Systemy Biolog mające zastosowanie w:

Transkrypt

1 Systemy Biolog mające zastosowanie w: IDENTYFIKACJI MIKROORGANIZMÓW - wprowadzona przez amerykaoską firmę Biolog, unikalna technologia systemów Biolog umożliwia dokładną identyfikację bakterii i grzybów na podstawie analizy metabolizmu mikroorganizmów w odniesieniu do zróżnicowanych źródeł węgla, znajdujących się na 96 dołkowej płytce Biolog. System Biolog porównuje obserwowane zmiany metaboliczne z największą na świecie bazą danych obejmującą około gatunków bakterii, drożdży i grzybów strzępkowych, pozwalając na ich identyfikację w czasie nie przekraczającym 4 godzin. Przełom w chemii Redox pozwala na testowanie bakterii Gram dodatnich i Gram ujemnych na tym samym panelu bez barwienia Grama oraz dodatkowych testów! Zestawy GEN III dokładnie analizują zdolnośd komórek do metabolizowania wszystkich głównych grup związków biochemicznych, w uzupełnieniu o inne ważne cechy fizjologiczne: ph, tolerancję soli i kwasu mlekowego, zdolności redukujące, wrażliwośd chemiczną. Identyfikacja może byd wykonana manualnie lub z wykorzystaniem wszystkich systemów Biolog półautomatycznego MicroStation TM i OmniLog FENOTYPOWANIU MIKROORGANIZMÓW PM - wyjątkowa technologia PM Phenotype Microarrays pozwala naukowcom na analizowanie ponad 2000 fenotypów komórek mikrobiologicznych podczas pojedynczego badania. Zintegrowany system profili komórkowych, specjalistyczne oprzyrządowanie i bioinformatyczne oprogramowanie zapewnia rozległą wiedzę na poziomie komórkowym, interpretację i analizę ekspresji genów, danych proteomicznych. Poprzez kompleksową i precyzyjną analizę fenotypów, badacze otrzymują właściwą ocenę efektu zmian genetycznych w komórkach, wpływu czynników środowiskowych, chemicznych, leków i wielu innych. Testy opierają się na wykorzystaniu źródeł C, N, P i S (~800 testów), ph (~100 testów), jonowej i niejonowej wrażliwości osmotycznej (~100 testów), wrażliwości na czynniki chemiczne (~1,000 testów). Zestawy mogą mied zastosowanie w badaniach naukowych, charakterystyka linii komórkowych, profilowanie metaboliczne, charakterystyka mutantów i mutacji, analiza efektów zmian genetycznych w komórkach, określenie funkcji genów, optymalizacja warunków hodowli komórkowych, rozwoju i ulepszania bioprocesów, kontroli jakości i walidacji bioprocesów, badania komórek macierzystych FENOTYPOWANIU KOMÓREK SSAKÓW PMM Phenotype Microarrays - zestawy do fenotypowania metabolizmu komórek ssaków. Zestawy w oparciu o prostą 3-etapową procedurę, umożliwiają analizę kinetyki energii oraz różnicowanie przepływu i przemian energii (głównie NADH) w setkach szlaków metabolicznych jednocześnie. Zestawy PMM są to dziewięddziesięciosześciodołkowe płytki opłaszczone metabolicznymi substratami i efektorami. Płytki PMM Biolog, mogą byd odczytywane przy użyciu każdego standardowego czytnika mikropłytek. Wykonanie badania jest bardzo wygodne i nieabsorbujące, a wyniki zapewniają wysoką powtarzalnośd. W połączeniu z szybkim definiowaniem preferencji substancji metabolicznych dla różnych typów komórek i generowaniem współczynników zmienności energii, zestawy są doskonałym narzędziem, umożliwiającym ocenę zmian aktywności metabolicznej w odpowiedzi na zmianę stężenia jonów, hormonów, leków przeciwnowotworowych. BADANIACH POPULACYJNYCH - płytki ECOPLATE, znajduje się na nich 31 różnych, najważniejszych dla środowiska, związków węgla w trzech powtórzeniach oraz trzy dołki kontrolne. Badania są użyteczne do badao potencjalnej różnorodności metabolicznej populacji mikroorganizmów środowisk zanieczyszczonych, ryzosfery roślin, gleb poddanych działaniu herbicydów, metali ciężkich, oceny struktury mikroorganizmów nawadnianych wodami pościelowymi. System pozwala na stworzenie profilu poziomu fizjologicznego populacji, profilu metabolicznego populacji bakterii i grzybów, wykorzystujących specyficzne źródła węgla. Unikalna technologia Biolog umożliwia dokładną identyfikację na podstawie analizy metabolizmu bakterii w odniesieniu do zróżnicowanych źródeł węgla, znajdujących się na 96 dołkowej płytce Biolog. Badany mikroorganizm wykorzystując specyficzne dla siebie źródła węgla, tworzy jedyny i niepowtarzalny wzór, tzw. odcisk palca, który może byd odczytany zarówno za pomocą systemów automatycznych jak i manualnie. Szeroki panel systemów pozwala użytkownikowi dokonad wyboru w zależności od posiadanego budżetu. W miarę potrzeb można także rozbudowywad i rozszerzad posiadany system. System Biolog zapewnia

2 najwyższą dokładnośd identyfikacji na poziomie molekularnym bez skomplikowanych i kosztownych metod sekwencjonowania genetycznego. MICROSTATION TM to najbardziej wszechstronny system, umożliwiający identyfikację i charakterystykę wszystkich typów bakterii, również tych szczególnie wrażliwych oraz środowiskowych we wszystkich zróżnicowanych obszarach mikrobiologii. W ofercie dostępnych jest 5 baz danych. Korzystając ze wszystkich, można zidentyfikowad ponad 2200 gatunków bakterii, drożdży i grzybów strzępkowych w czasie nie przekraczającym 4 godzin i minimalnym nakładzie pracy. Możliwe jest tworzenie własnych baz danych, do których można dodawad mikroorganizmy, wraz z ich specyficzną charakterystyką, zachowywad do ponownej oceny, wyświetlad w postaci dendrogramów i diagramów za pomocą oprogramowania Retrospect. Dane mogą byd eksportowane do takich aplikacji jak Excel lub Access. Metoda jest niezwykle dokładna a jednocześnie bardzo łatwa w użyciu. Półautomatyczne wykonanie wynik w czasie krótszym niż 4 godziny MICROSTATION ID System zapewnia najwyższą dokładnośd szybkiej identyfikacji oraz charakterystyki mikroorganizmów. Po inokulacji i inkubacji, płytka jest umieszczana w czytniku MicroStation Reader do przeprowadzenia analiz. Unikalny, metaboliczny wzór generowany przez dany organizm, jest zapisywany i porównywany z setkami profili identyfikacyjnych w odpowiedniej bazie danych Biolog. Automatyczny odczyt eliminuje subiektywnośd odczytu wizualnego analizując intensywnośd zabarwienia powstałego na skutek reakcji w poszczególnych dołkach płytki. MICROSTATION ID System zawiera obszerne aplikacje do analiz populacji mikrobiologicznych znajdujących się w glebie, wodzie, biofilmach i innych środowiskach. Opatentowana przez Biolog wyjątkowa technologia oparta na chemii Redox wykorzystującej specyficzne źródła węgla takie jak cukry, kwasy karboksylowe, aminokwasy i peptydy zapewnia niezrównane zasoby biochemicznych charakterystyk. Zróżnicowany zestaw testów umożliwia naszym systemom zidentyfikowad mikroorganizmy, których inne systemy nie rozpoznają lub błędnie identyfikują. OMNILOG SYSTEM zapewnia całkowicie zautomatyzowany proces inkubacji odczytu i interpretacji wyników dla 50 płytek MicroPlates TM Biolog jednocześnie. Oprogramowanie kontroluje wszystkie etapy procesu włącznie z wprowadzeniem próbki, usunięciem jak i kontrolą procesu inkubacji. Kolejne płytki mogą byd ładowane do systemu w dowolnym momencie, jeżeli są dostępne wolne pozycje lub został zakooczony proces identyfikacji poprzednich płytek. Wszystkie dane dla każdej płytki, wyniki identyfikacji wraz z wzorem reakcji wyświetlane są w menu systemowym. OmniLog ID System umożliwia dynamiczną automatyzację procesów zarządzania danymi. Szerokie spektrum bakterii Gram dodatnich i Gram ujemnych w tym nawet te szczególnie wrażliwe, wymagające specjalnej temperatury inkubacji czy warunków środowiskowych mają zapewnioną prawidłową i dokładną identyfikację. OmniLog Plus ID System posiada dodatkowo zdolnośd identyfikacji bakterii beztlenowych, grzybów strzępkowych i drożdży. OmniLog Combo Plus ID System wzbogacony jest o panel odczytu zestawów do fenotypowania bakterii Phenotype Microarrays. Jak wszystkie systemy do identyfikacji Biolog, OmniLog Systems opierają się na odczycie wyników reakcji biochemicznych na płytkach MicroPlates TM. Charakterystyczny metaboliczny wzór - odcisk palca mikroorganizmu, jest porównywany z setkami profili identyfikacyjnych znajdujących się w odpowiedniej bazie danych. Wynik jest zapisywany i archiwizowany, tworząc charakterystykę organizmu i umożliwiając analizę częstotliwości jego występowania. Oprogramowanie OmniLog jest wyjątkowo łatwe w obsłudze i zawiera wszystkie funkcjonalności elektronicznej obsługi danych, w tym również oprogramowanie Retrospect umożliwiające zapisywanie i obserwację mikroorganizmów. Posiada funkcje administracyjne zarządzające poziomami dostępu i uprawnieniami operatorów do modyfikacji lub tworzenia nowych plików. Oprogramowanie i bazy danych są systematycznie aktualizowane, uwzględniając nowe taksonomie, nowe gatunki a także nowe funkcjonalności spełniające oczekiwania użytkowników. Nazwa i wielkośd opakowania Wielkośd opakowania Nr katalogowy SYSTEMY AUTOMATYCZNEJ IDENTYFIKACJI GEN III Wszystkie systemy automatyczne Biolog, zawierają Omnilog GEN III Data Collection Software, Retrospect 2,0 Data Management Software, instrukcję użytkowania w wersji elektronicznej, OmniLog reader/incubator, komputer, drukarkę, pipetor, turbidymetr. Bazy danych są sprzedawane oddzielnie Wszystkie systemy Combo zawierają Omnilog Phenotype Microarray (PM) Software GEN III OmniLog ID System do szybkiej, automatycznej inkubacji i identyfikacji bakterii tlenowych. OmniLog ma zdolnośd inkubacji i monitorowania do 50 płytek BIOLOG Micro Plates. Identyfikacje rozpoczynają się po 4 h od załadowania MicroPlate 91372

3 GEN III OmniLog Plus ID System do szybkiej, automatycznej inkubacji i identyfikacji bakterii tlenowych oraz szybkiej identyfikacji bakterii beztlenowych, drożdży i grzybów mikroskopowych. OmniLog Plus ID System składa się z Omnilog ID System, MicroStation i komputera skonfigurowanego zarówno z oprogramowaniem OmniLog jak i MicroStation. GEN III OmniLog II Combo System do szybkiej, automatycznej inkubacji i identyfikacji bakterii tlenowych. OmniLog II Combo System z komputerem monitorem i drukarką skonfigurowany jest do automatycznej inkubacji i identyfikacji bakterii tlenowych oraz analiz Phenotype Microarray (PM) GEN III OmniLog II Combo Plus System do szybkiej, automatycznej inkubacji i identyfikacji bakterii tlenowych oraz szybkiej identyfikacji bakterii beztlenowych, drożdży i grzybów mikroskopowych. Także do automatycznej inkubacji i analiz Phenotype Microarray (PM) OmniLog II Combo Plus System składa się z Omnilog ID System, MicroStation i komputera skonfigurowanego zarówno z oprogramowaniem OmniLog ID, MicroStation i Phenotype MicroArray (PM) GEN III Bazy danych GEN III Database (dla obu grup bakterii Gram (-) i Gram (+). Database software zawiera odpowiednie standardy turbidymetryczne GEN III Turbidity Standards D 65 % T Turbidity Standard % T Turbidity Standard 3441 Półautomatyczny system identyfikacji GEN III Wszystkie systemy półautomatyczne Biolog, zawierają MicroLog 3 Software, Retrospect 2,0 Data Management Software, instrukcję użytkowania w wersji elektronicznej, reader, pipetor, turbidymetr. Bazy danych są sprzedawane oddzielnie GEN III MicroStation System - do szybkiej identyfikacji bakterii, drożdży i grzybów mikroskopowych. MicroStation ma możliwośd odczytu wszystkich konfiguracji Biolog MicroPlate GEN III MicroStation System z komputerem Software & Identification Databases Software GEN III Retrospect 2,0 Data Management Software Gen5 Data Analysis Software (optional reader control and data analysis software for (BioTek) MicroStation Reader) Bazy danych Database software zawiera odpowiednie standardy turbidymetryczne GEN III Database (dla obu grup bakterii Gram (-) i Gram (+). GN Database (GEN II dla Gram (-) bakterii tlenowych) GP Database (GEN II dla Gram (+) bakterii tlenowych) DP Database ( Dangerous Pathogen w zestawie GN i GP databases) Combination Database (GEN II zawiera GN, GP i DP Databases) AN Database ( dla bakterii beztlenowych ) - wymagany MicroStation lub Omnilog Plus System YT Database (dla drożdży) -- wymagany MicroStation lub OmniLog Plus System FF Database (dla grzybów strzępkowych) - wymagany MicroStation lub OmniLog Plus System GEN II System manualnej identyfikacji 26112D 3905C 22730D 22601D 22604D 22622D 22623D 22607D 22605D 22606D Wszystkie systemy manualne Biolog, zawierają MicroLog Software, instrukcję użytkowania w wersji elektronicznej, turbidymetr. Database i pipetor są sprzedawane oddzielnie GEN II MicroLog 1 System - do szybkiej identyfikacji bakterii. MicroLog 1 ma możliwośd odczytu wszystkich konfiguracji Biolog MicroPlate dla bakterii tlenowych. System nie zapewnia przechowywania oraz zarządzania danymi MicroLog 1 System bez komputera szt MicroLog 1 System z komputerem szt GEN II MicroLog 2 System - do szybkiej identyfikacji bakterii. MicroLog 2 ma możliwośd odczytu wszystkich konfiguracji Biolog MicroPlate dla bakterii tlenowych. System umożliwia zapisywanie danych i współpracę z oprogramowaniem Retrospect 2.0 MicroLog 2 System bez komputera szt 42402

4 MicroLog 2 System z komputerem szt GN Database (GEN II dla Gram (-) bakterii tlenowych) GP Database (GEN II dla Gram (+) bakterii tlenowych) Software & Identification Databases dla Microstation, ML1 & ML2 Database software zawiera odpowiednie standardy turbidymetryczne 22601D 22604D Ovation Electronic Pipettor (8-kanałowy) 3711 Akumulator Li Ion, Ovation 3718 Zasilacz 3719 Akumulator Ni-Cad. 1,2 V, 900 mah, 3569 GEN III Consumables Starter Kit Zestaw zawiera wszystkie materiały niezbędne nowemu użytkownikowi OmniLog System do identyfikacji bakterii: STARTER KIT CONSUMABLES dla GEN III (Ovation Tips) 20 GEN III Microplates, 1 box of piette tips (Ovation), 1 case of Reservoirs - sterile, 500 g of BUG Agar,1 box of Inoculatorz (100 sztuk indywidualnie pakowanych ), 20 probówek IF-A i 20 probówek IF-B zestaw O STARTER KIT CONSUMABLES dla GEN III (Matrix Tips) 20 GEN III Microplates, 1 box of piette tips (Matrix), 1 case of Reservoirs - sterile, 500 g of BUG Agar,1 box of Inoculatorz (100 sztuk zestaw M indywidualnie pakowanych ), 20 probówek IF-A i 20 probówek IF-B GEN II & GEN III Identification MicroPlates GEN III Microplate (dla obu grup bakterii Gram (-) i Gram (+)) 10 płytek 1030 GN2 MicroPlate (dla Gram (-) bakterii tlenowych) 10 płytek 1011 GP2 Microplate (dla Gram (+) bakterii tlenowych) 10 płytek 1014 AN Microplate (dla bakterii beztlenowych) 10 płytek 1007 YT Microplate (dla drożdży) 10 płytek 1005 FF MicroPlate (dla grzybówi) 10 płytek 1006 Special Purpose MicroPlates MT2 Micro Plate (f. metabolic studies) 10 płytek 1013 ECO Micro Plate - 3 zestawy 10 płytek 1506 SF-N2 Microplate (for metabolic characterization of spore- forming and conidia - forming gramnegative microbes) 10 płytek 1511 SF-P2 (for metabolic characterization of spore - forming and conidia-forming gram-positive microbes) 10 płytek 1514 BIOLOG Dehydrated Media BUG (Biolog Universal Growth) Agar 500 g (na BUY (Biolog Universal Yeast) Agar 500 g (na BUA (Biolog Universal Anaerobe) Agar 500 g (na Rainbow Agar Dehydrated Media 30 g (na g (na ,5 g (na Inoculating Fluids, Reagents and Biologicals GEN III IF-A (do użycia z GEN III bakterie tlenowe) 20 probówek GEN III IF-B (do użycia z GEN III bakterie tlenowe) 20 probówek GEN III IF-C (do użycia z GEN III bakterie tlenowe) 20 probówek GN/GP-IF (Gram-negative/Gram-positive inoculating fluid) sterile (19 ml-20 x 150 mm tube) 20 probówek AN-IF (Anaerobe inoculating fluid) sterile (14 ml -20 x 125 mm tube) 10 probówek FF-IF (Filamentous Fungi inoculating fluid) sterile (16 ml -20 x 125 mm tube) 20 probówek Sodium Thioglycolate 50 szt Sodium Salicylate 100mM 50 ml Calibration Solution 60 ml 90813

5 OmniLog PM Systems Wszystkie systemy OmniLog PM zawierają OmniLOg reader/incubator, komputer, OmniLog PM Software, instrukcja użytkowania, pipetor, turbidymetr OmniLog PM System OmniLog Pm Akcesoria Validation Manual and Supplie (Ovation Tips) O Validation Manual and Supplie (Matrix Tips) M OmniLog Trays - Type "A" Microplate footprint % T Turbidity Standard % T Turbidity Standard 3441 PM Gas Bags dla paneli wymagających specjalnej atmosfery beztlenowej 100 torebek 3032 PHENOTYPE MICROARRAY PLATES PM1 96 Carbon utilization assays 1 płytka PM2 96 Carbon utilization assays 1 płytka PM3 96 Nitrogen utilization assays 1 płytka PM4 96 Phosphorus - Sulfur utilization assays 1 płytka PM5 96 Biosynthetic pathway/nutrient stimulation 1 płytka PM6 96 Nitrogen utilization assays 1 płytka PM7 96 Nitrogen utilization assays 1 płytka PM8 96 Nitrogen utilization assays 1 płytka PM9 96 Osmotic/Ionic response assays 1 płytka PM10 96 ph response assays 1 płytka PM11 96 Bacterial chemical sensitivity assays 1 płytka PM12 96 Bacterial chemical sensitivity assays 1 płytka PM13 96 Bacterial chemical sensitivity assays 1 płytka PM14 96 Bacterial chemical sensitivity assays 1 płytka PM15 96 Bacterial chemical sensitivity assays 1 płytka PM16 96 Bacterial chemical sensitivity assays 1 płytka PM17 96 Bacterial chemical sensitivity assays 1 płytka PM18 96 Bacterial chemical sensitivity assays 1 płytka PM19 96 Bacterial chemical sensitivity assays 1 płytka PM20 96 Bacterial chemical sensitivity assays 1 płytka Płytki do badao komórek ssaków Nazwa Wielkośd opak. Nr kat. PM-M1 Metabolite utilization assays płytka 96 - dołkowa PM-M2 Metabolite utilization assays płytka 96 - dołkowa PM-M3 Metabolite utilization assays płytka 96 - dołkowa PM-M4 Metabolite utilization assays płytka 96 - dołkowa PM-M5 Cation / Anion sensitivity assays płytka 96 - dołkowa PM-M6 Hormone/Metabolic effector assays płytka 96 - dołkowa PM-M7 Hormone/Metabolic effector assays płytka 96 - dołkowa PM-M8 Hormone/Metabolic effector assays płytka 96 - dołkowa PM-M11 Chemosensitivity assays płytka 96 - dołkowa PM-M12 Chemosensitivity assays płytka 96 - dołkowa PM-M13 Chemosensitivity assays płytka 96 - dołkowa PM-M14 Chemosensitivity assays płytka 96 - dołkowa PM-M Tox 1 płytka 96 - dołkowa Biolog Redox Dye Mix MA (6X), 20 ml* butelka Biolog Redox Dye Mix MB (6X), 20 ml* butelka 74352