W kierunku jednolitej laboratoryjnej platformy informatycznej SYSTEM ZARZĄDZANIA DANYMI NAUKOWYMI STARLIMS

Wielkość: px

Rozpocząć pokaz od strony:

Download "W kierunku jednolitej laboratoryjnej platformy informatycznej SYSTEM ZARZĄDZANIA DANYMI NAUKOWYMI STARLIMS"

Bożena Grzybowska
8 lat temu
Przeglądów:

1 W kierunku jednolitej laboratoryjnej platformy informatycznej SYSTEM ZARZĄDZANIA DANYMI NAUKOWYMI STARLIMS

2 INTEGRACJA LIMS I SDMS W JEDNEJ PLATFORMIE ZWIĘKSZA UŻYTECZNOŚĆ, WARTOŚĆ, DOSTĘPNOŚĆ I TRWAŁOŚĆ ZASOBÓW INFORMATYCZNYCH ORGANIZACJI.

3 System zarządzania danymi naukowymi STARLIMS (SDMS Scientific Data Management System) jest pierwszym w swoim rodzaju produktem w pełni zintegrowanym z systemem zarządzania informacją laboratoryjną (LIMS). Wśród ważnych zalety tej integracji wymienić należy: zwiększoną użyteczność, ochronę danych i własności intelektualnej, eliminację powielonych wyszukiwań oraz usprawnienie zarządzania informacją w całej organizacji. Cele te zostają osiągnięte bez potrzeby rozwoju i utrzymywania drogich interfejsów. Zaprojektowany by sprostać surowym wymaganiom, SDMS firmy STARLIMS to idealne rozwiązanie do przechwytywania danych z aparatury i aplikacji biznesowych: plików wyjściowych z aparatury, certyfikatów analiz i raportów, specyfikacji produktów, standardowych procedur działania (SOP) itp. Jako aplikacja w pełni usługowa, STARLIMS SDMS umożliwia dostęp do informacji każdemu uprawnionemu użytkownikowi standardowej przeglądarki internetowej. Każdy dokument może być odzyskany lub przechowany poprzez aplikacje Microsoft Office po dodaniu do nich przycisków Wybierz z SDMS i zapisz w SDMS.

Wśród ważnych zalety tej integracji wymienić należy: zwiększoną użyteczność, ochronę danych i własności intelektualnej, eliminację powielonych wyszukiwań oraz usprawnienie zarządzania informacją w

4 Zadania STARLIMS SDMS można podsumować w czt Krok 1: Przechwytywanie Bezproblemowe przechwytywanie danych i generowanie raportów w cyklu pracy LIMS Pliki tworzone w trakcie cyklu pracy LIMS włączając raporty, dokumenty, multimedia, obrazy, są zapisywane w repozytorium SDMS. Dodatkowo STARLIMS SDMS automatyzuje przechwytywanie zawartości monitorując skonfigurowane źródła danych, takie jak: aparatura, skrzynki poczty , itd. Funkcjonalność tę zapewnia SDMS Grabber, który monitoruje zdarzenia tworzenia plików przez system operacyjny. Narzędzie to po utworzeniu pliku natychmiast przenosi go do bezpiecznego, zgodnego z CFR Część 11 repozytorium i udostępnia do dalszego przetwarzania. Możliwe jest również bezpośrednie zapisywanie plików do repozytorium STARLIMS SDMS przy użyciu konfigurowalnych przycisków Microsoft Office. Krok 2: Dzielenie Zawartość jest rozpoznawana przez sztuczną inteligencję STARLIMS stosuje algorytmy sztucznej inteligencji do przetwarzania nieustrukturyzowanych dokumentów w sposób automatyczny. STARLIMS SDMS wyciąga zawartość dokumentów i przechowuje je wraz z ważnymi zakładkami metadanych. W ten sposób nieustrukturyzowane dane są przekształcane do formatu XML, który jest zestandaryzowany i przystępny. Następnie w odpowiednim module STARLIMS tworzony jest link do dokumentu, a w przypadku danych z aparatury aktualizowana jest tabela wyników. Przed automatycznym przekazaniem danych STARLIMS SDMS dokonuje: identyfikacji źródła pliku (Varian Galaxy, Chemstation, Finigan GCMS, SOP, COA, itd.) ekstrakcji metadanych, zawartości z plików (ID próbki, nazwa aparatu) i tabeli wyników (nazwa piku, czas retencji, jednostki) mapowania wyciągniętych danych do skonfigurowanego przez użytkownika formatu XML definicji kierunków przekierowania, np.: wszystkie pliki przechwycone z CDS muszą być zatwierdzone przed wprowadzeniem do tabeli wyników LIMS wszystkie standardowe procedury poszczególnych muszą być przejrzane przez kierownika laboratorium, a następnie muszą przejść QC i QA włączeniem do systemu STARLIMS Zastosowanie algorytmów sztucznej inteligencji do ekstrahowania danych z plików jest rozwiązaniem wyjątkowym. STARLIMS SDMS podejmie próbę automatycznej identyfikacji następujących składników dokumentu: Znaczników słów zawsze obecnych w docelowym dokumencie, pozwalających na identyfikację źródła Słów kluczowych (zielony) etykiety metadanych Tabel (żółty) program automatycznie wykrywa tabele danych Wykresów (purpurowy) algorytm wykrywa wykresy, które można wyekstrahować, np. chromatogramy.

Dodatkowo STARLIMS SDMS automatyzuje przechwytywanie zawartości monitorując skonfigurowane źródła danych, takie jak: aparatura, skrzynki poczty email, itd.

5 erech krokach: Wszelkie niedokładności w ekstrakcji danych z nieznanego dokumentu mogą zostać poprawione metodą przeciągnij i upuść. Zmiany zostaną zapamiętane i uwzględnione w przetwarzaniu kolejnych plików. To podejście sprawia, iż trudne zadanie tworzenia skryptów wyciągających dane z plików staje się znacznie łatwiejsze. Skraca to czas konieczny do konfiguracji i eliminuje potrzebę uczenia się złożonych aplikacji. Krok 3: Zarządzanie cyklem pracy Standaryzacja procesów i zapewnienie zgodności z wymaganiami Używanie aplikacji do zarządzania cyklem pracy pozwala tworzyć, przeglądać, modyfikować i zatwierdzać dokumenty wewnątrz kontrolowanego środowiska, spełniającego wymagania wynikające z przepisów. Dokumenty są przekierowywane do cyklu pracy automatycznie lub ręcznie poprzez dołączenie dokumentu do unikatowego ID cyklu pracy. Pokazany poniżej edytor cyklu pracy pozwala definiować własne cykle pracy dostosowane do różnych typów dokumentów i określić zasady przekierowań. Każde utworzenie, odtworzenie i edycja dokumentu tworzy nową wersję, a integracja systemu zarządzania dokumentami Documentum pozwala zapisywać i utrzymywać każdą wersję. Wszystkie dokumenty są opatrzone podpisami elektronicznymi, dzięki czemu dostępny jest pełny audyt zmian. Użytkownicy są informowani o zaległych krokach cyklu pracy przez interfejs użytkownika STARLIMS SDMS lub przez włączenie przypomnień na pulpicie STARLIMS. Krok 4: Bezpieczne odzyskiwanie i raportowanie Ograniczenie dostępu tylko do dozwolonych plików. Możliwość wydajnego wyszukiwania i używania zgromadzonych informacji jest kluczem do ich wartości. STARLIMS SDMS pozwala efektywnie przeszukiwać i odzyskiwać informacje na podstawie znaczników metadanych. Intuicyjny kreator nawigacji pozwala użytkownikom definiować ścieżkę nawigacji. Dla przykładu: 1. Pokaż dokumenty należące do próbek wody Zawężenie wyszukiwania do szczególnego zakresu danych Zawężenie wyszukiwania do dokumentów testowanych przez GC Zawężenie wyszukiwania do dokumentów, dla których test=btex 2. Pokaż dokumenty specyfikacji dla aspiryny Zawężenie wyszukiwania do wersji 2 Często używane reguły mogą być przechowywane w celu ponownego użycia. Aktywny monitor bezpieczeństwa pozwala użytkownikom na dostęp tylko do dozwolonych dla nich dokumentów. Pełna integracja z produktami Microsoft Desktop pozwala generować raporty w dokumentach programów Word, Excel i PowerPoint. Dodatkowo integracja z produktem takim jak Documentum sprawia, iż wszystkie oryginalne pliki pozostają dostępne i mogą być odzyskane dzięki wbudowanym mechanizmom wyszukiwania w pełnym tekście.

Skraca to czas konieczny do konfiguracji i eliminuje potrzebę uczenia się złożonych aplikacji.

6 Typowe zastosowania STARLIMS SDMS Narzędzie zarządzania projektem promuje współpracę w ramach przedsiębiorstwa. Współpraca w projektach działu badań i rozwoju - STARLIMS SDSM działa z używanymi w firmie narzędziami do zarządzania projektem silnie promując współpracę w projektach badawczo-rozwojowych. Projekty te wymagają współpracy wielu jednostek oraz łatwego dostępu do danych generowanych przez współpracowników. Narzędzia zarządzania projektem STARLIMS umożliwiają tworzenie harmonogramu zadań wykonywanych przez kilka jednostek. SDMS zapisuje dokumenty wytworzone w wyniku tych działań tworząc spójny obraz całego projektu. To duży krok naprzód w realizacji celu i udostępnienia wyników całej organizacji. Integracja aparatury dzięki STARLIMS SDMS dane mogą być przechwycone z dowolnego instrumentu zapisującego pliki o znanej strukturze. System łatwo radzi sobie z pojedynczymi lub wieloma wynikami dla jednej próbki oraz wieloma wynikami dla wielu próbek. Informacje mogą być zapisane do formatu Unified XML (który pozwala przechowywać także obrazy) i importowane do innego systemu. Dodatkowo oryginalny plik może być przechowywany dzięki zarządzaniu zawartością i odtworzony przy użyciu XML. Zapewnia to nie tylko integrację z aparaturą, ale także pozwala na przechowywania informacji w neutralnym formacie, zapewniając długoterminową dostępność ważnych danych. Certyfikaty analiz i raporty materiały dostarczane do laboratorium mogą zawierać dołączone certyfikaty analiz producenta. Jeśli są one dostępne w formie elektronicznej mogą być automatycznie przetworzone i przechowywane. Zapewnia to ekstrakcję danych testowych i wyników oraz automatyczny import tych informacji do systemu, który ich potrzebuje, np.: LIMS czy ERP. Te same działania mogą dotyczyć certyfikatów i raportach generowanych w laboratorium. Specyfikacje produktów w przypadku wykorzystywania specyfikacji surowców w procesie produkcyjnym, ich utrzymywanie, aktualizowanie i zarządzanie nimi może stanowić problemem, zwłaszcza w dużym środowisku złożonym z wielu podjednostek. Specyfikacje muszą być tworzone, aktualizowane, zatwierdzane i dystrybuowane. Mechanizmy przeglądania i zatwierdzania mogą być ustalane w czasie definiowania cyklu pracy. Podczas zatwierdzania szczegóły specyfikacji mogą być konwertowane do formatu XML, stając się dostępnymi dla dowolnego systemu. Standardowe procedury operacyjne (SOP) SOP i metody mogą być zarządzane w ten sam sposób jak specyfikacje produktów. Podczas zatwierdzania dane mogą być ekstrahowane, przetwarzane i dowolnie udostępniane. Zarządzanie wiedzą implementacja zarządzania plikami i dokumentami przy pomocy STARLIMS SDMS zapewnia dostęp do danych i informacji w pojedynczym, zunifikowanym systemie. Zarządzanie wiedzą możliwe jest dzięki łatwemu dostępowi do danych i informacji tworzonych i używanych przez laboratorium. STARLIMS Corporation 4000 Hollywood Blvd. #515S Hollywood, FL USA Tel: Fax: Regional Centers Selvita sp. z o.o. ul. Ostatnia 1c, Kraków Polska Tel: Fax: selvita@selvita.com Europe Tel: Asia Pacific Tel: Copyright 2008 STARLIMS Corporation. All brand names and product names used here are trademarks, registered trademarks or trade names of their respective holders. STARLIMS is a registered trade mark of STARLIMS Corporation.

Projekty te wymagają współpracy wielu jednostek oraz łatwego dostępu do danych generowanych przez współpracowników.

Podobne dokumenty

Syenbi BI & Syenbi BI Pro Prezentacja systemu:

Syenbi BI & Syenbi BI Pro Prezentacja systemu: Syenbi BI & Syenbi BI Pro System monitorowania parku maszynowego / maszyn przemysłowych do analizy biznesowej. Program Syenbi BI analizuje informacje, pokazując