PRZEWODNIK I PROGRM NUCZNI PRZEDMIOTU FKULTTYWNEGO N WYDZILE LEKRSKIM I ROK KDEMICKI 2017/2018 PRZEWODNIK DYDKTYCZNY dla STUDENTÓW II ROKU STUDIÓW 1. NZW PRZEDMIOTU : BIOSTTYSTYK Z ELEMENTMI INFORMTYKI cz. II 2. NZW JEDNOSTKI (jednostek ) realizującej przedmiot: Katedra i Zakład Informatyki i Statystyki 3. dres jednostki odpowiedzialnej za dydaktykę: dres: ul. Dąbrowskiego 79, 60-529 Poznań Tel. 61 854 68 08 /Fax: 61 854 69 43 Strona WWW: www.kzis.ump.edu.pl E-mail: magda@ump.edu.pl 4. Kierownik jednostki: Prof. dr hab. Jerzy. Moczko 5. Osoba zaliczająca przedmiot w E-indeksie z dostępem do platformy WISUS dr Justyna Marcinkowska 6. Osoba odpowiedzialna za dydaktykę na Wydziale Lekarskim I z dostępem do platformy WISUS ( listy studentów) ( koordynator przedmiotu) : Nazwisko imię: Prof. dr hab. Jerzy. Moczko Tel. kontaktowy: 61 854 68 10 Możliwość kontaktu - konsultacje (dni, godz., miejsce): Katedra Informatyki i Statystyki, dni dyżurów dostępne na stronie Katedry http://www.kzis.ump.edu.pl E-mail: jmoczko@ump.edu.pl Osoba zastępująca: dr Michał Michalak Kontakt: 61 854 69 04, michal@ump.edu.pl 7. Osoba odpowiedzialna za rezerwację sal: Nazwisko imię: dr Majewski rkadiusz
Tel. kontaktowy: 61 854 69 04 E-mail: arkadiusz.majewski@ump.edu.pl 8. Miejsce przedmiotu w programie studiów: Rok: II Semestr: 3 9. Liczba godzin ogółem : 20 liczba pkt. ECTS: 1 Jednostki uczestniczące w nauczaniu przedmiotu Semestr zimowy/letni liczba godzin W Ć kategoria S Katedra i Zakład Informatyki i Statystyki 5 11 4 Razem: 5 11 4 10.Tematyka poszczególnych wykładów, ćwiczeń, seminariów Wykłady - Semestr zimowy/letni Wykład 1 Wykład 2 Wykład 3 Tematyka wykładów Zasady prowadzenia badań naukowych, badania obserwacyjne i doświadczalne, badania prospektywne i retrospektywne badania randomizowane i kliniczno-kontrolne. Wprowadzenie do testowania hipotez statystycznych, pojęcie błędu I i II rodzaju, p-value, hipotezy jedno i dwustronne, model badania. Dobór testu statystycznego dla porównania dwu i więcej grup w modelu zmiennych powiązanych i niepowiązanych na skali interwałowej, porządkowej i nominalnej. Testy diagnostyczne czułość i swoistość, krzywe ROC, RR- ryzyko względne, OR iloraz szans. Korelacja i regresja, model liniowy. naliza przeżycia konstrukcja krzywych przeżycia Kaplana-Meiera oraz metody porównywania krzywych. Wstęp do metaanalizy Imię i nazwisko osoby prowadzącej zajęcia Prof. dr hab. J.. Moczko Prof. dr hab. J.. Moczko Prof. dr hab. J.. Moczko
Ćwiczenia - Semestr zimowy Tematyka ćwiczeń Osoba odpowiedzialna SL Ćwiczenie 1. Ćwiczenie 2. Ćwiczenie 3. Testy dla porównania dwu grup w modelu zmiennych powiązanych i niepowiązanych, skala interwałowa i porządkowa (test t-studenta w modelu zmiennych powiązanych, test t-studenta w modelu zmiennych niepowiązanych, test Welcha, test Wilcoxona, test Manna-Whitney a) ćwiczenia praktyczne Testy statystyczne dla 2 grup skala nominalna (test Chi 2, test dokładny Fishera, test Mc Nemary) ćwiczenia praktyczne. Testy diagnostyczne czułość i swoistość, RR- ryzyko względne, OR iloraz szans. Testy diagnostyczne krzywe ROC. Porównania wielu grup (NOV w modelu zmiennych powiązanych i niepowiązanych, test Friedmana, test Kruskala-Wallisa) ćwiczenia praktyczne. Korelacja i regresja, model liniowy współczynnik korelacji Pearsona, nieparametryczny współczynnik korelacji Spearmana) ćwiczenia praktyczne. naliza przeżycia konstrukcja krzywych przeżycia Kaplana-Meiera oraz metody porównywania krzywych ćwiczenia praktyczne. Praktyczne kolokwium zaliczeniowe przy komputerze Prof. J. Moczko dr L. Kramer dr B. Kołodziejczak dr inż.. Majewski dr J. Marcinkowska dr M. Michalak dr I. Miechowicz dr M. Roszak dr inż.. Sowińska dr B. Więckowska Zajęcia odbywają się w salach dydaktycznych Katedry - ul. Dąbrowskiego 79, II piętro, sale nr 201, 202,,, 218 Seminaria - Semestr zimowy/letni Tematyka seminariów Imię i nazwisko osoby prowadzącej zajęcia SL Seminarium 1. Rozwiązywanie problemów medycznych z wykorzystaniem metod statystycznych Prof. J. Moczko dr L. Kramer dr B. Kołodziejczak dr inż.. Majewski dr J. Marcinkowska dr M. Michalak dr I. Miechowicz dr M. Roszak dr inż.. Sowińska dr B. Więckowska Zajęcia odbywają się w salach dydaktycznych Katedry - ul. Dąbrowskiego 79, II piętro, sale nr 201, 202,,, 218
REGULMIN ZJĘĆ: 1. Dla studentów II roku Wydziału Lekarskiego I zajęcia odbywają się w semestrze zimowym i obejmują: a) 5 godzin wykładów b) 11 godzin ćwiczeń w laboratorium komputerowym, c) 4 godziny seminarium w laboratorium komputerowym. 2. Obecność studentów na ćwiczeniach jest obowiązkowa i kontrolowana. 3. Każda nieobecność na ćwiczeniach musi być usprawiedliwiona i odrobiona w terminie ustalonym indywidualnie z prowadzącym zajęcia, lecz nie później niż przed kolokwium zaliczeniowym. Nie odrobienie zajęć powoduje niedopuszczenie do kolokwium, co jest jednoznaczne z otrzymaniem oceny niedostatecznej w pierwszym terminie. Zgodnie z regulaminem studiów (rozdział III, 11) w wyjątkowych sytuacjach dopuszcza się usprawiedliwioną nieobecność na zajęciach. 4. Warunkiem uzyskania zaliczenia z przedmiotu: BIOSTTYSTYK Z ELEMENTMI INFORMTYKI cz.ii jest: a. aktywność oraz obecność na wszystkich ćwiczeniach, b. zaliczenie kolokwium obejmującego całość materiału przerobionego na ćwiczeniach i seminariach (próg 66%). Zaliczenie ma formę praktyczną i realizowane jest przy pomocy komputera z oprogramowaniem stosowanym w trakcie zajęć. Nieusprawiedliwiona nieobecność na kolokwium jest równoznaczna z otrzymaniem oceny niedostatecznej. W przypadku otrzymania oceny niedostatecznej istnieje możliwość dwukrotnego jej poprawienia. 5. W wyjątkowych przypadkach kierownik Katedry może wyrazić zgodę na przeprowadzenie jednego dodatkowego kolokwium z całości lub z wybranej części materiału. 6. Spóźnienia na ćwiczeniach przekraczające 15 minut traktowane są jako nieobecność. 7. Z racji charakteru przerabianego materiału studentów obowiązuje bieżąca znajomość omawianych treści na kolejnych zajęciach. PROGRM ZJĘĆ: 1. Zasady prowadzenia badań naukowych - typy badań. 2. Wprowadzenie do testowania hipotez statystycznych. 3. Dobór testu statystycznego dla porównania dwu grup. 4. Dobór testu statystycznego dla 2 grup skala nominalna. 5. Testy diagnostyczne czułość i swoistość, krzywe ROC, RR- ryzyko względne, OR iloraz szans. 6. Porównania wielu grup. 7. Korelacja i regresja. 8. naliza przeżycia konstrukcja krzywych przeżycia Kaplana-Meiera oraz metody porównywania krzywych. 9. Wstęp do metaanalizy. 10. Praktyczne kolokwium zaliczeniowe przy komputerze z całości materiału.
PROGRM NUCZNI: Wymagania wstępne: wiedza i umiejętności z przedmiotu BIOSTTYSTYK Z ELEMENTMI INFORMTYKI cz.i. Przygotowanie do zajęć: bieżąca znajomość zagadnień poznanych na wykładach i ćwiczeniach. Wymagania końcowe: student potrafi zrealizować wszystkie procedury prezentowane na ćwiczeniach i seminarium. 11. Kryteria zaliczenia przedmiotu: zaliczenie, egzamin teoretyczny i praktyczny Zaliczenie kryterium zaliczenia Obecność i aktywność na wszystkich ćwiczeniach i seminarium. Zaliczenie kolokwium praktycznego przy komputerze. 12. Literatura: Zalecana literatura: 1. Petrie., Sabin C., Statystyka medyczna w zarysie ; Wydawnictwo Lekarskie PZWL Warszawa 2006. 2. Stanisz., Przystępny kurs statystyki z zastosowaniem STTISTIC PL na przykładach z medycyny, t.i, StatSoft Kraków 2006. 3. Moczko J.., Bręborowicz G.H., Nie samą biostatystyką...;own Poznań 2010. 4. Dokumentacja elektroniczna programu STTISTIC 13. Studenckie koło naukowe brak Opiekun koła Tematyka Miejsce spotkań 14. SYLBUS (proszę wypełnić wszystkie pola w tabeli) WYDZIŁ LEKRSKI I Nazwa kierunku Nazwa przedmiotu Lekarski BIOSTTYSTYK Z ELEMENTMI INFORMTYKI cz. II Poziom i tryb studiów Punkty ECTS 1 jednolite studia magisterskie stacjonarne Jednostka realizująca, wydział Katedra Informatyki i Statystyki
Koordynator przedmiotu Rodzaj przedmiotu Obszar nauczania Cel kształcenia Prof. dr hab. J.. Moczko obowiązkowy Osoba zaliczająca Semestr 3 NUKOWE PODSTWY MEDYCYNY dr Justyna Marcinkowska Rodzaj zajęć i liczba godzin Wykłady 5 Seminaria 4 Celem kształcenia jest zapoznanie studentów z zagadnieniami związanych ze statystyczną weryfikacją eksperymentalnych danych medycznych. Ćwiczenia 11 Wykłady 1.Zasady prowadzenia badań naukowych - typy badań 2. Wprowadzenie do testowania hipotez statystycznych 3. Dobór testu statystycznego dla porównania dwu i więcej grup 4. Dobór testu statystycznego dla 2 grup skala nominalna 5. Testy diagnostyczne pojęcia czułość i swoistość, krzywe ROC, RR- ryzyko względne, OR iloraz szans 6. Korelacja i regresja 7. naliza przeżycia 8. Wstęp do metaanalizy Seminaria 1. Rozwiązywanie problemów medycznych z wykorzystaniem metod statystycznych Treści programowe Formy i metody dydaktyczne Forma i warunki zaliczenia Literatura podstawowa Literatura Ćwiczenia 1. Test t-studenta w modelu zmiennych powiązanych, test t-studenta w modelu zmiennych niepowiązanych, test Welcha, test Wilcoxona, test Manna-Whitney a) ćwiczenia praktyczne z wykorzystaniem programu STTISTIC. 2. Test Chi 2, test dokładny Fishera, test Mc Nemary). Testy diagnostyczne: czułość i swoistość, krzywe ROC, RR- ryzyko względne, OR iloraz szans. Ćwiczenia praktyczne z wykorzystaniem programu STTISTIC. 3. NOV w modelu zmiennych powiązanych i niepowiązanych, test Friedmana, test Kruskala- Wallisa, tysty post-hoc ćwiczenia praktyczne z wykorzystaniem programu STTISTIC. 4. Korelacja i regresja, model liniowy: wsp. korelacji Pearsona, nieparametryczny wsp. korelacji Spearmana ćwiczenia praktyczne z wykorzystaniem programu STTISTIC. 5. naliza przeżycia konstrukcja krzywych przeżycia Kaplana-Meiera oraz metody porównywania krzywych ćwiczenia praktyczne z wykorzystaniem programu STTISTIC. 6. Kolokwium zaliczeniowe. Inne Metody: podające, problemowe, programowane, praktyczne Forma: wykład, analiza przypadków, zajęcia z użyciem komputera, ćwiczenia laboratoryjne, pokaz Warunki: Zaliczenie praktyczne przy komputerze Obecność na wszystkich zajęciach. Forma: Praktyczna z wykorzystaniem komputera i pakietu STTISTIC PL 1. Petrie., Sabin C., Statystyka medyczna w zarysie ; Wydawnictwo Lekarskie PZWL Warszawa 2006. 2. Stanisz., Przystępny kurs statystyki z zastosowaniem STTISTIC PL na przykładach z medycyny, t.i, StatSoft Kraków 2006. 3. Moczko J.., Bręborowicz G.H., Nie samą biostatystyką...;own Poznań 2010. 1. Dokumentacja elektroniczna programu STTISTIC
uzupełniająca Numer efektu kształcenia P.W1 P.W2 P.U1 P.U2 P.U3 Efekty kształcenia zna podstawowe metody analizy statystycznej wykorzystywane w badaniach populacyjnych i diagnostycznych; zna zasady prowadzenia badań naukowych, obserwacyjnych i doświadczalnych oraz badań in vitro służących rozwojowi medycyny; dobiera odpowiedni test statystyczny, przeprowadza podstawowe analizy statystyczne oraz posługuje się odpowiednimi metodami przedstawiania wyników; interpretuje wyniki metaanalizy, a także przeprowadza analizę prawdopodobieństwa przeżycia; wyjaśnia różnice między badaniami prospektywnymi i retrospektywnymi, randomizowanymi i kliniczno-kontrolnymi, opisami przypadków i badaniami eksperymentalnymi oraz szereguje je według wiarygodności i jakości dowodów naukowych; planuje i wykonuje proste badanie naukowe oraz interpretuje jego wyniki i wyciąga wnioski.. Odniesienie do kierunkowych efektów kształcenia B.W32. B.W34. B.U12. B.U13. B.U14. Nakład pracy studenta Liczba godzin Godziny kontaktowe z nauczycielem akademickim udział w wykładach 5 udział w seminariach 4 udział w ćwiczeniach 11 udział w konsultacjach związanych z zajęciami 2 Samodzielna praca studenta przygotowanie do ćwiczeń 3 Łączny nakład pracy studenta 25 Data opracowania sylabusa: 25.07.2017 Osoba przygotowująca sylabus: dr Barbara Kołodziejczak 15. Szczegółowa organizacja zajęć: Zajęcia na II roku odbywają się zgodnie z planem zajęć z Dziekanatu. Ramy czasowe zajęć zblokowanych: 8.00 11.00. Proszę podać dokładny podział godzin zajęć dydaktycznych zgodny z Ramowym Programem Studiów na rok akademicki 2017/18. WYKŁDY Dzień tygodnia Daty w których odbywają się wykłady Godzina Sala wtorek 26.09.2017 11:30-13:00 Sala Czarna ul. Święcickiego 6 wtorek 10.10.2017 11:30-13:00 Sala Czarna ul. Święcickiego 6
wtorek 17.10.2017 11:30-12:15 Sala Czarna ul. Święcickiego 6 SEMINRI Grupa Dni tygodnia Daty Godziny w których odbywają się zajęcia seminaryjne Nr Sali Jednostka przeprowadzająca zajęcia 1 2 3 4 5 6 9.10.2017 8:00-11:00 i GRUP 1 17.10.2017 8:00-11:00 i GRUP 2 GRUP 3 11.10.2017 8:00-11:00 i GRUP 4 19.10.2017 8:00-11:00 i 20.11.2017 8:00-11:00 i GRUP 5 21.11.2017 8:00-11:00 i GRUP 6 GRUP 7 22.11.2017 8:00-11:00 i GRUP 8 23.11.2017 8:00-11:00 i 18.12.2017 8:00-11:00 i GRUP 9 19.12.2017 8:00-11:00 i GRUP 10
GRUP 11 3.01.2018 8:00-11:00 i GRUP 12 4.01.2018 8:00-11:00 i ĆWICZENI Grupa Grupa 1 Grupa 2 Grupa 3 Grupa 4 Grupa 5 Grupa 6 Grupa 7 Grupa 8 Grupa 9 Podgrupy Dni tygodnia Daty Godziny w których odbywają się ćwiczenia 8:00-11:00 Nazwa, nr sali 25.09, 2.10, B 16.10 Jednostka przeprowadzająca zajęcia 26.09, 10.10, 8:00-11:00 B 24.10 27.09, 4.10, 8:00-11:00 B 18.10 5.10, 12.10, 8:00-11:00 B 26.10 6.11,13.11, 8:00-11:00 B 27.11 7.11, 14.11, 8:00-11:00 B 28.11 8.11, 15.11, 8:00-11:00 B 29.11 9.11, 16.11, 8:00-11:00 B 30.11 4.12, 11.12, 8:00-11:00 B 8.01
Grupa 10 Grupa 11 Grupa 12 5.12, 12.12, 8:00-11:00 B 23.01 6.12, 13.12, 8:00-11:00 B 10.01 7.12, 14.12, 8:00-11:00 B 1.02 16. Podpis osoby odpowiedzialnej za nauczanie przedmiotu lub koordynatora 17. Podpisy osób współodpowiedzialnych za nauczanie przedmiotu (w przypadku przedmiotów koordynowanych)