ANNALES UMCS. Identyfikacja obecności retrotranspozonu WIS 2-1A w genomie wybranych odmian pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.
|
|
- Maria Antczak
- 6 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 ANNALES UMCS VOL. LXXII (2) SECTIO E AGRICULTURA 2017 CC BY NC ND DOI: /as Katedra Biologii Komórki, Centrum Biologii Molekularnej i Biotechnologii, Uniwersytet Szczeciński, ul. Wąska 13, Szczecin, ewa.filip@usz.edu.pl EWA FILIP, IZABELA SZUĆKO Identyfikacja obecności retrotranspozonu WIS 2-1A w genomie wybranych odmian pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.) Identification of the WIS 2-1A retrotransposon presence in the genome of common wheat cultivars (Triticum aestivum L.) Streszczenie. WIS 2-1A były pierwszymi retrotranspozonami zidentyfikowanymi w sekwencjach kodujących wysokocząsteczkowe podjednostki glutenin (HMW-GS). Elementy WIS 2-1A należą do rodziny Ty-1 copia. Występują w genomie w różnej liczbie kopii (od kilku do kilku tysięcy kopii na genom). U pszenicy zwyczajnej oszacowano, że występują z częstotliwością 200 kopii na haploidalny genom. Charakteryzuje je duża różnorodność, jednakże większość z nich jest nieaktywna genetycznie. Niniejsze badania potwierdziły obecność retrotranspozonów WIS 2-1A w 15 na 26 analizowanych odmianach pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.). Dane literaturowe wskazują, że obecność elementów ruchomych może mieć wpływ na modyfikacje loci gluteninowych. W związku z tym wydaje się, że analiza elementów WIS 2-1A w pszenicy zwyczajnej może być pomocna w ocenie jakości glutenu. Słowa kluczowe: Triticum aestivum L., WIS 2-1A, HMW-GS, odmiany pszenicy WSTĘP W badaniach roślin zbożowych istotnym wyzwaniem współczesnej biologii molekularnej jest charakterystyka genomu Triticeae, plemienia, do którego należą istotne z punktu widzenia rolniczego zboża, tj. pszenica, jęczmień czy ryż. Czołowym zbożem, uprawianym nie tylko w Polsce, ale i na świecie, jest pszenica zwyczajna (Triticum aestivum L.). To przykład gatunku alloheksaploidalnego (2n = 6x = 42, genom AABBDD), organizmu powstałego dzięki hybrydyzacji trzech diploidalnych przodków z rodzajów Triticum i Aegilops [Feldman i Levy 2012]. Wynikiem poliploidyzacji jest zwiększenie rozmiaru genomu. Rozmiar genomu pszenicy zwyczajnej ( MB) jest nieporównywalnie większy od rozmiarów genomów roślin modelowych, tj. Arabidopsis (130 MB) czy ryżu (430 MB). Wielkość ta związana jest z ilością sekwencji powtarzalnych, które u pszenicy stanowią 90% jej genomu, z czego 60 80% to sekwencje retrotranspozonów [SanMiguel i in. 2002, Wicker i in. 2003, Gu i in. 2006]. Retrotranspozony są powszechnie występującymi w świecie roślin elementami ruchomymi. Opisano je u ponad 100 roślin wyższych należących do różnych rodzajów, m.in. Avena,
2 40 E. FILIP, I. SZUĆKO Brassica, Triticum, Vicia, Vitis, Zea. Replikacja tych elementów ruchomych prowadzi do gwałtowanego wzrostu liczby ich kopii a tym samym do wzrostu wielkości genomu roślinnego [Muñiz i in. 2001]. Sugeruje to, że mają one wpływ na organizację genomową, a także na samą strukturę genetyczną organizmu, w którym występują. W genomie pszenicy można wyróżnić kilka odrębnych rodzin retrotranspozonów pochodzących od jej diploidalnych przodków. Aktywacja roślinnych retrotranspozonów związana jest z odpowiedzią organizmu na czynniki stresogenne, np. infekcje wirusowe [Matsuoka i Tsunewaki 1999]. W genomach pszenicy najczęściej występującymi retrotranspozonami są: WIRE1 występuje w kopiach na genom, a także BIS1 obecny również w genomach ryżu i jęczmienia, ilość jego kopii stanowi nawet ok. 5% genomu tych gatunków. Często występują również, analizowane w powyższych badaniach, retrotranspozony WIS 2-1A, które opisano jako insercje w niemych allelach (ang. null alleles) loci genów Glu-1A-1 i Glu-1A-2, kodujących wysokocząsteczkowe podjednostki glutenin (HMW-GS) [Mondini i i in. 2008]. Gluteniny są, obok gliadyn, istotnym komponentem glutenu. Wśród glutenin to gluteniny HMW w znacznej mierze decydują o jakości glutenu, a zatem również o tzw. cechach reologicznych formowanego z mąki ciasta, tj. lepkości, sprężystości, wytrzymałości, rozciągliwości itd. [Branlard i in. 2001, Shewry i in. 2001]. Podjednostki glutenin wysokocząsteczkowe (HMW-GS) są kodowane przez geny następujących loci: Glu-A1, Glu-B1 i Glu-D1. Każdy locus zawiera dwa geny kodujące dwa różne typy HMW-GS: x i y. W analizach przeprowadzonych z zastosowaniem techniki SDS-PAGE HMW-GS typu x charakteryzują się wolniejszą mobilnością i większą masą cząsteczkową w porównaniu z HMW-GS typu y. Z uwagi na to, że niektóre geny są uśpione (null alleles), w praktyce jedna odmiana pszenicy heksaploidalnej może posiadać od 3 do 5 podjednostek HMW-GS. Wykazano, że pszenica zwyczajna powinna zawierać 6 różnych podjednostek HMW-GS kodowanych przez te geny. Jednak ze względu na wyciszenie niektórych z nich w odmianach pszenicy najczęściej występuje 3 5 podjednostek HMW-GS (T. durum zawiera 1 3 podjednostki). Z tego względu wszystkie pszenice heksaploidalne zawierają podjednostki 1Bx, 1Dx i 1Dy, czasami są też 1By i 1Ax. Podaje się, że allel kodujący podjednostkę 1Ay jest zawsze wyłączony w genomie heksaploidalnej pszenicy, a 1Ax jest czynny bardzo rzadko [Du i in. 2006]. Teoretycznie na podstawie obecności korzystnych lub nie poszczególnych podjednostek gluteninowych w trzech genomach pszenicy można z pewnym prawdopodobieństwem przewidzieć jakość wypiekową ziarna danej odmiany. Dlatego też niezwykle istotne wydaje się nie tylko analizowanie poszczególnych podjednostek glutenin, ale i genów je kodujących. Stąd w niniejszej pracy analizowano występowanie retrotranspozonu WIS 2-1A w wybranych odmianach pszenicy zwyczajnej. MATERIAŁ I METODY Materiał do badań stanowiło 26 odmian pszenicy zwyczajnej zarejestrowanych w latach (Triticum aestivum L.) (tab. 1). Materiał pochodził ze zbiorów Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie. Z każdej odmiany pszenicy do analiz pobierano 30 losowo wybranych ziarniaków. Genomowe DNA izolowano z koleoptyli (0,2 g na próbę) etiolowanych siewek za pomocą zestawu Wizard Genomic DNA (Promega). Tak wyizolowane DNA poddano
3 Identyfikacja obecności retrotranspozonu WIS 2-1A w genomie wybranych odmian pszenicy ocenie ilościowej i jakościowej poprzez pomiar absorbancji przy długości fali 230, 260 i 280 nm. Do wykonania takiego pomiaru wykorzystano system spektrofotometryczny typu NanoDrop 2000c (Thermo Scientific, Madison, USA). Tabela 1. Wykaz badanych odmian pszenicy zwyczajnej z uwzględnieniem: wyników reakcji PCR oraz składem wysokocząsteczkowych podjednostek gluteninowych HMW-GS analizowanych za pomocą SDS-PAGE [Filip 2010] Table 1. List of the studied the wheat cultivars with regard to: the results of the PCR reaction and high-molecular-weight glutenin subunit HMW-GS analyzed using SDS-PAGE [Filip 2010] Lp. No. Odmiana/ Cultivar Produkty PCR dla WIS 2-1A/ Products of PCR for WIS 2-1A Skład podjednostek HMW-GS w loci Glu-1/ Composition of HMW-GS subunits in loci Glu-1 Glu-A1 Glu-B1 Glu-D1 1 Wysokolitewka Sztywnosłoma null Magnatka Rogalińska Niewylegająca + null Squarehead Grodkowicka Biała Kaszubska Ostka Czerwona Łopuska null Ostka Mikulic Selit null 7+8(9) Ostka Górczańska + null Wysokolitewka Antonińska Ostka Kazimierska 1 7+8(9) Srebrzysta + null Mudczanka Czerwona + 2* Sielecka Genetyczna Sobieszyńska Balta + null Mydlniczanka Eka Nowa Antonińska Dańkowska Biała + null Udyczanka Czerwona Tryumf Mikulic null Sobótka Poznańska Biała + null Murzynka Lipińskiego Żelazna + null Ślązaczka null obecność produktu amplifikacji dla WIS 2-1A brak produktu amplifikacji dla WIS 2-1A W badaniach amplifikowano sekwencje genu kodującego integrazę retrotranspozonu WIS 2-1A zlokalizowanego w genomie A pszenicy zwyczajnej. Do reakcji wykorzystano następującą parę starterów: WIS-1 integrazy: 5 TATTCACTGCATGCCTCAGC3 oraz WIS-2 integrazy: 5 TGGACCGTTTGACTCACTTG 3. Startery te zostały zaprojektowane do sekwencji z bazy danych NCBI (National Center for Biotechnology
4 42 E. FILIP, I. SZUĆKO Information) o numerze akcesyjnym X i zostały zsyntezowane w Pracowni Sekwencjonowania i Syntezy DNA IBB PAN w Warszawie. Reakcje PCR prowadzono w termocyklerzet100 Thermal Cycler (Bio-Rad). Reakcję PCR przeprowadzano w objętości 25 µl mieszaniny w składzie: 1x bufor (Novazym), 0,28 mm MgCl 2 ; 0,2 mm dntp; 0,4 mm starter; 100 ng DNA; polimeraza 1U Allegro Taq 2,5 U/1 µl (Novazym). Reakcję prowadzono w dwóch powtórzeniach. Zastosowano następujący profil termiczny reakcji: wstępna denaturacja 95 C przez 5 min, następnie 34 cykle 95 C, 30 s; 52 C; 30 s, 72 C, 1 min oraz końcowe wydłużanie 72 C przez 5 min. Produkty amplifikacji rozdzielano w 1,5% żelu agarozowym (agaroza Prona) w 1x TBE (0,89 M Tris, 0,89 M kwas borowy, 2 mm EDTA, wszystkie odczynniki Sigma) przez 1,5 h przy napięciu 85 V. Do żelu dodany był bromek etydyny (Sigma) w stężeniu 0,1 µg/ml. Wyniki elektroforezy zapisywano za pomocą GelDoc XR (Bio-Rad) w programie Quantity One (Bio-Rad), za pomocą którego dokonano analizy elektroforegramów. WYNIKI W wyniku przeprowadzonej reakcji amplifikacji w 15 badanych odmianach pszenicy zwyczajnej otrzymano produkt o oczekiwanej długości 171 pz. Obecność produktu amplifikacji genu kodującego integrazę świadczyła o obecności retrotranspozonu WIS 2-1A w genomie A analizowanych odmian. Natomiast u pozostałych 11 nie stwierdzono obecności produktu w tym genomie (rys. 1, tab. 1). Linie/ Lines: M marker masowy/ size marker (Mass Ruler TM DNA Ladder Mix), 1. Wysokolitewka Sztywnosłoma, 2. Magnatka Rogalińska, 3. Niewylegająca, 4. Squarehead Grodkowicka, 5. Biała Kaszubska, 6. Ostka Czerwona Łopuska, 7. Ostka Mikulic Selit, 8. Ostka Górczańska, 9. Wysokolitewka Antonińska, 10. Ostka Kazimierska, 11. Srebrzysta, 12. Mudczanka Czerwona, 13. Sielecka Genetyczna, 14. Sobieszyńska, 15. Balta, 16. Mydlniczanka, 17. Eka Nowa, 18. Antonińska, 19. Dańkowska Biała, 20. Udyczanka Czerwona, 21. Tryumf Mikulic, 22. Sobótka, 23. Poznańska Biała, 24. Murzynka Lipińskiego, 25. Żelazna, 26. Ślązaczka, M marker masowy/ size marker (Mass Ruler TM DNA Ladder Mix) Rys. 1. Rozdział elektroforetyczny produktów amplifikacji fragmentu retrotranspozonu WIS 2-1A Fig. 1. Electrophoresis image of the amplification products obtained for WIS 2-1A retrotransposon
5 Identyfikacja obecności retrotranspozonu WIS 2-1A w genomie wybranych odmian pszenicy Ponadto w tabeli 1 zamieszczono wykaz wysokocząsteczkowych podjednostek gluteninowych (HMW-GS) w analizowanych odmianach pszenicy zwyczajnej [Filip 2010]. Wyniki te wykorzystano w celu porównania i zaobserwowania ewentualnych korelacji między obecnością/brakiem produktu amplifikacji fragmentu genu kodującego integrazę retrotranspozonu WIS 2-1A a podjednostką glutenin wysokocząsteczkowych HMW-GS w locus Glu-A1. W toku badań nie zaobserwowano jednak takich zależności. DYSKUSJA Elementy WIS 2-1A były pierwszymi retrotranspozonami zidentyfikowanymi u pszenicy w podjednostkach gluteninowych o dużej masie cząsteczkowej (HMW-GS) [Harbert i in. 1987]. Retrotranspozony ze względu na budowę można podzielić na dwie klasy: retrotranspozony zawierające długie proste powtórzenia na końcach (LTR) i retrotranspozony niezawierające tych powtórzeń (non-ltr). Z kolei wśród retrotranspozonów LTR można wyróżnić dwie podgrupy Ty1-copia i Ty3-gypsy. To właśnie retrotranspozony zawierające LTR są najliczniej występującą grupą elementów ruchomych w genomach roślinnych, u traw ich zawartość sięga 90% wielkości genomu [Kraitshtein i in. 2010]. WIS 2-1A analizowane w powyższych badaniach przynależą do rodziny Ty1-copia. Elementy te mają długie terminalne powtórki (LTR), które ograniczają obszar o długości 5114 pz. Długość LTRów wynosi 1755 pz, powodując tym samym, że retrotranspozony WIS 2-1A zajmują drugie miejsce wśród retrotranspozonów pod względem długości sekwencji LTR [Murphy i in. 1992]. Sekwencje LTR początkowo były znacznie krótsze, ich długość pierwotnie wynosiła około pz. Podczas ewolucji długość ta ulegała zwiększaniu, co było wynikiem akumulujących się mutacji w tym obszarze [Lucas i in.1992]. Retrotranspozony Ty1-copia w swojej strukturze mają domeny gag i pol. W obrębie obszaru gag znajduje się gen kodujący białko podobne do białka kapsydu wirusa, od którego pochodzą te retroelementy. Z kolei obszar kodujący kilka białek (pol) zawiera geny proteazy (prot), odwrotnej transkryptazy (rt), integrazy (int) i Rnazy H (Rnase H). Elementy z grupy Ty1-copia mają następującą kolejność tych genów: LTR-gag-prot-int-rt-RnaseH-LTR [Rogalska i in. 2004]. Mając na względzie strukturę retrotranspozonu WIS 2-1A, w niniejszych badaniach amplifikowano jedną z sekwencji będących jego integralną częścią, dzięki czemu możliwe stało się zidentyfikowanie obecności tego elementu ruchomego w genomie A wybranych pszenic uprawnych. Homologiczne sekwencje do tych retrotranspozonów znaleziono u Triticum monococcum, Secale cereale, Triticum speltoides, Aegilops squarossa, Triticum turgidum L., Triticum aestivum L. (odmiana Chinese Spring i Pané 247) i Triticosecale Wittmack (odmiana Presto i Torote) [Muñiz i in. 2001]. Fakt ten wskazuje, że WIS 2-1A były prawdopodobnie obecne już w genomie nieznanego przodka Triticeae i tylko w rzadkich przypadkach stawały się aktywne. Badania genów kodujących gluteniny w genomie A pszenic heksaploidalnych Glu- 1A-1 i Glu-1A-2 wskazują, że geny te oddzielone są od siebie obszarem o długości pz. Harbert i in. [1987] wykazali obecność 8kb insertu DNA w locus genu Glu-A1 zlokalizowanym na chromosomie 1A genomu pszenicy. Sekwencją insercyjną okazał się retrotranspozon WIS 2-1A, który spowodował wyciszenie aktywności tego genu.
6 44 E. FILIP, I. SZUĆKO W obszarze genu Glu-1A-2 również zidentyfikowano elementy ruchome WIS 2-1A [Muñiz i in. 2001]. WIS 2-1A są nazywane nieaktywnymi retrotranspozonami, które tylko w rzadkich przypadkach mogą być aktywne w układzie trans [Muñiz i in. 2001, Rogalska i in. 2004]. Dane literaturowe wskazują, że elementy WIS 2-1A występują z dużą częstotliwością 200 kopii na haploidalny genom pszenicy zwyczajnej. Jednakowoż elementy WIS 2-1A w wyniku akumulacji mutacji straciły zdolność do autonomicznej transpozycji [Mondini i in. 2008]. Wiele roślinnych retrotranspozonów w swojej strukturze wykazuje wewnętrzne insercje lub delecje najprawdopodobniej powstałe na skutek transpozycji tych elementów. To nie jest równoznaczne z faktem, że takie retrotranspozony nie są zdolne do retrotranspozycji z jednego genomu do innego. To z kolei przyczynia się do zwiększenia ilości ich kopii w pozostałych genomach. Retrotranspozony LTR, analizowane w powyższych badaniach, są wysoce heterogeniczną grupą elementów ruchomych. Mondini i in. [2008] analizowali za pomocą techniki real-time PCR liczbę kopii retrotranspozonu WIS 2-1A u T. monococcum, T. dicoccum i T. spelta. Najmniejszą liczbę kopii tego retrotranspozonu wykazano u T. monococcum, co związane jest z faktem, że pszenica samopsza ma najmniejszy genom spośród pszenic analizowanych przez badaczy. U T. spelta i T. dicoccum liczba kopii WIS 2-1A była porównywalna. Było to zgodne z badaniami Moore a i in. [1991], którzy z kolei wzięli pod uwagę gatunki: T. aestivum (genom A, B, D), Ae. longissisma (genom S), Ae. squarossa (genom D) oraz T. monoccocum (genom A). Udowodnili, że więcej kopii retroelementu WIS 2-1A występuje w genomie B niż w genomach A i D. Z kolei Bonchev i in. [2010] wykazali, że liczba transkryptów WIS 2-1A jest większa u Triticale niż u analizowanych przez nich heksaploidalnych form pszenic, pomimo że wyniki amplifikacji genomowego DNA wskazywały odwrotnie. Badacze wykazali także, że elementy ruchome BARE- 1/WIS 2-1A lokują się w obrębie genów kodujących gluteniny oraz γ-gliadyny. Wyniki te sugerują, że dynamika retrotranspozonu wpływa nie tylko na strukturę, ale i funkcje tych loci. Dodatkowo naukowcy stwierdzili, że aktywność transkrypcyjna elementów WIS 2-1A nie współgra z ich aktywnością transpozycyjną. To związane jest z faktem, że odwrotna transkryptaza w czasie swojej aktywności może popełniać błędy, co z kolei skutkuje powstawaniem różnych populacji, blisko spokrewnionych, transkrypcyjnie nieaktywnych siostrzanych kopii tego elementu ruchomego. Uwzględniając dane literaturowe [Moore i in. 1991, Muñiz i in. 2001, Mondini i in. 2008], w niniejszych badaniach zastosowano klasyczną technikę PCR, która okazała się wystarczająca do potwierdzania bądź wykluczenia obecności sekwencji genomowej genu kodującego integrazę WIS 2-1A, będącej integralną częścią struktury retroelementu (rys. 1). Badania przeprowadzono u 26 wybranych odmian pszenicy zwyczajnej, w których genomie A teoretycznie powinny znaleźć się sekwencje tego retroelementu. Natomiast wyniki analiz wykazały, że fragment tego retroelementu znajdował się jedynie u niewiele ponad połowy (58%) analizowanych odmian pszenicy. Co więcej, nie wykazano korelacji między występowaniem genu kodującego integrazę WIS 2-1A w genomie A analizowanych pszenic a opisanym dla nich składem podjednostek gluteninowych HWM-GS. Podsumowując, mechanizm dynamiki retrotranspozonu WIS 2-1A nie jest dokładnie znany, wiemy natomiast, że staje się bardziej aktywny w odpowiedzi na stres biotyczny i abiotyczny, zwiększając tym samym ekspresje genów wysokocząsteczkowych podjednostek gluteninowych (HMW-GS).
7 Identyfikacja obecności retrotranspozonu WIS 2-1A w genomie wybranych odmian pszenicy WNIOSKI 1. Stwierdzono obecność genu kodującego integrazę retrotranspozonu WIS 2-1A u większości badanych odmian pszenicy zwyczajnej (58%). 2. Zarówno pszenice zwyczajne cechujące się dobrym (Mudyczanka Czerwona 2*), jak i złym (Żelazna null) genotypem HMW-GS w locus Glu-A1 zawierają sekwencje genu kodującego integrazę. Wskazuje to na obecność retrotranspozonu WIS 2-1A (albo jego fragmentu) w genomie A badanych odmian pszenicy zwyczajnej. 3. Nie wykazano korelacji pomiędzy obecnością genu kodującego integrazę WIS 2-1A a obecnością poszczególnych podjednostek glutenin HMW-GS, tj. Ax1, Ax2*, null. PIŚMIENNICTWO Branlard G., Dardevet M., Saccomano R., Lagoutte F., Gourdon J., Genetic diversity of wheat storage proteins and bread wheat quality. Euphytica 119, Bonchev G., Georgiev S., Pearce S., Retrotransposons and ethyl methanesulfonate induced diversity in hexaploid wheat and Triticale. Cent. Eur. J. Biol. 5(6), Du C., Swigoňová Z., Messing J., Retrotranspositions in orthologous regions of closely related grass species. BMC Evol. Biol. 6(62), Feldman M., Levy A.A., Genome evolution due to allopolyploidization in wheat. Genetics 192(3), Filip E., Badanie zmienności genetycznej grupy odmian pszenicy heksaploidalnej Triticum aestivum L. za pomocą izoenzymów i markerów STS (PCR-DNA). Praca doktorska, Wydział Nauk Przyrodniczych, Uniwersytet Szczeciński, Gu Y.Q., Salse J., Coleman-Derr D., Dupin A., Crossman C., Lazo G.R., Huo N., Belcram H., Ravel C., Charmet G., Charles M., Anderson O.D., Chalhoub B., Types and rates of sequence evolution at the high-molecular-weight glutenin locus in hexaploid wheat and its ancestral genomes. Genetics 174(3), Harbert N.P., Flavell R.B., Thompson R.D., Identification of a transposon-like insertion in a Glu-1 allele of wheat. Mole. Genet. Genomics 209, Kraitshtein Z., Yaakov B., Khasdan V., Kashkush K., Genetic and epigenetic dynamics of retrotransposon after allopoliploidization of wheat. Genetics 186, Lucas H., Moore G., Murphy G., Flavell R., Inverted repears in the long-terminal repeats of the wheat retrotransposon WIS 2-1A. Mol. Biol. Evol. 9, Matsuoka Y., Tsunewaki K Evolutionary dynamics of Ty1-copia group retrotransposons in grass shown by reverse transcriptase domain analysis. Mol. Biol. Evol. 16(2), Mondini L., Porceddu E., Pagnotta M.A., Real-Time PCR, a tool for the analysis and quantitation of WIS 2-1A retrotransposon in hulled wheat. Proceedings of the 11th International Wheat Genetics Symposium, August 2008, Brisbane, 2, Moore G., Lucas H., Batty N., Flavell R., A family of retrotransposons and associated genomic variation in wheat. Genomics 10, Muñiz L.M., Cuadrado A., Jouve N., González J.M., The detection, cloning, and characterisation of WIS 2-1A retrotransposon-like sequences in Triticum aestivum L. and Triticosecale Wittmack and an examination of their evolution in related Triticeae. Genome 44(6), Murphy G.J.P., Lucas H., Moore G., Flavell R.B, Sequence analysis of WIS 2-1A, a retrotransposon-like element from wheat. Plant Mol. Biol. 20,
8 46 E. FILIP, I. SZUĆKO Rogalska S.M., Kalinka A., Achrem M., Słomińska-Walkowiak R., Skuza L., Filip E., Genetyczne elementy ruchome u roślin i innych organizmów. Kosmos Probl. Nauk Biol. 53, SanMiguel P.J., Ramakrishna W., Bennetzen J.L., Busso C.S., Dubcovsky J., Transposable elements, genes and recombination in a 215-kb contig from wheat chromosome 5A(m). Funct. Integr. Genom. 2, Shewry P.R., Tatham A.S., Fido R., Jones H., Barcelo P., Lazzeri P.A., Improving the end use properties of wheat by manipulating the grain protein composition. Euphytica 119, Wicker T., Yahiaoui N., Guyot R., Schlagenhauf E., Liu Z.D., Dubcovsky J., Keller B., Rapid genome divergence at orthologous low molecular weight glutenin loci of the A and Am genomes of wheat. Plant Cell. 15, Summary. WIS 2-1A elements were the first retrotransposons identified in a High Molecular Weight glutenin subunit (HMW-GS) of wheat. WIS 2-1A belong to the Ty-1 copia family. They occur in very different copy numbers, ranging from tens of thousands to just a few copies per genome. The copy number of WIS 2-1A was estimated to be about 200 per haploid genome in Triticum aestivum L. They are characterized by great diversity, while most of the sequences of those retrotransposons are inactive. The results obtained and presented in this study confirm the presence of WIS 2-1A retrotransposons in the genome of common wheat (Triticum aestivum L). In this study, the integrase gene for WIS 2-1A occupying locus X was used. This gene was identified in 15 from among 26 cultivars of common wheat (Triticum aestivum L.). The literature indicates that the presence of mobile elements can affect modifications of glutenins loci. Thereupon, it seems that analyzing WIS 2-1A in common wheat may be helpful to predict gluten quality. Key words: Triticum aestivum L., WIS 2-1A, HMW-GS, common wheat
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Autor: dr Mirosława Staniaszek
Zakład Hodowli Roślin Ogrodniczych Pracownia Genetyki i Hodowli Roślin Warzywnych Fot. J. Sobolewski Procedura identyfikacji genu Frl warunkującego odporność pomidora na Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków)
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków) Celem ćwiczenia jest wprowadzenie mutacji punktowej do genu
Acta Sci. Pol. Technologia Alimentaria 3(2) 2004, 147-155
SCIENTIARUM POLONORUMACTA Technologia Alimentaria 3(2) 2004, 147-155 OCENA JAKOŚCI NOWYCH LINII PSZENICY TWARDEJ NA PODSTAWIE CHARAKTERYSTYKI BIAŁEK GLIADYNOWYCH I GLUTENINOWYCH W WARUNKACH STOSOWANIA
PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 26/11
PL 214501 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 214501 (13) B1 (21) Numer zgłoszenia: 391458 (51) Int.Cl. C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/29 (2006.01) Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej
PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 04/14. SYLWIA OKOŃ, Dąbrowica, PL KRZYSZTOF KOWALCZYK, Motycz, PL
PL 220315 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 220315 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 400252 (22) Data zgłoszenia: 06.08.2012 (51) Int.Cl.
TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R
TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej
TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925
TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa IZOLACJA DNA Z HODOWLI KOMÓRKOWEJ.
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa tel. 22 572 0735, 606448502
Zastosowanie markerów RAPD do określenia podobieństwa genetycznego odmian jęczmienia ozimego (Hordeum vulgare L.)
NR 226/227/1 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2003 ANETTA KUCZYŃSKA 1 JAN BOCIANOWSKI 1 PIOTR MASOJĆ 2 MARIA SURMA 1 TADEUSZ ADAMSKI 1 1 Instytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk
Glimmer umożliwia znalezienie regionów kodujących
Narzędzia ułatwiające identyfikację właściwych genów GLIMMER TaxPlot Narzędzia ułatwiające amplifikację tych genów techniki PCR Primer3, Primer3plus PrimerBLAST Reverse Complement Narzędzia ułatwiające
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Genetyczne możliwości ulepszania jakości ziarna pszenicy ozimej Triticum aestivum L. w efekcie hybrydyzacji introgresywnej z Triticum durum Desf.
NR 236 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2005 JÓZEF PILCH Zakład Oceny Jakości i Metod Hodowli Zbóż Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Krakowie Genetyczne możliwości ulepszania jakości
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: 1. Otrzymanie pożądanego odcinka DNA z materiału genetycznego dawcy 2. Wprowadzenie obcego DNA do wektora 3. Wprowadzenie wektora, niosącego w sobie
Polimorfizm białek gliadynowych i gluteninowych a zmienność cech technologicznych u mieszańców orkiszu i pszenicy zwyczajnej
NR 253 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2009 JACEK WAGA MARIA STACHOWICZ KATARZYNA KARSKA Zakład Roślin Zbożowych Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin, Kraków Polimorfizm białek gliadynowych
Wpływ selekcji na częstotliwość występowania podjednostek glutenin kodowanych chromosomem 1A w populacjach mieszańcowych pszenicy ozimej *
NR 236 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2005 EDWARD WITKOWSKI 1 JACEK WAGA 2 AMELIA BIELAWSKA 3 KRYSTYNA WITKOWSKA 1 HELENA LUBER 3 1 Hodowla Roślin Smolice Sp. z o.o. 2 Zakład Oceny Jakości
Genetyka, materiały dla studentów Pielęgniarstwa
Markery genetyczne: definicja Marker genetyczny jest to cecha, która może być wykorzystana do identyfikacji osobników lub gatunków. Cechy markerów genetycznych Monogeniczny: warunkowany przez jeden gen
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Wstęp teoretyczny Technika RAPD (ang. Random Amplification of Polymorphic DNA) opiera się na prostej reakcji PCR, przeprowadzanej na genomowym
Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16
Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16 Ćwiczenie 3 Identyfikacja genetycznie modyfikowanych roślin w produktach spożywczych - jakościowe badanie obecności
Inżynieria Genetyczna ćw. 3
Materiały do ćwiczeń z przedmiotu Genetyka z inżynierią genetyczną D - blok Inżynieria Genetyczna ćw. 3 Instytut Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski, rok akad. 2018/2019
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Genetyczne zróżnicowanie białek zapasowych kilkunastu odmian pszenżyta ozimego (X Triticosecale Wittmack)
NR 236 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2005 MIŁOSZ SMOLIK DANUTA RZEPKA-PLEVNEŠ KATARZYNA GRYS Zakład Hodowli Roślin Ogrodniczych Akademia Rolnicza w Szczecinie Genetyczne zróżnicowanie
Określenie indeksu odmienności odmian pszenżyta ozimego metodą porównywania diagramów elektroforetycznych gliadyn
NR 220 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2001 EWA MAKARSKA Katedra Chemii Akademia Rolnicza w Lublinie Określenie indeksu odmienności odmian pszenżyta ozimego metodą porównywania diagramów
RAPORT ROCZNY/KOŃCOWY 1)
RAPORT ROCZNY/KOŃCOWY Załącznik nr 18 z realizacji projektu badawczego własnego habilitacyjnego promotorskiego 1. DANE OGÓLNE 1. Nazwa i adres jednostki naukowej*/ Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (2) GENOMY I ICH ADNOTACJE. Podstawy Bioinformatyki wykład 4
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (2) GENOMY I ICH ADNOTACJE Podstawy Bioinformatyki wykład 4 GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC PODSTAWY BIOINFORMATYKI 2017/2018 MAGDA MIELCZAREK 2 GENOMY I ICH ADNOTACJE
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1 1 Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Korzeniowych, Pracownia Biotechnologii, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji
Analiza zmienności allelicznej w locus Xgwm261 w odmianach pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.) zarejestrowanych w Polsce w latach
NR 252 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2009 KRZYSZTOF KOWALCZYK SYLWIA OKOŃ Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Analiza zmienności allelicznej
Ampli-LAMP Babesia canis
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400
Tytuł zadania: Identyfikacja zmienności genetycznej pszenicy korelującej z potencjałem plonotwórczym i wybranymi cechami systemu korzeniowego.
Lp. w zał. do Rozporządzenia MRiRW: 5 Tytuł zadania: Identyfikacja zmienności genetycznej pszenicy korelującej z potencjałem plonotwórczym i wybranymi cechami systemu korzeniowego. Kierownik zadania: prof.
GENOMIKA. MAPOWANIE GENOMÓW MAPY GENOMICZNE
GENOMIKA. MAPOWANIE GENOMÓW MAPY GENOMICZNE Bioinformatyka, wykład 3 (21.X.2008) krzysztof_pawlowski@sggw.waw.pl tydzień temu Gen??? Biologiczne bazy danych historia Biologiczne bazy danych najważniejsze
Kilka Nowych Translokacji. Adam Lukaszewski University of California, Riverside
Kilka Nowych Translokacji Adam Lukaszewski University of California, Riverside adam.lukaszewski@ucr.edu #1 pszenica Cel: Pm21 z Haynaldia villosa do pszenicy - Pm21 daje pełną ochronę przed Blumeria graminis
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (1) GENOMY I ICH ADNOTACJE
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (1) GENOMY I ICH ADNOTACJE Podstawy Bioinformatyki wykład 2 PODSTAWY BIOINFORMATYKI 2018/2019 MAGDA MIELCZAREK 1 GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC PODSTAWY BIOINFORMATYKI
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów:
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów: dobór warunków samej reakcji PCR (temperatury, czas trwania cykli, ilości cykli itp.) dobór odpowiednich starterów do reakcji amplifikacji
WYKORZYSTANIE MARKERÓW MOLEKULARNYCH W HODOWLI ODPORNOŚCIOWEJ POMIDORA NA CHOROBY POWODOWANE PRZEZ FUSARIUM OXYSPORUM
WYKORZYSTANIE ARKERÓW OLEKULARNYCH W HODOWLI ODPORNOŚCIOWEJ POIDORA NA CHOROBY POWODOWANE PRZEZ FUSARIU OXYSPORU F.SP. LYCOPERSICI I PSEUDOONAS SYRINGAE PV. TOATO USE OF OLECULAR ARKERS IN THE BREEDING
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA. Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi Mutacja Mutacja (łac. mutatio zmiana) - zmiana materialnego
Sylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Program kształcenia Farmacja, jednolite studia magisterskie, forma studiów: stacjonarne
Zadanie 2.4. Dr inż. Anna Litwiniec Dr inż. Barbara Skibowska Dr inż. Sandra Cichorz
Zadanie 2.4 Poszerzanie puli genetycznej buraka cukrowego przez doskonalenie procesu gynogenezy oraz podnoszenie odporności na wirus nekrotycznego żółknięcia nerwów i tolerancji na suszę Dr inż. Anna Litwiniec
Zadanie nr Kierownik tematu: prof. dr hab. Anna Nadolska-Orczyk
Zadanie nr. 2.1 Zwiększanie wartości użytkowej roślin poprzez poszerzanie ich puli genetycznej i wdrażanie postępu biologicznego z przeznaczeniem na różne cele. Kierownik tematu: prof. dr hab. Anna Nadolska-Orczyk
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji
Organizacja genomu człowieka i sekwencjonowanie DNA
Organizacja genomu człowieka i sekwencjonowanie DNA Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Organizacja genów na ludzkim chromosomie.
ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁODOWSKA LUBLIN POLONIA
ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁODOWSKA LUBLIN POLONIA VOL. LXVIII (3) SECTIO E 2013 Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie ul. Akademicka 15, 20-950
ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁ ODOWSKA LUBLIN POLONIA
ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁ ODOWSKA LUBLIN POLONIA VOL. LVII SECTIO E 2002 1 Katedra Szczegółowej Uprawy Roślin, Akademia Rolnicza w Lublinie, ul. Akademicka 15, 20-950 Lublin 1, Poland 2 Instytut
Charakterystyka izoenzymów aminotransferazy asparaginianowej z siewek pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.)
Charakterystyka izoenzymów aminotransferazy asparaginianowej z siewek pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.) Marcin Maciąga & Andrzej Paszkowski Katedra Biochemii, Wydział Rolnictwa i Biologii, SGGW
ANNALES. Maria Chrząstek
AALES UIVERSITATIS VOL. LIX, r 1 MARIAE LUBLI * CUR I E - S K Ł O D O W S K A POLOIA SECTIO E 2004 Instytut Genetyki i Hodowli Roślin, Akademia Rolnicza w Lublinie, ul. Akademicka 15, 20-033 Lublin, Poland
Ćwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO
Ćwiczenie numer 6 Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO 1. Informacje wstępne -screening GMO -metoda CTAB -qpcr 2. Izolacja DNA z soi metodą CTAB 3. Oznaczenie ilościowe i jakościowe DNA
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK24N Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Detekcja
PCR - ang. polymerase chain reaction
PCR - ang. polymerase chain reaction łańcuchowa (cykliczna) reakcja polimerazy Technika PCR umożliwia otrzymywanie dużej liczby kopii specyficznych fragmentów DNA (czyli amplifikację zwielokrotnienie fragmentu
Zadanie 2.4 Poszerzanie puli genetycznej buraka cukrowego przez doskonalenie procesu gynogenezy oraz podnoszenie odporno
Zadanie 2.4 Poszerzanie puli genetycznej buraka cukrowego przez doskonalenie procesu gynogenezy oraz podnoszenie odporności na wirus nekrotycznego żółknięcia nerwów i tolerancji na suszę Wykonawcy: Dr
Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF
Agnieszka Gładysz Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Katedra i Zakład Biochemii i Chemii Klinicznej Akademia Medyczna Prof.
Charakterystyka białek glutenu w materiałach hodowlanych pszenicy
NR 282 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2017 MACIEJ KAŁA 1 MATEUSZ PRZYBOROWSKI 1 BOGUSŁAWA ŁUGOWSKA 2 SEBASTIAN GASPARIS 1 ANNA NADOLSKA-ORCZYK 1 1 Zakład Genomiki Funkcjonalnej, Instytut
Mikrosatelitarne sekwencje DNA
Mikrosatelitarne sekwencje DNA Małgorzata Pałucka Wykorzystanie sekwencji mikrosatelitarnych w jądrowym DNA drzew leśnych do udowodnienia pochodzenia materiału dowodowego w postępowaniu sądowym 27.09.2012
Poszukiwanie źródeł odporności u pszenic na wirus odglebowej mozaiki zbóż (Soil-borne cereal mosaic virus, SBCMV)
Małgorzata Jeżewska Zakład Wirusologii i Bakteriologii, Instytut Ochrony Roślin Państwowy Instytut Badawczy, Poznań Poszukiwanie źródeł odporności u pszenic na wirus odglebowej mozaiki zbóż (Soil-borne
GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 1 Biologia I MGR /
GENETYKA POPULACJI Ćwiczenia 1 Biologia I MGR 1 ZAGADNIENIA struktura genetyczna populacji obliczanie frekwencji genotypów obliczanie frekwencji alleli przewidywanie struktury następnego pokolenia przy
Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu
Techniki biologii molekularnej - opis przedmiotu Informacje ogólne Nazwa przedmiotu Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu 13.9-WB-BMD-TBM-W-S14_pNadGenI2Q8V Wydział Kierunek Wydział Nauk Biologicznych
2. Przedmiot zamówienia: Odczynniki chemiczne do izolacji DNA i reakcji PCR, wymienione w Tabeli 1. Nazwa odczynnika Specyfikacja Ilość*
Poznao, 6 lutego 2012 r. Zapytanie ofertowe nr 001 /2012 dotyczące zakupu odczynników chemicznych do izolacji DNA i reakcji PCR GENESIS Polska Sp. z o.o Ul. Za Cytadelą 19, 61-659 Poznao NIP 778 13 56
TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA
DNA 28SRNA 18/16S RNA 5SRNA mrna Ilościowa analiza mrna aktywność genów w zależności od wybranych czynników: o rodzaju tkanki o rodzaju czynnika zewnętrznego o rodzaju upośledzenia szlaku metabolicznego
WYSTĘPOWANIE WYBRANYCH GENÓW ODPORNOŚCI NA PARCH JABŁONI U ODMIAN I GATUNKÓW DZIKICH UŻYWANYCH W PROGRAMACH HODOWLANYCH JABŁONI.
Roczniki Akademii Rolniczej w Poznaniu CCCLXXXIII (2007) MAŁGORZATA KORBIN, SYLWIA KELLER-PRZYBYŁKOWICZ, EDWARD ŻURAWICZ WYSTĘPOWANIE WYBRANYCH GENÓW ODPORNOŚCI NA PARCH JABŁONI U ODMIAN I GATUNKÓW DZIKICH
MOLEKULARNE PODSTAWY ODPORNOŚCI MIOTŁY ZBOŻOWEJ (APERA SPICA-VENTI L.) NA HERBICYDY SULFONYLOMOCZNIKOWE
Progress in Plant Protection / Postępy w Ochronie Roślin, 47 (3) 2007 MOLEKULARNE PODSTAWY ODPORNOŚCI MIOTŁY ZBOŻOWEJ (APERA SPICA-VENTI L.) NA HERBICYDY SULFONYLOMOCZNIKOWE MICHAŁ KRYSIAK 1, MAGDALENA
SPECYFIKACJA TECHNICZNA AGAROZ
SPECYFIKACJA TECHNICZNA AGAROZ D1 LOW EEO i D1 MEDIUM EEO, D1 HIGH EEO D1 LOW EEO GQT; (Genetic Quality Tested) D2 HIGH GELLING TEMPERATURE D5 HIGH STRENGTH GEL Agaroza LM Agaroza LM GQT; (Genetic Quality
Dominika Stelmach Gr. 10B2
Dominika Stelmach Gr. 10B2 Czym jest DNA? Wielkocząsteczkowy organiczny związek chemiczny z grupy kwasów nukleinowych Zawiera kwas deoksyrybonukleoinowy U organizmów eukariotycznych zlokalizowany w jądrze
ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ
ŻYW NO ŚĆ 3(20)Supl 1999 JOANNA CHMIELEWSKA, JOANNA KAWA-RYGIELSKA ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ S t r e s z c z e n i e W pracy podjęto próbę wykorzystania metody
Katalog bloków białek gliadynowych polskich odmian i rodów pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.)
NR 243 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2007 JACEK WAGA Zakład Oceny Jakości i Metod Hodowli Zbóż Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin, Kraków Katalog bloków białek gliadynowych polskich
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT Ćwiczenia 1 mgr Magda Kaczmarek-Okrój magda_kaczmarek_okroj@sggw.pl 1 ZAGADNIENIA struktura genetyczna populacji obliczanie frekwencji genotypów obliczanie frekwencji alleli
Wartość technologiczna introgresywnych form pszenicy ozimej (Triticum aestivum L.)
NR 223/224 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2002 JÓZEF PILCH Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin, Oddział w Krakowie Wartość technologiczna introgresywnych form pszenicy ozimej (Triticum
PL 217144 B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego
PL 217144 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 217144 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 391926 (22) Data zgłoszenia: 23.07.2010 (51) Int.Cl.
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
Instrukcja ćwiczeń Biologia molekularna dla II roku Analityki Medycznej. Reakcja odwrotnej transkrypcji. Projektowanie starterów do reakcji PCR.
INSTRUKCJA Ćwiczenie nr 5 Odczynniki: Sprzęt: 1. 5xNG cdna Buffer 2. 50 µm oligo(dt)20 3. NG dart RT mix l 4. Probówki typu Eppendorf 0,2 ml 5. Woda wolna od RNaz 6. Lód 1. Miniwirówka 2. Termocykler 3.
Ampli-LAMP Goose Parvovirus
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego parwowirusa GPV u gęsi techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-GPV-200 AML-GPV-400 Wydanie
Wykorzystanie krajowych i światowych zasobów genowych w pracach badawczych oraz hodowlanych pszenicy
Wykorzystanie krajowych i światowych zasobów genowych w pracach badawczych oraz hodowlanych pszenicy Miejsce realizacji badań: Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin Państwowy Instytut Badawczy w Radzikowie
Sylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Program kształcenia Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Analityka Medyczna, studia jednolite magisterskie, studia stacjonarne
Bloki licencjackie i studia magisterskie na Kierunkach: Biotechnologia, specjalność Biotechnologia roślinna oraz Genetyka
Bloki licencjackie i studia magisterskie na Kierunkach: Biotechnologia, specjalność Biotechnologia roślinna oraz Genetyka INSTYTUT BIOLOGII EKSPERYMENTALNEJ W Katedrze Genetyki Ogólnej, Biologii Molekularnej
Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9
Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów Rozdział 9 Wykrywanie jakościowe kukurydzy MON810, kukurydzy Bt-176 i soi Roundup Ready metodą PCR M. Querci, M. Maretti, M. Mazzara
Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK25N Wersja zestawu: 1.2012 Zestaw do wykrywania spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Zestaw
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
Identyfikacja genów Vrn w odmianach jęczmienia zwyczajnego (Hordeum vulgare L.) zarejestrowanych w Polsce
NR 252 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2009 MICHAŁ NOWAK Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Identyfikacja genów Vrn w odmianach jęczmienia
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
AGRONOMY SCIENCE. Białka gluteninowe charakterystyka i ich wpływ na właściwości reologiczne pszenicy. Praca przeglądowa
AGRONOMY SCIENCE wcześniej formerly Annales UMCS sectio E Agricultura VOL. LXXIII (2) 2018 CC BY NC ND http://dx.doi.org/10.24326/asx.2018.2.1 Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet
SYLABUS. Wydział Biologiczno-Rolniczy. Katedra Biochemii i Biologii Komórki
SYLABUS 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna z elementami inżynierii genetycznej Kod przedmiotu/ modułu* Wydział (nazwa jednostki prowadzącej kierunek)
Projektowanie reakcji multiplex- PCR
Projektowanie reakcji multiplex- PCR Dzięki nowoczesnym, wydajnym zestawom do PCR, amplifikacja DNA nie jest już takim wyzwaniem, jak w latach 80-tych i 90-tych. Wraz z poprawą metodyki, pojawiły się ciekawe
Biologia molekularna
Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Program kształcenia Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Analityka Medyczna, studia jednolite magisterskie, studia stacjonarne i niestacjonarne
plezjomorfie: podobieństwa dziedziczone po dalszych przodkach (c. atawistyczna)
Podobieństwa pomiędzy organizmami - cechy homologiczne: podobieństwa wynikające z dziedziczenia - apomorfie: podobieństwa dziedziczone po najbliższym przodku lub pojawiająca się de novo (c. ewolucyjnie
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH GENOMY I ICH ADNOTACJE. Pracownia Informatyczna 2
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH GENOMY I ICH ADNOTACJE Pracownia Informatyczna 2 WYBRANE BIOLOGICZNE BAZY DANYCH GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC NATIONAL CENTER FOR BIOTECHNOLOGY INFORMATION NCBI Utworzone
Zastosowanie nowych technologii genotypowania w nowoczesnej hodowli i bankach genów
Zastosowanie nowych technologii genotypowania w nowoczesnej hodowli i bankach genów Jerzy H. Czembor, Bogusław Łapiński, Aleksandra Pietrusińska, Urszula Piechota Krajowe Centrum Roślinnych Zasobów Genowych
KARTA KURSU (realizowanego w module specjalności) Biologia eksperymentalna i środowiskowa
KARTA KURSU (realizowanego w module specjalności) Biologia eksperymentalna i środowiskowa Nazwa Nazwa w j. ang. Wybrane problemy biologii molekularnej kwasy nukleinowe Selected problems of molecular biology
Warszawa, dnia 23 maja 2017 r. Poz ROZPORZĄDZENIE MINISTRA ROLNICTWA I ROZWOJU WSI 1) z dnia 15 maja 2017 r.
DZIENNIK USTAW RZECZYPOSPOLITEJ POLSKIEJ Warszawa, dnia 23 maja 2017 r. Poz. 1003 ROZPORZĄDZENIE MINISTRA ROLNICTWA I ROZWOJU WSI 1) z dnia 15 maja 2017 r. zmieniające rozporządzenie w sprawie terminów
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Rocz. Nauk. Zoot., T. 37, z. 2 (2010) 145 149. Identyfikacja sekwencji genu kodującego dehydrogenazę NADH 1 u sarny
Rocz. Nauk. Zoot., T. 37, z. 2 (2010) 145 149 Identyfikacja sekwencji genu kodującego dehydrogenazę NADH 1 u sarny M a ł g o r z a t a N a t o n e k - W i ś n i e w s k a, E w a S ł o t a Instytut Zootechniki
ZMIENNOŚĆ ALLELICZNA W LOCUS XGWM 261 W POLSKICH ODMIANACH PSZENICY ZWYCZAJNEJ ZAREJESTROWANYCH DO 1975 ROKU Krzysztof Kowalczyk
Acta Agrophysica, 2006, 8(2), 415-421 ZMIENNOŚĆ ALLELICZNA W LOCUS XGWM 261 W POLSKICH ODMIANACH PSZENICY ZWYCZAJNEJ ZAREJESTROWANYCH DO 1975 ROKU Krzysztof Kowalczyk Instytut Genetyki i Hodowli Roślin,
MASA WŁAŚCIWA NASION ZBÓś W FUNKCJI WILGOTNOŚCI. Wstęp. Materiał i metody
InŜynieria Rolnicza 3/2006 Bronisława Barbara Kram Instytut InŜynierii Rolniczej Akademia Rolnicza we Wrocławiu MASA WŁAŚCIWA NASION ZBÓś W FUNKCJI WILGOTNOŚCI Wstęp Streszczenie Określono wpływ wilgotności
Mitochondrialna Ewa;
Mitochondrialna Ewa; jej sprzymierzeńcy i wrogowie Lien Dybczyńska Zakład genetyki, Uniwersytet Warszawski 01.05.2004 Milion lat temu Ale co dalej??? I wtedy wkracza biologia molekularna Analiza różnic
ANALIZA ZALEŻNOŚCI POMIĘDZY CECHAMI DIELEKTRYCZNYMI A WŁAŚCIWOŚCIAMI CHEMICZNYMI MĄKI
Inżynieria Rolnicza 5(103)/2008 ANALIZA ZALEŻNOŚCI POMIĘDZY CECHAMI DIELEKTRYCZNYMI A WŁAŚCIWOŚCIAMI CHEMICZNYMI MĄKI Deta Łuczycka, Leszek Romański Instytut Inżynierii Rolniczej, Uniwersytet Przyrodniczy