BIOMETRIA 1. Wykład wstępny 2. Opis danych przeznaczonych do analizy 3. Wprowadzenie do pakietu SAS 4. SAS Wykresy 5. SAS Test t 6. SAS Test c2 7. SAS Regresja liniowa 8. SAS Analiza wariancji 9. Wprowadzenie do pakietu R 10.R Wykresy 11.R Test t 12.R Test c2 13.R Regresja liniowa 14.R Analiza wariancji 15.R Wykład podsumowujący
WSTĘP 1. SAS praca z programem 2. Wprowadzanie i edycja danych
SAS FUNKCJE edycja analiza różnorodne metody statystyczne wizualizacja wykonywanie wykresów bazy danych... PROGRAM KOMERCYJNY roczna licencja ZALETY stale wzbogacany możliwość analizy bardzo dużych zbiorów danych
SAS STRUKTURA PAKIETU zbiór "procedur" wykonywanie konkretnych analiz / wykresów modyfikacja procedur opcje tworzenie własnych programów SAS dla WINDOWS interfejs graficzny 3 okna SAS dla LINUX interfejs graficzny + linia komend
PRACA Z PROGRAMEM
PRACA Z PROGRAMEM WYKONANIE BRAK BŁĘDÓW PROGRAM EDITOR INSTRUKCJE LOG BŁĘDY OUTPUT INTERPRETACJA
PRACA Z PROGRAMEM OKNO PROGRAM EDITOR
OKNO PROGRAM EDITOR INSTRUKCJE TWORZENIE INSTRUKCJI, KTÓRE ZOSTANĄ WYKONANE PRZEZ PAKIET SAS INSTRUKCJE MUSZĄ ZAWIERAĆ: specyfikację pliku zawierającego dane format danych w pliku specyfikację metod statystycznych wpisanie instrukcji bezpośrednio w oknie skopiowanie instrukcji z zewnętrznego pliku
OKNO PROGRAM EDITOR INSTRUKCJE WPISANIE INSTRUKCJI
OKNO PROGRAM EDITOR INSTRUKCJE WPROWADZENIE INSTRUKCJI Z PLIKU
OKNO PROGRAM EDITOR INSTRUKCJE WYKONANIE INSTRUKCJI
PRACA Z PROGRAMEM OKNO LOG
OKNO LOG KOMUNIKATY W OKNIE LOG ZAWARTE SĄ INFORMACJE O PRZEBIEGU DZIAŁANIA PROGRAMU, m. in.: nazwa pliku zawierającego dane liczba analizowanych osobników liczba osobników z brakującymi danymi oraz informacje o ewentualnych błędach komunikaty w oknie LOG należy przeanalizować po wykonaniu instrukcji z okna PROGRAM EDITOR, a przed (!!! ) interpretacją wyników
OKNO LOG KOMUNIKATY BRAK BŁĘDU BŁĄD
PRACA Z PROGRAMEM OKNO OUTPUT
OKNO OUTPUT WYNIKI
PRACA Z PROGRAMEM STRUKTURA PROGRAMU
STRUKTURA PROGRAMU ZBIÓR DANYCH definicja zbioru danych wczytanie danych do programu OBLICZENIA edycja danych wybór procedur statystycznych wybór procedur graficznych + wybór opcji dla procedur
PROGRAM EDYCJA DANYCH /* 15.03.2011 JS read data on alcohol dependence */ data ALCOHOL ; infile 'c:/asia/class/pakietystatystycznebioinf/lectures/gaw.txt' delimiter='09'x firstobs=2 ; input FAMID IID FID MID SEX $ AGE_INTERVIEW ETHNICITY ALCDEPEND AGE_ONSET MAXDRINK MAXCIGAR ; * define missing codes ; if FAMID eq 0 then delete ; if IID eq 0 then delete ; if SEX ne 'F' or SEX ne 'M' then SEX=. ; if AGE_INTERVIEW gt AGE_ONSET then delete ; * modify data ; AGE_INTERVIEW=AGE_INTERVIEW*12 ; run ; /* data summary */ proc means data=alcohol ; run ; proc univariate data=alcohol ; run ; proc freq data=alcohol ; tables SEX ; tables ETHNICITY ; run ;
PROGRAM EDYCJA DANYCH /* 15.03.2011 JS read data on alcohol dependence */ komentarz data ALCOHOL ; nazwa zbioru danych infile 'c:/gaw.txt' delimiter='09'x firstobs=2 ; ścieżka do pliku, struktura danych input FAMID IID FID MID SEX $ AGE_INTERVIEW ETHNICITY ALCDEPEND AGE_ONSET MAXDRINK MAXCIGAR ; nazwy zmiennych * define missing codes ; komentarz if FAMID eq 0 then delete ; usuwanie brakujących danych if IID eq 0 then delete ; if SEX ne 'F' or SEX ne 'M' then SEX=. ; kod brakujących danych if AGE_INTERVIEW gt AGE_ONSET then delete ; sprawdzanie poprawności co jeszcze trzeba umieścić w tym miejscu??? jaka jest składnia programu??? * modify data ; AGE_INTERVIEW=AGE_INTERVIEW*12 ; run ; modyfikacja zmiennych
PROGRAM EDYCJA DANYCH PROCEDURY PODSUMOWANIA DANYCH /* data summary */ proc means data=alcohol ; run ; proc univariate data=alcohol ; run ; proc freq data=alcohol ; tables SEX ; tables ETHNICITY ; run ;
LITERATURA http://support.sas.com/documentation/onlinedoc/91pdf/index.html