Advances in Biochemistry

Transkrypt

1 POLSKIE TOWARZYSTWO BIOCHEMICZNE PL IS S N Advances in Biochemistry TOM 42, NR 4,1996 Tadeusz Reichstein Wspomnienia Choroby wywołane przez priony. 320 Rejon lizy faga A Antygeny zgodności tkankowej MHC I I Transport enzymów lizosomalnych receptory M 6 P Kwas arachidonowy Eikozanoidy Komunikat Komisji Słownictwa. 369 Roczny spis tre ś c i...370

2 K w a rta ln ik,,postępy B io c h e m ii" w ydaw an y z pom ocą finansow ą K o m ite tu Badań N aukow ych

3 SPIS TREŚCI CONTENTS W YDAW CA Editor POLSKIE TOWARZYSTWO BIOCHEMICZNE Polish Biochemical Society ul. Pasteura Warszawa Poland D ru k a rn ia N a u k o w o -T e c h n ic z n a M iń s k a W arszaw a REDAKCJA Editorial Board REDAKTOR NACZELNY Editor in chief ZOFIA ZIELIŃSKA tel REDAKTORZY Editors GRAŻYNA PALAMARCZYK tel ANDRZEJ JERZMANOWSKI tel w ANNA SZAKIEL tel JOLANTA GRZYBOWSKA tel BARBARA ZARZYCKA tel w. 332 R EC EN ZEN C I ZESZYTU Referees of this issue PIOTR CEGŁOWSKI (Warszawa) JADWIGA GNIOT-SZULŻYCKA (Toruń) ANNA INGLOT (Wrocław) WITOLD JACHYMCZYK (Warszawa) ANDRZEJ JERZMANOWSKI (Warszawa) JOANNA STROSZNAJDER (Warszawa) GRAŻYNA PALAMARCZYK (Warszawa) A D R ES REDAKCJI Address REDAKCJA KWARTALNIKA POSTĘPY BIOCHEMII POLSKIE TOWARZYSTWO BIOCHEMICZNE ul. Pasteura Warszawa tel. (2) w. 441 fax: (22) Tadeusz Reichstein Noblista z W ło cław ka W spomnienie Tadeusz Reichstein the Nobelwinner from Włocławek Obituary Pasażowalne amyloidozy m ózgowe czyli choroby w y w o łane przez priony: czy struktura czynnika scrapie jest już rzeczywiście znana? Transmissible cerebral amyloidoses or prion diseases: is the structure of the infectious agent really understood? PAWEŁ P. LIBERSKI, JOLANTA BRATOSIEWICZ Rola białek kodowanych przez faga 1 w destrukcji bakteryjn ej ściany kom órkow ej i kontroli czasu lizy Role of bacteriophage À,-proteins in destruction of bacterial cell wall and the control of lysis timing SABINA KĘDZIERSKA, ALINA T A Y L O R Budowa i funkcja antygenów zgodności tkankowej (M H C ) klasy II Structure and function of the MHC class II molecules BOGDAN FALKIEWICZ, BOGDAN LIBEREK W ew nątrzkom órkow y transport enzym ów lizosomalnych Rola receptorów m annozo-6 fosforanu Mannose-6 phosphate receptors in intracellular trransport of lysosomal enzymes BARBARA CZARTORYSKA Kwas arachidonow y w fizjologii i patologii tkanki nerw ow ej Arachidonic acid in physiology and pathology of nervous tissue LUDMIŁA ŻYLIŃSKA, LILLA LACHOW ICZ Eikozanoidy m ózgow e przekaźniki sygnałów Eicosanoides brain's signal transducers LILLA LACHOWICZ, LUDMIŁA ŻYLIŃSKA Komunikat Komisji Słow nictw a Report of the Nomenclature Commission Roczny spis t r e ś c i

4 Tadeusz Reichstein noblista z Włocławka Wspomnienie W dniu 1 sierpnia 1996 roku zmarł w Bazylei profesor Tadeusz Reichstein, laureat Nagrody Nobla w dziedzinie fizjologii i medycyny, członek honorowy Polskiego Towarzystwa Biochemicznego. Tadeusz Reichstein urodził się 20 lipca 1897 roku we Włocławku, jako najstarszy syn Izydora Reichsteina chemika i przemysłowca oraz Gustawy z domu Brockman. Były to powszechnie poważane dwie rodziny żydowskie, spośród wielu osiadłych od stuleci na Kujawach. Bardzo silne więzi rodziców Tadeusza z krajem ich urodzenia przejawiły się między innymi i tym, że mieszkając już w Szwajcarii po odzyskaniu przez Polskę niepodległości przyjęli obywatelstwo polskie i pozostali polskimi obywatelami. Imię Tadeusz, zostało nadane profesorowi na cześć Tadeusza Kościuszki, a na pytanie jak trzeba określić jego narodowość, za kogo się uważa, profesor Reichstein odpowiadał: Czuję się Szwajcarem, polsko-żydowskiego pochodzenia. Kiedy Tadeusz miał 8 lat, jego ojciec przeniósł swoją rodzinę do Szwajcarii. Tadeusz Reichstein kształcił się tam i dorastał. Ukończył studia chemiczne na Politechnice w Zurychu i doktoryzował się w roku 1922 u wybitnego chemika, Hermanna Staudingera, późniejszego laureata Nagrody Nobla. Tadeusz Reichstein pozostał związany z Politechniką w Zurychu aż do 1938 roku. Przedmiotem początkowej działalności badawczej w Politechnice w Zurychu były związki warunkujące aromat kawy. Okazało się, że substancji takich jest bardzo wiele i trudno byłoby wyizolować lub zsyntetyzować kilka takich, których mieszanina imitowałaby aromat kawy naturalnej. Wielkim sukcesem natomiast zakończyły się podjęte przez Reichsteina próby opracowania chemicznej syntezy witaminy C. Jako materiał wyjściowy zastosowano glukozę. Po wielu próbach Reichsteinowi wprawdzie udało się otrzymać syntetyczną witaminę C, ale z bardzo niską wydajnością i przy wysokich kosztach. By je obniżyć należało znacznie zwiększyć wydajność syntezy. Dla chemika najtrudniejszym zadaniem było przeprowadzenie stereochemicznej przemiany sorbitolu w odpowiednią formę sorbozy bezpośredniego prekursora witaminy C. Tadeusz Reichstein wpadł na pomysł, aby do tej przemiany wykorzystać specyficzny enzym produkowany przez bakterie żyjące w przewodzie pokarmowym muchy. Szczegółową procedurę syntezy opublikował on w 1934 roku. Jej zastosowanie zmniejszało koszty produkcji witaminy C aż tysiąckrotnie! Pozwoliło to na obniżenie ceny 1 kilograma witaminy C z 13 tysięcy dolarów do 14 dolarów. Procedura wprowadzona przez Reichsteina przyniosła mu zasłużoną sławę i jest do dziś stosowana z małymi modyfikacjami. Za radą przyszłego noblisty Leopolda Rużicki podjął Tadeusz Reichstein w 1929 roku próby wyizolowania z kory nadnerczy biologicznie czynnego związku jednego, jak wówczas myślano niezbędnego do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Wieloletnie badania doprowadziły do wydzielenia z kory nadnerczy niewielkich ilości aż 29 związków rozpuszczalnych w tłuszczach, które w swojej cząsteczce zawierały pierścień sterydowy. Swe badania w tej dziedzinie od 1938 roku kontynuował Reichstein w Bazylei jako profesor zwyczajny i dyrektor Instytutu Farmaceutycznego tamtejszego Uniwersytetu. W końcu lat trzydziestych już trzy zespoły badawcze zajmowały się identyfikacją i ustalaniem chemicznej struktury steroidowych hormonów nadnerczy. Były to oprócz zespołu Tadeusza Reichsteina w Szwajcarii dwie grupy badaczy amerykańskich. Reichstein stopniowo izoluje i identyfikuje kolejne hormony z kory nadnerczy. Próbuje je też chemicznie syntetyzować. Pierwszą syntezę deoksykortykosteronu przeprowadził Reichstein, zanim jeszcze ten związek był przez niego wykryty w ekstraktach kory nadnerczy. Prócz deoksykortykosteronu wykrywa on także kortyzon i aldosteron. Syntetyczny kortyzon otrzymany przez Reichsteinau został podany pacjentom z chorobą reumatoidalną w roku Skutki tego odkrycia stały się rewolucyjne dla medycyny. Komitet Nagrody N obla uznał w 1950 roku, że nagrodą w dziedzinie medycyny i fizjologii należy uhonorować trzech uczonych: Tadeusza Reichsteina i dwóch amerykanów: Edwarda Kendalla i Philipa Hencha za badania nad hormonami sterydowymi nadnerczy. Przez następnych 17 lat, pod kierunkiem noblisty Reichsteina w Bazylei rozwikłano wiele dalszych problemów związanych z chemią hormonów sterydowych nadnerczy oraz chemią glikozydów. W roku 1967 profesor Reichstein przeszedł na emeryturę z imponującym dorobkiem naukowym obejmującym ponad 630 publikacji i 150 przewodów doktorskich, których był promotorem. Mógł więc odpoczywać jako człowiek zasłużony. Jednak, jako amatorbotanik, zajął się z upodobaniem badaniem paproci. Rychło stał się w tej dziedzinie ekspertem światowym. Do 1994 roku opublikował prawie 100 prac z pteridologii, stale pracując w tej dziedzinie. Mając 98 lat uczony przesłał 4 dalsze prace do czasopism botanicznych. Był to więc fenomen światowy. Ale to nie wszystko. Profesor Tadeusz Reichstein znany był ze swojej nadzwyczajnej skromności i szlachetnej dobroczynności. Opiekował się wieloma osobami, fundując im stypendia, w tym i kilku stypendystom z Polski. Jego osobowość była niezwykła i urzekała ludzi, którzy się z Nim zetknęli. W roku 1995 profesor Tadeusz Reichstein został wybrany przez Walne Zebranie Polskiego Towarzystwa Biochemicznego honorowym członkiem Towarzystwa. Dyplom honorowego członka Towarzystwa wraz z bukietem róż został wręczony profesorowi Reichsteinowi w Bazylei przez profesora Witolda 318 POSTĘPY BIOCHEMII 42(4), 1996

5 Filipowicza. Profesor Reichstein był niezwykle wzruszony tym wyróżnieniem, które poczytywał za zaszczyt. Wspominał kraj swego urodzenia z ogromnym wzruszeniem i serdecznością. Z wielkim żalem żegnamy profesora Tadeusza Reichsteina. Polskie Towarzystwo Biochemiczne Uprzejm ie zaw iadam iam y PT Koleżanki i PT Kolegów o przeniesieniu siedziby Zarządu Głównego Polskiego Tow arzystw a Biochemicznego na teren Instytutu Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego pokój 632 i 633 Obecny adres: Polskie T ow arzystw o Biochemiczne ul. Pasteura 3, W arszaw a Tel. bezpośredni Tel. przez centralę w. 352 Fax Dyżury biura Zarządu odbyw ać się będą jak dotychczas w e w torki w godz POSTĘPY BIOCHEMII 42(4),

6 A R T Y K U Ł Y A n 1 1 n ü h i Pasażowalne amyloidozy mózgowe czyli choroby wywołane przez priony: czy struktura czynnika scrapie jest już rzeczywiście znana? Transmissible cerebral amyloidoses or prion diseases: is the structure of the infectious agent really understood? PAWEŁ P. LIBERSKI1 2 JOLANTA BRATOSIEWICZ2 Spis treści: I. Wstęp II. Amyloid w pasażowalnyeh amyloidozaeh mózgowych III. Mutacje w genie białka prionu korelują z fenotypem C JD, G S S i FFI IV7. Badania na zwierzętach transgenicznych V. PrP jako amyloid: koncepcja pasażowalnyeh amyloidoz mózgowych VI. Co pozostało? Contents: I. Introduction II. Amyloid in transmissible brain amyloidoses III. M utations in the gene for PrP correlate with the phenotypic expression of C JD, G S S and FFI IV. Transgenic studies V. PrP as the amyloid: a concept of transmissible brain am yloidoses VI. W hat remains? I. Wstęp Dwanaście ofiar, poniżej 30 roku życia, zmarłych na rzadki zespół otępienny tzw. chorobę Creutzfeldta- Jakoba (CJD) sugeruje, że encefalopatia gąbczasta krów (choroba szalonych krów; BSE) zainfekowała ostatecznie człowieka [1]. Panika, która wybuchła z tego powodu spowodowała, że grób jednej z ofiar był głęboki na 9 stóp a nie jak zwykle na 6 zaś grabarze zostali wyposażeni w ochronne ubrania i rękawice chirurgiczne. Nie po raz pierwszy choroby wywołane przez priony, do których należy CJD i BSE, poruszyły media. Poprzednio gdy w 1985 roku brytyjska telewizja podała sensacyjną wiadomość iż chory, który zmarł prawdopodobnie na CJD został zakażony podczas podawania hormonu wzrostu wyizolowanego z przysadek człowieka wśród biorców hormonu i lekarzy wybuchło przerażenie. U ludzi przyjmujących hormon wzrostu nie obserwowano jednak epidemii CJD. Co stanie się teraz nie wiadomo. Młodzi ludzie 1 P ro f. d r n. m e d. L a b o r a t o r i u m M ik r o s k o p ii E le k tr o n o w e j i N e u r o p a t o l o g i i, S a m o d z ie ln e j P r a e o w n i B io lo g ii N o w o tw o r ó w, K a te d r y O n k o lo g ii A.M. ul. P a d e r e w s k ie g o 4, Ł ó d ź 2 m g r P r a c o w n ia M ik r o s k o p ii E le k tr o n o w e j Z a k ł a d u P a to m o r f o lo g ii, C e n tr u m Z d r o w ia M a tk i P o lk i umierający na C JD w Wielkiej Brytanii i Francji (jeden przypadek) chorują na tzw. wariant (vcjd) tej choroby. Charakteryzuje się on nieco odmiennym obrazem klinicznym (długi przebieg, dysestezje jako objaw wiodący, brak charakterystycznego obrazu EEG oraz otępienie jedynie w późnym okresie choroby) oraz neuropatologicznym (bardzo liczne blaszki amyloidowe; ang. Jlorid plaąues, otoczone wieńcem wakuoli) (Ryc. 1). Identyczny obraz uzyskano po inokulacji makaków BSE [2]. Istnieje zatem bezpośredni dowód eksperymentalny, że BSE przenosi się na naczelne powodując zmiany neuropatologiczne identyczne z tymi stwierdzanymi u człowieka. CJD i BSE należy do tzw. pasażowalnyeh amyloidoz mózgowych (inne nazwy to podostre encefalopatię gąbczaste lub tzw. choroby wywołane przez priony, prion diseases). Są one wywołane przez czynnik infekcyjny różnie określany terminami wirus powolny, prion lub wiriono dla odróżnienia go od zwykłach wirusów i wiroidów. Czynnik ten, w opinii autora, nie został dotąd w pełni scharakteryzowany. Poza CJD i BSE, do grupy tych chorób należą: kuru, i choroba Gerstmanna-Strausslera-Scheinkera (GSS) oraz śmiertelna rodzinna bezsenność (Jatal familial insomnia, F F I) u człowieka, naturalna scrapie u owiec, kóz i muflonów, pasażowalna encefalopatia norek 320 POSTĘPY BIOCHEMII 42(4), 1996

7 Ryc. 1 T y p o w a blaszk a am y lo id o w a z m ózgu ch o reg o na w arian t ch o ro b y C reu tzfeld ta-jak o b a. Z w rac ają uw agę w akuole prom ieniście otaczające blaszkę. Dzięki u przejm ości d r Ja m esa 1 r o n s i d e a, E d y n b u rg, Szkocja. (transmissible mink encephalopathy), przewlekła choroba wyniszczająca (chronic wasting disease, CW D) u kilku gatunków jeleni w stanie Madison w USA, wreszcie encefalopatia gąbczasta kotów i encefalopatię gąbczaste u kilku gatunków antylop, geparda, pumy, ocelota i tygrysa w ogrodach zoologicznych Wielkiej Brytanii. Niepasażowalne amyloidozy mózgowe to choroba Alzheimera i jej pochodne. II. Amyloid w pasażowalnych amyloidozach mózgowych Zjawiskiem osiowym w patogenezie wszystkich amyloidoz, włączając pasażowalne amyloidozy mózgowe, jest synteza i przetwarzanie molekularnie odmiennego prekursora amyloidu, który następnie odkłada się w tkankach mózgu [3-5]. Terminem amyloid określa się grupę molekularnie odrębnych białek (Afk PrP, gelsolina, transthyretyna, cystatina C), najczęściej glikozylowanych, posiadających wspólną konformację P-fałdową i związane z nią właściwości histochemiczne i ultrastrukturalne. Należą do nich: dwułomność w świetle spolaryzowanym po zabarwieniu czerwienią Congo, charakterystyczna żółtozielona fluorescencja po zabarwieniu tioflawiną S oraz formowanie włókien (Jibers) utworzonych z 2-4 bn wlókienek (Jihrils). Amyloid w pasażowalnych amyloidozach mózgowych, prion protein (PrP) o ciężarze kda, PrP 27-30, został po raz pierwszy zidentyfikowany we frakcjach uzyskanych z homogenatów mózgów chomików eksperymentalnie zakażonych scrapie [6], W nomenklaturze grupy Stanleya B. Prusineraz Uniwersytetu Kalifornijskiego, San Francisco, nazwa prion odpowiada nazwie czynnik scrapie [7-10], PrP jest produktem ograniczonej proteolizy większego białka prekursorowego, PrP 33-35sc (33-35 kda; sc, od scrapie) [11-13]. Dla CJD lub GSS można używać analogicznych terminów P rp CJD lub P rp GSS. Gen kodujący P rp sc (P R N P, od prion protein, akronim PRP, od proline-rich protein był już zajęty ) zlokalizowany jest u człowieka na chromosomie 20, a u myszy na chromosomie 2 (u myszy gen ten nosi nazwę Prn-p, [11, 14]. Geny dla PrP scharakteryzowano dla wielu gatunków ssaków w tym owiec [15], krów [16], świni domowej [17] naczelnych [18, 19] oraz torbaczy [20], Istnieją analogi tego genu u ptaków, Drosphila i nicienia C. elegans [21-23], Gen ten składa się, w zależności od gatunku, z dwóch lub trzech eksonów (u człowieka z dwóch); cala sekwencja kodująca białko (otwarta rama odczytu: open reading frame, ORF) jest zawarta w drugim (lub trzecim) eksonie [11]. PrP 33-35sc nie jest jednak pierwotnym produktem tego genu; jest nim białko PrP (c, od cellular), o sekwencji aminokwasów identycznej z PrPsc [11-13]. PrPc, w wyniku niezidentyfikowanych, prawdopodobnie konformacyjnych [24-27], modyfikacji postranslacyjnych, zostaje zmodyfikowane do p r p sc p r psc człowieka składa się z 253 aminokwasów i wykazuje wysoki stopień homologii z PrP innych gatunków ssaków [23]. Jak wspominano, sekwencja aminokwasów PrP i PrPs, oraz wszystkie m odyfikacje posttranslacyjne, włączając obecność C-końcowej kotwicy utworzonej z fosforylowanego glikolipidu (GPI, glycophospholipid inositol anchor) [28-29], są identyczne, natomiast białka te różnią się niektórymi własnościami fizykochemicznymi; między innymi w wyniku trawienia proteinazą K w obecności detergentu, PrP ulega całkowitej zaś P rp sc jedynie częściowej proteolizie uwalniając rdzeń PrP [12-13]. Konwersja PrP w PrPsc odbywa się na nieokreślonym etapie poprzez transport nowo syntetyzowanego PrPc na powierzchnię komórki, gdzie staje się ono dostępne dla PIPLC (phosphoinositol-specific phospholipase C), a następnie do lizosomów [30]. W badaniu elektronomikroskopowym homogenatów mózgu, PrP uwidacznia się jako tzw. włókienka towarzyszące scrapie (SAF, scrapie associated Jibrils) lub prion rods, których struktura spełnia wyżej wymienione kryteria włókien amyloidu [31-33] (Ryc. 2). Badania konformacji P rpc i P rp sc wykazały, że PrP w swojej strukturze trzeciorzędowej zawiera trzy oc-helisy zaś PrPsc przewagę obszarów (3-fałdowych [24-27, patrz niżej]. POSTĘPY BIOCHEMII 42(4),

8 Rye. 2 Liczne w łókienka tow arzyszące scrapie (scrapie-associated fibrils) w yizolow ane z m ózgów chom ików zak ażonych szczepem 263K scrapie. Liberski P.P., Brown P. i Gajdusek D.C., B arw ienie n eg aty w o we kw asem fosforow olfram ow ym. Pow iększenie, x III. Mutacje w genie białka prionu korelują z fenotypem C JD, GSS i FFI Pomimo iż PAM są wywołane przez dotychczas niezidentyfikowany czynnik zakaźny, 10-15% przypadków CJD oraz, ex definitione, wszystkie przypadki GSS i FFI występują rodzinnie dziedzicząc się autosomalnie dominująco [34-36]. Z klasycznych badań Dickinsona i wsp. [37-38] w Edynburgu wiadomo, że okres inkubacji (a zatem replikacja) czynnika scrapie znajduje się pod ścisłą kontrolą genu Sine (od shorter ineubation period) tożsamego z Prn-p (analog genu P R N P u człowieka [39]. Gen dla PrP (PRNP) u człowieka stał się zatem oczywistym celem poszukiwań zmian ko-segregujących z fenotypową ekspresją choroby. Pierwsza mutacja wykryta w obrębie P R N P była mutacją kodonu 102 stwierdzona w GSS i prowadząca do substytucji proliny leucyną [40] (Ryc. 3). Mutacje te (Leu102) wykryto w wielu rodzinach GSS na całym świecie [41-49] (łącznie z oryginalną austriacką rodziną, w której po raz pierwszy opisano ten zespół w 1936 r. [50]). W niezwykłej rodzinie (Indiana kindred) z GSS ze stanu Indiana, USA [51], charakteryzującej się obecnością typowych dla choroby Alzheimera, tau-pozytywnych dystroficznych neurytów (patrz niżej) współwystępujących ze zmianami specyficznymi dla GSS), występuje mutacja kodonu 198 prowadząca do substytucji fenyloalaniny seryną zaś w podobnej fenotypowo rodzinie ze Szwecji występuje mutacja kodonu 217 prowadząca do substytucji kwasu glutaminowego argininą [52-53], Mutacje w obrębie genu dla PrP (PRNP) wykryto także w rodzinnych przypadkach CJD [54-58, 34], Mutację kodonu 200 prowadzącą do substytuacji glutaminy lizyną (Ryc. 4) wykryto we wszystkich trzech ogniskach endemicznej CJD: w Izraelu u Żydów Stefardyjskich pochodzenia libijskiego ( u wandering Jew of the Diaspora'; [59-61]), w Czechosłowacji Ryc. 3 W zó r p rążk ó w p o reakcji P C R i d o t b io t o raz h ybrydyzacji z w y znak o w anym i ra d io a k ty w n ie so n d a m i specyficznym i d la form y p raw idłow ej (P ro ) i zm u to w an ej (Leu) k o d o n u 102. O b ecn e są intensyw ne p rążk i na filtrach in k u b o w an y ch z so n d a m i specyficznym i d la ty p u dzikiego; na filtrach in k u b o w a n y c h z so n d a m i specyficznym i d la ty p u z m u to w a nego p rążki są słabe lub ich brak. 322 POSTĘPY BIOCHEMII 42(4), 1996

9 »l>bc IW rxfcsure. Ryc. 4 W zó r p rążk ó w po reakcji P C R i d o t b io t o raz hybrydyzacji z w y zn ak o w a n y m i rad io ak ty w n ie so n d a m i specyficznym i d la form y praw idłow ej (G lu) i zm u to w an ej (Lys) k o d o n u 200. T rzy p ró b y b a d a n e na filtrze 294 i 295 są h eterozygotyczne pod względem tego k o d on u (główki strzałek). ( Oravske kuru") [57] oraz w Chile [62]. Taka sama mutacja występuje jednak również w japońskiej rodzinie zc JD [63]. W fińskich, holenderskich, francuskich i amerykańskich (pochodzenia holenderskiego i węgierskiego) rodzinach z CJD wykryto mutacje kodonu 178 prowadzącą do substytuacji asparginy kwasem asparaginowym (Ryc. 5) [64-67]. Mutacje te wykryto także w sławnej rodzinie Backer, w której po raz pierwszy opisano rodzinne występowanie CJD [34, 68]. Identyczna mutacja występuje w przypadkach FFI, znanych w klasycznej literaturze neuropatologicznej jako demencje wzgórzowe (thalamic dementias) [69-73], Na marginesie, pierwszym, który opisał rodzinę z FFI był Gabriel Garcia Marquez w książce Sto lat samotności. Mutacja Leu105 występuje w przypadkach rodzinnej spastycznej paraparezy z mnogimi PrP-pozytywnymi blaszkami w korze ruchowej zaś nielicznymi w móżdżku [74]. Fenotyp ten może być także wariantem GSS. Mutacja Ile210 została odkryta we Włoszech [75] i Francji [76] w sporadycznych przypadkach CJD. Tego typu doniesienie należy traktować z ostrożnością ponieważ związki rodzinne mogą ujawnić się dopiero w badaniach genealogicznych kilka pokoleń wstecz. Wreszcie, wykryto podwójną mutację kodonów 180 (Val do Ile) i 232 (Met do Arg) w sporadycznych przypadkach CJD charakteryzujących się późnym początkiem (84 lata) oraz brakiem typowego zapisu EEG (tak jak w przypadkach z mutacją kodonu 178) [77]. W kilku rodzinnych przypadkach zespołów otępiennych wykazujących cechy pośrednie pomiędzy CJD i GSS oraz w przypadkach rodzinnych demencji bez charakterystycznego obrazu neuropatologicznego [78] wykryto w genie dla PrP wstawki (inserís) oktapeptydowych sekwencji powtarzalnych (repeats) w regionie pomiędzy kodonami 51 i 91 gdzie w warunkach prawidłowych znajduje się 5 takich oktapeptydów a w wymienionych rodzinnych przypadkach CJD ich liczba wzrasta do (Ryc. 6) [79-84], Obecność markerów molekularnych typowych dla CJD w rodzinach bez cech kliniczno-patologicznych tej choroby zmusza do refleksji nad redefiniowaniem molekularnym jednostek chorobowych z tej grupy [57], Schematy zmian molekularnych przedstawiają ryciny (Ryc. 3-7). Wszystkie wymienione mutacje występowały w przypadkach rodzinnych. Występująca endemicznie kuru, podobnie jak sporadyczne przypadki CJD, nie są spowodowane żadną mutacją. Natomiast sporadyczne przypadki CJD występują przede wszystkim u ludzi będących homozygotami dla polimorfizmu kodonu 129 P R N P (Ryc. 7) [83, 85-87]. W sporadycznych przypadkach CJD (w tym przypadkach jatrogennych po podawaniu ludzkiego hormonu wzrostu) przeważają homozygoty i29metmet lub 129Val Val w odróżnieniu od dominującej heterozygotycznej populacji 129Met vai [88-89], Szczególnie interesujące, Val129 występuje powiązana z Ser198 lub Arg217 w GSS Ryc. 5 W zór p rążk ó w po reakcji P C R i d o t biot o raz hybrydyzacji z w y zn ak o w anym i rad io ak ty w n ie so n d am i specyficznym i d la form y p raw idłow ej (Asp) i zm u to w an ej (Asn) k o d o n u 178. O b ecn o ść intensyw nych p rążk ó w d la sond ty p u dzikiego i brak prążków dla typu zm utow anego św iadczy o p raw id łowej budow ie k od o n u w b adanych próbkach. POSTĘPY BIOCHEMII 42(4),

10 Ryc. 6 Żel po reakcji PC R ob ejm ującej region o k ta p e p ty - dów (pom iędzy k o d o n a m i 51 i 91). Linie zaw ierają zam plifikow any fragm ent D N A praw idłow ej długości. D o d a tk o w y p rą żek na linii 23 (głów ka strzałki) zaw iera w staw ki oktapeptydow e. z tau-pozytywnymi dystroficznymi neurytami [52-53] zaś z Asn178 w rodzinnych przypadkach CJD [69, 72], Obecność genotypu Val129 Asn178 prowadzi do wystąpienia fenotypu CJD natomiast M et129 Asn178 jest powiązana fenotypowo z FFI [69, 72]. Należy zaznaczyć, iż obecność mutacji w obrębie ludzkiego genu dla PrP częściowo warunkuje fenotyp kliniczny CJD [56, 64, 90]. Dla przykładu, w 74% przypadków CJD z mutacją kodonu 200 występuje typowy zapis EEG. W odróżnieniu, zapis ten prawie nigdy nie pojawia się w przypadkach CJD z mutacją kodonu 178 [64]. Przypadki CJD z mutacją kodonu 178 cechuje znacznie wcześniejszy niż w przypadkach sporadycznych wiek zachorowania i znacznie dłuższy czas trwania choroby [64]. Jeszcze wcześniej manifestują się przypadki CJD, w których gen kodujący PrP zawiera dodatkowe wstawki [64]. Przypadki GSS zajmują ekstremalną pozycję, manifestując się naji» a % e y f e a o n e. wcześniej i trwając najdłużej. Fizjologiczna rola PrPc oraz rola mutacji genu PrP nie jest znana. Istnieją dwie podstawowe, a zarazem sprzeczne hipotezy. Hipoteza prionu sugeruje, iż konwersja P rp c do P rpsc, spowodowana przez mutacje w przypadkach rodzinnych lub będąca zjawiskiem stochastycznym w przypadkach sporadycznych, jest warunkiem koniecznym i wystarczającym do wystąpienia objawów choroby [91, 7-9, 92-93, 23], Według tej hipotezy, P rp sc, nabierając cech infekcyjnego białka, sam byłby czynnikiem infekcyjnym czyli prionem. Innymi słowami, pasażowalność procesu chorobowego byłaby jedynie epifenomenem. Druga, mniej ortodoksyjna hipoteza sugeruje, że konwersja PrPc w P rp sc zwiększa jedynie wrażliwość na zakażenie dotychczas niescharakteyzowanym wirusem. Na poparcie tej hipotezy przytacza się powiązanie wrażliwości na zakażenie naturalną strupie u owiec z określonym polimorfizmem długości fragmentów restrykcyjnych (RFLP) genu PrP (tożsamego z genem S IP ) [94-98] oraz powiązanie innego polimorfizmu dwóch kodonów tego genu z długością okresu inkubacji eksperymentalnej strupie u myszy [39, 99], U myszy charakteryzujących się krótkim okresem inkubacji po zakażeniu szczepem Chandler wirusa scrupie, kodon 108 genu PrP odpowiada leucynie, a kodon 189 treoninie. Natomiast u myszy o długim okresie inkubacji, kodon 108 odpowiada fenyloalaninie natomiast kodon 189, walinie [99]. Hipoteza wirino zakłada z kolei, iż jeśli P rp sc jest częścią czynnika infekcyjnego, czynnik ten byłby rodzajem chimery molekularnej utworzonej z wirusowospecyficznego oligonukleotydu (dotychczas niewyizolowanego, a zatem całkowicie hipotetycznego) i białka gospodarza (PrPsc); taka struktura tłumaczyłaby większość niezwykłych cech wirusa np. brak wywoływanej odpowiedzi immunologicznej [100, 101], Istnieje wreszcie możliwość, że konwersja PrPc do P rp sc jest jedynie indukowana przez dotychczas niewykryty wirus. IV. Badania na zwierzętach transgenicznych Ryc. 7 A u to ra d io g ra m o b razu jący polim orfizm k o d o n u 129. F iltr 310 in k u b o w a n y był z so n d ą specyficzną d la m etio n in y, filtr 311 z so n d ą specyficzną dla w aliny. G e n o ty p b ad an y ch p acjen tó w jest następ u jący : 1, M /M ; 2, M /M ; 3, M /V ;4, M /V ; 5, V/V; 6, M /M. Szczep 263 K scrupie (Sc237) jest patogenny dla chomików (Ha) ale nie myszy (Mo). Transgeniczne myszy Tg(HaPrP) zawierające transgen PrP chomika stają się natomiast wrażliwe na zakażenie tym szczepem, a okres inkubacji jest odwrotnie proporcjonalny do liczby kopii transgenu [93, 102]. Badania tego typu 324 POSTĘPY BIOCHEMII 42(4), 1996

11 jednoznacznie sugerują interację pomiędzy P rp c gospodarza a P rp sc zawartym w inokulum. Hipoteza prionu sugeruje, że amplifikacja P rp sc jedynie naśladuje replikację czynnika infekcyjnego. Wyniki badań innych eksperymentów z myszami transgenicznymi nie są jednak już tak jednoznaczne. Myszy transgeniczne Tg(M o Prn-pb) posiadające transgen Prn-pb (kodujący dłuższy okres inkubacji po zakażeniu szczepem Chandler) wykazują paradoksalne skrócenie (a nie spodziewane wydłużenie) okresu inkubacji po zakażeniu tym szczepem. U myszy transgenicznych Tg(M oprp-p101 L) transfekowanych transgenem zawierającym mutację kodonu 101 genu dla PrP (odpowiadającą mutacji kodonu 102 GSS, gen myszy zawiera delecję kodonu 55) pojawia się spontaniczna choroba neurozwyrodnieniowa charakteryzująca się obecnością wakuoli i PrP-immunopozytywnych blaszek amyloidowych [103], Z kolei u myszy transgenicznych, o dużej liczbie kopii transgenu PrP chomika Tg(HaPrP), spontanicznie pojawia się nekrotyzująca mielopatia oraz demielinizacyjna polineuropatia [104]. Efekt ten zależy od dawki transgenu. N a przykład, u homozygotycznych myszy Tg(H aprp + / + ) choroba rozwija się po dniach życia zaś u hemizygotycznych myszy T g (H ap rp +/~) dopiero po 650 dniach. Interesujące, zarówno u myszy Tg(M oprp-p101 L) jak i u myszy T g (H ap rp +/+) ze spontaniczną chorobą neurologiczną nie udaje się wykryć P rp sc, pomimo obecności PrP-immunododatnich blaszek amyloidowych. Modyfikacja ekspresji transgenu dodatkowo wpływa na fenotyp choroby. Dziesięciokrotnie większa ekspresja transgenu u myszy Tg(M oprp-p101 L) 2866 i 2477 powoduje wystąpienie objawów choroby już po dniach natomiast u myszy Tg(M oprp-p101 L)2866 skrzyżowanych z knock-outami Prn-p0/0 choroba pojawia się jeszcze wcześniej, bo po dniach [105]. Jeśli opublikowane dane o udanym pasażu z tych myszy (ale tylko na chomiki i myszy transgeniczne Tg(M oprp- -P101L) o niskiej liczbie kopii transgenu) [106] zostaną potwierdzone w niezależnym laboratorium, będzie to ostateczny dowód hipotezy prionu. Wyniki badań transgenicznych wskazują, że w konwersji P rpc-p rp sc bierze udział dodatkowy kom ponent, tzw. białko X [107, 108]. W odróżnieniu od myszy Tg(HaPrP), myszy zawierające transgen P R N P człowieka, Tg(HuPrP) nie wykazują zwiększonej wrażliwości na zakażenie materiałem CJD (okres inkubacji dni). Natomiast w chimerach Tg(M H u2m PrP), analogicznych do niżej opisanych chimer Tg(M H 2M PrP), okres inkubacji po zakażeniu CJD skraca się do około 200 dni. Różną wrażliwość myszy Tg(H uprp) i Tg(M H u2m PrP) na zakażenie CJD można tłumaczyć obecnością hipotetycznego chaperonowego białka X myszy, które biorąc udział w konwersji P rp c do P rpsc łatwiej interaguje z kom pleksem H u P rp CJD/M H u 2 M P rp c niż z kompleksem H u P rp CJD/H u P rp c. Co więcej konwersja P rp c-prpsc jest najłatwiejsza jeśli homología obu białek w kodonie 129 jest tożsama. U myszy Tg(HuPrP)132 (Val w kodonie 129) i Tg(HuPrP)440 (Met w tym samym kodonie) okres inkubacji po zakażeniu jest najkrótszy wtedy jeśli PrP w inokulum zawiera w kodonie 129 aminokwas identyczny jak ten kodowany przez transgen. To ostatnie zjawisko może również tłumaczyć wyniki badań z użyciem myszy transgenicznych Tg(M Hu2M PrP) i Tg(HPurP) bez konieczności odwoływania się do istnienia białka X. Hipoteza prionu oparta o założenie interakcji P rp c- P rpsc uzyskała oparcie w wyniku badań wykorzystujących myszy chimery. Inokulowanie in vitro komórek neuroblastoma transfekowanych chimerami genu PrP składającymi się z różnych kombinacji fragmentów genu chomika i myszy (geny te różnią się w 16 kodonach) prowadziło do powstawania P rp sc myszy (rozpoznawanego przeciwciałem monoklonalnym 3F4) jedynie wówczas gdy transgen (M HM 2 i M4) był rozpoznawany jako gen myszy, a nie chomika. Dla odróżnienia, transgeny H4 i H3M nie były rozpoznawane jako transgeny myszy lecz chomika i jako takie nie produkowały PrPsc. W oparciu o ww. transgeny (oraz dodatkowy transgen M H2M ) skonstruowano myszy transgeniczne, z których Tg (MH2M) były wrażliwe na zakażenie szczepem 263 K scrapie ( chomiczym ) natomiast myszy Tg(M HM 2) wykazywały oporność na ten szczep (białko M H2M jest rozpoznawane jako białko myszy, nie chomika). Interesujące, transgeny M H2M i MHM2 wykazują różnice jedynie dwóch kodonów. Jeżeli liczba kopii transgenu MHM2 jest bardzo duża (Tg(MH2M)294) wówczas myszy te stają się w końcu wrażliwe na zakażenie tym szczepem. Interpretacja wyników tego ostatniego eksperymentu jest w zasadzie analogiczna do tej tłumaczącej paradoksalne skrócenie okresu inkubacji u myszy Tg(M o Prn-pb); liczba kopii transgenu przezwycięża inherentną dla tego transgenu właściwość oporności na zakażenie szczepem 263 K. Obecność transgenu M H2M wpływa na okres inkubacji; okres inkubacji szczepu 263 K przepasażowanego przez myszy Tg(MH2M), a następnie przez chomiki syryjskie wydłuża się. Uzyskanie, poprzez homologiczną rekombinację, myszy bez PrP dostarczyło narzędzia, które umożliwiło zweryfikowanie przynajmniej części przedstawionych hipotez [92, ]. Myszy te nie wykazują początkowo żadnych zaburzeń rozwojowych [111], natomiast w późniejszym okresie obserwuje się defekt w funkcjonowaniu złącza synaptycznego [112], snu [113] oraz ataksję móżdżkową powiązaną ze zwyrodnieniem komórek Purkinjego [114], Po inokulacji, u myszy tych nie występują objawy scrapie oraz nie występuje replikacja czynnika zakaźnego [109]. Doświadecznia te wykazały, że PrP jest niezbędne dla replikacji czynnika natomiast nie pozwalają one na definitywne stwierdzenie, że PrP jest jednocześnie czynnikiem infekcyjnym [115]. POSTĘPY BIOCHEMII 42(4),

12 V. PrP jako amyloid: koncepcja pasażowalnych amyloidoz mózgowych PrP-dodatnia blaszka (płytka) amyloidowa stanowi najbardziej specyficzny składnik neuropatologii om a wianej grupy chorób. Ponieważ mózgi chorych na kuru zawierały miriady takich blaszek, dlatego też Gajdusek nazwał kuru galloping senscence of the juvenile [116]. Trzy dziesięciolecia później ustalono, iż blaszka amyloidowa w TSE zawiera P rp sc; tak więc P rp sc jest, ex definitione amyloidem w pasażowalnych amyloidozach mózgowych, niezależnie od tego czy białko to jest także częścią czynnika scrapie. Bezpośredniego dowodu, iż P rp sc zawiera przewagę charakterystycznych dla każdego amyloidu struktur (3-fałdowych w swojej budowie przestrzennej dostarczył po raz pierwszy Caughey i wsp. [24] posługując się spektroskopią w podczerwieni. Następnie P r u s i - n e r i wsp. [25-27] potwierdził, iż P rp sc zawiera około 54% struktur (3-fałdowych (Ryc. 8). W wyniku denaturacji SDS (który to proces powoduje znaczny spadek infekcyjności), odsetek struktur (3-fałdowych spada. Podobnie, wysokie ph powoduje spadek zarówno miana infekcyjności, jak i zawartości struktur (3-fałdowych w P rp sc. Dla odróżnienia, P rp c zawiera w swej konformacji trzy [117] obszary a-helikalne. Z kolei, trzy z czterech syntetycznych peptydów odpowiadających sekwencją czterem obszarom a-helikalnym P rp c tworzą samorzutnie włókna amyloidowe, co sugeruje obecność struktur (3-fałdowych a nie a-helikalnych, co potwierdzają badania z użyciem N M R (Ryc. 9) [117]. Co bardziej interesujące, wszystkie obszary a-helikalne mapują się do tej części P rp sc, która stanie się opornym na trawienie proteinazami PrP w CJD ale nie we wszystkich postaciach GSS. Razem, dane te dostarczają kolejnego dowodu, że interakcja białko-białko (PrPsc-PrPc) stanowi podstawowy proces patogenezy w pasażowalnych amyloidozach mózgowych. Safar i wsp. [ ] posługując się technikami spektroskopii dichroizmu kołowego zastosowanego do cienkich warstw PrP uzyskiwanych na szkle lub mice wykazali iż P rpsc zawiera 34% struktur (3-fałdowych i 20% a-helikalnych, zaś PrP odpowiednio 43% struktur (3-fałdowych bez obszarów a-helikalnych. Prusiner [105] przedstawił analogiczne dane dla P rp sc (30% a-helikoid, 43% struktur (3-fałdowych i 27% struktur przypadkowych (turn and coil); P rpc (odpowiednio 42%, 3% i 55%) oraz P rp (21%, 54% i 15%). Wszystkie te dane sugerują, że P rpsc w zajętym przez pasażowalne amyloidozy mózgu pozostaje głównie w konformacji (3-fałdowej w odróżnieniu od P rp c, które konformacyjnie jest głównie a-helikalne. Ostatnio opublikowano badania N M R fragmentu PrPc uzyskanego technikami rekombinacyjnymi w E. coli [117]. W odróżnieniu od poprzednio cytowanych modeli, P rpc zawiera tutaj trzy a-helikoidy (fragmenty , i 200 do 217) oraz dwa anty paralelne łańcuchy (3-fałdowe ( i ). Prawdopodobnie już wkrótce zostanie opublikowana struktura N M R P rp sc. Konwersji P rp c w P rp sc dokonano także w systemie bezkomórkowym in vitro, co dostarczyło pierwszego bezpośredniego dowodu, że taka konwersja istotnie dokonuje się w procesie nukleacji (seeding) wokół jądra [122]. W cytowanym eksperymencie, znakowany 35S- P rp c zostawał przekształcony w 35S-PrPsc pod wpływem nadmiaru P rp sc. Konwersja PrPc w PrPsc jest gatunkowo-specyficzna, to znaczy 35S-H aoprpc konwertował pod wpływem M op rp sc znacznie mniej wydajnie niż pod wpływem H ap rp sc i tworzące się w wyniku tej konwersji formy PrP oporne na proteinazę K (a więc analogiczne do PrP 27-30) były odmiennej Ryc. 8 M o d ele P r P c (b) i P rp sc (a), (a) P ro p o n o w a n y m odel P r P sc. S tru k tu ra p re z e n to w a n a n a rycinie z o stała w y b ra n a z sześciu ró żn y ch m odeli b iałk a ja k o k o relu jąca najlepiej z d an y m i genetycznym i. P r P sc zaw iera cztery d o m en y (3-fałdowe i dw ie a-helisy. (3-fałdowe d o m en y l a i lb (czerw one) o d p o w ia d a ją pierw szej a-helisie P rp c zaś d o m en y 2a i 2b (zielone), drugiej a-helisie P rp c. H elisy 3 i 4 p o zo stają niezm ienione w tym m odelu. C ztery reszty am in o k w aso w e (A snl08; M et 112, M e tl2 9 i A lal3 3 ) o d g ry w ające role w barierze g atu n k o w ej p rzed staw io n e ja k o białe m odele kulkow e, (b). P ro p o n o w a n y m odel P rp c. H elisa pierw sza p rz e d sta w io n a w czerw ieni d ru g a w zieleni. M odel ten zo stał jed y n ie częściow o p o tw ierd zony b a d a n ia m i N M R [117]. D zięki u p rzejm o ści Prof. S tan ley a B. Prusinera, U niw ersy tet K alifornijski, San F rancisco, USA. C zęściow o zm odyfik o w an e wg Huang Z, Prusiner SB, Cohen FE (1995) Folding Design 1: POSTĘPY BIOCHEMII 42(4), 1996

13 Ryc. 9 S tru k tu ra fra g m e n tu P rp ( ) m yszy. T rzy a-helisy o z n a c z o n o k o lo rem żółtym, zaś dw ie an ty -ró w n o leg łe d o m en y ß-faldow e, niebieskim. Ł ą c zące pętle o zn acz o n o k o lo re m zielonym. M o stek d w u siarczkow y pom iędzy resztam i cysteiny 179 i 214 o znacz o n o k o lo rem białym. D zięki u p rzejm o ści prof. Glockshuber a, In sty tu t fur M o le k u la rb io lo g ie und Biophysik, Z ürich, S zw ajcaria [117], wielkości [123], Konwersja P rp c w P rp sc była zależna od czasu oraz od stężenia tego ostatniego przy czym istniało progowe stężenie P rp sc, poniżej którego konwersja ustawała [124]. Co więcej, aktywność konwertująca wiązała się z agregatami PrP a nie z m onomerem tego białka. Interesujące, użycie ultrafiltracji wykazało, że aktywność konwertująca jest zatrzymywana przez filtr o wielkości porów < 100 kda; znów, zjawisko to można interpretować jako dowód, że aktywność taką wykazuje agregat a nie monomer PrP [124]. W tym miejscu należy zaznaczyć, że nie można wykluczyć, iż dodatkowy komponent (< 100 kda) ko-sedymentujący z P rp sc jest w istocie odpowiedzialny za proces konwersji. Przytoczone eksperymenty świadczące na korzyść hipotezy nukleacji metaforycznie przypominają lód-9 z książki Kocia kołyska Kurta Yonneguta, w której ten izomer lodu powoduje przekształcenie stykającej się z nim wody w kolejne molekuły lodu-9 i tak ad infinitum [125]. Metafory lodu-9 jako pierwszy używał D. Carleton G a j d u - sek, w swoich wykładach (patrz, 125, przypis). VI. Co pozostało? W chwili obecnej hipoteza prionu jest powszechnie zaakceptowana także z powodu bezskutecznych poszukiwań struktur wiruso-podobnych. Jednak od 1968 r. kiedy to David Ferreira i wsp. [126] wykryli tzw. struktury tubulopęcherzykowe w mózgach myszy zakażonych scrapie, struktury te udało się wykazać we wszystkich badanych modelach scrapie, CJD i GSS [127,129]. Ostatnio jeden z nas (Paweł P. Liberski) oraz M artin Jeffrey z M AFF, CVL, Lasswade Veterinary Laboratory w Edynburgu, Szkocja wyka POSTĘPY BIOCHEMII 42(4),

14 Rye. 10 S tru k tu ry tu b u lo p ęch erzy k o w e (strzałki) o średnicy o k o ło 25 nm p rzylegające d o w łókienek P rp am y lo id u (głów ki strzałek). N ie o p u b lik o w a n e b a d a n ia P P L i D r. M a rtin a Jeffreya, M A F F, C V L, L assw ad e V eterin ary L a b o ra to ry, E d y n b u rg, Szkocja. T ra n sm isy jn a m ik ro sk o p ia elek tro n o w a, k o n tra sto w a n ie o ctan em u ran y lu i cy try n ian em ołow iu; o ry g in aln e pow iększenie, x. zali obecność struktur tubulopęcherzykowych w ścisłym kontakcie z włókienkami PrP-amyloidu (Ryc. 10) w tzw. luźnych blaszkach amyloidowych w obszarze podwyściółkowym mózgów chomików zakażonych scrapie. Jeżeli obserwacje te zostaną niezależnie potwierdzone i jeżeli struktury te okażą się cząsteczką wirusa scrapie, to tak bezpośredni kontakt jest w stanie wyjaśnić ścisły związek PrP i infekcyjności. Podziękowania Materiał omówiony w powyższym artykule wykorzystano w wykładzie przedstawionym na sesji Otępienie, XVI Zjazd Polskiego Towarzystwa Neurologicznego, Katowice września, 1996 r. Praca ta jest częścią projektu EC Concerted action Prion disorders (Project leader: Prof. Herbert Budka). Badania naukowe prowadzone przez prof. P. P. Liberskiego były finansowane przez Fogarty International Center oraz Fundację Kościuszkowską w USA, przez British Council w U.K. oraz przez KBN, Fundację Marii Skłodowskiej-Curie, Fundację Nauki Polskiej i Akademię Medyczną w Łodzi, w Polsce. Artykuł otrzymano 23 września 1996 r. Zaakceptowano do druku 26 września 1996 r. Piśm iennictwo 1. Will RG, Ironside J W, Zeidler M, Cousens SN, Estibeiro K, Alperovitch A, Po ser S, Pocchiari M, Hofman A, Smith R G (1996) The L ancet 347: Lasmezas CI, Deslys JP, Demaimay R, Adjou KT, Lamoury F, Dorm ont D (1996) N a tu rę (L ond) 381: Gajdusek DC (1990) W: F ields V irology, Vol. 2, , S econd ed itio n, F ields B. N., K n ip e D. M., Eds, R aven Press, N ew Y ork 4. Gajdusek DC (1993) W: L ight an d E lectron M icroscopic N eu ro p a th o lo g y of Slow V irus D iso rd ers 1-31, Liberski P P, Red., C R C Press, Boca R ato n 5. Gajdusek DC (1988) M o u n t Sinai J M ed 55: McKinley MP, Bolton DC, PrusinerSB (1983) Cell 35: Prusiner SB (1991) Science 252: Prusiner SB (1991) B iochem M o lec Biol 26: Prusiner SB (1982) Science 216: Prusiner SB (1987) W: P rio n s. N ovel Infectious P a th o g en s C ausing Scrapie an d C rcu tzfeld t-jak ob D isease 38-53, P rusiner S. B., M ck inley M. P., A cadem ic Press, N ew Y ork 11. Basler K, Oesch B, Scott M, Westeway D, W alch I i M, Groth DF, McKinley MP, PrusinerSB, Weissmann C (1986) Cell 46: Chesebro B, Race R, Wehrly K, Nishio J, Bloom M, Lechner D, Bergstrom S, Robbins K, Mayer L, Keith JM,Garon C, Haase A (1985) N ature (L ond) 315: Oesch B, Westaway D, Walchlii M. McKinley MP, Kent SBH, Aebersold R, Barry R A, Temps t P, Teplow DB, Hood LE, Prusiner SB, Weiss m a n n C (1985) Cell 40: Sparkes RS, Simon M. Cohn VH, Fournier REK, Lem J, Klisak I, Heinzmann C, Blatt C, Lucero M, Mohandas T, DeArmond SJ, Westaway D. P ru siner SB, Weiner LP (1987) Proc N a tl A cad Sei U SA 83: Goldm ann W, Hunter N, Martin T, Dawson M, Hope J (1991) J Gen Virol 72: Goldm ann W, Hunter N, Foster JD, Salbaum JM, Beyreuther K, Hope J (1990) Proc N a tl A cad Sei U SA 87: Matin T, Hughes S, Hughes K, Dawson M (1995) Biochimica et Biophysica A cta 1270: Schatz 1 HM, Da Costa M, Taylor L, Cohen FE, Prusiner SB (1995) J M o l B iol 245: Cervenakova L, Brown P, Goldfarb LG, Nagle J, Pettrone K, Rubenstein R, Dubnick M, Gibbs 328 POSTĘPY BIOCHEMII 42(4), 1996

15 CJ J r., G a j d u s e k D C (1994) Proc N a tl A ca d Sei U SA 91: Windl O, Dempster M.Estibeiro P, Lathe R (1995) Gene 159: Gabriel J-M,Ocach B, Kretzschmar H,Scott M, P r u s i n e r SB (1992) Proc N a tl A cad Sei U SA 89: Harris DA, Falls DL, Johnson FA, Fischbach GD (1991) Proc N a tl A cad Sei U SA 88: Westaway D, Prusiner SB (1989) Trends N eurosci 12, Caughey B, Dong A, Bhat KS, Ernst D, Hayes SF, Caughey WS (1991) B iochem istry 30: Gasset M, Baldwin MA, Fletterick RJ, Prusiner SB (1993) Proc N a tl A cad Sei U SA 90: Gasset M, Baldwin M A, Iloyd DH, Gabriel J-M, Holt 7. man DM, Cohen F, Fletterick RJ, Prusiner S B (1992) Proc N a tl A cad Sei U SA 89: P a n K-M,Baldwin M,Nguyen J,Gasset M,Serban A, Groth D, Mehlhorn 1, Huang Z, Fletterick RJ, Cohen FE. Prusiner SB (1993) Proc N a tl Acad Sei U SA 90: Stahl N, Baldwin M A, Hecker R. Pan K-M, Burlingame A L, Prusiner SB (1992) B iochem istry 31: Stahl N, Borchelt DR, Hsiao K, Prusiner SB (1987) C ell 51: Stahl N, B o r c h e 11 D R, P r u s i n e r S B (1992) Biochem istry 29: Merz PA, Rohwer RG, Kascak R, Wiśniewski HM, Somerville RA, Gibbs CJ J r., Gajdusek DC (1984) Science 225: Merz PA, Somerville R A, Wiśniewski HM, Iqbal J (1981) A cta N europathol (Berl.) 60: Prusiner SB, McKinley MP, Bowman K A, Bolton DC, Bendheim P E, G r o t h DC, Glenner G G (1983) Cell 35: Meggendorfer F (1930) Z ges N eurol P sychiatr 128: Masters CL, Gajdusek DC, Gibbs CJ Jr (1981) Brain 104: Brown P, Gold farb LG, Gajdusek DC (1991) Lancet 337: Dickinson AG, M a c k a y J M K (1964) H eredity 19: Dickinson AG, Meiklc VMH, Fraser H (1968) J C om p Pathol 78: C a r 1 s o n G A, Kingsbury DT, Goodm an P A, C o - leman S, Marshall ST, DeArmond SJ, Westaway D, Prusiner SB (1986) C ell 46: Hsiao K, Baker HF, Crow TJ,Poulter M.Owen F, TerwilligerJD, Westaway D, Ott J, Prusiner SB (1989) N ature (L ond) 338: Baker HF, Poulter M, Crow T J, Frith CD, Lofthouse R, Ridley RM (1991) L ancet 337: Colinge J, Harding AE, Owen F, Poulter M, Lofthouse R, Boughey AM, Shah T, Crow TJ (1989) L ancet 1: D o h - U r a K, T a t c i s h i J. K i t a m o t o T, S a s a k i H, Sakaki Y (1990) A nn N eurol 27: Goldabger D, Goldfarb L, Brown P, Asher D, Brown T, Lin S, Teener JW, Feinstone S M, R u - benstein R, Kascak R. BollaardJW, Gajdusek D C (1989) E xp N eurol 106: G oldham m er Y, Gabi z on R, Meiner Z, Sadeh M (1993) N eurology 43: Hsiao K, Doh-Ura, Kitam otot, TateishiJ, P ru sin er SB (1989) Ann N eurol 26: K retzschmar HA, Kufer P.Riethmuller G,DeArmon D S, Prusiner SB, Schiffer D (1992) N eurology 42, Young K, Jones CK, Piccardo P, Lazzarini A, Golbe LI, Zimmerman TR, Dickson DW.McLachlan DC, George-Hyslop PS t, Lennox A, Perlman S, Vinters HV, Hodes ME, Dlouhy S, Ghetti B (1995) N eurology 45: Ghetti B, Piccardo P, Frangione B, Bugiani O, Giaccone G, Young K, Prelli F, Farlow MR, Dlouhy SR,Tagliavini F (1996) Brain P athol 6: Kretzschmar HA, Honold G, Seitelberger F, Feucht M,Wessely P, Mehraein P, Budka H (1991) L ancet 337: Giaccone G, Verga L, Bugiani O, Frangione B, Serban D, Prusiner SB. Farlow MF, Ghetti B, T a g 1i a v i n i F (1992) Proc N a tl A cad Sci U SA 89: Dlouhy SR, Hsiao K, Farlow MR, Foroud T, Conneally PM,Prusiner SB, Hodes ME, Ghetti B (1992) N ature genetics 1: Hsiao K, Dlouhy SR, Farlow MR, Cass C, Da Costa M, Conneally PM, Hodes ME, Ghetti B, Prusiner SB (1992) N ature G enetics 1: BertoniJM, Brown P, Goldfarb LG, Rubenstein R, Gajdusek DC (1992) J A M A 268: Brown P, Goldfarb LG, Cat hala F, Vbrovska A, Sulima M, Nieto A, Gibbs CJ Jr, Gajdusek DC (1991) J N eurol Sci 105: Brown P, Goldfarb LG, Gibbs CJ Jr., Gajdusek DC (1991) Europ J Epidemiol. 7: Brown P, Kaur P, Sulima M, Goldfarb LG, Gibbs CJ Jr, Gajdusek DC (1993) Lancet 341: Goldfarb L, Brown P, Goldgaber D, G arruto RM, Yanagihara R, Asher DM, Gajdusek DC (1990) L ancet 336: Goldfarb L, Brown P, Mitrova E, Cervenakova L, Goldin L, Korczyn AD. Chapman J, Galvez S, C a r t i e r L, R u b i n s t e i n R,Gajdusek DC (1991) E u rop J E pidem iol 7: Goldfarb LG, Korczyn AD, Brown P, Chapman J, Gajdusek DC (1990) Lancet 336: Hsiao K, Meiner Z, Kahana E. Cass C, Kahana I, Avraham D, Scarlato G. Abramsky O, Prusiner SB, Ga bizon R (1991) N ew Engl J M ed 324: Brown P, Galvez S, Goldfarb LG, Nieto A, C a r tier L, Gibbs CJ J r., G ajdusek DC (1992) J N e u ro l Sci 112: I n o u e I, K i t a m o t o T, D o h - U r a K, S h i i H, G o t o I, T a t e i s h i J (1994) N eurology 44: Brown P, Goldfarb LG, Kovanen J, Haltia M, CathalaF, Sulima M, Gibbs CJ Jr, Gajdusek DC (1991) Ann N eurol 31: F i n k J K, Warren J T, D r u r y 1, M urman D, P e a cock M L (1991) N eurology 41: Goldfarb LG, Haltia M, Brown P, Nieto A, K o v a n en J, McCombie WR. Trapp S, Gajdusek DC (1991) L ancet 337: Nieto A, Goldfarb LG, Brown P, McCombie WR, T r a p p S, Asher DM, Gajdusek DC (1991) L a n cet 337: Kretzschmar HA, Neumann M,Stavrou D (1995) A cta N europathol. 89: Goldfarb LG, Petersen RB, Tabaton M. Brown P, LeBlanc AC, M ontanga P, Cortelli P, Jullien J, Vital C, Pendelbury WW, Haltia M, Wills PR, H auwjj, McKeever PE, Monari L, Schrank B, Swergold GD, Autillo-Gambetti L, Gajdusek DC, Lugaresi E, Gambetti P (1992) Science 258: Medori R, M ontagna P, Tritschler H-J, Le Blanc A, Cordelli P, Tinuper P, Laugaresi E, Gambetti P (1992) N eurology 42: Medori R, Tritschler H-J, LeBlanc A, Villare F, Manetto V, Chen HY, Xue R, Leal S, M ontagna P, Cortelli P, Tinuper P, Avoni P, Mochi M. B a - ruzzi A, Hauw JJ, Ott J, Lugaresi L, Autilio- Gambetti L, Gambetti P (1992) N Engl J M ed. 326: Monari L, ChenS G. Brown P, Parchi P, Petersen R, Mikol J, Gray F, Cortelli P, M ontagna P, Ghetti B, Goldfarb LG, Gajdusek DC, Lugaresi E, Gambetti P, Autilio-Gambetti L (1994) P roc N a tl Acad Sci U SA 91: Reder AT, Mednick AS, Brown P, Spire J P, Van Cauter E, Wollmann RL, Cervenakova L, G o ld farb LG, Garay A, Ovsiew F, Gajdusek DC, Ross R P (1995) N eurology 45: POSTĘPY BIOCHEMII 42(4),

16 74. Kitamoto M, Amano N, Terao Y, Nakazato Y, I s s h i k 8 T, Mizutani T, Tadeishi J (1993) A nn N eurol 34: Pocchiari N. Salvatore M, Cutruzzola F, Genuardi M, Travaglini, Allocatelli C, Massullo C, Macchi G, Alema G, Galgani S, Xi YG,, Petraroli R, Silvestrini MC, Brunori M (1993) Ann N erurol 34: Ripoll L, LaplancheJ-L, Salzmann M, Jouvet A, Planques B, Dussaucy M, Chatelain J, Beaudry P, Launay J-M (1993) N eu ro lo g y 43: Hitoschi S, Nagura H, Yamanouchi H, K itam o to T (1993) J N eurol Sci 120: Collinge J, Owen F, Poulter M, Leach M, Crow TJ, Rossor MN, Hardy J, Mullan MJ, Janota I, L a n t o s PL (1990) Lancet 336: Goldfarb L, Brown P, Little BW, Cervenakova L, Kenney K, Gibbs CJ Jr, Gajdusek DC (1993) N eurology 43: Goldfarb L, Brown P, McCombie WR, Goldgaber D, Swergold GD, Wills PR, Cervenakova L, Baron H, Gibbs CJ Jr, Gajdusek DC (1991) Proc N a tl Acid Sci U SA 88: Goldfarb L, Brown P, Vrbovska A, Baron H, McCombie WR, Cathala F, Gibbs CJ Jr, G a j dusek DC (1992) J N eurol Sci 111: Owen F, Poulter M, Shah T, Collinge J, Lofthouse R, Baker H, Ridley R, McVey J, Crow TJ (1991) M olec Brain Res 7: Palmer MS, Dryden AJ, Hughes JT, Collinge J (1991) N ature (L ond) 35: O d a T, Kitamoto T, Mitsuhashi T, Iwabuchi K, Haga C, Oguni E, Kato Y, Tominaga I, Y a n a i K. Kashima K, Kogure T, Hori K, Ogino K (1995) A cta N europathol 90: Collinge J, Palmer MS, Dryden AJ (1991) L ancet 337: Deslys J-P, Marce D, Dormont D (1994) J Gen Virol 75: Miyazono M, Kitamoto T, Doh-Ura K, Iwaki T, T a t e i s h i J (1992) A cta N europathol 84: O w en F, Poulter M, Collinge J, Crow T (1989) N u c l A cid R es 18, Owen F, Poulter M, Collinge J, Crow T (1990) A m J H um Genet 46: Brown P, Rodgers-Johnson P, Cathala F, Gibbs CJ, Jr, Gajdusek DC (1984) A nn N eurol 16: Brown P, Liberski PP, Wolff A, Gajdusek DC (1990) Proc N a tl Acad Sci 87: Prusiner SB, Groth D, Serban A, K o eh ler R, F o s - t e r D, Torchia M, Burton D, Yang SL DeArmond S J (1993) Proc N a tl Acad Sci U SA 90: Prusiner SB, Scott M, Foster D, Pan K-M., Groth M, Mirenda C, Torchia M, Yang S-L, Serban D, Carlson G A, Hoppe PC, Westeway D, DeArmond SJ C ell 63: Hunter N (1993) R ev M e d Virol 3: Hunter N, Dann J C, Bennett AD, Somerville A, McConnell I, Hope J (1992) J Gen Virol 73: Hunter N, Foster JD, Dickinson AG, Hope J (1989) Vet R ec 124: Hunter N, Hope J, McConnell I, Dickinson AG (1987) J Gen Virol 68: IkedaT, Horiuchi M,Ishiguro N, M uram atsuy, Kai-Uwe GD, Shinagawa M (1995) J Gen Virol 76: Westaway D, G oodm an PA, Mirenda CA, McKinley MP, Carlson G A, Prusiner SB (1987) Cell 51: Weissmann C (1989) N a tu re (L ond) 338: Weissmann C (1991) N a tu re (L ond) 352: Scott M, Foster D, Mirenda C, Derban D, Coufal F, Walchli M, DeArmond SJ, Westaway D, Prusiner SB (1989) C ell 59: Hsiao K, Scott M, Foster D, Groth DF, D ea r mond SJ, Prusiner SB (1990) Science 250: Westaway D, DeArmond SJ, Cayetano-Canlas J, Groth D, Foster D, Yang S-L, Torchia M, Carlson G A, Prusiner SB (1994) Cell 76: Prusiner SB (1996) W: Fields V irology , Fields BN, K n ip e D M, H ow ley P M, et. al. L ip p in co tt-r av e n n a P ublishers, P hiladelphia 106. Hsiao KK, Groth D, Scott M, Yang S-L, Serban H, Rapp D, Foster D, Torchia M, DeArmond SJ, Prusiner SB (1994) Proc N a tl A ca d Sci U SA 91: Telling GC, Scott M, Hsiao KK, Foster D, Yang S-L, Torchia M, Sidle K C L, Collinge J, DeArmond SJ, Prusiner SB (1994) Proc N a tl A cad Sci U SA 91: Telling GC, Scott M, Mastrianni J, Gabizon R, Torchia M, Cohen ME, DeArmond SJ, Prusiner S B (1995) Cell 83: Bueler H, A g u z z i A, Sailer A, Greiner R A. A u - tenried P, Aguet M, Weissmann C (1993) Cell 73: Bueler H, Fischer M, Lang Y, Bluthmann H, Lipp H-P, DeArmond SJ, Prusiner SB. Aguet M, Weissmann C (1992) N a tu re (L o n d ) 356: Brenner HR, Herczeg A, Oech B (1992) Proc R Soc (L ond) 250: Collinge J, Whittington M A, Sidle K C L, Smith CJ, Palmer MS, Clarke A R, Jeffreys GR (1994) N ature (L ond) 370: Tobler I, Gaus SE, Deboer T, Achermann P, Fischer M, Rulicke T, Moser M, Oesch B, McBride PA, Manson JC (1996) N ature (L ond) 380: Sakaguchi S, Katamine S, Nishida N, Moriuchi R, Shigematsu K, Sugimoto T, Nakatani A, K ataoka Y, Houtani T, Shirabe S, Ok ad a H, Hasegawa S, Miyamoto T, Noda T (1996) N a tu re (L ond) 380: Beyreuther K, Masters CL (1994) N ature (L ond) 370: Gajdusek DC (1994) M olec N euro p a th o l 8: Riek R, Hornemann S, Wider G, Billeter M, Glockshuber R, Wuthrich K (1996) N a tu re (L ond) 382: Safar J, Roller P, Ruben G C, Gajdusek DC, Gibbs C J J r (1993) J Biol Chem 268: Safar J, Roller P, Ruben GC, Gajdusek DC, Gibbs CJ Jr (1993) B iopolym ers 33: Safar J, Roller P, Ruben GC, Gajdusek DC, Gibbs CJ Jr (1993) P rotein Science 2: Safar J, Roller P, Gajdusek DC, Gibbs CJ Jr (1994) Biochem istry 33: Kocisko DA, Ćome JH, Priola SA, Chesebro B, Raymond GJ, Lansbury PT, Caughey B (1994) N ature (L ond) 370: Kocisko DA, Priola S A, Raymond GJ, Chesebro B, Lansbury PT, Caughey B (1995) Proc N a tl A cad Sci U SA 92: Caughey B, Kocisko DA, Raymond GJ, Lansbury PT Jr (1995) Chem & B iol 2: Lansbury PrJr, Caughey B (1995) Chem & Biol 2: David-Ferreira JF, David-Ferreira KL, Gibbs CJ Jr, Morris JA (1968) Proc Soc E x p Biol M ed 127: Liberski PP, Yanagihara R, Gibbs CJ Jr, G a j dusek DC (1990) A cta N euro p a th o l 79: Liberski PP, Budka H, Sluga E, Barcikowska M, Kwieciński H (1992) A cta N euro p a th o l 84: Liberski PP, Budka H (1994) A c ta N europathol (1994) 88: Prenum erata P o stęp ó w Biochem ii w 1997 r. Prenum erata dla instytucji 60 zł Indywidualna 30 zł 50% zniżki dla członków PTBioch. 330 POSTĘPY BIOCHEMII 42(4), 1996

17 Rola białek kodowanych przez faga X w destrukcji bakteryjnej ściany komórkowej i kontroli czasu lizy Role of bacteriophage X coded proteins in destruction of bacterial cell wall and the control of lysis timing SABINA KĘDZIERSKA1, ALINA TAYLOR2 Spis treści: I. Wstęp II. N akładające się geny rejonu lizy faga X II-l. Białka S105 i S107, produkty jednego genu o antagonistycznych funkcjach fizjologicznych II-2. Białko R, enzym rozszczepiający wiązania P -l, 4-glikozydow e przez transglikozylację Lokalizowane w błonach bakteryjnych białka Rz i R zl; rola białka R zl w fuzji błon bakteryjnych III. Podsumowanie Contents: I. Introduction II. Overlapping genes of the lysis region II-l. Two S proteins, one gene products with antagonistic physiological function II-2. R protein, the enzyme splitting p -l, 4-glycosidic bonds by transglycosylation II-3. Rz and R zl; proteins localized in bacterial membranes; a role of the R zl in membranes fusion III. Summary W ykaz stosowanych skrótów: aa aminokwas(y); IM błona wewnętrzna (cytoplazmatyczna); nt nukleotyd(y); OM błona zewnętrzna; ORF otwarta rama odczytu; SD sekwencja Shine-Dalgarno, rbs; Tn transpozon. I. Wstęp Zakażenie wirusem X komórki Escherichia coli prowadzi do lizy lub lizogenizacji czyli integracji genomu wirusowego z DNA komórkowym. Zintegrowany profag replikuje się z chromosomem bakteryjnym i przekazywany jest kolejnym pokoleniom potomnym zakażonej komórki [1]. Jego geny znajdują się w stanie represji realizowanej, przez produkt genu cl W odpowiednich warunkach może nastąpić indukcja profaga polegająca na inaktywacji represora i derepresji genów fagowych. Wówczas następuje replikacja fagowego DNA i ekspresja genów fagowych. W końcowym efekcie dochodzi do wytworzenia i uwolnienia potom nych fagów przez lizę komórki bakteryjnej. Liza polega na zniszczeniu osłony komórkowej bakterii, złożonej z IM, OM i mureiny. W procesie tym biorą udział białka, kodowane przez genom fagowy; S, R i Rz oraz prawdopodobnie Rzl wykryte przez nas w 1993 r. [2] (Tab. 1). II. N akładające się geny rejonu lizy faga X, Geny lizy znajdują się w prawym ramieniu genomu faga X [3], Rycina 1przedstawia uaktualnioną, uproszczoną mapę fizyczną tego rejonu. Transkrypcja genów T a b ela 1. P ro d u k ty genów rejo n u lizy faga /. B iałko k D a Pi lo k alizacja w k o m órce E. coli p ro p o n o w a n a funkcja (8.9,11) 11.6 (8.5) 9 IM udział w translo k acji transglikozylazy k o n tro la czasu lizy ^(1 7,34) b iałko rozpuszczalne (transglikozylaza) d estrukcja m ureiny r z(2.39, strefy adhezji (A) (endopeptydaza?) d estrukcja m ureiny? Rzl( (p rek u rso r) (białko dojrzałe) ~ 8.3 O M fuzja IM i O M? T ab elkę o p raco w an o w o p arciu o prace: [2, 8, 9, 11, 17, 34, 39, 40] 1Dr, 2prof. dr hab., Katedra Biochemii, Pracownia Biochemii Bakteryjnej, Uniwersytet Gdański, ul. Kładki 24, Gdańsk zależy od konstytutywnego prom otora pr., ale wkrótce po starcie ulega terminacji w miejscu terminatorowym tr. Aktywacja tej tzw. transkrypcji późnej zależy od POSTĘPY BIOCHEMII 42(4),

18 Ryc. 1. Rejon lizy b akteriofaga X. Strzałki w skazują k ieru n ek tran sk ry p cji p ó źnego o p e ro n u faga X. L iczby o d p o w ia d a ją pozycjom nt w sekw encji LD N A [3]. W górnej linii p o d an o nazw y p ro d u k tó w genów lizy i liczbę ich reszt am inokw asów (w naw iasach). Sym bole: gen Q, kodujący białko an ty te rm in a to ro w e ; (- -). n a k ła d a ją c e się geny lizy S, R, R z, R z l o raz gen bor, k tó ry ulega tran sk ry p cji z drugiej nici D N A faga X w przeciw nym k ieru n k u w sto su n k u d o tra n sk ry p c ji genów R z R z l [37] i p rzy puszczalnie nie uczestniczy w lizie; (o), późny p ro m o to r; (x), późny term in a to r rozp o znaw an y przez p ro d u k t genu Q. (cyt. wg [40] za zgodą wyd.) antyterminatorowego białka Q [4]. Powstający transkrypt koduje białka lizy, białka odpowiedzialne za pakowanie fagowego DNA oraz białka strukturalne główki i ogonka. Transkrypcja późna zaczyna się ok. 8 min. po zakażeniu komórki E. coli fagiem lub po indukcji komórki lizogennej. Translacja ok. 25 genów kodowanych w późnym transkrypcie podlega skomplikowanej regulacji, w wyniku której poziom ekspresji poszczególnych genów może różnić się tysiąckrotnie [5-7]. Mechanizm tej potranskrypcyjnej regulacji nie jest znany i budzi zainteresowanie. Oczywiście, różne mechanizmy kontroli mogą dotyczyć różnych genów. Seria prac z laboratoriów R. Y o u n g a (USA) i U. B 1a s i e g o (Austria) dotyczy regulacji ekspresji genu S, pierwszego genu późnego transkryptu. R. Y o u n g omawia to zagadnienie w pracy przeglądowej [8], zwracając uwagę na możliwość występowania struktur drugorzędowych w sekwencji 598 nukleotydów między końcem 5' mrna i kodonem inicjatorowym S, które mogłyby kontrolować translację genu S (Ryc. 3) [9], Regulacja ekspresji genu S może mieć wpływ na ekspresję pozostałych genów lizy, R, Rz i Rzl. Na uwagę zasługuje stwierdzenie, że produkt genu R, enzym bakteriolityczny o swoistości transglikozylazy mureinowej, jest syntetyzowany w wykrywalnych ilościach już 8 min po indukcji profaga [10], mimo że liza występuje dopiero ok. 45 min później. Wskazuje to na istnienie potranslacyjnego mechanizmu kontrolującego czas wystąpienia lizy. Według Blasi ego i wsp. [9, 11] główną rolę odgrywają w tym dwa produkty jednego genu S, SI07, inhibitor lizy i SI05, efektor lizy, oligomeryzujący w IM i w ten sposób tworzący w niej kanał dla translokacji produktu genu R, co stanowi wczesny etap lizy. Szczegóły dotyczące tego zagadnienia będą omówione w podrozdziale o genie S i białkach S. Gen S zachodzi o 14 nukleotydów na gen R (Ryc. 1), można więc było oczekiwać, że translacja S ma wpływ na translację R. Z kolei sygnał terminacji translacji R, UGA, zachodzi na kodon inicjatorowy AUG(A) genu Rz, co sugeruje działanie mechanizmu reinicjacji translacji, polegającego na przesunięciu się małej podjednostki rybosomalnej po zakończeniu translacji genu bliższego końcowi 3' mrna do następnego kodonu inicjacyjnego, bez odłączenia się od odczytywanego mrna. Gen R zl znajduje się całkowicie wewnątrz genu Rz. Jest poprzedzony RBS, którego sekwencja pozwala sądzić, że jest to sygnał bardzo efektywny. Sekwencja ta -AAGGAG-jest bardzo zbliżona do sekwencji zgodności (consensus) i identyczna z występującą przed genem 10 faga T7 znanym z silnej ekspresji i dlatego używaną w plazmidzie ekspresyjnym pt7-7 [12]. Analogiczne geny, odpowiedniki S, R i Rz faga A, występują także u innych fagów lambdoidalnych (Ryc. 2). Rycina 2 przedstawia geny rejonów lizy czterech fagów lambdoidalnych: X, 21, PA-2 i P22 z uwzględnieniem podobieństwa między nimi, wyrażonego w procentach. Gen Rz spośród genów lizy wykazuje najwyższy stopień ewolucyjnego konserwatyzmu [8], Interesujący jest fakt, że O R F dla białka 6,5-kDa, które byłoby analogiem Rzl jest również obecna w genierz21 i to w tej samej pozycji jak w XRz. O R F (Rz21) jest w 98% homologiczna w sekwencji nukleotydowej z XRz (dane uzyskane z bazy danych EMBL; program FASTA). Ponadto sekwencja Rz21 jest poprzedzona identyczną sekwencją SD (-AAGGAG) w odległości 7 nukleotydów od kodonu AUG. II-l. Białka SI05 i SI07, produkty jednego genu o antagonistycznych funkcjach fizjologicznych Gen S składa się z 321 par nukleotydów, co odpowiada 107 kodonom w mrna. Obliczona na tej podstawie masa jego produktu białkowego wynosi 11.6-kDa, ale ciężar cząsteczkowy S wyznaczony na podstawie ruchliwości elektroforetycznej w żelu SDSpolikarylamidowym odpowiada Białko S niezbędne jest do wywołania lizy bakterii E. coli, [13]. Inaktywacja genu S sprawia, że po indukcji lizogenu 332 POSTĘPY BIOCHEMII 42(4), 1996

19 Ryc. 2. G eny rejonów lizy bakteriofagów lam bdoidalnych : X, 21, PA -2 i P22. G en y kasety litycznej" p rzed staw io n o w postaci p ro sto k ą tó w ; o b o k p o d a n o ilość reszt am in o k w aso w y ch ich p ro d u k tó w. S topień p o d o b ie ń stw a o d p o w iad ający c h sobie białek p o d a n o w % ; sekw encje am in o k w asó w w yznaczono na p o d sta w ie sekw encji nukleo ty d ó w o d p o w ied n ich genów. S trzałki um ieszczone na zew n ątrz w skazują p o d o b ie ń stw o m iędzy p aram i o d p o w iad ający c h sobie genów, S faga X i 13 faga P22 o ra z /.R z i 15 faga P22. N ie stw ierd zo n o żad n eg o p o d o b ień stw a m iędzy genam i R i 19 fagów X i P22. P ro d u k te m genu XR jest tran sg lik o zy laza, n a to m ia st genu 19 faga P22, lizozym. P ro d u k ty genów R fagów 21 i PA -2 nie zostały zidentyfikow ane. Sekw encja R z faga PA -2 nie została do k o ń ca p o zn an a. W genie R : faga 21 jest o b ecn a O R F 6 0 d la b iałk a 6.5-kD a, k tó re byłoby analogiem p ro d u k tu genu R :1 faga X. (cyt. za [8 ] zm odyfikow ane) procesy metaboliczne: oddychanie, syntezy m akrocząsteczek są kontynuowane w czasie, w którym w komórce zakażonej X,wt zostałyby zahamowane i wystąpiłaby liza [ 14, 15]. W cytoplazmie E. coli {ES ~) gromadzą się dojrzałe fagi oraz endolizyna w ilości znacznie większej niż przy zakażeniu A,wt [15, 16]. Nazwa endolizyna, oznacza aktywność bakteriolityczną, która może zależeć od dwóch enzymów: produktu genu ER, transglikozylazy, a możliwe, że także od produktu genu Rz, który mógłby mieć aktywność endopeptydazy. Ta ostatnia hipoteza nie została udowodniona [17]. Dodanie chloroformu do indukowanych hodowli lizogenów ES~ wywołuje prawie natychmiastową liżę bakterii, co sugeruje, że białko S musi wpływać na przepuszczalność IM [15, 18] i uczestniczyć w transporcie transglikozylazy do jej substratu, mureiny, który znajduje się w przestrzeni periplazmatycznej [ 13], Te właściwości mutantów ES decydują 0 ich praktycznym zastosowaniu do otrzymywania dużych ilości faga E lub wektorów skonstruowanych z DNA faga E. Problemy związane z detekcją małego, występującego w niewielkich ilościach, letalnego i względnie nieimmunogennego białka jakim jest białko S sprawiły, że w ciągu długich badań amerykańskich laboratoriów R. Younga i D. Wilsona, za produkt genu S uważano kolejno 6 różnych polipeptydów (!). W myśl pierwszej propozycji Wilsona [19] produktami genu S były dwa białka znacznie różniące się ciężarem cząsteczkowym, subkomórkową lokalizacją 1funkcją im przypisywaną. Jeden z polipeptydów o M r zlokalizowano w IM komórki zakażonej fagiem E i uważano, że jest on odpowiedzialny za podwyższoną przepuszczalność IM dla związków drobnocząsteczkowych [19, 20]. Według tych autorów drugi polipeptyd o ciężarze cząsteczkowym 5500 występował w dużej ilości kopii w oczyszczonych wirionach i przypisywano mu udział w naprawie uszkodzeń IM, wywołanych wprowadzeniem DNA faga E [20], A 11 - m a n i w s p. [21] z produktem genu S identyfikowali białko o masie 8.5-kDa, które występowało w osłonie komórki bakteryjnej. Istotny postęp wniosła praca Zagotty i Wilsona [22], którzy potwierdzili poprzedni wynik (8.5-kDa) metodami immunologicznymi dzięki otrzymaniu przeciwciał anty-s. Różnicę pomiędzy ciężarem cząsteczkowym S, zidentyfikowanym (8.5-kDa) a obliczonym na podstawie sekwencji nukleotydowej genu 5 (1 1.6-kDa) tłumaczono nietypowym wiązaniem SDS do silnie hydrofobowego białka S. Jednak nie jest wykluczona proteolityczna modyfikacja potranslacyjna białka S. Analiza genetyczna mutantów S ujawniła nieoczekiwaną złożoność ekspresji genu S [ 10, 23]. Według tych autorów ekspresja genu Sjest kontrolowana na poziomie translacji przez drugorzędową strukturę mrna, sekwencję sdi [9, 11]. Miejsce sdi (Ryc. 3A), obejmuje dwie struktury szpilek do włosów oraz dwie połączone sekwencje SD, które odpowiedzialne są za inicjację translacji od kodonu M etl lub Met3 [11]. Zatem z tej samej ramy odczytu genu S mogą powstać dwa polipeptydy: S 107 (start od M etl) i S 105 (start od Met3), które różnią się tylko obecnością reszt POSTĘPY BIOCHEMII 42(4),

20 A CCCGCUUUGUCUGCGAGGUGGGUUAUGAAAUCAAUGGACAAAAUC... Ryc. 3. A Region regu lato ro w y (sdi) genu S P rz e d sta w io n o dw ie stru k tu ry szpilek d o w łosów o ra z p o łączo n e sekw encje SD (G G G G G i U A A G ) o d p o w ied n io dla inicjacji tran slacji od k o d o n u M e tl i M et3. Pow yżej sekw encji m R N A p o d a n o sekw encję N -te rm in a ln ą b iałk a S107 (in h ib ito ra lizy), a poniżej S105 (efektora lizy). (sdil), (sdi2), (sdi3) m iejsca m utacji p u n k to w y ch, k tó re um ożliw iły określenie sekw encji sdi (structure directed initiation), regulującej częstotliw ość inicjacji tran slacji od A U G, (M e f,) lub A U G 3 (M e t3) [10]; B M otyw p o d w ójnego sta rtu tran slacji genów o funkcji analogicznej d o funkcji genu S faga X [cyt. za 8], P rz e d sta w io n o regiony inicjacji translacji i N -term in aln e sekw encje p ro d u k tó w genów S fagów lam b d o id aln y ch : X, 21 i PA -2 o ra z faga P22, d la k tó reg o g o sp o d a rzem jest Salm onella typhim urium. Strzałki, (o >), w sk azu ją ram y odczy tu p ro d u k tó w genów S; stru k tu ry sdi zo stały p o d k reślo n e, w naw iasach p o d a n o liczby reszt am in o - k w asow ych o d p o w ied n ich białek. W ystęp o w an ie m o ty w u p o d w ó jn eg o sta rtu tran slacji zo stało p o p a rte dośw iadczeniem tylko w p rz y p a d k u fagów X i P22. W p o zo stały ch p rz y p a d k a c h o b ecn o ść m o ty w u p o d w ó jn eg o sta rtu tran slacji w yw n io sk o w an o z sekw encji nukleotydow ej genów S. (cyt. wg [8 ] za zgodą wyd.) M et1-lys2 przy końcu N-terminalnym w S 107 [9-11]. Analogiczny model podwójnego startu translacji genów o funkcji analogicznej do S jest zachowany wśród fagów lambdoidalnych [8, 25, 26] (Ryc. 3B). Wykazano, że białka SI07 i SI05 w procesie lizy pełnią funkcje antagonistyczne [9]: S 107 jest inhibitorem polipeptydu SI05, którego aktywność jest letalna dla komórki. Istnieje korelacja między czasem lizy a ilościowym stosunkiem inhibitora (SI07) do letalnego efektora (S105) [9, 11, 24]. 334 POSTĘPY BIOCHEMII 42(4), 1996