Czy poprawki ZPV do stałych ekranowania zależą od konformacji? Przypadek dimetoksymetanu



Podobne dokumenty
Obliczanie Dokładnych Parametrów NMR Charakterystyka struktury i parametrów spektroskopowych wybranych układów molekularnych

Aromatic or Not? An Insight from the Calculated Magnetic Indexes

Modelowanie molekularne

Molecular Modeling of Small and Medium Size Molecular Systems. Structure and Spectroscopy

Małe, średnie i... nano. Modelowanie molekularne w Opolu (i nie tylko) Teobald Kupka, Małgorzata A. Broda

Modelowanie molekularne

Wpływ heterocyklicznego ugrupowania na natywną konformację naturalnych peptydów

Wykład 5: Cząsteczki dwuatomowe

3. Cząsteczki i wiązania

3. Cząsteczki i wiązania

Struktura elektronowa σ-kompleksu benzenu z centrum aktywnym Fe IV O cytochromu P450

Teoria VSEPR. Jak przewidywac strukturę cząsteczki?

RJC. Wiązania Chemiczne & Slides 1 to 39

Wstęp do Optyki i Fizyki Materii Skondensowanej

Geometria cząsteczek wieloatomowych. Hybrydyzacja orbitali atomowych.

Różne typy wiązań mają ta sama przyczynę: energia powstającej stabilnej cząsteczki jest mniejsza niż sumaryczna energia tworzących ją, oddalonych

Modelowanie molekularne

Załącznik Nr 5 do Zarz. Nr 33/11/12

Wykład przygotowany w oparciu o podręczniki:

Podstawy chemii obliczeniowej

Inne koncepcje wiązań chemicznych. 1. Jak przewidywac strukturę cząsteczki? 2. Co to jest wiązanie? 3. Jakie są rodzaje wiązań?

Deskryptory molekularne

1 i 2. Struktura elektronowa atomów, tworzenie wiązań chemicznych

była obserwowana poniżej temperatury 200. Dla wyższych temperatur widać redukcję drugiego momentu M^ w zakresie (1.5-2) [G*].

Orbitale typu σ i typu π

RJC # Defin i i n c i ja

Atomy wieloelektronowe

Wykład z Chemii Ogólnej

Plan prezentacji. Wprowadzenie Metody Wyniki Wnioski Podziękowania. Yaghi et al. Nature 2003, 423, 705 2

UKŁAD OKRESOWY PIERWIASTKÓW

Impulsy selektywne selektywne wzbudzenie

Ćwiczenie 4: Modelowanie reakcji chemicznych. Stan przejściowy.

CHEMIA 1. INSTYTUT MEDICUS Kurs przygotowawczy na studia medyczne kierunek lekarski, stomatologia, farmacja, analityka medyczna ATOM.

Chemia Grudzień Styczeń

CHEMIA. Wymagania szczegółowe. Wymagania ogólne

Anna Grych Test z budowy atomu i wiązań chemicznych

TEORIA ORBITALI MOLEKULARNYCH (MO) dr Henryk Myszka - Uniwersytet Gdański - Wydział Chemii

First Prev Next Last Go Back Full Screen Close Quit. Katedra Makroekonomii i Teorii Handlu Zagranicznego WNE UW mgr Leszek Wincenciak.

ekranowanie lokx loky lokz

Ligand to cząsteczka albo jon, który związany jest z jonem albo atomem centralnym.

Zastosowania algorytmów genetycznych w badaniach struktury związków biologicznie czynnych

Wykład 16: Atomy wieloelektronowe

Teoretyczne badania reakcji odwodornienia borazanu katalizowanych przez kompleksy oparte na palladzie

Krystalografia. Analiza wyników rentgenowskiej analizy strukturalnej i sposób ich prezentacji

INADEQUATE-ID I DYNAMICZNY NMR MEZOJONOWYCH. 3-FENYLO-l-TIO-2,3,4-TRIAZOLO-5-METYUDÓW. Wojciech Bocian, Lech Stefaniak

Elektronowa struktura atomu

Wydział Chemiczny Wybrzeże Wyspiańskiego 27, Wrocław. Prof. dr hab. Ilona Turowska-Tyrk Wrocław, r.

Podstawy teoretyczne i moŝliwości aplikacyjne kwantowej teorii atomów w cząsteczkach - QTAIM

Ćwiczenie 3. Spektroskopia elektronowa. Etylen. Trypletowe przejścia elektronowe *

Praca licencjacka. Imię i nazwisko Studenta, czcionka 12 pt., pogrubiona Numer albumu

Cz. I Materiał powtórzeniowy do sprawdzianu dla klas I LO - Wiązania chemiczne + przykładowe zadania i proponowane rozwiązania

Cząsteczki. 1.Dlaczego atomy łącz. 2.Jak atomy łącz. 3.Co to jest wiązanie chemiczne? Jakie sąs. typy wiąza

Model wiązania kowalencyjnego cząsteczka H 2

Energetyka w Środowisku Naturalnym

Magnetyczny rezonans jądrowy

Wykład 5 Widmo rotacyjne dwuatomowego rotatora sztywnego

ZAAWANSOWANE METODY USTALANIA BUDOWY ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH. Witold Danikiewicz. Instytut Chemii Organicznej PAN ul. Kasprzaka 44/52, Warszawa

Kombinatoryczna analiza widm 2D-NOESY w spektroskopii Magnetycznego Rezonansu Jądrowego cząsteczek RNA. Marta Szachniuk

VI Podkarpacki Konkurs Chemiczny 2013/2014

Zastosowanie spektroskopii NMR do określania struktury związków organicznych
























Budowa atomu Poziom: rozszerzony Zadanie 1. (2 pkt.)

Ćwiczenie nr 2 Komputerowe modelowanie cząsteczek związków chemicznych przy uŝyciu programu HyperChem Lite

Cz. I Materiał powtórzeniowy do sprawdzianu dla klas II LO - Wiązania chemiczne + przykładowe zadania i proponowane rozwiązania

Układ okresowy pierwiastków

Oznaczenia konfiguracji absolutnej związków konformacyjnie labilnych

Wykład 3. Witold Bekas SGGW.

WOJEWÓDZKI KONKURS PRZEDMIOTOWY Z CHEMII DLA UCZNIÓW GIMNAZJÓW - rok szkolny 2011/2012 eliminacje rejonowe

Wojewódzki Konkurs Przedmiotowy z Chemii dla uczniów gimnazjów województwa śląskiego w roku szkolnym 2014/2015

Elektroujemność w konwencji Sandersona. mgr Magdalena Chrzan

Budowa atomu. Izotopy

3. Jaka jest masa atomowa pierwiastka E w następujących związkach? Który to pierwiastek? EO o masie cząsteczkowej 28 [u]

Nazwy pierwiastków: ...

Elementy chemii obliczeniowej i bioinformatyki Zagadnienia na egzamin

SPRAWOZDANIE z grantu obliczeniowego za rok 2011

Spektroskopia Analiza rotacyjna widma cząsteczki N 2. Cel ćwiczenia: Wyznaczenie stałych rotacyjnych i odległości między atomami w cząsteczce N 2

WOJEWÓDZKI KONKURS PRZEDMIOTOWY Z CHEMII

Opracowała: mgr inż. Ewelina Nowak

Transkrypt:

Czy poprawki ZPV do stałych ekranowania zależą od konformacji? Przypadek dimetoksymetanu Wojciech Migda Wydział Chemii, Uniwersytet Jagielloński, Kraków Bronowice, 1-2 XII 2004

Zero-Point Vibrational Corrections First Prev Next Last Go Back Full Screen Close Quit

Zero-Point Vibrational Corrections First Prev Next Last Go Back Full Screen Close Quit

Zero-Point Vibrational Corrections First Prev Next Last Go Back Full Screen Close Quit

Åstrand, P.-O.; Ruud, K.; Taylor, P. R. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2655 r eff,j = r e,j 1 4ω 2 e,j N m=1 V (3) e,jmm ω e,m Ruud, K.; Åstrand, P.-O.; Taylor, P. R. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2669 σ (0) 2 = 1 4 N i=1 σ (2) eff,ii ω eff,i σ ZPV = σ(r eff ) σ(r e ) + σ (0) 2

Åstrand, P.-O.; Ruud, K.; Taylor, P. R. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2655 r eff,j = r e,j 1 4ω 2 e,j N m=1 V (3) e,jmm ω e,m Ruud, K.; Åstrand, P.-O.; Taylor, P. R. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2669 σ (0) 2 = 1 4 N i=1 σ (2) eff,ii ω eff,i σ ZPV = σ(r eff ) σ(r e ) + σ (0) 2

Åstrand, P.-O.; Ruud, K.; Taylor, P. R. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2655 r eff,j = r e,j 1 4ω 2 e,j N m=1 V (3) e,jmm ω e,m Ruud, K.; Åstrand, P.-O.; Taylor, P. R. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2669 σ (0) 2 = 1 4 N i=1 σ (2) eff,ii ω eff,i σ ZPV = σ(r eff ) σ(r e ) + σ (0) 2

Ruud, K.; Åstrand, P.-O.; Taylor, P. R. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2669 poprawki ZPV ab initio MC-SCF, ppm σ e σ ZPV σ expt metan ( 13 C) 201,69-3,20 198,49 198,7 fluorowodór ( 19 F) 423,17-8,75 414,42 410 (±6)

Ruud, K.; Åstrand, P.-O.; Taylor, P. R. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2669 poprawki ZPV ab initio MC-SCF, ppm σ e σ ZPV σ expt metan ( 13 C) 201,69-3,20 198,49 198,7 fluorowodór ( 19 F) 423,17-8,75 414,42 410 (±6)

Ruud, K.; Åstrand, P.-O.; Taylor, P. R. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4826 Zero-Point Vibrational Effects on Proton Shieldings: Functional-Group Contributions from ab Initio Calculations Åstrand, P.-O.; Ruud, K. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 5, 5015 Zero-point vibrational contributions to fluorine shieldings in organic molecules Auer, A. A.; Gauss, J.; Stanton, J. F. J. Chem. Phys. 2003, 118, 10407 Quantitative prediction of gas-phase 13 C nuclear magnetic shielding constants

Ruud, K.; Åstrand, P.-O.; Taylor, P. R. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4826 Functional Zero-Point Vibrational Contributions to the Hydrogen Shielding Constants, ppm metan -0,59 CR 2 H -0,70 ± 0,11 =CRH -0,46 ± 0,13 CH -0,76 ± 0,01 H COR -0,55 ± 0,06 RO H 0,48 ± 0,13 RN H 2-0,18 ± 0,03 RCOO H -0,49 ± 0,06 Ar H -0,39 ± 0,06

CEL sprawdzenie, czy poprawki ZPV do stałych ekranowania zależą nie tylko od konstytucji cząsteczki, ale też od przyjmowanej przez nią konformacji jeżeli tak, to... czy obserwowana zależność konformacyjna jest systematyczna czy można ją powiązać w występowaniem efektu stereoelektronowego (anomerycznego)

Metody algorytmy obliczania σ ZPV program DALTON geometrie cząsteczek, gradienty i hesjany cząsteczkowe (DFT Becke3LYP/TZVP++) program Gaussian 03 stałe ekranowania jąder (GIAO-DFT mpw1pw91/tzvp++) program Gaussian 03

Konformacje dimetoksymetanu 60 / 60 60 / 180 180 / 180 gauche gauche (gg) gauche anti (ga) anti anti (aa)

Efekt stereoelektronowy (anomeryczny) korzystne nakładanie orbitala niewiążącej pary elektronowej n LP z antywiążącym orbitalem σ sąsiedniego wiązania C-O powoduje obniżenie energii i stabilizację geometrii

Konformacje dimetoksymetanu 60 / 60 60 / 180 180 / 180 gauche gauche (gg) gauche anti (ga) anti anti (aa)

Poprawki ZPV dla jąder 13 C w grupie CH 3 O, ppm dimetoksymetan

Poprawki ZPV dla jąder 1 H w grupie CH 3 O, ppm dimetoksymetan

czy obserwowana zależność wynika tylko ze zmiany kątów torsyjnych, czyli jest czysto geometryczna czy też jest wynikiem obecności efektu stereoelektronowego (anomerycznego) w konformacjach gauche gauche i gauche anti dimetoksymetanu eter metylowo-propylowy posiada konformacje analogiczne jak dimetoksymetan jest pozbawiony możliwości wystąpienia efektu stereoelektronowego

Konformacje eteru metylowo-propylowego 60 / 60 60 / 180 gauche gauche (gg) gauche anti (ga) 180 / 60 180 / 180 anti gauche (ag) anti anti (aa)

Poprawki ZPV dla jąder 13 C w grupie CH 3 O, ppm dimetoksymetan vs. eter metylowo-propylowy

Poprawki ZPV dla jąder 1 H w grupie CH 3 O, ppm dimetoksymetan vs. eter metylowo-propylowy

Konkluzje zarówno w cząsteczce dimetoksymetanu (DMM), jak i eteru metylowo-propylowego (MPE) poprawki ZPV dla jąder 1 H i 13 C w grupie CH 3 O zmieniają się wraz z konformacją obserwowane zmiany można skorelować z ułożeniem grupy CH 3 O (gauche albo anti) dla MPE pochodzenie zmian jest czysto geometryczne, zaś w przypadku DMM dodatkowo na wielkość zmian wpływa obecność efektu stereoelektronowego reguła korelująca strukturę cząsteczki z poprawkami ZPV dla protonów (Ruud et. al. JACS 2001, 123, 4826) nie jest spełniona dla atomów w grupie metylowej o orientacji gauche

Makulski, W.; Jackowski, K. J. Mol. Struct. 2003, 651-653, 265 stała ekranowania 17 O w dimetoksymetanie, ppm σ e (MP2/TZVP++//B3LYP/TZVP++) 300,72 σ ZPV (mpw1pw91/tzvp++//b3lyp/tzvp++) -13,50 σ 287,22 eksperyment (gaz, 333 K) 282,3 First Prev Next Last Go Back Full Screen Close Quit

Podziękowania Pani dr hab. Barbara Rys za pomocne dyskusje i sugestie ACK Cyfronet grant obliczeniowy KBN/SGI2800/UJ/002/2003 Free Software Foundation darmowe oprogramowanie (Linux, L A T E X 2ε, OpenOffice, GIMP)