MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: 89-98
|
|
- Aleksander Nowak
- 8 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: Opracowanie szybkiego testu PCR-RFLP do identyfikacji pałeczek Yersinia enterocolitica bioserotypu 1B/O8 z epidemicznego szczepu tych drobnoustrojów izolowanych w Polsce od 2004 roku Development of molecular PCR-RFLP test for identification of the epidemic strain of Y. enterocolitica bioserotype 1B/O8 circulating in Poland since 2004 Tomasz Wołkowicz, Natalia Wolaniuk, Katarzyna Zacharczuk, Rafał Gierczyński, Natalia Rokosz, Waldemar Rastawicki Zakład Bakteriologii Narodowego Instytutu Zdrowia Publicznego Państwowego Zakładu Higieny w Warszawie Od 2004 roku obserwowane jest w Polsce rozproszone ognisko zakażeń pałeczkami Y. enterocolitica należącymi do wysoce chorobotwórczego bioserotypu 1B/O8. Celem prowadzonych badań było opracowanie szybkiego, molekularnego testu do identyfikacji drobnoustrojów należących do tego epidemicznego szczepu. Zaproponowany schemat diagnostyczny obejmuje dwa etapy. Pierwszy z nich, test multipleks-pcr, pozwala na identyfikację pałeczek Y. enterocolitica bioserotypu 1B/O8 poprzez detekcję czterech markerów genetycznych (ail, ysta, irp1, sekwencja 16S rdna). Drugi etap, test dupleks-pcr-rflp, pozwala wykryć wariant genu ysrr charakterystyczny dla epidemicznego szczepu. Zaproponowany test może stanowić przydatne narzędzie diagnostyczne w typowaniu izolatów epidemicznego szczepu Y. enterocolitica 1B/O8 w diagnostyce klinicznej, weterynaryjnej, badaniu żywności jak również w dochodzeniu epidemiologicznym. Słowa kluczowe: Yersinia enterocolitica, bioserotyp 1B/O8, PCR-RFLP, molekularna diagnostyka ABSTRACT Introduction: Highly pathogenic Y. enterocolitica bioserotype 1B/O8 is considered to be an important etiological agent of yersiniosis in Poland. Infections caused by Y. enterocolitica 1B/O8 became an important public health problem in Poland, especially because of their high potential of virulence and the unknown source of the bacteria. Y. enterocolitica 1B/O8
2 90 T. Wołkowicz i inni Nr 2 isolates recovered in Poland are genetically highly related and constitute single epidemic sensu stricto strain. The aim of the present study was to develop a time- and money-effective molecular assay for rapid identification of pathogenic Y. enterocolitica 1B/O8 isolates belonging to the epidemic strain. Methods: In the first stage we performed a multiplex-pcr for four genetic markers: ail, ysta, irp1 and 16S rdna sequence. In the next stage we designed a duplex-pcr-rflp assay with BtsI endonuclease to detect / identify specific variant of an ysrr gene that is characteristic for epidemic strain of Y. enterocolitica 1B/O8 strain. The assay was tested against a panel of a consisted of a variety Yersinia enterocolitica and Y. pseudotuberculosis strains. Results: All the tested Y. enterocolitica 1B/O8 strains were positive for all the genetic markers in multiplex-pcr assay what distinguished them from other tested Yersinia strains. In duplex-pcr-rflp test all tested isolates of the epidemic strain were negative for ysrr digestion with BtsI endonuclease, while all tested reference strains of Y. enterocolitica 1B/ O8 were positive. Conclusions: The assay developed in this study was two-stage / two-step molecular test efficiently distinguishing wild-type and the epidemic Y. enterocolitica 1B/O8 strain. Such test can be a useful screening tool for clinical, veterinary and food diagnostics, as well as for the purposes of epidemiological investigation. Key words: Yersinia enterocolitica, bioserotype 1B/O8, PCR-RFLP, molecular diagnostic WSTĘP Wysoce chorobotwórcze pałeczki Y. enterocolitica bioserotypu 1B/O8 stanowią w Polsce istotny etiologiczny czynnik jersiniozy - ostrej choroby zakaźnej. Drobnoustroje te, określane mianem szczepów amerykańskich izolowane są w Polsce od osób z jersiniozą od ponad 10 lat (7, 15, 16, 17). Po raz pierwszy w pełni wirulentny szczep Y. enterocolitica 1B/O8 został wyhodowany z węzła chłonnego krezki pacjentki z marskością wątroby w 2004 roku (11, 16, 23). Do końca lat 80. XX w. pałeczki bioserotypu 1B/O8 były izolowane od osób chorych głównie na terenie USA, gdzie występowały endemicznie. W następnych latach zostały one wyparte przez aktualnie dominujący na świecie bioserotyp 4/O3 (1, 2). W latach 90. pierwsze przypadki izolacji pałeczek Y. enterocolitica 1B/O8 od zwierząt oraz ludzi zaczęto odnotowywać w Japonii (21). W Europie pierwszy udokumentowany przypadek jersiniozy wywołany przez pałeczki Y. enterocolitica bioserotypu 1B/O8 został opisany w 2003 roku w Niemczech (22). Dotychczas, według danych piśmiennictwa, największa liczba izolacji tych bakterii była odnotowana w Polsce, ale doniesienia o klinicznych szczepach z tej grupy pochodzą również z Niemiec (16, 20, 27). Unikatową cechą pałeczek Y. enterocolitica 1B/O8 izolowanych w Polsce jest wyjątkowo bliskie genetyczne pokrewieństwo powodujące, że izolaty te można zaliczyć do tego samego szczepu sensu stricto (11, 27). Zaobserwowana wysoka homogenność genetyczna wśród badanych izolatów Y. enterocolitica 1B/O8 wskazuje na stabilne utrzymywanie się epidemicznego szczepu tych pałeczek na terenie Polski. Jednakże do tej pory nie udało się ustalić źródła zakażenia jak i dróg szerzenia się tych drobnoustrojów (12, 28).
3 Nr 2 Szybki test PCR-RFLP do identyfikacji Y. enterocolitica 1B/O8 91 Zakażenia pałeczkami Y. enterocolitica bioserotypu 1B/O8 stanowią istotne zagrożenie dla zdrowia publicznego, ponieważ drobnoustroje te zaliczane są do grupy wysoce chorobotwórczych przedstawicieli swojego gatunku (4, 5). Pałeczki z bioserotypu 1B/O8 charakteryzują się zwiększonym potencjałem chorobotwórczym, wynikającym z posiadania dodatkowych czynników wirulencji w porównaniu do innych chorobotwórczych przedstawicieli gatunku Y. enterocolitica, tj.: systemem pozyskiwania żelaza yersiniabaktyna (Ybt), a także systemem sekrecji białek Ysa (T3SS) i Yst1(T2SS) (1, 3, 13, 26). Obecność tych czynników wirulencji u pałeczek Yersinia powoduje zwiększenie ryzyka wystąpienia nasilonych objawów klinicznych w przebiegu jersiniozy u osoby zakażonej (4, 24). Bakteriologiczna diagnostyka zakażeń Y. enterocolitica opiera się głównie na określeniu właściwości fenotypowych drobnoustrojów, pozwalających określić ich biotyp oraz grupę serologiczną. Oznaczenie przynależności do odpowiedniego bioserotypu może być przydatne w określeniu potencjału chorobotwórczego danego izolatu. Coraz częściej w praktyce stosowane są również testy molekularne do identyfikacji określonych determinant chorobotwórczości tych patogenów (6, 25). Dokładna molekularna charakterystyka epidemicznego szczepu Y. enterocolitica 1B/O8 występującego w Polsce wykazała, iż mimo przynależności do tego wysoce patogennego bioserotypu oraz obecności genetycznych markerów chorobotwórczości charakterystycznych dla tej grupy pałeczek Y. enterocolitica, nie posiada on zdolności do ekspresji systemu Ysa (19). Analiza sekwencji nukleotydowej locus YSAPI wykazała, że przyczyną inaktywacji systemu T3SS Ysa jest mutacja punktowa w genie regulatorowym ysrr skutkująca powstaniem przedwczesnego kodonu STOP (18). Dotychczasowe wyniki badań naszego zespołu (dane niepublikowane) pozwalają twierdzić, że mutacja ta występuje u każdego izolatu należącego do epidemicznego szczepu Y. enterocolitica 1B/O8 występującego w Polsce. W celu potwierdzenia, czy badany izolat Y. enterocolitica 1B/O8 należy do epidemicznego szczepu konieczne było przeprowadzenie jego typowania metodą PFGE, która jest czasochłonna i kosztowna (11, 28). Z tego względu celem niniejszej pracy było opracowanie szybkiego testu diagnostycznego do identyfikacji izolatów należących do epidemicznego szczepu Y. enterocolitica 1B/O8 występującego w Polsce. Punktem wyjścia do tych badań było wspomniane wyżej założenie, że mutacja generująca powstanie przedwczesnego kodonu stop w genie ysrr występuje powszechnie i jest specyficzna dla tych drobnoustrojów, izolowanych od osób z jersiniozą na terenie kraju. MATERIAŁ I METODY Szczepy bakteryjne. Materiał do badań stanowiły izolaty Y. enterocolitica bioserotypu 1B/O8 (n= 11) wyosobnione z materiału klinicznego od osób zamieszkałych w Polsce, szczepy z kolekcji Zakładu Bakteriologii NIZP-PZH, szczepy referencyjne Y. enterocolitica 1B/O8 z kolekcji Referencyjnego Ośrodka WHO ds. Yersinia (Instytut Pasteura, Francja) (n=10) i kolekcji Instytutu Max von Pettenkofer w Monachium (n=1, szczep WA-314). Ponadto w badaniach posłużono się szczepami Y. enterocolitica reprezentującymi bioserotypy: 4/O3 (n=2), 2/O9 (n=2), 2/O5;27 (n=2), biotyp 1A (n=1) oraz szczepami z gatunku Y. pseudotuberculosis (n=2). Tabela 1.
4 92 T. Wołkowicz i inni Nr 2 Izolacja DNA. Preparaty genomowego DNA badanych izolatów uzyskiwano zgodnie z opisaną wcześniej procedurą (10). Badanie metodą multipleks-pcr. Do wykrywania obecności markerów genetycznych: ysta, ail, irp1, 16S rdna zastosowano multipleks-pcr (12, 28). Sekwencje nukleotydowe starterów oraz oczekiwaną wielkość produktów PCR podano w Tabeli 1. Reakcję PCR przeprowadzano w końcowej objętości 25 μl. Mieszanina reakcyjna zawierała: jałową wodę dejonizowaną; 2,5 μl 10 x buforu (10X DreamTaq Green Buffer, Thermo Scientific); 0,5 μl 10 mm mieszaniny dntp (Sigma-Aldrich); 0,75 μl 10mM każdego ze starterów (w przypadku starterów 16S rrna użyto ilości 0,25 μl 10mM każdego ze starterów); 0,75 U polimerazy DNA (DreamTaq, Thermo Scientific) i 2 μl matrycy DNA. Reakcję amplifikacji prowadzono w termocyklerze Mastercycler (Eppendorf) w następujących warunkach: 94 C przez 5 min., następnie 35 cykli: 94 C przez 45 s, 58 C przez 45 s i 72 C przez 45s. Produkty amplifikacji rozdzielano w 2% żelu agarozowym (MP Biomedicals). Dupleks PCR-RFLP. W celu rozróżnienia szczepów należących do epidemicznego szczepu Y. enterocolitica 1B/O8 występującego w Polsce od innych szczepów tego bioserotypu zaprojektowano układ diagnostyczny typu dupleks PCR-PFLP. W pierwszym etapie amplifikowano fragment genu irp2 (startery irp-2f i irp2-r) oraz gen ysrr (startery ysrr-f i ysrr-r). Reakcję PCR przeprowadzano w końcowej objętości 25 μl. Mieszanina reakcyjna zawierała: jałową wodę dejonizowaną; 2,5 μl 10 x buforu (10X DreamTaq Green Buffer, Thermo Scientific); 0,5 μl 10 mm mieszaniny dntp (Sigma-Aldrich); 0,6 μl 10mM każdego ze starterów; 0,75 U polimerazy DNA (DreamTaq, Thermo Scientific) i 2 μl preparatu genomowego DNA. Reakcję amplifikacji prowadzono w termocyklerze Mastercycler (Eppendorf) w następujących warunkach: 94 C przez 5 min., następnie 35 cykli: 94 C przez 45 s, 57 C przez 45 s i 72 C przez 45 s. W drugim etapie, produkty PCR trawiono enzymem BtsI. Mieszanina reakcyjna w objętości końcowej 15µl zawierała: wodę dejonizowaną; 1,5µl CutSmart Buffer (New England Biolabs); 10µl produktu PCR i 4U enzymu BtsI (New England Biolabs). Reakcję enzymatyczną prowadzono w temperaturze 55 C przez 2h. Produkty trawienia rozdzielano w 2% żelu agarozowym (MP Biomedicals) stosując marker wielkości Perfect 100bp DNA Ladder (EURx). WYNIKI I ICH OMÓWIENIE Zaproponowany schemat diagnostyczny do identyfikacji pałeczek Y. enterocolitica 1B/O8 należących do szczepu epidemicznego występującego na terenie kraju składa się z dwóch etapów. Pierwszy z nich obejmuje test multipleks-pcr, w którym analizowana jest obecność w badanym izolacie trzech genów: ysta, ail, irp1 oraz sekwencji 16S rdna. Sekwencje nukleotydowe: ail, ysta kodujące odpowiednio adhezynę Ail i termostabilną enterotoksynę YstA stanowią determinanty wirulencji charakterystyczne dla chorobotwórczych pałeczek Y. enterocolitica należących zarówno do szczepów europejskich o niskim potencjale chorobotwórczym (bioserotypy: 4/O3, 2/O9, 2/O5,27) oraz do wysoce chorobotwórczych szczepów amerykańskich (głównie bioserotyp 1B/O8) (1, 12). Obecność zaś genu irp1, biorącego udział w biosyntezie jersiniabaktyny wskazuje na przynależność izolatu do wysoce chorobotwórczych pałeczek tego gatunku. Otrzymanie w powyższym teście
5 Nr 2 Szybki test PCR-RFLP do identyfikacji Y. enterocolitica 1B/O8 93 Tabela 1. Oznakowanie, sekwencja starterów oraz oczekiwana wielkość produktów amplifikacji obszaru DNA badanych szczepów Y. enterocolitica. Wielkość Gen lub Produkt Sekwencja startera (forward) Sekwencja startera (reverse) produktu marker ekspresji genu PCR (pz) Piśmiennictwo 16S rdna - 5 GAGGATGACCAGCCACACTGG 5 CATCACGTGCTGGCAACAAAGG 842 (11) ysta Enterotoksyna YstA 5 AATGCTGTCTTCATTTGGAGC 5 GCAACATACATCACAGCAATC 163 (14) ail Adhezyna Ail 5 CCTGAAGTACCGTTATGAAC 5 TTGACGTCTTACTTGCACTG 251 (9) irp1 syntetaza HMWP 5 GTACAGACCGCCTGCTCCAGTT 5 TGTAACCTACCTGCCTGTCGTC 412 (9) irp2 syntetaza HMWP2 5 CTCCGCAGAACAGGTAGCCGA 5 CGACATACTCAATCTGTCCGG 500 (11) ysrr Regulator YsrR 5 ATGACACAAACGAAAACGCTCAAT 5 TTATAGAGAAATTTCATGAGCAT 711 -
6 94 T. Wołkowicz i inni Nr 2 Tabela 2. Zestawienie stosowanych w badaniu szczepów oraz wyniki amplifikacji genów ysta, ail, irp1, 16SrRNA, irp2 oraz ysrr w reakcji PCR oraz wyniki reakcji trawienia restrykcyjnego amplifikowanych fragmentów genów irp2 i ysrr enzymem BtsI. Nazwa szczepu Źródło Rok izolacji Gatunek / bioserotyp ysta ail irp1 DM0110 ZB NIZP-PZH 2005 Y. enterocolitica 1B/O DM0150 ZB NIZP-PZH 2004 Y. enterocolitica 1B/O DM0149 ZB NIZP-PZH 2005 Y. enterocolitica 1B/O DM0147 ZB NIZP-PZH 2006 Y. enterocolitica 1B/O DM0111 ZB NIZP-PZH 2007 Y. enterocolitica 1B/O DM086 ZB NIZP-PZH 2008 Y. enterocolitica 1B/O DM0204 ZB NIZP-PZH 2009 Y. enterocolitica 1B/O DM0340 ZB NIZP-PZH 2010 Y. enterocolitica 1B/O DM0357 ZB NIZP-PZH 2011 Y. enterocolitica 1B/O DM0367 ZB NIZP-PZH 2012 Y. enterocolitica 1B/O DM0370 ZB NIZP-PZH 2013 Y. enterocolitica 1B/O DM0194 ZB NIZP-PZH 2008 Y. enterocolitica 2/O P ZB NIZP-PZH* b.d. Y. enterocolitica 2/O DM0002 ZB NIZP-PZH b.d. Y. enterocolitica 4/O P ZB NIZP-PZH* b.d. Y. enterocolitica 4/O O5,27 ZB NIZP-PZH* b.d. Y. enterocolitica 2/O5, /11 ZB NIZP-PZH b.d. Y. enterocolitica 1A Y31 ZB NIZP-PZH b.d. Y. pseudotuberculosis b.d. b.d. b.d. b.d Y77 ZB NIZP-PZH b.d. Y. pseudotuberculosis b.d. b.d. b.d. b.d WA-314 MPI b.d. Y. enterocolitica 1B/O IP b.d. Y. enterocolitica 1B/O IP b.d. Y. enterocolitica 1B/O IP b.d. Y. enterocolitica 1B/O IP b.d. Y. enterocolitica 1B/O IP b.d. Y. enterocolitica 1B/O IP b.d. Y. enterocolitica 1B/O IP b.d. Y. enterocolitica 1B/O IP b.d. Y. enterocolitica 1B/O IP b.d. Y. enterocolitica 1B/O IP b.d. Y. enterocolitica 1B/O IP Instytut Pastera, Paryż, Francja MPI Max Von Pettenkofer Institut, Monachium, Niemcy ZB NIZP-PZH - Zakład Bakteriologii NIZP-PZH * - w kolekcji Zakładu Bakteriologii od 2001 roku, przekazane z MPI. b.d. brak danych 16S rrna irp2 irp2 + BtsI ysrr ysrr + BtsI
7 Nr 2 Szybki test PCR-RFLP do identyfikacji Y. enterocolitica 1B/O8 95 wyłącznie produktu PCR odpowiadającego sekwencji kodującej 16S rrna wskazywać może na przynależność badanego szczepu Y. enterocolitica do biotypu 1A, który to biotyp obejmuje w większości szczepy uznawane za niechorobotwórcze dla ludzi (1, 4). Wyniki badań przeprowadzonych na kolekcji szczepów Y. enterocolitica należących do różnych bioserotypów przedstawiono w tabeli 2. W drugim etapie zaproponowanego schematu diagnostycznego w układzie dupleks PCR amplifikacji poddawano fragment genu irp2, który również związany jest z biosyntezą jersiniabaktyny. Amplifikowany fragment genu irp2 miał długość 500 nt. Jednocześnie w tej samej mieszaninie reakcyjnej amplifikacji ulegał też fragment genu ysrr o długości 711 nt, a następnie produkty PCR poddawano trawieniu endonukleazą BtsI. W dzikiej wersji genu ysrr, spotykanej u szczepów wzorcowych Y. enterocolitica 1B/O8 izolowanych poza krajem, występuje miejsce rozpoznawane przez enzym BtsI, który w wyniku trawienia produktu PCR generuje dwa fragmenty DNA o długości 268 oraz 445 nt. Natomiast w zmutowanym genie ysrr, charakterystycznym dla szczepu epidemicznego tych pałeczek w Polsce, sekwencja rozpoznawana przez enzym BtsI nie występuje. Równocześnie w opracowanym przez nas teście trawieniu ulega fragment genu irp2 zawierający natywne miejsce cięcia swoiste dla BstI, efektem czego jest powstanie dwóch fragmentów DNA o długości 314 i 188 nt widocznych na rycinie 1. W tym wypadku gen irp2 służy jako naturalna kontrola wewnętrzna testu, potwierdzająca prawidłowe dla reakcji trawienia enzymem BtsI warunki i skład mieszaniny. Profile prążków charakterystyczne dla szczepu epidemicznego oraz dla szczepu referencyjnego WA-314 przedstawiono na rycinie 1. Wyniki reakcji dupleks-pcr-rflp, przeprowadzonej z użyciem szczepów z kolekcji pałeczek Yersinia, przedstawiono w tabeli 2. Na uwagę zasługuje fakt, że produkty amplifikacji obydwu genów były uzyskiwane w przypadku wszystkich badanych szczepów Y. enterocolitica bioserotypu 1B/O8. Badane szczepy Y. pseudotuberculosis wykazywały obecność genu irp2, przy jednoczesnym braku produktu amplifikacji genu ysrr. Dodatni wynik analizy restrykcyjnej amplifikowanych fragmentów genu irp2 stwierdzono, zarówno u szczepów Y. enterocolitica 1B/O8 jak i Y. pseudotuberculosis. Z kolei amplifikowany fragment genu ysrr ulegał trawieniu enzymem BtsI jedynie w przypadku szczepów Y. enterocolitica 1B/O8 pochodzących z kolekcji Instytutu Pasteura oraz szczepu WA-314. Wynik ten pokazuje, że opracowany test wyraźnie różnicuje izolaty szczepu epidemicznego, których produkt PCR genu ysrr nie ulegał trawieniu enzymem BtsI i jego wielkość pozostawała niezmieniona, co widać na elektroforegramie przedstawionym na rycinie 1. Ze względu na wciąż notowane przypadki zakażeń pałeczkami Y. enterocolitica 1B/O8 w Polsce, zaproponowany molekularny test diagnostyczny może być przydatny do identyfikacji izolatów epidemicznego szczepu tych drobnoustrojów, a tym samym do monitorowania ognisk zakażeń tymi drobnoustrojami w Polsce. Trzeba mieć na uwadze fakt, iż głównym rezerwuarem pałeczek Y. enterocolitica, zarówno chorobotwórczych, jak i niepatogennych jest trzoda chlewna. Tak więc, test ten może okazać się przydatny w weterynarii, w badaniach dotyczących obecności pałeczek epidemicznego szczepu Y. enterocolitica 1B/O8 u zwierząt i w żywności, zwłaszcza w mięsie wieprzowym. Bardzo wysoki stopień wzajemnego podobieństwa wszystkich izolatów Y. enterocolitica 1B/O8 izolowanych na terenie Polski oraz brak ich zmienności na przestrzeni ponad dziesięciu lat sugeruje występowanie jednego źródła tych patogenów (7, 12, 27). Jednak mimo ponad 10. lat trwania rozproszonego ogniska tych zakażeń, jego źródło w dalszym
8 96 T. Wołkowicz i inni Nr 2 Rycina 1. Wynik testu dupleks-pcr-rflp dla szczepu DM0110 (ścieżki 1-2) oraz WA314 (ścieżki 3-4). Opis ścieżek: M marker wielkości Perfect 100bp DNA Ladder (EURx); 1 i 3 amplifikat trawiony enzymem BtsI; 2 i 4 amplifikat nie trawiony enzymem BtsI. ciągu nie jest znane. Zastosowanie powyższego testu w diagnostyce weterynaryjnej oraz diagnostyce żywności może pomóc w zdefiniowaniu źródła zakażeń. Badania były finansowane ze środków Narodowego Centrum Nauki przeznaczonych na realizację projektu badawczego nr N N PIŚMIENNICTWO 1. Bottone EJ. Yersinia enterocolitica: the charisma continues. Clinic Microbiol Rev 1997; 10: Bottone EJ. Yersinia enterocolitica: overview and epidemiologic correlates. Microbes Infect 1999; 1: Carniel E. The Yersinia high-pathogenicity island: an iron-uptake island. Microbes Infect 2001; 3: EFSA Panel on Biological Hazards (BIOHAZ). Monitoring and identification of human enteropathogenic Yersinia spp. - Scientific Opinion of the Panel on Biological Hazards. EFSA J 2007; 595: EFSA. Scientific Report of EFSA. The European Union Summary Report on Trends and Sources of Zoonoses, Zoonotic Agents and Food-borne Outbreaks in EFSA J 2011; 9(3): 2090 [378 pp.].
9 Nr 2 Szybki test PCR-RFLP do identyfikacji Y. enterocolitica 1B/O Falcão JP, Falcão DP, Pitondo-Silva A, Malaspina AC, Brocchi M. Molecular typing and virulence markers of Yersinia enterocolitica strains from human, animal and food origins isolated between 1968 and 2000 in Brazil. J Med Microbiol 2006; 55: Furman S, Napiórkowska A, Sadkowska-Todys M. Jersinioza w Polsce w 2009 roku. Przegl Epidemiol 2011; 65: Gierczyński R. Ocena przydatności wybranych markerów wirulencji do identyfikowania chorobotwórczych szczepów pałeczek Yersinia enterocolitica. Cz. III. Chromosomalne markery wirulencji. Med Dośw Mikrobiol 2000; 52: Gierczyński R, Jagielski M, Rastawicki W. Molecular virulence attributes and occurence of pyvbearing strains among human clinical isolates of Yersinia enterocolitica in Poland. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2002; 21: Gierczyński R, Szych J, Cieślik A, Rastawicki W, Jagielski M. The occurrence of the first two CTX-M-3 and TEM-1 producing isolates of Salmonella enterica serovar Oranienburg in Poland. Int J Antimicrob Agents 2003; 21: Gierczyński R, Szych J, Rastawicki W, Wardak S, Jagielski M. Molecular characterization of human clinical isolates of Yersinia enterocolitica bioserotype 1B/O8 in Poland: emergence and dissemination of three highly related clones. J Clin Microbiol 2009; 47: Gierczyński R. Genetyczna struktura populacji I determinanty chorobotwórczości pałeczek Yersinia enterocolitica izolowanych materiału klinicznego od ludzi w Polsce w latach Rozprawa na stopień doktora habilitowanego nauk medycznych w zakresie biologii medycznej. Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego - Państwowy Zakład Higieny, Warszawa Haller JC, Carlson S, Pederson KJ, Pierson DE.A chromosomally encoded type III secretion pathway in Yersinia enterocolitica is important in virulence. Mol Microbiol 2000; 3: Ibrahim A, Liesack W, Stackebrandt E. Polymerase chain reaction-gene probe detection system specific for pathogenic strains of Yersinia enterocolitica. J Clinic Microbiol 1992; 30: Napiórkowska A, Bobel D, Sadkowska-Todys M. Jersinioza w Polsce w 2007 roku. Przegl Epidemiol 2009; 63: Rastawicki W, Szych J, Gierczyński R, Rokosz N. A dramatic increase of Yersinia enterocolitica serogroup O:8 infections in Poland. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2009; 28: Rastawicki W, Szych J, Rokosz N, Zacharczuk K, Gierczyński R. Seasonality of Yersinia enterocolitica bioserotype 1B/O:8 infections in Poland. Epidemiol Infect : Rastawicki W, Szych J, Rokosz N, Zacharczuk K, Wołkowicz T, Gierczyński R. Emergence of high-pathogenicity Yersinia enterocolitica bioserotype 1B/O8 infections in Poland. W: Materiały Zjazdowe Yersinia 11: The 11th International Symposium on Yersinia. Suzhou, China, June 2013, Rokosz-Chudziak N, Rastawicki W, Zacharczuk K, Gierczyński R. Elektroforetyczna i immunologiczna analiza natywnych białek wydzielniczych wytwarzanych in vitro w warunkach indukcji Ysa (Yersinia secretion apparatus) przez izolaty Yersinia enterocolitica 1B/O8 wyosobnione w Polsce. Med Dośw Mikrobiol. 2013; 65: Rosner BM, Stark K, Werber D. Epidemiology of reported Yersinia enterocolitica infections in Germany, BMC Public Health 2010; 10: Sakai T, Nakayama A, Hashida M, Yamamoto Y, Takebe H, Imai S. Outbreak of food poisoning by Yersinia enterocolitica serotype O8 in Nara prefecture: the first case report in Japan. Jpn J Infect Dis 2005; 58: Schubert S, Bockemühl J, Brendler U, Heesemann J. First isolation of virulent Yersinia enterocolitica O8, biotype 1B in Germany. Eur J Clin Microbiol Infect 2003; 22: Szych J, Rastawicki W, Gierczyński R, Krygier R, Mądroszczyk A, Cieślik A. First isolation of virulent Yersinia enterocolitica O8 biotype 1B in Poland. Post Mikrobiol 2004; 43; (Supl 1): Szych J. Jersinioza nowe zagrożenie mało znaną chorobą. Nowa Klinika 2011; 18:
10 98 T. Wołkowicz i inni Nr Thoerner P, Bin Kingombe CI, Bögli-Stuber K, Bissig-Choisat B, Wassenaar TM, Frey J, Jemmi T. PCR detection of virulence genes in Yersinia enterocolitica and Yersinia pseudotuberculosis and investigation of virulence gene distribution. Appl Environ Microbiol 2003; 69: Young GM. The Ysa type 3 secretion system of Yersinia enterocolitica biovar 1B.Adv Exp Med Biol 2007; 603: Zacharczuk K. Molekularna charakterystyka pałeczek Yersinia enterocolitica 1B/O8 wyizolowanych od ludzi w Polsce w 2009 roku. Rozprawa doktorska, NIZP-PZH Warszawa. 28. Zacharczuk K. Analiza profilu genetycznych markerów chorobotwórczości pałeczek Yersinia enterocolitica bioserotypu 1B/O8 wyizolowanych z materiału klinicznego w Polsce w 2009 r. Med Dośw Mikrobiol 2013; 65: Otrzymano: 16 V 2014 r. Adres Autora: Warszawa, ul. Chocimska 24, Zakład Bakteriologii NIZP-PZH, twolkowicz@pzh.gov.pl, tel ,
Investigation of molecular virulence factors of Yersinia enterocolitica 1B/O8 human clinical isolates collected in Poland in 2009
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2013, 65: 233-243 Analiza profilu genetycznych markerów chorobotwórczości pałeczek Yersinia enterocolitica bioserotypu 1B/O8 wyizolowanych z materiału klinicznego w Polsce w 2009
Identyfikacja pałeczek Yersinia enterocolitica z wykorzystaniem spektroskopii mas typu MALDI-TOF
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2012, 64: 123-128 Identyfikacja pałeczek Yersinia enterocolitica z wykorzystaniem spektroskopii mas typu MALDI-TOF Rapid identification of Yersinia enterocolitica by matrix-assisted
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: Katarzyna Zacharczuk, Rafał Gierczyński
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 133-142 Katarzyna Zacharczuk, Rafał Gierczyński OCENA PRZYDATNOŚCI NOWYCH ENZYMÓW RESTRYKCYJNYCH SFAAI ORAZ SMII DO RÓŻNICOWANIA IZOLATÓW YERSINIA ENTEROCOLITICA 4/O3 I
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2013, 65: Natalia Rokosz-Chudziak, Waldemar Rastawicki, Katarzyna Zacharczuk, Rafał Gierczyński
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2013, 65: 245-254 Elektroforetyczna i immunologiczna analiza natywnych białek wydzielniczych wytwarzanych in vitro w warunkach indukcji Ysa (Yersinia secretion apparatus) przez izolaty
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: Sebastian Wardak, Marek Jagielski 1
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 63-77 Sebastian Wardak, Marek Jagielski 1 OCENA PRZYDATNOŚCI WYBRANYCH METOD GENOTYPOWYCH I FENOTYPOWYCH DO WEWNĄTRZGATUNKOWEGO RÓŻNICOWANIA PAŁECZEK CAMPYLOBACTER JEJUNI
Presence of β-lactamase encoding genes in clinical isolates of Y. enterocolitica bioserotype 1B/O8mm isolated in Poland in Katarzyna Zacharczuk
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2018, 70: 149-157 DOI 10.32394/mdm.70.2.4 Charakterystyka obecności genetycznych determinantów warunkujących oporność pałeczek Y. enterocolitica bioserotypu 1B/O8 izolowanych w Polsce
Ocena wpływu zastosowanych odczynników na szybkość uzyskania wyniku identyfikacji laseczki wąglika w teście RSI-PCR dla genu plcr
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 321-326 Aleksandra A. Zasada Ocena wpływu zastosowanych odczynników na szybkość uzyskania wyniku identyfikacji laseczki wąglika w teście RSI-PCR dla genu plcr Zakład Bakteriologii
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Wstęp teoretyczny Technika RAPD (ang. Random Amplification of Polymorphic DNA) opiera się na prostej reakcji PCR, przeprowadzanej na genomowym
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków)
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków) Celem ćwiczenia jest wprowadzenie mutacji punktowej do genu
Jolanta Szych, Aleksandra Jakubczak, Sebastian Wardak, Grzegorz Madajczak
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 29, 61: 311-319 Jolanta Szych, Aleksandra Jakubczak, Sebastian Wardak, Grzegorz Madajczak OCENA WRAŻLIWOŚCI NA WYBRANE ANTYBIOTYKI PAŁECZEK YERSINIA ENTEROCOLITICA I YERSINIA PSEUDOTUBERCULOSIS
Autor: dr Mirosława Staniaszek
Zakład Hodowli Roślin Ogrodniczych Pracownia Genetyki i Hodowli Roślin Warzywnych Fot. J. Sobolewski Procedura identyfikacji genu Frl warunkującego odporność pomidora na Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici
TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925
TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2017, 69: Waldemar Rastawicki, Anna Chróst, Kornelia Gielarowiec
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2017, 69: 27-4 Ocena przydatności opracowanego we własnym zakresie lateksowego testu aglutynacyjnego do poszukiwania przeciwciał dla antygenów pałeczek Yersinia enterocolitica i
Glimmer umożliwia znalezienie regionów kodujących
Narzędzia ułatwiające identyfikację właściwych genów GLIMMER TaxPlot Narzędzia ułatwiające amplifikację tych genów techniki PCR Primer3, Primer3plus PrimerBLAST Reverse Complement Narzędzia ułatwiające
AmpliTest Babesia spp. (PCR)
AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:
PL 217144 B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego
PL 217144 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 217144 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 391926 (22) Data zgłoszenia: 23.07.2010 (51) Int.Cl.
Inżynieria Genetyczna ćw. 3
Materiały do ćwiczeń z przedmiotu Genetyka z inżynierią genetyczną D - blok Inżynieria Genetyczna ćw. 3 Instytut Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski, rok akad. 2018/2019
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1 1 Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Korzeniowych, Pracownia Biotechnologii, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji
Ocena rozprawy doktorskiej Pani lek. wet. Iwony Kozyry p.t. Molekularna charakterystyka zoonotycznych szczepów rotawirusa świń
Prof. dr hab. Zbigniew Grądzki Katedra Epizootiologii i Klinika Chorób Zakaźnych Wydział Medycyny Weterynaryjnej Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Ocena rozprawy doktorskiej Pani lek. wet. Iwony Kozyry
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: 1. Otrzymanie pożądanego odcinka DNA z materiału genetycznego dawcy 2. Wprowadzenie obcego DNA do wektora 3. Wprowadzenie wektora, niosącego w sobie
TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R
TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej
Ampli-LAMP Salmonella species
Novazym Products Novazym Polska ul. Żywokostowa 23, 61-680 Poznań, tel. +48 0 61 610 39 10, fax +48 0 61 610 39 11, email info@novazym.com Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego bakterii z rodzaju
Zalecenia rekomendowane przez Ministra Zdrowia. KPC - ang: Klebsiella pneumoniae carbapenemase
Zalecenia dotyczące postępowania w przypadku identyfikacji w zakładach opieki zdrowotnej szczepów bakteryjnych Enterobacteriaceae wytwarzających karbapenemazy typu KPC * * KPC - ang: Klebsiella pneumoniae
ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ
ŻYW NO ŚĆ 3(20)Supl 1999 JOANNA CHMIELEWSKA, JOANNA KAWA-RYGIELSKA ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ S t r e s z c z e n i e W pracy podjęto próbę wykorzystania metody
Ampli-LAMP Babesia canis
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2017, 69: Waldemar Rastawicki, Kornelia Gielarowiec, Anna Chróst
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2017, 69: 127-141 Występowanie przeciwciał dla rekombinowanych białek i lipopolisacharydów werotoksycznych pałeczek Escherichia coli (VTEC) w poszczególnych podklasach IgG u dzieci
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: Natalia Rokosz, Waldemar Rastawicki, Marek Jagielski
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 299-304 Natalia Rokosz, Waldemar Rastawicki, Marek Jagielski Wykorzystanie odczynu ELISA do poszukiwania przeciwciał dla lipopolisacharydów werotoksycznych pałeczek okrężnicy
EDA projekt Database of B-agent wykorzystanie w epidemiologii
EDA projekt Database of B-agent wykorzystanie w epidemiologii Cele I fazy projektu: Stworzenie sieci nowoczesnych laboratoriów biologicznych Stworzenie wspólnej bazy danych poszczególnych szczepów bakterii
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR)
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzaju Salmonella techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK25N Wersja zestawu: 1.2012 Zestaw do wykrywania spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Zestaw
Prof. dr hab. Zbigniew Grądzki Katedra Epizootiologii i Klinika Chorób Zakaźnych Wydziału Medycyny Weterynaryjnej UP w Lublinie
Prof. dr hab. Zbigniew Grądzki Katedra Epizootiologii i Klinika Chorób Zakaźnych Wydziału Medycyny Weterynaryjnej UP w Lublinie Ocena rozprawy doktorskiej Pani lek. wet. Magdaleny Frączyk pt. Opracowanie
Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK24N Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Detekcja
Prof. dr hab. Zbigniew Grądzki
Prof. dr hab. Zbigniew Grądzki Katedra Epizootiologii i Klinika Chorób Zakaźnych Wydziału Medycyny Weterynaryjnej Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie Ocena rozprawy doktorskiej Pani lek. wet. Ewy Kwit
Genetyka, materiały dla studentów Pielęgniarstwa
Markery genetyczne: definicja Marker genetyczny jest to cecha, która może być wykorzystana do identyfikacji osobników lub gatunków. Cechy markerów genetycznych Monogeniczny: warunkowany przez jeden gen
Ćwiczenie 12. Diagnostyka molekularna. Poszukiwanie SNPs Odczytywanie danych z sekwencjonowania. Prof. dr hab. Roman Zieliński
Ćwiczenie 12 Diagnostyka molekularna. Poszukiwanie SNPs Odczytywanie danych z sekwencjonowania Prof. dr hab. Roman Zieliński 1. Diagnostyka molekularna 1.1. Pytania i zagadnienia 1.1.1. Jak definiujemy
Analysis of laboratory tests results for Salmonella infections performed since 2008 to 2014 in Poland
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2015, 67: 97-106 Analiza wyników badań laboratoryjnych w kierunku zakażeń wywołanych przez pałeczki Salmonella w latach 2008-2014 w Polsce Analysis of laboratory tests results for
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
AKTUALNOÂCI BINET. Nr 10/ Drogie Koleżanki i Koledzy. Inwazyjna choroba meningokokowa w 2015 roku
www.koroun.edu.pl Drogie Koleżanki i Koledzy Witamy serdecznie, oddajemy w Państwa ręce kolejny numer Aktualności BINet. Jest on poświęcony epidemiologii inwazyjnych zakażeń wywoływanych przez Neisseria
DIAGNOSTYKA POLSKICH SZCZEPÓW WIRUSA MOZAIKI PEPINO (PEPINO MOSAIC VIRUS)
Progress in Plant Protection / Postępy w Ochronie Roślin, 47 (2) 2007 DIAGNOSTYKA POLSKICH SZCZEPÓW WIRUSA MOZAIKI PEPINO (PEPINO MOSAIC VIRUS) HENRYK POSPIESZNY, BEATA HASIÓW, NATASZA BORODYNKO Instytut
uzyskanymi przy zastosowaniu innych metod użyto testu Manna-Whitney a. Jako miarę korelacji wykorzystano współczynnik. Przedstawiona w dysertacji
STRESZCZENIE Zakażenia mykoplazmowe u bydła, a zwłaszcza na tle M. bovis, stanowią istotny problem epidemiologiczny i ekonomiczny w wielu krajach świata. Uważa się, że M. bovis jest odpowiedzialna za 25%
Narodowy Instytut Leków ul. Chełmska 30/34, 00-725 Warszawa Tel. 022 851-46-70, Fax. 022 841-29-49 www.korld.edu.pl Warszawa, dn. 21.10.2009r.
Narodowy Instytut Leków ul. Chełmska 30/34, 00-725 Warszawa Tel. 022 851-46-70, Fax. 022 841-29-49 www.korld.edu.pl Warszawa, dn. 21.10.2009r. Wytyczne postępowania w przypadku wykrycia szczepów pałeczek
Zastosowanie metody MLVA do genotypowania Corynebacterium diphtheriae. Badania wstępne 1
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 209-218 Aleksandra A. Zasada, Marek Jagielski,Magdalena Rzeczkowska, Aleksandra Januszkiewicz Zastosowanie metody MLVA do genotypowania Corynebacterium diphtheriae. Badania
Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Diagnostyka molekularna w OIT
Diagnostyka molekularna w OIT B A R B A R A A D A M I K K A T E D R A I K L I N I K A A N E S T E Z J O L O G I I I I N T E N S Y W N E J T E R A P I I U N I W E R S Y T E T M E D Y C Z N Y W E W R O C
Podsumowanie europejskiego badania nt. rozpowszechnienia bakterii opornych na karbapenemy. Podsumowanie. Projekt EuSCAPE
Podsumowanie europejskiego badania nt. rozpowszechnienia bakterii opornych na karbapenemy Październik 2013 Podsumowanie Celem Europejskiego Badania nt. Rozpowszechnienia Pałeczek Enteriobacteriaceae Wytwarzających
Sekcja Higieny i Epidemiologii, Wojskowy Instytut Medyczny w Warszawie
ZASADY POSTĘPOWANIA W OGNISKACH EPIDEMICZNYCH WYWOŁYWANYCH PRZEZ SZCZEPY STAPHYLOCOCCUS AUREUS. ZADANIA ZESPOŁU DS. ZAKAŻEN SZPITALNYCH lek. med.marta Kania-Pudło 1, mgr Katarzyna Bojarska 2, prof. dr
Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9
Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów Rozdział 9 Wykrywanie jakościowe kukurydzy MON810, kukurydzy Bt-176 i soi Roundup Ready metodą PCR M. Querci, M. Maretti, M. Mazzara
pojedynczych mutacji punktowych, lokalizujących się we fragmencie genu o wielkości około 600 pz. Uważa się, że poszczególne układy mutacji są
Streszczenie Spośród herpeswirusów występujących u koni najważniejsze znaczenie, zarówno z klinicznego jak i ekonomicznego punktu widzenia posiada EHV-1. Wirus ten powoduje zapalenie górnych dróg oddechowych
Rocz. Nauk. Zoot., T. 37, z. 2 (2010) 145 149. Identyfikacja sekwencji genu kodującego dehydrogenazę NADH 1 u sarny
Rocz. Nauk. Zoot., T. 37, z. 2 (2010) 145 149 Identyfikacja sekwencji genu kodującego dehydrogenazę NADH 1 u sarny M a ł g o r z a t a N a t o n e k - W i ś n i e w s k a, E w a S ł o t a Instytut Zootechniki
-PCR for typing of monophasic Salmonella enterica isolates with antigenic shame 1,4,[5],12:i:- *
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2015, 67: 155-164 Usefulness of the -PCR for typing of monophasic Salmonella enterica isolates with antigenic shame 1,4,[5],12:i:- * Ocena przydatności metody -PCR do różnicowania
adaptacji oraz mutacji uzyskały zdolność infekowania innych organizmów. Zakażenia ptaków dzikich następują najczęściej bezobjawowo na drodze kontaktu
Streszczenie Wirus grypy (Influenza virus, IV) należy do rodziny Orthomyxoviridae i dzięki swoim zdolnościom adaptacyjnym jest jednym z najgroźniejszych patogenów na świecie. Wyróżnia się trzy typy wirusa
PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 26/11
PL 214501 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 214501 (13) B1 (21) Numer zgłoszenia: 391458 (51) Int.Cl. C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/29 (2006.01) Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Zakład Bakteriologii Narodowego Instytutu Zdrowia Publicznego Państwowego Zakładu Higieny w Warszawie Kierownik: prof. dr hab. M.
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 305-314 Tomasz Wołkowicz 1, Jolanta Szych 1, Sebastian Wardak 2 Analiza podłoża genetycznego i mechanizmów rozprzestrzeniania się oporności na tetracyklinę populacji szczepów
Bazy danych czynników biologicznych i ich wykorzystanie w identyfikacji zagrożenia biologicznego.
Bazy danych czynników biologicznych i ich wykorzystanie w identyfikacji zagrożenia biologicznego. ppłk. Dr lek. wet. Marcin Niemcewicz Ośrodek Diagnostyki i Zwalczania Zagrożeń Biologicznych Wojskowego
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2015, 67: Waldemar Rastawicki, Stanisław Kałużewski
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2015, 67: 165-171 Zastosowanie odczynu immunoenzymatycznego ELISA do poszukiwania przeciwciał dla lipopolisacharydowych antygenów somatycznych O oraz otoczkowego antygenu Vi pałeczek
Zestaw dydaktyczny. genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP
2014-07-17 Zestaw dydaktyczny EasyGenotyping PCR-RFLP - S. aureus genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP Celem ćwiczenia jest przeprowadzenie typowania genetycznego dostarczonych
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR)
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii Borrelia burgdorferi, Anaplasma, Ehrlichia oraz pierwotniaków rodzaju Babesia (B. canis, B. gibsoni,
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa IZOLACJA DNA Z HODOWLI KOMÓRKOWEJ.
dystrybucji serotypów powodujących zakażenia inwazyjne w poszczególnych grupach wiekowych zapadalność na IChP w poszczególnych grupach wiekowych
Warszawa, 15.06.2015 Rekomendacje Pediatrycznego Zespołu Ekspertów ds. Programu Szczepień Ochronnych (PZEdsPSO) dotyczące realizacji szczepień obowiązkowych, skoniugowaną szczepionką przeciwko pneumokokom;
Dr n. med. Dorota Żabicka, NPOA, KORLD, Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii Klinicznej NIL
Raport opracowany ze środków finansowych będących w dyspozycji Ministra Zdrowia w ramach realizacji programu polityki zdrowotnej pn. Narodowy Program Ochrony Antybiotyków na lata 06-00 Narodowy Instytut
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: Sebastian Wardak, Marek Jagielski 1
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 47-61 Sebastian Wardak, Marek Jagielski 1 OCENA PRZYDATNOŚCI WYBRANYCH METOD GENOTYPOWYCH I FENOTYPOWYCH DO WEWNĄTRZGATUNKOWEGO RÓŻNICOWANIA PAŁECZEK CAMPYLOBACTER JEJUNI
PROBLEMY TERAPEUTYCZNE WTÓRNYCH ZAKAŻEŃ KRWI POWODOWANE PRZEZ PAŁECZKI Enterobacterales W PRAKTYCE ODDZIAŁÓW ZABIEGOWYCH I ZACHOWAWCZYCH
PROBLEMY TERAPEUTYCZNE WTÓRNYCH ZAKAŻEŃ KRWI POWODOWANE PRZEZ PAŁECZKI Enterobacterales W PRAKTYCE ODDZIAŁÓW ZABIEGOWYCH I ZACHOWAWCZYCH DOROTA ROMANISZYN KATEDRA MIKROBIOLOGII UJCM KRAKÓW Zakażenie krwi
PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 04/14. SYLWIA OKOŃ, Dąbrowica, PL KRZYSZTOF KOWALCZYK, Motycz, PL
PL 220315 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 220315 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 400252 (22) Data zgłoszenia: 06.08.2012 (51) Int.Cl.
Diagnostyka zakażeń EBV
Diagnostyka zakażeń EBV Jakie wyróżniamy główne konsekwencje kliniczne zakażenia EBV: 1) Mononukleoza zakaźna 2) Chłoniak Burkitta 3) Potransplantacyjny zespół limfoproliferacyjny Jakie są charakterystyczne
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Charakterystyka wzorów lekowrażliwości szpitalnych szczepów Clostridium difficile w Polsce oraz badanie mechanizmów oporności na wybrane leki
STRESZCZENIE W JĘZYKU POLSKIM Charakterystyka wzorów lekowrażliwości szpitalnych szczepów Clostridium difficile w Polsce oraz badanie mechanizmów oporności na wybrane leki Clostridium difficile to Gram-dodatnia,
Delegacje otrzymują w załączeniu dokument D043211/04.
Rada Unii Europejskiej Bruksela, 11 maja 2017 r. (OR. en) 8950/17 AGRILEG 92 DENLEG 41 VETER 36 PISMO PRZEWODNIE Od: Komisja Europejska Data otrzymania: 4 maja 2017 r. Do: Nr dok. Kom.: D043211/04 Dotyczy:
Platforma Genie II. innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification
1 Platforma Genie II innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification 1 2 Charakterystyka platformy Genie II Genie II jest innowacyjnym
Corynebacterium diphtheriae
Porównanie wybranych molekularnych metod typowania Corynebacterium diphtheriae Comparison of selected molecular methods for Corynebacterium diphtheriae typing Aleksandra A. Zasada, Marek Jagielski Narodowy
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR)
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA terminatora NOS techniką Real Time PCR Nr kat.: GMO03-50 GMO03-100 Wielkość zestawu: 50 reakcji 100 reakcji Objętość pojedynczej
Scenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej
Scenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej Temat lekcji: Planowanie doświadczeń biologicznych jak prawidłowo zaplanować próbę kontrolną? Cele kształcenia IV etap edukacyjny: 1. Wymagania ogólne:
1. Zamawiający: 2. Opis przedmiotu zamówienia:
Zapytanie ofertowe na dostawę analizatora wraz z oprogramowaniem do automatycznej izolacji, amplifikacji i detekcji sekwencji DNA wirusów brodawczaka ludzkiego typu wysokiego ryzyka (hr-hpv) metodą PCR
EPIDEMIOLOGIA DANE KRAJOWE
EPIDEMIOLOGIA DANE KRAJOWE Dane krajowe zostały opracowane na podstawie informacji przekazanych przez Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego - Państwowy Zakład Higieny (zwany dalej NIZP-PZH) oraz zamieszczonych
Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej
Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej Ponad 60% zakażeń w praktyce klinicznej jest wywołana przez wirusy. Rodzaj i jakość materiału diagnostycznego (transport!) oraz interpretacja wyników badań
Instytut Mikrobiologii
Instytut Mikrobiologii Warto zostać mikrobiologiem! Zrób licencjat w Instytucie Mikrobiologii UW (a potem pracę magisterską i doktorat) Badamy biologię oraz genetyczne podstawy funkcjonowania bakterii
Ampli-LAMP Goose Parvovirus
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego parwowirusa GPV u gęsi techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-GPV-200 AML-GPV-400 Wydanie
Prowadzący: dr Lidia Boss znacznik fluorescencyjny (np. SYBR Green II)
Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii Biologia i Biologia Medyczna II rok Katedra Biologii Molekularnej Przedmiot: Biologia Molekularna z Biotechnologią ============================================================================
(62) Numer zgłoszenia, z którego nastąpiło wydzielenie:
PL 227091 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 227091 (21) Numer zgłoszenia: 419590 (22) Data zgłoszenia: 20.01.2014 (62) Numer zgłoszenia,
Wstęp. Key words: MSSCP, PCR RFLP, Staphylococcus spp., 16S rrna, 16S 23S rrna
Streszczenie Zakażenia szpitalne stanowią złożony problem dla współczesnego lecznictwa i są przyczyną przedłużonego leczenia, rekonwalescencji, zwiększonych kosztów a nawet wielu zgonów wśród pacjentów
Lek. Ewelina Anna Dziedzic. Wpływ niedoboru witaminy D3 na stopień zaawansowania miażdżycy tętnic wieńcowych.
Lek. Ewelina Anna Dziedzic Wpływ niedoboru witaminy D3 na stopień zaawansowania miażdżycy tętnic wieńcowych. Rozprawa na stopień naukowy doktora nauk medycznych Promotor: Prof. dr hab. n. med. Marek Dąbrowski
Waldemar Rastawicki, Karolina Śmietańska, Anna Chróst, Tomasz Wołkowicz, Natalia Rokosz-Chudziak
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2016, 68: 23-31 Ocena przydatności uzyskanych we własnym zakresie rekombinowanych białek Yop pałeczek Yersinia enterocolitica jako wysoce swoistych antygenów w odczynach ELISA i
Występowanie przeciwciał dla pałeczek Francisella tularensis w poszczególnych podklasach IgG u osób z tularemią
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: 11-15 Występowanie przeciwciał dla pałeczek Francisella tularensis w poszczególnych podklasach IgG u osób z tularemią Serum immunoglobulin IgG subclass distribution of
WYSTĘPOWANIE I ZRÓŻNICOWANIE GENÓW ODPOWIEDZIALNYCH ZA OPORNOŚĆ NA TETRACYKLINĘ SZCZEPÓW ENTEROCOCCUS FAECALIS IZOLOWANYCH W REGIONIE GDAŃSKIM.
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 13-17 Tomasz Jarzembowski 1), Aleksandra Dybikowska 2) Maria Dąbrowska-Szponar 1) WYSTĘPOWANIE I ZRÓŻNICOWANIE GENÓW ODPOWIEDZIALNYCH ZA OPORNOŚĆ NA TETRACYKLINĘ SZCZEPÓW
OPORNOŚĆ NA CIPROFLOKSACYNĘ I TETRACYKLINĘ SZCZEPÓW CAMPYLOBACTER SPP. IZOLOWANYCH Z PRODUKTÓW DROBIARSKICH
BROMAT. CHEM. TOKSYKOL. XLII, 2009, 3, str. 588 592 Elżbieta Maćkiw 1, Katarzyna Rzewuska 1, Katarzyna Tomczuk 1, Dorota Korsak 1,2 OPORNOŚĆ NA CIPROFLOKSACYNĘ I TETRACYKLINĘ SZCZEPÓW CAMPYLOBACTER SPP.
Genotypowanie szczepów Clostridium perfringens izolowanych od chorych z objawami zatrucia pokarmowego oraz próbek żywności
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2016, 68: 191-201 Genotypowanie szczepów Clostridium perfringens izolowanych od chorych z objawami zatrucia pokarmowego oraz próbek żywności Genotyping Clostridium perfringens strains
Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16
Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16 Ćwiczenie 3 Identyfikacja genetycznie modyfikowanych roślin w produktach spożywczych - jakościowe badanie obecności
WYKRYWANIE BAKTERII SALMONELLA METODAMI MOLEKULARNYMI W PRODUKTACH ŻYWNOŚCIOWYCH
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych nr 573, 2013, 3 11 WYKRYWANIE BAKTERII SALMONELLA METODAMI MOLEKULARNYMI W PRODUKTACH ŻYWNOŚCIOWYCH Anna Misiewicz, Anna Goncerzewicz Instytut Biotechnologii
Autoreferat. dr n. wet. Agata Dorota Bancerz-Kisiel. Katedra Epizootiologii Wydział Medycyny Weterynaryjnej Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie
Załącznik nr 2 do wniosku o przeprowadzenie postępowania habilitacyjnego Autoreferat dr n. wet. Agata Dorota Bancerz-Kisiel Katedra Epizootiologii Wydział Medycyny Weterynaryjnej Uniwersytet Warmińsko-Mazurski
OCENA STOPNIA KONTAMINACJI BAKTERIAMI CAMPYLOBACTER SPP. PRODUKTÓW DROBIARSKICH DOSTĘPNYCH W HANDLU DETALICZNYM
BROMAT. CHEM. TOKSYKOL. XLIV, 2011, 3, str. 678 682 Elżbieta Maćkiw 1), Dorota Korsak 1,2), Katarzyna Tomczuk 1), Katarzyna Stoś 1) OCENA STOPNIA KONTAMINACJI BAKTERIAMI CAMPYLOBACTER SPP. PRODUKTÓW DROBIARSKICH
OCENA PRZYDATNOŚCI TESTU PREMI TEST SALMONELLA DO IDENTYFIKACJI PAŁECZEK SALMONELLA NIETYPUJĄCYCH SIĘ METODAMI KLASYCZNYMI
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 29-36 Grzegorz Madajczak, Jolanta Szych OCENA PRZYDATNOŚCI TESTU PREMI TEST SALMONELLA DO IDENTYFIKACJI PAŁECZEK SALMONELLA NIETYPUJĄCYCH SIĘ METODAMI KLASYCZNYMI Zakład
Sequence-based typing molekularne typowanie szczepów Legionella pneumophila w ramach międzynarodowego sprawdzianu external quality assessment
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2013, 65: 103-110 Sequence-based typing molekularne typowanie szczepów Legionella pneumophila w ramach międzynarodowego sprawdzianu external quality assessment Sequence-based typing
Oporność na antybiotyki w Unii Europejskiej Dane zaprezentowane poniżej zgromadzone zostały w ramach programu EARS-Net, który jest koordynowany przez
Informacja o aktualnych danych dotyczących oporności na antybiotyki na terenie Unii Europejskiej Październik 2013 Główne zagadnienia dotyczące oporności na antybiotyki przedstawione w prezentowanej broszurze
starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg
STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia
Dziennik Urzędowy Unii Europejskiej L 280/5
24.10.2007 Dziennik Urzędowy Unii Europejskiej L 280/5 ROZPORZĄDZENIE KOMISJI (WE) NR 1237/2007 z dnia 23 października 2007 r. zmieniające rozporządzenie (WE) nr 2160/2003 Parlamentu Europejskiego i Rady