ladder Plus (Fermentas), N, N negative control, 1, 2 positive control Thatcher Lr9 and Thatcher Lr19 lines DYSKUSJA W badaniach własnych podjęto próbę genotypowania 12 europejskich odmian uprawnych pod kątem obecności genów odporności na rdzę brunatną. Podobne badania prowadzili Stępień i in. [2003], którzy analizowali 37 odmian pszenicy zwyczajnej, pochodzących z 7 europejskich państw oraz 15 linii hodowlanych, pod kątem użyteczności markerów STS w identyfikacji siedmiu genów Lr odporności na rdzę brunatną (Lr9, Lr10, Lr19, Lr24, Lr26 i Lr37). Gen Lr9 zidentyfikowano w dwóch liniach hodowlanych. Gen Lr10 był obecny w 16 z 37 analizowanych odmian, natomiast gen Lr19 występował w trzech liniach hodowlanych. Identyfikacja, w badaniach własnych, form zawierających konkretne geny odporności umożliwi wykorzystanie ich w programach hodowlanych jako źródła odporności na rdzę brunatną. Na szczególną uwagę zasługuje tutaj odmiana Angelina zawierająca geny Lr10 i Lr19.

26 J. LEŚNIOWSKA-NOWAK, A. GRĄDZIELEWSKA, M. MAJEK Schachermayr i in. [1994] przetestowali 20 linii za pomocą markerów RAPD oraz STS i w 19 z nich stwierdzili obecność genu Lr19. Uzyskane wyniki były identyczne przy użyciu obu systemów markerowych. W badaniach własnych spośród 12 analizowanych odmian obecność produktu o wielkości 550 pz, świadczącego o występowaniu genu Lr9, stwierdzono w jednej odmianie Dar Zaporozhya, co świadczy o tym, że gen ten nie występuje powszechnie w europejskich odmianach pszenicy zwyczajnej. Schachermayr i in. [1997] opracowali markery molekularne pozwalające na identyfikację genu Lr10 kodującego receptor kinezy. Wykorzystali do tego celu system markerowy RFLP. Identyfikację genu Lr10 przy zastosowaniu opracowanych markerów autorzy przeprowadzili w 12 odmianach pszenicy i w 50 europejskich liniach hodowlanych. Wszystkie badane odmiany wykazywały obecność tych samych alleli genu Lr10 co linia Thatcher Lr10. Większość natomiast linii o nieznanej kompozycji locus Lr10 nie wykazywała obecności tego genu. Spośród badanych linii sześć wykazywało ten sam allel co linia Thatcher Lr10, natomiast 20% linii zawierało inny allel. Kombinacja markerów STS Lrk10-6 została również wykorzystana przez Hanzalovą i in. [2009] w celu wykrycia genu Lr10. Spośród 28 testowanych odmian pszenicy zwyczajnej gen ten zaobserwowano w 10 odmianach, co dowodzi, że jest on stosunkowo powszechnie wykorzystywany w programach hodowlanych. Powszechne wykorzystanie tego genu zostało również potwierdzone w badaniach własnych, gdzie stwierdzono jego obecność w 9 odmianach spośród 12 badanych. Gen Lr 19 jest wykorzystywany w programach hodowlanych polskich spółek. Okoń i in. [2012] prowadzili badania pod kątem identyfikacji tego genu w liniach hodowlanych. Brak genu stwierdzono we wszystkich formach pochodzących z Poznańskiej Hodowli Roślin oraz Małopolskiej Hodowli Roślin. Obecność genu Lr19 została stwierdzona jedynie w 33 liniach pochodzących z Hodowli Roślin Strzelce. Podobne wyniki uzyskali Kowalczyk i in. [2012]. Gen ten został zidentyfikowany w 20 liniach pochodzących z Hodowli Roślin Strzelce i pięciu pochodzących z Hodowli Roślin Smolice. Ponadto Kowalczyk i in. [2009] zidentyfikowali gen Lr19 w 38 formach spośród 350 analizowanych genotypów. W przedstawionej pracy gen ten został stwierdzony tylko w jednej odmianie. Badania własne oraz innych autorów wskazują na niewielką popularność tego genu w programach hodowlanych pszenicy zwyczajnej. W pracy podjęto również udaną próbę opracowania warunków Multiplex PCR dla genów Lr9 i Lr19. Nie włączono genu Lr10 ze względu na konieczność stosowania podwójnej amplifikacji. Warunki Multiplex PCR dla genów Lr26 i Lr37 opracowały i zoptymalizowały Sumíková i Hanzalová [2010]. Froidmont [1998] podjął się natomiast jednoczesnej identyfikacji pszenno-żytniej translokacji 1BL/1RS niosącej gen Yr9 nadający odporność na rdzę żółtą, gen Sr31 nadający odporność na rdzę źdźbłową, gen Lr26 nadający odporność na rdzę brunatną oraz gen Pm8 nadający odporność na mączniaka prawdziwego. WNIOSKI 1. Na podstawie uzyskanych wyników badań stwierdzono obecność genu Lr10 w dziewięciu testowanych odmianach pszenicy zwyczajnej, co świadczy o powszechnym wykorzystaniu tego genu w europejskich programach hodowlanych pszenicy zwyczajnej.

Identyfikacja genów odporności na rdzę brunatną w wybranych europejskich odmianach pszenicy... 27 2. Odmiana Angelina, w której zidentyfikowano zarówno gen Lr10, jak i Lr19, może być bardzo dobrym donorem genów odporności na rdzę brunatną w programach hodowlanych pszenicy oraz pszenżyta. 3. Opracowano warunki Multiplex PCR umożliwiające identyfikację genów Lr9 i Lr19, co pozwoli na ograniczenie kosztów analiz. PIŚMIENNICTWO Błaszczyk L., Chełkowski J., 2010. Geny odporności na patogeny w genomie pszenicy. Hod. Roś. Nasienn. 3, 15 22. Cherukuri D.P., Gupta S.K., Charpe A., Koul S., Prabhu K.V., Singh R.B., Hag Q.M., Chauhan S.V.S., 2003. Identification of a molecular marker linked to an Agropyrum elongatum derived gene Lr19 for leaf rust resistance in wheat. Plant Breed. 122, 204 208. Froidmont D., 1998. A co-dominant marker for the 1BL/1RS wheat-rye translocation via multiplex PCR. J. Cereal. Sci. 27 (3), 229 232. Gupta S.K., Chape A., Koul S., Prabhu K.V., Hag Q.M.R., 2005. Development and validation of molecular markers linked to an Aegilops umbellulata derived leaf-rust-resistance gene, Lr9, for marker assisted selection in bread wheat. Genome 48, 823 830. Gupta S.K., Charpe A., Prabhu K.V., Haque Q.M.R., 2006. Identification and validarion of molecular markers linked to the leaf rust resistance gene Lr19 in wheat. Theor. Appl. Genet. 113, 1027 1036. Hanzalová A., Sumíková T., Bartoš P., 2009. Determination of Leaf Rust Resistance Gene Lr10, Lr26 and Lr37 by Molecular Markers in Wheat Cultivars Registred in Czech Republic. Czech J. Genet. Plant Breed. 45 (2), 79 84. Kolmer J.A., Jin Y., Long D.L., 2007. Wheat leaf rust in the United States. Austr. J. Agric. Res. 58, 631 638. Kowalczyk K., Okoń S., Leśniowska-Nowak J., Nowak M., 2009. Wykorzystanie genów odporności na rdzę brunatną Lr19, Lr21 i Lr35 w programach hodowlanych pszenicy zwyczajnej w Polsce. Zesz. Probl. Post. Nauk Rol. 542, 255 260. Kowalczyk K., Okoń S., Nowak M., Leśniowska-Nowak J., 2012. Using of DNA markers for selection of common wheat in Polish breeding programs. EWAC Newsletter, Proc. of the 15th Int. Conf. Novi Sad, Serbia 59 62. Li X., Yang W., Li Y., Liu D., Yan H., Meng Q., Zhang T., 2006. A SSR marker for leaf rust resistance gene Lr19 in wheat. Agric. Sci. China 5, 111 115. Li X., Yang W., Li Y., Liu D., Yan H., Meng Q., Zhang T., 2007. Identification of AFLP markers linked to Lr19 resistance to wheat leaf rust. Agric. Sci. China 6, 311 315. Lind V., Gultyaeva E., 2007. Virulence frequencies of Puccinia triticina in Germany and the european regions of Russian Federation. J. Phytopathol. 155, 13 21. Okoń S., Matysik P., Nita Z., Bichoński A., Rubrycki A., Woźniak-Pawlak U., Kowalczyk K., 2012. Identyfikacja genu Lr 19 odporności na rdzę brunatną w polskich liniach pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.). Annales UMCS, Sec. E., Agricultura 67 (3), 39 43. Prins R., Groenewald J.Z., Marais G.F., Snape J. W., Koebner R.M.D., 2001. AFLP and STS tagging of Lr19, a gene conferring resistance to leaf rust in wheat. Theor. Appl. Genet. 103, 618 624. Schachermayr G., Feuillet C., Keller B., 1997. Molecular markers for the detection of the wheat leaf rust resistance gene Lr10 in diverse genetic backgrounds. Mol. Breed. 3, 65 74. Schachermayr G., Siedlec H., Gale M. D., Winzler H., Winzler M., Keller G., 1994. Identification and localization of molecular markers linked to the Lr9 leaf rust resistance gene of wheat. Theor. Appl. Genet. 88, 110 115.

28 J. LEŚNIOWSKA-NOWAK, A. GRĄDZIELEWSKA, M. MAJEK Stępień Ł., Golka L., Chełkowski J., 2003. Leaf rust resistance genes of wheat: identification in cultivars and resistance sources. J. Appl. Genet. 44 (2), 139 149. Sumíková T., Hanzalová A., 2010. Multiplex PCR Assay to Detect Rust Resistance Genes Lr26 and Lr37 in Wheat. Czech J. Genet. Plant Breed. 46 (2), 85 89. Woźniak-Strzembicka A., 1997. Rdza brunatna pszenicy genetyczne podstawy odporności. Biul. IHAR 204, 245 251. Summary. Leaf rust caused by fungus Puccinia triticina, is considered to be one of the most significant diseases of bread wheat. The most efficient way of this pathogen limitation is breeding and cultivation of resistant cultivars with genetically introduced resistance. The aim of the study was identification of Lr9, Lr10 and Lr19 genes in European wheat cultivars and development of Multiplex PCR conditions for Lr9 and Lr19 genes identification. Development of this kind of reaction enables to reduce the cost and time of the analysis. Key words: triticale, dwarfing genes, lodging, yield components