Wst p do obs ugi bazy danych Reaxys

Transkrypt

1 Wst p do obs ugi bazy danych Reaxys Baza danych Reaxys pozwala na przeszukiwanie literatury z zakresu chemii, biologii i nauk pokrewnych. Przeszukiwanie literatury odbywa si mo e na ró nych drogach: - literatura; - nazwy i formu y; - struktury i reakcje (dodatkowo mo na u aplikacji Synthesis Plans ). W dalszej cz ci instrukcji: -pole zakre lone niebieskim kó kiem oznacza tylko zaznaczenie, aby zwróci Pa stwa uwag ; -niebieskie kó ko ze strza oznacza, miejsce w które nale y klikn mysz aby przeprowadzi kolejny krok.

2 Przeszukiwanie Literaturowe

3

4 Po naci ni ciu poprzednio zaznaczonego okna otworzy si nast puj ce pole w którym w zale no ci od potrzeb mo emy dokona przeszukiwania tematycznego

5 Dokonamy wyszukiwania poj cia menthol auxiliary, z równoczesnym zaw eniem przeszukiwania tylko do artyku ów.

6 Po wprowadzeniu danych mo emy rozpocz wyszukiwanie poprzez naci ni cie pola SEARCH

7 Po zako czeniu wyszukiwania otrzymamy nowy widok strony gdzie zostan pokazane wyniki przeszukania. Ka dy z uzyskanych wyników mo na obejrze dok adniej, w tym celu nale y skorzysta z czerwonych rozszerze pod ka dym cytowaniem.

8 Tu wida efekt po naci ni ciu pola Title/Abstract

9 Je li z komputera na którym Pa stwo pracujecie macie dost p do wersji elektronicznych publikacji, mo na bezpo rednio przej do wyszukanego artyku u, w tym celu nale y nacisn pole Full text

10 Otworzy si nast puj ce okno. Wtedy nale y poczeka, albo nacisn czerwony numer DOI

11 Je li w ramach wyszukiwania liczba uzyskanych reakcji jest zbyt mnoga, mo na dokona zaw enia poszukiwa ródju uzyskanych artyku ów. Do tego s y kolumna po lewej stronie Filter by:

12 Zaw enia uzyskanych wyników tylko do publikacji najnowszych tzn. z lat , dokonamy poprzez ich zaznaczenie. Nast pnie nale y nacisn pole Limit to

13 Operacja ta doprowadzi a do 6 w porównaniu do poprzednio uzyskanych 34 cytowa.

14 Aby powróci do strony g ównej bazy i dokona nowego wyszukiwania nale y nacisn pole Query

15 Aby dokona wyczyszczenia poprzednio wpisanych danych wciskamy przycisk Reset Form lub Clear Query

16 Przeszukiwanie poprzez nazwy lub sk ad pierwiastkowy

17

18 Po wci ni ciu pola Names & Folmulas otworzy si nast puj ce pole. Tak jak w poprzednim przypadku nale y je wype ni danymi których poszukujemy.

19 Wyszukamy has a menthol. Podczas wpisywania baza podpowiada nam podobne sformu owania które znalaz a, mo na z nich skorzysta ale nie jest to konieczne.

20 Tym razem oprócz wyszukiwania nazwy zwi zku dokonamy dodatkowego zaw enia wyszukiwania. Dodatkowo chcemy dowiedzie si warto temperatury wrzenia danej substancji. W tym celu musimy wybra pole Physical

21 Po otworzeniu si nowego pola wybieramy boiling point i naciskamy pole OK

22 Wtedy na stronie g ównej oprócz has a menthol pojawi si dodatkowe parametry wyszukiwania. Mo emy rozpocz przeszukiwanie.

23 Po zako czeniu wyszukiwania uzyskujemy tabel wyników, gdzie w dodatkowej kolumnie przy ka dym znalezionym wyszukaniu znajduj si dost pne dla tej cz steczki dane. Po naci ni ciu interesuj cego nas pola dane te pojawi si.

24 Wybieramy interesuj cy nas parametr, temperatura wrzenia

25 Pojawi si tabela z danymi liczbowymi, z dodatkow pe informacj bibliograficzn.

26 Tak jak poprzednio aby rozpocz nowe przeszukanie trzeba nacisn przycisk Query w górze ekranu.

27 Nast pnie wyczy ci poprzednie dane.

28 Przeszukiwanie: struktura i reakcje

29

30 Po wybraniu trzeciej mo liwej drogi przeszukiwania bazy, poka e nam si nast puj co wygl daj ca strona. Podczas tego rodzaju przeszukiwania musimy narysowa zwi zek lub ca reakcj chemiczn której szukamy. W tym celu musimy pos si specjalnym programem do rysowania (MarvinSketch)

31 Po w czeniu tego programu uzyskujemy okno, w którym mo emy narysowa interesuj nas reakcj lub zwi zek.

32 Dokonamy wyszukiwania syntezy Sultamu Oppolzera. Narysowali my struktur interesuj cej cz steczki, przed któr wstawili my strza. Oznacza to e chcemy znale wszystkie mo liwe sposoby syntezy tego zwi zku bez narzucania struktury substratu. Po zako czeniu rysowania w lewym dolnym rogu ekranu naciskamy pole Transfer Query co pozwoli na przeniesienie naszego zapytania do programu Reaxys.

33 Tak b dzie wygl da strona po zaimportowaniu danych. Je li wszystko si zgadza rozpoczynamy przeszukiwanie bazy.

34 Po zako czeniu przeszukiwania program wy wietli wyniki, które mo emy przegl da, dokonywa ich zaw ania.

35 Dodatkow funkcj przydatn przy planowaniu syntezy jest aplikacja Synthesis Plans

36

37 Po jej naci ni ciu otworzy si nowa strona, gdzie w celu rozpocz cia przeszukania nale y nacisn pole New.

38 Nale y otworzy program do rysowania

39 Rysujemy cz steczk której drogi syntetycznej poszukujemy. Nast pnie eksportujemy wszystko do bazy Reaxys.

40 Po zaimportowaniu danych zaczynamy przeszukiwanie bazy.

41 Po zako czeniu wyszukiwania, uzyskujemy list rezultatów. Po ich obejrzeniu i okre leniu która reakcja nas interesuje naciskamy wyst puj cy przy niej przycisk Add selected, wtedy nast pi przeniesienie tego etapu do okna zbiorczego na górze strony.

42 Aby wyszuka drog syntetyczn nowo wyszukanego zwi zku, w oknie zbiorczym pod substratem pole naciskamy Synthesize

43 Uzyskamy wtedy pasek rozszerzenia gdzie wybieramy opcj Manually. Co rozpocznie proces wyszukiwania sposobu syntezy tego zwi zku.

44 Ponownie uzyskamy list reakcji, t która nas interesuje nale y doda do okna g ównego poprzez naci ni cie Add selected

45 Po zako czeniu wyszukiwania ca ego ci gu syntetycznego uzyskane dane mo na zapami ta w formie PDF. W tym celu nale y nacisn pole Output.

46 Potwierdzamy ch uzyskania pliku PDF

47 Dokonujemy ci gni cia i zapami tania pliku.

48 Uzyskany PDF