ZASTOSOWANIE MIKROSYSTEMÓW W MEDYCYNIE LABORATORIUM. Ćwiczenie nr 4 MIKROCYTOMETR DO BADANIA KOMÓREK BIOLOGICZNYCH

Podobne dokumenty
DETEKCJA W MIKRO- I NANOOBJĘTOŚCIACH. Ćwiczenie nr 3 Detektor optyczny do pomiarów fluorescencyjnych

( L ) I. Zagadnienia. II. Zadania

Wahadło. Celem ćwiczenia jest zapoznanie się z zasadą dokonywania wideopomiarów w systemie Coach 6 oraz obserwacja modelu wahadła matematycznego.

1. Opis okna podstawowego programu TPrezenter.

Profil pracownika. Wydziału Neofilologii

Cel i zakres ćwiczenia

Laboratorium - Monitorowanie i zarządzanie zasobami systemu Windows 7

Opis programu Konwersja MPF Spis treści

Profil pracownika. Wydziału Neofilologii

Aby uruchomić Multibooka, należy podłączyć nośnik USB do gniazda USB w komputerze, na którym program ma być używany.

EASY CAP VIDEO GRABBER SZYBKI START. Instalacja sterowników

Laboratorium - Monitorowanie i zarządzanie zasobami systemu Windows XP

OSTRZEŻENIE: NIEBEZPIECZEŃSTWO ZADŁAWIENIA małe elementy. Dla dzieci powyżej 3 roku życia.

1. Pobieranie i instalacja FotoSendera

Aby pobrać program FotoSender naleŝy na stronę lub i kliknąć na link Program do wysyłki zdjęć Internetem.

Instrukcja wgrywania aktualizacji oprogramowania dla routera Edimax LT-6408n

ROZDZIAŁ 1: Instrukcja obsługi oprogramowania VMS

Ćwiczenie 1. Parametry statyczne diod LED

K2 XVR-04, K2 XVR-08, K2 XVR-16, K2 XVR-24. Rejestrator Cyfrowy S E R I E: K2 XVR. DVR klient. Instrukcja użytkownika

SYSTEM REJESTRACJI VIDEO PRO SURVEILLANCE SYSTEM V R

Instrukcja instalacji certyfikatu kwalifikowanego w programie Płatnik wersja b

THP-100 su Obsługa oprogramowania oraz instrukcja wzorcowania

Aktywacja karty numaps Lifetime

pomocą programu WinRar.

WIFI Full-HD Black-300

Laboratorium - Monitorowanie i zarządzanie zasobami systemu Windows Vista

SKRÓCONA INSTRUKCJA DLA REJESTRATORÓW SERII AHD 4, 8 I 16 KANAŁOWYCH (MODELE: AHDR-1042D/M, AHDR1041D/M, AHDR-1082D/M, AHDR1162D/M)

Skrócona instrukcja obsługi rejestratorów marki

Integracja programów LeftHand z systemem Skanuj.to

Okno logowania. Okno aplikacji. 1. Logowanie i rejestracja

Badanie współczynników lepkości cieczy przy pomocy wiskozymetru rotacyjnego Rheotest 2.1

REJESTRATOR PRZENOŚNY + MINIKAMERA BEZPRZEWODOWA

AKADEMIA MORSKA KATEDRA NAWIGACJI TECHNICZEJ

Product Update Funkcjonalność ADR dla przemienników Częstotliwości PowerFlex 750 oraz 525 6

Część I: Excel - powtórka

ARRIS VIP Copyright 2015 Grupa MULTIPLAY.

Instrukcja przygotowania i programowania animacji programem Animation Manager w drukarce fiskalnej Novitus HD E.

Przewodnik instalacji i rejestracji ASN RadioOS

Model: JMC-03_V2.2_RNS510 TV DVB-T for CAR INSTRUKCJA OBSŁUGI RNS 510. Spis treści

Przed restartowaniem routera odłącz wszystkie urządzenia podłączone pod porty USB.

Pomiar temperatury procesora komputera klasy PC, standardu ATX wykorzystanie zestawu COACH Lab II+. Piotr Jacoń K-4 I PRACOWNIA FIZYCZNA

a) Tworzymy podcast w programie Audacity

Platforma szkoleniowa krok po kroku

ZASTOSOWANIE MIKROSYSTEMÓW W MEDYCYNIE LABORATORIUM. Ćwiczenie nr 2 DOZOWANIE MIKRO- I NANOOBJĘTOŚCI Z DETEKCJĄ KONDUKTOMETRYCZNĄ

Podręcznik użytkownika PCI-x Karta przechwytująca 4xHDMI

Instrukcja składania wniosku o dofinansowanie w systemie informatycznym IP na potrzeby konkursu nr 1/1.1.2/2015

Kalibracja czujnika temperatury zestawu COACH Lab II+. Piotr Jacoń. K-5a I PRACOWNIA FIZYCZNA

Jak zamówić zdjęcia przez FotoSender?

Instrukcja obsługi Skaner

58 Zjazd Naukowy PTChem. Zgłaszanie abstraktów

Orientacja pojedynczego zdjęcia

Gromadzenie danych. Przybliżony czas ćwiczenia. Wstęp. Przegląd ćwiczenia. Poniższe ćwiczenie ukończysz w czasie 15 minut.

Instrukcja obsługi programu FotoSender

Stanowisko do badania zjawiska tłumienia światła w ośrodkach materialnych

POMIARY WIDEO W PROGRAMIE COACH 5

Instrukcja obsługi platformy

Instrukcja obsługi programu CMS Dla rejestratorów HANBANG

Program SigmaViewer.exe

ZASTOSOWANIE MIKROSYSTEMÓW W MEDYCYNIE LABORATORIUM. Ćwiczenie nr 5 INSTRUMENT LAB-ON-A-CHIP DO ELEKTROFORETYCZNEJ ANALIZY MATERIAŁU GENETYCZNEGO

Instrukcja korzystania z Systemu Telnom - Nominacje

LABORATORIUM Pomiar charakterystyki kątowej

Instrukcja obsługi. Karta video USB + program DVR-USB/8F. Dane techniczne oraz treść poniższej instrukcji mogą ulec zmianie bez uprzedzenia.

Instalacja i obsługa aplikacji MAC Diagnoza EP w celu wykonania Diagnozy rozszerzonej

Arkadiusz Kalicki, Lech Mankiewicz Plugin Webcam dla SalsaJ Podręcznik użytkownika

Ciało Doskonale Czarne

Woltamperometryczne oznaczanie kadmu na elektrodzie błonkowej (MFE rtęciowa elektroda błonkowa) Uruchom program PSLite 1.8

Kliknij na odnośnik aby przejść do strony logowania na serwerze MSDN AA

etrader Pekao Podręcznik użytkownika Strumieniowanie Excel

Do korzystania ze strony elektronicznej rekrutacji zalecamy następujące wersje przeglądarek internetowych:

Instalowanie dodatku Message Broadcasting

Państwowa Wyższa Szkoła Zawodowa w Gorzowie Wlkp. Laboratorium architektury komputerów

1. Instalacja Programu

Platforma szkoleniowa krok po kroku. Poradnik Kursanta

Część I. Pomiar drgań własnych pomieszczenia

Pakiet Sokrates Instrukcja instalacji

INSTRUKCJA DO OPROGRAMOWANIA KOMPUTEROWEGO

Instrukcja generowania certyfikatu PFRON i podpisywania dokumentów aplikacji SODiR w technologii JS/PKCS 12

INSTRUKCJE WIKAMP Dotyczy wersji systemu z dnia

Jak zapisać wersje elektroniczną pracy dyplomowej? - INSTRUKCJA (krok po kroku)

I N S T R U K C J A O B S Ł U G I P L AT F O R M Y E N E R G I A S P O Ł E C Z N A. Spis treści

Podręcznik użytkownika programu. Ceremonia 3.1

CONCEPTRONIC. Instrukcja Szybkiej Instalacji

Odczyt karty SD za pomocą aplikacji KK-01 podręcznik użytkownika

Memeo Instant Backup Podręcznik Szybkiego Startu

OKULARY Z KAMERĄ BLACK V11

Politechnika Łódzka. Instytut Systemów Inżynierii Elektrycznej. Laboratorium przyrządów wirtualnych. Ćwiczenie 3

Veronica. Wizyjny system monitorowania obiektów budowlanych. Instrukcja oprogramowania

ZASTOSOWANIE MIKROSYSTEMÓW W MEDYCYNIE LABORATORIUM. Ćwiczenie nr 1 PRZEPŁYW I MIESZANIE CIECZY W MIKROKANAŁACH

EASY CAP VIDEO GRABBER SZYBKI START. Instalacja sterowników

Jeszcze raz więc powtarzam - wymieramy NIE i przechodzimy do kolejnego obrazka.

5. Wyświetli nam się spis treści oraz lista rozdziałów. Aby wejść w podgląd podręcznika, należy wybrać interesujący nas rozdział oraz kliknąć w napis

ZASTOSOWANIE MIKROSYSTEMÓW W MEDYCYNIE LABORATORIUM. Ćwiczenie nr 2 DOZOWANIE MIKRO- I NANOOBJĘTOŚCI Z DETEKCJĄ KONDUKTOMETRYCZNĄ

Rozpoczęcie pracy z programem.

REJESTRATOR CYFROWY INTROX IN 104

Instalacja i obsługa aplikacji MAC Diagnoza EP w celu wykonania Arkusza obserwacji

5.6.2 Laboratorium: Punkty przywracania

Rozdział 4. Multimedia

Transkrypt:

ZASTOSOWANIE MIKROSYSTEMÓW W MEDYCYNIE LABORATORIUM Ćwiczenie nr 4 MIKROCYTOMETR DO BADANIA KOMÓREK BIOLOGICZNYCH Cel ćwiczenia: Celem ćwiczenia jest zapoznanie się z budową i warunkami działania mikrocytometru typu T z detekcją fluorymetryczną. W ćwiczeniu badany będzie poziom sygnału fluorescencyjnego pochodzącego od mikrokulek fluorescencyjnych, które stanowią model dla oocytu/zarodka bydła lub trzody chlewnej. Opis stanowiska: 1. Krzemowo-szklany mikrocytometr typu T 2. Źródło światła: laser półprzewodnikowy o długości fali emisji 532 nm i mocy 5 mw 3. Kamera CCD z filtrem optycznym górnoprzepustowym FEL600 nm oraz kartą TV 4. Zasilacz do kamery (12 V) oraz lasera (5 V) 5. Komputer z oprogramowaniem Rys. 1. Schemat budowy mikrocytometru Rys. 2. Obszar detekcji fluorymetrycznej Rys. 3. Idea pracy mikrocytometru 1

Rys. 4. Schemat układu pomiarowego Stanowisko wyposażone jest w pompę perystaltyczną, która w sposób ciągły (ale pulsacyjny) podaje ciecz nośną z zawieszonymi w niej mikrokulkami oznaczonymi fluorescencyjnie. Kierunek przepływu mikrokulek jest dowolny. Przebieg ćwiczenia: 1. Zaznajomienie się z układem pomiarowym 2. Pomiary sygnału fluorescencyjnego emitowanego przez oznakowane kulki polistyrenowe nr 1 i nr 2 1. Włączyć zasilacz. 2. Sprawdzić, czy laser oraz kamera CCD są podłączone do zasilacza (kamera: zasilacz MDM 12 V, laser: zasilacz MDM 5 V). 3. Włączyć komputer i zalogować się na konto Student (hasło: Student). 4. Włączyć program VirtualDub, wybrać opcję File Capture AVI, Video Preview. Sprawdzić czy obraz z kamery CCD, która znajduje się dokładnie nad chipem jest wyraźny. 5. W programie VirtualDub kreślić ścieżkę zapisu filmu (File Set Capture File). 6. Podłączyć zbiornik z kulkami nr1 (potem nr 2) do wlotu pompy perystaltycznej, włączyć pompę; początkowo zastosować duży przepływ (6), a kiedy front cieczy dojdzie do wlotu mikrokanału i sygnał fluorescencyjny od kulek będzie widoczny zmniejszyć przepływ (1). 7. Rozpocząć proces nagrywania filmu (Capture Start Capture). 8. W czasie nagrywania filmu co najmniej 10 kulek powinno przepłynąć przez skrzyżowanie T tak, aby dobrze widoczny był sygnał fluorescencji. 9. Wyłączyć nagrywanie filmu (Capture Stop Capture). 3. Analiza wyników pomiarów: Analizę wyników dokonuje się na podstawie obrazów graficznych zarejestrowanych kamerą cyfrową. 2

Zmiana rozmiaru filmu 1. Uruchomić program VirtualDub. 2. Wczytać plik z filmem (File Open video file). Pojawią się dwa okna z wczytanym filmem. 3. Następnie zmienić rozmiar analizowanego pliku (Video Filters Add ; pojawi się dodatkowe okienko, w którym wybieramy filtr resize i zadajemy szerokość 320 i wysokość 240 pikseli, po czym zatwierdzamy przyciskiem OK, dwukrotnie). 4. Kolejnym krokiem jest zapisanie filmu w formacie *.avi (File Save as AVI). 5. Czynność tą wykonujemy dla każdego z nagranych filmów. Analiza sygnału fluorescencji 1. Uruchomić program OPTOLABCARD software. 2. Wybrać ścieżkę zapisu wygenerowanego po analizie pliku *.xls oraz zdjęcia (Change dir). 3. Wczytać wybrany film do analizy (Select movie). 4. Po wczytaniu pliku w oknie po prawej stronie pojawi się obraz do analizy. Analizowany obraz 5. W celu dokładnego zaznaczenia analizowanych punktów należy powiększyć analizowany obszar przez naciśnięcie Enlarge area i zakreślenie tylko obszaru oświetlanego kanału. 6. Należy wybrać obszary, które będą poddane analizie. W tym celu należy zaznaczyć 2 pola do analizy (1 czerwone i 2 zielone). Jedno z nich powinno znajdować się w obszarze świecenia (sygnał fluorescencji kulki), a drugie poza nim (sygnał tła), ale w obszarze kanału. Pola do analizy nie powinny przekraczać wymiarów 2 2. W celu dokładnego narysowania pola do analizy można się posługiwać precyzyjnymi strzałkami. 3

Analizowane pola Rozmiar analizowanych pól Precyzyjne strzałki 7. W celu dokonania analizy zaznaczonych pól należy wcisnąć przycisk Measure. Spowoduje to pojawienie się krzywych pomiarowych w lewej części ekranu (Rys. 5) oraz automatycznie zostaną wygenerowane pliki *.xls oraz bmp do katalogu, który został wskazany na początku procedury. Krzywe pomiarowe 8. Powyższe czynności należy wykonać tak, aby uzyskać co najmniej 10 pików fluorescencyjnych (sygnały od 10 kulek). 4. Opracowanie wyników: 1. Wygenerowany w trakcie analizy plik *.xls zawiera trzy kolumny: 1 czas, 2 sygnał fluorescencji z pola czerwonego, 3 sygnał fluorescencji z pola zielonego. 2. Dla pojedynczej, wybranej kulki należy odjąć sygnał tła od sygnału fluorescencji w programie Excel lub Origin. 3. Czynności te należy powtórzyć dla każdej z 10 kulek. 4

4. Końcowym wynikiem analizy danych pomiarowych jest wykres (słupkowy) intensywności fluorescencji w zależności od numeru kulki. UWAGA!!! Po przeprowadzeniu serii pomiarów należy zawiesinę z kulkami przepompować z powrotem do zbiorniczka, a następnie kanał mikrocytometru przepłukać wodą dejonizowaną. W tym celu należy: a) zmienić kierunek pompowania i poczekać aż cała zawartość zmierzonej zawiesiny kulek nr 1 znajdzie się z powrotem w zbiorniczku nr 1, b) odłączyć rurkę wlotową pompy od naczynka z kulkami nr 1 i przepłukać mikrocytometr wodą dejonizowaną, c) powtórzyć pomiary dla kulek nr 2 i powtórzyć procedurę czyszczenia, jak dla kulek nr 1. Przykładowe pytania: Gdzie znajdują zastosowanie urządzenia typu Lab-on-a-Chip? Przedstawić schemat budowy mikrocytometru wraz z opisem funkcji poszczególnych elementów. Z jakich materiałów zbudowany jest mikrocytometr, opisz technologię. Jakie rodzaje detekcji oraz jakie detektory stosuje się w mikrocytometrach? Jakie metody są wykorzystywane do oceny jakości komórek rozrodczych? Przed wykonaniem ćwiczenia proszę zapoznać się z materiałami pomocniczymi przygotowanymi do ćwiczenia. 5