Zastosowanie analizy kladystycznej do rekonstrukcji filogenezy hominidów
|
|
- Damian Malinowski
- 6 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Przegląd Antropologiczny tom 56, z s , Poznań 1993 Zastosowanie analizy kladystycznej do rekonstrukcji filogenezy hominidów Katarzyna A. Kaszycka Abstract RECONSTRUCTION OF HOMINID PHYLOGENY ON THE BASIS OF CLADISTIC ANALYSIS. Phylogenetic relationships among eight hominid taxa (the Australopithecines and Homo) are examined using cladistic techniques. Data on morphological and morphometric characters of fossil hominid crania, mandibles and dentition were collected from the literature. Cladograms were constructed using the PAUP phylogeny program to find the best fitting (maximum parsimony) hypotheses. Two equally the most parsimonious cladograms were found. The genus Homo is confirmed to be monophyletic, while Australopithecus is not. Results of this analysis support a close phylogenetic relationship of A.africanus to both Homo and the "robust Australopithecine clades. Even though the relationships of A.aethiopicus (W T17000) are ambiguous, the most parsimonious cladograms do not place this species as a sister taxon of both A.boisei and A.robustus. Katarzyna A. Kaszycka, 1993; Polish Anthropological Review, vol. 56, 1-2, Adam Mickiewicz University Press, Poznafi 1993, pp , figs. 12. ISBN , ISSN Część I. Analiza kladystyczna W ostatnich latach, wśród badaczy zajmujących się biologią porównawczą, a w szczególności systematyką, coraz większą popularność zyskuje kladystyka. Kladystyczna metoda analizy systematycznej (zwana także systematyką filogenetyczną) po raz pierwszy została zaproponowana przez niemieckiego ento- mologa W. HENNIGA [1965,1966]. Zgodnie z pomysłem Henniga, miała to być empiryczna metoda wykrywania i weryfikacji filogenetycznych powiązań między grupami organizmów. Każdy gatunek - twierdzi ten autor - jest mozaiką cech Instytut Antropologii Uniwersytet im. Adama Mickiewicza Fredry 10, Poznań prymitywnych i wyspecjalizowanych, a filogenetyczne relacje w grupie gatunków można wydedukować ż rozkładu występujących u nich wspólnych cech wyspecjalizowanych. Proponowana metoda opiera się więc na: 1) określeniu, które z cech występujących w badanej grupie są relatywnie prymitywne, a które relatywnie zaawansowane w rozwoju, 2) pogrupowaniu gatunków zgodnie ze wspólnymi dla nich cechami zaawansowanymi. Stosowane w biologii podejścia czy metody klasyfikacji, poza wspomnianym wyżej podejściem filogenetycznym, można podzielić na tradycyjne" i fenetyczne. Tradycyjna systematyka w znacznej mierze bazuje na intuicji badacza, który decyduje o doborze cech istotnych dla analizy - cech konserwatywnych" z genetyczne-
2 1 4 0 K.A. Kaszycka go punktu widzenia, pozwalających na wyodrębnienie gatunków. Analiza fenetyczna w systematyce jest próbą zastosowania metody empirycznej w określaniu relacji taksonomicznych. Jednak, jak twierdzą WlLEY i wsp. [1991], określanie tych relacji z zastosowaniem metod fenetycznych niewiele zmienia w stosunku do systematyki tradycyjnej - wyniki postępowania fonetycznego odzwierciedlają uogólnione podobieństwo badanych organizmów, co nie eliminuje możliwości ustanawiania także sztucznych" grup. Kladystyka (lub systematyka filogenetyczna) korzysta z metod empirycznych, z pomocą których dąży do znalezienia genealogicznych powiązań między taksonami raczej niż ich powiązań opartych na wzajemnych ogólnych podobieństwach. Dowodem wspólnego pochodzenia jest współwystępowanie takich samych, rozwojowo wyspeqalizowanych, cech - synapomorfii. W wyniku grupowania powstaje kladogram" (lub drzewo filogenetyczne), który jest rekonstrukcją związków genealogicznych. Nazwę kladystyka wzięła od greckiego słowa klados oznaczającego gałąź. Aby w pełni zrozumieć koncepcję systematyki filogenetycznej, należałoby zapoznać się z pewnymi terminami i definicjami, którymi jej użytkownicy się posługują. Definicje i objaśnienia pochodzą głównie z prac HENNINGA [1965, 1966], WlLEYA [1981] oraz WlLEYA i wsp. [1991] (terminologia polska - por. BOROWIEC [1989] oraz MATILE i wsp. [1993]). Terminologia związana z atrybutam i obiektów badań Podstawowym pojęciem biologii porównawczej jest cecha - właściwość lub atrybut organizmu, wykazująca zmienność i dająca się zarejestrować w formie zmiennej jakościowej lub ilościowej. Można wyróżnić dwa typy przejawiania się podobieństwa cech u organizmów: Homologia - podobieństwo wynikające ze wspólnoty pochodzenia. Cechy występujące u porównywanych gatunków są homologiczne, jeśli występowały już u wspólnego dla nich gatunku macierzystego, nawet gdy reprezentują różne etapy przemiany ewolucyjnej (rys. la). Homoplazja - w odróżnieniu od homologii, oznacza podobieństwo cech, które w dwu różnych taksonach wyewoluowały niezależnie, a gatunek macierzysty tych taksonów cechy takiej nie posiadał. Rozróżnia się trzy rodzaje homoplazji: - paralelizm, gdy cecha jest taka sama w dwu taksonach na skutek niezależnej ewolucji, przy czym u gatunku macierzystego występowała w odmiennej formie (rys. Ib); -konwergencja, gdy u porównywanych gatunków obserwujemy podobne cechy, lecz wyewoluowały one z dwu różnych cech gatunków macierzystych (rys. lc); - rewersja, kiedy w serii przemian cecha powraca wtórnie do stanu morfologicznego podobnego do stanu wyjściowego, utrzymującego się w innym taksonie (rys. Id). W trakcie ewolucji gatunków ich cechy ulegają przemianom. Sekwencja takich przemian nosi nazwę serii spolaryzowanej. Warianty cech, występujące w początkowych stadiach rozważanego ciągu genealogicznego nazywają się cechami plezjomorficznymi (prymitywnymi), w stadiach późniejszych - apomorficznymi (zaawansowanymi rozwojowo). Porównując gatunki możemy stwierdzić występowanie u nich cech: autapomorficznych - nowych, charakterystycznych
3 Zastosowanie analizy kladystycznei 141 tylko dla danego gatunku; symplezjomorficznych - wspólnych prymitywnych; synapomorficznych - wspólnych zaa wanso w anych. Terminologia dotycząca grup organizmów (taksonów) Wyodrębnia się trzy zasadnicze kategorie systematyczne grup. Grupa monofiletyczna (rys. 2a), to grupa gatunków zawierająca gatunek macierzysty (wspólnego przodka) i wszystkie gatunki potomne. Członkowie grupy monofiletycznej dysponują zestawem, wspólnych przez pochodzenie, właściwości nie dzielonych z żadnym gatunkiem umieszczonym poza tą grupą. Grupa monofiletyczna jest jednostką historii ewolucyjnej, zdefiniowaną na podstawie synapomorfii. Przykładem grupy monofiletycznej są ssaki (Mammalia). Dla takiej grupy stosuje się też nazwę klad (gałąź, ang. clade). a a b b a a b b c b b c a b b a a a a a Rys. 1. Przykłady homologii (A) i homoplazji: paralelizmu (B), konwergencji (C) i rewersji (D) Grupa parafiletyczna (rys. 2b) to grupa sztuczna - zawiera gatunek macierzysty, ale nie wszystkie gatunki potomne. Jest ona zdefiniowana na podstawie symplezjomorfii. Taksony parafiletyczne nie mają przodka właściwego tylko dla siebie, dlatego też nie da się im przypisać indywidualnej historii. Przykłady grup parafiletycznych to Pongidae lub Reptilia. Grupa polifiletyczna (rys. 2c) jest również grupą sztuczną. Składające się na nią gatunki wywodzą się z różnych gatunków macierzystych. Jest ona zdefiniowana na podstawie podobieństw wynikających z konwergencji. Przykładem mogą być..stałocieplne". Grupa siostrzana (rys. 3) to takson genealogicznie najbliżej spokrewniony z grupą rozważaną. Mówiąc o grupach, że są siostrzane stwierdzamy, że wywodzą się one bezpośrednio z tego samego gatunku macierzystego, nie będącego przodkiem dla żadnego innego taksonu. Rys. 2. Przykłady grup: monofiletycznej (a), parafiletycznej (b) i polifiletycznej (c) Grupa zewnętrzna (rys. 3 - każdy genealogicznie spokrewniony takson nie należący do grupy rozważanej. Grupy zewnętrzne wykorzystuje się dla celów porównawczych, by wykazać polaryzację cech. Najistotniejsze porównania grupy rozważanej z grupami zewnętrznymi dotyczą grup siostrzanych badanych taksonów. Wspólny gatunek macierzysty (rys. 3), który inaczej można określić jako bezpośredniego wspólnego przodka. Aby jakiś gatunek (P) uznać za macierzysty dla dwu gatunków (A i B) w powyższym sensie, musi on: - posiadać wszystkie apomorfie charakteryzujące grupę złożoną z gatunków A i B; - nie może dzielić apomorfii z jednym tylko z gatunków (A lub B); -n ie może mieć apomorfii właściwej tylko sobie (autapomorfii); -m usi być starszy od każdego z gatunków grupy A i B.
4 1 4 2 K.A. Kaszycka Terminy związane z procedurą i metodologią Zależności pomiędzy taksonami nie da się ustanowić na podstawie cech unikatowych - autapomorfii, podobnie jak nie są przydatne dla tego celu wspólne cechy prymitywne - symplezjomorfie. Te ostatnie mogą pozostawać niezmienione mimo wielu kolejnych specjacji i ich obecność w różnych taksonach nie może być dowodem bliskiego pokrewieństwa. Dla celów klasyfikacyjnych są więc one bez wartości. Jedynymi, potencjalnie użytecz- GRUPA ROZWAŻANA Y X Ć A Rys. 3. Kladogram dla grupy ABC (grupa rozważana) i grup zewnętrznych X i Y. X - grupa zewnętrzna - siostrzana względem rozważanej; P - gatunek macierzysty dla A i B nymi dla analizy kladystycznej cechami są synapomorfie - cechy wspólne, rozwojowo zaawansowane. Jednakże, aby dokonać rozróżnienia między cechami prymitywnymi i wyspecjalizowanymi, niezbędne jest porównanie z grupami zewnętrznymi, przy założeniu, że występują w nich cechy w prymitywnej formie. dl RELATYWNIE MAŁY MÓZG c m 3) e) PROGNATYZM TWARZY ^ Rysunek 4 przedstawia przykład postępowania klasyfikacyjnego. Przedstawiony na nim takson H posiada unikatową cechę a (autapomorfia), nieobecną w taksonach P i A. Taksony A i H mają wspólne zaawansowane rozwojowo cechy b i c (synapomorfie), których brak w taksonie P. Taksony P i A wykazują podobieństwo ze względu na obecne u nich prymitywne cechy d i e (symplezjomorfie), nieobecne w taksonie H. Wspólne, zaawansowane cechy obecne w taksonach A i H stanowią dowód, że taksony te są bliżej ze sobą spokrewnione niż każdy z nich z taksonem P. Wspólne prymitywne cechy, jakie występują w taksonach A i P, nie określają żadnego szczególnego pokrewieństwa między nimi. Zarówno symplezjomorfia jak i synapomorfia, to terminy relatywne. Wszystkie plezjomorfie były kiedyś apomorfiami. Ilustruje to przykład (rys. 5) uporządkowanej, wielostadialnej cechy, której stadia 0,1 i 2 tworzą szereg 0 1 -* 2. Taksony B i C posiadają wspólną cechę w stadium zaawansowanym 1 (takson A reprezentuje stadium prymitywne 0 ). Jednakże to samo stadium 1" można również uważać za symplezjomorfię, ponieważ takson D dysponuje autapomorficznym stadium 2 rozważanej cechy. W systematyce filogenetycznej przyjmuje się założenie, że każdy nowy gatunek pochodzi od innego gatunku, a proces powstawania gatunku - kladogeneza H a OBECNOŚĆ BRÓDKI b DWUNOŻNOŚĆ C) DWUGUZKOWY P3 Rys. 4. Kladogram przedstawiający przykład postępowania klasyfikacyjnego; a - cecha antapomorficzna; b, c - synapomorfie; d, e - symplezjomorfie
5 Zastosowanie analizy kladystycznej Aq Bi Ci D2 Rys. 5. Przykład uporządkowanej", wielostadialnej cechy o stadiach 0,1,2, obecnych w taksonach A, B, C i D (interpretacja w tekście) - polega na rozszczepieniu jednej linii rozwojowej na dwie potomne. W procesie tym jeden gatunek macierzysty daje dwa (lub więcej) gatunków potomnych (rys. 6). Kladogram jest graficznym A Rys. 6. Kladogeneza - gatunek macierzysty C daje początek dwu gatunkom potomnym: A i B przedstawieniem stosunków pokrewieństwa, rozgałęzionym diagramem zbudowanym na podstawie synapomorfii. Jest on pozaczasową" reprezentacją pokrewieństw. W sytuacji najprostszej, dla 3 taksonów, istnieją cztery możliwe kladogramy (rys. 7). B Ważnym elementem postępowania kladystycznego jest ustalanie polaryzacji cech, to jest określanie, które z badanych homologii mają charakter plezjomorficzny, a które apomorficzny. Istotność polaryzacji dla wyodrębniania grup siostrzanych ilustruje rysunek 8. Przy ustalaniu polaryzacji cech stosuje się cztery zasadnicze kryteria: paleontologiczne, powszechności, ontogenetyczne i porównania pozagrupowego. Podstawą działania kryterium paleontologicznego jest założenie, że stadia rozwojowe cech, obserwowane na starszych materiałach kopalnych, są bardziej prymitywne (plezjomorficzne) od tych, które spotyka się na materiałach młodszych. Kryterium powszechności funkcjonuje na zasadzie porównania wewnątrzgrupowego. Zakłada się, że stadium rozwojowe cechy, najbardziej rozpowszechnione wśród członków rozważanego (istniejącego aktualnie) taksonu, jest stadium prymitywnym - plezjomorfią. Kryterium ontogenetyczne stosuje się na dwa sposoby. Pierwszy wynika z przyjęcia założenia, że warianty cechy pojawiające się we wcześniejszych fazach rozwoju są plezjomorficzne (odwołujemy się tu do sekwencji ontogenetycznej, jak A B C A B C B C A A B C Rys. 7. Cztery teoretycznie możliwe kladogramy ilustrujące pokrewieństwa trzech gatunków: A, B i C Takson cecha A 1 1 jeżeli 0 1 to(a B )C jeżeli 1 0 to A(BC) A B C A B C B 1 0 C 0 0 Rys. 8. Wpływ polaryzacji cechy na wyodrębnienie grup siostrzanych
6 1 4 4 K. A. Kaszycka w prawie biogenetycznym Haeckela). Sposób drugi bazuje na założeniu, że wariant cechy, pojawiający się częściej w ontogenezie różnych członków grupy, jest bardziej prymitywny - plezjomorficzny niż ten, który występuje tylko w jednej z grup (prawo von Baera). GRUPA ROZW AŻANA ponad inne kryteria polaryzacji. Kryterium to jest, co więcej, w pełni ewolucyjne. Kodowanie cech jest nadawaniem cechom wartości numerycznych. Jeśli dana cecha występuje tylko w dwu wersjach, to przyjęto wartość 1 przypisywać GRUPA R O ZW AŻANA Rys. 9. Kladogram A okazuje się bardziej oszczędny" niż B, gdy weźmie się pod uwagę grupę zewnętrzną (kladogramy C i D) [za M a d d is o n i wsp. 1984] Kryterium porównania pozagrupowego, ostatnie z czterech zasadniczych kryteriów oceny ewolucyjnej polaryzacji, mówi, że jeżeli w rozważanej grupie cecha występuje w dwu (lub więcej) stadiach rozwojowych, to stadium spotykane w spokrewnionym taksonie (grupie zewnętrznej) uznaje się za plezjomorficzne (rys. 9). Kryterium porównania zewnątrzgrupowego zapewnia rozstrzygnięcia zgodnie z zasadą oszczędności" (ogólnie, najoszczędniejszy wewnątrzgrupowy kladogram to taki, którego konstrukcja wymaga najmniejszej liczby hipotez o paralelizmie i rewersji wewnątrz rozważanej grupy oraz w grupach zewnętrznych) i to jest jeden z powodów, dla których jest ono preferowane o 1 KROK {TRANSFORMACJA) 0 2 KROKI (TRANSFORMACJE) Rys. 10. Przykład różnych liczb transformacji uzasadniających połaczenia w kladogramie (0,1 - postacie cechy) wersji apomorficznej (zaawansowanej), a wartość - 0 plezjomorficznej (prymitywnej). Jednym z parametrów kladogramu jest długość drzewa", czyli - jak przyjmuje się najczęściej - liczba transformacji ewolucyjnych niezbędnych dla wyjaśnienia konfiguracji połączeń danego kladogramu. Analiza oszczędnościowa (ang. - parsimony) polega na minimalizacji rozstrzygnięć przy ustanawianiu grup siostrzanych (jeśli możliwe są rozstrzygnięcia alternatywne). Minimalizując liczbę kroków (transformacji) przy tworzeniu hipotetycznego drzewa filogenetycznego, maksymalizuje się jego moc wyjaśniającą (rys. 10). Postulat homologii wyjaśnia podobieństwa pomiędzy taksonami jako wynik dziedzictwa, podczas gdy stwierdzenie homoplazji wymaga pominięcia podobieństw i uznanie ich za skutki koincydencji. Jak twierdzą FARRIS [1989] oraz FAR- RIS i KLUGE [1985], uzasadnieniem dla stosowania analizy oszczędnościowej" w rozumowaniu filogenetycznym jest fakt, że najprostszy kladogram ma największą moc wyjaśniającą.
7 Zastosowanie analizy kladystycznej 145 Część II. Filogeneza hominidów Problem filogenezy hominidów jest dyskutowany intensywnie od wielu lat i choć stale przybywa znalezisk, ciągle wydaje się daleki od ostatecznego rozstrzygnięcia. Większość badaczy zgadza się, że dzisiejszy rodzaj Homo wyewoluował z któregoś z gatunków rodzaju Australopithecus, nadal jednak niejasne pozostają filogenetyczne powiązania pomiędzy poszczególnymi gatunkami. Aktualnie, w plio- plejstoceńskich materiałach kopalnych z Afryki wyróżnia się co najmniej sześć gatunków wczesnych hominidów: Australopithecus afarensis, A. africanus, A. robustus, A. boisei, A. aethiopicus i Homo habilis, a relacje pomiędzy nimi są różnie przedstawiane przez różnych autorów. Do niedawna uważano na ogół, że A. africanus był prymitywniejszą formą homínida w stosunku do form późniejszych, takich jak H. habilis i masywne" australopiteki. W latach osiemdziesiątych zaproponowano istnienie nowego gatunku - A. afarensis, co zmusiło antropologów do zmiany poglądów na temat ewolucyjnych powiązań pomiędzy hominidami. Kolejne istotne zmiany nastąpiły w wyniku odkrycia (w 1985 r.) następnego wczesnego gatunku australopiteka - A. aethiopicus. Jego bardzo masywna czaszka, znana obecnie jako tzw. czarna czaszka" (black skuli), ze względu na kolor znaleziska, stworzyła nowe, liczne problemy w interpretacji ewolucji australopiteków. Zanim odkryto czarną czaszkę" (KNM-WT A. aethiopicus), spory dotyczyły głównie dwu zagadnień. Pierwsze z nich to filogenetyczna pozycja Australopithecus africanus. Wysuwano trzy różne hipotezy. SKELETON i wsp. [1986] uważał A. africanus za wspólnego przodka zarówno H. habilis, jak i masywnych" australopiteków; Boaz [1983] sugerował, że tylko Homo wywodzi sie z A. africanus, wreszcie zdaniem WHITE'A i wsp. [1981] A. africanus był przodkiem jedynie masywnych" australopiteków. Drugie ze spornych zagadnień to pytanie, czy masywne" australopiteki można podzielić na dwa gatunki, umieszczając je nawet w odrębnym rodzaju - A. (lub Paranthropus) robustus oraz A. (P.) boisei. Przegląd tego zagadnienia przedstawili WOOD i CHA- BERLAIN [1987]. Obecnie przeważa przekonanie, że A. afarensis jest najbardziej zgeneralizowanym (prymitywnym) gatunkiem australopiteka i najlepszym kandydatem na ostatniego wspólnego przodka wszystkich późniejszych hominidów. Wielu autorów dyskutowało systematykę hominidów z perspektywy kladystycznej. Na przykład WHITE i wsp. [1981], Skelton i wsp. [1986], ale tylko nieliczne analizy kladystyczne zostały przeprowadzone z zachowaniem odpowiedniej procedury i na oryginalnych danych (np. Wood i Chamberlain [1986], Chamberlain i Wood [1987]). Celem przedstawianej pracy jest rekonstrukcja filogenezy hominidów (z uwzględnieniem gatunku A. aethiopicus), wykorzystująca metodę kladystyczną. Materiał i metody Związki filogenetyczne pomiędzy ośmioma taksonami hominidów (australopiteki i Homo) zbadano z użyciem analizy kladystycznej. Dane dotyczące 255 morfologicznych i morfometrycznych cech kopalnych czaszek, żuchw i uzębienia hominidów pochodzą z literatury. Badana próba obejmuje lepiej zachowane czaszki i żuchwy, nie zawiera natomiast materiału postkranialnego. Okazy należą
8 1 4 6 K.A. Kaszycka do wymienionych niżej, konwencjonalnie zdefiniowanych taksonów (datowania głównie za JOHANSONEM [1989]). A. afarensis: Hadar, Laetoli (4,0-3,0 min lat) A. aethiopicus: Lake Turkana (2,6-2,5 min lat) A. africanus: Sterkfontein, Makapansgat, Taung (2,9-2,3 min lat) A. robustus: Swartkrans, Kromdraai (1,9-1,6 min lat) A. boisei: Lake Turkana, 01duvai, Peninj, Omo, Chesowanja (2,2-1,3 min lat) H. habilis: Lake Turkana, 01duvai, Omo, Swartkrans, Sterkfontein (2,0-1,3 min lat) H. erectus: materiały z Chin, Indonezji i Afryki (1,6-0,3 min lat) Dane wykorzystane w tej analizie pochodzą z pięciu różnych źródeł. Pierwszy zestaw danych pochodzi z pracy KlM- BELA i wsp. [1988]. Jest to jedyny zestaw danych zawierający informacje o cechach nowego gatunku - A. aethiopicus, w szczególności jest to opis pojedynczej, prawie kompletnej czaszki oznaczonej numerem katalogowym KNM-WT , znanej jako black skuli. Spośród 32 cech wymienianych w pracy, 12 określono jako prymitywne, nawiązujące do A. afarensis, 6 zaawansowanych, wspólnych z A. africanus, A. robustus i A. boisei (a do pewnego stopnia także z Homo), 12 zaawansowanych cech wspólnych z A. robustus i A. boisei i dwie zaawansowane, wspólne jedynie z A. boisei. Jednakże cytowana praca nie jest analizą kladystyczną - autorzy po prostu przedstawiają listę powiązań czaszki WT i proponują 4 alternatywne filogenezy Hominidae z uwzględnieniem A. aethiopicus. Wszystkie cechy wymienione przez KlMBELA i wsp. [1988] zostały wykorzystane w analizie. Drugi zestaw danych pochodzi z pracy W o o d a i C h a m b e r la in a [1986]. Chociaż autorzy wymieniają 39 cech, do analizy wykorzystanych zostało jedynie 8 - pozostałe były wartościami wskaźnikowymi i nie odpowiadały warunkom analizy. Trzeci zestaw danych zaczerpnięto z pracy CHAMBERLAINA i WOODA [1987], w której autorzy zastosowali metodę wyznaczania stadiów rozwojowych cech na podstawie wartości pomiarów liniowych. Przedstawili oni 90 cech - wszystkie zostały wykorzystane w analizie. Czwartym źródłem danych była praca TOBIASA [1988]. Autor ten nie wyróżnił gatunku A. afarensis, ponieważ jego zdaniem gatunek ten jest w rzeczywistości tylko podgatunkiem A.africanus [TOBIAS 1980]. W analizie nie wykorzystano 30 z prezentowanych 73 cech, ponieważ zawierały one wartości wskaźnikowe bądź były uwzględnione w innych zestawach. Ostatni, piąty zestaw cech pochodzi z pracy SKELTONA i wsp. [1986]. Pewien problem stwarzał fakt, że autorzy nie rozróżniali dwu masywnych" gatunków australopiteków, wobec czego te same stadia rozwojowe cech zostały przypisane zarówno A. robustus, jak i A. boisei. Większość cech podanych przez SKEL TONA i wsp. [1986] pochodzi z pracy WHITE'A i wsp. [1981] (cech takich było 66). Stadia rozwojowe tych cech zostały uporządkowane", to jest ułożone w odpowiedniej kolejności. W celu dokonania polaryzacji cech (określenia, które ich warianty należy uznać za prymitywne, a które za wyspecjalizowane), wykorzystano metodę porównania pozagrupowego (hipotetyczny przodek). W tej analizie założono, że cechy zostały prawidłowo spolaryzowane przez wszystkich autorów, których dane uwzględniono. Niektórzy z tych autorów posługiwali się małpami człekokształtnymi jako grupami zewnętrznymi, inni stosowali kryterium powszechności, biorąc
9 Zastosowanie analizy kladystycznej pod uwagę współczesne małpy i kopalne hominoidy, inni wreszcie zastosowali kryterium paleontologiczne. Zasadnicza analiza została wykonana z użyciem komputerowego programu kladystycznego PAUP (Phylogenetic Analysis Using Parsimony), w wersji 3.0k [SWOFFORD 1990]. Zbiór danych był wystarczająco mały, by zbudować wszystkie możliwe drzewa. W celu optymalizacji zastosowano metodę ACCTRAN (accelerated transformation), która faworyzuje rewersję wobec paralelizmu, gdy wybór dotyczy dwu tak samo oszczędnych rozwiązań. Niektóre wielostadialne cechy zostały uporządkowane. Zmienne cechy były kodowane dwukrotnie, raz jako 0", a drugi raz jako 1". Przyjęto równoważność wszystkich cech. Gatunki były traktowane jako taksony końcowe Wyniki i dyskusja W wyniku opisanego wyżej postępowania powstało ponad drzew, o długości od 583 do 847, w tym dwa kladogramy najoszczędniejsze, o takiej samej długości (583) (rys. 11). Zbiór wynikowych statystyk przedstawia się następująco: Długość drzewa = 583 Wskaźnik konsystencji = 0,756 Wskaźnik homoplazji = 0,244 Wskaźnik konsystencji po wyłączeniu cech nieinformatywnych = 0,738 Wskaźnik retencji = 0,664 Przeskalowany wskaźnik konsystencji = 0,502 Analiza kladystyczna potwierdziła monofiletyzm rodzaju Homo, czego nie można powiedzieć o rodzaju Australopithecus. Relacja A. aethiopicus do innych taksonów nie jest jasna. Główną przyczyną tej niejasności są brakujące dane - tylko -Hipotetyczny przodek A.afarensis A.africanus Hipotetyczny przodek A.afarensis [ A.aethiopicus A.africanus f - A.aethiopicus A.boisei A robustus H.habilis H.erectus H.habilis H. sapiens A.robustus A.boisei H.erectus H. sapiens Rys. 11. Najoszczędniejsze kladogramy uzyskane w wyniku analizy 41 (spośród 255) cech dotyczyło czarnej czaszki. Na kladogramie A (rys. lla ) A. aethiopicus umieszczony jest w pozycji taksonu siostrzanego w stosunku do A. boisei. Na równie oszczędnym kladogramie B (rys. llb ) gatunek ten jest taksonem siostrzanym grupy [A. africanus [A. robustus, A. boisei] [H. habilis [H. erectus, H. sapiens]]], podczas gdy pozycje pozostałych taksonów pozostały niezmienione. Uwzględnienie dodatkowych informacji (datowanie gatunków) nie ułatwia wyboru pomiędzy tymi kladogramami, choć kladogram B wydaje się bardziej prawdopodobny niż kladogram A. Jest rzeczą ogólnie znaną, że - z powodu braku datowań bezwzględnych - chronologia południowoafrykańskich stanowisk pozostaje problematyczna. Wątpliwości dotyczą dwu spraw. Po pierwsze, jak szerokie są przedziały czasowe, po drugie, jaki jest B
10 1 4 8 K.A. Kaszycka WALKER et ol. [1986) A.boisei A. robustus Homo \ \ / WT17K A.africanus A.afarensis DELSON [1986] A.boisei A.robustus Homo A.afarensis WOOD [1992] A.boisei A robustus Homo WT 17 K A.a fric a n u s / \ I / A.afarensis Rys. 12. Powiązania filogenetyczne wczesnych hominidów wiek stanowisk. Wschodnioafrykański A. aethiopicus, z datowaniem na 2,6-2,5 min lat, wydaje się młodszy od najwcześniejszych ze znanych przedstawicieli A. africanus z Afryki Południowej, choć jednocześnie wydaje się również starszy niż najpóźniejsze znane okazy tego gatunku. Z drugiej strony, A. aethiopicus - jak wszystko wskazuje - jest najstarszy wśród tak zwanych masywnych" gatunków australopiteków. Z tych powodów prawdopodobieństwo prawdziwości kladogramu A wydaje się mniejsze niż kladogramu B. W obu opisanych przypadkach pozycja A. aethiopicus jest niezgodna z obrazem filogenezy, przyjmowanym na podstawie badań metodami konwencjonalnymi. Na przykład KlMBEL i wsp. [1988] stwierdzają, że odkrycie czarnej czaszki" nie wyjaśniło wiele w filogenetycznej pozycji A. africanus - nadal pozostaje ona zagadkowa. Zdaniem tych autorów A. aethiopicus nadaje się znakomicie (pod względem morfologii) na ewolucyjne ogniwo między A. afarensis i późniejszymi masywnymi formami - A. robustus i A. boisei. Poniżej przedstawione zostały trzy spośród ostatnio publikowanych schematów filogenezy wczesnych hominidów (rys. 12). Zdaniem WALKERA i wsp. [1986] A. africanus należy uważać za przodka A. robustus, a A. aethiopicus za przodka A. boisei, co sugeruje istnienie dwu niezależnych linii rozwojowych masywnych" australopiteków - we wschodniej i południowej Afryce. DELSON [1986] włącza A. africanus do gałęzi Homo. Czarna czaszka" reprezentuje, jego zdaniem, wspólnego przodka A. robustus i A. boisei. WOOD [1992] także przedstawia WT jako wspólnego przodka obu masywnych" gatunków australopiteków, jednak, na podstawie własnych danych, dochodzi do wniosku, że A. africanus ani nie wykazuje silniejszego związku z Homo, ani nie pasuje do gałęzi masywnych" australopiteków. Wyniki przedstawionej analizy potwierdzają bliski filogenetyczny związek A. africanus, zarówno z Homo jak i z masywnymi" australopitekami (w sensie kladystycznym). Jakkolwiek powiązania A. aethiopicus są niejasne, w najoszczędniejszych kladogramach gatunek ten nie stał się taksonem siostrzanym dla grupy złożonej z A. robustus i A. boisei łącznie. Same dane przedstawione przez KlMBELA i wsp. [1988] odrzucają możliwość uznania A. aethiopicus za wspólnego przodka obu masywnych" gatunków australopiteków, bowiem A. aethiopicus ma dwie wspólne, zaawansowane cechy dzielone tylko z A. boisei. Jest to sprzeczne z założeniem, że aby dany gatunek mógł być uznany za ostatniego wspólnego przodka dwu innych gatunków, nie może dzielić apomorfii tylko z jednym z nich.
11 Zastosowanie analizy kladystycznej Piśmiennictwo B o az N.T., 1983, Morphological Trends and Phylogenetic Relationships from Middle Miocene Hominoids to Late Pliocene Hominoids, [w:] New Interpretations of Ape and Human Ancestry, R.L. Ciochon, R.S. Corruccini (Eds), Plenum Publ. Corpor., New York, B o r o w ie c L., 1989, Teoria i praktyka taksonomii kladystycznej, Przegl. Zool., 33, C h a m b e r l a in A.T., BA. W o o d, 1987, Early hominid phytogeny, J. Hum. Evol., 16, D e l s o n E., 1986, Human phytogeny revised again, Nature, 322, F a r r is J.S., 1989, Entropy and fruit flies, Cladistics, 5, F a r r is J.S., A.G. K l u g e, 1985, Parsimony, synapomorphy, and explanatory power: a reply to Duncan, Taxon, 34, H enn ig W., 1965, Phylogenetic systematics, Ann. Rev. Entomol., 10, Hennig W., 1966, Phylogenetic Systematics, Univ. of Illinois Press, Urbana Johanson D.C., 1989, The current status of Australopithecus, [w:] Hominoidea. Proceeding of the 2nd International Congress of Human Paleontology, Milan, Kimbel W.H., T.D. White, D.C. Johanson, 1988, Implications of KNM-WT for the Evolution of robust" Australopithecus, [w:] Evolutionary History of the Robust" Australopithecines, F. E. Grine (Ed.), Aldine, Chicago, M a d d is o n W.P., M.J. Donoghue, D.R. Maddison, 1984, Outgroup analysis and parsimony, Syst. Zool., 33, Matile L., P. Tassy, D. Goujet, 1993, Wstpp do systematyki zoologicznej, Warszawa Skelton R.R., H. McHenry, G.M. Drawhorn, 1986, Phylogenetic analysis of early hominids, Curr. Anthrop., 27,21-43 S w o f f o r d D.L., 1990, PAUP: phylogenetic analysis using parsimony, Version 3.0, May 1990, Illinois. Nat. Hist. Surv., Champaign Tobias P.V., 1980, Australopithecus afarensis" and A. africanus: critique and an alternative hypothesis, Palaeont. Afr. 23,1-17 Tobias P.V., 1988, Numerous apparently synapomorphic features in Australopithecus robustus, Austaralopithecus boisei and Homo habilis: support for the Skeleton-McHenry-Drawhom hypothesis, [w:] Evolutionary History of the Robust" Australopithecines, F.E. Grine ed., Aldine, Chicago, W alker A., R.E. Leakey, J. M.Harris, F.H. Brown, 1986, 2.5-Myr Australopithecus boisei from west of Lake Turkana, Kenya, Nature, 322, White T.D., D.C. Johanson, W.H. Kimbel, 1981, Australopithecus africanus: its phyletic position reconsidered, South Afr. J. Sci., 77, Wiley E.O., 1981, Phylogenetics: The Theory and Practice of Phylogenetic Systematics, New York Wiley E.O., D.Siegel-Causey, D.R. Brooks, V.A. Funk, 1991, The Compleat Cladist: A Primer of Phylogenetic Procedures, Univ. of Kansas, Lawrence W o o d B.A., A.T. C h a m b e r la in, 1986, Australopithecus: grade or clade?, [w:j Major Topics in Primate and Human Evolution, B.Wood, L. Martin, P. Andrews (Eds), Cambridge, Univ. Press, W o o d B.A., A.T. C h a m b e r la in, 1987, The nature and affinities of the "robust" Australopithecines: a review, J. Hum. Evol., 16,
klasyfikacja fenetyczna (numeryczna)
Teorie klasyfikacji klasyfikacja fenetyczna (numeryczna) systematyka powinna być wolna od wszelkiej teorii (a zwłaszcza od teorii ewolucji) filogeneza jako ciąg zdarzeń jest niepoznawalna opiera się na
FILOGENEZA A KLADYSTYKA
1996, 45 (4): 763-768 Towarzystwo " 1 ^ " 1\ /T PL ISSN 0023-4249 i S S S S X V v - / 0 1 V l v y 0 M ie c z y s a w W o ls a n Instytut Paleobiologii PAN al. Żwirki i Wigury 93, 02-089 Warszawa FILOGENEZA
Ewolucja człowieka. Ostatnie 5 milionów lat
Ewolucja człowieka Ostatnie 5 milionów lat 1 Złożone zagadki } } Odnaleziono wiele skamieniałości naczelnych, różne gatunki w tym samym czasie Trudno ustalić relacje między nimi } Przodkowie, czy boczne
Urszula Poziomek, doradca metodyczny w zakresie biologii Materiał dydaktyczny przygotowany na konferencję z cyklu Na miarę Nobla, 14 stycznia 2010 r.
Ćwiczenie 1 1 Wstęp Rozważając możliwe powiązania filogenetyczne gatunków, systematyka porównuje dane molekularne. Najskuteczniejszym sposobem badania i weryfikacji różnych hipotez filogenetycznych jest
ANTROPOGENEZA KARTA PRACY DLA UCZNIA
ANTROPOGENEZA KARTA PRACY DLA UCZNIA 1. STANOWISKO SYSTEMATYCZNE CZŁOWIEKA Przedstaw systematykę człowieka, korzystając z przedstawionego poniżej schematu, ilustrującego uproszczone drzewo genealogiczne
KARTA KURSU. Podstawy taksonomii. Dr hab. Mieczysław Mazur, prof. UP
Kierunek, stopień, tok studiów, rok akademicki, semestr Biologia, 1 stopień, stacjonarne, 2017/2018, sem. 1 KARTA KURSU Nazwa Nazwa w j. ang. Podstawy taksonomii Principles of taxonomy Koordynator Dr hab.
Kierunek i poziom studiów: Biologia, poziom drugi Sylabus modułu: Filogenetyka i taksonomia roślin i zwierząt dla EKOP
Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 1 Kierunek i poziom studiów: Biologia, poziom drugi Sylabus modułu: Filogenetyka i taksonomia roślin i zwierząt dla EKOP kod modułu: 2BL_12 1. Informacje ogólne koordynator
Filogenetyka molekularna I. Krzysztof Spalik
Filogenetyka molekularna I Krzysztof Spalik Literatura Krzysztof Spalik, Marcin Piwczyński (2009), Rekonstrukcja filogenezy i wnioskowanie filogenetyczne w badaniach ewolucyjnych, Kosmos 58(3-4): 485-498
Ewolucja człowieka. Ślady w ziemi i ślady w genach
Ewolucja człowieka Ślady w ziemi i ślady w genach Gdyby Ziemia istniała 1 rok 26 XII wymierają dinozaury 28 XII małpy 31 XII, 14:00 rozdzielenie linii przodków ludzi i szympansów 31 XII, 20:00 Homo erectus
Genomika Porównawcza. Agnieszka Rakowska Instytut Informatyki i Matematyki Komputerowej Uniwersytet Jagiellooski
Genomika Porównawcza Agnieszka Rakowska Instytut Informatyki i Matematyki Komputerowej Uniwersytet Jagiellooski 1 Plan prezentacji 1. Rodzaje i budowa drzew filogenetycznych 2. Metody ukorzeniania drzewa
Ewolucja człowieka. Ślady w ziemi i ślady w genach
Ewolucja człowieka Ślady w ziemi i ślady w genach!1 Złożone zagadki Odnaleziono wiele skamieniałości naczelnych, różne gatunki w tym samym czasie Trudno ustalić relacje między nimi Przodkowie, czy boczne
PODSTAWY BIOINFORMATYKI WYKŁAD 5 ANALIZA FILOGENETYCZNA
PODSTAWY BIOINFORMATYKI WYKŁAD 5 ANALIZA FILOGENETYCZNA ANALIZA FILOGENETYCZNA 1. Wstęp - filogenetyka 2. Struktura drzewa filogenetycznego 3. Metody konstrukcji drzewa 4. Etapy konstrukcji drzewa filogenetycznego
Filogenetyka molekularna I
2 Literatura Krzysztof Spalik, Marcin Piwczyński (2009), Rekonstrukcja filogenezy i wnioskowanie filogenetyczne w badaniach ewolucyjnych, Kosmos 58(3-4): 485-498 Filogenetyka molekularna I John C. Avise
Recenzja rozprawy doktorskiej. mgr Marcina Jana Kamińskiego. pt. Grupa rodzajowa Ectateus (Coleoptera: Tenebrionidae) filogeneza i klasyfikacja.
Dr hab. Grzegorz Paśnik Instytut Systematyki i Ewolucji Zwierząt Polska Akademia Nauk ul. Sławkowska 17, 31-016 Kraków Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Marcina Jana Kamińskiego pt. Grupa rodzajowa Ectateus
Antropogeneza - konspekt lekcji z wykorzystaniem technologii komputerowej.
Antropogeneza - konspekt lekcji z wykorzystaniem technologii komputerowej. Cele edukacyjne i wychowawcze wymagania. Po zajęciach uczeń potrafi: Wiadomości: - zdefiniować terminy: antropogeneza, hominizacja.
Filogenetyka molekularna. Dr Anna Karnkowska Zakład Filogenetyki Molekularnej i Ewolucji
Filogenetyka molekularna Dr Anna Karnkowska Zakład Filogenetyki Molekularnej i Ewolucji Co to jest filogeneza? Filogeneza=drzewo filogenetyczne=drzewo rodowe=drzewo to rozgałęziający się diagram, który
Ograniczenia środowiskowe nie budzą wielu kontrowersji, co nie znaczy że rozumiemy do końca proces powstawania adaptacji fizjologicznych.
1 Ograniczenia środowiskowe nie budzą wielu kontrowersji, co nie znaczy że rozumiemy do końca proces powstawania adaptacji fizjologicznych. Wiadomo, że ściśle powiązane z zagadnieniem interakcji kompetencje
Teoria ewolucji. Podstawy wspólne pochodzenie.
Teoria ewolucji. Podstawy wspólne pochodzenie. Ewolucja biologiczna } Znaczenie ogólne: } proces zmian informacji genetycznej (częstości i rodzaju alleli), } które to zmiany są przekazywane z pokolenia
Koncepcje gatunku: Przegląd i ocena stosowalności do badañ materiałów kopalnych
Przegląd Antropologiczny tom 59, s. 19 29, Poznań 1996 Koncepcje gatunku: Przegląd i ocena stosowalności do badañ materiałów kopalnych Abstract SPECIES CONCEPTS: REVIEW AND EVALUATION IN THE CONTEXT OF
Konstruowanie drzew filogenetycznych. Magda Mielczarek Katedra Genetyki Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu
Konstruowanie drzew filogenetycznych Magda Mielczarek Katedra Genetyki Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu Drzewa filogenetyczne ukorzenione i nieukorzenione binarność konstrukcji topologia (sposób rozgałęziana
Budowanie drzewa filogenetycznego
Szkoła Festiwalu Nauki 134567 Wojciech Grajkowski Szkoła Festiwalu Nauki, ul. Ks. Trojdena 4, 02-109 Warszawa www.sfn.edu.pl sfn@iimcb.gov.pl Budowanie drzewa filogenetycznego Cel Ćwiczenie polega na budowaniu
Statystyka w pracy badawczej nauczyciela
Statystyka w pracy badawczej nauczyciela Wykład 1: Terminologia badań statystycznych dr inż. Walery Susłow walery.suslow@ie.tu.koszalin.pl Statystyka (1) Statystyka to nauka zajmująca się zbieraniem, badaniem
Filogenetyka molekularna I. Krzysztof Spalik Zakład Filogenetyki Molekularnej i Ewolucji
Filogenetyka molekularna I Krzysztof Spalik Zakład Filogenetyki Molekularnej i Ewolucji 3 Literatura Krzysztof Spalik, Marcin Piwczyński (2009), Rekonstrukcja filogenezy i wnioskowanie filogenetyczne w
Metodologia badań naukowych
Metodologia badań naukowych Cele zajęć: Nabycie umiejętności określania problemu badawczego i planowania badania Przyswojenie umiejętności z zakresu przygotowania i przeprowadzenia badania empirycznego
Etapy modelowania ekonometrycznego
Etapy modelowania ekonometrycznego jest podstawowym narzędziem badawczym, jakim posługuje się ekonometria. Stanowi on matematyczno-statystyczną formę zapisu prawidłowości statystycznej w zakresie rozkładu,
Jak powstają nowe gatunki. Katarzyna Gontek
Jak powstają nowe gatunki Katarzyna Gontek Powstawanie gatunków (specjacja) to proces biologiczny, w wyniku którego powstają nowe gatunki organizmów. Zachodzi na skutek wytworzenia się bariery rozrodczej
METODY CHEMOMETRYCZNE W IDENTYFIKACJI ŹRÓDEŁ POCHODZENIA
METODY CHEMOMETRYCZNE W IDENTYFIKACJI ŹRÓDEŁ POCHODZENIA AMFETAMINY Waldemar S. Krawczyk Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Komendy Głównej Policji, Warszawa (praca obroniona na Wydziale Chemii Uniwersytetu
Teoria ewolucji. Podstawowe pojęcia. Wspólne pochodzenie.
Teoria ewolucji Podstawowe pojęcia. Wspólne pochodzenie. Ewolucja Znaczenie ogólne: zmiany zachodzące stopniowo w czasie W biologii ewolucja biologiczna W astronomii i kosmologii ewolucja gwiazd i wszechświata
STRESZCZENIE. rozprawy doktorskiej pt. Zmienne jakościowe w procesie wyceny wartości rynkowej nieruchomości. Ujęcie statystyczne.
STRESZCZENIE rozprawy doktorskiej pt. Zmienne jakościowe w procesie wyceny wartości rynkowej nieruchomości. Ujęcie statystyczne. Zasadniczym czynnikiem stanowiącym motywację dla podjętych w pracy rozważań
Wspólne pochodzenie. Ślady ewolucji.
Wspólne pochodzenie Ślady ewolucji. Wspólne pochodzenie Wspólni przodkowie Dla wszystkich organizmów na Ziemi można odnaleźć wspólnego przodka przeszłość Wspólny przodek Drzewo i klasyfikacja hierarchiczna
Pojęcia to. porównanie trzech sposobów ujmowania pojęć. Monika Marczak IP, UAM
Pojęcia to. porównanie trzech sposobów ujmowania pojęć Monika Marczak IP, UAM Takiego zwierzęcia nie ma?????????? Jeśli brakuje umysłowej reprezentacji pewnego fragmentu rzeczywistości, fragment ten dla
Dopasowanie sekwencji (sequence alignment)
Co to jest alignment? Dopasowanie sekwencji (sequence alignment) Alignment jest sposobem dopasowania struktur pierwszorzędowych DNA, RNA lub białek do zidentyfikowanych regionów w celu określenia podobieństwa;
Ewolucja człowieka. Ślady w ziemi i ślady w genach
Ewolucja człowieka Ślady w ziemi i ślady w genach Gdyby Ziemia istniała 1 rok 26 XII wymierają dinozaury 28 XII małpy 31 XII, 14:00 rozdzielenie linii przodków ludzi i szympansów 31 XII, 20:00 Homo erectus
Testowanie hipotez statystycznych. Wnioskowanie statystyczne
Testowanie hipotez statystycznych Wnioskowanie statystyczne Hipoteza statystyczna to dowolne przypuszczenie co do rozkładu populacji generalnej (jego postaci funkcyjnej lub wartości parametrów). Hipotezy
Wykład Bioinformatyka 2012-09-24. Bioinformatyka. Wykład 7. E. Banachowicz. Zakład Biofizyki Molekularnej IF UAM. Ewolucyjne podstawy Bioinformatyki
Bioinformatyka Wykład 7 E. Banachowicz Zakład Biofizyki Molekularnej IF UAM http://www.amu.edu.pl/~ewas 1 Plan Bioinformatyka Ewolucyjne podstawy Bioinformatyki Filogenetyka Bioinformatyczne narzędzia
Proces badawczy schemat i zasady realizacji
Proces badawczy schemat i zasady realizacji Agata Górny Zaoczne Studia Doktoranckie z Ekonomii Warszawa, 23 października 2016 Metodologia i metoda naukowa 1 Metodologia Metodologia nauka o metodach nauki
Badania eksperymentalne
Badania eksperymentalne Analiza CONJOINT mgr Agnieszka Zięba Zakład Badań Marketingowych Instytut Statystyki i Demografii Szkoła Główna Handlowa Najpopularniejsze sposoby oceny wyników eksperymentu w schematach
Badania eksploracyjne Badania opisowe Badania wyjaśniające (przyczynowe)
Proces badawczy schemat i zasady realizacji Agata Górny Demografia Wydział Nauk Ekonomicznych UW Warszawa, 4 listopada 2008 Najważniejsze rodzaje badań Typy badań Podział wg celu badawczego Badania eksploracyjne
Analiza korespondencji
Analiza korespondencji Kiedy stosujemy? 2 W wielu badaniach mamy do czynienia ze zmiennymi jakościowymi (nominalne i porządkowe) typu np.: płeć, wykształcenie, status palenia. Punktem wyjścia do analizy
Bazy danych. Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie. Wykład 3: Model związków encji.
Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie Bazy danych Wykład 3: Model związków encji. dr inż. Magdalena Krakowiak makrakowiak@wi.zut.edu.pl Co to jest model związków encji? Model związków
Algorytm Genetyczny. zastosowanie do procesów rozmieszczenia stacji raportujących w sieciach komórkowych
Algorytm Genetyczny zastosowanie do procesów rozmieszczenia stacji raportujących w sieciach komórkowych Dlaczego Algorytmy Inspirowane Naturą? Rozwój nowych technologii: złożone problemy obliczeniowe w
Warszawa, kwiecień 2011 BS/38/2011 STOSUNEK POLAKÓW DO PRACY I PRACOWITOŚCI
Warszawa, kwiecień 2011 BS/38/2011 STOSUNEK POLAKÓW DO PRACY I PRACOWITOŚCI Znak jakości przyznany CBOS przez Organizację Firm Badania Opinii i Rynku 13 stycznia 2011 roku Fundacja Centrum Badania Opinii
Opis wykonanych badań naukowych oraz uzyskanych wyników
Opis wykonanych badań naukowych oraz uzyskanych wyników 1. Analiza danych (krok 2 = uwzględnienie epistazy w modelu): detekcja QTL przy wykorzystaniu modeli dwuwymiarowych z uwzględnieniem różnych modeli
Bioinformatyka Laboratorium, 30h. Michał Bereta
Bioinformatyka Laboratorium, 30h Michał Bereta mbereta@pk.edu.pl www.michalbereta.pl 1 Często dopasować chcemy nie dwie sekwencje ale kilkanaście lub więcej 2 Istnieją dokładne algorytmy, lecz są one niewydajne
Metodologia badań psychologicznych
Metodologia badań psychologicznych Lucyna Golińska SPOŁECZNA AKADEMIA NAUK Psychologia jako nauka empiryczna Wprowadzenie pojęć Wykład 5 Cele badań naukowych 1. Opis- (funkcja deskryptywna) procedura definiowania
Proces badawczy schemat i zasady realizacji
Proces badawczy schemat i zasady realizacji Agata Górny Zaoczne Studia Doktoranckie z Ekonomii Warszawa, 14 grudnia 2014 Metodologia i metoda badawcza Metodologia Zadania metodologii Metodologia nauka
Proces badawczy schemat i zasady realizacji
Proces badawczy schemat i zasady realizacji Agata Górny Wydział Nauk Ekonomicznych UW Warszawa, 28 października 2014 Najważniejsze rodzaje badań Typy badań Podział wg celu badawczego Kryteria przyczynowości
Algorytm. Krótka historia algorytmów
Algorytm znaczenie cybernetyczne Jest to dokładny przepis wykonania w określonym porządku skończonej liczby operacji, pozwalający na rozwiązanie zbliżonych do siebie klas problemów. znaczenie matematyczne
Hierarchiczna analiza skupień
Hierarchiczna analiza skupień Cel analizy Analiza skupień ma na celu wykrycie w zbiorze obserwacji klastrów, czyli rozłącznych podzbiorów obserwacji, wewnątrz których obserwacje są sobie w jakimś określonym
SCENARIUSZ LEKCJI. TEMAT LEKCJI: Zastosowanie średnich w statystyce i matematyce. Podstawowe pojęcia statystyczne. Streszczenie.
SCENARIUSZ LEKCJI OPRACOWANY W RAMACH PROJEKTU: INFORMATYKA MÓJ SPOSÓB NA POZNANIE I OPISANIE ŚWIATA. PROGRAM NAUCZANIA INFORMATYKI Z ELEMENTAMI PRZEDMIOTÓW MATEMATYCZNO-PRZYRODNICZYCH Autorzy scenariusza:
Katarzyna Wojewoda-Buraczyńska Koncepcja multicentryczności prawa a derywacyjne argumenty systemowe. Studenckie Zeszyty Naukowe 9/13, 84-87
Katarzyna Wojewoda-Buraczyńska Koncepcja multicentryczności prawa a derywacyjne argumenty systemowe Studenckie Zeszyty Naukowe 9/13, 84-87 2006 Katarzyna Wojewoda-Buraczyńska Koncepcja multicentryczności
Wnioskowanie bayesowskie
Wnioskowanie bayesowskie W podejściu klasycznym wnioskowanie statystyczne oparte jest wyłącznie na podstawie pobranej próby losowej. Możemy np. estymować punktowo lub przedziałowo nieznane parametry rozkładów,
POJĘCIA WSTĘPNE. STATYSTYKA - nauka traktująca o metodach ilościowych badania prawidłowości zjawisk (procesów) masowych.
[1] POJĘCIA WSTĘPNE STATYSTYKA - nauka traktująca o metodach ilościowych badania prawidłowości zjawisk (procesów) masowych. BADANIE STATYSTYCZNE - ogół prac mających na celu poznanie struktury określonej
Elementy statystyki opisowej, podstawowe pojęcia statystyki matematycznej
Elementy statystyki opisowej, podstawowe pojęcia statystyki matematycznej Dr Joanna Banaś Zakład Badań Systemowych Instytut Sztucznej Inteligencji i Metod Matematycznych Wydział Informatyki Politechniki
Testy zgodności. Dr Joanna Banaś Zakład Badań Systemowych Instytut Sztucznej Inteligencji i Metod Matematycznych. Wykład 11
Testy zgodności Dr Joanna Banaś Zakład Badań Systemowych Instytut Sztucznej Inteligencji i Metod Matematycznych Wydział Informatyki Politechniki Szczecińskiej 27. Nieparametryczne testy zgodności Weryfikacja
Teoria ewolucji. Podstawowe pojęcia. Wspólne pochodzenie.
Teoria ewolucji Podstawowe pojęcia. Wspólne pochodzenie. Informacje Kontakt: Paweł Golik Instytut Genetyki i Biotechnologii, Pawińskiego 5A pgolik@igib.uw.edu.pl Informacje, materiały: http://www.igib.uw.edu.pl/
Zastosowanie symulacji Monte Carlo do zarządzania ryzykiem przedsięwzięcia z wykorzystaniem metod sieciowych PERT i CPM
SZKOŁA GŁÓWNA HANDLOWA w Warszawie STUDIUM MAGISTERSKIE Kierunek: Metody ilościowe w ekonomii i systemy informacyjne Karol Walędzik Nr albumu: 26353 Zastosowanie symulacji Monte Carlo do zarządzania ryzykiem
SYSTEMY UCZĄCE SIĘ WYKŁAD 10. PRZEKSZTAŁCANIE ATRYBUTÓW. Dr hab. inż. Grzegorz Dudek Wydział Elektryczny Politechnika Częstochowska.
SYSTEMY UCZĄCE SIĘ WYKŁAD 10. PRZEKSZTAŁCANIE ATRYBUTÓW Częstochowa 2014 Dr hab. inż. Grzegorz Dudek Wydział Elektryczny Politechnika Częstochowska INFORMACJE WSTĘPNE Hipotezy do uczenia się lub tworzenia
46 Olimpiada Biologiczna
46 Olimpiada Biologiczna Pracownia statystyczno-filogenetyczna Łukasz Banasiak i Jakub Baczyński 22 kwietnia 2017 r. Statystyka i filogenetyka / 30 Liczba punktów (wypełnia KGOB) PESEL Imię i nazwisko
Ewolucjonizm NEODARWINIZM. Dr Jacek Francikowski Uniwersyteckie Towarzystwo Naukowe Uniwersytet Śląski w Katowicach
Ewolucjonizm NEODARWINIZM Dr Jacek Francikowski Uniwersyteckie Towarzystwo Naukowe Uniwersytet Śląski w Katowicach Główne paradygmaty biologii Wspólne początki życia Komórka jako podstawowo jednostka funkcjonalna
Prowadzący. Doc. dr inż. Jakub Szymon SZPON. Projekt jest współfinansowany ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
EDUKACJA DLA BEZPIECZEŃSTWA studia podyplomowe dla czynnych zawodowo nauczycieli szkół gimnazjalnych i ponadgimnazjalnych Projekt jest współfinansowany ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego
ZALEŻNOŚĆ MIĘDZY WYSOKOŚCIĄ I MASĄ CIAŁA RODZICÓW I DZIECI W DWÓCH RÓŻNYCH ŚRODOWISKACH
S ł u p s k i e P r a c e B i o l o g i c z n e 1 2005 Władimir Bożiłow 1, Małgorzata Roślak 2, Henryk Stolarczyk 2 1 Akademia Medyczna, Bydgoszcz 2 Uniwersytet Łódzki, Łódź ZALEŻNOŚĆ MIĘDZY WYSOKOŚCIĄ
Weryfikacja hipotez statystycznych, parametryczne testy istotności w populacji
Weryfikacja hipotez statystycznych, parametryczne testy istotności w populacji Dr Joanna Banaś Zakład Badań Systemowych Instytut Sztucznej Inteligencji i Metod Matematycznych Wydział Informatyki Politechniki
operacje porównania, a jeśli jest to konieczne ze względu na złe uporządkowanie porównywanych liczb zmieniamy ich kolejność, czyli przestawiamy je.
Problem porządkowania zwanego również sortowaniem jest jednym z najważniejszych i najpopularniejszych zagadnień informatycznych. Dane: Liczba naturalna n i ciąg n liczb x 1, x 2,, x n. Wynik: Uporządkowanie
wersja elektroniczna - ibuk
Parteka A. (2015). Dywersyfikacja handlu zagranicznego a rozwój gospodarczy. Warszawa: Wydawnictwo Naukowe PWN. ISBN 978-83-01-18336-3 wersja elektroniczna - ibuk Opis Czy zróżnicowanie handlu ma znaczenie?
Metody doboru próby do badań. Dr Kalina Grzesiuk
Metody doboru próby do badań Dr Kalina Grzesiuk Proces doboru próby 1. Ustalenie populacji badanej 2. Ustalenie wykazu populacji badanej 3. Ustalenie liczebności próby 4. Wybór metody doboru próby do badań
Wykład ze statystyki. Maciej Wolny
Wykład ze statystyki Maciej Wolny T1: Zajęcia organizacyjne Agenda 1. Program wykładu 2. Cel zajęć 3. Nabyte umiejętności 4. Literatura 5. Warunki zaliczenia Program wykładu T1: Zajęcia organizacyjne T2:
Aproksymacja funkcji a regresja symboliczna
Aproksymacja funkcji a regresja symboliczna Problem aproksymacji funkcji polega na tym, że funkcję F(x), znaną lub określoną tablicą wartości, należy zastąpić inną funkcją, f(x), zwaną funkcją aproksymującą
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 6 ANALIZA FILOGENETYCZNA
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 6 ANALIZA FILOGENETYCZNA ANALIZA FILOGENETYCZNA 1. Wstęp - filogenetyka 2. Struktura drzewa filogenetycznego 3. Metody konstrukcji drzewa - przykłady 4. Etapy konstrukcji drzewa
P (A B) P (B) = 1/4 1/2 = 1 2. Zakładamy, że wszystkie układy dwójki dzieci: cc, cd, dc, dd są jednakowo prawdopodobne.
Wykład Prawdopodobieństwo warunkowe Dwukrotny rzut symetryczną monetą Ω {OO, OR, RO, RR}. Zdarzenia: Awypadną dwa orły, Bw pierwszym rzucie orzeł. P (A) 1 4, 1. Jeżeli już wykonaliśmy pierwszy rzut i wiemy,
Statystyka opisowa. Wykład I. Elementy statystyki opisowej
Statystyka opisowa. Wykład I. e-mail:e.kozlovski@pollub.pl Spis treści Elementy statystyku opisowej 1 Elementy statystyku opisowej 2 3 Elementy statystyku opisowej Definicja Statystyka jest to nauka o
Wykład 3 Hipotezy statystyczne
Wykład 3 Hipotezy statystyczne Hipotezą statystyczną nazywamy każde przypuszczenie dotyczące nieznanego rozkładu obserwowanej zmiennej losowej (cechy populacji generalnej) Hipoteza zerowa (H 0 ) jest hipoteza
Mitochondrialna Ewa;
Mitochondrialna Ewa; jej sprzymierzeńcy i wrogowie Lien Dybczyńska Zakład genetyki, Uniwersytet Warszawski 01.05.2004 Milion lat temu Ale co dalej??? I wtedy wkracza biologia molekularna Analiza różnic
Zagadnienia: wprowadzenie podstawowe pojęcia. Doświadczalnictwo. Anna Rajfura
Zagadnienia: wprowadzenie podstawowe pojęcia Doświadczalnictwo 1 Termin doświadczalnictwo Doświadczalnictwo planowanie doświadczeń oraz analiza danych doświadczalnych z użyciem metod statystycznych. Doświadczalnictwo
TESTOWANIE HIPOTEZ Przez hipotezę statystyczną rozumiemy, najogólniej mówiąc, pewną wypowiedź na temat rozkładu interesującej nas cechy.
TESTOWANIE HIPOTEZ Przez hipotezę statystyczną rozumiemy, najogólniej mówiąc, pewną wypowiedź na temat rozkładu interesującej nas cechy. Hipotezy dzielimy na parametryczne i nieparametryczne. Zajmiemy
Algorytm genetyczny (genetic algorithm)-
Optymalizacja W praktyce inżynierskiej często zachodzi potrzeba znalezienia parametrów, dla których system/urządzenie będzie działać w sposób optymalny. Klasyczne podejście do optymalizacji: sformułowanie
Systemy uczące się Lab 4
Systemy uczące się Lab 4 dr Przemysław Juszczuk Katedra Inżynierii Wiedzy, Uniwersytet Ekonomiczny 26 X 2018 Projekt zaliczeniowy Podstawą zaliczenia ćwiczeń jest indywidualne wykonanie projektu uwzględniającego
Mechanizmy ewolucji. SYLABUS A. Informacje ogólne
Mechanizmy ewolucji A. Informacje ogólne Elementy sylabusu Nazwa jednostki prowadzącej kierunek Nazwa kierunku studiów Poziom kształcenia Profil studiów Forma studiów Język Rodzaj Rok studiów /semestr
Ekologia wyk. 1. wiedza z zakresu zarówno matematyki, biologii, fizyki, chemii, rozumienia modeli matematycznych
Ekologia wyk. 1 wiedza z zakresu zarówno matematyki, biologii, fizyki, chemii, rozumienia modeli matematycznych Ochrona środowiska Ekologia jako dziedzina nauki jest nauką o zależnościach decydujących
Nowe narzędzia zarządzania jakością
Nowe narzędzia zarządzania jakością Agnieszka Michalak 106947 Piotr Michalak 106928 Filip Najdek 106946 Co to jest? Nowe narzędzia jakości - grupa siedmiu nowych narzędzi zarządzania jakością, które mają
STATYSTYKA I DOŚWIADCZALNICTWO Wykład 4
STATYSTYKA I DOŚWIADCZALNICTWO Wykład 4 Inne układy doświadczalne 1) Układ losowanych bloków Stosujemy, gdy podejrzewamy, że może występować systematyczna zmienność między powtórzeniami np. - zmienność
Analiza wariancji - ANOVA
Analiza wariancji - ANOVA Analiza wariancji jest metodą pozwalającą na podział zmienności zaobserwowanej wśród wyników eksperymentalnych na oddzielne części. Każdą z tych części możemy przypisać oddzielnemu
Statystyka matematyczna dla leśników
Statystyka matematyczna dla leśników Wydział Leśny Kierunek leśnictwo Studia Stacjonarne I Stopnia Rok akademicki 03/04 Wykład 5 Testy statystyczne Ogólne zasady testowania hipotez statystycznych, rodzaje
Statystyka w pracy badawczej nauczyciela Wykład 4: Analiza współzależności. dr inż. Walery Susłow walery.suslow@ie.tu.koszalin.pl
Statystyka w pracy badawczej nauczyciela Wykład 4: Analiza współzależności dr inż. Walery Susłow walery.suslow@ie.tu.koszalin.pl Statystyczna teoria korelacji i regresji (1) Jest to dział statystyki zajmujący
SYSTEMY UCZĄCE SIĘ WYKŁAD 4. DRZEWA REGRESYJNE, INDUKCJA REGUŁ. Dr hab. inż. Grzegorz Dudek Wydział Elektryczny Politechnika Częstochowska
SYSTEMY UCZĄCE SIĘ WYKŁAD 4. DRZEWA REGRESYJNE, INDUKCJA REGUŁ Częstochowa 2014 Dr hab. inż. Grzegorz Dudek Wydział Elektryczny Politechnika Częstochowska DRZEWO REGRESYJNE Sposób konstrukcji i przycinania
WYNIKI ANKIETY PRZEPROWADZONEJ WŚRÓD UCZESTNIKÓW WARSZTATÓW W DNIACH
WYNIKI ANKIETY PRZEPROWADZONEJ WŚRÓD UCZESTNIKÓW WARSZTATÓW W DNIACH 21-23.02.2017 TYTUŁ ANKIETY: Ankietę Poglądy na temat istoty nauki przeprowadzono wśród uczestników warsztatów Natura nauki i jej powiązania
Metody symulacji komputerowych Modelowanie systemów technicznych
Metody symulacji komputerowych Modelowanie systemów technicznych dr inż. Ryszard Myhan Katedra Inżynierii Procesów Rolniczych Program przedmiotu Lp. Temat Zakres 1. Wprowadzenie do teorii systemów Definicje
Sposoby prezentacji problemów w statystyce
S t r o n a 1 Dr Anna Rybak Instytut Informatyki Uniwersytet w Białymstoku Sposoby prezentacji problemów w statystyce Wprowadzenie W artykule zostaną zaprezentowane podstawowe zagadnienia z zakresu statystyki
TEORIA wiązań Magdalena Pawłowska Gr. 10B2
TEORIA wiązań Magdalena Pawłowska Gr. 10B2 Techniki kombinatoryczne rozróżniania węzłów i splotów ØLiczba skrzyżowań, ØLiczba mostów, ØKolorowanie, ØIndeks zaczepienia, ØSzkic elementów arytmetyki węzłów.
KLASYFIKACJA NACZELNYCH
KLASYFIKACJA NACZELNYCH Rząd: Primates (Naczelne) Podrząd: Prosimii (Małpiatki) Zespół: Lemuriformes (Lemurokształtne) Zespół: Tarsiiformes (Wyrakokształtne) Podrząd: Anthropoidea (Małpy właściwe) Infrarząd:
Wszystkie wyniki w postaci ułamków należy podawać z dokładnością do czterech miejsc po przecinku!
Pracownia statystyczno-filogenetyczna Liczba punktów (wypełnia KGOB) / 30 PESEL Imię i nazwisko Grupa Nr Czas: 90 min. Łączna liczba punktów do zdobycia: 30 Czerwona Niebieska Zielona Żółta Zaznacz znakiem
plezjomorfie: podobieństwa dziedziczone po dalszych przodkach (c. atawistyczna)
Podobieństwa pomiędzy organizmami - cechy homologiczne: podobieństwa wynikające z dziedziczenia - apomorfie: podobieństwa dziedziczone po najbliższym przodku lub pojawiająca się de novo (c. ewolucyjnie
1 Wprowadzenie do algorytmiki
Teoretyczne podstawy informatyki - ćwiczenia: Prowadzący: dr inż. Dariusz W Brzeziński 1 Wprowadzenie do algorytmiki 1.1 Algorytm 1. Skończony, uporządkowany ciąg precyzyjnie i zrozumiale opisanych czynności
Regresja logistyczna (LOGISTIC)
Zmienna zależna: Wybór opcji zachodniej w polityce zagranicznej (kodowana jako tak, 0 nie) Zmienne niezależne: wiedza o Unii Europejskiej (WIEDZA), zamieszkiwanie w regionie zachodnim (ZACH) lub wschodnim
4.3 Grupowanie według podobieństwa
4.3 Grupowanie według podobieństwa Przykłady obiektów to coś więcej niż wektory wartości atrybutów. Reprezentują one poszczególne rasy psów. Ważnym pytaniem, jakie można sobie zadać, jest to jak dobrymi
w analizie wyników badań eksperymentalnych, w problemach modelowania zjawisk fizycznych, w analizie obserwacji statystycznych.
Aproksymacja funkcji a regresja symboliczna Problem aproksymacji funkcji polega na tym, że funkcję F(), znaną lub określoną tablicą wartości, należy zastąpić inną funkcją, f(), zwaną funkcją aproksymującą
Analiza współzależności zjawisk. dr Marta Kuc-Czarnecka
Analiza współzależności zjawisk dr Marta Kuc-Czarnecka Wprowadzenie Prawidłowości statystyczne mają swoje przyczyny, w związku z tym dla poznania całokształtu badanego zjawiska potrzebna jest analiza z
Streszczenie pracy doktorskiej Autor: mgr Wojciech Wojaczek Tytuł: Czynniki poznawcze a kryteria oceny przedsiębiorczych szans Wstęp W ciągu
Streszczenie pracy doktorskiej Autor: mgr Wojciech Wojaczek Tytuł: Czynniki poznawcze a kryteria oceny przedsiębiorczych szans Wstęp W ciągu ostatnich kilku dekad diametralnie zmienił się charakter prowadzonej
Podstawowe pojęcia statystyczne
Podstawowe pojęcia statystyczne Istnieją trzy rodzaje kłamstwa: przepowiadanie pogody, statystyka i komunikat dyplomatyczny Jean Rigaux Co to jest statystyka? Nauka o metodach ilościowych badania zjawisk