Wstęp. Key words: cisplatin, gene expression, drug resistance, promyelocytic leukemia cells, HL-60
|
|
- Beata Pluta
- 8 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Streszczenie Efekt terapeutyczny cisplatyny jest wynikiem wytworzenia inter- i intramolekularnych wiązań z DNA i najczęściej prowadzi do śmierci komórki nowotworowej w drodze apoptozy. Jednocześnie koordynacja cisplatyny do DNA uaktywnia szereg mechanizmów prowadzących do powstawania oporności takich jak: zmniejszenie transportu leku do komórki, usuwanie z komórki, sekwestracja z udziałem glutationu i metalotionein, naprawa DNA, hamowanie apoptozy. Stosując technikę mikromacierzy oligonukleotydowych (Affymetrix) porównano ekspresję genów związanych z procesami odpowiedzialnymi za powstawanie oporności na lek w komórkach białaczki promielocytarnej HL-60 eksponowanych na cisplatynę oraz w komórkach kontrolnych. Analizując sygnały fluorescencji 770 sond, wyselekcjonowanych z bazy NetAffx Analysis Center, reprezentujących ekspresję 412 genów, wykazano najsilniejszy wzrost ekspresji genów TOP2A, TOP1, KRAS, BIK, BAX, TFAM, GTSE1, CASP6 oraz zmniejszenie ekspresji genów SLC7A11, CD70, MTF1, ABCC3. Poznanie efektów zmienionej ekspresji tych genów jest istotne zwłaszcza dla projektowania nowych pochodnych platyny charakteryzujących się zwiększoną skutecznością, które ponadto nie będą wywoływały narastania oporności na lek. Abstract Therapeutic effect of cisplatin results from formation of inter- and intrastrand DNA crosslinks and usually leads to death of tumour cells through apoptosis. At the same time its incorporation and binding to DNA activate mechanisms which cause resistance to the drug, such as decreased uptake, removal from the cell, sequestration by glutathione and metallothionein, DNA repair, and inhibition of apoptosis. Using oligonucleotide microarray technique (Affymetrix) the expression of genes involved in development of drug resistance in promyelocytic leukemia HL-60 cells exposed to cisplatin and control cells was compared. Analysis of the fluorescence signals of 770 probes, which represented 412 genes selected from the NetAffx Analysis Center database showed highest expression increase of TOP2A, TOP1, KRAS, BIK, BAX, TFAM, GTSE1, CASP6, and inhibition of SLC7A11, CD70, MTF1, ABCC3. Elucidation of these genes altered expression effects seems to be important, particularly in synthesis of new cisplatin analogs, which besides increased efficiency, overcome drug resistance. Key words: cisplatin, gene expression, drug resistance, promyelocytic leukemia cells, HL-60 Słowa kluczowe: cisplatyna, ekspresja genów, oporność na lek, komórki białaczki promielocytarnej, HL-60 Wstęp Efekt terapeutyczny cisplatyny, powszechnie stosowanego leku przeciwnowotworowego, jest wynikiem wytworzenia inter- i intramolekularnych wiązań z DNA. Mechanizm działania cisplatyny polega przede wszystkim na jej aktywacji wewnątrz komórki poprzez zastąpienie dwóch atomów chloru grupami hydroksylowymi, co w konsekwencji umożliwia wiązanie do DNA i tworzenie adduktów [1], które powodują lokalne zaburzenie struktury podwójnej helisy i blokowanie procesów replikacji i transkrypcji, co w konsekwencji prowadzi do zaburzeń w szlakach sygnałowych kontrolujących wzrost, różnicowanie czy odpowiedź na stres oksydacyjny wywoływany przez ten lek [2]. Addukty cisplatyny z DNA są rozpoznawane przez szereg białek komórkowych związanych, np. z szlakami na-
2 prawy DNA, co najczęściej prowadzi do śmierci komórki w drodze apoptozy [3]. Z drugiej strony wiązanie cisplatyny do DNA uaktywnia cały szereg mechanizmów prowadzących do powstawania oporności i braku wrażliwości na ten lek. Za oporność na cisplatynę odpowiedzialny jest przede wszystkim niewystarczający transport do komórki [4]. Istnieją doniesienia o udziale w usuwaniu cisplatyny z komórki zależnych od ATP białek MDR1, MRP1, MRP2, MRP3, jednakże późniejsze prace przypisują funkcję usuwania tego leku przede wszystkim białkom związanym z transportem miedzi, ATP-azom ATP7A oraz ATP7B [5]. Również nadekspresja glutationu oraz niektórych białek zawierających grupy tiolowe, jak metalotioneina, powoduje oporność na cisplatynę [6]. Wiązanie glutationu i cisplatyny jest katalizowane przez transferazy S-glutationowe, które zwiększając właściwości anionowe związku, zwiększają jego usuwanie z komórki poprzez zależną od ATP pompę S-koniugatów glutationu [7]. Oprócz niewystarczającej akumulacji cisplatyny wewnątrz komórek, główną przyczyną braku wrażliwości nowotworu na ten lek są procesy związane z możliwością naprawy DNA oraz usuwaniem adduktów cisplatyna-dna [8]. W odróżnieniu od niewrażliwych komórek wielu guzów wykazujących wzrost zdolności naprawczych polekowych uszkodzeń DNA, znaczna wrażliwość komórek, np. raka jądra, wynika z upośledzenia ich zdolności do naprawy DNA. Podstawowymi mechanizmami usuwającymi spowodowane przez cisplatynę uszkodzenia DNA są: naprawa przez wycinanie nukleotydów (NER), naprawa przez wycinanie zasad (BER), naprawa źle sparowanych zasad (MMR) i naprawa pęknięć DNA. Zwiększona tolerancja na wywołane przez cisplatynę uszkodzenia DNA może także wystąpić na skutek utraty funkcji szlaku MMR. Pochodna cisplatyny, Eloxatin nie wywołuje powstawania oporności, gdyż mechanizm jej akumulacji nie zależy w tak znacznym stopniu od transportera miedzi CTR1 [9]. Ponadto połączenia tego leku z DNA nie są rozpoznawane przez białka MMR, podczas gdy addukty cisplatyna - DNA są rozpoznawane przez białka MSH2, MSH3 i MSH6. Gdy komórki podlegają kolejnym bezskutecznym cyklom naprawy DNA, poziom uszkodzeń pozostaje wystarczający do uruchomienia mechanizmów apoptozy. Kolejny z mechanizmów oporności związany jest z omijaniem podczas replikacji przez polimerazy DNA i η miejsc w DNA, do których przyłączona jest cisplatyna [10]. Tolerancja na cisplatynę może również być wynikiem zmniejszonej ekspresji, albo utraty szlaków apoptozy, zarówno wewnętrznego jak i zewnętrznego, na skutek zmienionej aktywności białek takich jak P53, anty- i proapoptotycznych białek rodziny BCL2 oraz JNK [11]. W przedstawianej pracy, w celu pełniejszego wyjaśnienia mechanizmów molekularnych decydujących o wrażliwości komórek nowotworowych na cisplatynę, poddaliśmy ocenie zmiany profilu ekspresji genów kodujących białka uczestniczące w transporcie wielolekowym, syntezie glutationu i metalotionein, naprawie DNA oraz zmniejszaniu aktywacji i hamowaniu indukcji szlaków apoptozy pod wpływem tego leku. Do badań wykorzystaliśmy hodowane w warunkach laboratoryjnych komórki ludzkiej linii nowotworowej białaczki promielocytarnej HL-60. Do analizy ekspresji genów zastosowano technikę mikromacierzy oligonukleotydowych HG-U133A (Affymetrix). Materiał i metody Hodowle komórkowe Materiał do badań stanowiły hodowane komórki ludzkiej linii nowotworowej białaczki promielocytarnej HL-60. Komórki hodowano, zgodnie z zaleceniami ATCC, w standardowych warunkach (w temperaturze 37 C, w atmosferze 5% CO 2 ), w pożywce hodowlanej RPMI-1640 (Gibco) z dodatkiem 10% bydlęcej surowicy płodowej (FBS; Sigma), 100 g /ml streptomycyny, 100 U/ml penicyliny (Sigma), 2 mm glutaminy (Sigma), 1 mm pirogronianu sodu (Sigma) i 4,5 g/l glukozy. Po 48 godzinach inkubacji do hodowli dodawano roztwór cisplatyny (Sigma) rozpuszczonej w DMSO (Sigma) tak, aby uzyskać stężenie 0,22 g/ml, odpowiadające wartości ID30 (Inhibitory Dose 30%). Hodowle kontrolne prowadzono w identyczny sposób, dodając po 48 godzinach czysty DMSO, stosowany ze względu na ograniczoną rozpuszczalność cisplatyny. Po sześcio godzinnej inkubacji komórki zbierano i przygotowywano do ekstrakcji RNA. Ekstrakcja całkowitego RNA RNA ekstrahowano z użyciem odczynnika TRIZOL (Invitrogen Life Technologies), zgodnie z protokołem producenta. Ekstrakty całkowitego RNA oczyszczono z wykorzystaniem zestawu RNeasy Mini Kit (Qiagen). Ekstrakty RNA oceniano jakościowo techniką elektroforezy w 1% żelu agarozowym barwionym bromkiem etydyny oraz ilościowo przy użyciu spektrofotometru GeneQuant II (Pharmacia Biotech). Analiza aktywności transkrypcyjnej genów techniką mikromacierzy oligonukleotydowych Całkowite RNA (8 g) zostało wykorzystane do syntezy dwuniciowego cdna (Gibco BRL SuperScript Choice system), które stanowiło matrycę do syntezy biotynylowanego crna (reakcja transkrypcji in vitro, Enzo kit). Po fragmentacji biotynylowanego crna przeprowadzono hybrydyzację z mikromacierzą Test3, a następnie po pozytywnej weryfikacji z mikromacierzą HG-U133A (Affymetrix). Znakowanie produktów hybrydyzacji przeprowadzono kilkustopniowo kompleksem streptawidyna fikoerytryna, znakowanymi przeciwciałami przeciw biotynie oraz przeciwciałami przeciw kompleksowi streptawidyna fikoerytryna zgodnie z protokołem EukGEWS2v4 zalecanym dla mikromacierzy oligonukleotydowej HG U133A w przewodniku Gene Expression Analysis Technical Manual (Affymetrix). Następnie płytki mikromacierzy odczytywano używając skanera Agilent GeneArray Scanner G2500A (Agilent Technologies). Otrzymane wyniki intensywności fluorescencji zapisano i zarchiwizowano w programie Microarray Suite oraz specjalnie do tego celu przygotowanej bazie danych. Analizę porównawczą transkryptomów przeprowadzono po normalizacji wyników w programie RMA Express polegającej na przekształceniu logarytmicznym wartości sygnału fluorescencji dla każdego transkryptu (log 2 ) wykorzystując programy komputerowe: Statistica v.7,0, Gnumeric, oraz Microsoft Excel. Wyodrębnienia grup genów związanych
3 z powstawaniem oporności na lek dokonano korzystając z bazy danych Affymetrix NetAffx Analysis Center ( analysis/index.affx) po wpisaniu kwerend: drug resistance, cisplatin resistance, drug transport, glutathione, metallothionein, SLC, MDR, DNA repair oraz anti-apoptosis. Sumaryczny zbiór 770 sond stanowił podstawę do poszukiwania genów różnicujących. Z grupy sond mrna, obecnych na mikromacierzy HG-U133A, wyfiltrowano za pomocą arkusza programu Gnumeric sygnały fluorescencji charakteryzujące ekspresję wybranych transkryptów związanych z powstawaniem oporności na cisplatynę. Porównując sygnały fluorescencji sond zarejestrowane dla komórek kontrolnych oraz komórek eksponowanych na cisplatynę, wyznaczono zbiory, tzw. genów różnicujących o ekspresji różniącej się, co najmniej, ± 2SLR. Wyniki Analizę profilu ekspresji genów, kodujących białka związane powstawaniem w komórkach HL-60 oporności na cisplatynę, poprzedzono porównaniem raportów wygenerowanych w programie Microarray Suite Affymetrix bezpośrednio po odczycie sygnałów fluorescencji na mikromacierzy. Prawidłowy rozkład znormalizowanych sygnałów fluorescencji (RMA Express) był podstawą do zakwalifikowania mikromacierzy do dalszych analiz. Za pomocą programu Gnumeric, z grupy mrna obecnych na mikromacierzy HGU133A, wyselekcjonowano sygnały fluorescencji 770 transkryptów związanych z powstawaniem oporności. Wyznaczono parametr SLR (signal log ratio) wskazujący wielokrotność różnicy sygnału fluorescencji, wyodrębniono zbiór genów różnicujących transkryptomy komórek HL-60 kontrolnych oraz eksponowanych na cisplatynę. Wykonane analizy pozwoliły na stwierdzenie, że w komórkach HL-60 eksponowanych na cisplatynę w porównaniu do komórek kontrolnych w największym stopniu stymulowana jest ekspresja genów TOP2A, TOP1, KRAS, BIK, BAX, TFAM, GTSE1, CASP6, AP1S1 i BNIP3L. Genami, których ekspresja została najbardziej zahamowana, okazały się SLC7A11, CD70, MTF1, ABCC3, FAS oraz SLC2A3. Szczegółowe dane uwzględniające nazwy sond, symbole genów, nazwy kodowanych białek, oraz wartości SLR dla transkryptów różnicujących zestawiono w tabeli I. Geny te pełnią bardzo istotne funkcje w procesach powstawania oporności na lek. Dyskusja Zjawisko wytwarzania przez komórki nowotworowe różnych mechanizmów obronnych stanowi jeden z głównych problemów we współczesnej terapii przeciwnowotworowej. Oporność nowotworów niewrażliwych na cisplatynę wynika najczęściej z niewystarczającej akumulacji tego leku w komórce [12, 13]. Cisplatyna jest związkiem o znacznej polarności, co powoduje, że przenika do komórek znacznie wolniej niż większość niskocząsteczkowych leków przeciwnowotworowych. Wchłanianie cisplatyny zależy od stężenia jonów sodu i potasu, ph oraz obecności czynników redukujących. Oprócz dyfuzji biernej, transport cisplatyny do wnętrza komórki zachodzi z udziałem białek transportujących, kanałów jonowych oraz przezbłonowego transportera miedzi CTR1. Zarówno miedź jak i cisplatyna, w zakresie stężeń występujących fizjologicznie w organizmie oraz podczas terapii, powodują obniżenie poziomu CTR1 poprzez makropinocytozę i degradację z udziałem proteasomów [5]. Kolejną przyczyną powstawania oporności komórek nowotworowych jest zmieniony transport leków przeciwnowotworowych przez MDR-1, nadrodzinę białek transportujących zależnych od ATP, oraz inne białka oporności wielolekowej [12]. W przedstawianej pracy zaobserwowano obniżony poziom ekspresji ABCC3. Gen ten koduje białko ABCC3 - kanalikularne białko 2 związane z opornością wielolekową (canalicular multispecific organic anion transporter 2; MRP3) należące do nadrodziny błonowych białek transportowych zależnych od ATP. Białka te charakteryzują się znacznym polimorfizmem i powszechnie występują w komórkach nowotworowych [14]. Innym genem, którego ekspresja w komórkach HL-60 pod wpływem cisplatyny uległa obniżeniu, jest SLC2A3 kodujący błonowe białka rodziny SLC2A, które są odpowiedzialne za transport związków polarnych [15]. Chociaż udział tego przenośnika w transporcie cisplatyny do komórek nie został dotychczas opisany, nie można wykluczyć, że zaobserwowana w naszych eksperymentach zmniejszona ekspresja tego genu jest wynikiem odpowiedzi komórki mającej na celu obniżenie stężenia cisplatyny w cytoplazmie. Przyczyną oporności na cisplatynę jest również podwyższone stężenie w cytoplazmie związków zawierających grupę tiolową, takich jak glutation czy metalotioneiny, które unieczynniają cisplatynę na skutek wiązania platyny i siarki [6, 13]. Zwiększone stężenie metalotionein w komórkach mysich powoduje 4-krotne, a w ludzkich komórkach raka jajnika 7-krotne zwiększenie oporności na cisplatynę. Komórki raka jajnika wykazują ujemną korelację poziomu glutationu oraz wrażliwości na cisplatynę. Badania dwóch linii komórek raka jajnika, wywodzących się od tego samego pacjenta, wyizolowanych przed terapią i po zastosowaniu cisplatyny wykazały 2,9 krotny wzrost aktywności transferaz glutationowych, które katalizują sprzęganie glutationu z cisplatyną [16]. Ponadto, udowodniono, że wytworzone addukty cisplatyna-glutation są usuwane z komórki poprzez zależną od ATP pompę S-koniugatów glutationu. Już w 1994 roku Ishikawa i wsp. wykazali, że oporności białaczki promielocytarnej HL-60 towarzyszy zwiększona ekspresja zależnej od ATP pompy S-koniugatów glutationu (MRP1 lub MRP2) [7]. W cytoplazmie, glutation przyłącza się do cisplatyny, a w jądrze do adduktów cisplatyny z DNA, uniemożliwiając w ten sposób utworzenie potencjalnie cytotoksycznych wiązań krzyżowych w DNA [17]. Rezultaty naszych eksperymentów pokazują, że w komórkach HL-60 eksponowanych na cisplatynę ulega obniżeniu ekspresja genu SLC7A11, kodującego specyficzne białko transportowe cystyna/glutaminian uczestniczące w transporcie anionowej formy cystyny do komórek. Ponieważ bardzo niska ekspresja tego białka na powierzchni niektórych komórek (m.in. limfocytów) przy obniżonej dostępności cysteiny skutkuje spowolnieniem syntezy glutationu, można się spodziewać, że obniżenie ekspresji SLC7A11, świadczy o braku pierwotnej oporności związanej z nadmierną syntezą glutationu w badanych komórkach [18]. Udział metalotionein w de-
4 Nazwa sondy Symbol genu Nazwa kodowanego białka toksykacji cisplatyny udokumentowany został już w latach 90-tych poprzedniego stulecia. Komórki narażone na działanie metali ciężkich natychmiast po ekspozycji rozpoczynają syntetyzować metalotioneiny. Wzrost ekspresji MTF1 poprzedza syntezę metalotionein. MTF1 (metal regulatory transcription factor 1) koduje czynnik transkrypcyjny, który indukuje ekspresję genów metalotionein oraz innych genów uczestniczących w homeostazie metali takich jak kadm, cynk, miedź i srebro. MTF1 jest transportującym białkiem jądrowo-cytoplazmatycznym, które gromadzi się w jądrze na skutek ekspozycji na metale ciężkie i wiąże się do promotorów zawierających element odpowiedzi na metale (MRE) [12,13]. W przedstawianej pracy zaobserwowano obniżony poziom ekspresji MTF1 w komórkach HL-60 po ekspozycji na cisplatynę. Obniżonemu poziomowi ekspresji MTF1 towarzyszył wzrost ekspresji szeregu genów odpowiedzialnych za syntezę metalotionein, jednak niewystarczający, aby zaklasyfikować te geny jako różnicujące. Ekspozycja komórek HL-60 na cisplatynę spowodowała wzrost ekspresji genu AP1S1 kodującego białko - podjednostkę kompleksu sigma 1A, stanowiące część kompleksu płaszcza klatryny okrywającego pęcherzyki transportujące, np. w procesie Tab. I. Ekspresja genów różnicujących związanych z regulacją i powstawaniem oporności na lek w komórkach białaczki promielocytarnej HL-60 eksponowanych na cisplatynę względem prób odniesienia (komórki eksponowane na DMSO), (SLR ang. signal log ratio stosunek zlogarytmowanych uśrednionych wartości fluorescencji transkryptu w porównywanych próbach, strzałka - nadekspresja, strzałka - spadek ekspresji genu w komórkach HL-60 eksponowanych na cisplatynę) Wartość SLR _s_at TOP2A topoizomeraza (DNA) II alfa (topoisomerase (DNA) II alpha) 2, _s_at TOP1 topoizomeraza (DNA) I (topoisomerase (DNA) I) 1, _s_at KRAS (v-ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog) 1, _at BIK BIK (BCL2-interacting killer) 1, _s_at BAX białko związane z BCL2 (BCL2-associated X protein) 1, _s_at TFAM mitochondrialny czynnik transkrypcyjny A (transcription factor A, mitochondrial) 1, _s_at GTSE1 białko 1 ulegające ekspresji w fazach G2 i S (G2 and S-phase expressed 1 protein) 1, _s_at CASP6 kaspaza 6 (caspase 6, apoptosis-related cysteine peptidase) 1, _s_at BAX białko związane z BCL2 (BCL2-associated X protein) 1, _at AP1S1 adaptor-related protein complex 1, sigma 1 subunit 1, _x_at TFAM mitochondrialny czynnik transkrypcyjny A (transcription factor A, mitochondrial) 1, _s_at BNIP3L BCL2/adenovirus E1B 19 kda protein-interacting protein 3-like 1, _s_at SLC2A3 transporter wielolekowy SLC2 (solute carrier family 2) -1, _s_at FAS Fas (TNF receptor superfamily, member 6) -1, _s_at ABCC3 ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 3-1, _s_at MTF1 metal-regulatory transcription factor 1-1, _at SLC7A11 transporter wielolekowy SLC7 (solute carrier family 7) -1, _at CD70 (CD70 molecule) -1, _at SLC7A11 transporter wielolekowy SLC7 (solute carrier family 7) -2,28 endocytozy oraz w aparacie Golgiego. Zwiększona ekspresja tego genu jest zapewne związana z dążeniem komórki do sekwestracji cisplatyny, do struktur pęcherzykowych, nie mających bezpośredniego kontaktu z DNA, a następnie jej wydalenia. Białko to pełni także funkcję czynnika transkrypcyjnego [19]. Powszechnie znanym jest fakt, że indukcja apoptozy jest wynikiem przekroczenia w komórce pewnego poziomu uszkodzeń. Gdy dochodzi do modyfikacji DNA, które nie mogą być usunięte przez system naprawy DNA, następuje indukcja apoptozy, która jest wynikiem obniżenia ekspresji genu BCL-2 kodującego białko antyapoptotyczne oraz stymulacji ekspresji genu BAX oraz białek BAK, BIK, P53, przy czym w tym samym czasie uaktywnione zostają mechanizmy antyapoptotyczne. Zaburzenia mechanizmów prowadzące do hamowania procesu apoptozy są jedną z głównych przyczyn powstawania oporności [9]. Wyniki wykonanych przez nas pomiarów pokazują wzrost ekspresji BAX, oraz innych genów kodujących białka z rodziny BCL-2 takich jak BIK i BNIP3L w badanych komórkach HL-60 eksponowanych na ciplatynę. W badaniach wykonanych przez Floros i wsp. [20] dotyczących apoptozy indukowanej przez cisplatynę w komórkach HL-60, stwierdzono wzrost ilości komórek ulegających apoptozie korelujący z czasem ekspozycji na ten lek. W pierwszych godzinach ekspozycji (3 i 6 godzin) następował wzrost ekspresji BCL-2L12, a po 12 godzinach ciągłego traktowania komórek tym lekiem zaobserwowano zmniejszenie ekspresji tego genu. Obserwacje te wskazują na obronną, antyapoptotyczną reakcję komórek w pierwszych godzinach ekspozycji i potwierdzają mechanizm śmierci komórek HL-60 eksponowanych na cisplatynę w drodze apoptozy [20]. Alternatywną drogą indukowania apoptozy przez białka z rodziny BCL-2 jest ich interakcja z czynnikiem Apaf 1 (apoptic protease activating factor 1) oraz z cytochromem C i kaspazą 9, co prowadzi do aktywacji innych kaspaz. Również interakcja białek BID i BIK z białkami BCL-2 i BCL-XL prowadzi do kaskadowej aktywacji kaspaz i apoptozy [21]. Wzrost aktywności genu
5 kaspazy 6 (CASP6) zaobserwowano w komórkach HL-60 eksponowanych na cisplatynę. Ponadto, wykazano wzrost ekspresji genu GTSE1, który uczestniczy w syntezie G2 i S enzymatycznego białka 1, ulegającego ekspresji w fazach S oraz G2 cyklu komórkowego. Białko to, w odpowiedzi na uszkodzenie DNA gromadzi się w jądrze i wiąże białko P53, powodując jego przemieszczenie z jądra i hamując jego zdolność do indukowania apoptozy. Nagromadzenie się białka GTSE1, głównie w pobliżu mikrotubuli, powoduje opóźnienie przejścia komórki z fazy G2 do M [22]. Przyczyną wytwarzania oporności komórek nowotworowych na lek są mechanizmy związane z naprawą polekowych uszkodzeń DNA. Naprawa DNA prowadzi do usunięcia adduktów z cisplatyną. Spośród wielu mechanizmów naprawy DNA tylko naprawa przez wycinanie nukleotydów (NER) odgrywa znaczącą rolę w powstawaniu oporności na cisplatynę. Chociaż w procesie tym bierze udział ponad 30 rodzajów cząsteczek, jest on limitowany przez białka ERCC1 oraz XP [9]. Rezultaty przeprowadzonych eksperymentów pokazują wzrost ekspresji genów TOP2A (DNA topoizomeraza II alfa) i TOP1 (DNA topoizomeraza I) w komórkach HL-60 na skutek działania cisplatyny. TOP2A koduje zlokalizowany w jądrze enzym topoizomerazę DNA, który dodając superskręty do cząsteczki DNA, kontroluje i zmienia stany topologiczne DNA podczas transkrypcji. Zmiany aktywności tego genu pod wpływem różnych związków przeciwnowotworowych obserwowane są w komórkach wielu nowotworów, w tym również białaczki promielocytarnej HL-60, a jego amplifikacja bądź delecja może być czynnikiem predykcyjnym w terapii przeciwnowotworowej. TOP1 koduje białko uczestniczące w procesie transkrypcji odpowiadające za usuwanie (relaksację) superskrętów z cząsteczki DNA [23]. W opisywanym eksperymencie zaobserwowano wzrost ekspresji genu TFAM (mitochondrialny czynnik transkrypcyjny A), który pełni, podobnie tak jak histony w jądrowym DNA, rolę ochronną względem mtdna. Replikacja w mitochondriach przebiega niezależnie i częściej od podziałów komórkowych, co sprawia, że mtdna jest dużo bardziej narażony na czynniki uszkadzające i mutagenne, np. reaktywne formy tlenu (RFT), niż DNA jądrowy [24]. Dotychczasowe badania na komórkach różnych linii nowotworowych w znacznym stopniu wyjaśniają molekularne mechanizmy powstawania oporności na chemioterapię i mogą przyczynić się do opracowywania skutecznego postępowania klinicznego. Ponadto, rezultaty tych badań mogą być wykorzystywane przez laboratoria badawcze podczas tworzenia nowych pochodnych platyny o zwiększonej skuteczności i obniżonej toksyczności, które ponadto nie będą wywoływały narastania oporności. W przedstawionej pracy opisano wyniki badań wczesnych zmian w ekspresji genów spowodowanych przez cisplatynę dodaną do hodowli komórek HL-60 w fazie eksponencjalnego wzrostu. Oczywistym jest fakt, że efekt działania substancji wykazującej cytotoksyczność zależy zarówno od stężenia jak i czasu ekspozycji. Gdy komórki białaczki promielocytarnej HL-60 hodowane są w kolejnych pasażach w obecności cisplatyny w odpowiednio dobranych, często wzrastających stężeniach, dochodzi w nich do powstania utrwalonej oporności na ten lek. Sytuacja ta w pewnym stopniu nawiązuje do powstawania oporności u pacjentów poddawanych chemioterapii w kolejnych jej cyklach. Przedstawione przez nas wyniki sugerują, że zmienione sygnały ekspresji analizowanych genów, już po pierwszej ekspozycji komórek nowotworowych na lek, mogą być brane pod uwagę w przewidywaniu powstawania oporności. Wnioski 1. Cisplatyna powoduje w komórkach białaczki promielocytarnej HL-60 zmiany w ekspresji genów związanych z opornością na lek. 2. Powstawanie oporności na cisplatynę w komórkach białaczki promielocytarnej HL-60 zależy od poziomu ekspresji genów związanych z transportem i usuwaniem leku oraz naprawą DNA. 3. Poznanie mechanizmów molekularmych powstawania oporności komórek nowotworowych na cisplatynę może być podstawą opracowywania skutecznego postępowania klinicznego. Piśmiennictwo 1. Siddik ZH. Cisplatin: mode of cytotoxic action and molecular basis of resistance. Oncogene 2003; 22: Mandic A i wsp. Cisplatin induces endoplasmic reticulum stress and nucleus-independent apoptotic signaling. J Biol Chem 2003; 278: Chaney SG i wsp. Protein interactions with platinum DNA adducts: from structure to function. J Inorg Biochem 2004; 98: Perez RP. Cellular and molecular determinants of cisplatin resistance. Eur J Cancer 1998; 34: Holzer AK, Manorek GH, Howell SB. Contribution of the major copper influx transporter CTR1 to the cellular accumulation of cisplatin, carboplatin and oxaliplatin. Molec Pharmacol 2006; 70: Fokkema E i wsp. JM216-, JM118-, and cisplatininduced cytotoxicity in relation to platinum-dna adduct formation, glutathione levels and p53 status in human tumor cell lines with different sensitivities to cisplatin. Biochem Pharmacol 2002; 63: Ishikawa T, Wright CD, Ishizuka H. GS-X pump is functionally overexpressed in cis-diamminedichloroplatinum (II)-resistant human leukemia HL-60 cells and down-regulated by cell differentiation. J Biol Chem1994; 269: Rosell R i wsp. DNA repair and cisplatin resistance in non-small cell lung cancer. Lung Cancer 2002; 38: Torigoe T. i wsp. Cisplatin resistance and transcription factors. Curr Med Chem Anti-Cancer Agents 2005; 5: Albertella MR i wsp. A role for polymerase η in the cellular tolerance to cisplatin-induced damage. Cancer Res 2005; 65: Gadducci A i wsp. Molecular mechanisms of apoptosis and chemosensitivity to platinum and paclitaxel in ovarian cancer: biological data and clinical implications. Eur J Gynaecol Oncol 2002; 23:
6 12. Borst P i wsp. A family of drug transporters: the multidrug resistance-associated proteins. J Natl Cancer Inst 2000; 92: Choi CH i wsp. Molecular mechanisms of heptaplatin effective against cisplatin-resistant cancer cell lines: less involvement of metallothionein. Cancer Cell Int : Muller PJ i wsp. Polymorphisms in ABCG2, ABCC3 and CNT1 genes and their possible impact on chemotherapy outcome of lung cancer patients. Int J Cancer 2009; 124: Uldry M, Thorens B. The SLC2 family of facilitated hexose and polyol transporters. Pflugers Arch 2004; 447: Holford J i wsp. Mechanisms of drug resistance to the platinum complex ZD0473 in ovarian cancer cell lines. Eur J Cancer 2000; 36: Zhang K i wsp. Modulation of cisplatin cytotoxicity and cisplatin-induced DNA cross-links in HepG2 cells by regulation of glutathione related mechanisms. Mol Pharmacol 2001; 59: Wang H i wsp. Expression of the activity of cystine/glutamate exchange transporter, system x(c)(-), by xct and rbat. Biochem Biophys Res Commun 2003; 305: Guay D i wsp. The strand separation and nuclease activities associated with YB-1 are dispensable for cisplatin resistance but overexpression of YB-1 in MCF7 and MDA-MB-231 breast tumor cells generates several chemoresistance signatures. Int J Biochem Cell Biol 2008; 40: Floros KV i wsp. Cisplatin-induced apoptosis in hl- 60 human promyelocytic leukemia cells differential expression of BCL2 and novel apoptosis-related gene BCL2L12. Ann NY Acad Sci 2003; 1010: Zou H. Apaf 1, a human protein homologous to C elegans CED 4 participates in cytochrome C dependent acti vation of caspase 3. Cell 1997; 90: Monte M i wsp. The cell cycle-regulated protein human GTSE-1 controls DNA damage-induced apoptosis by affecting p53 function. J Biol Chem 2003; 278: Chen A i wsp. Microarray and biochemical analysis of bufalin-induced apoptosis of HL-60 cells. Biotechnol Lett 2009; 31: Larsen NB, Rasmussen M, Rasmussen LJ. Nuclear and mitochondrial DNA repair: similar pathways? Mitochondrion 2005; 5: Adres do korespondencji: dr hab. n. farm. Adam Wilczok Katedra i Zakład Biofarmacji SUM ul. Narcyzów Sosnowiec tel awilczok@sum.edu.pl
Wstęp. Streszczenie. Abstract
Streszczenie Cisplatyna (CPT) jest chemioterapeutykiem tworzącym kowalencyjne wiązania z DNA, zarówno wewnątrz- jak i międzyniciowe. Sprawność i funkcjonowanie mechanizmów naprawy DNA pozostają w ścisłym
Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego
Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki
Do moich badań wybrałam przede wszystkim linię kostniakomięsaka 143B ze względu na jej wysoki potencjał przerzutowania. Do wykonania pracy
Streszczenie Choroby nowotworowe stanowią bardzo ważny problem zdrowotny na świecie. Dlatego, medycyna dąży do znalezienia nowych skutecznych leków, ale również rozwiązań do walki z nowotworami. Głównym
Wstęp. Abstract. Streszczenie
Streszczenie Cisplatyna (CPT) jest jednym z najpowszechniejszych chemioterapeutyków stosowanych w terapii nowotworów. Uszkodzenie genomowego DNA po wniknięciu CPT do jądra komórkowego wyzwala cytotoksyczne
Wykład 13. Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA. Mechanizmy powstawania nowotworów
Wykład 13 Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA Mechanizmy powstawania nowotworów Uszkodzenie DNA Wykrycie uszkodzenia Naprawa DNA Zatrzymanie cyklu kom. Apoptoza Źródła uszkodzeń
Wstęp. Key words: cisplatin, gene expression, cell cycle, promyelocytic leukemia cells, HL-60
Streszczenie Cisplatyna, lek przeciwnowotworowy stosowany w monoterapii jak i terapii skojarzonej wielu nowotworów, zaliczana jest do cytostatyków o działaniu niezależnym od cyklu podziałowego, niszczącym
starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg
STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF
Agnieszka Gładysz Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Katedra i Zakład Biochemii i Chemii Klinicznej Akademia Medyczna Prof.
Składniki diety a stabilność struktury DNA
Składniki diety a stabilność struktury DNA 1 DNA jedyna makrocząsteczka, której synteza jest ściśle kontrolowana, a powstałe błędy są naprawiane DNA jedyna makrocząsteczka naprawiana in vivo Replikacja
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska
Dane mikromacierzowe Mateusz Markowicz Marta Stańska Mikromacierz Mikromacierz DNA (ang. DNA microarray) to szklana lub plastikowa płytka (o maksymalnych wymiarach 2,5 cm x 7,5 cm) z naniesionymi w regularnych
Układ pracy. Wstęp i cel pracy. Wyniki. 1. Ekspresja i supresja Peroksyredoksyny III w stabilnie transfekowanej. linii komórkowej RINm5F
The influence of an altered Prx III-expression to RINm5F cells Marta Michalska Praca magisterska wykonana W Zakładzie Medycyny Molekularnej Katedry Biochemii Klinicznej Akademii Medycznej w Gdańsku Przy
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Promotor: prof. dr hab. Katarzyna Bogunia-Kubik Promotor pomocniczy: dr inż. Agnieszka Chrobak
INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ IM. LUDWIKA HIRSZFELDA WE WROCŁAWIU POLSKA AKADEMIA NAUK mgr Milena Iwaszko Rola polimorfizmu receptorów z rodziny CD94/NKG2 oraz cząsteczki HLA-E w patogenezie
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
Prezentuje: Magdalena Jasińska
Prezentuje: Magdalena Jasińska W którym momencie w rozwoju embrionalnym myszy rozpoczyna się endogenna transkrypcja? Hipoteza I: Endogenna transkrypcja rozpoczyna się w embrionach będących w stadium 2-komórkowym
Badanie oddziaływania polihistydynowych cyklopeptydów z jonami Cu 2+ i Zn 2+ w aspekcie projektowania mimetyków SOD
Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Analityki Medycznej Badanie oddziaływania polihistydynowych cyklopeptydów z jonami Cu 2+ i Zn 2+ w aspekcie projektowania mimetyków SOD Aleksandra Kotynia PRACA DOKTORSKA
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY d r i n ż. Magdalena Górnicka Zakład Oceny Żywienia Katedra Żywienia Człowieka WitaminyA, E i C oraz karotenoidy Selen Flawonoidy AKRYLOAMID Powstaje podczas przetwarzania
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
STRESZCZENIE PRACY DOKTORSKIEJ
mgr Bartłomiej Rospond POSZUKIWANIE NEUROBIOLOGICZNEGO MECHANIZMU UZALEŻNIENIA OD POKARMU - WPŁYW CUKRÓW I TŁUSZCZÓW NA EKSPRESJĘ RECEPTORÓW DOPAMINOWYCH D 2 W GRZBIETOWYM PRĄŻKOWIU U SZCZURÓW STRESZCZENIE
Transport przez błony
Transport przez błony Transport bierny Nie wymaga nakładu energii Transport aktywny Wymaga nakładu energii Dyfuzja prosta Dyfuzja ułatwiona Przenośniki Kanały jonowe Transport przez pory w błonie jądrowej
Wpływ cisplatyny i doksorubicyny na układ prooksydacyjno/antyoksydacyjny oraz ekspresję białka p53 w komórkach gruczolakoraka płuc in vitro
lek. Katarzyna Jędrzejowska Wpływ cisplatyny i doksorubicyny na układ prooksydacyjno/antyoksydacyjny oraz ekspresję białka p53 w komórkach gruczolakoraka płuc in vitro Rozprawa na stopień doktora nauk
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
ĆWICZENIA Z BIOCHEMII
ĆWICZENIA Z BIOCHEMII D U STUDENTfiW WYDZIAŁU LEKARSKIEGO Pod redakcją Piotra Laidlera, Barbary Piekarskiej, Marii Wróbel WYDAWNICTWO UNIWERSYTETU JAGIELLOŃSKIEGO ĆWICZENIA Z BIOCHEMII DLA STUDENTÓW WYDZIAŁU
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
Badanie nowych syntetycznych heterocykli jako potencjalnych związków o działaniu przeciwnowotworowym
Dorota Katarzyna Pomorska Badanie nowych syntetycznych heterocykli jako potencjalnych związków o działaniu przeciwnowotworowym Praca na stopień doktora nauk medycznych wykonana w Zakładzie Chemii Biomolekularnej
Dr hab. n. med. Paweł Blecharz
BRCA1 zależny rak piersi i jajnika odmienności diagnostyczne i kliniczne (BRCA1 dependent breast and ovarian cancer clinical and diagnostic diversities) Paweł Blecharz Dr hab. n. med. Paweł Blecharz Dr
Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca
Tytuł pracy: Autor: Promotor rozprawy: Recenzenci: Funkcje białek ELAC2 i SUV3 u ssaków i ryb Danio rerio. Praca doktorska wykonana w Instytucie Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii UW Lien Brzeźniak
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Metody badania ekspresji genów
Metody badania ekspresji genów dr Katarzyna Knapczyk-Stwora Warunki wstępne: Proszę zapoznać się z tematem Metody badania ekspresji genów zamieszczonym w skrypcie pod reakcją A. Lityńskiej i M. Lewandowskiego
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny Analizy wielkoskalowe wykorzystujące mikromacierze DNA Genotypowanie: zróżnicowane wewnątrz genów RNA Komórka eukariotyczna Ekspresja genów: Które geny? Poziom
Technika fluorescencyjnego oznaczania aktywności enzymów. Wstęp:
Technika fluorescencyjnego oznaczania aktywności enzymów Wstęp: Wśród technik biologii molekularnej jedną z najczęściej stosowanych jest technika fluorescencyjna. Stosując technikę fluorescencyjną można
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
Indukcja apoptozy w komórkach białaczek ludzkich MOLT4 i HL60 przez acyloksytriazoloakrydony nową grupę związków o właściwościach przeciwnowotworowych
Indukcja apoptozy w komórkach białaczek ludzkich MOLT4 i HL60 przez acyloksytriazoloakrydony nową grupę związków o właściwościach przeciwnowotworowych Induction of apoptosis of human leukemia MOLT4 and
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
Wydział Chemiczny Politechniki Gdańskiej Katedra Technologii Leków i Biochemii. Biologia komórki nowotworowej: Ćwiczenie C
Wydział Chemiczny Politechniki Gdańskiej Katedra Technologii Leków i Biochemii Biologia komórki nowotworowej: Ćwiczenie C Akumulacja i wewnątrzkomórkowa dystrybucja leków przeciwnowotworowych WSTĘP Większość
SEMINARIUM 8:
SEMINARIUM 8: 24.11. 2016 Mikroelementy i pierwiastki śladowe, definicje, udział w metabolizmie ustroju reakcje biochemiczne zależne od aktywacji/inhibicji przy udziale mikroelementów i pierwiastków śladowych,
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane
1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy
1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy a) Toma A, Widłak W, Vydra N (2012) Rola czynnika transkrypcyjnego HSF1 w procesie nowotworzenia. Postępy Biologii Komórki 39(2):269 288 b) Vydra N, Toma
Nowe terapie choroby Huntingtona. Grzegorz Witkowski Katowice 2014
Nowe terapie choroby Huntingtona Grzegorz Witkowski Katowice 2014 Terapie modyfikujące przebieg choroby Zahamowanie produkcji nieprawidłowej huntingtyny Leki oparte o palce cynkowe Małe interferujące RNA
IL-4, IL-10, IL-17) oraz czynników transkrypcyjnych (T-bet, GATA3, E4BP4, RORγt, FoxP3) wyodrębniono subpopulacje: inkt1 (T-bet + IFN-γ + ), inkt2
Streszczenie Mimo dotychczasowych postępów współczesnej terapii, przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) nadal pozostaje chorobą nieuleczalną. Kluczem do znalezienia skutecznych rozwiązań terapeutycznych
1. Znaczenie podjętych badań
Ocena rozprawy doktorskiej mgr analityki medycznej Natalii Koniecznej pt. Badanie wpływu hamowania telomerazy za pomocą TMPyP4 na skuteczność leków przeciwnowotworowych w komórkach raka piersi in vitro,
Pro apoptotyczne właściwości ekstraktów z kory Cochlospermum angolense Welw.
Pro apoptotyczne właściwości ekstraktów z kory Cochlospermum angolense Welw. Paulina Wdowiak 1, Tomasz Baj 2, Magdalena Wasiak 1, Piotr Pożarowski 1, Jacek Roliński 1, Kazimierz Głowniak 2 1 Katedra i
Prof. dr hab. Grzegorz Bartosz Katedra Biofizyki Molekularnej Uniwersytetu Łódzkiego
Prof. dr hab. Grzegorz Bartosz Katedra Biofizyki Molekularnej Uniwersytetu Łódzkiego Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Joanny Weżgowiec pt. The influence of electroporation on selected anti-tumor
Fizjologia człowieka
Fizjologia człowieka Wykład 2, część A CZYNNIKI WZROSTU CYTOKINY 2 1 Przykłady czynników wzrostu pobudzających proliferację: PDGF - cz.wzrostu z płytek krwi działa na proliferację i migrację fibroblastów,
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa,
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa, 14.01. 2018 Instytut Biochemii i Biofizyki PAN Ul. Pawińskiego 5a 02-106 Warszawa Recenzja pracy doktorskiej Pana mgr Michała Płachty Pod Tytułem Regulacja funkcjonowania
Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl
Ogół przemian biochemicznych, które zachodzą w komórce składają się na jej metabolizm. Wyróżnia się dwa antagonistyczne procesy metabolizmu: anabolizm i katabolizm. Szlak metaboliczny w komórce, to szereg
Autoreferat. Tomasz Deptuła
Tomasz Deptuła Autoreferat przedstawiający wyniki badań opisane w rozprawie doktorskiej pod tytułem: WPŁYW PODSTAWNIKÓW POLIETEOWYCH NA AKTYWNOŚĆ BIOLOGICZNĄ KUKUMINY Wydział Chemii, Uniwersytet Warszawski
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T Joanna Frąckowiak Rozprawa doktorska Praca wykonana w Katedrze i Zakładzie Fizjopatologii Gdańskiego
CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Takao Ishikawa Faculty of Biology, University of Warsaw, Poland Performance of Polish students at IBO Gold Silver Bronze Merit
Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego. Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa
Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego raka jajnika Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa Sześć diabelskich mocy a komórka rakowa (Gibbs
Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza
dr hab. Beata Schlichtholz Gdańsk, 20 października 2015 r. Katedra i Zakład Biochemii Gdański Uniwersytet Medyczny ul. Dębinki 1 80-211 Gdańsk Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza pt.
KOŁO NAUKOWE IMMUNOLOGII. Mikrochimeryzm badania w hodowlach leukocytów in vitro
KOŁO NAUKOWE IMMUNOLOGII Mikrochimeryzm badania w hodowlach leukocytów in vitro Koło Naukowe Immunolgii kolo_immunologii@biol.uw.edu.pl kolo_immunologii.kn@uw.edu.pl CEL I PRZEDMIOT PROJEKTU Celem doświadczenia
Materiał i metody. Wyniki
Abstract in Polish Wprowadzenie Selen jest pierwiastkiem śladowym niezbędnym do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Selen jest wbudowywany do białek w postaci selenocysteiny tworząc selenobiałka (selenoproteiny).
Sylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Program kształcenia Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Analityka Medyczna, studia jednolite magisterskie, studia stacjonarne
Substancje stosowane do osadzania enzymu na stałym podłożu Biotyna (witamina H, witamina B 7 ) Tworzenie aktywnej powierzchni biosensorów
SEKWECJWAIE ASTĘPEJ GEERACJI- GS Losowa fragmentacja nici DA Dołączanie odpowiednich linkerów (konstrukcja biblioteki) Amplifikacja biblioteki na podłożu szklanym lub plastikowym biosensory Wielokrotnie
Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak
Katedra Fizjologii i Biochemii Roślin Uniwersytetu Łódzkiego Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak Plan wykładu Przykłady
Zarówno u organizmów eukariotycznych, jak i prokariotycznych proces replikacji ma charakter semikonserwatywny.
HIPTEZY WYJAŚIAJĄCE MECHAIZM REPLIKACJI C. Model replikacji semikonserwatywnej zakłada on, że obie nici macierzystej cząsteczki DA są matrycą dla nowych, dosyntetyzowywanych nici REPLIKACJA każda z dwóch
Badania osobniczej promieniowrażliwości pacjentów poddawanych radioterapii. Andrzej Wójcik
Badania osobniczej promieniowrażliwości pacjentów poddawanych radioterapii Andrzej Wójcik Zakład Radiobiologii i Immunologii Instytut Biologii Akademia Świętokrzyska Świętokrzyskie Centrum Onkologii Fig.
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
Sprawozdanie z wykonania projektu badawczego:
Sprawozdanie z wykonania projektu badawczego: ODDZIAŁYWANIE POLA MAGNETYCZNEGO GENEROWANEGO PRZEZ STYMULATOR ADR NA CZYNNOŚĆ LUDZKICH KOMÓREK IMMUNOKOMPETENTNYCH in vitro Celem przeprowadzonych badań była
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011 DLACZEGO DOROSŁY CZŁOWIEK (O STAŁEJ MASIE BIAŁKOWEJ CIAŁA) MUSI SPOŻYWAĆ BIAŁKO? NIEUSTAJĄCA WYMIANA BIAŁEK
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
Nukleotydy w układach biologicznych
Nukleotydy w układach biologicznych Schemat 1. Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy Schemat 2. Dinukleotyd NADP + Dinukleotydy NAD +, NADP + i FAD uczestniczą w procesach biochemicznych, w trakcie których
Czym jest medycyna personalizowana w kontekście wyzwań nowoczesnej onkologii?
Czym jest medycyna personalizowana w kontekście wyzwań nowoczesnej onkologii? Wykorzystanie nowych technik molekularnych w badaniach nad genetycznymi i epigenetycznymi mechanizmami transformacji nowotworowej
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
FOCUS Plus - Silniejsza ryba radzi sobie lepiej w trudnych warunkach
FOCUS Plus - Silniejsza ryba radzi sobie lepiej w trudnych warunkach FOCUS Plus to dodatek dostępny dla standardowych pasz tuczowych BioMaru, dostosowany specjalnie do potrzeb ryb narażonych na trudne
Temat ćwiczenia: Techniki stosowane w badaniach toksyczności in vitro
Temat ćwiczenia: Techniki stosowane w badaniach toksyczności in vitro Miarą aktywności cytotoksycznej badanej substancji jest określenie stężenia hamującego, IC 50 (ang. inhibitory concentration), dla
&ARM 0RZEGL.AUK Streszczenie Summary Key words; Słowa kluczowe; ' Ö
Streszczenie Leptyna indukuje wzrost komórek nowotworowych poprzez aktywację różnych ścieżek sygnałowych w komórce. Celem pracy było porównanie transkryptomów tkanek endometrium wyznaczonych techniką mikromacierzy
Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji?
WYKŁAD: 4 Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji? Prof. dr hab. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej 1 Dieta niskokaloryczna (calorie restriction,cr) 2 3 4 Zdjęcie 2. Stuletnia mieszkanka
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2022 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna Kod przedmiotu/ modułu* Wydział (nazwa jednostki prowadzącej kierunek)
W 2010 roku, rak płuc był w Polsce najczęstszą przyczyną zgonów spowodowanych nowotworami złośliwymi u obu płci. Wyjaśnianie zależności pomiędzy
Ocena pracy doktorskiej lek. Katarzyny Jędrzejowskiej pt. Wpływ cisplatyny i doksorubicyny na układ prooksydacyjno/antyoksydacyjny oraz ekspresję białka p53 w komórkach gruczolakoraka płuc in vitro Nowotwory
Uniwersytet Łódzki, Instytut Biochemii
Życie jest procesem chemicznym. Jego podstawą są dwa rodzaje cząsteczek kwasy nukleinowe, jako nośniki informacji oraz białka, które tę informację wyrażają w postaci struktury i funkcji komórek. Arthur
Badanie wpływu Selolu na ekspresję genów kodujących transportery błonowe i enzymy metabolizujące leki w komórkach nowotworowych wrażliwych i opornych
PRACA ORYGINALNA Badanie wpływu Selolu na ekspresję genów kodujących transportery błonowe i enzymy metabolizujące leki w komórkach nowotworowych wrażliwych i opornych A study of the effect of Selol on
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA (skrajne daty)
Załącznik nr 4 do Uchwały Senatu nr 430/01/2015 SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2022 (skrajne daty) 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna
TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA
DNA 28SRNA 18/16S RNA 5SRNA mrna Ilościowa analiza mrna aktywność genów w zależności od wybranych czynników: o rodzaju tkanki o rodzaju czynnika zewnętrznego o rodzaju upośledzenia szlaku metabolicznego
Personalizacja leczenia w hematoonkologii dziecięcej
MedTrends 2016 Europejskie Forum Nowoczesnej Ochrony Zdrowia Zabrze, 18-19 marca 2016 r. Personalizacja leczenia w hematoonkologii dziecięcej Prof. dr hab. n. med. Tomasz Szczepański Katedra i Klinika
Nowe leki onkologiczne kierunki poszukiwań. 20 września 2013 roku
Nowe leki onkologiczne kierunki poszukiwań 20 września 2013 roku Wyzwania Nowotwór ma być wyleczalny. Nowotwór ma z choroby śmiertelnej stać się chorobą przewlekłą o długim horyzoncie czasowym. Problemy
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt do wykładu
TRANSLACJA II etap ekspresji genów
TRANSLACJA II etap ekspresji genów Tłumaczenie informacji genetycznej zawartej w mrna (po transkrypcji z DNA) na aminokwasy budujące konkretne białko. trna Operon (wg. Jacob i Monod) Zgrupowane w jednym
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach
WYKŁAD: Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Białka Retrowirusy Białka Klasyczny
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
Dodatek F. Dane testowe
Dodatek F. Dane testowe Wszystkie dane wykorzystane w testach pochodzą ze strony http://sdmc.lit.org.sg/gedatasets/datasets.html. Na stronie tej zamieszczone są różne zbiory danych zebrane z innych serwisów
ROZPRAWA DOKTORSKA STRESZCZENIE
Uniwersytet Medyczny w Lublinie Katedra i Zakład Patomorfologii Klinicznej ROZPRAWA DOKTORSKA STRESZCZENIE Lek. Joanna Irla-Miduch WERYFIKACJA HISTOPATOLOGICZNA I OCENA EKSPRESJI BIAŁKA p16 INK4A ORAZ
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS. Inżynieria genetyczna. Podstawowe pojęcia Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS Część I Badanie ekspresji genów Podstawy klonowania i różnicowania transformantów Kolokwium (14pkt) Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka Kolokwium (26pkt) EGZAMIN
Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi
Marta Klimczak Studium Medycyny Molekularnej Warszawski Uniwersytet Medyczny Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi Praca wykonana w Zakładzie Biologii Molekularnej
IMMUNOHISTOCHEMICZNA OCENA MERKERÓW PROLIFERACJI KOMÓRKOWEJ W RAKU JELITA GRUBEGO
IMMUNOHISTOCHEMICZNA OCENA MERKERÓW PROLIFERACJI KOMÓRKOWEJ W RAKU JELITA GRUBEGO EWA STĘPIEŃ ZAKŁAD PATOMORFOLOGII OGÓLNEJ AKADEMII MEDYCZNEJ W BIAŁYMSTOKU KIEROWNIK I OPIEKUN PRACY: Dr KATARZYNA GUZIŃSKA-USTYMOWICZ
Fig. S1 A. B. control Bortezomib. control Bortezomib. Rela ative expression N.D. MYC BCL2 XIAP TNF IL6
Fig. S A. B. Rela ative expression 5 4 3 2 control Bortezomib Rela ative expression 5 4 3 2 control Bortezomib MYC BCL2 XIAP TNF IL6 N.D. MYC BCL2 XIAP TNF IL6 Figure S. Bortezomib inhibits NF- B signaling
Antyoksydanty pokarmowe a korzyści zdrowotne. dr hab. Agata Wawrzyniak, prof. SGGW Katedra Żywienia Człowieka SGGW
Antyoksydanty pokarmowe a korzyści zdrowotne dr hab. Agata Wawrzyniak, prof. SGGW Katedra Żywienia Człowieka SGGW Warszawa, dn. 14.12.2016 wolne rodniki uszkodzone cząsteczki chemiczne w postaci wysoce
Dr hab. Janusz Matuszyk. Ocena rozprawy doktorskiej. Pani mgr Hanny Baurskiej
Dr hab. Janusz Matuszyk INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ im. Ludwika Hirszfelda P OLSKIEJ A K A D E M I I N AUK Centrum Doskonałości: IMMUNE ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław tel. (+48-71)