PROGRAM ĆWICZEŃ Z MIKROBIOLOGII DLA STUDENTÓW II ROKU WYDZIAŁU LEKARSKIEGO W ROKU AKADEMICKIM 2016/2017

Transkrypt

1 PROGRAM ĆWICZEŃ Z MIKROBIOLOGII DLA STUDENTÓW II ROKU WYDZIAŁU LEKARSKIEGO W ROKU AKADEMICKIM 2016/2017 Semestr zimowy 2016/ ćw x 2 h = 26 h Ćwiczenie 1. Morfologia bakterii. Metody barwienia. Budowa mikroskopu Ćwiczenie 2. Ziarniaki Gram-dodatnie: gronkowce (Staphylococcus) i paciorkowce (Streptococcus, Enterococcus) Ćwiczenie 3. Laseczki Gram-dodatnie - Bacillus, Clostridium Ćwiczenie 4. Bakterie spiralne: Treponema, Borrelia, Leptospira, Vibrio, oraz Helicobacter, Campylobacter Ćwiczenie 5. + KOLOKWIUM 1 (z ćwiczeń 1-4, waga oceny x 5) Ziarniaki Gram-ujemne (Neisseria, Moraxella), oraz Gram-ujemne pałeczki małe (Haemophilus, Bordetella, Legionella) Ćwiczenie 6. Gram-ujemne pałeczki fermentujące (rodzina Enterobacteriaceae) Ćwiczenie 7. Gram-ujemne pałeczki niefermentujące oraz Gram-ujemne pałeczki bezwzględnie beztlenowe (Bacteroides, Prevotella, Porphyromonas, Fusobacterium) Ćwiczenie 8. + KOLOKWIUM 2 (z ćwiczeń 5-7, waga oceny x 5) Prątki Mycobacterium, promieniowce, maczugowce Corynebacterium. Ćwiczenie 9. Antybiotyki cz. I (uwaga: sprawdzian testowy z podstawowych grup antybiotyków, waga oceny x 2) Ćwiczenie 10. Antybiotyki cz. II. FERIE ZIMOWE 23.XII.2016 do 01.I.2017 Ćwiczenie KOLOKWIUM 3 (z ćwiczeń 8-10, waga oceny x 5). Sterylizacja i dezynfekcja. Mycie rąk + wymazy do ćwiczenia z flory fizjologicznej Ćwiczenie 12. Flora fizjologiczna (oraz odczyty posiewów flory i mycia rąk) Ćwiczenie 13. Podstawy diagnostyki chorób grzybiczych. ZIMOWA SESJA EGZAMINACYJNA 30.I II.2017 ZIMOWA PRZERWA MIĘDZYSEMESTRALNA 13.II II X X X X.2016 Grupa Pn. 07.XI.2016 Grupa Wt. 08.XI.2016 Grupa Śr. 09.XI.2016 Grupa Cz 03.XI.2016 Grupa Pt. 04.XI XI XI XI 02.XII XII XII I I I.2017 Semestr letni 2016/ ćw x 2 h 1 ćw x 1 h Razem 19 h Ćwiczenie KOLOKWIUM 4 (z ćwiczeń 11-13, waga oceny x 5) Choroby przenoszone drogą płciową Ćwiczenie 15. Zakażenia górnych dróg oddechowych Ćwiczenie 16. Zakażenia dolnych dróg oddechowych Ćwiczenie 17. Zakażenia układu moczowego Ćwiczenie KOLOKWIUM 5 (z ćwiczeń 14-17, waga oceny x 5) Zakażenia skóry i tkanek miękkich Ćwiczenie 19. Zapalenie żołądka i jelit oraz zatrucia pokarmowe Ćwiczenie 20. Zakażenia ośrodkowego układu nerwowego Ćwiczenie 21. Bakteriemia i sepsa FERIE WIOSENNE Ćwiczenie 21. Bakteriemia i sepsa Ćwiczenie 22. (ćwiczenie 45-minutowe) KOLOKWIUM 6 (z ćwiczeń 18-21, waga oceny x 5) Ćwiczenie 23. EGZAMIN PRAKTYCZNY LETNIA SESJA EGZAMINACYJNA 14.VI 02.VII II II 3.III III III III III IV.2017 Grupa Pn. 10.IV.2017 Grupa Wt. 11.IV.2017 Grupa Śr. 12.IV.2017 Grupa Cz. 20.IV.2017 Grupa Pt. 21.IV IV V.2017 Ćwiczenia z mikrobiologii odbywają się w sali ćwiczeń Katedry i Zakładu Mikrobiologii Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu WYKŁADY: wtorek sala wykładowa, czwartek sala wykładowa - 1 -

2 SZCZEGÓŁOWY PLAN ĆWICZEŃ Z MIKROBIOLOGII semestr zimowy 2016/2017 ĆWICZENIE 1 (03.X - 07.X. 2016) TEMAT: MORFOLOGIA BAKTERII. METODY BARWIENIA PREPARATÓW. Organizacja i dyscyplina pracy w czasie ćwiczeń z mikrobiologii. Typy mikroskopów używanych na ćwiczeniach: świetlny, z ciemnym polem widzenia, fluorescencyjny. Morfologia bakterii. Metody barwienia preparatów mikroskopowych: barwienie proste, złożone, pozytywne, negatywne, negatywno-pozytywne. Sporządzanie i oglądanie w mikroskopie świetlnym preparatów z hodowli bakterii; barwienie metodą Grama (Staphylococcus sp., Bacillus sp, Escherichia coli) Demonstracja gotowych preparatów z bakterii w mikroskopie świetlnym, w ciemnym polu i fluorescencyjnym. ĆWICZENIE 2 (10.X 14.X. 2016) TEMAT: ZIARNIAKI GRAM-DODATNIE: GRONKOWCE I PACIORKOWCE Charakterystyka i chorobotwórczość Staphylococcus aureus, Staph.epidermidis, Staph.saprophyticus. Charakterystyka i chorobotwórczość Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus z gr. orale, Enterococcus sp. Demonstracja hodowli na agarze z krwią, opis morfologii kolonii, rodzaje hemolizy. Demonstracja gotowych preparatów z omawianych bakterii w mikroskopie świetlnym Testy identyfikacyjne dla gronkowców: wytwarzanie katalazy, CF (wykonanie), wrażliwość na nowobiocynę i furazolidon, test koagulazowy (demonstracja), ID32 Staph do odczytu, Crystal GP - demonstracja. Testy identyfikacyjne dla paciorkowców: wrażliwość na bacytracynę i optochinę, szereg biochemiczny dla enterokoków, wykrywanie antygenów grupowych (demonstracja Slidex Strepto Kit), Api20Strep do odczytu, Crystal GP -demonstracja. ĆWICZENIE 3 (17.X 21.X. 2016) TEMAT: LASECZKI GRAM-DODATNIE: BACILLUS, CLOSTRIDIUM. Charakterystyka i chorobotwórczość laseczek: Bacillus anthracis, Clostridium tetani, Clostridium difficile, Clostridium botulinum, Clostridium perfringens. Metody hodowli bakterii beztlenowych anaerostat fizyczny i chemiczny, generatory atmosfery beztlenowej Schemat profilaktyki pre- i poekspozycyjnej przy podejrzeniu tężca. Demonstracja hodowli laseczek beztlenowych na podłożach wybiórczych: Agar Schaedler a z krwią, bulion tioglikolanowy. Demonstracja Bacillus subtilis na Agarze zwykłym morfologia kolonii laseczek na wybranych podłożach. Demonstracja gotowych preparatów bakteryjnych w mikroskopie świetlnym. Demonstracja testów identyfikacyjnych dla bakterii beztlenowych - odczyt testów API 20A, demonstracja Crystal ANR

3 ĆWICZENIE 4 (24.X 28.X. 2016) TEMAT: BAKTERIE SPIRALNE: TREPONEMA, BORRELIA, LEPTOSPIRA, VIBRIO, HELICOBACTER, CAMPYLOBACTER Charakterystyka i chorobotwórczość Treponema pallidum, Borrelia recurrentis, Borrelia burgdorferi, Leptospira, Vibrio, Campylobacter jejuni, Helicobacter pylori. Demonstracja bezpośredniego preparatu bioptatu z żołądka z Helicobacter pylori. Demonstracja hodowli Campylobacter i Helicobacter. Oglądanie gotowych preparatów z Campylobacter i Helicobacter. Demonstracja preparatu srebrzonego z Treponema pallidum Demonstracja Leptospira w mikroskopie z ciemnym polem widzenia. ĆWICZENIE 5 + KOLOKWIUM 1 (z ćwiczeń 1-4) (grupy poniedziałkowe 7.XI.2016, grupy wtorkowe 8.XI.2016, grupy środowe 9.XI.2016, grupy czwartkowe 3.XI,2016 grupy piątkowe 4.XI.2016) TEMAT: ZIARNIAKI GRAM-UJEMNE (NEISSERIA, MORAXELLA) ORAZ GRAM- UJEMNE PAŁECZKI MAŁE: HAEMOPHILUS, BORDETELLA, LEGIONELLA Charakterystyka i chorobotwórczość rodzaju Neisseria i Moraxella Charakterystyka i chorobotwórczość Gram(-) pałeczek małych: Haemophilus, Bordetella, Legionella Aktualny kalendarz szczepień dotyczący bakterii Neisseria, Bordetella, Haemophilus Omówienie testu z czynnikami wzrostowymi BX i BV dla Haemophilus influenzae Demonstracja hodowli bakterii na podłożach Neisseria i Moraxella na Agarze z krwią, Haemophilus na podłożu Cassmana (podłoże czekoladowe) Demonstracja testów identyfikacyjnych: Crystal NH, Api NH do identyfikacji Neisseria meningitidis i Haemophilus influenzae Różnicowanie Moraxella catarrhalis od szczepów Neisseria wchodzących w skład flory fizjologicznej górnych dróg oddechowych test BC na agarze Muller-Hintona (MH) Oglądanie gotowych preparatów ĆWICZENIE 6 (14.XI 18.XI. 2016) TEMAT: GRAM-UJEMNE PAŁECZKI FERMENTUJĄCE: ENTEROBACTERIACEAE Charakterystyka i chorobotwórczość pałeczek rodziny Enterobacteriaceae: Salmonella, Shigella, Escherichia, Proteus, Klebsiella, Enterobacter. Demonstracja hodowli bakterii na podłożach wybiórczych: Mac Conkey a i SS (Enterobacteriaceae) Morfologia kolonii pałeczek Gram-ujemnych Enterobacteriaceae na wybranych podłożach Demonstracja gotowych preparatów bakteryjnych w mikroskopie świetlnym Identyfikacja Gram-ujemnych pałeczek- odczyt testów ID32GN, demonstracja Crystal ENF

4 ĆWICZENIE 7 (21.XI 25.XI.2016) TEMAT: GRAM-UJEMNE PAŁECZKI NIEFERMENTUJĄCE: PSEUDOMONAS, ACINETOBACTER, STENOTROPHOMONAS ORAZ GRAM-UJEMNE PAŁECZKI BEZWZGLĘDNIE BEZTLENOWE: BACTEROIDES, PORPHYROMONAS, PREVOTELLA Charakterystyka i chorobotwórczość pałeczek niefermentujących: Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Stenotrophomonas maltophilia. Charakterystyka i chorobotwórczość Gram-ujemnych bakterii bezwzględnie beztlenowych (Bacteroides, Prevotella, Porphyromonas, Fusobacterium). Demonstracja hodowli bakterii tlenowych i beztlenowych na podłożach wybiórczych: agar Muller-Hintona (MH), Mac Conkey a (MC) i Schaedler a obserwacja morfologii kolonii bakteryjnych Demonstracja gotowych preparatów w mikroskopie świetlnym. Identyfikacja Gram-ujemnych pałeczek niefermentujących: odczyt testów ID32GN i Crystal ENF. Test na wytwarzanie oksydazy (metodą paskową!) i barwników dla G(-) pałeczek niefermentujących. Demonstracja i identyfikacja Gram-ujemnych pałeczek bezwzględnie beztlenowych: odczyt testów API 20 A dla Bacteroides fragilis, demonstracja testu Crystal ANR. ĆWICZENIE 8 (28.XI 2.XII. 2016) + KOLOKWIUM 2 ( z ćwiczeń 5-7) TEMAT: PRĄTKI Mycobacterium, PROMIENIOWCE Actinomyces, Nocardia, MACZUGOWCE Corynebacterium. Charakterystyka i chorobotwórczość maczugowców Corynebacterium diphtheriae. Szczepionka DPT (Diphtheria Pertussis - Tetanus). Podział taksonomiczny prątków Charakterystyka i chorobotwórczość Mycobacterium tuberculosis oraz mykobakterii MOTT. Postacie kliniczne gruźlicy, diagnostyka, szczepienia (BCG), próby tuberkulinowe Odporność śródzakaźna fenomen Kocha Charakterystyka i chorobotwórczość Actinomyces spp. i Nocardia spp. Demonstracja hodowli i gotowych preparatów: Corynebacterium. Demonstracja hodowli i gotowych preparatów Actinomyces spp. i Nocardia spp. Testy identyfikacyjne dla maczugowców (ApiCoryne), dla promieniowców (API 20A). Demonstracja hodowli prątków na podłożu Loewensteina-Jensena: Mycobacterium smegmatis, Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium tuberculosis Oglądanie preparatów plwociny od chorego prątkującego barwionych metodą Ziehl-Neelsena (czynnik wiązkowy cord factor). Oznaczanie wrażliwości prątków na tuberkulostatyki demonstracja antybiogramu

5 ĆWICZENIE 9 (5.XII 9.XII. 2016) + SPRAWDZIAN TESTOWY WEJŚCIÓWKA (ze znajomości podstawowych grup antybiotyków) TEMAT: ANTYBIOTYKI część I. MECHANIZMY DZIAŁANIA ANTYBIOTYKÓW Charakterystyka najważniejszych grup antybiotyków - mechanizm działania, spektrum przeciwbakteryjne, farmakokinetyka: antybiotyki beta-laktamowe, aminoglikozydy, tetracykliny, makrolidy, ketolidy, linkozamidy, glikopeptydy, fluorochinolony, sulfonamidy, nitroimidazole, tygecyklina, polimyksyny (kolistyna), oksazolidynony (linezolid). Metody oznaczania wrażliwości bakterii na antybiotyki - Metoda dyfuzyjno-krążkowa - Metoda seryjnych rozcieńczeń w podłożu bulionowym MH oznaczanie MIC i MBC leku (demonstracja) - Metoda E-testów oznaczanie MIC leku - Metoda rozcieńczenia leku w pożywce Loewensteina Jensena dla prątków gruźlicy demonstracja Wykonanie antybiogramu metodą dyfuzyjno-krążkową dla wybranych szczepów bakterii: - Staphylococcus aureus MRSA z ropy zakażenie rany poopreacyjnej - Enterococcus HLAR z moczu zakażenie układu moczowego - Klebsiella pneumoniae ESBL+ z plwociny zapalenie płuc związane z wentylacją mechaniczną ĆWICZENIE 10 (12.XII 16.XII. 2016) TEMAT: ANTYBIOTYKI część II. MECHANIZMY OPORNOŚCI BAKTERII Omówienie wybranych mechanizmów oporności bakterii na antybiotyki: MRS, MLS B, VISA, VRSA, HLAR, VRE, GRE, MBL, ESBL, KPC Odczyt i interpretacja antybiogramów z poprzedniego ćwiczenia. Odczyt antybiogramów przygotowanych metodą ATB dla różnych szczepów bakterii. Wykonanie testu z cefinazą wykrywanie beta-laktamaz u Moraxella. Demonstracja antybiogramów z różnymi mechanizmami oporności bakterii: MRSA, MLS B, ESBL Demonstracja E-testu (VRE) oraz demonstracja testu z EDTA (MBL)..FERIE ZIMOWE

6 ĆWICZENIE 11 (9.I 13.I. 2017) + KOLOKWIUM 3 (z ćwiczeń 8-10) TEMAT: STERYLIZACJA i DEZYNFEKCJA MYCIE RĄK. POBIERANIE WYMAZÓW DO ĆWICZEŃ Z FLORY FIZJOLOGICZNEJ. Omówienie metod sterylizacji i dezynfekcji oraz preparatów stosowanych w antyseptyce. Doświadczenie: higieniczne mycie rąk (mycie + jednokrotna dezynfekcja) - jedna płytka agarowa dla zespołu dwóch studentów. Pobieranie wymazów do ćwiczeń z flory fizjologicznej: wymaz z nosa, gardła, ucha, spojówki oka, skóry suchej i wilgotnej. ĆWICZENIE 12 (16.I 20.I. 2017) TEMAT: FLORA FIZJOLOGICZNA Omówienie roli flory endogennej człowieka. Chorobotwórczość i anatomiczne rozmieszczenie flory fizjologicznej człowieka. Omówienie pojęć: kolonizacja, nosicielstwo, zakażenie oportunistyczne. Ocena skuteczności higienicznego mycia rąk odczyt doświadczenia Morfologia kolonii stanowiących florę fizjologiczną różnych miejsc: opis morfologii, wykonanie i oglądanie barwionych preparatów różnych typów drobnoustrojów. ĆWICZENIE 13 (23.I 27.I. 2017) TEMAT: PODSTAWY DIAGNOSTYKI CHORÓB GRZYBICZYCH. Omówienie najczęściej występujących przypadków grzybic miejscowych i układowych oraz czynników etiologicznych (Candida, Cryptococcus, Aspergillus). Omówienie metod pobierania, przesyłania i zasad hodowli grzybów chorobotwórczych. Charakterystyka najważniejszych grup leków przeciwgrzybiczych: polieny (nystatyna, natamycyna, amfoterycyna B), imidazole, triazole, antymetabolity (5-fluorocytozyna), echinokandyny. Identyfikacja grzybów drożdżopodobnych: - obserwacja morfologii hodowli na podłożu Sabouraud a i Chromagar Candida, - obserwacja blastospor i artrospor w preparatach barwionych metodą Grama, - odczyt testu filamentacji (wykonanie preparatów natywnych), - obserwacja charakterystycznych struktur (chlamydospor) w mikrohodowli, - odczyt testu ID 32 C. - demonstracja ustalenia wartości MIC dla Candida - E-test Grzyby pleśniowe i dermatofity: - obserwacja morfologii hodowli Aspergillus i Penicillium na podłożu Czapka, - obserwacja gotowych preparatów dermatofitów w laktofenolu (Trichophyton, Epidermophyton, Microsporum).. SESJA I ZIMOWA PRZERWA MIĘDZYSEMESTRALNA

7 ĆWICZENIE 14 (20.II 24.II. 2017) + KOLOKWIUM 4 (z ćwiczeń 11-13) TEMAT: CHOROBY PRZENOSZONE DROGĄ PŁCIOWĄ Część teoretyczna Omówienie zakażeń przenoszonych drogą płciową oraz czynników etiologicznych STD. Część praktyczna ćwiczenie demonstracyjne Diagnostyka kiły: - USR i TPHA do odczytu i interpretacji - FTA-ABS i ELISA do omówienia - preparat srebrzony z tkanki mózgowej Diagnostyka rzeżączki (GU): - hodowla gonokoków na podłożu Roiron - wykonanie testu na oksydazę - demonstracja preparatu z ropy rzeżączkowej - omówienie testu przesiewowego Gonoline Duo 2 Diagnostyka rzęsistkowicy: - demonstracja preparatu z Trichomonas vaginalis (Giemsa) Diagnostyka NGU: - hodowla Mycoplasma hominis - Mycoplasma IST-test do odczytu i interpretacji - Chlamydia trachomatis (zakażona linia komórkowa Mc Coy a - zdjęcie) Diagnostyka grzybicy dróg rodnych - hodowla grzybów Candida na podłożu Sabourauda z antybiotykiem UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DIAGNOSTYCZNYCH DO ĆWICZENIA Z ZAKAŻEŃ GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH 1. wymaz z gardła (angina paciorkowcowa Streptococcus pyogenes) posiew na ½ AK 2. wymaz z gardła (zakażenie wirusowe flora fizjologiczna) posiew na ½ AK ĆWICZENIE 15 (27.II 3.III. 2017) TEMAT: ZAKAŻENIA GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH Omówienie postaci klinicznych oraz etiologii zakażeń górnych dróg oddechowych. Schemat badania mikrobiologicznego. Pobieranie i przesyłanie próbek do badania. Odczyt posiewów próbek z zakażeń górnych dróg oddechowych: 1. wymaz z gardła (angina paciorkowcowa) Streptococcus pyogenes wykonanie preparatu mikroskopowego barwionego metodą Grama z własnego posiewu, test wrażliwości na bacytracynę (demonstracja), test do wykrywania antygenów S. pyogenes (Slidex Strepto Kit) 2. wymaz z gardła (zakażenie wirusowe/flora fizjologiczna) demonstracja testu z optochiną Demonstracja hodowli wybranych patogenów górnych dróg oddechowych: Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Moraxella catarrhalis, Corynebacterium diphtheriae Demonstracja bezpośredniego z wymazu z gardła chorego na anginę Plaut-Vincent a. Demonstracja szybkich testów w kierunku anginy ropnej, zakażenia RSV. UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DO ĆWICZENIA Z ZAKAŻEŃ DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH 1. plwocina (pozaszpitalne zapalenie płuc - Streptococcus pneumoniae) posiew na AK, MC 2. A) wydzielina oskrzelowa (VAP Acinetobacter baumannii) posiew na ½ AK, ½ MC, ½ SAB B) krew (VAP Acinetobacter baumannii) - posiew na ½ AK, ½ MC, ½ SAB - 7 -

8 ĆWICZENIE 16 (6.III 10.III. 2017) TEMAT: ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH Omówienie postaci klinicznych oraz etiologii zakażeń dolnych dróg oddechowych. Schemat badania mikrobiologicznego. Zasady pobierania i transportu próbek z dróg oddechowych. Odczyt posiewów próbek z zakażeń dolnych dróg oddechowych: 1. plwocina (zapalenie płuc, pacjent pozaszpitalny) Streptococcus pneumoniae wykonanie preparatu barwionego metodą Grama z posiewów własnych, test z optochiną (demonstracja), antybiogram. 2. wydzielina z drzewa oskrzelowego + krew (pacjent hospitalizowany OIT, VAP) Acinetobacter baumannii wykonanie preparatu mikroskopowego barwionego metodą Grama z posiewów własnych, odczyt testu ID32GN, antybiogram. Demonstracja szybkich testów w kierunku Legionella. RSV UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DIAGNOSTYCZNYCH DO ZAKAŻEŃ UKŁADU MOCZOWEGO 1. mocz (pacjent ambulatoryjny, Escherichia coli) - Posiew ilościowy na AK, MC. 2. mocz (pacjent zacewnikowany, Proteus mirabilis) - Posiew ilościowy na AK, MC. ĆWICZENIE 17 (13.III 17.III. 2016) TEMAT: ZAKAŻENIA UKŁADU MOCZOWEGO Omówienie czynników etiologicznych zakażeń układu moczowego. Schemat badania mikrobiologicznego moczu. Pobieranie i przesyłanie materiałów diagnostycznych do badania zakażeń układu moczowego. Odczyt posiewów materiałów diagnostycznych: mat.1. identyfikacja E. coli - test ID32GN, interpretacja antybiogramu, mat.2. identyfikacja P. mirabilis - test ID32GN, interpretacja antybiogramu demonstracja hodowli wybranych patogenów układu moczowego: E.coli, Klebsiella spp., Pseudomonas aeruginosa, Staph.epidermidis, Staph.saprophyticus, Enterococcus spp., Candida spp. demonstracja testu Golda wynik dodatni i ujemny. demonstracja posiewu moczu zanieczyszczonego demonstracja gotowych zestawów do półilościowego posiewu moczu: Uriline, Uricult. UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DIAGNOSTYCZNYCH DO ĆWICZENIA Z ZAKAŻEŃ SKÓRY I TKANEK MIĘKKICH 1. wymaz z ropnia podprzeponowego (pacjent z ropniem podprzeponowym, Bacteroides fragilis + E. coli), posiew na podłoża: AK, MC, ½ agar Schaedlera z krwią (tioglikolan jałowy do demonstracji). 2. ropa z czyraka na wymazówce (pacjent z czyrakiem mnogim, Staphylococcus aureus), posiew na podłoża: AK, MC, ½ agar Schaedlera z krwią (tioglikolan jałowy do demonstracji). 3. Wymaz z rany oparzeniowej (pacjent po rozległym oparzeniu, Pseudomonas aeruginosa), posiew na podłoża: AK, MC, bulion cukrowy

9 ĆWICZENIE 18 (20.III 24.III. 2017) + KOLOKWIUM 5 (z ćwiczeń 14-17) TEMAT: ZAKAŻENIA SKÓRY i TKANEK MIĘKKICH. Część teoretyczna Omówienie czynników etiologicznych zakażeń skóry i tkanek miękkich. Schemat badania mikrobiologicznego ropy. Pobieranie i przesyłanie próbek do badania. Część praktyczna Odczyt posiewów próbek ze zmian ropnych, identyfikacja szczepów, interpretacja antybiogramów. Mat.1. identyfikacja Bacteroides odczyt API 20A; identyfikacja E. coli: odczyt ID32GN; interpretacja antybiogramu dla E.coli. Mat.2. identyfikacja Staphylococcus: wykonanie testu na katalazę, demonstracja testu na obecność koagulazy, odczyt ID32Staph, interpretacja antybiogramu Mat.3. identyfikacja Pseudomonas aeruginosa: wykonanie testu na oksydazę metodą paskową (!), odczyt ID32GN, interpretacja antybiogramu. Demonstracja hodowli wybranych patogenów zakażeń skóry i tkanek miękkich: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Bacteroides fragilis. Demonstracja gotowych preparatów w/w patogenów w mikroskopie świetlnym. UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DO ĆWICZENIA Z ZAKAŻEŃ PRZEWODU POKARMOWEGO 1. Wymaz z odbytu (badanie nosicielstwa Salmonella/Shigella) posiew na ½ MC, ½ SS, bulion SF 2. Wymaz z odbytu (biegunka, ograniczona flora fizjologiczna) posiew na ½ MC, ½ SS, bulion SF ĆWICZENIE 19 (27.III 31.III. 2017) TEMAT: ZAPALENIE ŻOŁĄDKA I JELIT ORAZ ZATRUCIA POKARMOWE Omówienie czynników etiologicznych zakażeń przewodu pokarmowego. Schemat badania mikrobiologicznego kału. Pobieranie i przesyłanie materiałów diagnostycznych. Odczyt posiewów materiałów diagnostycznych: Mat.1.identyfikacja Salmonella: test ID32GN, demonstracja typowania serologicznego Salmonella metodą aglutynacji szkiełkowej. Mat.2. identyfikacja E. coli: test ID32GN, demonstracja hodowli wybranych patogenów układu pokarmowego: Salmonella, Shigella, Escherichia coli, Yersinia enterocolitica, Campylobacter jejuni. Demonstracja gotowych preparatów w/w patogenów w mikroskopie świetlnym. demonstracja testu do wykrywania rotawirusów i adenowirusów w kale: Rota-Adeno Kit. demonstracja testu kasetkowego do wykrywania toksyn Clostridium difficile w kale UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DIAGNOSTYCZNYCH DO ĆWICZENIA Z ZAKAŻEŃ OUN Materiał 1. Pacjent z zapaleniem opon mózgowo-rdzeniowych (Neisseria meningitidis): 1a) PMR na podłożu transportowo-wzrostowym Meningomedium - DEMONSTRACJA 1b) PMR w jałowej probówce (PILOTKA) studenci samodzielnie wykonują preparat bezpośredni barwiony metodą Grama 1c) krew na podłożu transportowo-wzrostowym - posiew na podłoża: ½AK, ½MC, ½Casman a

10 Materiał 2. Pacjent z zapaleniem opon mózgowo-rdzeniowych (Streptococcus pneumoniae): 2a) PMR na podłożu transportowo-wzrostowym Meningomedium - DEMONSTRACJA 2b) PMR w jałowej probówce (PILOTKA) studenci samodzielnie wykonują preparat bezpośredni barwiony metodą Grama 2c) krew na podłożu transportowo-wzrostowym - posiew na podłoża: ½AK, ½MC, ½Casman a. ĆWICZENIE 20 (3.IV 7.IV.2016) TEMAT: ZAKAŻENIA OŚRODKOWEGO UKŁADU NERWOWEGO Część teoretyczna Omówienie czynników etiologicznych zakażeń OUN. Schemat badania mikrobiologicznego płynu mózgowo-rdzeniowego. Pobieranie i przesyłanie próbek PMR do badań mikrobiologicznych. Część praktyczna Odczyt posiewów próbek krwi i płynu mózgowo-rdzeniowego (!PMR posiewa sala ćwiczeń!) Barwienie i oglądanie preparatów z PMR (pilotka) z poprzedniego ćwiczenia Materiał 1. identyfikacja Neisseria meningitidis: preparat mikroskopowy z posiewów własnych barwiony metodą Grama, wykonanie testu na oksydazę, odczyt testu API NH, demonstracja testu Crystal NH. Materiał 2. identyfikacja Streptococcus pneumoniae: preparat mikroskopowy z posiewów własnych barwiony metodą Grama, demonstracja testu wrażliwości na optochinę, odczyt testu API 20 Strep, demonstracja testu Crystal GP, odczyt i interpretacja antybiogramu dla Streptococcus pneumoniae z OUN Demonstracja hodowli wybranych patogenów zakażeń centralnego układu nerwowego: Neisseria meningitidis (AK), Streptococcus agalactiae (AK), Escherichia coli (MC), Haemophilus influenzae (Casman), Candida albicans (SAB) Demonstracja gotowych preparatów z w/w drobnoustrojów w mikroskopie świetlnym. UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DO ĆWICZENIA Z ZAKAŻEŃ OGÓLNOUSTROJOWYCH (SEPSA) - dla grup poniedziałkowych, wtorkowych i środowych. Materiał 1. Pacjent z podejrzeniem zakażenia krwi (Klebsiella pneumoniae): krew na podłożu transportowowzrostowym po 24 godz. inkubacji (krew dodatnia) - posiew na podłoża AK i MC Materiał 2. Pacjent z zakażeniem odcewnikowym (Staphylococcus epidermidis): krew na podłożu transportowowzrostowym po 24 godz. Inkubacji (krew dodatnia) - posiew na podłoża AK i MC Grupy czwartkowe i piątkowe, ze względu na ferie wiosenne, będą miały przygotowane ćwiczenia

11 ĆWICZENIE 21 (grupy poniedziałkowe 10.IV.2017, grupy wtorkowe 11.IV.2017, grupy środowe 12.IV.2017, grupy czwartkowe 20.IV.2017, grupy piątkowe 21.IV.2017) TEMAT: ZAKAŻENIA OGÓLNOUSTROJOWE - BAKTERIEMIA I SEPSA Część teoretyczna Omówienie czynników etiologicznych zakażeń ogólnoustrojowych Schemat badania mikrobiologicznego krwi - pobieranie i przesyłanie próbek do badania. Omówienie czynników ryzyka rozwinięcia się zakażenia krwi u pacjenta hospitalizowanego Część praktyczna Odczyt posiewów próbek krwi oraz interpretacja antybiogramów. Materiał 1. identyfikacja Klebsiella pneumoniae: demonstracja testu Crystal ENF, odczyt testu ID32GN, odczyt antybiogramu (szczep ESBL+) Materiał 2. identyfikacja Staphylococcus epidermidis: demonstracja Crystal GP, odczyt testu ID32Staph, odczyt antybiogramu (szczep MRCNS) Demonstracja hodowli wybranych patogenów zakażeń ogólnoustrojowych: Streptococcus agalactiae, Streptococcus salivarius, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecalis, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter cloacae, Candida albicans Demonstracja gotowych preparatów z w/w drobnoustrojów w mikroskopie świetlnym. Demonstracja podłoży transportowo-namnażających do posiewu płynów ustrojowych. Demonstracja aparatu Bact Alert do hodowli próbek płynów ustrojowych. ĆWICZENIE 22 (24.IV 28.IV. 2017) KOLOKWIUM 6 (z ćwiczeń 18-21)!!! Ćwiczenie 45-minutowe ĆWICZENIE 23 (8.V 12.V. 2017) TEMAT: EGZAMIN PRAKTYCZNY (samodzielne ustawienie gotowego preparatu w mikroskopie świetlnym, ocena preparatu przez studenta, omówienie wyniku badania mikrobiologicznego wylosowanego przez studenta) UWAGA: Materiały teoretyczne do ćwiczeń znajdują się na stronie internetowej: Wrocław, dr n med. Katarzyna Jermakow, adiunkt dydaktyczny, prof. dr hab. Grażyna Gościniak, kierownik Katedry Mikrobiologii,