Wydział Pedagogiki i Promocji Zdrowia kierunek Fizjoterapia, Wyższa Szkoła Informatyki i Umiejętności w Łodzi
|
|
- Andrzej Lipiński
- 8 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 PRACE ORYGINALNE I KLINICZNE Aluna Wpływ słonecznego promieniowania ultrafioletowego (UV) na organizm człowieka. Część II: Mutagenne działanie promieniowania UV i naprawa uszkodzeń DNA* The effect of solar ultraviolet radiation (UVR) on a human organism. Part II: UVR mutagenic activity and repair of DNA lesions Tomasz Ferenc 1, Marta Pacholczyk 1, Jan Czernicki 2 1 Zakład Biologii i Genetyki Medycznej, Katedra Nauk Podstawowych, Uniwersytet Medyczny w Łodzi 2 Wydział Pedagogiki i Promocji Zdrowia kierunek Fizjoterapia, Wyższa Szkoła Informatyki i Umiejętności w Łodzi STRESZCZENIE Docierające do powierzchni Ziemi promieniowanie ultrafioletowe (UV) o długości fali nm (UVB) i nm (UVA) wywołuje uszkodzenia struktur komórkowych, w tym kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA). Mechanizmy uszkadzającego działania UVB i UVA na cząsteczki DNA są odmienne. Promieniowanie UVB indukuje powstawanie dwóch rodzajów fotoproduktów: cyklobutylowych dimerów pirymidynowych (CPDs) i fotoproduktów pirymidyno(6-4) pirymidynowych (6,4-PP). Spośród CPDs najbardziej mutagenne są dimery tymina-cytozyna (T-C) i cytozyna-cytozyna (C-C). Fotoprodukty: CPDs i 6,4-PP mogą prowadzić do powstawania wysoce specyficznych mutacji tandemowej tranzycji CC TT oraz tranzycji C T. Promieniowanie UVA uszkadza DNA w sposób pośredni poprzez generowanie reaktywnych form tlenu (ROS). ROS indukują powstanie uszkodzeń oksydacyjnych w postaci modyfikacji zasad azotowych i pęknięć jednoniciowych DNA (DSBs), rzadziej wiązań krzyżowych DNA a DNA i DNA a białka chromatyny. Oksydacyjne uszkodzenia DNA prowadzą głównie do powstawania 7,8-dihydroksy-8-oksyguaniny (8-oxoG). Błędne parowanie 8-oxyG z adeniną (A) lub włączenie uszkodzonego nukleotydu zawierającego 8-oxyG do nowopowstającego łańcucha DNA prowadzi odpowiednio do transwersji (T G) lub transwersji (C A). Uszkodzenia DNA powstałe pod wpływem UVA są naprawiane w mechanizmie wycinania zasad azotowych (BER), a powstałe pod wpływem UVB w mechanizmie wycinania nukleotydów (NER). Brak lub niekompletna naprawa uszkodzeń DNA w komórkach skóry wywołanych przez UVB lub UVA może prowadzić do powstawania różnych typów mutacji, a w konsekwencji do rozwoju nowotworów skóry. Słowa kluczowe: promieniowanie UV, dimery pirymidynowe, uszkodzenia oksydacyjne DNA, naprawy DNA SUMMARY Ultraviolet radiation (UV) reaching the surface of the Earth of the wavelength nm (UVB) and nm (UVA) induces cellular structure damage including deoxyribonucleic acid (DNA). The damaging effects of UVB and UVA on DNA molecules are different. UVB radiation induces the development of two kinds of photoproducts: cyclobutane pyrimidine dimers (CPDs) and the pyrimidine (6-4) pirimidone photoproducts (6-4 PPs). Among CPDs, thymine-cytosine (T-C) and cytosine-cytosine (C-C) dimers are most mutagenic. Photoproducts: CPDs and 6.4-PP can lead to the formation of highly specific mutations tandem transition CC TT and transition C T. UVA radiation damages DNA in a direct way through the generation of reactive oxygen species (ROS). ROS induce oxidative damage in the form of nitric base modifications and DNA single strand breaks (DSBs), less frequently DNA-to-DNA and DNA-to-chromatin protein crosslinks. DNA oxidative damages lead mainly to the formation of 7.8-dihydroxy-8-oxoguanine (8-oxoG). Incorrect pairing of 8-oxoG with adenine (A) or inclusion of a damaged nucleotide containing 8-oxoG to a newly formed DNA chain leads respectively to T G transversion or C A transversion. UVA-induced DNA lesions are repaired in the mechanism of nitric base excision *Część I pracy opublikowana w Acta Balneologica, LVI, 1(135),
2 Wpływ słonecznego promieniowania ultrafioletowego (UV) na organizm człowieka. Część II: Mutagenne działanie promieniowania UV i naprawa uszkodzeń DNA repair (BER) and UVB-induced DNA lesions in nucleotide excision repair mechanism (NER). The lack or incomplete repair of UVB or UVA-induced DNA lesions can lead to the formation of different types of mutations and in consequence to the development of skin carcinomas. Key words: UV radiation, pirimidine dimers, DNA oxidative damage, DNA repair Acta Balneol., TOM LVI, Nr 2 (136)/2014, s WPROWADZENIE Kwas deoksyrybonukleinowy (DNA) należy do najważniejszych cząsteczek subkomórkowych, które absorbują fotony promieniowania ultrafioletowego (UV). DNA składa się z dwóch długich łańcuchów polinukleotydowych o strukturze prawoskrętnej helisy. Każdy z łańcuchów zbudowany jest z czterech rodzajów nukleotydów, a każdy nukleotyd składa się z trzech elementów: cukru 2 -deoksyrybozy, grupy fosforanowej, składającej się z jednej, dwóch lub trzech reszt fosforanowych oraz jednej z czterech zasad azotowych dwupierścieniowej puryny: adeniny (A) lub guaniny (G) i jednopierścieniowej pirymidyny: cytozyny (C) lub tyminy (T). W nukleotydzie zasada azotowa jest połączona z resztą cukrową wiązaniem -N-glikozydowym, a reszta fosforanowa związana jest z atomem węgla 5 reszty cukrowej. W łańcuchu polinukleotydowym DNA pojedyncze nukleotydy połączone są ze sobą kowalencyjnym wiązaniem 5-3 -fosfodiestrowym. Dwa łańcuchy polinukleotydowe w cząsteczce DNA biegną antyrównolegle (5 3 i 3 5 ) i są połączone ze sobą wiązaniami wodorowym, które stabilizują podwójną helisę. Wiązania wodorowe tworzą się między zasadami należącymi do przeciwległych łańcuchów. Łączenie się zasad w pary zachodzi według reguły komplementarności, tj. adenina tworzy parę z tyminą (para A-T), a guanina tworzy parę z cytozyną (para G-C) [1, 2]. Czynniki mutagenne (genotoksyczne) oddziałują z DNA i zmieniają strukturę pojedynczych nukleotydów. Zmiany te, jeżeli nie zostaną prawidłowo naprawione, prowadzą do wystąpienia mutacji. Gdy uszkodzenie DNA jest utrwalone może być przekazywane komórkom potomnym. Mutacje mogą zachodzić na różnych poziomach; wyróżnia się mutacje genomowe (zwielokrotnienie haploidalnego zestawu chromosomów), chromosomowe (aberracje liczbowe i strukturalne) i genowe. Mutacje genowe to trwała zmiana sekwencji nukleotydowej krótkiego obszaru genomu genu. W obrębie genu może dojść do delecji lub insercji jednego lub więcej nukleotydów. Szczególnym rodzajem mutacji genowych są mutacje punktowe typu tranzycji lub transwersji polegające na zamianie par zasad azotowych, np. C T, A G (tranzycja), A C, T G (transwersja) [1, 2]. MECHANIZMY USZKADZAJĄCEGO DZIAŁANIA PROMIENIOWANIA UV NA DNA Promieniowanie UV, zwłaszcza o krótkiej fali i wysokiej energii stanowi bezpośrednie zagrożenie dla stabilności cząsteczek biologicznych. Promieniowanie UV wywiera silne działanie genotoksyczne na DNA komórki, co może prowadzić do jego uszkodzenia i wystąpienia mutacji genowych. Powstające fotouszkodzenia w materiale genetycznym komórek skóry mogą przyczyniać się do rozwoju nowotworów tego narządu [3]. Badania ostatnich lat wskazują, że ryzyko rozwoju nowotworów skóry jest uzależnione głównie od przewlekłej ekspozycji na promieniowanie UV z zakresu UVB. Istnieją również wyniki badań, dotyczące roli promieniowania UVA w kancerogenezie [3, 4]. Uszkodzenia DNA powstają na skutek reakcji fotochemicznej wywołanej UV. Typ uszkodzenia DNA zależy od długości fali UV, co wiąże się z ilością energii pochłoniętej przez pary zasad w łańcuchu DNA [3, 5]. Podział na promieniowanie UVA i UVB jest arbitralny i oba typy promieniowania stanowią część widma fal elektromagnetycznych o stopniowo zmieniających się właściwościach fotofizycznych, fotochemicznych i fotobiologicznych [5]. Działanie promieniowania UV polega na wzbudzeniu elektronów walencyjnych, co wywołuje reakcję fotochemiczną. W wyniku absorpcji energii promieniowania UV, dochodzi do zmiany struktury cząsteczki. Pod wpływem UV mogą powstawać także reaktywne formy tlenu ROS (reactive oxygen species ROS), które w sposób pośredni wywołują uszkodzenia struktur komórkowych. DNA jest szczególnie narażony na uszkadzające działania UV, w zakresie długości fali <315 nm [4]. Wykazano, że UVA i UVB uszkadzają komórki na drodze dwóch różnych mechanizmów [6]. Zagadnienia te będą omawiane w dalszej części pracy. Działanie promieniowania UV, a zwłaszcza UVB, prowadzi do mutacji w obrębie protoonkogenów regulujących różnicowanie i wzrost komórek. UV wywołuje również mutacje genów supresorowych (antyonkogenów) hamujących transformację nowotworową, z których najistotniejszą rolę odgrywa gen supresorowy P53. Produkt tego genu białko p53 jest regulatorem cyklu komórkowego i funkcjonuje jako strażnik integralności genomu [1, 4]. W wyniku uszkodzenia DNA komórki pod wpływem czynnika genotoksycznego, jakim jest promieniowanie UV, dochodzi do zatrzymania cyklu komórkowego w fazie G1 przed wejściem w fazę S i uruchomienie enzymatycznych systemów naprawiających uszkodzenia DNA. W kontroli prawidłowości przebiegu cyklu komórkowego niezwykle istotną rolę odgrywa białko p53. W przypadku detekcji powstałego uszkodzenia DNA keratynocytów, po ekspozycji na promieniowanie UV, wzrasta poziom prawidłowego białka p53 83
3 Tomasz Ferenc, Marta Pacholczyk, Jan Czernicki w komórce. Dzięki temu cykl komórkowy zostaje zatrzymany w punkcie kontrolnym G1/S do czasu naprawy uszkodzeń w łańcuchu DNA. Jeżeli uszkodzenia DNA zostaną naprawione, cykl komórkowy jest kontynuowany. Jeżeli nie ma możliwości naprawy DNA, keratynocyty z uszkodzonym DNA kierowane są na szlak zaprogramowanej śmierci (apoptozy) [1, 7, 8]. Należy podkreślić, że mutacje indukowane UV mogą wystąpić także w genie P53, wówczas podziały komórkowe uszkodzonych keratynocytów ze zmutowanym genem P53 nie ulegają zatrzymaniu w fazie G1. W tej sytuacji komórka rozpoczyna fazę S, w której ma miejsce replikacja uszkodzonego DNA. Obecność mutacji genu P53 wykazano w stanach przednowotworowych skóry, a także w komórkach skóry nie ulegających apoptozie po ekspozycji na promieniowanie UV [1, 9, 10]. Białko p53 odgrywa również istotną rolę w procesie ściemnienia skóry pod wpływem UV. Po narażeniu na UV, prawidłowe białko p53 gromadzące się w komórce, w odpowiedzi na uszkodzenie DNA, nasila ekspresję genu proopiomelanokortyny (POMC) i genów kodujących cytokiny prozapalne. W wyniku cięcia proteolitycznego POMC powstaje m.in. hormon stymulujący melanocyty -MSH (melanocyte stimulating hormone MSH), który działając za pośrednictwem receptora melanokortyny 1 (MC1R) pobudza biosyntezę melaniny, różnicowanie melanocytów oraz transport melanosomów do keratynocytów. Stąd powstawanie opalenizny stanowi reakcję obronną organizmu przed szkodliwym wpływem UV, a ponadto stanowi dowód na wystąpienie uszkodzeń DNA w komórkach skóry [10, 11]. Najnowsze doniesienia podkreślają, że ściemnienie skóry pod wpływem UV wskazuje na uszkodzenie DNA komórek skóry [10]. PROMIENIOWANIE UVB Promieniowanie UVB o długości fali w zakresie (315) nm posiada o wiele większe właściwości genotoksyczne niż promieniowanie UVA [4, 6]. Genotoksyczne działanie promieniowania UVB polega głównie na bezpośrednim pochłanianiu energii tego promieniowania przez DNA. Natomiast promieniowanie o fali >320 nm (UVA) działa na DNA głównie za pośrednictwem ROS [1, 6]. Promieniowanie UVB indukuje dimeryzację sąsiadujących ze sobą zasad pirymidynowych, powodując powstanie cyklobutylowych dimerów pirymidynowych (CPDs cyclobutane pyrimidine dimers). Najczęściej dimeryzacji ulegają dwie tyminy, inne kombinacje pirymidyn również tworzą dimery, w kolejności częstości powstawania są to: 5 -CT-3 > 5 -TC-3 > 5 -CC-3. Podkreśla się, że 10-krotnie więcej CPDs powstaje przy długości fali 300 nm niż przy długości fali 280 nm [12]. Powstawanie dimerów puryn jest znacznie rzadsze. Powstają one między dwoma sąsiadującymi zasadami adeninowymi (A-A) lub między adeniną a tyminą (A-T). Znaczenie fotoproduktów purynowych jest niewielkie i zwykle jest pomijane w procesie mutagenezy [13]. CPDs tworzą się w wyniku powstania wiązania kowalencyjnego między atomami węgla C5 i C6 sąsiednich zasad pirymidynowych w łańcuchu DNA. Dimeryzacja wywołana przez UVB z reguły powoduje delecję nukleotydu podczas kopiowania zmodyfikowanej nici. Inny rodzaj fotoproduktu, którego powstawanie jest Rycina 1. Powstawanie cyklobutanowych dimerów pirymidynowych (CPDs) i fotoproduktów pirymidyno (6-4) pirymidynowych (6,4-PP). Przedrukowano za zgodą Elsevier: J. Autoimmun., Light, including ultrafiolet., 34, 2010; J247-J257; Maverakis E., Miyamura Y., Bowen M.P., Correa G., Ono Y., Goodarzi H., figure 5. indukowane przez UVB, stanowi uszkodzenie określane jako fotoprodukt pirymidyno (6-4) pirymidynowy (6,4-PP pyrimidine (6-4) pyrimidone photoproducts), w którym atomy węgla w pozycjach 4 i 6 sąsiadujących ze sobą pirymidyn tworzą wiązanie kowalencyjne (ryc. 1). Najczęstszym tego rodzaju fotoproduktem jest dimer tymina-cytozyna [1, 5, 6]. Do mutacji indukowanych promieniowaniem UVB najczęściej dochodzi w regionie łańcucha DNA, w którym często występuje 5-metylocytozyna, są to tzw. miejsca gorące (hot spots) [14]. Należy zaznaczyć, że maksimum absorpcji dla DNA przypada na fale o długości nm. Oznacza to, że w indukcji powstawania fotoproduktów w cząsteczce DNA najbardziej efektywnie (najsilniej) działa nie docierające do powierzchni Ziemi promieniowanie UVC [5]. Wykazano, że spośród CPDs najbardziej mutagenne są dimery tymina- -cytozyna (T-C) i cytozyna-cytozyna (C-C). Ponadto są one mniej skutecznie naprawiane w porównaniu do 6,4-PP. Stąd CPDs są uważane za główny czynnik sprawczy powodujący mutacje w komórkach ssaków i odgrywają znaczącą rolę w procesie fotokarcynogenezy [1]. CPDs i 6,4-PP mogą prowadzić do wysoce specyficznych mutacji, tj. tandemowej tranzycji zasad CC TT oraz tranzycji C T w miejscu występowania dwóch zasad pirymidynowych. Mutacje te są obrazowo określane jako odcisk palca pozostawiony przez promieniowanie UV (UVR fingerprint) [6]. Do niedawna uważano, że do rozwoju raków skóry prowadzi jedynie 84
4 Wpływ słonecznego promieniowania ultrafioletowego (UV) na organizm człowieka. Część II: Mutagenne działanie promieniowania UV i naprawa uszkodzeń DNA ta część widma promieniowania słonecznego, która odpowiada spektrum UVB, pod wpływem którego tworzą się cyklobutanowe dimery pirymidynowe (CPDs) [5, 10]. Ostatnie doniesienia wskazują, że również promieniowanie UVA w zakresie długości fali nm, które w niewielkim stopniu jest absorbowane przez cząsteczki DNA, może indukować powstawanie CPDs i 6,4-PP [5, 9]. Należy także zaznaczyć, że bezpośrednia indukcja fotoproduktów DNA jest zależna również od promieniowania UVC. Maksimum pochłaniania energii fotonów dla DNA w roztworze wynosi 260 nm, to sprawia, że promieniowanie UVC jest najbardziej efektywną długością fali pod względem indukowania fotoproduktów w DNA [12]. PROMIENIOWANIE UVA Właściwości mutagenne i kancerogenne UVA są mniej poznane niż UVB. Jednak biorąc pod uwagę fakt, że większą część widma UV docierającego do Ziemi stanowi promieniowanie UVA oraz że ten rodzaj promieniowania UV jest emitowany przez komercyjnie dostępne łóżka opalające (solaria), należy zwrócić szczególną uwagę na mechanizm mutagenezy i karcynogenezy indukowany przez UVA. Energia promieniowania UVA pochłonięta przez chromofory subkomórkowe inne niż DNA może być następnie przekazana na cząsteczkę DNA (typ I reakcji fotouczulającej) lub na tlen cząsteczkowy (typ II reakcji fotouczulającej), w wyniku czego powstają reaktywne formy tlenu (ROS) [5, 13]. Cząsteczki DNA absorbują niewielką ilość promieniowania UVA o długości fali w zakresie 320 (315)-400 nm. W związku z tym promieniowanie UVA uszkadza DNA głównie za pośrednictwem ROS, które powstają w wyniku pochłaniania UVA przez wewnątrzkomórkowe fotouczulacze lub egzogenne substancje uczulające w przypadku terapii fotodynamicznej [13, 15]. ROS indukują powstawanie uszkodzeń oksydacyjnych w postaci modyfikacji zasad azotowych, pęknięć jednoniciowych (SSBs - single strand breaks) lub rzadziej dwuniciowych (DSBs double strand breaks) w łańcuchu DNA (ryc. 2). W mniejszym stopniu uszkodzenia oksydacyjne obejmują powstawanie pirymidyno-dioli, jak również tworzenie się wiązań krzyżowych między DNA a DNA i DNA a białkami chromatyny. Powstawanie uszkodzeń oksydacyjnych może prowadzić do mutacji i aberracji chromosomowych i w konsekwencji do rozwoju nowotworów skóry [1, 4, 6, 15, 16]. Do reaktywnych form tlenu (ROS) należą anionorodnik ponadtlenkowy ( O 2 ), rodnik hydroksylowy ( OH) i tlenek azotu (NO ), które należą do wolnych rodników tlenowych oraz ROS nie będące wolnymi rodnikami (nie posiadające niesparowanego elektronu), tj. tlen singletowy ( 1 O 2 ), nadtlenek wodoru (H 2 O 2 ), nadtlenoazotyn (ONOO ) [5, 13, 17]. Wolne rodniki, jako atomy lub cząsteczki posiadające jeden lub więcej niesparowanych elektronów na zewnętrznej powłoce walencyjnej, są wysoce reaktywne i mogą reagować Rycina 2. Uszkodzenia DNA indukowane promieniowaniem UV. Przedrukowano za zgodą Springer Science+Business Media: Adv. Exp. Med. Biol., UV damage and DNA repair in malignant melanoma and nonmelanoma skin cancer., 624, 2008; ; Rass K., Reichrath J., figure 1. ssdna przerwania jednoniciowe DNA. 85
5 Tomasz Ferenc, Marta Pacholczyk, Jan Czernicki z innymi rodnikami lub związkami, które rodnikami nie są. Jednym z następstw powstawania ROS jest powstawanie wtórnych wolnych rodników. Przykładem jest powstawanie nadtlenków lipidów (LOO ) w procesie peroksydacji lipidów, będące przyczyną uszkodzenia błon lipidowych. Zwiększone wytwarzanie ROS wywołuje zjawisko określane mianem stresu oksydacyjnego, w wyniku którego dochodzi do oksydacyjnego uszkodzenia nie tylko DNA, ale także błon komórkowych i białek w komórce [5, 17]. Potencjał genotoksyczny UVA w głównej mierze wynika z oksydacyjnych uszkodzeń DNA. Tlen singletowy i inne rodzaje reaktywnych form tlenu uszkadzają przede wszystkim guaninę. Utlenienie guaniny prowadzi do powstania 7,8-dihydro-8-oksoguaniny (8-oxoG). Najbardziej efektywne w procesie generowania 8-oxoG jest promieniowanie UVA o długości fali powyżej 350 nm. W wyniku błędnego parowania 8-oxoG z adeniną zamiast z cytozyną dochodzi do powstania mutacji punktowej polegającej na zamianie tyminy na guaninę (T G) (transwersja). Z kolei włączenie uszkodzonego nukleotydu guaninowego 8-oxoG do nowo powstającego łańcucha DNA prowadzi do błędnego parowania zasad i zastąpienia cytozyny adeniną (C A) w następnej rundzie replikacyjnej. Do rzadziej spotkanych uszkodzeń oksydacyjnych powstających pod wpływem UV należy glikol tyminy, którego wystąpienie w łańcuchu polinukleotydowym może prowadzić do mutacji typu tranzycji T C [5]. Ostatnio wykazano, że jednym z endogennych antyoksydantów skóry, chroniącym komórki przed stresem oksydacyjnym powstającym pod wpływem UV jest melatonina. Antyoksydacyjne działanie melatoniny polega na bezpośrednim usuwaniu wolnych rodników, a także na aktywacji głównych enzymów eliminujących ROS [18]. NAPRAWY USZKODZEŃ POWSTAŁE PRZY UDZIALE PROMIENIOWANIA UVA I UVB Skuteczne usuwanie uszkodzeń DNA indukowanych promieniowaniem UV ma kolosalne znaczenie dla przetrwania wszystkich istot żywych [19]. Uszkodzenia DNA powstałe pod wpływem promieniowania UVA są naprawiane głównie w systemie napraw przez wycinanie zasad azotowych (BER Base Excision Repair) [20-24]. System naprawy BER, jak i omawiany poniżej system NER (Nucleotide Excision Repair) typowy dla napraw uszkodzeń DNA indukowanych promieniowaniem UVB są procesami bardzo złożonymi. Stąd w ramach tego artykułu ograniczono się do przedstawienia tylko podstawowych etapów napraw w tych systemach. Należy również zaznaczyć, że w komórkach ssaków system napraw BER i NER nie dotyczy tylko uszkodzeń wywołanych promieniowaniem UV [20, 23]. Naprawa uszkodzonych zasad wywołanych promieniowaniem UVA odbywa się najczęściej tzw. podstawowym szlakiem BER, a w niektórych przypadkach szlakiem alternatywnym [19, 22]. Szlak BER przebiega jako seria działania następowych kompleksów naprawy, które działają w miejscu uszkodzenia DNA [22]. W komórkach ssaków enzymami, które rozpoczynają naprawę DNA przez system BER, są glikozylazy DNA. Wyróżnia się dwa typy N-glikozylaz: glikozylazy monofunkcyjne (typ I) i glikozylazy dwufunkcyjne (typ II). Oba typy N-glikozydaz rozpoznają uszkodzone zasady i usuwają je z DNA przez hydrolizę wiązań N-glikozydowych między uszkodzoną zasadą a cząsteczką deoksyrybozy, co powoduje powstawanie tzw. miejsc apurynowych/ apirymidynowych (AP) [7, 20-23]. Na szlaku podstawowym BER (większość napraw zachodzi na tej drodze) dwufunkcyjna glikozylaza DNA (glikozylaza/ap liaza) po usunięciu uszkodzonej zasady powoduje hydrolizę wiązania fosfodiestrowego między nukleotydem po stronie 3 uszkodzenia a deoksyrybozą pozbawioną zasady azotowej. Następnie enzym endonukleaza AP (APE1) usuwa powstałe w reakcji -eliminacji reszty fosforanowe na końcu 3. Powstająca jednonukleotydowa luka w łańcuchu DNA z wolną resztą 3 OH zostaje wypełniana przy udziale polimerazy DNA. W końcowym etapie ligaza DNA III w kompleksie z białkiem XRCC1 łączy wolne końce nici DNA i proces naprawy zostaje zakończony [19, 20, 22-24]. NAPRAWY USZKODZEŃ POWSTAŁYCH PRZY UDZIALE PROMIENIOWANIA UVB Uszkodzenia DNA powstające pod wpływem promieniowania UVB, takie jak cyklobutanowe dimery pirymidynowe (CPD) czy fotoprodukty [6-4] pirymidyno-pirymidynowe (6-4PP) są naprawiane w uniwersalnym systemie napraw DNA przez wycinanie nukleotydów (NER) [22]. Ustalono, że w komórkach człowieka eliminacja fotoproduktów 6-4PP jest co najmniej 5-krotnie szybsza niż eliminacja CPD [25]. Wykazano, że dimery pirymidynowe zawierające cytozynę (C-C i C-T) są naprawiane o wiele szybciej niż te, które utworzone są przez dwie tymidyny (T-T) [6]. Uszkodzenia DNA powstające pod wpływem promieniowania UVB, takie jak cyklobutanowe dimery pirymidynowe (CPD) czy fotoprodukty [6-4] pirymidyno-pirymidynowe (6-4PP) są naprawiane w uniwersalnym systemie napraw DNA przez wycinanie nukleotydów (NER) [22]. System NER w komórkach ssaków jest procesem bardzo złożonym i bierze w nim udział ponad 25 różnych czynników naprawczych oraz szereg białek pomocniczych [19, 22]. System naprawy NER usuwa uszkodzenia DNA w sposób sekwencyjny, który obejmuje: rozpoznanie uszkodzenia; przyłączenie kompleksu białkowego i rozplecenie podwójnej helisy DNA w miejscu uszkodzenia; podwójne nacięcie uszkodzonej jednej nici w miejscu oddalonym o kilka nukleotydów zarówno po stronie 3, jak i 5 ; syntezę naprawczą przez polimerazę DNA; połączenie wolnych końców przy udziale ligazy DNA I [7, 20, 22, 23]. Wśród czynników biorących udział w naprawie szlakiem NER należy wymienić czynniki odgrywające zasadniczą rolę w rozpoznawaniu uszkodzenia DNA (kompleks XPC-HR23B, czynnik RPA, XPA, kompleks XPC-TFIIH) i procesie replikacji polimeraza DNA delta (Pol ) lub epsilon (Pol ) oraz białko PCNA. W procesie naprawy w systemie NER bierze udział również czynnik TFIIH zbudowany z 10 podjednostek, wśród których występują helikazy XPB i HPD. Czynnik TFIIH bierze również udział w tzw. naprawie DNA sprzężoną z transkrypcją (transcription coupled repair TCR), która dotyczy transkrybowanej nici DNA przy udziale polimerazy RNA II [7, 19, 86
6 Wpływ słonecznego promieniowania ultrafioletowego (UV) na organizm człowieka. Część II: Mutagenne działanie promieniowania UV i naprawa uszkodzeń DNA 22, 26]. W procesie wycinania uszkodzeń i rekombinacji biorą udział dwie endonukleazy: kompleks XPF-ERCC1 i czynnik XPG, które wycinają około 30-nukleotydowy fragment DNA zawierający fotoprodukt [7, 19]. System NER usuwa fragment DNA obejmujący powstałe dimery pirymidynowe i przywraca prawidłową sekwencję nici uszkodzonej (na zasadzie komplementarności par zasad: A-T, G-C) w oparciu o nić DNA nie uszkodzoną pełniącą funkcję matrycy [20, 22, 23]. W celu monitorowania narażenia populacji ludzkich na działanie genotoksycznych czynników środowiskowych, w tym promieniowania UVA i UVB opracowano testy cytogenetyczne oceniające stopień uszkodzenia DNA powstającego w wyniku ekspozycji na mutageny i kancerogeny środowiskowe. Jednym z najczęściej wykorzystywanych obecnie testów jest test komety (comet assay) oparty o elektroforezę pojedynczych komórek w żelu agarozowym. Zaletą testu komety jest jego wysoka czułość, łatwość wykonania oraz możliwość wykorzystania w teście wszystkich typów komórek człowieka. Obecnie test komety znajduje szerokie zastosowanie w badaniach oceniających sprawność mechanizmów naprawy uszkodzeń DNA wywołanych promieniowaniem UV u osób narażonych. Z tego względu może on służyć do określania osób o zwiększonym ryzyku rozwoju nowotworów skóry [27, 28]. Piśmiennictwo 1. Marrot L., Meunier J.R.: Skin DNA photodamage and its biological consequences. J. Am. Acad. Dermatol. 2008, 58 (5 suppl. 2), S139-S Brown T.A.: Genomy. Węgleński P. (red.) PWN, Warszawa Ikehata H., Ono T.: The mechanisms of UV mutagenesis. J. Radiat. Res. 2011, 52(2), De Gruijl F.R.: Photocarcinogenesis: UVA vs UVB. Skin Pharmacol. Appl. Skin Physiol. 2002, 15(5), Rünger T.M., Kappes U.P.: Mechanisms of mutation formation with long-wave ultraviolet light (UVA). Photodermatol. Photoimmunol. Photomed. 2008, 24(1), Brenner M., Hearing V.J.: The protective role of melanoma against UV damage in human skin. Photochem. Photobiol. 2008, 84(3), Ichihashi M., Ueda M., Budiyanto T. et al.: UV-induced skin damage. Toxicology 2003, 189(1-2), Bachelor M.A., Owens D.M.: Squamous cell carcinoma of the skin: current strategies for treatment and prevention. Curr. Canc. Ther. Rev. 2009, 5(1), Rass K., Reichrath J.: UV damage and DNA repair in malignant melanoma and nonmelanoma skin cancer. Adv. Exp. Med. Biol. 2008, 624, Woo D.K., Eide M.J.: Tanning beds, skin cancer, and vitamin D: an examination of the scientific evidence and public health implications. Dermatol. Ther. 2010, 23(1), Park H.Y., Kosmadaki M., Yaar M., Gilchrest B.A.: Cellular mechanisms regulating human melanogenesis. Cell. Mol. Life Sci. 2009, 66(9), Timares L., Katiyar S.K., Elmets C.A.: DNA damage, apoptosis and langerhans cells-activators of UV-induced immune tolerance. Photochem. Photobiol. 2008, 84(2), Pattison D.I., Davies M.J.: Actions of ultraviolet light on cellular structures. EXS 2006, 96, von Thaler A.K., Kamenisch Y., Berneburg M.: The role of ultraviolet radiation in melanomagenesis. Exp. Dermatol. 2010, 19(2), Narayanan D.L., Saladi R.N., Fox J.L.: Ultraviolet radiation and skin cancer. Int. J. Dermatol. 2010, 49(9), Clauson C., Schärer O.D., Niedernhofer L.: Advances in understanding the complex mechanisms of DNA interstrand cross-link repair. Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2013, 5(10), a Al-Gubory K.H.: Maternal nutrition, oxidative stress and prenatal development outcomes. W: Agarwal A., Aziz N., Rizk B.: Studies on Womens s Health, Oxidative Stress in Aplied Basic Research and Clinical Practice. Humana Press, New York Kleszczyński K., Hardkop L.H., Fischer T.W.: Differential effects of melatonin as a broad range UV-damage preventive dermato-endocrine regulator. Dermatoendocrinol. 2011, 3(3), Moriwaki S., Takahashi Y.: Photoaging and DNA repair. J. Dermatol. Sci. 2008, 50(3), Sancar A., Lindsey-Boltz L.A., Unsal-Kacmaz K., Linn S.: Molecular mechanisms of mammalian DNA repair and the damage checkpoints. Annu. Rev. Biochem. 2004, 73, Ridley A.J., Whiteside J.R., Mc Millan T.J., & Allison S.L.: Cellular and sub-cellular responses to UVA in relation to carcinogenesis. Int. J. Radiat. Biol. 2009, 85(3), Rastogi R.P., Richa, Kumar A., Tyagi M.B., Sinha R.P.: Molecular mechanisms of ultrafiolet radiation induced DNA damage and repair. J. Nucleic. Acids. 2010, 16, Drewa G., Ferenc T., Bratkowska W., Witczak M.: Zmienność i mutacje. W: Genetyka medyczna. Red. Drewa G., Ferenc T. Wyd. Elsevier Urban&Partner, Wrocław Krokan HE, Bjørås M.: Base excision repair. Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2013, 5(4), a Nakanishi M., Niida H., Murakami H., Shimada M.: DNA damage responses in skin biology Implications in tumor prevention and aging acceleration. J. Dermatol. Sci. 2009, 56(2), Schärer O.D.: Nucleotide excision repair in eukaryotes. Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2013, 5(10), a Speit G., Rothfuss A.: The comet assay: a sensitive genotoxicity test for the detection of DNA damage and repair. Methods Mol. Biol. 2012, 920, Anderson D., Dhawan A., Laubenthal J.: The comet assay in human biomonitoring. Methods Mol. Biol. 2013, 1044, Wkład autorów: Według kolejności Konflikt interesu: Autorzy nie zgłaszają konfliktu interesów Pracę nadesłano: r. Zaakceptowano: r. ADRES DO KORESPONDENCJI: Marta Pacholczyk Zakład Biologii i Genetyki Medycznej, Katedra Nauk Podstawowych Uniwersytet Medyczny w Łodzi pl. Hallera 1, Łódź tel./fax: (42) tel. kom marta.pacholczyk@umed.lodz.pl 87
Składniki diety a stabilność struktury DNA
Składniki diety a stabilność struktury DNA 1 DNA jedyna makrocząsteczka, której synteza jest ściśle kontrolowana, a powstałe błędy są naprawiane DNA jedyna makrocząsteczka naprawiana in vivo Replikacja
Antyoksydanty pokarmowe a korzyści zdrowotne. dr hab. Agata Wawrzyniak, prof. SGGW Katedra Żywienia Człowieka SGGW
Antyoksydanty pokarmowe a korzyści zdrowotne dr hab. Agata Wawrzyniak, prof. SGGW Katedra Żywienia Człowieka SGGW Warszawa, dn. 14.12.2016 wolne rodniki uszkodzone cząsteczki chemiczne w postaci wysoce
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Scenariusz lekcji przyrody/biologii (2 jednostki lekcyjne)
Joanna Wieczorek Scenariusz lekcji przyrody/biologii (2 jednostki lekcyjne) Strona 1 Temat: Budowa i funkcje kwasów nukleinowych Cel ogólny lekcji: Poznanie budowy i funkcji: DNA i RNA Cele szczegółowe:
Dominika Stelmach Gr. 10B2
Dominika Stelmach Gr. 10B2 Czym jest DNA? Wielkocząsteczkowy organiczny związek chemiczny z grupy kwasów nukleinowych Zawiera kwas deoksyrybonukleoinowy U organizmów eukariotycznych zlokalizowany w jądrze
POLIMERAZY DNA- PROCARYOTA
Enzymy DNA-zależne, katalizujące syntezę DNA wykazują aktywność polimerazy zawsze w kierunku 5 3 wykazują aktywność polimerazy zawsze wobec jednoniciowej cząsteczki DNA do utworzenia kompleksu z ssdna
MECHANIZMY NAPRAWY USZKODZEŃ DNA
MECHNIZMY NPRWY USZKODZEŃ DN Piotr Nowosad EFEKT KOŃCOWY Po zakończeniu seminarium powinieneś: zdefiniować pojęcia uszkodzenie DN i mutacja ; wymienić i opisać procesy naprawy uszkodzeń DN; określić rolę
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Ekspresja genów jest regulowana
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
Informacje dotyczące pracy kontrolnej
Informacje dotyczące pracy kontrolnej Słuchacze, którzy z przyczyn usprawiedliwionych nie przystąpili do pracy kontrolnej lub otrzymali z niej ocenę negatywną zobowiązani są do dnia 06 grudnia 2015 r.
Kwasy Nukleinowe. Rys. 1 Struktura typowego dinukleotydu
Kwasy Nukleinowe Kwasy nukleinowe są biopolimerami występującymi w komórkach wszystkich organizmów. Wyróżnia się dwa główne typy kwasów nukleinowych: Kwas deoksyrybonukleinowy (DNA) Kwasy rybonukleinowe
20. STRUKTURĘ DNA. Chemiczne czynniki modyfikujące DNA. Iwona śak, Paweł Niemiec
20. CZYIKI MDYFIKUJĄCE STRUKTURĘ DA Iwona śak, Paweł iemiec Czynniki chemiczne lub fizyczne o charakterze mutagennym są niejednorodną grupą. Wszystkie reagują bezpośrednio z DA, wprowadzając modyfikacje
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA. Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi Mutacja Mutacja (łac. mutatio zmiana) - zmiana materialnego
6. Z pięciowęglowego cukru prostego, zasady azotowej i reszty kwasu fosforowego, jest zbudowany A. nukleotyd. B. aminokwas. C. enzym. D. wielocukier.
ID Testu: F5679R8 Imię i nazwisko ucznia Klasa Data 1. Na indywidualne cechy danego osobnika ma (maja) wpływ A. wyłacznie czynniki środowiskowe. B. czynniki środowiskowe i materiał genetyczny. C. wyłacznie
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY d r i n ż. Magdalena Górnicka Zakład Oceny Żywienia Katedra Żywienia Człowieka WitaminyA, E i C oraz karotenoidy Selen Flawonoidy AKRYLOAMID Powstaje podczas przetwarzania
Wprowadzenie. DNA i białka. W uproszczeniu: program działania żywego organizmu zapisany jest w nici DNA i wykonuje się na maszynie białkowej.
Wprowadzenie DNA i białka W uproszczeniu: program działania żywego organizmu zapisany jest w nici DNA i wykonuje się na maszynie białkowej. Białka: łańcuchy złożone z aminokwasów (kilkadziesiąt kilkadziesiąt
Zmienność genomu. Przyczyny, skutki i sposoby kontroli
Zmienność genomu Przyczyny, skutki i sposoby kontroli Zmienność genomu Przez zmienność genomu (polimorfizm) rozumiemy różnice w sekwencji DNA genomowego pomiędzy osobnikami jednego gatunku. Wyróżniamy:
Wykład 13. Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA. Mechanizmy powstawania nowotworów
Wykład 13 Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA Mechanizmy powstawania nowotworów Uszkodzenie DNA Wykrycie uszkodzenia Naprawa DNA Zatrzymanie cyklu kom. Apoptoza Źródła uszkodzeń
Naprawa i rekombinacja. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
aprawa i rekombinacja DA Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. DA jest ciągle poddawane działaniu czynników uszkadzających pochodzących
REPLIKACJA, NAPRAWA i REKOMBINACJA DNA
REPLIKACJA, NAPRAWA i REKOMBINACJA DNA 1) Replikacja DNA 2) Replikacja całych chromosomów 3) Replikacja telomerów 4) Naprawa DNA przy jego syntezie 5) Naprawa DNA poza jego syntezą 6) Naprawa DNA system
Czy żywność GMO jest bezpieczna?
Instytut Żywności i Żywienia dr n. med. Lucjan Szponar Czy żywność GMO jest bezpieczna? Warszawa, 21 marca 2005 r. Od ponad połowy ubiegłego wieku, jedną z rozpoznanych tajemnic życia biologicznego wszystkich
Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...
1. Zadanie (0 2 p. ) Porównaj mitozę i mejozę, wpisując do tabeli podane określenia oraz cyfry. ta sama co w komórce macierzystej, o połowę mniejsza niż w komórce macierzystej, gamety, komórki budujące
POLIMERAZY DNA- PROCARYOTA
Enzymy DNA-zależne, katalizujące syntezę DNA wykazują aktywność polimerazy zawsze w kierunku 5 3 wykazują aktywność polimerazy zawsze wobec jednoniciowej cząsteczki DNA do utworzenia kompleksu z ssdna
CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
Numer pytania Numer pytania
KONKURS BIOLOGICZNY ZMAGANIA Z GENETYKĄ 2016/2017 ELIMINACJE SZKOLNE I SESJA GENETYKA MOLEKULARNA KOD UCZNIA. IMIĘ i NAZWISKO. DATA... GODZINA.. Test, który otrzymałeś zawiera 20 pytań zamkniętych. W każdym
Generator testów 1.3.1 Biochemia wer. 1.0.5 / 14883078 Strona: 1
Przedmiot: Biochemia Nazwa testu: Biochemia wer. 1.0.5 Nr testu 14883078 Klasa: zaoczni_2007 IBOS Odpowiedzi zaznaczamy TYLKO w tabeli! 1. Do aminokwasów aromatycznych zalicza się A) G, P oraz S B) L,
Zawartość. Wstęp 1. Historia wirusologii. 2. Klasyfikacja wirusów
Zawartość 139585 Wstęp 1. Historia wirusologii 2. Klasyfikacja wirusów 3. Struktura cząstek wirusowych 3.1. Metody określania struktury cząstek wirusowych 3.2. Budowa cząstek wirusowych o strukturze helikalnej
Do moich badań wybrałam przede wszystkim linię kostniakomięsaka 143B ze względu na jej wysoki potencjał przerzutowania. Do wykonania pracy
Streszczenie Choroby nowotworowe stanowią bardzo ważny problem zdrowotny na świecie. Dlatego, medycyna dąży do znalezienia nowych skutecznych leków, ale również rozwiązań do walki z nowotworami. Głównym
Kwasy nukleinowe. Replikacja
Kwasy nukleinowe Replikacja Białko Helikaza Prymaza SSB Funkcja w replikacji DNA Rozplata podwójną helisę Syntetyzuje starterowy odcinek RNA Stabilizuje regiony jednoniciowe Gyraza DNA Wprowadza ujemne
CORAZ BLIŻEJ ISTOTY ŻYCIA WERSJA A. imię i nazwisko :. klasa :.. ilość punktów :.
CORAZ BLIŻEJ ISTOTY ŻYCIA WERSJA A imię i nazwisko :. klasa :.. ilość punktów :. Zadanie 1 Przeanalizuj schemat i wykonaj polecenia. a. Wymień cztery struktury występujące zarówno w komórce roślinnej,
SOLARIA MODA SZKODZĄCA ZDROWIU I ŻYCIU. Wstęp
SOLARIA MODA SZKODZĄCA ZDROWIU I ŻYCIU. Wstęp Solaria to urządzenia elektryczne, których zasadniczym elementem są lampy wytwarzające promieniowanie ultrafioletowe (UVR) w zakresie fal UVA (320-400 nm)
JĄDRO KOMÓRKOWE I ORGANIZACJA CHROMATYNY
Wykład: 2 JĄDRO KOMÓRKOWE I ORGANIZACJA CHROMATYNY Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Jądro komórkowe 1 Jądro komórkowe Otoczka jądrowa zewnętrzna membrana jądrowa wewnętrzna
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
Wykład: 2 JĄDRO KOMÓRKOWE I ORGANIZACJA CHROMATYNY. Jądro komórkowe. Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej.
Wykład: 2 JĄDRO KOMÓRKOWE I ORGANIZACJA CHROMATYNY Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Jądro komórkowe Jądro komórkowe Otoczka jądrowa zewnętrzna membrana jądrowa wewnętrzna
Wykład 12 Kwasy nukleinowe: budowa, synteza i ich rola w syntezie białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 12 Kwasy nukleinowe: budowa, synteza i ich rola w syntezie białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI
Mikrosatelitarne sekwencje DNA
Mikrosatelitarne sekwencje DNA Małgorzata Pałucka Wykorzystanie sekwencji mikrosatelitarnych w jądrowym DNA drzew leśnych do udowodnienia pochodzenia materiału dowodowego w postępowaniu sądowym 27.09.2012
Zarówno u organizmów eukariotycznych, jak i prokariotycznych proces replikacji ma charakter semikonserwatywny.
HIPTEZY WYJAŚIAJĄCE MECHAIZM REPLIKACJI C. Model replikacji semikonserwatywnej zakłada on, że obie nici macierzystej cząsteczki DA są matrycą dla nowych, dosyntetyzowywanych nici REPLIKACJA każda z dwóch
Zadania maturalne z biologii - 2
Koło Biologiczne Liceum Ogólnokształcące nr II w Gliwicach 2015-2016 Zadania maturalne z biologii - 2 Zadania: Zad. 1(M. Borowiecki, J. Błaszczak 3BL) Na podstawie podanych schematów określ sposób w jaki
ZASTOSOWANIE TEORII WĘZŁÓW. Natalia Grzechnik 10B2
ZASTOSOWANIE TEORII WĘZŁÓW Natalia Grzechnik 10B2 1. Rola DNA 2. Omówienie budowy DNA Zasady azotowe w DNA Sposób ich łączenia Rodzaje wiązań w cząsteczce DNA 3. Krótka definicja teorii węzłów 4. Przykłady
Replikacja DNA. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Replikacja DNA Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Replikacja DNA jest bardzo złożonym procesem, w którym biorą udział setki
GENETYKA. Budowa i rola kwasów nukleinowych Geny i genomy Replikacja DNA NM G
GENETYKA Budowa i rola kwasów nukleinowych Geny i genomy Replikacja DNA 1 Podręcznik Biologia na czasie 3 Maturalne karty pracy 3 Vademecum 2 Zadanie domowe Na podstawie różnych źródeł opisz historię badań
Metody odczytu kolejności nukleotydów - sekwencjonowania DNA
Metody odczytu kolejności nukleotydów - sekwencjonowania DNA 1. Metoda chemicznej degradacji DNA (metoda Maxama i Gilberta 1977) 2. Metoda terminacji syntezy łańcucha DNA - klasyczna metoda Sangera (Sanger
Inżynieria Genetyczna ćw. 3
Materiały do ćwiczeń z przedmiotu Genetyka z inżynierią genetyczną D - blok Inżynieria Genetyczna ćw. 3 Instytut Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski, rok akad. 2018/2019
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach
WYKŁAD: Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Białka Retrowirusy Białka Klasyczny
A. Ogólny opis przedmiotu
Załącznik do zarządzenia nr 166 Rektora UMK z dnia 21 grudnia 2015 r. Formularz opisu przedmiotu (formularz sylabusa) na studiach wyższych, doktoranckich, podyplomowych i kursach dokształcających A. Ogólny
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Mutacje jako źródło różnorodności wewnątrzgatunkowej
Mutacje jako źródło różnorodności wewnątrzgatunkowej Zajęcia terenowe: Zajęcia w klasie: Poziom nauczania oraz odniesienie do podstawy programowej: Liceum IV etap edukacyjny zakres rozszerzony: Różnorodność
Blok licencjacki genetyczny
Blok licencjacki genetyczny Za twórcę genetyki uważa się czeskiego zakonnika Grzegorza Mendla, który w 1866 r. odkrył podstawowe prawa przekazywania cech dziedzicznych i postawił hipotezę istnienia jednostek
Prokariota i Eukariota
Prokariota i Eukariota W komórkach organizmów żywych ilość DNA jest zazwyczaj stała i charakterystyczna dla danego gatunku. ILOŚĆ DNA PRZYPADAJĄCA NA APARAT GENETYCZNY WZRASTA WRAZ Z BARDZIEJ FILOGENETYCZNIE
3. Podstawy genetyki S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Nazwa modułu. Kod F3/A. Podstawy genetyki. modułu
S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) 3. Podstawy genetyki I nformacje ogólne Kod F3/A modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Nazwa modułu Podstawy
Interfaza to niemal 90% cyklu komórkowego. Dzieli się na 3 fazy: G1, S i G2.
W wyniku podziału komórki powstaje komórka potomna, która ma o połowę mniej DNA od komórki macierzystej i jest o połowę mniejsza. Aby komórka potomna była zdolna do kolejnego podziału musi osiągnąć rozmiary
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Połączenia komórek
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
ROLA SYGNALIZACJI MIĘDZYKOMÓRKOWEJ W ODPOWIEDZI NA PROMIENIOWANIE ULTRAFIOLETOWE
Politechnika Śląska Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki Aleksandra Krzywoń Autoreferat rozprawy doktorskiej: ROLA SYGNALIZACJI MIĘDZYKOMÓRKOWEJ W ODPOWIEDZI NA PROMIENIOWANIE ULTRAFIOLETOWE Promotor
DNA - niezwykła cząsteczka. Tuesday, 21 May 2013
DNA - niezwykła cząsteczka Składniki DNA Składniki DNA Nazewnictwo nukleotydów w DNA i RNA Zasada zawsze jest przyłączana wiązaniem N-glikozydowym Ortofosforan może być przyłączony w pozycji 3 lub 5 Struktura
Mutageneza i naprawa DNA Rekombinacja
1 Mutageneza i naprawa DNA Rekombinacja Zmiany genomu } Wielkoskalowe } Zmiany liczby i formy chromosomów, duplikacje całych genomów } Rearanżacje chromosomowe } Dotyczą dużej liczby genów, fenotyp plejotropowy
ODDZIAŁYWANIE KSENOBIOTYKÓW Z DNA
Wydział Chemiczny olitechniki Gdańskiej Katedra Technologii Leków i Biochemii Biochemia DDZIAŁYWAIE KSEBITYKÓW Z DA Struktura DA DA, kwas deoksyrybonukleinowy, może być docelowym miejscem działania ksenobiotyku
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
Biologia molekularna genu. Replikacja i stabilność genomu c. d.
Biologia molekularna genu Replikacja i stabilność genomu c. d. Replikacja Model semikonserwatywny: w każdej cząsteczce potomnej jedna nić rodzicielska i jedna nowa doświadczenie Meselsona i Stahla (Brown,
MUTACJE GENOWE- SUBSTYTUCJE. MUTACJE spontaniczne indukowane. germinalne somatyczne. genomowe chromosomowe genowe.
WSZYSTKIE OSOBNIKI TEGO SAMEGO GATUNKU POSIADAJĄ TE SAME GENY! NIE WSZYSTKIE OSOBNIKI DANEGO GATUNKU POSIADAJĄ TAKIE SAME GENY MIEJSCA KODUJĄCE W GENACH SĄ CHRONIONE PRZED UTRWALENIEM ZMIAN- MIEJSCA KONSERWATYWNE
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA (skrajne daty)
Załącznik nr 4 do Uchwały Senatu nr 430/01/2015 SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2022 (skrajne daty) 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna
Aktywuj geny młodości. Badanie genetyczno-biochemiczne dotyczące własnych możliwości organizmu do spowolnienia procesów starzenia.
Aktywuj geny młodości. Badanie genetyczno-biochemiczne dotyczące własnych możliwości organizmu do spowolnienia procesów starzenia. mgr Konrad Tomaszewski Dział Nauki, Badań i Rozwoju Marinex International
Mutageneza i naprawa DNA Rekombinacja
1 Mutageneza i naprawa DNA Rekombinacja Zmiany genomu Wielkoskalowe Zmiany liczby i formy chromosomów, duplikacje całych genomów Rearanżacje chromosomowe Dotyczą dużej liczby genów, fenotyp plejotropowy
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa,
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa, 14.01. 2018 Instytut Biochemii i Biofizyki PAN Ul. Pawińskiego 5a 02-106 Warszawa Recenzja pracy doktorskiej Pana mgr Michała Płachty Pod Tytułem Regulacja funkcjonowania
Bioinformatyka wykład 9
Bioinformatyka wykład 9 14.XII.21 białkowa bioinformatyka strukturalna krzysztof_pawlowski@sggw.pl 211-1-17 1 Plan wykładu struktury białek dlaczego? struktury białek geometria i fizyka modyfikacje kowalencyjne
TRANSLACJA II etap ekspresji genów
TRANSLACJA II etap ekspresji genów Tłumaczenie informacji genetycznej zawartej w mrna (po transkrypcji z DNA) na aminokwasy budujące konkretne białko. trna Operon (wg. Jacob i Monod) Zgrupowane w jednym
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
DHPLC. Denaturing high performance liquid chromatography. Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko
DHPLC Denaturing high performance liquid chromatography Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko Mini-słowniczek SNP (Single Nucleotide Polymorphism) - zmienność sekwencji DNA; HET - analiza heterodupleksów; HPLC
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
Sylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Program kształcenia Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Analityka Medyczna, studia jednolite magisterskie, studia stacjonarne
Wykład 9: HUMAN GENOME PROJECT HUMAN GENOME PROJECT
Wykład 9: Polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) odrębność genetyczna, która czyni każdego z nas jednostką unikatową Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej HUMAN GENOME
DNA musi współdziałać z białkami!
DNA musi współdziałać z białkami! Specyficzność oddziaływań między DNA a białkami wiążącymi DNA zależy od: zmian konformacyjnych wzdłuż cząsteczki DNA zróżnicowania struktury DNA wynikającego z sekwencji
Scenariusz lekcji biologii dla klasy 8 SP, 1 liceum poziom podstawowy. Temat: DNA nośnik informacji dziedzicznej. Przepływ informacji genetycznej.
Scenariusz lekcji biologii dla klasy 8 SP, 1 liceum poziom podstawowy Temat: DN nośnik informacji dziedzicznej. Przepływ informacji genetycznej. utor: Renata Ziomek ele lekcji: Uczeń po zajęciach potrafi
Stabilność genomu. Mutageneza i naprawa DNA. Rekombinacja.
Stabilność genomu Mutageneza i naprawa DNA. Rekombinacja. Literatura Brown, rozdział 16 Allison, rozdział 7 Dokładność replikacji Systemy replikacyjne współczesnych organizmów są bardzo dokładne Żadna
Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl
Ogół przemian biochemicznych, które zachodzą w komórce składają się na jej metabolizm. Wyróżnia się dwa antagonistyczne procesy metabolizmu: anabolizm i katabolizm. Szlak metaboliczny w komórce, to szereg
Modelowanie matematyczne w zastosowaniach biomedycznych
Modelowanie matematyczne w zastosowaniach biomedycznych Wykład 6: Model liniowo-kwadratowy w radioterapii nowotworów Dr Jan Poleszczuk 5/04/2017 IBIB PAN Znamiona raka ( Hallmarks of Cancer ) Hanahan &
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Chromosomy - przypomnienie
Sylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Program kształcenia Farmacja, jednolite studia magisterskie, forma studiów: stacjonarne
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
GIMNAZJUM SPRAWDZIANY SUKCES W NAUCE
GIMNAZJUM SPRAWDZIANY BIOLOGIA klasa III SUKCES W NAUCE II GENETYKA CZŁOWIEKA Zadanie 1. Cechy organizmu są warunkowane przez allele dominujące i recesywne. Uzupełnij tabelę, wykorzystując poniższe określenia,
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2022 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna Kod przedmiotu/ modułu* Wydział (nazwa jednostki prowadzącej kierunek)
Biologia molekularna genu. Replikacja i stabilność genomu
Biologia molekularna genu Replikacja i stabilność genomu Lektura Allison, rozdziały 2 i 6 Brown, rozdział 15 Replikacja Model semikonserwatywny: w każdej cząsteczce potomnej jedna nić rodzicielska i jedna
Nośnikiem informacji genetycznej są bardzo długie cząsteczki DNA, w których jest ona zakodowana w liniowej sekwencji nukleotydów A, T, G i C
MATERIAŁ GENETYCZNY KOMÓRKI BIOSYNTEZA BIAŁEK MATERIAŁ GENETYCZNY KOMÓRKI Informacja genetyczna - instrukcje kierujące wszystkimi funkcjami komórki lub organizmu zapisane jako określone, swoiste sekwencje
Mutacje. Michał Pszczółkowski
Mutacje Michał Pszczółkowski IIIc Mutacja to nagła,trwała zmiana w materiale genetycznym komórki, który może być dziedziczny. Jest ona zjawiskiem losowym-może pojawić się w dowolnym miejscu nici DNA. Termin
Zastosowanie teorii węzłów w biologii molekularnej. Piotr Krzywda Gr. 10B2
Zastosowanie teorii węzłów w biologii molekularnej Piotr Krzywda Gr. 10B2 Na początku trochę biologii. Biologia molekularna Biologia molekularna jest to dziedzina nauki z pogranicza kilku nauk biologicznych,
Rozwój metod dozymetrii biologicznej oraz biofizycznych markerów i indykatorów wpływu promieniowania na organizmy żywe
Rozwój metod dozymetrii biologicznej oraz biofizycznych markerów i indykatorów wpływu promieniowania na organizmy żywe Marcin Kruszewski Centrum Radiobiologii i Dozymetrii Biologicznej Instytut Chemii
Biologia Molekularna Podstawy
Biologia Molekularna Podstawy Budowa DNA Budowa DNA Zasady: Purynowe: adenina i guanina Pirymidynowe: cytozyna i tymina 2 -deoksyryboza Grupy fosforanowe Budowa RNA Budowa RNA Zasady: purynowe: adenina
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Hybrydyzacja kwasów nukleinowych
Hybrydyzacja kwasów nukleinowych Jaka jest lokalizacja genu na chromosomie? Jakie jest jego sąsiedztwo? Hybrydyzacja - powstawanie stabilnych struktur dwuniciowych z cząsteczek jednoniciowych o komplementarnych
Geny i działania na nich
Metody bioinformatyki Geny i działania na nich prof. dr hab. Jan Mulawka Trzy królestwa w biologii Prokaryota organizmy, których komórki nie zawierają jądra, np. bakterie Eukaryota - organizmy, których
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy
Temat: Białka Aminy Pochodne węglowodorów zawierające grupę NH 2 Wzór ogólny amin: R NH 2 Przykład: CH 3 -CH 2 -NH 2 etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy
Zadanie 1. (0 4) a ) (0-1) 1 p. za prawidłowe uzupełnienie 3 zasad azotowych Rozwiązanie:
Model odpowiedzi i schemat punktowania do zadań stopnia rejonowego Wojewódzkiego Konkursu Przedmiotowego z Biologii dla uczniów szkół podstawowych województwa śląskiego w roku szkolnym 2018/2019 Za rozwiązanie
Biotechnologia i inżynieria genetyczna
Wersja A Test podsumowujący rozdział II i inżynieria genetyczna..................................... Imię i nazwisko.............................. Data Klasa oniższy test składa się z 16 zadań. rzy każdym