Rys historyczny. Rys historyczny (2) Przykłady zobrazowań. Rodzaje źródeł obrazowania



Podobne dokumenty
NMR (MAGNETYCZNY REZONANS JĄDROWY) dr Marcin Lipowczan

Sprzęt stosowany w pozytonowej tomografii emisyjnej

ABC tomografii komputerowej

Wykład 4. metody badania mózgu II. dr Marek Binder Zakład Psychofizjologii

Wykorzystanie zjawiska rezonansu magnetycznego w medycynie. Mariusz Grocki

Magnetyczny Rezonans Jądrowy (NMR)

Rodzaje badań obrazowych i ich podstawy teoretyczne. Podstawy fizyczne diagnostyki obrazowej. Rentgenodiagnostyka. dr n. med.

AKCELERATORY I DETEKTORY WOKÓŁ NAS

Spektroskopia magnetycznego rezonansu jądrowego - wprowadzenie

Techniki Jądrowe w Diagnostyce i Terapii Medycznej

Wyznaczanie profilu wiązki promieniowania używanego do cechowania tomografu PET

lek. wet. Joanna Głodek Katedra Chirurgii i Rentgenologii z Kliniką Wydział Medycyny Weterynaryjnej Uniwersytet Warmińsko Mazurski w Olsztynie

Metody rezonansowe. Magnetyczny rezonans jądrowy Magnetometr protonowy

Magnetyczny rezonans jądrowy

Metody obrazowania wmedycynie

Obrazowanie MRI Skopia rtg Scyntygrafia PET

Techniki Jądrowe w Diagnostyce i Terapii Medycznej

Rodzaje badań obrazowych i ich podstawy teoretyczne. Podstawy fizyczne diagnostyki obrazowej. Rentgenodiagnostyka. dr n. med.

impulsowe gradienty B 0 Pulsed Field Gradients (PFG)

( F ) I. Zagadnienia. II. Zadania

Październik 2013 Grupa Voxel

PRZEWODNIK PO PRZEDMIOCIE

Wprowadzenie do analizy obrazów medycznych. Łukasz Trzciałkowski 1

Ćwiczenie 363. Polaryzacja światła sprawdzanie prawa Malusa. Początkowa wartość kąta 0..

Badania obrazowe w diagnostyce chorób serca. II Katedra i klinika Kardiologii CM UMK

Oddziaływanie cząstek z materią

Wg W. Duch Jak działa mózg. UMK Toruń notatki z wprowadzenia do kognitywistyki. Dostępne na str.

SPEKTROSKOPIA NMR. No. 0

FIZYKA III MEL Fizyka jądrowa i cząstek elementarnych

PL B1. Uniwersytet Śląski,Katowice,PL BUP 25/02. Andrzej Dyszkiewicz,Cieszyn,PL Zygmunt Wróbel,Katowice,PL

MATERIAŁY POMOCNICZE DO WYKŁADU Z BIO-

MAGNETYCZNY REZONANS JĄDROWY - podstawy

Pomiar energii wiązania deuteronu. Celem ćwiczenia jest wyznaczenie energii wiązania deuteronu

Zestaw ćwiczeń laboratoryjnych z Biofizyki dla kierunku elektroradiologia w roku akademickim 2017/2018.

Zestaw ćwiczeń laboratoryjnych z Biofizyki dla kierunku Elektroradiologia w roku akademickim 2016/2017.

Nowoczesne techniki obrazowania w medycynie. Jakub Zieliński Zakład Biofizyki i Fizjologii Człowieka WUM

Tak określił mechanikę kwantową laureat nagrody Nobla Ryszard Feynman ( ) mechanika kwantowa opisuje naturę w sposób prawdziwy, jako absurd.

Komputerowe obrazowanie medyczne

I ,11-1, 1, C, , 1, C

Med-fizykadla nie-fizyków. mgr inż. Anna Kozłowska Zakład Dydaktyki Fizyki UMK

Ponadto, jeśli fala charakteryzuje się sferycznym czołem falowym, powyższy wzór można zapisać w następujący sposób:

Praktyka z diagnostycznych metod nieradiacyjnych

Theory Polish (Poland)

PET. Positron Emission Tomography. Tomograf PET. Wytwórnia radiofarmaceutyków linia technologiczna. Wytwórnia radiofarmaceutyków centrum sterowania

Fala jest zaburzeniem, rozchodzącym się w ośrodku, przy czym żadna część ośrodka nie wykonuje zbyt dużego ruchu

SYMULACJA GAMMA KAMERY MATERIAŁ DLA STUDENTÓW. Szacowanie pochłoniętej energii promieniowania jonizującego

Spin jądra atomowego. Podstawy fizyki jądrowej - B.Kamys 1

II KATEDRA KARDIOLOGII CM UMK

zadania zamknięte W zadaniach od 1. do 10. wybierz i zaznacz jedną poprawną odpowiedź.

2008/2009. Seweryn Kowalski IVp IF pok.424

Praktyczne aspekty ultrasonografii jamy brzusznej u małych zwierząt

WSTĘP. Skaner PET-CT GE Discovery IQ uruchomiony we Wrocławiu w 2015 roku.

Lekcja 81. Temat: Widma fal.

Wprowadzenie do technologii HDR

Komputery są dziś powszechnie stosowane do przechowywania, przetwarzania i przesyłania także obrazów.

LASERY I ICH ZASTOSOWANIE

Badanie schematu rozpadu jodu 128 I

Procedury TK i MR - zalecenia PLTR

Promieniowanie rentgenowskie. Podstawowe pojęcia krystalograficzne

Światło fala, czy strumień cząstek?

I. PROMIENIOWANIE CIEPLNE

Poziom nieco zaawansowany Wykład 2

Widmo fal elektromagnetycznych

Urządzenia do planowania radioterapii (Symulatory i TK)

Badanie schematu rozpadu jodu 128 J

Anatomia radiologiczna. Kończyny

Interferometr Michelsona zasada i zastosowanie

doświadczenie Rutheforda Jądro atomowe składa się z nuklonów: neutronów (obojętnych elektrycznie) i protonów (posiadających ładunek dodatni +e)

SPEKTROMETRIA CIEKŁOSCYNTYLACYJNA

Ciało doskonale czarne absorbuje całkowicie padające promieniowanie. Parametry promieniowania ciała doskonale czarnego zależą tylko jego temperatury.

Atomy mają moment pędu

Efekt Dopplera. dr inż. Romuald Kędzierski

Kwantowe własności promieniowania, ciało doskonale czarne, zjawisko fotoelektryczne zewnętrzne.

II.6 Atomy w zewnętrznym polu magnetycznym

γ6 Liniowy Model Pozytonowego Tomografu Emisyjnego

uzyskujemy promienie X. Poniżzy rysunek przedstawia zasadę działania lampy Rentgenowskiej: ruch elektronow

Neurokognitywistyka WYKŁAD 5 Nowe metody badawcze

PROGRAM STAŻU SZKOLENIOWEGO DLA NAUCZYCIELI W ZAWODZIE TECHNIK ELEKTRORADIOLOG

MOMENT MAGNETYCZNY W POLU MAGNETYCZNYM

ŚWIADCZENIA TOMOGRAFII KOMPUTEROWEJ. Kod. Lp. ICD TK głowy bez środka kontrastującego 1. Personel:

Katedra Fizyki Ciała Stałego Uniwersytetu Łódzkiego. Ćwiczenie 1 Badanie efektu Faraday a w monokryształach o strukturze granatu

Wzajemne relacje pomiędzy promieniowaniem a materią wynikają ze zjawisk związanych z oddziaływaniem promieniowania z materią. Do podstawowych zjawisk

cz. 1. dr inż. Zbigniew Szklarski

Podstawy Rentgenowskiej Tomografii Komputerowej

Widmo promieniowania

Rozważania rozpoczniemy od fal elektromagnetycznych w próżni. Dla próżni równania Maxwella w tzw. postaci różniczkowej są następujące:

Niezwykłe światło. ultrakrótkie impulsy laserowe. Piotr Fita

I. Poziom: poziom rozszerzony (nowa formuła)

ν 1 = γ B 0 Spektroskopia magnetycznego rezonansu jądrowego Spektroskopia magnetycznego rezonansu jądrowego h S = I(I+1)

Optyka falowa. Optyka falowa zajmuje się opisem zjawisk wynikających z falowej natury światła

OD ROZPOZNANIA DO NAPROMIENIANIA. Edyta Dąbrowska

functional Magnetic Resonance Imaging

Specyficzne własności helu w temperaturach kriogenicznych

Dr Piotr Sitarek. Instytut Fizyki, Politechnika Wrocławska

Podstawy fizyki wykład 8

tomografia komputerowa

LASERY I ICH ZASTOSOWANIE W MEDYCYNIE

5.1. Powstawanie i rozchodzenie się fal mechanicznych.

Transkrypt:

Wprowadzenie do Informatyki Biomedycznej Wykład 5: Wprowadzenie do obrazowania biomedycznego Wydział Informatyki PB Marek Krętowski pokój 206 e-mail: m.kretowski@pb.edu.pl http://aragorn.pb.bialystok.pl/~mkret Rola obrazowania w biomedycynie Diagnoza - najbardziej rozpowszechniona Ocena stanu pacjenta w kontekście postępów procesu chorobowego lub odpowiedzi na zastosowane leczenie Planowanie zabiegów (wykorzystanie np. tomografii komputerowej do przygotowania operacji chirurgicznych) Przeprowadzanie zabiegów pod kontrolą informacji obrazowej - wykorzystanie technik wirtualnej rzeczywistości pozwala w czasie rzeczywistym wspomagać manipulowanie chirurga endoskopia i minimalnie-inwazyjna chirurgia potencjalnie zabiegi na odległość (telepresence and telerobotics) Telemedycyna (np. teleradiologia) - zdalne interpretacje i konsultacje Edukacja i trening Badania Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 2 z 36 Informatyka obrazowa (ang. imaging informatics) Zaproponowana została nowa poddyscyplina informatyki biomedycznej: Generowanie obrazów (ang. image generation) - proces pozyskiwania i (ewentualnie) ich przekształcania do formy cyfrowej Zarządzanie obrazami (ang. image management) obejmuje metody przechowywania (magazynowania), transmitowania, wyświetlania, wyszukiwania i organizowania obrazów Przetwarzanie i analiza obrazów (ang. image manipulation) wykorzystuje preprocesing i postprocesing w celu uwydatnienia (poprawy), wizualizacji i analizy obrazów Integracja obrazów (ang. image integration) - połączenie obrazów z innymi informacjami niezbędnymi do interpretacji, zarządzania i itd.. Podstawy generowania obrazów Obraz cyfrowy jest reprezentowany jako 2-wymiarowa tabela liczb, z których każdy element (piksel) oznacza poziom intensywności niewielkiego obszaru obrazu w przypadku obrazów przestrzennych mamy 3-wymiarową tabele, której elementy przestrzenne nazywamy wokselami Obrazy są zwykle charakteryzowane przez parametry jakości obrazu rozdzielczość przestrzenna (ang. spatial resolution) - związana z ostrością obrazu, mierzy jak dobrze punkty z obiektu znajdujące się blisko siebie (w pikselach na obraz) rozdzielczość kontrastu (ang. contrast resolution) - rozróżnialność niewielkich różnic w intensywności, związana z różnicami w mierzonych wartościach (np. pochłanianiu promieni X) (liczba bitów na piksel) rozdzielczość czasowa (ang. temporal resolution) - czas potrzebny na uzyskanie obrazu; zakłada się, że procedura obrazowania działa w czasie rzeczywistym, jeżeli jest w stanie pozyskać 30 obrazów na sekundę (niezamazany obraz bijącego serca) Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 3 z 36 Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 4 z 36

Rys historyczny Rys historyczny (2) Odkrycie w 1895 r. przez fizyka W. C. Rentgena promieniowania przenikliwego, które zostało oznaczone przez niego literą X (ang. X rays) promieniowanie to jest pewnym rodzajem energii elektromagnetycznej, analogicznej do fal radiowych czy światła, od których odróżnia się przede wszystkim znacznie krótszą długością fal (typ. wart. od 100 do 0.01 nm) Doceniając ogromne znaczenie tego odkrycia, jego autor został uhonorowany pierwszą nagrodą Nobla w dziedzinie fizyki w 1901 r., a odkryte promieniowanie z czasem zyskało nazwę rentgenowskiego Bardzo szybko naukowcy zdali sobie sprawę z ogromnych możliwości jakie niesie wykorzystanie promieniowania rentgenowskiego do badania bezpośrednio niedostępnych własności obiektów: dzięki wykorzystaniu zjawiska zaczerniania kliszy fotograficznej pod wpływem promieniowania umożliwiono utrwalenie wewnętrznej struktury obiektu w postaci zdjęcia. W ten sposób narodziła się zupełnie nowa dziedzina nauki - obrazowanie Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 5 z 36 Przez wiele dziesięcioleci technika zdjęć rentgenowskich była praktycznie jedyną dostępną metodą obrazowania biomedycznego i jest nadal stosowana z powodzeniem np. w diagnostyce chorób płuc czy uszkodzeń kości Kolejnym krokiem milowym było opracowanie przez G. N. Hounsfielda, w laboratorium badawczym angielskiej firmy EMI Limited, pierwszego komercyjnie dostępnego cyfrowego urządzenia obrazującego zostało ono zainstalowane w jednym z podlondyńskich szpitali (Atkinson Morley Hospital) w 1971 roku i było wykorzystywane wyłącznie do uzyskiwania przekrojów głowy pacjentów Za osiągnięcia związane z rozwojem tomografii komputerowej Hounsfield, wspólnie z matematykiem A. M. Cormackiem, otrzymali w 1979 roku nagrodę Nobla w dziedzinie fizjologii i medycyny Nagrodę Nobla z medycyny w 2003 roku otrzymali: Paul C. Lauterbur (profesor chemii) i Peter Mansfield (profesor fizyki) za przełomowe odkrycia dotyczące wykorzystania rezonansu magnetycznego w obrazowaniu Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 6 z 36 Rodzaje źródeł obrazowania Przykłady zobrazowań Światło widzialne obrazy uszkodzeń skóry w dermatologii; obrazy siatkówki oka, obrazowanie endoskopowe Energia dźwięku - w postaci echa struktur wewnętrznych echo serca, organów wewnętrznych, piersi przesunięcie częstotliwości Doppler (badanie przepływu krwi w dużych naczyniach) Energia promieniowania rentgenowskiego - odmienna absorpcja promieniowania przez różne tkanki zdjęcia rentgenowskiego kości; tomografia komputerowa Emisja izotopowa - radioaktywne cząsteczki wykorzystywane są do pozyskiwania obrazów medycyny nuklearnej Zmiany energii elektromagnetycznej tomograf rezonansu magnetycznego Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 7 z 36 Promienie X Ultrasonografia Rezonans magnetyczny (MRI) klatka piersiowa (płuca) kręgosłup płodu mózg Emisyjna Tomografia Pozytonowa (PET) mózg Tomografia Komputerowa (CT) jama brzuszna (wątroba) Tomografia Komputerowa Emisji Pojedynczych Fotonów (SPECT) mięsień sercowy Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 8 z 36

Tomografia komputerowa (ang. computed tomography, CT) Termin ten jest tradycyjnie używany do opisania techniki obrazowania, w której pomiary osłabienia (ang. attenuation) wąskich wiązek promieni rentgenowskich, wykonanych z wielu różnych kątów wokół badanego obiektu, są następnie wykorzystywane do rekonstrukcji przekroju obiektu przy użyciu komputera Do technik opartych na analogicznym schemacie, ale wykorzystujących inne niż promieniowanie rentgenowskie zjawisko fizyczne, używane są bardziej specyficzne nazwy np. SPECT (ang. Single Photon Emission Computerized Tomography) czy PET (ang. Positron Emission Tomography) Urządzenie wykorzystywane do pozyskiwanie obrazów tomograficznych nazywane jest tomografem lub skanerem (ang. scanner) Najczęściej w wyniku zastosowania tomografii otrzymujemy serię dwuwymiarowych obrazów odpowiadających kolejnym przekrojom ciała pacjenta. Aktualnie coraz częściej mamy również możliwość uzyskania w pełni trójwymiarowej informacji obrazowej Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 9 z 36 Zasada działania tomografu Mono-energetyczna wiązka promieni rentgenowskich przechodząc przez materię ulega osłabieniu zgodnie ze wzorem: µ x I = I 0 e gdzie I 0, I - intensywności początkowa i końcowa; osłabienie wiązki jest zależne od rodzaju materiału, zgodnie z liniowym współczynnikiem osłabienia µ oraz odległością x, na której wiązka przechodzi przez rozpatrywany materiał W tomografii do charakteryzacji tkanki ze względu na własności absorpcji promieniowania wykorzystywana jest tzw. skala Hounsfielda, w której +1000H odpowiada kości, 0 H wodzie, natomiast -1000 H reprezentuje powietrze. Wycelowane (ang. collimated) wiązki promieniowania przenikają przez ciało pacjenta w kierunku detektorów położonych po przeciwnej stronie dzięki dokładnemu wysterowaniu źródła promieniowania możliwe jest wysłanie odpowiednio wąskich wiązek w konkretne miejsca detekcji część energii promieni zostaje zaabsorbowana; pozostała część osiąga detektor i może być zmierzona detektor wyłożony jest krystaliczną warstwą scyntylacyjną lub warstwą emitującą fotony, podczas bombardowania promieniami X. intensywność reakcji kryształu jest mierzona przez fotodetektory i wykorzystywana jest jako miara energii wiązki po przejściu przez ciało pacjenta Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 10 z 36 Budowa tomografu Podstawowe kwestie techniczne: organizacja ruchu - ruch rozumiany jako: przesuwanie się źródła promieniowania w celu uzyskania kolejnych pomiarów dla ustalonego kąta obrót układu względem ciała pacjenta przemieszczenie się układu pomiarowego lub pacjenta w celu uzyskania serii obrazów. typ detektorów - wybór detektora zawsze jest związany z kompromisem pomiędzy jakością obrazu a dawką promieniowania współczesne detektory krystaliczne budowane są najczęściej z jodku sodu, fluorku wapnia czy kadmu i wolframu. Aktualnie duże nadzieje wiąże się z wykorzystaniem detektorów półprzewodnikowych geometria pomiarów projekcji - wzajemne położenie źródeł promieniowania i detektorów;najczęściej stosowane w przypadku dwuwymiarowej tomografii typy geometrii: równoległe wiązki (ang. parallel beam) dziób (ang. beak beam) wachlarz (ang. fan beam) Typy geometrii wiązek Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 11 z 36 I generacja - pomiar równoległej projekcji dla zadanego kąta uzyskiwano przemieszczając wzdłuż ciała pacjenta źródło promieni X wraz ze znajdującym się po przeciwległej stronie pojedynczym detektorem; następnie układ obracano o pewien kąt i proces powtarzano rozwiązanie wolne i zawodne, gdyż wymagało podwójnego układu ruchu: do przesuwania i obracania. II generacja - przyspieszenie dzięki zastosowaniu bloku detektorów i szybszemu przesuwanie źródła prom. wykonanie równocześnie kilku pomiarów, ograniczony, wąski wachlarz wymagane dalej dwa układy ruchu oraz ciągła emisja promieni Generacje skanerów III generacja - dzięki wykorzystaniu szerokiej rozbiegającej się wiązki, która pada na przeciwległą, ułożoną na łuku, tablicę detektorów, zrezygnowano z przesuwania źródła pr. dla zadanego kąta pomiary dla różnych kątów => wykorzystanie pulsującego źródła zsynchronizowanego z obrotem względem ciała pacjenta IV generacja - stały pierścień detektorów oraz obracające się źródło prom. zwiększenie odległości do detektorów i powiększenie nieznacznie wachlarza => początkowa i końcowa wiązka mogą być stale monitorowane; umożliwia to m.in. korektę w przypadku zmiany charakterystyki detektora oraz nie występuje również potrzeba pulsacji źródła promieniowania Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 12 z 36

Szybkie tomografy V generacji Skanery V generacji - całkowicie wyeliminowano obrót względem pacjenta: wykorzystanie większej liczby źródeł promieniowania; w systemie DSR (ang. Dynamic Spatial Reconstructor) równocześnie pracuje 28 par źródło-detektor system EBS (ang. Electron Beam System) - pochodzący z działa elektronowego strumień elektronów odchylany jest polem magnetycznym i uderza w wolframowy wycinek pierścienia (210 stopni) wytwarzając wiązkę promieniowania; po przeciwnej stronie pacjenta znajdują się analogicznej wielkości wycinki pierścienia zawierające detektory; w systemie tym sterowanie jest w pełni elektroniczne Schemat tomografu (typ Electron Beam System) Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 13 z 36 Inne tryby pracy Skanowanie spiralne - większość współczesnych tomografów oferuje możliwość skanowania spiralnego (ang. helical scanning) Należy wspomnieć, że tradycyjnie tomografy są projektowane do uzyskiwania poprzecznych przekrojów (ang. axial planes) ciała pacjenta. Inne przekroje mogą być stół z pacjentem powoli przesuwa się w czasie ciągłej pracy obracającego się układu źródeł i detektorów uzyskiwane dzięki rekonstrukcji na podstawie serii standardowych przekrojów, czyli poprzez tzw. MPR (ang. Multi Planar rekonstrukcja poszczególnych przekrojów wymaga bardziej skomplikowanych algorytmów uwzględniających stałe przesuwanie się warstwy Reconstruction) w zamian uzyskujemy krótszy czas skanowania, co jest szczególnie pomocne w eliminacji zniekształceń wywołanych oddychaniem pacjenta podczas obrazowania klatki piersiowej i jamy brzusznej Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 14 z 36 Metody rekonstrukcji obrazu na podstawie projekcji Metody iteracyjne (m. algebraiczne (ang. Metody analityczne - rekonstruowany algebraic reconstruction technique ART): obraz jest wyliczany bezpośrednio na wykorzystywane w skanerach I i II podstawie zmierzonych projekcji; do generacji (m.in. przez Hounsfielda) najbardziej znanych i najczęściej wykorzystywanych tego typu metod wymagają podania startowego przybliżonego obrazu, na podstawie należy filtrowana wsteczna projekcja; zawdzięcza ona swoja popularność którego obliczane są odpowiadające projekcje i porównywane ze głównie dużej dokładności i możliwości efektywnej implementacji (np. zmierzonymi wart. zrównoleglenie obliczeń) bazując na otrzymanych różnicach dokonywana jest modyfikacja obrazu i W przypadku każdego z algorytmów proces jest powtarzany: rekonstrukcji obrazu, w zależności od liczba iteracji niezbędna do uzyskania przyjętej architektury systemu, zbieżności takiego procesu zależy od związanej ze sposobem pomiaru konkretnej metody i może być duża projekcji, opracowywane są warianty problemy ze zbieżnością w sytuacji wykorzystywane w konkretnej klasie występowania szumu urządzeń Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 15 z 36 Twierdzenie o przekroju w dziedzinie Fouriera (ang. Fourier Slice Theorem) Daje matematyczne podstawy tomografii i wiąże zmierzone projekcje z dwuwymiarową transformacją Fouriera przekroju obiektu Twierdzenie to pokazuje, że jednowymiarowe przekształcenie Fouriera S θ projekcji P θ zmierzonej dla kąta θ jest równe przekrojowi pod tym samym kątem dwuwymiarowej transformacji Fouriera F funkcji f(x,y): oznacza to, że dla zadanego kąta transformacja obserwowanej projekcji obiektu jest równoznaczna odtworzeniu przekroju transformacji samego obiektu wykorzystując projekcje z różnych kątów można zrekonstruować dwuwymiarową transformację obiektu, a następnie dzięki wykorzystaniu odwrotnej transformacji można odtworzyć obiekt Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 16 z 36

Algorytm filtrowanej wstecznej projekcji (ang. filtered back-projection) Bezpośrednie wykorzystanie twierdzenia jest utrudnione, gdyż z natury rzeczy dysponujemy jedynie ograniczoną liczbą projekcji Oznacza to, że wartość F(u,v) może być znana tylko w określonych punktach na półprostych promieniście rozchodzących się od środka układu Wykorzystanie interpolacji do wyznaczenia potrzebnych wartości w innych punktach, może prowadzić do stosunkowo dużych błędów Dotyczy to zwłaszcza składowych wysokiej częstotliwości, co niekorzystnie odbija się na jakości obrazu Algorytm: Zmierzenie projekcji Transformacja Fouriera (FFT) Filtracja Odwrotna transformacja Fouriera Normalizacja Wsteczna projekcja (ang. back projection) Wsteczna projekcja Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 17 z 36 Obrazowanie Rezonansu Magnetycznego (MRI) - wstęp odkrycie fenomenu rezonansu magnetycznego 1946 r. Felix Bloch oraz Edward Purcell (1952 r. nagroda Nobla) zauważyli, że jądra komórkowe pewnych substancji umieszczone w polu magnetycznym mogą absorbować energie w zakresie fali radiowych widma elektromagnetycznego oraz następnie uwalniać ją podczas relaksacji, czyli powrotu do stanu równowagi w ten sposób narodziła się spektroskopia nuklearnego rezonansu magnetycznego, która w następnych dwudziestu latach była wykorzystywana głównie do badań nad budową chemiczną i fizyczną różnorodnych molekuł w 1971 r. Raymond Damadian udowodnił, iż czasy relaksacyjne rezonansu magnetycznego dla tkanek chorych oraz tkanek zdrowych różnią się między sobą, co było bezpośrednim powodem coraz szerszego zainteresowania naukowców tą technika, jako metodą do detekcji schorzeń Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 19 z 36 Obrazowanie Rezonansu Magnetycznego (MRI) wstęp (2) pierwsza prezentacja zjawiska rezonansu magnetycznego - Paul Lauterbur 1973 r. sposób przestrzennej identyfikacji elementów obrazu, zastosowany przez Lauterbura, został szybko odrzucony, ponieważ w 1975 r. zostały zaproponowane nowe, lepsze metody kodowania przestrzeni przez Richarda Ernsta, jak: kodowanie fazy i częstotliwości oraz transformata Fourier'a, które do dziś stanowią podstawę wielu bardziej zaawansowanych technik pierwszy raz obrazowanie ciała ludzkiego zostało zaprezentowane w 1980 r. przez Edelsteina i jego współpracowników (czas na otrzymanie obrazów wynosił około 5 minut, do roku 1986 został skrócony do kilku sekund) wprowadzenie angiografii rezonansu magnetycznego 1987 r. Charles Dumoulin (obrazowanie przepływu krwi bez środków kontrastujących) (MRA, magnetic resonance angiography) nagroda Nobla, 1991 r. Richard Ernst, zastosowania transformaty Fouriera w MRI wprowadzenie funkcjonalnego rezonansu magnetycznego 1992 r. (fmri, functional MRI), pozwalającego na przyporządkowanie różnych funkcji mózgu do odpowiednich jego części Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 20 z 36 Obrazowanie Rezonansu Magnetycznego (MRI) wstęp (3) 1994 r. prezentacja MRI spolaryzowanego gazu 129 Xe, rozwój obrazowania MR funkcji oddechowych nagroda Nobla 2003 r. Paul C. Lauterbur oraz Sir Peter Mansfield za osiągnięcia w dziedzinie MRI współcześnie MRI jedna z najnowocześniejszych technik obrazowania w zastosowaniach medycznych, pozwala ona na uzyskiwanie obrazów o bardzo wysokiej rozdzielczości przestrzennej, jej ogromna zaletą znikoma szkodliwość działania, w porównaniu np. do CT czy PET (przynajmniej jak dotychczas niewykryta szkodliwość) http://blog.posmyk.info/czytanie-w-myslach-nie-telepatia-tylko-rezonans-magnetyczny/ Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 21 z 36

Zjawisko rezonansu magnetycznego wszystkie substancje składają się z atomów, atom natomiast z jądra atomowego (protony i neutrony) i elektronów jądro o niezerowym spinie (nieparzysta liczba protonów lub neutronów) zachowuje się jak naładowana wirująca cząstka/magnesik, czyli posiada pole elektromagnetyczne M Zjawisko rezonansu magnetycznego silne zewnętrzne pole magnetyczne umieszczenie naładowanych, wirujących cząstek w silnym zewnętrznym polu magnetycznym o indukcji B 0 powoduje, że ustawiają się one zgodnie z liniami sił pola lub też przeciwnie w substancjach organicznych cząstki układają się w taki sposób, ze wypadkowe pole magnetyczne jest bardzo bliskie zera, czyli pozostają one w równowadze elektromagnetycznej; dlatego też nasze ciała nie przyciągają metalowych przedmiotów Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 22 z 36 Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 23 z 36 Zjawisko rezonansu magnetycznego precesja Larmor'a przeciwne układanie się spinów powoduje wyzerowanie się pól magnetycznych wytwarzanych przez cząsteczki; te, dla których nie zostanie wyzerowane pole magnetyczne, nazywane są cząstkami rezonansowymi, wykonują one precesje z częstotliwością Larmor'a ω 0 Zjawisko rezonansu magnetycznego pobudzenie, absorpcja energii jeżeli próbka zawierająca cząstki rezonansowe zostanie dodatkowo naświetlona promieniowaniem elektromagnetycznym o indukcji B 1 o częstotliwości Larmor'a to może to spowodować absorpcję emitowanej energii, zjawisko rezonansu magnetycznego, co powoduje powstanie dodatkowej precesji o częstotliwości ω 1 w takich warunkach ruch wektora magnetyzacji M jest złożeniem szybkiej precesji Larmor'a z częstotliwością ω 0 i wolnej precesji o częstotliwości ω 1 wokół B 1 wraz z upływem czasu działania dodatkowego pola magnetycznego, następuje coraz większe odchylenie wypadkowego wektora magnetyzacji Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 24 z 36 Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 25 z 36

Zjawisko rezonansu magnetycznego relaksacja, emisja energii wyłączenie impulsu elektromagnetycznego, powoduje rozpoczęcie powrotu cząstek do stanu równowagi, czyli wcześniej pochłonięta energia jest uwalniana, co powoduje że pole magnetyczne cząstek dąży do swojej pierwotnej wartości proces ten nazywany jest relaksacją jednocześnie, ale niezależnie zachodzą dwa jej rodzaje: relaksacja podłużna oraz poprzeczna, które powodują odpowiednio zmiany wektora magnetyzacji w płaszczyźnie podłużnej i poprzecznej Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 26 z 36 Zjawisko rezonansu magnetycznego akwizycja sygnału i rekonstrukcja obrazu czas powrotu do stanu równowagi jest zazwyczaj różny dla różnych tkanek, dzięki czemu różne tkanki emitują różne porcje energii w jednostce czasu i tym samym zmiany wektora magnetyzacji (wirowanie) zachodzą z różnymi prędkościami sygnał, który jest rejestrowany przy obrazowaniu techniką rezonansu magnetycznego, jest to napięcie indukowane na cewce odbiorczej poprzez zmiany w strumieniu pola magnetycznego, wywołane przemieszczaniem się wypadkowego wektora magnetyzacji dla układu cząstek, zależność ta opisana jest prawem indukcji elektromagnetycznej Faraday'a otrzymywany sygnał poddawany jest konwersji analogowo-cyfrowej i zapisywany w odpowiedniej macierzy odbiorczej (macierz k-space) otrzymywana macierz zawiera wszystkie niezbędne informacje na temat poszukiwanego obrazu, aby go uzyskać wykonywana jest jeszcze transformata Fourier'a ponieważ cewka odbiorcza rejestruje sumę sygnałów (napięć) z całego pobudzonego obszaru, podczas obrazowania wykonywane jest dodatkowo kodowanie przestrzeni za pomocą gradientów pola magnetycznego, które nieznacznie zmieniają wartości magnetyzacji cząstek względem ich pozycji przestrzennej Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 27 z 36 Rezonans magnetyczny w medycynie Rezonans magnetyczny w medycynie (2) pacjent umieszczany jest w komorze aparatu MRI w stałym polu magnetycznym o wysokiej energii (indukcja B 0 ) => linie pola magnetycznego jąder atomów w organizmie człowieka ustawiają się równolegle do kierunku wytworzonego pola aparat emituje fale radiowe (indukcja B 1 ), które wzbudzają analogiczne fale w tkankach (zjawisko rezonansu) = > następnie dodatkowe pole zostaje wyłączone i aparat rejestruje emitowaną energię/fale najczęściej jako rezonator wykorzystuje się cząstki wodoru, w skład których wchodzą tylko pojedyncze protony; jest to spowodowane wysoką wartością współczynnika giromagnetycznego, stąd też duża liczba cząstek rezonansowych, co więcej ciało człowieka składa się od 60% do 80% z wody, w której znajdują się dwa atomy wodoru na jeden atom tlenu; zawartość wody (a tym samym wodoru) w poszczególnych tkankach jest różna, co umożliwia ich identyfikację na obrazach rezonansu magnetycznego Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 28 z 36 impuls elektromagnetyczny o indukcji B 1 nazywany jest często impulsem częstotliwości radiowych (RF pulse, radio frequency pulse), ponieważ jest to w rzeczywistości oscylująca fala elektromagnetyczna z częstotliwością należąca do okna częstotliwości radiowych widma elektromagnetycznego moc energii wytworzonej przez taka fale jest o wiele mniejsza niż przy promieniowaniu rentgenowskim oraz świetle widzialnym, ponieważ energia fali elektromagnetycznej jest proporcjonalna do jej częstotliwości jest to jeden z powodów bezinwazyjności metod obrazowania opierających się na rezonansie magnetycznym inne zalety: ocena struktur anatomicznych w dowolnej płaszczyźnie i trójwymiarowo; szczególnie dobrze ośrodkowy układ nerwowy (mózg i kanał kręgowy) tkanki miękkie kończyn (tkanki podskórne, kości, stawy) możliwość pomiaru przepływu krwi i innych płynów ustrojowych minimalizacja artefaktów (wpływ struktur kostnych, wypełnień stomatologicznych i metalowych protez) ograniczone oddziaływanie do otoczenia Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 29 z 36

Obrazy rezonansu magnetycznego mózgu Angiografia rezonansu magnetycznego 3 przekroje Różne serie sagitalny osiowy koronalny T1 T1 T2 PD (kontrast) FLAIR DIFFUSION Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 30 z 36 głowa klatka piersiowa i szyja Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 31 z 36 Inne obrazy rezonansu magnetycznego Ultrasonografia (USG) kręgosłup ramię dłoń Wykorzystuje zjawisko pochłaniania i odbicia fal ultradźwiękowych, wysyłanych (wiązka wielokierunkowa) w głąb ciała za pomocą specjalnej głowicy czynnikiem decydującym o wyniku pomiaru są własności mechaniczne tkanek (szybkość propagacji fal, oraz odbicia, załamania, rozpraszanie i tłumienie fal) Bardzo mała inwazyjność, pozwala na długotrwałe nieprzerwane obserwowanie funkcjonowania badanych struktur Umożliwia obrazowanie szczególnie wrażliwych obiektów (np. rozwijający się płód, ruchome zastawki serca) Pozwala wykrywać niektóre struktury niewykrywane w innych technikach: zmiana tekstury na obrazie USG wątroby pozwala wykrywać zróżnicowanie właściwości mechanicznych tkanek o takim samym składzie chemicznym => zmiany nowotworowe w miąższu wątroby Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 32 z 36 USG nerki Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 33 z 36

Pozytonowa tomografia emisyjna (PET) Pozytonowa tomografia emisyjna (2) Technika medycyny nuklearnej, bazuje na promieniowaniu powstającym podczas anihilacji pozytonów Pacjentowi podawana jest specjalna substancja (ang. tracer), która zawiera izotopy promieniotwórcze o krótkim czasie połowicznego rozpadu (pozwala to ograniczyć negatywne skutki promieniowania) Wykorzystuje się fakt, że określonym zmianom chorobowym towarzyszy podwyższony metabolizm niektórych związków chemicznych, np. cukrów W obszarze docelowym substancja ulega rozpadowi (metabolizm w aktywnym obszarze) i emituje pozytony, które zderzają się z elektronami => anihilacja i generowana jest para fotonów w dokładnie przeciwnych kierunkach, które są rejestrowane przez detektory skanera PET pozwala na uzyskiwanie trójwymiarowych obrazów funkcjonalnych np. aktywności metabolicznej Przy badaniach mózgu, serca, stanów zapalnych niejasnego pochodzenia oraz nowotworów (duże prawd. rozpoznania nowotworów) Rozdzielczość przestrzenna PET jest jednak zdecydowanie niższa niż np. TK czy TRM aby uzyskiwać dokładniejsze odwzorowanie - łączenie z TK (PET-CT) Konieczność uruchomienia cyklotronu w pobliżu (krótki czas rozpadu maks. skrócenie czasu transportu) Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 34 z 36 Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 35 z 36 Tomografia emisyjna pojedynczych fotonów (SPECT) Bazuje na zjawisku emisji promieniowania gamma z podanego pacjentowi radioaktywnego izotopu wykorzystywane są metale ciężkie w połączeniu z substancjami biologicznie neutralnymi (np. thallium Tl lub technetium -Tc) umożliwia wizualizację przepływu krwi (np. w mózgu) i metabolizmu Pojedynczy foton gamma jest emitowany z jądra Projekcje co kilka stopni (3 lub 6) => całkowity obrót wokół pacjenta badanie trwa kilkanaście minut W porównaniu do PET mniejsza rozdzielczość przestrzenna (np. 96x96) i czasowa, mniejsze też spektrum zastosowań, ale możliwość badania dłużej trwającego metabolizmu (dzięki dłuższemu czasowi rozpadu) Obrazy w skali szarości, albo pseudo-kolorowane stosowane w onkologii, obrazowaniu mózgu, kości, perfuzji serca,... SPECT wątroby: zmiana aktywności w czasie Informatyka Biomedyczna Wyk. 5 Slajd 36 z 36