Genetyka Populacji http://ggoralski.com
Frekwencje genotypów i alleli Frekwencja genotypów
Frekwencje genotypów i alleli
Zadania P AA = 250/500 = 0,5 P Aa = 100/500 = 0,2 P aa = 150/500 = 0,3 = 1
Frekwencje genotypów i alleli Jeśli w diploidalnej populacji wszystkie genotypy mają taką sama płodność i żywotność to powyższy wzór opisuje także proporcje liczby gamet zawierających poszczególne allele.
Frekwencje genotypów i alleli
Frekwencje genotypów i alleli
Frekwencje genotypów i alleli
Zadanie
Zadanie cd.
Frekwencje genotypów i alleli
Frekwencje genotypów i alleli Aby obliczyć szansę powstania konkretnej heterozygoty (np. dziedziczącej allel A od ojca oraz a od matki), mnożymy: P' Aa = p A * p a Jeśli chcemy obliczyć szansę powstania jakiejkolwiek heterozygoty, trzeba pamiętać, że istnieją dwie możliwe heterozygoty: Aa oraz aa, ponieważ prawdopodobieństwo powstania każdej z nich jest takie same, mnożymy je przez 2: P' HT = 2(p A * p a ) Jeśli przewidywana frekwencja genotypów różni się od frekwencji rzeczywistej, oznacza to, że na frekwencję występowania genotypu mają wpływ inne czynniki, np. dobór naturalny
Zadanie
Zadanie Metoda I: użyjemy wzorów: pa = P aa + ½P Aa ; P aa = N aa /N ; P Aa = N Aa /N N = 360 + 480 + 160 = 1000 p a = 160/1000 + 240/1000 = 400/1000 = 0,4 Metoda II: użyjemy wzoru: p a = (2N aa + N Aa )/2N p a = (2*160 + 480)/2*1000 = (320 + 480)/2000 = 800/2000 = 0,4 Obliczamy frekwencję genotypu AA na podstawie frekwencji a: użyjemy wzorów: p A = 1 p a ; P AA = p A 2 p A = 1 0,4 = 0,6 ; P AA = 0,6 2 = 0,36 0,36 = 360/1000 czyli zgadza się
Prawo Hardy'ego-Weinberga Prawo Hardy'ego-Weinberga
Proporcje genotypów zależą od frekwencji alleli i w ciągu jednego pokolenia, niezależnie od frekwencji genotypów w poprzednim pokoleniu, zostają ustalone w proporcjach:
Proporcje genotypów - ujęcie geometryczne p (pa) p (pa) p 2 q (pa) pq q (pa) qp q 2
Zadanie Obliczamy frekwencje genotypów w następnym pokoleniu: P' D = (P D + ½ P H ) 2 ; P' H = 2(P D + ½ P H )(P R + ½ P H ); P' R = (P R + ½ P H ) 2 p p q q Pokolenie 1: P' D = (0,6 + ½ 0) 2 = 0,36 P' H = 2(0,6 + ½ 0)(0,4 + ½ 0) = 0,48 P' R = (0,4 + ½ 0) 2 = 0,16 Pokolenie 2: P'' D = (0,36 + ½ 0,48) 2 = 0,36 P'' H = 2(0,36 + ½ 0,48)(0,16 + ½ 0,48) = 0,48 P'' R = (0,16 + ½ 0,48) 2 = 0,16
Zadanie cd Obliczamy frekwencje alleli korzystając z wzorów: p = P D + ½ P H ; q = P R + ½ P H Początkowa frekwencja alleli: p = 0,6 + ½ 0 = 0,6; q = 0,4 + ½ 0 = 0,4 Pokolenie 1: P D = p 2 =0,6 2 =0,36 ; P H = 2pq = 2 * 0,6 * 0,4 = 0,48 ; P H =q 2 = 0,4 2 = 0,16 p' = 0,36 + ½ 0,48 = 0,6; q = 0,16 + ½ 0,48 = 0,4 Pokolenie 2: Ponieważ frekwencje genotypów w obu pokoleniach potomnych są takie same, takie same też są frekwencje alleli.
Prawo Hardy'ego-Weinberga - wnioski
Prawo Hardy'ego-Weinberga - wnioski
Prawo Hardy'ego-Weinberga - wnioski 0,5 1,0 0,8 0,6 0,4 0,2 0,0 p q aa = q 2 AA = p 2 Aa = 2pq 0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0 1,0 0,8 0,6 0,5 0,4 0,2 0,0 Dla każdego q frekwencje genotypów sumują się do 1. Częstości genotypów homozygotycznych mieszczą się między 0 a 1 a frekwencja heterozygot nie przekracza wartości 0,5 Frekwencja genotypów heterozygotycznych jest najwyższa (0,5) gdy p = q = 0,5. Częstość heterozygot nie może być wyższa niż suma częstości homozygot. Przy niskich frekwencjach allelu, występuje on głównie w heterozygotach, przy wyższych w homozygotach.