Cu-GnRH nowy analogon gonadoliberiny (GnRH) Cu-GnRH new gonadoliberin (GnRH) analog
|
|
- Amelia Lipińska
- 8 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Postepy Hig Med Dosw (online), 2013; 67: e-issn Original paper Received: Accepted: Published: Cu-GnRH nowy analogon gonadoliberiny (GnRH) Cu-GnRH new gonadoliberin (GnRH) analog Kazimierz Kochman Instytut Fizjologii i Żywienia Zwierząt im. Jana Kielanowskiego Polskiej Akademii Nauk, Zakład Neuroendokrynologii Streszczenie W pracy opisano badania skoncentrowane wokół aspektów fizjologicznych i strukturalnych kompleksów metali z GnRH, które otrzymał prof. Henryk Kozłowski z Uniwersytetu Wrocławskiego. Stwierdzono, że kompleksy miedzi, niklu, cynku i kobaltu stymulowały uwalnianie LH i FSH w warunkach in vivo i in vitro. Najbardziej trwały i obiecujący okazał się kompleks miedzi z GnRH (Cu-GnRH), miał większe powinowactwo do swoistego receptora niż natywny GnRH, większą siłę uwalniającą oraz stymulował odmienną ścieżkę sygnalizacji wewnątrzkomórkowej. Ocenia się, że jest on bardzo obiecującym analogonem GnRH i powinien być wykorzystywanym w dalszych badaniach. Słowa kluczowe: GnRH receptor GnRH analogon GnRH Cu-GnRH Ni-GnRH Co-GnRH sygnalizacja wewnątrzkomórkowa Summary Our research was concentrated about physiological and structural aspects of metal complexes with GnRH, which were synthetized by Professor Henryk Kozłowski from the Uniwersity of Wrocław. We found that copper, nickel, zinc and cobalt complexes with GnRH stimulated the release of LH and FSH both in vivo and in vitro. The most stable and active was Cu-GnRH. It also exhibited the higher affinity to specific receptor than GnRH, had higher releasing power for LH and FSH and stimulated differently the intracellular signaling. We suggest, that this complex in highly promissive as a new analog of GnRH with possible application to further research. Key words: GnRH receptor GnRH GnRH analogs Cu-GnRH Ni-GnRH Co-GnRH intracellular signaling Full-text PDF: Word count: Tables: Figures: References: Adres autora: Wykaz skrótów: prof. dr hab. Kazimierz Kochman, Instytut Fizjologii i Żywienia Zwierząt im. Jana Kielanowskiego Polskiej Akademii Nauk, Zakład Neuroendokrynologii, ul. Instytucka 3, Jabłonna; office@ifzz.pan.pl camp - cykliczny adenozynomonofosforan; DSMO - nazwa roztworu używanego do badań; GnRH - gonadoliberyna; 1 HNMR - odmiana NMR; MR - jądrowy rezonans magnetyczny; mrna - informacyjny mrna; TOCS4, ROES4, DYANA, MALDI-TOFMAS metody badań struktury peptydów Postepy Hig Med Dosw (online), 2013; 67
2 Kochman K. Cu-GnRH nowy analogon GnRH Wprowadzenie GnRH (gonadoliberina; hormon uwalniający gonadotropiny; mgnrh; GnRH I; pglu-his-trp-ser-tyr-gly-leu-arg- -Pro-Gly-NH 2 ) został wyizolowany najpierw z podwzgórz owczych, bydlęcych i świńskich jest w wielu laboratoriach, wśród nich i w naszym [25,26,28], lecz w połowie lat 60 ubiegłego wieku tylko dwa laboratoria mogły skutecznie pracować nad strukturą GnRH. Jego struktura pierwszorzędowa została ustalona przez te dwie niezależne grupy badawcze kierowane przez profesorów Andrew V. Schally ego i Rogera Guillemina [6,36], którzy zostali uhonorowani za te badania Nagrodą Nobla w roku Uważano wtedy, że istnieje tylko jedna struktura GnRH u wszystkich zwierząt i u ludzi spełniając jedną rolę fizjologiczną w regulacji uwalniania i biosyntezy LH i FSH z przedniego płata przysadki mózgowej. Podstawowe wiadomości o GnRH i jego receptorze GnRH jest głównym peptydem podwzgórzowym przekazującym dyspozycję nerwową do zapoczątkowania całej skomplikowanej kaskady reakcji wewnątrzkomórkowych po jego związaniu się ze swoistym receptorem na powierzchni komórki przedniej części przysadki. Jest on syntetyzowany jako duża cząsteczka prohormonu w neuronach okolicy przedwzrokowej podwzgórza, a następnie poddany przekształceniom w neuronach z tego dużego prohormonu do aktywnego dekapeptydu przez odpowiednie enzymy do postaci aktywnej, a następnie przechowywany w granulach sekrecyjnych, skąd jest transportowany do zewnętrznej wyniosłości pośrodkowej [34,40]. Peptyd ten jest uwalniany w sposób pulsacyjny, w pulsach zsynchronizowanych, z zakończeń nerwowych, z których przez krążenie wrotne Ssak* pglu His Trp Ser Tyr Gly Leu Arg Pro Gly NH 2 2 Kurczak I pglu His Trp Ser Tyr Gly Leu Gln Pro Gly NH 2 3 Świnka morska pglu Tyr Tyr Ser Tyr Gly Val Arg Pro Gly NH 2 4 Żaba pglu His Trp Ser Tyr Gly Leu Trp Pro Gly NH 2 5 Seabream 2 pglu His Trp Ser Tyr Gly Leu Ser Pro Gly NH 2 6 Łosoś*** pglu His Trp Ser Tyr Gly Trp Leu Pro Gly NH 2 7 Ryżanka jap. 1 pglu His Trp Ser Phe Gly Leu Ser Pro Gly NH 2 8 Zębacz pglu His Trp Ser His Gly Leu Asn Pro Gly NH 2 9 Whitefish pglu His Trp Ser Tyr Gly Met Asn Pro Gly NH 2 10 Śledź pglu His Trp Ser His Gly Leu Ser Pro Gly NH 2 11 Pies morski pglu His Trp Ser His Gly Trp Leu Pro Gly NH 2 12 Minóg morski II pglu His Trp Ser His Gly Trp Phe Pro Gly NH 2 13 Kurczak II** pglu His Trp Ser His Gly Trp Tyr Pro Gly NH 2 14 Minóg morski III pglu His Trp Ser His Gly Trp Lys Pro Gly NH 2 15 Minóg morski I pglu His Tyr Ser Leu Glu Trp Lys Pro Gly NH 2 16 Chelyosoma I pglu His Trp Ser Asp Tyr Phe Lys Pro Gly NH 2 17 Chelyosoma II pglu His Trp Ser Leu Cys His Ala Pro Gly NH 2 18 Żachwa I pglu His Trp Ser Tyr Ala Leu Ser Pro Gly NH 2 19 Żachwa II pglu His Trp Ser Leu Ala Leu Ser Pro Gly NH 2 20 Żachwa III pglu His Trp Ser Asn Gln Leu Thr Pro Gly NH 2 21 Żachwa IV pglu His Trp Ser Tyr Glu Phe Met Pro Gly NH 2 22 Żachwa V pglu His Trp Ser Tyr Glu Tyr Met Pro Gly NH 2 23 Żachwa VI pglu His Trp Ser Lys Gly Tyr Ser Pro Gly NH 2 24 Żachwa VII pglu His Trp Ser Asn Lys Leu Ala Pro Gly NH Ośmiornica pglu Asn Tyr His Phe Ser Asn Gly Trp His Pro Gly NH 2 26 Jeż morski pglu Val His His Arg Phe Ser Gly Trp Arg Pro Gly NH 2 27 Zając morski pglu Asn Tyr His Phe Ser Asn Gly Trp Tyr Ala - NH 2 28 Skałoczep pglu His Tyr His Phe Ser Asn Gly Trp Lys Ser - NH 2 29 Robak morski pglu Ala Tyr His Phe Ser His Gly Trp Phe Pro - NH 2 30 Pijawka pglu Ser Ile His Phe Ser Asn Ser Trp Gln Pro - NH 2 * ssak GnRH mgnrh: GnRH I; ** kurczak II cgnrh II: GnRH II; *** łosoś GnRH sgnrh: GnRH III Ryc. Ryc. 1. Sekwencja 1. Sekwencja reszt aminokwasowych reszt aminokwasowych (w kodzie trzyliterowym) (w naturalnie kodzie występujących trzyliterowym) GnRH, które pojawiły naturalnie się w ciągu występujących 600 mln lat ewolucji GnRH, zwierząt. które Pogrubione pojawiły litery skrótów się aminokwasów w ciągu 600 (lewa mln i prawa lat strona) ewolucji pokazują zachowawcze zwierząt. końcowe Pogrubione reszty NH2- litery i COOH, skrótów które pełnią aminokwasów istotną rolę funkcyjną. (lewa Pozostałe i prawa reszty są albo strona) niezbyt pokazują istotne, albo są zachowawcze ważne tylko dla poszczególnego końcowe receptora reszty GnRH. NH2- GnRH i COOH, są nazwane które tak jak nazwy pełnią gatunkowe istotną zwierząt, rolę u funkcyjną. których były odkryte Pozostałe po raz pierwszy, reszty chociaż są występują albo niezbyt tylko u istotne, jednego gatunku, albo są np. ważne ssaczy GnRH tylko I jest dla powszechnie poszczególnego obecny u płazów receptora i prymitywnych GnRH. ryb ościstych; GnRH kurczęcy są nazwane GnRH II (chicken II) jest tak obecny jak u nazwy większości gatunkowe kręgowców, łącznie zwierząt, z człowiekiem; u których łososiowy były GnRH (GnRH odkryte III) jest po prawdopodobnie raz pierwszy, obecny u chociaż wszystkich ryb występują kostnoszkieletowych nie tylko (wg [40,48] u jednego zmodyfikowano). gatunku, 1) Ryżanka np. japońska ssaczy GnRH ryba, której I długość jest nie powszechnie przekracza 4 cm, charakteryzuje obecny u się płazów krótkim okresem i prymitywnych rozrodu; w 1994 roku ryb 2 samice ościstych; i 2 samce tej ryby kurczęcy odbyły 15-dniową GnRH podróż II w (chicken kosmosie, przystąpiły II) jest do obecny tarła; złożyły u i zapłodniły większości ikrę. Wszystkie kręgowców, osobniki i narybek łącznie wróciły z żywe człowiekiem; na ziemię. 2) Ryba łososiowy z rodziny Sparidae GnRH (Ameryka (GnRH Płn.). Whitefish: III) jest angielska prawdopodobnie nazwa ryby z rodziny obecny Coregonidae. u Numery wszystkich GnRH: 1-15: ryb kręgowce; kostnoszkieletowych 16-24: bezkręgowce, przedstrunowce (Millar i wsp., (Chelyosoma 2004; i Ciona); Roch 25-30: i bezkręgowce: wsp., 2011 ośmiornica zmodyfikowana; głowonóg (Octopus vulgaris); Kochman jeż morski-szkarłupień 2012). 1) (Strongylocentrotus Ryżanka japońska purpuratus); zając ryba, morski której mięczak długość (Aplysia californica); nie przekracza skałoczep mięczak 4 cm, (Lottia charakteryzuje gigantea); robak się morski krótkim pierścienica okresem (Capitella rozrodu; teleta), pijawka w 1994 pierścienica roku (Helobdella 2 samice robusta) i 2 samce tej ryby odbyły 15-dniową podróż w kosmosie, przystąpiły do tarła; złożyły i zapłodniły ikrę. Wszystkie osobniki i narybek wróciły żywe na ziemię. 2) Ryba z rodziny Sparidae (Ameryka Płn.). Whitefish : angielska nazwa ryby z rodziny Coregonidae. Numery GnRH: 1-15: kręgowce; 16-24: bezkręgowce, przedstrunowce (Chelyosoma i Ciona); 25-30: bezkręgowce: ośmiornica głowonóg (Octopus vulgaris); jeż morski-szkarłupień (Strongylocentrotus purpuratus); zając morski mięczak (Aplysia californica); skałoczep mięczak (Lottia gigantea); robak morski pierścienica (Capitella teleta), pijawka pierścienica (Helobdella robusta) 1067
3 Postepy Hig Med Dosw (online), 2013; tom 67: Domeny transmembranowe (TM) bp cdna receptora GnRH typu I człowieka Ekson 1 Ekson 2 Ekson 3 5 UTR 522 bp 220 bp 245 bp 3 UTR 4.2 kb 5 kb Gen receptora GnRH typu I człowieka Ryc. 2. Struktury cdna oraz genu ludzkiego receptora GnRH typu I, który jest zlokalizowany na chromosomie i składa się 3 eksonów przedzielonych dwoma intronami. Ekson 1 zawiera 5 -UTR (region niepodlegający translacji) oraz koduje pierwsze 3 domeny TM (transmembranowe) oraz część czwartej domeny TM. Ekson 2 składa się z 220 par zasad (bp) i koduje pozostałą część czwartej domeny TM, piątą domenę TM oraz część trzeciego wewnątrzkomórkowego zwoju IC. Ekson 3 koduje pozostałe części otwartej ramki odczytu oraz zawiera 3 -UTR (wg [8] zmodyfikowano) co min dostaje się do przedniej części przysadki. Tam stymuluje uwalniane i biosyntezę hormonu luteinizującego (LH) i hormonu dopechęrzykowego (FSH) z gonadotropów po uprzednim związaniu się z receptorem GnRH typu I na błonie komórkowej. Każdy puls GnRH stymuluje sekrecję i biosyntezę LH i FSH [8,40], lecz pulsy FSH są mniej wyraźne. LH jest zgromadzony w przedniej przysadce i zależny od związania się GnRH z receptorem na błonie komórki przysadkowej, z której jest uwalniany. Częstotliwość pulsów jest największa podczas wyrzutu owulacyjnego, a najniższa w czasie fazy lutealnej cyklu płciowego. Zsynchronizowany układ wyrzutu LH i FSH wynika ze zmian pulsów GnRH, modulującego wpływu steroidów gonadowych i hormonów peptydowych na działanie stymulacyjne GnRH oraz różnice w okresie półtrwania tych hormonów [34,40]. W czasie intensywnych badań w latach następnych upewniono się, że istnieje wiele odmian tego peptydu u kręgowców; obecnie zidentyfikowano i określono strukturę 30 różnych struktur GnRH. Spośród nich 15 zostało zidentyfikowanych u kręgowców [40,48], 9 form GnRH zidentyfikowano u przedstrunowców, które są przodkami kręgowców [1,18], a także zidentyfikowano ciekawy homolog GnRH mający 12 reszt aminokwasowych u ośmiornicy oraz 5 GnRH u innych bezkręgowców (ryc. 1) [1,22,48]. Cząsteczki GnRH są obecne w wielu różnych tkankach u kręgowców, pełniąc w nich różne funkcje, łącznie z funkcją neuroendokrynną. Działają w sposób parakrynny w łożysku i gonadach, w sposób autokrynny w neuronach GnRH, komórkach immunogennych oraz pełnią rolę neuroprzekaźników i neuromodulatorów w ośrodkowym i obwodowym układzie nerwowym, np. w zwojach sympatycznych i w śródmózgowiu [40]. Żadna z tych funkcji jednak nie zachodzi przez dostarczenie GnRH do komórki docelowej przez krążenie ogólne. Jedyna postać GnRH byłaby w stanie spełniać wszystkie te funkcje, ale przynajmniej dwie, a nawet trzy różne formy GnRH są obecne u większości kręgowców. GnRH II, wyizolowany początkowo z mózgu kurcząt, jest obecny u zdecydowanej większości gatunków zwierząt. Struktura GnRH II jest zachowana w sposób doskonały w czasie ewolucji i jest obecna u wszystkich gatunków, od ryb kostnoszkieletowych do człowieka. Jest najwcześniej wyewoluowaną postacią, nazwana później GnRH II, podczas gdy GnRH podwzgórzowy został nazwany GnRH I [40]. U większości kręgowców zidentyfikowano również trzecią postać GnRH, bardzo zachowawczą (łososiowy GnRH), a zlokalizowano ją w zakończeniach nerwowych w przednim mózgowiu u ryb kostnoszkieletowych; nazwano ją GnRH III. GnRH III zachował pełną konserwację sekwencji, lecz jest obecny tylko u ryb kostnoszkieletowych, co oznacza, że jego gen został utworzony po ewolucyjnym zróżnicowaniu ryb kostnoszkieletowych i odłączeniu ich od ścieżki ewolucyjnej kręgowców. Należy odnotować interesujący fakt, że w genomie ryby łososiowatej nerki istnieją dwa geny kodujące ten sam GnRH (GnRH III) [40]. Gen receptora GnRH typu I u człowieka jest pojedynczą kopią zlokalizowaną na chromosome 4q21.2 [2,24,33], przeciwnie do większości białek receptorów związanych z białkiem G (GPCR), które są bez intronów, składa się z trzech eksonów oddzielonych od siebie dwoma intronami i zajmuje więcej niż 15 kb wzdłuż chromosomu [8,15] (ryc. 2). Ekson l zawiera region niepodlegający translacji 5 -UTR oraz pierwsze 522 nukleotydy otwartej ramki odczytu, koduje również pierwsze trzy domeny transmembranowe (TM) oraz część czwartej domeny TM. Ekson 2 jest odpowiedzialny za kodowanie następnych 220 nukleotydców w ramce odczytu, zawiera resztę czwartej domeny TM, piątą domenę TM oraz część trzeciego zwoju wewnątrzkomórkowego (IC). Ekson 3 ma resztę sekwencji kodującej oraz 3-UTR. Granice między eksonami i intronami w ludzkim genie receptora GnRH są dobrze zachowane [8]. Pięć miejsc sygnalnych poliadenylacji jest w okolicy bp i stanowią wiązkę ulokowaną w 3 - UTR genu ludzkiego receptora GnRH [15]. 3 -UTR zawiera wiele motywów w sekwencji nukleotydów (ATTTA), które są odpowiedzialne za niestabilność mrna; wykryto je również w wielu innych RNA, które podlegają szybkiej degradacji [17,49]. Wielkość mrna receptora GnRH wnioskowana z długości sekwencji od 5 do 3 -UTR jest około 5,5 kb, co się doskonale zgadza z opisanym dużym transkryptem (4,7-5 kb), który jest tworzony w wyniku ekspresji genu w ludzkiej przedniej przysadce mózgowej [8]. Związanie się liganda (GnRH) do odpowiadającego mu swoistego receptora, należącego do nadrodziny białek związanych z białkiem G - GPCR, takiego jak receptor GnRH, zawierającego siedem domen transmembranowych (TM), wywołuje 1068
4 Kochman K. Cu-GnRH nowy analogon GnRH modyfikację konformacyjną tego receptora po powstaniu kompleksu, a to z kolei pozwala receptorowi na interakcję z białkiem G i na indukcję wymiany nukleotydu guanylowego na podjednostce α białka G i w konsekwencji na uwolnienie podjednostki α oraz βγ od kompleksu receptora z białkiem G. Białko G inicjuje aktywację klasycznych efektorów sygnalizacji wewnątrzkomórkowej, takich jak fosfolipaza C, cyklaza adenylanowa, kanały wapniowe oraz reguluje poziom wewnątrzkomórkowy fosforanów inozytolu, wapnia, cyklicznego AMP oraz wiele innych przenośników sygnałów [34,40]. Siłą napędową badań nad strukturą receptora GnRH i jego interakcji z GnRH jest przekonanie, że taka informacja może dać racjonalną podstawę do stworzenia nowych analogonów GnRH o pożądanych własnościach. Aby zrozumieć własności i zależności struktura-funkcja receptora z cząsteczką GnRH oraz zmiany konformacyjne w rodzinie białek G po związaniu się różnych analogonów GnRH, należało również dokładnie zrozumieć i określić kieszeń wiążącą GnRH w receptorze. Aktywacja receptora wpływa na rotacje helis wewnątrzmembranowych (TM) i ruchy części struktur helis TM 2, 3, 6 i 7. Helisy są mocno upakowane w stanie nieaktywnym, a podlegają rozluźnieniu w czasie aktywacji receptora [40]. Rola miedzi w rozrodzie O potencjalnym znaczeniu jonów miedzi w biochemii peptydów mózgu można wnioskować z faktu, że stężenie tego metalu w zakończeniach aksonów podwzgórzowych jest 1-2 albo więcej razy większe aniżeli w plazmie krwi [37]. Peptydy zawierające resztę histydyny są zwykle bardzo dobrymi ligandami dla jonów metali, a zwłaszcza dla Cu 2+ [35]. W 1936 r. Fevold i wsp. [16] wykryli jako pierwsi, że owulacja może być indukowana przez dożylne wstrzyknięcie soli miedzi. Od tego czasu wielu innych badaczy wykryło, że podanie soli miedzi królikom [14,21,50,51,52] oraz owcom prowadzi do owulacji przez jej działanie na poziomie podwzgórza. Jony miedzi stymulowały uwalniane LH, zarówno podstawowe jak i stymulowane przez GnRH z komórek przysadki niedojrzałych samic szczura in vitro [19]. Miedź jest również bardzo dobrym czynnikiem uwalniającym GnRH z izolowanych granul podwzgórzowych, co potwierdza hipotezę, że miedź wpływa na neurony GnRH, a nie tylko na granule. Barnea i wsp. w serii interesujących badań wykazali znaczenie miedzi w utrzymaniu stabilności podwzgórzowych granul zawierających GnRH i sugerują mechanizm uwalniania GnRH zarówno z wyizolowanych granul oraz z granul w ekplantach podwzgórzowych [3,9]. Inkubacja wyizolowanych granul z Cu-ATP oraz z Mg-ATP oznaczała, że Cu-ATP stymuluje nie tylko uwalnianie GnRH niezależnie od KCl, ale była o wiele bardziej skuteczna od Mg-ATP. Wydaje się więc, że Cu-ATP oraz Mg-ATP mogą działać przez oddzielne mechanizmy w uwalnianiu GnRH [3], a granule sekrecyjne mogą być miejscem działania miedzi [3,4]. Amidacja GnRH Monooksygenaza α-amidująca peptydyloglicyny (PAM) katalizuje reakcję α-amidacji na karboksylowym końcu łańcucha peptydylo-glicyny. W wyniku tej reakcji hormony peptydowe i białkowe, nieaktywne biologicznie, są przekształcane do ich właściwych postaci aktywnych w podwzgórzu i przysadce [44,45]. PAM jest umiejscowiona w komórce głównie w kompleksie Golgiego, jest także białkiem błonowym związanym z granulami zawierającymi peptydy. Reakcja amidacji zachodzi w reakcji dwuetapowej, a katalizacja zachodzi za pośrednictwem jej dwóch enzymów składowych: PHM monooksydazy peptydylo-α-hydroksyglicyny oraz PAL - liazy α-amidującej peptydyloglicylo-α-hydroksyglicyny, które razem noszą nazwę PAM [39]. PyroGlu-His-Trp-Ser-Tyr-Gly-Leu-Arg-Pro-Gly-NH-CH 2 -COO (nieaktywna forma GnRH) 2 Askorbinian 2Cu 2+, O 2 PHM PyroGlu-His-Trp-Ser-Tyr-Gly-Leu-Arg-Pro-Gly-NH-CHOH-COO (GnRH z -hydroksyglicyną) Zn 2+ PAL PyroGlu-His-Trp-Ser-Tyr-Gly-Leu-Arg-Pro-Gly-NH 2 + glioksal (aktywna forma GnRH) Ryc. 3. Amidacja prohormonu GnRH - bardzo ważna dla uzyskania aktywnej cząsteczki GnRH. PHM: monooksydaza peptydyloglycylo-α-hydroksyglicyny; PAL: liaza α-amidująca peptydyloglicylo-α-hydroksyglicyny (wg [39] zmodifikowano) 1069
5 Postepy Hig Med Dosw (online), 2013; tom 67: Pierwszy stopień amidacji zachodzi z udziałem PHM, a drugi stopień jest katalizowany przez PAL. PHM zawiera dwa jony miedzi, które są między Cu 2+ i Cu + stanem utlenienia. Taka struktura sugeruje, że reakcja z udziałem PHM poprzedza aktywację substratu przez tlen związany z miedzią. Enzym PAM zawiera również atom cynku, który jest związany z PAL. Aktywność jego może być ograniczona przez takie czynniki chelatujące jak srebro (Ag) czy EDTA i rekonstytuowana przez dodanie molarnego nadmiaru metali dwuwartościowych (ryc. 3). Aktywność PAM zależy od tlenu cząsteczkowego, askorbinianu i miedzi. Małe stężenia PAM i askorbinianu mogą uczynić reakcję α-amidacji czynnikiem ograniczającym w syntezie biologicznie aktywnego peptydu. Miedź odgrywa istotną rolę w amidacji GnRH i nie może być zastąpiona przez żaden inny metal dwuwartościowy [29,46]. Kompleksy metali z GnRH jako analogony GnRH osiągnięcia polskiej myśli naukowej Znając rezultaty wielu badań dotyczących roli miedzi w reprodukcji oraz badań nad połączeniem miedzi z aminokwasami, dwoje wybitnych polskich uczonych chemików prof. Barbara Rzeszotarska zajmująca się syntezą chemiczną GnRH (Uniwersytet Opolski) i prof. Henryk Kozłowski specjalista od kompleksów miedzi z aminokwasami i peptydami (Uniwersytet Wrocławski) powzięli myśl o syntezie ng/ml poziom LH Ryc. 4. Uwalnianie LH z przysadki do krwi u kastrowanych, potraktowanych uprzednio estradiolem i progesteronem samic szczura in vivo, 15 min po dożylnym wstrzyknięciu GnRH (5 mg) albo kompleksów metali GnRH. 1- sól fizjjologiczna (NaCl); 2 - GnRH (0,1 mg); 3 - GnRH (1 mg); 4 - Cu-GnRH (1 mg); 5 - Cu-GnRH (5 mg); 6 - Ni-GnRH (1 mg); 7 - Ni-GnRH (1 mg); 8 - Zn-GnRH (1 mg); 9 - Zn-GnRH (10 mg); 4-9 vs 1-3 różnica statystycznie istotna ng/ml poziom FSH Ryc. 5. Uwalnianie FSH z przysadki do krwi u kastrowanych samic szczura, potraktowanych uprzednio estradiolem i progesteronem in vivo, 15 min po dożylnym wstrzyknięciu GnRH albo kompleksów metali z GnRH. 1- sól fizjologiczna (NaCl); 2 - GnRH (0,1 mg); 3 - GnRH (1 mg); 4 - Cu-GnRH (1 mg); 5 - Cu-GnRH (5 mg); 6 - Ni-GnRH (1 mg); 7 - Ni-GnRH (5 mg); 8 - Zn-GnRH (1 mg); 9 - Zn-GnRH (10 mg); 4-9 vs 1-3 różnica statystycznie istotna 1070
6 Kochman K. Cu-GnRH nowy analogon GnRH kompleksów GnRH z miedzią, niklem i cynkiem. Pierwsze badania strukturalne i biologiczne wypadły bardzo obiecująco [18,31]. Kompleksy w badaniach in vivo indukowały owulację [18]. Te wyniki oznaczały, że w polskim laboratorium narodził się nowy interesujący analogon GnRH - Cu-GnRH. Wyżej wymienieni uczeni zwrócili się do mnie o dalsze kierowanie tymi badaniami. Dalszym eksperymentem dotyczącym aktywności biologicznej i mocy uwalniającej gonadotropiny przysadkowej była infuzja kompleksów bezpośrednio do przysadki szczurzycy, odpowiednio przygotowanej według metody Ramireza i McCanna, służącej pierwotnie do testowania frakcji przy oczyszczaniu naturalnego GnRH (LHRF). Infuzja doprzysadkowa była opracowana w Instytucie w Jabłonnie przez profesora E. Domańskiego; za pomocą aparatu stereotaktycznego wprowadzono na stałe kaniule do przysadki i po zaleczeniu rany pooperacyjnej użyto do eksperymentu. Rezultaty badań wykazały pełną aktywność uwalniającą LH przez kompleksy metali z GnRH, a zwłaszcza Cu-GnRH, którego siła uwalniania LH była większa od natywnego GnRH. W następnym doświadczeniu, samicom owariektomizowanym i potraktowanym uprzednio estradiolem i progesteronem, aby zahamować uwalnianie endogennego GnRH, wstrzykiwano GnRH, Cu-GnRH, Ni-GnRH albo Zn-GnRH, aby po 15 minutach od dożylnego wstrzyknięcia pobrać krew i w niej oznaczyć, już nową metodą radioimmunologiczną, LH i FSH (ryc. 4 i 5). Wyniki tych badań wskazują, że uwalnianie LH i FSH przez Cu-GnRH było znacznie wyższe aniżeli przez natywny GnRH; Ni-GnRH wykazuje również moc uwalniającą chociaż znacznie niższą od Cu-GnRH [30]. LH (% zawartości podstawowej) 250 kontrola GnRH Cu-GnRH 200 Ni-GnRH Czas inkubacji, min Ryc. 6. Uwalnianie LH z komórek przedniej części przysadki przez GnRH, Cu- GnRH oraz Ni-GnRH w stosunku do czasu inkubacji. Dane przedstawiają średnią ±SEM; *P<0,05; **P<0,01 Eksperymenty przeprowadzone na dużych grupach zwierząt i przy precyzyjnym oznaczeniu RIA hormonów ostatecznie potwierdziły dużą aktywność uwalniającą gonadotropiny przez kompleksy, a zwłaszcza dużą moc uwalniającą LH przez Cu-GnRH. W serii badań nad uwalnianiem LH z komórek przysadkowych stwierdzono aktywność uwalniającą kompleksów metali, a zwłaszcza aktywność Cu-GnRH (ryc. 6). W dalszych naszych badaniach nad wiązaniem się kompleksów metali z receptorem wykazaliśmy, że kompleks Cu-GnRH wiązał się do receptora z większym powinowactwem w porównaniu z naturalnym dekapeptydem GnRH, natomiast kompleks Ni-GnRH wiązał się z receptorami przysadkowymi z mniejszym powinowactwem [29]. Dalsze badania wiązania się badanych kompleksów do receptora przysadki owcy wykazały, że agonista GnRH buserelina (D-Ser-(tBu) 6 -Pro 9 -NHEt)-GnRH współzawodniczy z GnRH o swoiste miejsca wiążące receptora. Gdy porównywano kompleksy meta1-gnrh z wolnym GnRH stwierdzono, że wolny hormon i kompleks nikiel(ii) oraz kobalt(ii) wykazują mniejsze powinowactwo do receptora aniżeli Cu-GnRH [11]. Wyniki tych badań uzasadniają i poszerzają wcześniejsze wyniki, wykonane w badaniach z użyciem receptora przysadki szczura, owcy i świni [11,29,42] i ostatecznie dowodzą, że jony metali pełnią istotną rolę w modulacji aktywności biologicznej hormonu GnRH. W dalszych badaniach stwierdziliśmy, że kompleksy metali wykazywały inny profil sygnalizacji wewnątrzkomórkowej aniżeli natywny GnRH (ryc. 7 i 8). GnRH generował głównie syntezę fosforanu inozytolu w komórkach przysadki, natomiast wewnątrzkomórkowa synteza camp była znacznie podwyższona po stymulacji komórek przysadkowych przez kompleksy metali z GnRH, a szczególnie przez Cu-GnRH [5,27]. Stwierdziliśmy także, że kompleksy GnRH nie generowały desensytyzacji receptora po dłuższym czasie działania. Cu-GnRH odznacza się także znacznie większą stabilnością i mniejszą podatnością na degradację enzymatyczną [20]. Badania strukturalne kompleksów miedzi i niklu z GnRH Podjęto wnikliwe badania strukturalne kompleksów Cu- -GnRH oraz Ni-GnRH [42,43]. Badania z zastosowaniem jądrowego rezonansu magnetycznego (MR) oraz nowoczesnej metodyki pamięci molekularnej (MM), wykonane w ramach międzyrządowego porozumienia naukowego polsko-japońskiego; pozwoliły ujawnić obecność dwóch domen strukturalnych w cząsteczce natywnego GnRH, których orientacja przestrzenna jest modulowana przez dużą mobilność glicyny w pozycji 6 sekwencji. Utworzenie się kompleksów metali z GnRH zostało potwierdzone przez pomiar spektrum metodą MALDI-TOF- MAS. Z tych pomiarów wynika, że kompleks 1:1 Cu(II)-GnRH (m/z = 1245) jest najbardziej stabilny ze wszystkich trzech możliwych kompleksów metalu z GnRH, wnioskując z intensywności występujących szczytów. Utworzenie stabilnej formacji kompleksu 1:1 Cu(II) GnRH zostało również potwierdzone przez badania spektrum masowego FAB (m/z = 1244). Metastabilne sygnały odpowiadające [GnRH)n-Cu] m+ (n, m # 1) nie były obserwowane, co sugeruje, że stosunek wiązania GnRH z miedzią (II) jest 1:1. Wiązanie się GnRH z jonami metalu było również monitorowane przez spektroskopię 1 HNMR. Sygnały protonów z GnRH znacznie się rozszerzały ze zwiększającym się stężeniem jonów Cu(II), aż do stosunku 1:1 GnRH i Cu(II), podczas gdy rozszerzenie się sygnału nie zwiększa się już, gdy stosunek sięga już 1:1. To oznacza, że stosunek wiązania metalu 1071
7 Postepy Hig Med Dosw (online), 2013; tom 67: IP (% zawartości podstawowej) camp (% zawartości podstawowej) kontrola GnRH Cu-GnRH Ni-GnRH Ryc. 7. Wewnątrzkomórkowa synteza fosforanu inozytolu (IP) w komórkach przysadki po 30 min inkubacji z GnRH, Cu-GnRH oraz Ni-GnRH. Stężenia wszystkich peptydów wynosiły 10-7 M. Dane przedstawiają średnią ±SEM; *P<0,05 kontrola GnRH Cu-GnRH Ni-GnRH Forskolina Ryc. 8. Akumulacja wewnątrzkomórkowa camp w komórkach przysadki po inkubacji z GnRH, Cu-GnRH oraz Ni-GnRH. Wszystkie peptydy w stężeniu 10-7 M. Forskolina (10 mm użyta jako pozytywna kontrola). Dane przedstawiają średnią ±SEM; *P<0,05; ***P<0,001 do GnRH jest 1:1, co jest zgodne z rezultatami otrzymanymi z zastosowaniem metody MALDI-TOFMAS. Aby określić stosunek wiązania GnRH i jonu miedzi (II), zastosowano metodę ciągłych zmian, którą dostosowano do pomiarów systemu metal-peptyd. Wynik maksimum około X = 0,5 oznacza, że stosunek wiązania jest 1:1. Ten wynik jest zgodny z pomiarami metodami MALDI-TOFMAS i 1 HNMR. Reszta imidazolowa His jest głównym miejscem wiązania jonu Cu(II), więc struktura kompleksu między PyroGlu- -His-Trp-NHCH 3 i jonem metalu została określona przez obliczenia metodą pamięci cząsteczkowej 3(MM3), chociaż nie została doprowadzona idealnie do warunków optymalnych. Możliwe są trzy miejsca koordynacji: azot imidozolu (N - w pozycji 1) reszty histydyny, deprotonowanej azot amidowy (N - ) reszty histydyny oraz deprotonowany azot (N - ) amidowy pierścienia kwasu pyroglutaminowego. Czwartym miejscem koordynacji może być tlen (O) cząsteczki wody. Jak wiadomo, dla kompleksów Cu(II) konfiguracja kwadratowa płaska jest faworyzowana. W istocie, kompleks pokazany na ryc. 9 ma taką konfigurację kwadratową płaską [42,43]. Badania strukturalne kompleksu Ni-GnRH wykonano mierząc spektra 1 H-NMR dla GnRH w DM S O przez eksperymenty TOCS4 i ROES4 [11] i są zgodne z danymi dotychczas opublikowanymi [7]. Zaobserwowane metodą ROES4, zachodzące na siebie piki były użyte jako wyznaczniki w obliczeniach dynamiki molekularnej wykonanej za pomocą programu DYANA [11]. Obliczone struktury pokazano na ryc. 10 i 11. Nałożenie szkieletów z 30 najlepszych wyników struktur otrzymanych metodą DYANA pokazuje ogólną tendencję konformacyjną, ale jest względnie słabe, jak to wykazano przez duże wartości średniej RMSD (0,188 ± 0,74 nm dla szkieletu oraz 0,206 ± 0,101 nm dla atomów ciężkich). Otrzymano dokładny wgląd w strukturę przez wzajemne nakładanie obwodów końców łańcucha peptydu. Peptyd jest ułożony strukturalnie prawidłowo na obu końcach, a nieuporządkowanie pochodzi od glicyny w pozycji 6. Mię- Ryc. 10. Struktura Ni-GnRH o najniższej energii. Obliczone struktury z N-końca łańcucha, 4N obliczone w sferze koordynacyjnej jonów Ni w Ni-GnRH A B Ryc. 9. Struktura kompleksu PyroGlu-His-Trp-NHCH 3 i miedzi Cu(II) obliczona metodą pamięci cząsteczkowej - MM3 Ryc. 11. Trzydzieści nakładających się na siebie struktur N-końca łańcucha (A) i C-końca łańcucha (B) części kompleksu peptydu Ni-GnRH 1072
8 Kochman K. Cu-GnRH nowy analogon GnRH dzycząsteczkowe zachodzenie na siebie pików ROES4 wykryto wcześniej dla obu końców [7] oraz wokół Gly-6, co może spowodować utratę struktury wymuszonej; stwierdzono dużą mobilność Gly-6, a Cα stwierdzoną poprzednio [12] w sytuacji małej mobilności węgli szkieletu Cα reszt aromatycznych [13]. Wzajemna orientacja części struktur może być modulowana przez mobilność szkieletu przy Gly-6. Taka mobilność wydaje się istotna w konformacyjnym dostosowaniu się do peptydu w miejscu wiązania się z receptorem, jak to sugeruje dramatyczna zmiana aktywności po zastąpieniu Gly-6 przez inny aminokwas [10,23,32,41,47]. Wyraźnie określona wzajemna orientacja pierścieni wewnątrz N - końca łańcucha w tych badaniach nie może być przesadnie korzystnie interpretowana z następujących powodów: 1. Wszystkie możliwe zachodzące na siebie piki wewnątrzcząsteczkowe zostały przekształcone w wymuszone odległości; wśród nich niektóre, takie jak HN- H α albo H α - H β, dają bardzo wyraźne odległości i są po prostu odbiciem średniej konformacji. 2. Te same przymusowe ograniczenia nie są w sprzeczności z innymi, ponieważ odnoszą się one do peryferyjnych części peptydu, które samoistnie mają wyższy stopień swobody poruszania się [11]. Uporządkowanie w łańcuchach bocznych stosunkowo małego peptydu, należy interpretować jako strukturę średnią, gdzie mobilność moduluje względne orientacje pierścieni do siebie. Średnia struktura jest jednak całkowicie wystarczająca, aby wytłumaczyć szeroki szczyt wykryty dla H 4 histydyny. Takie rozszerzenie szczytu może być wyjaśnione tylko przez wymianę konformacyjną, w skali czasu milisekundy, dając rozkład wielkości przestrzennej zbliżony do wielkości rzeczywistej T 2. Obecność wymiany w tej skali, pokazuje ukształtowanie interakcji wewnątrzcząsteczkowej, która z kolei wyjaśnia znaczenie His-2 dla aktywności biologicznej cząsteczki Ni-GnRH [10,12,23,32,41,47]. Podsumowanie Metale skompleksowane z GnRH [Cu(II)], [Ni(II)], [Co(II)] i [Zn(II)] wywierają istotny modulujący wpływ na wiązanie GnRH z jego receptorem. Kompleks z miedzią dzia- ła na receptor jako rozbudowany agonista, natomiast wpływ [Ni(II)], [Co(II)] i [Zn(II)] w kompleksie działają mniej zdecydowanie jako agoniści. Zmieniają one również ścieżki sygnalizacji wewnątrzkomórkowej przez receptor i z tego względu mogą być uważane jako ważne analogony GnRH, zarówno w badaniach nad zróżnicowanym działaniem receptora na sygnalizację w komórce i końcowy efekt fizjologiczny oraz oczekują na zastosowanie ich w klinice po podjęciu badań testowych i klinicznych w tym zakresie. Współpraca w realizacji badań Instytut Fizjologii i Żywienia Zwierząt im. Jana Kielanowskiego Polskiej Akademii Nauk, Jabłonna: Prof. dr hab. Kazimierz Kochman, Dr hab. Alina Gajewska, prof. nadzw., Dr Anna Michaluk, Mgr Helena Kochman Uniwersytet Wrocławski, Wydział Chemii: Prof. dr hab. Henryk Kozłowski, Dr Kinga Kulon Wyższa Szkoła Pedagogiczna w Opolu, Katedra Chemii (obecnie Uniwersytet Opolski): Prof. dr hab. Barbara Rzeszotarska, Dr Elżbieta Masiukiewicz Uniwersytet Warmińsko-Mazurski, Katedra Fizjologii: Prof. dr hab. Jadwiga Przała, Dr Iwona Bogacka, Dr Gabriela Siawrys Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie: Prof. dr hab. Adam Zięcik, Prof. dr hab. Agnieszka Blitek, Dr Monika Kaczmarek Instytut Genetyki i Hodowli Zwierząt PAN w Jastrzębcu: Prof. Lech Zwierzchowski, Dr Dagmara Robakowska-Hyżorek, Dr Paweł Lisowski Physiologie de l axe gonadotrope, Unité de Biologie Fonctionnelle et Adaptative, Université Paris, France: Prof. Raymond Counis Institute for Biological Resources and Functions, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Japan: Prof. Hiroaki Okuno, Dr Masato Kodaka, Dr Kazuhiko Nakamura Podziękowanie Składam serdeczne podziękowania Prof. Henrykowi Kozłowskiemu z Uniwersytetu Wrocławskiego za krytyczne przeczytanie manuskryptu i cenne uwagi. Piśmiennictwo [1] Adams B.A., Tello J.A., Erchegyi J., Warby C., Hong D.J., Akinsanya K.O., Mackie G.O., Vale W., Rivier J.E., Sherwood N.M.: Six novel gonadotropin-releasing hormones are encoded as triplets on each of two genes in the protochordate, Ciona intestinalis. Endocrinology, 2003; 144: [2] Albarracin C.T., Kaiser U.B., Chin W.W.: Isolation and characterization of the 5 -flanking region of the mouse gonadotropin-releasing hormone receptor gene. Endocrinology, 1994; 135: [3] Barnea A., Cho G.: Evidence that copper-amino acid complexes are potent stimulators of the release of luteinizing hormone-releasing hormone from isolated hypothalamic granules. Endocrinology, 1984; 115: [4] Barnea A., Colombani-Vidal M.: A ligand-specific action of chelated copper on hypothalamic neurons: Stimulation of the release of luteinizing hormone-releasing hormone from median eminence explants. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1984; 81: [5] Blitek A., Zięcik A., Gajewska A., Kodaka M., Counis R., Kochman K.: Cobalt complex with GnRH stimulates the LH release and PKA signaling pathway in pig anterior pituitary cells in vitro. Brain Res. Bull., 2005; 65: [6] Burgus R., Butcher M., Amoss M., Ling N., Monahan M., Rivier J., Fellows R., Blackwell R., Vale W., Guillemin R.: Primary structure of the ovine hypothalamic luteinizing hormone-releasing factor (LRF) (LH- -hypothalamus-lrf-gas chromatography-mass spectrometry-decapeptide-edman degradation). Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1972; 69:
9 Postepy Hig Med Dosw (online), 2013; tom 67: [7] Calzolai L., Gaggelli E., Valensin G., Maccotta A.: NMR studies of the luteinizing hormone-releasing hormone (LH-RH) decapeptide in DMSO solution. Magn. Reson. Chem., 1994; 32: [8] Cheng C.K., Leung P.C.: Molecular biology of gonadotropin-releasing hormone (GnRH)-I, GnRH-II, and their receptors in humans. Endocr. Rev., 2005; 26: [9] Colombani-Vidal M., Barnea A.: Copper stimulation of LHRH release from median eminence explants. I. A divalent metal specific process that does not require extracellular calcium. Neuroendocrinology, 1986; 43: [10] Coy D.H., Labrie F., Savary M., Coy E.J., Schally A.V.: LH-releasing activity of potent LH-RH analogs in vitro. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1975; 67: [11] D Amelio N., Gaggelli E., Gajewska A., Kochman H., Kochman K., Kozłowski H., Latajka Z., Młynarz P., Panek J., Valensin G.: Structural analysis and sheep pituitary receptor binding of GnRH and its complexes with metal ions. J. Inorg. Biochem., 2003; 94: [12] Deslauriers R., Levy G.C., McGregor W.H., Sarantakis K., Smith I.C.: Conformational flexibility of luteinizing hormone-releasing hormone in aqueous solution. A carbon-13 spin-lattice relaxation time study. Biochemistry, 1975; 14: [13] Deslauriers R., Somorjai R.L.: Internal rotations of side chains and backbone in luteinizing hormone-releasing hormone (LH-RH). Analysis of carbon-13 spin-lattice relaxation times. J. Am. Chem. Soc., 1976; 98: [14] Donley S.A., Ilagan B.J., Rim H., Linder M.C.: Copper transport to mammary gland and milk during lactation in rats. Am. J. Physiol. Endocrinol. Metabol., 2002; 283: E667-E675 [15] Fan N.C., Peng C., Krisinger J., Leung P.C.: The human gonadotropin-releasing hormone receptor gene: complete structure including multiple promoters, transcription initiation sites, and polyadenylation signals. Mol. Cell. Endocrinol., 1995; 107: R1-R8 [16] Fevold H.L., Hisaw F.L., Greep R.: Augmentation of the gonad- -stimulating action of pituitary extracts by inorganic substances, particularly copper salts. Am. J. Physiol., 1936; 117: [17] Gay E., Babajko S.: AUUUA sequences compromise human insulin-like growth factor binding protein-1 mrna stability. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2000; 267: [18] Gerega K., Kozlowski H., Masiukiewicz E., Pettit L.D., Pyburn S., Rzeszotarska B.: Metal complexes of luteinizing hormone-releasing hormone (LHRH). Potentiometric and spectroscopic studies. J. Inorg. Biochem., 1988; 33: [19] Hazum E.: Copper and thiol regulation of gonadotropin releasing hormone binding and luteinizing hormone release. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1983; 112: [20] Herman A., Kozłowski H., Czauderna M., Kochman K., Kulon K., Gajewska A.: Gonadoliberin (GnRH) and its copper complex (Cu- -GnRH) enzymatic degradation in hypothalamic and pituitary tissue in vitro. J. Physiol. Pharmacol., 2012; 63: [21] Hiroi M., Sugita S., Suzuki M.: Ovulation induced by implantation of cupric sulfate into the brain of the rabbit. Endocrinology, 1965; 77: [22] Iwakoshi E., Takuwa-Kuroda K., Fujisawa Y., Hisada M., Ukena K., Tsutsui K., Minakata H.: Isolation and characterization of a GnRH-like peptide from Octopus vulgaris. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2002; 291: [23] Janecka A., Janecki T., Bowers C.Y., Folkers K.: New, highly active antagonists of LHRH with acylated lysine and p-aminophenylalanine in positions 5 and 6. Int. J. Pept. Protein Res., 1994; 44: [24] Kakar S.S.: Molecular structure of the human gonadotropin-releasing hormone receptor gene. Eur. J. Endocrinol., 1997; 137: [25] Kochman K.: Some biochemical properties of LH-releasing factor from ovine hypothalamus. Third International FEBS Meeting, Warsaw 4-7 April, Book of Abstracts, Abstract F 302, p. 333 [26] Kochman K.: Purification and properties of LH and FSH releasing factor from ovine hypothalamus. PhD. Thesis. Institute of Applied Biology, Polish Academy of Sciences (Cracow), 1969 [27] Kochman K., Blitek A., Kaczmarek M., Gajewska A., Siawrys G., Counis R., Zięcik A.J.: Different signaling in pig anterior pituitary cells by GnRH and its complexes with copper and nickel. Neuro Endocrinol. Lett., 2005; 26: [28] Kochman K., Domanski E.: Studies on purification of the hypothalamic substances responsible for the release of gonadotropins from the pituitary gland. Acta Physiol. Pol., 1969; 20: [29] Kochman K., Gajewska A., Kochman H., Kozłowski H., Masiukiewicz E., Rzeszotarska B.: Binding of Cu2+, Zn2+, and Ni2+-GnRH complexes with the rat pituitary receptor. J. Inorg. Biochem., 1997; 65: [30] Kochman K., Gajewska A., Kozłowski H., Masiukiewicz E., Rzeszotarska B.: Increased LH and FSH release from the anterior pituitary of ovariectomized rat, in vivo, by copper-, nickel-, and zinc-lhrh complexes. J. Inorg. Biochem., 1992; 48: [31] Kozłowski H., Masiukiewicz E., Rzeszotarska B., Potargowicz E., Walczewska-Sumorok A.: Ovulation-inducing activity of luliberin (LHRH) complexed by copper(ii), nickel(ii), and zinc(ii) ions. J. Inorg. Biochem., 1990; 40: [32] Kutscher B., Bernd M., Beckers T., Polymeropoulos E.E., Engel J.: Chemistry and molecular biology in the search of new LHRH antagonists. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 1997; 36: [33] Leung P.C., Squire J., Peng C., Fan N., Hayden M.R., Olofsson J.I.: Mapping of the gonadotropin-releasing hormone (GnRH) receptor gene to human chromosome 4q21.2 by fluorescence in situ hybridization. Mamm. Genome, 1995; 6: [34] Liu F., Usui I., Evans L.G., Austin D.A., Mellon P.L., Olefsky J.M., Webster N.J.: Involvement of both Gq/11 and Gs proteins in gonadotropin-releasing hormone receptor-mediated signaling in LβT2 cells. J. Biol. Chem., 2002; 277: [35] Livera C.E., Pettit L.D., Bataille M., Perly B., Kozłowski H., Radomska B.: J. Chem. Soc. Dalton Trans., 1987; 16: [36] Matsuo H., Baba Y., Nair R.M., Arimura A., Schally A.V.: Structure of the porcine LH- and FSH-releasing hormone. I. The proposed amino acid sequence. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1971; 43: [37] Merriam G.R., Nunnelley L.L., Trish J.W., Naftolin F.: Sex-related and cyclic variation of trace elements in rat hypothalamus and pituitary. Brain Res., 1979; 171: [38] Michaluk A., Blitek A., Gajewska A., Kaczmarek M.M., Gromadzka-Hliwa K., Kochman H., Ziecik A.J., Kochman K.: LH release by Cu and Ni salts and metal GnRH complexes, in vitro. Neuro Endocrinol. Lett., 2006; 27: [39] Michaluk A., Kochman K.: Involvement of copper in female reproduction. Reprod. Biol., 2007; 7: [40] Millar R.P., Lu Z.L., Pawson A.J., Flanagan C.A., Morgan K., Maudsley S.R.: Gonadotropin-releasing hormone receptors. Endocr. Rev., 2004; 25: [41] Monahan M.W., Amoss M.S., Anderson H.A, Vale W.: Synthetic analogs of the hypothalamic luteinizing hormone releasing factor with increased agonist or antagonist properties. Biochemistry, 1973; 12: [42] Nakamura K., El-Mehasseb I.M., Kodaka M., Okuno H., Kozłowski H., Gajewska A., Kochman H., Kochman K.: Structural and receptor binding analysis of Cu-GnRH, Ni-GnRH and Co-GnRH complexes. Central European Conference of Neurobiology, Cracow, August 11-15, 2001, Abstract 14, p
10 Kochman K. Cu-GnRH nowy analogon GnRH [43] Nakamura K., Kodaka M., El-Mehasseb I.M., Gajewska A., Okuno H., Ochwanowska E., Witek B., Kozłowski H., Kochman K.: Further structural analysis of GnRH complexes with metal ions. Neuro Endocrinol. Lett., 2005; 26: [44] O Donnel P.J., Driscoll W.J., Bäck N., Muth E., Mueller G.P.: Peptidylglycine-α-amidating monooxygenase and pro-atrial natriuretic peptide constitute the major membrane-associated proteins of rat atrial secretory granules. J. Mol. Cell. Cardiol., 2003; 35: [45] Prigge S.T., Kolhekar A.S., Eipper B.A., Mains R.E., Amzel L.M.: Amidation of bioactive peptides: the structure of peptidylglycine-αhydroxylating monooxygenase. Science, 1997; 278: [46] Prigge S.T., Mains R.E., Eipper B.A., Amzel L.M.: New insights into copper monooxygenases and peptide amidation: structure, mechanism and function. Cel. Mol. Life Sci., 2000; 57: [47] Rivier J., Vale W., Burgus R., Ling N., Amoss M., Blackwell R., Guillemin J.: Synthetic luteinizing hormone releasing factor analogs. Series of short-chain amide LRF homologs converging to the amino terminus. J. Med. Chem., 1973; 16: [48] Roch G.J., Busby E.R., Sherwood N.M.: Evolution of GnRH: diving deeper. Gen. Comp. Endocrinol., 2011; 171: 1-16 [49] Ross J.: Control of messenger RNA stability in higher eukaryotes. Trends Genet., 1996; 12: [50] Suzuki M., Tnemoto Y., Takahashi K.: The effect of copper salt on ovulation, especially on hypothalamic ovulatory hormone releasing factor. Tohoku J. Exp. Med., 1972; 108: 9-18 [51] Suzuki M., Watanabe S., Hoshii M.: Effect of estrogen on copper induced ovulation in the rabbit. Endocrinology, 1965; 76: [52] Tsou R.C., Dailey R.A., McLanahan C.S., Parent A.D., Tindall G.T., Neill J.D.: Luteinizing hormone releasing hormone (LHRH) levels in pituitary stalk plasma during the preovulatory gonadotropin surge of rabbits. Endocrinology, 1977; 101: Autor deklaruje brak potencjalnych konfliktów interesów. 1075
Chemiczne składniki komórek
Chemiczne składniki komórek Pierwiastki chemiczne w komórkach: - makroelementy (pierwiastki biogenne) H, O, C, N, S, P Ca, Mg, K, Na, Cl >1% suchej masy - mikroelementy Fe, Cu, Mn, Mo, B, Zn, Co, J, F
40-lecie ustalenia struktury pierwszorzędowej GnRH 100-lecie urodzin prof. Eugeniusza Domańskiego 90-lecie urodzin prof.
NAUKA 3/2012 141-154 KAZIMIERZ KOCHMAN GnRH i jego receptor 40-lecie ustalenia struktury pierwszorzędowej GnRH 100-lecie urodzin prof. Eugeniusza Domańskiego 90-lecie urodzin prof. Mariana Jutisza Wstęp
Przegląd budowy i funkcji białek
Przegląd budowy i funkcji białek Co piszą o białkach? Wyraz wprowadzony przez Jönsa J. Berzeliusa w 1883 r. w celu podkreślenia znaczenia tej grupy związków. Termin pochodzi od greckiego słowa proteios,
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski. Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul. Smętna 12, Kraków Plan prezentacji: Cel naukowy Podstawy teoretyczne Przyjęta metodyka
Informacje. W sprawach organizacyjnych Slajdy z wykładów
Biochemia Informacje W sprawach organizacyjnych malgorzata.dutkiewicz@wum.edu.pl Slajdy z wykładów www.takao.pl W sprawach merytorycznych Takao Ishikawa (takao@biol.uw.edu.pl) Kiedy? Co? Kto? 24 lutego
21. Wstęp do chemii a-aminokwasów
21. Wstęp do chemii a-aminokwasów Chemia rganiczna, dr hab. inż. Mariola Koszytkowska-Stawińska, WChem PW; 2016/2017 1 21.1. Budowa ogólna a-aminokwasów i klasyfikacja peptydów H 2 N H kwas 2-aminooctowy
etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy
Temat: Białka Aminy Pochodne węglowodorów zawierające grupę NH 2 Wzór ogólny amin: R NH 2 Przykład: CH 3 -CH 2 -NH 2 etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy
Struktura biomakromolekuł chemia biologiczna III rok
truktura biomakromolekuł chemia biologiczna III rok jak są zbudowane białka? dlaczego białka są tak zbudowane? co z tego wynika? 508 13 604 liczba struktur dostępnych w Protein Data Bank wynosi aktualnie
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 4 Jak działają geny?
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
Badanie oddziaływania polihistydynowych cyklopeptydów z jonami Cu 2+ i Zn 2+ w aspekcie projektowania mimetyków SOD
Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Analityki Medycznej Badanie oddziaływania polihistydynowych cyklopeptydów z jonami Cu 2+ i Zn 2+ w aspekcie projektowania mimetyków SOD Aleksandra Kotynia PRACA DOKTORSKA
46 i 47. Wstęp do chemii -aminokwasów
46 i 47. Wstęp do chemii -aminokwasów Chemia rganiczna, dr hab. inż. Mariola Koszytkowska-Stawińska, WChem PW; 2017/2018 1 21.1. Budowa ogólna -aminokwasów i klasyfikacja peptydów H 2 H H 2 R H R R 1 H
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Wpływ heterocyklicznego ugrupowania na natywną konformację naturalnych peptydów
Wpływ heterocyklicznego ugrupowania na natywną konformację naturalnych peptydów Monika Staś, Dawid Siodłak, Małgorzata Broda mstas@uni.opole.pl Zakład Chemii Fizycznej i Modelowania Molekularnego Wydział
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
Bioinformatyka wykład 9
Bioinformatyka wykład 9 14.XII.21 białkowa bioinformatyka strukturalna krzysztof_pawlowski@sggw.pl 211-1-17 1 Plan wykładu struktury białek dlaczego? struktury białek geometria i fizyka modyfikacje kowalencyjne
Nukleotydy w układach biologicznych
Nukleotydy w układach biologicznych Schemat 1. Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy Schemat 2. Dinukleotyd NADP + Dinukleotydy NAD +, NADP + i FAD uczestniczą w procesach biochemicznych, w trakcie których
Komputerowe wspomaganie projektowanie leków
Komputerowe wspomaganie projektowanie leków wykład VI Prof. dr hab. Sławomir Filipek Grupa BIOmodelowania Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii oraz Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych Cent-III www.biomodellab.eu
Komputerowe wspomaganie projektowanie leków
Komputerowe wspomaganie projektowanie leków wykład II Prof. dr hab. Sławomir Filipek Grupa BIOmodelowania Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii oraz Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych Cent-III www.biomodellab.eu
Wielofunkcyjne bialko CBC dynamika wiazania konca 5 mrna
Wielofunkcyjne bialko CBC dynamika wiazania konca 5 mrna Ryszard Stolarski UNIWERSYTET WARSZAWSKI Wydzial Fizyki, Instytut Fizyki Doswiadczalnej, Zaklad Biofizyki ul. Zwirki i Wigury 93, 02-089 Warszawa
Dr hab. Marek Lisowski Wrocław, tel.:
Dr hab. Marek Lisowski Wrocław, 20.03.2018 tel.: 71 375 7384 e-mail: marek.lisowski@chem.uni.wroc.pl Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Aleksandry Banaszczyk pt. Kompleksy platyny(ii) z ligandami receptorów
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
SEMINARIUM 8:
SEMINARIUM 8: 24.11. 2016 Mikroelementy i pierwiastki śladowe, definicje, udział w metabolizmie ustroju reakcje biochemiczne zależne od aktywacji/inhibicji przy udziale mikroelementów i pierwiastków śladowych,
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
Hormony Gruczoły dokrewne
Hormony Gruczoły dokrewne Dr n. biol. Urszula Wasik Zakład Biologii Medycznej HORMON Przekazuje informacje między poszczególnymi organami regulują wzrost, rozwój organizmu efekt biologiczny - niewielkie
katedra fizjologii i biochemii zwierząt
katedra fizjologii i biochemii zwierząt RYS HISTORYCZNY Powstanie Katedry 1951 r Z chwilą utworzenia Wydziału Zootechnicznego Wyższej Szkoły Rolniczej w Poznaniu (rozporządzenie Ministra Szkół Wyższych
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg
STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
Budowa aminokwasów i białek
Biofizyka Ćwiczenia 1. E. Banachowicz Zakład Biofizyki Molekularnej IF UAM http://www.amu.edu.pl/~ewas Budowa aminokwasów i białek E.Banachowicz 1 Ogólna budowa aminokwasów α w neutralnym p α N 2 COO N
LECZENIE PRZEDWCZESNEGO DOJRZEWANIA PŁCIOWEGO U DZIECI
Załącznik nr 11 do zarządzenia Nr 59/2011/DGL Prezesa NFZ z dnia 10 października 2011 r. Nazwa programu: LECZENIE PRZEDWCZESNEGO DOJRZEWANIA PŁCIOWEGO U DZIECI ICD-10 E 22.8 Przedwczesne dojrzewanie płciowe
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski michal.michalowski@uwr.edu.pl michaladamichalowski@gmail.com michal.michalowski@uwr.edu.pl https://mmichalowskiuwr.wordpress.com/
Kombinatoryczna analiza widm 2D-NOESY w spektroskopii Magnetycznego Rezonansu Jądrowego cząsteczek RNA. Marta Szachniuk
Kombinatoryczna analiza widm 2D-NOESY w spektroskopii Magnetycznego Rezonansu Jądrowego cząsteczek RNA Marta Szachniuk Plan prezentacji Wprowadzenie do tematyki badań Teoretyczny model problemu Złożoność
-1- Preparat o właściwościach immunoregulatorowych
-1- Preparat o właściwościach immunoregulatorowych Przedmiotem wynalazku jest preparat o właściwościach immunoregulatorowych. Wynalazek może znaleźć zastosowanie w przemyśle spożywczym i farmaceutycznym,
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
Joanna Bereta, Aleksander Ko j Zarys biochemii. Seria Wydawnicza Wydziału Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego
Joanna Bereta, Aleksander Ko j Zarys biochemii Seria Wydawnicza Wydziału Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego Copyright by Wydział Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii
Substancje o Znaczeniu Biologicznym
Substancje o Znaczeniu Biologicznym Tłuszcze Jadalne są to tłuszcze, które może spożywać człowiek. Stanowią ważny, wysokoenergetyczny składnik diety. Z chemicznego punktu widzenia głównym składnikiem tłuszczów
Wpływ niektórych czynników na skład chemiczny ziarna pszenicy jarej
NR 218/219 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 21 SZYMON DZIAMBA IZABELLA JACKOWSKA 1 Katedra Szczegółowej Uprawy Roślin 1 Katedra Chemii Akademia Rolnicza w Lublinie Wpływ niektórych czynników
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Priony. co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski
Priony co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski Choroba Kreutzfeldta-Jakoba Pierwsze opisy pochodzą z lat 30. XX wieku Zakaźna choroba, często rodzinna
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
Zadanie 1. [ 3 pkt.] Uzupełnij zdania, wpisując brakującą informację z odpowiednimi jednostkami.
Zadanie 1. [ 3 pkt.] Uzupełnij zdania, wpisując brakującą informację z odpowiednimi jednostkami. I. Gęstość propanu w warunkach normalnych wynosi II. Jeżeli stężenie procentowe nasyconego roztworu pewnej
Struktura i funkcja białek (I mgr)
Struktura i funkcja białek (I mgr) Dr Filip Jeleń fj@protein.pl http://www.protein.pl/ Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer Biochemia Carl Branden, John Tooze Introduction to Protein Structure
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Takao Ishikawa Faculty of Biology, University of Warsaw, Poland Performance of Polish students at IBO Gold Silver Bronze Merit
Geny i działania na nich
Metody bioinformatyki Geny i działania na nich prof. dr hab. Jan Mulawka Trzy królestwa w biologii Prokaryota organizmy, których komórki nie zawierają jądra, np. bakterie Eukaryota - organizmy, których
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
spektroskopia elektronowa (UV-vis)
spektroskopia elektronowa (UV-vis) rodzaje przejść elektronowych Energia σ* π* 3 n 3 π σ σ σ* daleki nadfiolet (λ max < 200 nm) π π* bliski nadfiolet jednostki energii atomowa jednostka energii = energia
STRESZCZENIE PRACY DOKTORSKIEJ
mgr Bartłomiej Rospond POSZUKIWANIE NEUROBIOLOGICZNEGO MECHANIZMU UZALEŻNIENIA OD POKARMU - WPŁYW CUKRÓW I TŁUSZCZÓW NA EKSPRESJĘ RECEPTORÓW DOPAMINOWYCH D 2 W GRZBIETOWYM PRĄŻKOWIU U SZCZURÓW STRESZCZENIE
Materiał i metody. Wyniki
Abstract in Polish Wprowadzenie Selen jest pierwiastkiem śladowym niezbędnym do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Selen jest wbudowywany do białek w postaci selenocysteiny tworząc selenobiałka (selenoproteiny).
The influence of N-methylation on conformational properties of peptides with Aib residue. Roksana Wałęsa, Aneta Buczek, Małgorzata Broda
The influence of N-methylation on conformational properties of peptides with ib residue. Roksana Wałęsa, neta Buczek, Małgorzata Broda Konformacje peptydów w W W w 2 Budowa białek 3 Modyfikacje peptydów
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
Lek od pomysłu do wdrożenia
Lek od pomysłu do wdrożenia Lek od pomysłu do wdrożenia KRÓTKA HISTORIA LEKU KRÓTKA HISTORIA LEKU KRÓTKA HISTORIA LEKU KRÓTKA HISTORIA LEKU KRÓTKA HISTORIA LEKU KRÓTKA HISTORIA LEKU KRÓTKA HISTORIA LEKU
ZAKŁAD IMMUNOLOGII EWOLUCYJNEJ
ZAKŁAD IMMUNOLOGII EWOLUCYJNEJ Kierownik Zakładu - dr hab. Magdalena Chadzińska Dr. Joanna Homa Prof. dr hab. Barbara Płytycz Kurs: IMMUNOLOGIA III rok studiów, semestr letni ODPORNOŚĆ NABYTA ADAPTACYJNA
Enzymy katalizatory biologiczne
Enzymy katalizatory biologiczne Kataliza zjawisko polegające na obniżeniu energii aktywacji reakcji i zwiększeniu szybkości reakcji chemicznej i/lub skierowaniu reakcji na jedną z termodynamicznie możliwych
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych. źródło: (3)
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych źródło: (3) Interakcje białko-białko Ze względu na zadanie: strukturalne lub funkcjonalne. Ze względu na właściwości fizyczne: stałe lub
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją).
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją). Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) 2 Cząsteczki organiczne mog y powstać w atmosferze pierwotnej
INADEQUATE-ID I DYNAMICZNY NMR MEZOJONOWYCH. 3-FENYLO-l-TIO-2,3,4-TRIAZOLO-5-METYUDÓW. Wojciech Bocian, Lech Stefaniak
INADEQUATEID I DYNAMICZNY NMR MEZOJONOWYCH 3FENYLOlTIO2,3,4TRIAZOLO5METYUDÓW Wojciech Bocian, Lech Stefaniak Instytut Chemii Organicznej PAN ul. Kasprzaka 44/52, 01224 Warszawa PL9800994 WSTĘP Struktury
Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl
Ogół przemian biochemicznych, które zachodzą w komórce składają się na jej metabolizm. Wyróżnia się dwa antagonistyczne procesy metabolizmu: anabolizm i katabolizm. Szlak metaboliczny w komórce, to szereg
Bioinformatyka. z sylabusu... (wykład monograficzny) wykład 1. E. Banachowicz. Wykład monograficzny Bioinformatyka.
Bioinformatyka (wykład monograficzny) wykład 1. E. Banachowicz Zakład Biofizyki Molekularnej IF UAM http://www.amu.edu.pl/~ewas z sylabusu... Wykład 1, 2006 1 Co to jest Bioinformatyka? Zastosowanie technologii
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU KSZTAŁT BIAŁEK.
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU KSZTAŁT BIAŁEK. SPIS TREŚCI: I. Wprowadzenie. II. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. III. Karty pracy. 1. Karta
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Ekspresja genów jest regulowana
Jest to dziedzina biologiczna wywodząca się z biotechnologii. Bioinformatyka
Wstęp do obsługi biologicznych baz danych i analizy porównawczej białek i genów Katedra Fizjologii i Biotechnologii Roślin Pok. 113 CB jan.jastrzebski@uwm.edu.pl bioinformatyka@gmail.com www.ebiology.net
INHIBICJA KANAŁÓW JONOWYCH POSZUKIWANIE NOWYCH LEKÓW.
INHIBICJA KANAŁÓW JONOWYCH POSZUKIWANIE NOWYCH LEKÓW. Dariusz Matosiuk Katedra i Zakład Syntezy i Technologii Chemicznej Środków Leczniczych, Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Analityki Medycznej Uniwersytet
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała Uwaga: tkanka tłuszczowa (adipose tissue) NIE wykorzystuje glicerolu do biosyntezy triacylogliceroli Endo-, para-, i autokrynna droga przekazu informacji biologicznej.
Repetytorium z wybranych zagadnień z chemii
Repetytorium z wybranych zagadnień z chemii Mol jest to liczebność materii występująca, gdy liczba cząstek (elementów) układu jest równa liczbie atomów zawartych w masie 12 g węgla 12 C (równa liczbie
AUTOREFERAT. opis dorobku i osiągnięć naukowych
dr inż. Gabriela Siawrys Katedra Fizjologii Zwierząt Wydział Biologii i Biotechnologii Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie ul. Oczapowskiego 1A 10-719 Olsztyn tel. (089) 523 39 04 e-mail: gabri@uwm.edu.pl
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW. Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki
Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki Metabolizm całokształt przemian biochemicznych i towarzyszących
Wyznaczenie struktury i dynamiki białka CsPin oraz jego oddziaływania z modelowymi peptydami metodami spektroskopii NMR
mgr Łukasz Jaremko Warszawa, 21.11.2012 Wydział Chemii, UW Autoreferat rozprawy doktorskiej pt.: Wyznaczenie struktury i dynamiki białka CsPin oraz jego oddziaływania z modelowymi peptydami metodami spektroskopii
Opis zakładanych efektów kształcenia OPIS ZAKŁADANYCH EFEKTÓW KSZTAŁCENIA
Załącznik nr 2 do Uchwały Rady Wydziału Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ z dnia 19czerwca 2018 r. w sprawie zmian programu i planu na BIOCHEMIA na poziomie pierwszego stopnia (według wzoru zawartego
WOJEWÓDZKI KONKURS PRZEDMIOTOWY Z CHEMII... DLA UCZNIÓW GIMNAZJÓW - rok szkolny 2011/2012 eliminacje wojewódzkie
ŁÓDZKIE CENTRUM DOSKONALENIA NAUCZYCIELI I KSZTAŁCENIA PRAKTYCZNEGO kod Uzyskane punkty..... WOJEWÓDZKI KONKURS PRZEDMIOTOWY Z CHEMII... DLA UCZNIÓW GIMNAZJÓW - rok szkolny 2011/2012 eliminacje wojewódzkie
Aminokwasy, peptydy i białka. Związki wielofunkcyjne
Aminokwasy, peptydy i białka Związki wielofunkcyjne Aminokwasy, peptydy i białka Aminokwasy, peptydy i białka: - wiadomości ogólne Aminokwasy: - ogólna charakterystyka - budowa i nazewnictwo - właściwości
Wskaźniki włóknienia nerek
Wskaźniki włóknienia nerek u dzieci z przewlekłą chorobą nerek leczonych zachowawczo Kinga Musiał, Danuta Zwolińska Katedra i Klinika Nefrologii Pediatrycznej Uniwersytetu Medycznego im. Piastów Śląskich
Recenzja rozprawy doktorskiej Pana mgr Mariusza Dziekońskiego zatytułowanej:
Jabłonna, 19 lutego 2019 r. dr hab. Alina Gajewska, prof. nadzwyczajny Zakład Fizjologii Zwierząt Instytut Fizjologii i Żywienia Zwierząt im. Jana Kielanowskiego, PAN Jabłonna k. Warszawy Recenzja rozprawy
ZAJĘCIA 1. uczenie się i pamięć mechanizmy komórkowe. dr Marek Binder Zakład Psychofizjologii
ZAJĘCIA 1 uczenie się i pamięć mechanizmy komórkowe dr Marek Binder Zakład Psychofizjologii problem engramu dwa aspekty poziom systemowy które części mózgu odpowiadają za pamięć gdzie tworzy się engram?
Czy żywność GMO jest bezpieczna?
Instytut Żywności i Żywienia dr n. med. Lucjan Szponar Czy żywność GMO jest bezpieczna? Warszawa, 21 marca 2005 r. Od ponad połowy ubiegłego wieku, jedną z rozpoznanych tajemnic życia biologicznego wszystkich
KARTA KURSU Biologia z przyrodą
KARTA KURSU Biologia z przyrodą.. (nazwa specjalności) Nazwa Nazwa w j. ang. Podstawy neuroendokrynologii Neuroendocrinology Kod Punktacja ECTS* 1 Koordynator Dr Agnieszka Greń Zespół dydaktyczny Opis
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt do wykładu
Statystyczna analiza danych
Statystyczna analiza danych ukryte modele Markowa, zastosowania Anna Gambin Instytut Informatyki Uniwersytet Warszawski plan na dziś Ukryte modele Markowa w praktyce modelowania rodzin białek multiuliniowienia
8. Trwałość termodynamiczna i kinetyczna związków kompleksowych
8. Trwałość termodynamiczna i kinetyczna związków kompleksowych Tworzenie związku kompleksowego w roztworze wodnym następuje poprzez wymianę cząsteczek wody w akwakompleksie [M(H 2 O) n ] m+ na inne ligandy,
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny Zadanie 1 1 pkt. za prawidłowe podanie typów dla obydwu zwierząt oznaczonych literami A oraz B. A. ramienionogi, B. mięczaki A.
Translacja i proteom komórki
Translacja i proteom komórki 1. Kod genetyczny 2. Budowa rybosomów 3. Inicjacja translacji 4. Elongacja translacji 5. Terminacja translacji 6. Potranslacyjne zmiany polipeptydów 7. Translacja a retikulum
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
Transport makrocząsteczek
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii, dzięki której organizm uzyskuje energię biosynteza białka i innych związków Transport
Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF
Agnieszka Gładysz Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Katedra i Zakład Biochemii i Chemii Klinicznej Akademia Medyczna Prof.
CORAZ BLIŻEJ ISTOTY ŻYCIA WERSJA A. imię i nazwisko :. klasa :.. ilość punktów :.
CORAZ BLIŻEJ ISTOTY ŻYCIA WERSJA A imię i nazwisko :. klasa :.. ilość punktów :. Zadanie 1 Przeanalizuj schemat i wykonaj polecenia. a. Wymień cztery struktury występujące zarówno w komórce roślinnej,
Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak
Katedra Fizjologii i Biochemii Roślin Uniwersytetu Łódzkiego Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak Plan wykładu Przykłady
Budowa i zróżnicowanie neuronów - elektrofizjologia neuronu
Budowa i zróżnicowanie neuronów - elektrofizjologia neuronu Neuron jest podstawową jednostką przetwarzania informacji w mózgu. Sygnał biegnie w nim w kierunku od dendrytów, poprzez akson, do synaps. Neuron
Scenariusz lekcji chemii w klasie III gimnazjum. Temat lekcji: Białka skład pierwiastkowy, budowa, właściwości i reakcje charakterystyczne
Scenariusz lekcji chemii w klasie III gimnazjum Temat lekcji: Białka skład pierwiastkowy, budowa, właściwości i reakcje charakterystyczne Czas trwania lekcji: 2x 45 minut Cele lekcji: 1. Ogólny zapoznanie
analogicznie: P g, K g, N g i Mg g.
Zadanie 1 Obliczamy zawartość poszczególnych składników w 10 m 3 koncentratu: Ca: 46 g Ca - 1 dm 3 roztworu x g Ca - 10000 dm 3 roztworu x = 460000 g Ca analogicznie: P 170000 g, K 10000 g, N 110000 g
Podstawy projektowania leków wykład 6
Podstawy projektowania leków wykład 6 Łukasz Berlicki Peptydy i peptydomimetyki Peptydy oligomery zbudowane z aminokwasów połączonych wiązaniem amidowym. Peptydomimetyki cząsteczki naśladujące strukturę
Projekt CHIP Chemia i Praca Zwiększenie kompetencji w ramach studiów I i II stopnia na kierunku Chemia i Technologia Chemiczna
WSTĘPNA PROPOZYCJA SZKOLEN /WARSZTATO W oferowanych w ramach Projektu CHIP Chemia i Praca Zwiększenie kompetencji w ramach studio w I i II stopnia na kierunku Chemia i Technologia Chemiczna w roku akademickim