Wykrywanie i identyfikacja chorobotwórczych pałeczek jelitowych z rodziny Enterobacteriaceae w diagnostyce schorzeń jelitowych

Podobne dokumenty
Oznaczenie sprawy AE/ZP-27-41/13 Załącznik Nr 1 Formularz Cenowy

Oznaczenie sprawy AE/ZP-27-49/14 Załącznik Nr 1 Formularz Cenowy

Badania kału wirusologiczne, bakteriologiczne i parazytologiczne

VIII. Pałeczki Gram-ujemne z rodziny Enterobacteriaceae

Protokoły do zajęć praktycznych z mikrobiologii ogólnej i żywności dla studentów kierunku: Dietetyka

XIX. Pałeczki Gram-ujemne część I - ćwiczenia praktyczne

liczba godzin 2 MIKROBIOLOGIA KOSMETOLOGICZNA dla studentów II roku, studiów I st. kierunku KOSMETOLOGIA półpłynne stałe

FORMULARZ CENOWY. Data:... Nazwa wykonawcy:... Siedziba wykonawcy:... Przedstawia zestawienie cenowe dla oferowanego przedmiotu zamówienia:

Zestaw SIT Szybki Identyfikacyjny Test Szczepów Salmonella Enteritidis i Typhimurium

Zagrożenia mikrobiologiczne w przetwórstwie owocowym

Polska-Łódź: Odczynniki i środki kontrastowe 2015/S

VII. Fizjologia bakterii - ćwiczenia praktyczne

IU-01 PSSE w Ostrowie Wielkopolskim Laboratorium Mikrobiologii i Parazytologii Wyd.6/ strona1/1

III. Fizjologia bakterii i zasady diagnostyki bakteriologicznej

II. OZNACZANIE LICZBY BAKTERII Z GRUPY COLI I BAKTERII Z GRUPY COLI TYP FEKALNY METODĄ PŁYTKOWĄ W ŻYWNOŚCI I INNYCH PRODUKTACH wg PN-ISO 4832: 2007

Ćwiczenie 4-5 Mikrobiologiczne kryteria oceny sanitarnej wody

WNOZ - DIETETYKA PODSTAWOWE METODY STOSOWANE W BAKTERIOLOGII METODY MIKROSKOPOWE MORFOLOGIA BAKTERII BAKTERIE GRAM-UJEMNE

Temat 14 i 15: Różnicowanie pałeczek z rodziny Enterobacteriaceae. Izolacja bakteriofagów ze ścieków

Badania w kierunku wirusów oddechowych 6. Badania w kierunku wirusów RS

Pasteurella sp, Yersinia sp, Francisella sp

Brucella sp. Małe pałeczki Gram ujemne

Pobieranie i transport próbek kału do badania bakteriologicznego w kierunku nosicielstwa pałeczek Salmonella i Shigella /instrukcja dla klienta/

Zestaw SIT InHaVi Szybki Identyfikacyjny Test Szczepów Salmonella Infantis, Hadar oraz Virchow

zastosowanie do Yersinia enterocolitica 1 op.= 5 fiolek (fiolka wystarcza na 1000 ml podłoża) op. = 5 fiolek 5

Jednostka Ilość miary zastosowanie do Yersinia enterocolitica 1 op.= 5 fiolek (fiolka wystarcza na 1000 ml podłoża) op.

Przedmiot zamówienia -Specyfikacja cenowa

Mikrobiologia II rok Towaroznawstwo i Dietetyka. Ćwiczenie 10

Rekomendacje diagnostyczne inwazyjnych zakażeń bakteryjnych nabytych poza szpitalem M. Kadłubowski, A. Skoczyńska, W. Hryniewicz, KOROUN, NIL, 2009

- podłoża transportowo wzrostowe..

Warszawa, dnia 22 lipca 2016 r. Poz. 1081

FORMULARZ ASORTYMENTOWO CENOWY załącznik nr 7

Dostawy

Kontrola pożywek mikrobiologicznych. Sekcja Badań Epidemiologicznych

ELIMINACJA ODRY/RÓŻYCZKI PROGRAM WHO REALIZACJA W POLSCE ZASADY INSTRUKCJE

Względnie beztlenowe, Gramujemne pałeczki. Bakterie zasiedlające przewód pokarmowy

Ćwiczenie 11. Temat: Wskaźniki higieniczne żywności.

ELIMINACJA ODRY/RÓŻYCZKI

Wojewódzka Stacja Sanitarno-Epidemiologiczna w Poznaniu

Tok badania bakteriologicznego. Klasyczne metody stosowane w diagnostyce bakteriologicznej. (identyfikacja bakterii i oznaczanie lekowrażliwości).

Erysipelothrix rhusiopathiae. Włoskowiec różycy

KALKULACJA CENY OFERTY Część I - podłoża i dodatki do podłoży. Jednostka miary. op. = 500g 4. op. = 500g 4. op. = 500g 7

KALKULACJA CENY OFERTY Część I Podłoża i dodatki do podłoży. Jednostka miary. op.= 250g 1

Bakterie helikalne: Campylobacter sp.

Program ćwiczeń z mikrobiologii dla studentów III roku Oddziału Analityki Medycznej, rok akademicki 2014/2015 SEMESTR LETNI

Krętki: Leptospira spp

ZAKRES AKREDYTACJI LABORATORIUM BADAWCZEGO Nr AB 448

ZASADY BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH

WNOZ - DIETETYKA PODSTAWOWE METODY STOSOWANE W BAKTERIOLOGII METODY MIKROSKOPOWE MORFOLOGIA BAKTERII BAKTERIE GRAM-UJEMNE

Status oznaczenia / pomiaru Bakteriologiczne badanie krwi. Metoda badawcza

WYKAZ METOD BADAWCZYCH STOSOWANYCH W LABORATORIUM EPIDEMIOLOGII WSSE W SZCZECINIE Nazwa oznaczenia/ Procedura Badawcza PB/EP/PS/03

1. Wykonanie preparatów bezpośrednich i ich ocena: 1a. Wykonaj własny preparat bezpośredni ze śliny Zinterpretuj i podkreśl to co widzisz:

Sekcja I: Instytucja zamawiająca/podmiot zamawiający

ZAKRES AKREDYTACJI LABORATORIUM BADAWCZEGO Nr AB 1029 wydany przez POLSKIE CENTRUM AKREDYTACJI Warszawa ul. Szczotkarska 42

1. Rodzaj materiału klinicznego w zależności od kierunku i metodyki badań

L.p. Nazwa badania. Czas oczekiwania na wynik. Pobranie materiału do badania BADANIA MIKROBIOLOGICZNE - POSIEWY

Załącznik nr 4 Metodyka pobrania materiału przedstawiona jest w osobnym Instrukcja PZH

Arkusz1. Nazwa artykułu opakowanie ilość opak. 1 Agar Columbia + 5% krew barania 20 płytek* 205

Badaniem pozwalającym na

Narodowy Instytut Leków ul. Chełmska 30/34, Warszawa Tel , Fax Warszawa, dn r.

Rekomendacje laboratoryjnej diagnostyki zakażeń przewodu pokarmowego bakteriami rosnącymi w warunkach tlenowych oraz mikroaerofilnych

WOJEWÓDZKA STACJA SANITARNO-EPIDEMIOLOGICZNA w GDAŃSKU ul. Dębinki 4, Gdańsk

PROCEDURA BADAWCZA P0BIERANIE I TRANSPORT MATERIAŁU DO BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH PB - 01/SMiP

SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20005/11858/09

WOJEWÓDZKA STACJA SANITARNO-EPIDEMIOLOGICZNA w GDAŃSKU ul. Dębinki 4, Gdańsk

1. Rodzaj materiału klinicznego w zależności od kierunku i metodyki badań

1. Typowanie punktów pomiarowych dla jednego stanowiska pracy, zapoznanie się z procesem technologicznym, chronometrażem pracy,

KONSPEKTY DO ĆWICZEN Z MIKROBIOLOGII LEKARSKIEJ WYDZIAŁ LEKARSKO-DENTYSTYCZNY II ROK 2019/2020 CZĘŚĆ PRAKTYCZNA

Harmonogram zajęć z Mikrobiologii z parazytologią i Immunologii dla studentów II roku kierunku lekarskiego WL 2018/2019 GRUPA 5

ZAKRES AKREDYTACJI LABORATORIUM BADAWCZEGO Nr AB 639

Zatrucia bakteriami z rodzaju Salmonella

X. Pałeczki Gram-dodatnie. Rodzaje: Corynebacterium, Listeria, Erysipelothtix, Lactobacillus

MATERIAŁY Z GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH - badanie bakteriologiczne + mykologiczne

- tłumaczenie robocze - Wstępna Ocena Ryzyka sporządzona przez ECDC

Wytyczne dotyczące pobierania, transportu i przechowywania próbek do badań.

ZAKRES AKREDYTACJI LABORATORIUM BADAWCZEGO Nr AB 1029 wydany przez POLSKIE CENTRUM AKREDYTACJI Warszawa ul. Szczotkarska 42

Agar ALOA wg Ottaviani i Agosti. strona 1 / 5

Ćwiczenie 4-5 Mikrobiologiczne kryteria oceny sanitarnej wody

Program ćwiczeń z mikrobiologii dla studentów III roku Oddziału Analityki Medycznej, rok akademicki 2018/2019 SEMESTR LETNI

Corynebacterium. Maczugowce

Światowy Dzień Mycia Rąk

marketinginformacja Diagnostyka weterynaryjna Szybkie testy dla rolnictwa +++ dostępne w SalesPlusie +++

INFORMACJA DLA OSÓB POWRACAJĄCYCH Z REGIONU AFRYKI ZACHODNIEJ. Gwinea, Liberia, Sierra Leone, Nigeria

WYKAZ METOD BADAWCZYCH STOSOWANYCH W LABORATORIUM EPIDEMIOLOGII WSSE W SZCZECINIE Nazwa oznaczenia/

Mikrobiologia - Bakteriologia

ZAKRES AKREDYTACJI LABORATORIUM BADAWCZEGO Nr AB 1088

SHL.org.pl SHL.org.pl

Spis treści: 1. Cel 2. Opis postepowania 3. Dokumenty związane 4. Załączniki

Krętki: Brachyspira spp

Mikrobiologiczne zatrucia pokarmowe znane i mało znane. Dr Małgorzata Jałosińska

Mikrobiologia - Bakteriologia

IV. Streptococcus, Enterococcus ćwiczenia praktyczne

LABORATORIUM MIKROBIOLOGICZNE INSTRUKCJA POBIERANIA I POSTĘPOWANIA Z PRÓBKAMI DO BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH

Probiotyki, prebiotyki i synbiotyki w żywieniu zwierząt

VII. Pałeczki Gram-dodatnie: Corynebacterium, Listeria, Erysipelothtix, Lactobacillus - ćwiczenia praktyczne

Mikrobiologiczne kryteria oceny sanitarnej wody

Instrukcja Robocza do Procedury Ogólnej PO-05 IR-21/PO-05

ZAKRES AKREDYTACJI LABORATORIUM BADAWCZEGO Nr AB 924

MOŻLIWE SKUTKI ZAGROŻENIA WIRUSY. zapalenie jelit, biegunka, wymioty przestrzeganie zasad. zapalenie układu oddechowego, angina, gorączki, zapalenie

Badanie na obecność pałeczek CPE Informacje dla pacjentów

WYKAZ METOD BADAWCZYCH STOSOWANYCH W LABORATORIUM EPIDEMIOLOGII WSSE W SZCZECINIE

Transkrypt:

SEKCJA BADAŃ EPIDEMIOLOGICZNYCH PRACOWNIA DIAGNOSTYKI SCHORZEŃ JELITOWYCH Wykrywanie i identyfikacja chorobotwórczych pałeczek jelitowych z rodziny Enterobacteriaceae w diagnostyce schorzeń jelitowych 27.04.2015 r.

1. Wstęp 2. Charakterystyka rodziny Enterobacteriaceae 3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Salmonella, Shigella, Yersinia, EPEC, EHEC 4. Podłoża i odczynniki 5. Przebieg badania 6. Potwierdzenie serologiczne 7. Sposób pobierania i transportu próbek do badań bakteriologicznych i wirusologicznych

1. Wstęp Wykaz badań wykonywanych w Pracowni Diagnostyki Schorzeń Jelitowych: badania w kierunku nosicielstwa pałeczek Salmonella i Shigella (branżowcy - do książeczki zdrowia) badania osób chorych lub z biegunką w kierunku Salmonella, Shigella, Yersinia, EHEC, EPEC (dzieci i dorośli) badania osób ze styczności, ozdrowieńców i nosicieli w kierunku Salmonella, Shigella potwierdzanie szczepu bakteryjnego Salmonella spp. Zgodnie z procedurą PB-01-EB wykrywanie rota i adenowirusów Zgodnie z procedurą PB-03-EB Na wszystkie badania posiadamy akredytację PCA.

2. Charakterystyka rodziny Enterobacteriaceae Pałeczki z rodziny Enterobacteriaceae (pałeczki jelitowe) stanowią dużą grupę bakterii, na którą składa się czterdzieści rodzajów obejmujących ponad dwieście gatunków. Wiele rodzajów rodziny Enterobacteriaceae (np. Escherichia, Klebsiella, Enterobacter) zasiedla jelita zdrowych ludzi i zwierząt. Inne (Salmonella, Shigella, czy Yersinia) są bezwzględnymi patogenami wywołującymi choroby. Wszystkie bakterie wchodzące w skład rodziny są bardzo podobne do siebie pod względem morfologii komórek, morfologii kolonii, jak i metabolizmu. Są to gramujemne pałeczki. Wiele gatunków jest urzęsionych. Mają niewielkie wymagania odżywcze. Są to względne beztlenowce, które wyrastają zarówno w warunkach tlenowych, jak i beztlenowych. Wszystkie pałeczki mają wspólne cechy biochemiczne: fermentują glukozę i nie wytwarzają oksydazy cytochromowej.

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Salmonella Gram - ujemne, z reguły urzęsione pałeczki należące do rodziny Enterobacteriaceae nie fermentują laktozy (w większości przypadków) nie wytwarzają indolu wytwarzają H 2 S (w większości przypadków) wytwarzają gaz na podłożu Kliglera charakteryzują się dużą odpornością na warunki środowiskowe (w glebie mogą przeżyć do kilu miesięcy, w wodzie od kilku dni (w lecie) do kilku tygodni (w temp. poniżej 0 0 C)

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Salmonella Klasyfikacja pałeczek z rodzaju Salmonella: dwa gatunki: Salmonella enterica W obrębie tego gatunku wyróżnia się 6 podgatunków: o Salmonella enterica subsp. enterica (w tym podgatunku wyróżniono ponad 2500 odmian serologicznych) o Salmonella enterica subsp. salamae o Salmonella enterica subsp. arizone o Salmonella enterica subsp. diarizonae o Salmonella enterica subsp. houtenae o Salmonella enterica subsp. indica Salmonella bongori

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Salmonella Choroby wywołane przez pałeczki z rodzaju Salmonella szerzące się głównie drogą pokarmową: dur brzuszny (S.Typhi), dur rzekomy (S.Paratyphi) - naturalnym źródłem zakażenia jest chory człowiek lub nosiciel. Dur brzuszny choroba szerząca się tylko wśród ludzi. Człowiek jest jedynym rezerwuarem tych bakterii. Dur brzuszny rozwija się długo (10-14 dni), faza wysokiej gorączki związana jest z wysiewami bakterii do krwi. Występują objawy ze strony przewodu pokarmowego (wymioty, biegunka lub zaparcie). Chorobie towarzyszy wysypka skórna durowa. Infekcja ta pozostawia czasem nosicielstwo tych pałeczek w jelicie, co stanowi zagrożenie dla osób z otoczenia. Łagodniejszą formą duru brzusznego jest dur rzekomy. W tym przypadku infekcja dotyczy tylko ludzi. Nosicielstwo tych pałeczek jest rzadsze.

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Salmonella Choroby wywołane przez pałeczki z rodzaju Salmonella szerzące się głównie drogą pokarmową: salmonellozy (odzwierzęce serotypy Salmonella) naturalnym źródłem zakażenia jest chore zwierzę lub zwierzę - nosiciel, rzadziej człowiek Choroba ma krótki czas wylęgania (6-48 godzin). Towarzyszą jej gorączka, bolesne skurcze jelit i biegunka. Choroba trwa 2-6 dni i na ogół, jeśli nie występują zaburzenia elektrolitowe, ustępuje bez leczenia. Rezerwuarem tych pałeczek są zwierzęta hodowlane (drób i jego jaja, bydło, trzoda), dzikie i rzadko człowiek. Drogi szerzenia się zakażenia u ludzi przez nośniki bezpośrednie: żywność pochodzenia zwierzęcego (jaj, drób, mięso, mleko inne), środowisko np. woda pitna; pośrednie: skażone sprzęty, maszyny używane przy produkcji, transporcie, magazynowaniu i sprzedaży żywności. Salmonellozy mogą powodować : zapalenie żołądkowo-jelitowe, zakażenia układowe (pozajelitowe), powikłania pozakaźne.

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Shigella Pałeczki Shigella są nieurzęsione. Cechą charakterystyczną rodzaju jest bardzo słabą aktywność biochemiczna, a w tym brak zdolności rozkładu laktozy (w większości przypadków). Różnicowanie biochemiczne gatunków w obrębie rodzaju Shigella jest trudne lub niemożliwe. Szczepy należące do podgrup A, B, C są bardzo do siebie podobne. Identyfikacja gatunków dokonuje się przede wszystkim metodami serologicznymi wykorzystującymi różnice w budowie antygenu somatycznego O.

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Shigella Klasyfikacja pałeczek z rodzaju Shigella: cztery gatunki: o Shigella dysenteriae o Shigella flexneri o Shigella boydii o Shigella sonnei Określane czasem jako podgrupy serologiczne A, B, C, D.

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Shigella Chorobotwórczość pałeczek Shigella związana jest ze zdolnością penetrowania i atakowania komórek warstwy nabłonka jelita. W cytoplazmie komórek bakterie te namnażają się i niszczą je powodując w ten sposób krwawiące owrzodzenia. Zakażenie jest ograniczone do komórek błony śluzowej i tkanek okrężnicy. Aktywność silnej toksyny jest przyczyną postępujących uszkodzeń nabłonka i może prowadzić do powstawania zespołu mocznicowo-hemolitycznego. Wszystkie gatunki Shigella są bezwzględnie patogenne i powodują czerwonkę bakteryjną. Objawy zespołu czerwonkowego to: podwyższona temperatura ciała osłabienie złe samopoczucie silne bóle brzucha bolesne parcia na stolec początkowo śluzowa, później krwista biegunka

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Yersinia Yersinia są to najmniejsze spośród pałeczek z rodziny Enterobacteriaceae, a długość ich komórek nie przekracza 2 μm. Ich kształt często jest ziarenkowaty. Yersinia tworzy bardzo drobne kolonie, często osiągające średnicę 1mm. Optymalna temperatura ich wzrostu to 28-30 0 C, ale wykazują one dużą tolerancję i mnożą się w niskich temperaturach (4-8 0 C) w temperaturze 25 0 C są ruchliwe, a w temperaturze 37 0 C są nieruchliwe różnicowanie odbywa się na podstawie fermentacji cukrów, dekarboksylacji ornityny i wytwarzania indolu

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Yersinia Zróżnicowanie wewnątrzgatunkowe: wyróżniono 60 typów serologicznych antygenu O znanych jest 7 grup biochemicznych: 1A, 1B, 2, 3, 4, 5, 6 szczepy chorobotwórcze to O3; O5,27; O8; O9

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Yersinia Dla człowieka chorobotwórcze są Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica pałeczka jersiniozy, Yersinia pseudotuberculosis subsp. pseudotuberculosis i Yersinia pestis pałeczka dżumy. Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica jest dość powszechna w środowisku (woda, gleba). Na podstawie zróżnicowania antygenu somatycznego O wyodrębniono 54 grupy serologiczne, spośród których infekcje u ludzi wywołują najczęściej O:3, O:8, O:9, O:5,27. Yersinia enterocolitica powoduje zakażenia przenoszone drogą pokarmową zapalenie jelit, częściej u niemowlaków i małych dzieci, ale także u dorosłych. Długotrwałe biegunki połączone z biegunką i zajęciem węzłów chłonnych w obrębie jamy brzusznej są często spowodowane spożyciem skażonego mleka i produktów mlecznych, ale także innych produktów.

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Yersinia Yersinia pseudotuberculosis subsp. pseudotuberculosis jest mniej rozpowszechniona w środowisku, a zakażenia rzadziej spotykane. Dochodzi do nich droga pokarmową. Najczęściej Yersinia pseudotuberculosis wywołuje zapalenie węzłów chłonnych krezki przypominające zapalenie wyrostka robaczkowego. Yersinia pestis wywołuje dżumę, chorobę o wysokiej śmiertelności, a jej rezerwuarem są gryzonie, szczególnie szczury. Choroba przenoszona jest na człowieka za pośrednictwem pcheł, przez kontakt z zakażonymi zwierzętami, a także droga kropelkową od chorych ludzi. Dżuma może wystąpić w dwóch postaciach: płucnej i dymieniczej z zapaleniem węzłów chłonnych.

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Escherichia Bakterie z rodzaju Echerichia są krótkimi prostymi pałeczkami. Najważniejsze cechy biochemiczne E.coli to zdolność fermentowania laktozy i rozkładania tryptofanu do indolu. Większość gatunków tego rodzaju wchodzi w skład fizjologicznej flory jelit ludzi i zwierząt i jest izolowana z próbek kału. Jednak kolonizująca organizm poza przewodem pokarmowym E.coli jest oportunistycznym patogenem. Najczęściej jest czynnikiem etiologicznym zakażeń dróg moczowych zapalenia pęcherza moczowego i ostrego odmiedniczkowego zapalenia nerek. Pałeczka okrężnicy może wywoływać także zapalenie opon mózgowo - rdzeniwych u noworodków, zapalenie pęcherzyka żółciowego, zapalenie ucha środkowego i zapalenie płuc.

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Escherichia W obrębie gatunku E.coli spotykane są szczególnie, patogenne odmiany serologiczne serotypy. Serotypy patogenne podzielono na pięć wirotypów w zależności od patogenezy wywoływanych przez nie biegunek. Mają one różne cechy i są wyposażone w odmienne czynniki chorobotwórczości. Pałeczki E.coli wywołujące stany biegunkowe: enteropatogenne (EPEC) biegunki niemowląt enterokrwotoczne (EHEC) - w tym E.coli 0157:H7 enterotoksykogenne (ETEC) biegunki podróżnych enteroinwazyjne (EIEC) zakażenia podobne do czerwonki bakteryjnej enteroagregacyjne (EAEC)

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Escherichia Kliniczne objawy zakażenia pałeczkami EPEC: - wodnista biegunka - kał może zawierać śluz (bez krwi) - gorączka - złe samopoczucie - wymioty - nietolerancja pożywienia - odwodnienie - utrata wagi Choroba trwa 5-15 dni, ale może przejść w stan chroniczny. Dotyczy głównie dzieci do 2 lat.

3. Charakterystyka pałeczek z rodzaju Escherichia Objawy kliniczne zakażenia pałeczkami EHEC: - silne skurczowe bóle brzucha - wodnista biegunka (na ogół bez lub z niewielką gorączką) - krwawe stolce pojawiają się 2-3 dnia choroby - czasami zakażeniu towarzysza wymioty Okres wylęgania 3-4 dni. Średni czas trwania choroby niepowikłanej 6-8 dni.

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne A. Agarowe podłoża wybiórczo różnicujące do posiewów wstępnych MacConkey pożywka słabo wybiórcza do izolacji pałeczek gramujemnych. Zawartość soli żółciowych i fioletu krystalicznego hamuje wzrost bakterii gramdodatnich. Zawartość laktozy pozwala na różnicowanie pałeczek laktozododatnich z tymi, które nie rozkładają laktozy. W obecności zawartego w podłożu wskaźnika czerwieni obojętnej, kolonie bakterii rozkładające laktozę laktozododatnie zabarwiają się na kolor różowy i są otoczone różową strefą (np. Escherichia coli). Szczepy, które nie rozkładają laktozy laktozoujemne, mają bezbarwne kolonie (np. Salmonella, Shigella).

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne wzrost Escherichia coli na MC wzrost Salmonella spp. na MC

wzrost Shigella MC wzrost Yersinia - MC

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne MacConkey z sorbitolem podłoże wybiórcza do wykrywania enterokrwotocznej pałeczki E.coli (EHEC) O157. Podłoże to zamiast laktozy zawiera sorbitol, telluryn i cefiksym, rozkładany przez pałeczki okrężnicy, z wyjątkiem EHEC, które tworzą na nim bezbarwne kolonie (z beżowym środkiem). wzrost O157 na MC z sorbitolem

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne Hektoen (He) wybiórcze podłoże do izolacji pałeczek Salmonella i Shigella. Obecne w pożywce sole żółciowe uniemożliwiają wzrost bakteriom gramdodatnich i hamują wzrost fizjologicznej flory gramujemnej. Różnicowanie pałeczek jelitowych opiera się na zdolności fermentowania zawartej w pożywce laktozy, sacharozy i salicyny oraz wytwarzaniu H 2 S. Pałeczki nie fermentujące laktozy występują w postaci zielonych kolonii (Shigella). Pałeczki nie fermentujące laktozy, ale wytwarzające H 2 S mają zielono-niebieskie kolonie z lub bez czarnego środka (Salmonella). Pałeczki fermentujące laktozę tworzą kolonie żółte, a strefa wzrostu w ich pobliżu jest różowołososiowa do jasnopomarańczowej (Escherichia, Enterobacter, Klebsiella).

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne wzrost Salmonella spp. Na He wzrost Shigella spp. na He

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne wzost Escherichia coli na He

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne Podłoże SS podłoże wybiórcze do izolacji pałeczek Salmonella i Shigella. Zawarta w podłożu laktoza pozwala odróżnić kolonie pałeczek laktozododatnich, w tym najliczniej występującej w kale E.coli. Tiosiarczan sodowy jest źródłem siarki gwarantującym wykrycie szczepów wytwarzających H 2 S. Pałeczki Salmonella (nie wytwarzające H 2 S ) i Shigella tworzą kolonie bezbarwne, a szczepy Salmonella wytwarzające H 2 S bezbarwne z zaczernionym środkiem.

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne wzrost Salmonella spp. na SS wzrost Shigella spp. na SS

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne Podłoże Wilsona-Blaira (WB) podłoże do izolacji pałeczek Salmonella. Związki bizmutu i soli żelaza powodują charakterystyczny wzrost Salmonella. Umożliwia ono wykrycie szczepów laktozododatnich. Pałeczki Salmonella tworzą czarne kolonie z czarną strefą wokół koloni, z metalicznym połyskiem i podłożem pod kolonią zabarwionym na czarno. Wzrost innych pałeczek jelitowych jest silnie zahamowany. Pałeczki Shigella w ogóle nie rosną tym podłożu.

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne B. Płynne podłoża wybiórczo namnażające Podłoże SF jest to wybiórczo - namnażajace płynne podłoże do wzbogacania próbek zawierających pałeczki jelitowe. Przeznaczone jest do wybiórczego namnażania pałeczek Salmonella. Czynnikiem wzmagającym ich wzrost jest zawarty w pożywce selenin sodowy.

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne C. Podłoża do identyfikacji biochemicznej: - p. Kliglera, - woda peptonowa z tryptofanem, - p. z mocznikiem wg Chistensena - p. z 10% laktozą, - p. z cyjankiem potasu, - p. z malonianem sodu, - p. do wykrywania ruchliwości szczepu, - p. do wykrywania fermentacji cukrów i alkoholi (woda peptonowa z mannitolem, dulcytolem, sorbitolem, arabinoza, ramnoza, sacharozą, ksylozą, maltozą), - p. do dekarboksylacji lizyny ornityny, argininy, - p. z cytrynianem wg Christensena, - p. Simmonsa, - p. Clarka, - p. z fenyloalaniną

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne D. Niewybiórcze podłoża namnażające - półpłynny agar odżywczy - bulion mózgowo sercowy - agar adżywczy - agar tryptozowo - sojowy

4. Podłoża bakteriologiczne i odczynniki diagnostyczne E. Odczynniki diagnostyczne: do wykonywania testów lateksowych - do wykrywania antygenów Salmonella - do wykrywania antygenów EPEC - do wykrywania antygenów EHEC surowice odpornościowe do aglutynacji szkiełkowej - do wykrywania antygenów Salmonella - do wykrywania antygenów Shigella

5. Przebieg badania PB-01-EB Wykrywanie i identyfikacja pałeczek z rodziny Enterobacteriaceae w diagnostyce schorzeń jelitowych Metoda polega na posiewie badanych próbek na selektywne i różnicujące podłoża bakteriologiczne, inkubacji w optymalnej temperaturze, posiewie charakterystycznych kolonii na podłoża umożliwiające identyfikację biochemiczną drobnoustrojów oraz serologicznym potwierdzeniu chorobotwórczych drobnoustrojów rodzaju Salmonella, Shigella, EPEC i EHEC.

5. Przebieg badania Posiew wstępny badanych próbek Inkubacja podłoży posiewów wstępnych w temp. 37 0 C ±1 0 C Czas inkubacji uzależniony od rodzaju podłoża: SF : 16-20 h MC, MC-S, He : 18-24h SS : 24-48h WB : 42-48h Wykonanie testu lateksowego na wykrycie obecności antygenów Salmonella Klasyfikacja i izolacja kolonii do dalszej identyfikacji po inkubacji ocenia się hodowlę na podłożach i wyznacza do dalszego badania najczęściej dwie kolonie podejrzane o przynależność do chorobotwórczych pałeczek z rodzaju Salmonella, Shigella, Yersinia.

5. Przebieg badania Morfologiczny obraz kolonii Salmonella, Shigella, Yersinia izolowanych z podłóż posiewu wstępnego

5. Przebieg badania Posiew na szeregi biochemiczne Różnicowanie biochemiczne w zależności od podłoża, z którego się izoluje kolonie opiera się na metodzie jedno- lub dwuetapowej - izolacja z MC metoda dwuetapowa I etap szereg krótki II etap szereg długi, dobór podłoży zależy od wyników reakcji uzyskanych po 18-24h hodowli na podłożach szeregu krótkiego - izolacja z SS, He, WB metoda jednoetapowa szereg wydłużony Inkubacja szeregów w temp. 37 0 C ±1 0 C przez 18-24 godziny Identyfikacja biochemiczna Potwierdzenie serologiczne badanych szczepów

5. Przebieg badania szereg krótki Escherichia coli szereg długi Escherichia coli

5. Przebieg badania szereg krótki i długi Salmonella spp.

szereg wydłużony Salmonella szereg wydłużony - Shigella

6. Potwierdzenie serologiczne Wyizolowane szczepy na podstawie właściwości biochemicznych określone jako Salmonella i Shigella poddaje się serologicznemu potwierdzeniu metodą odczynu aglutynacji szkiełkowej przy użyciu surowic odpornościowych. Identyfikacja wszystkich odmian serologicznych rodzaju Salmonella odbywa się na drodze serologicznej. Postępowanie dotyczącej pełnej identyfikacji serowarów z użyciem zestawów surowic z przeciwciałami dla antygenów rzęskowych (H) i somatycznych (O) jest wyznaczone przez schemat Kauffmana-White a. Schemat wykorzystuje budowę antygenową powierzchni pałeczek Salmonella, uwzględniając antygeny: O (somatyczny), H (rzęskowy) i Vi. Podział serowarów na grupy wynika z budowy antygenu O. Zdecydowana większość serowarów izolowanych z materiałów klinicznych od ludzi należy do grup A, B, C 1, C 2, D i E. Odmiany serologiczne różnią się swoistością antygenów rzęskowych.

6. Potwierdzenie serologiczne Badanie przeprowadza się wykonując szereg aglutynacji szkiełkowych. Szczep powinien tworzyć homogenie zmętnienie w 3 % roztworze NaCl. Przygotowuje się gęstą, mleczną zawiesinę szczepu w kropli surowicy. Aglutynacje przeprowadza się na szkiełku podstawowym z odpowiednimi surowicami w odpowiedniej kolejności. - najpierw surowica HM zawierająca przeciwciała dla wszystkich antygenów rzęskowych Salmonella. Aglutynacja świadczy o przynależności do Salmonella. - surowice grupowe zawierające mieszaninę przeciwciał dla antygenów somatycznych w obrębie poszczególnych grup: kolejno AO, BO, CO, DO, EO. Aglutynacja świadczy o przynależności do określonej grupy serologicznej. - surowice w obrębie danej grupy mieszanin antygenów rzęskowych fazy 1. Aglutynacja świadczy o przynależności do określonego serowaru. W przypadku trudności w oznaczeniu szczep jest wysyłany do NIZP-PZH celem dalszej identyfikacji.

Wykrywanie EPEC: Z podłoże MC izoluje się 10 różowych (laktozododatnich kolonii) i każdą posiewa na wodę peptonową z tryptofanem i malonian sodu. Po 18-24 godzinnej inkubacji w temp. 37 0 C ± 1 0 C - hodowle malonianoujemne poddaje się testowi lateksowemu na obecność antygenów EPEC wykorzystując hodowlę w wodzie peptonowej z tryptofanem. Dodatni wynik potwierdza się szeregiem biochemicznym wykorzystując hodowlę w malonianie sodu - hodowle malonianododatnie wyklucza EPEC

Wykrywanie O157: Z podłoża MC-S wybiera się 10 koloni sorbitoloujemnych, czyli jasnych z beżowym środkiem i każdą posiewa na wodę peptonową z tryptofanem i malonian sodu. Po 18-24 godzinnej inkubacji w temp. 37 0 C ± 1 0 C - hodowle malonianoujemne poddaje się testowi lateksowemu na obecność antygenów O157 wykorzystując hodowlę w wodzie peptonowej z tryptofanem. Dodatni wynik potwierdza się szeregiem biochemicznym wykorzystując hodowlę w malonianie sodu - hodowle malonianododatnie wyklucza O157

Rotawirusy są jednym z czynników etiologicznych stanów biegunkowych małych dzieci. Wywołują one zachorowania głównie jesienią i zimą. Są wydalane z kałem osób chorych. Okres wylęgania wynosi 1-3 dni, choroba trwa zwykle 4-10 dni. Główne objawy zakażenia to: biegunka, wymioty, gorączka. Wykrycie rotawirusów jest najbardziej prawdopodobne, kiedy próbka pobrana jest w okresie ostrych objawów choroby. Pobranie próbek po ustąpieniu ostrych objawów biegunki, ilość antygenów może być niewystarczająca do wystąpienia pozytywnej reakcji. Wykrywanie obecności rotawirusów i adenowirusów w próbce kału odbywa się za pomocą szybkiego testu immnunochromatograficznego. Jest to jakościowy test opierający na reakcji immunologicznej antygen przeciwciało i wystąpieniu reakcji barwnej.

5. Sposób pobierania i transportu próbek do badań bakteriologicznych i wirusologicznych Nosicielstwo pałeczek z rodzaju Salmonella i Shigella W celu wykonania badania na nosicielstwo należy pobrać 3 próbki kału przez 3 kolejne dni. Każdego dnia używamy jednego kompletu probówki z podłożem transportowym Amies. Sposób pobierania próbek kału do badania - wyjąć z jednego opakowania probówkę z wymazówką - trzymając wymazówkę za korek pobrać końcem z watą odrobinę kału - włożyć wymazówkę do probówki - upewnić się, że korek wymazówki szczelnie zamyka probówkę - probówkę podpisać: imieniem i nazwiskiem, datą i godziną pobrania - każdego z trzech kolejnych dni powtórzyć czynności opisane powyżej - probówki przechowywać w temperaturze pokojowej

5. Sposób pobierania i transportu próbek do badań bakteriologicznych i wirusologicznych Nosicielstwo pałeczek z rodzaju Salmonella i Shigella W przypadku problemu z pobraniem próbki wymazu z kału można wykonać wymaz z odbytu w taki sposób, aby na wymazówce widoczny był wyraźny ślad kału. Transport próbek do laboratorium Wszystkie 3 próbki dostarczyć razem, najpóźniej w ciągu 72 godzin od pobrania pierwszej próbki do Punktu Przyjmowania Próbek Epidemiologicznych. Wraz z próbkami należy dostarczyć wypełnione zlecenie na badanie - Formularz F1/IT-07-EB/PO-14.

5. Sposób pobierania i transportu próbek do badań bakteriologicznych i wirusologicznych Osoby chore, ozdrowieńcy, nosiciele, osoby ze styczności Czas pobrania : - w okresie objawowym, na początku choroby - przed rozpoczęciem antybiotykoterapii - w momencie nawrotu objawów (biegunka) - w przypadku kontroli po leczeniu, nie wcześniej niż po upływie trzech dni od zakończenia antybiotykoterapii Sposoby pobierania próbek: - kał oddać do czystego, suchego naczynia - w przypadku niemowlęcia, materiał pobrać z jałowej pieluszki - jeżeli w kale znajdują się nabłonki, krew, śluz, należy pobrać próbki z tych miejsc

5. Sposób pobierania i transportu próbek do badań bakteriologicznych i wirusologicznych Osoby chore, ozdrowieńcy, nosiciele, osoby ze styczności Rodzaj próbki : próbka świeżego kału - kał uformowany (grudka wielkości orzecha laskowego) pobrać jałową łopatką do jednorazowego pojemnika, a następnie zamknąć szczelnie pokrywką w przypadku kału płynnego pobrać około 2-3 ml wymaz z próbki kału - pobrać za pomocą wymazówki z kilku miejsc, uwzględniając miejsca patologiczne i umieszczamy w probówce z podłożem transportowym głęboki wymaz z odbytu - wprowadzić wymazówkę poza zwieracz zewnętrzny do odbytnicy, w taki sposób, aby na waciku widoczny był wyraźny ślad kału i umieścić w probówce z podłożem transportowym. Jest on najlepszym materiałem przy zakażeniu wywołanym przez pałeczki Shigelli. W przypadku badań w kierunku rotawirusów i adenowirusów należy pobrać wyłącznie próbkę świeżego kału.

5. Sposób pobierania i transportu próbek do badań bakteriologicznych i wirusologicznych Osoby chore, ozdrowieńcy, nosiciele, osoby ze styczności Przechowywanie i transport próbek do laboratorium: - świeży kał: dostarczyć do laboratorium w ciągu 2-3 godzin - wymaz z próbki kału lub wymaz z odbytu nie dłużej niż w ciągu 72 godzin, do czasu transportu do laboratorium, próbki przechowywać w temperaturze pokojowej Do pobranych próbek dołączyć wypełnione zlecenie na badania mikrobiologiczne - Formularz F1/IT-07-EB/PO-14.

DZIĘKUJĘ ZA UWAGĘ