PROGRAM ĆWICZEŃ Z MIKROBIOLOGII DLA STUDENTÓW II ROKU WYDZIAŁU LEKARSKIEGO W ROKU AKADEMICKIM 2015/2016 semestr zimowy

Transkrypt

1 Wrocław, PROGRAM ĆWICZEŃ Z MIKROBIOLOGII DLA STUDENTÓW II ROKU WYDZIAŁU LEKARSKIEGO W ROKU AKADEMICKIM 2015/2016 semestr zimowy Ćwiczenia z mikrobiologii odbywają się w sali ćwiczeń Katedry i Zakładu Mikrobiologii Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu WYKŁADY: Wtorek sala wykładowa Czwartek sala wykładowa OGÓLNY PLAN ĆWICZEŃ Z MIKROBIOLOGII semestr zimowy 2015/2016 Semestr zimowy 2015/ tyg x 2 h = 26 h Ćwiczenie 1. Morfologia bakterii. Metody barwienia. Budowa mikroskopu Ćwiczenie 2. Ziarniaki Gram-dodatnie: gronkowce i paciorkowce Ćwiczenie 3. Ziarniaki Gram-ujemne (Neisseria). Gram-ujemne pałeczki małe (Haemophilus, Bordetella, Brucella) Ćwiczenie 4. Gram-ujemne pałeczki fermentujące (Enterobacteriaceae) Ćwiczenie 5. + KOLOKWIUM 1 (z ćw. 1-4) Gram-ujemne pałeczki niefermentujące oraz Gram-ujemne pałeczki bezwzględnie beztlenowe Ćwiczenie 6. Bakterie spiralne: Treponema, Borrelia, Leptospira, Vibrio, Helicobacter, Campylobacter Ćwiczenie 7. Prątki, promieniowce, Corynebacterium. Ćwiczenie 8. Sterylizacja i dezynfekcja. Mycie rąk + wymazy do ćw.9. Ćwiczenie 9. Flora fizjologiczna (oraz odczyty posiewów flory i mycia rąk) Ćwiczenie KOLOKWIUM 2 (z ćw. 5-9) Laseczki (Bacillus, Clostridium) Ćwiczenie 11. Podstawy diagnostyki chorób grzybiczych. 1.X, 05.X 09.X X 16.X X 23.X X 30.X XI 06.XI XI 13.XI XI 20.XI XI 27.XI XI 04.XII XII 11.XII XII 18.XII Ćwiczenie 12. Antybiotyki cz. I FERIE ZIMOWE Ćwiczenie 13. Antybiotyki cz. II. 23.XII I I 08.I I 15.I

2 Poniedziałek (I) (II) (III) Wtorek (I) (II) Środa (I) (II) Czwartek (I) (II) (III) Piątek (I) SZCZEGÓŁOWY PLAN ĆWICZEŃ Z MIKROBIOLOGII semestr zimowy 2015/2016 ĆWICZENIE 1 (01.X oraz 05.X 09.X. 2015) TEMAT: MORFOLOGIA BAKTERII. METODY BARWIENIA PREPARATÓW. Organizacja i dyscyplina pracy w czasie ćwiczeń z mikrobiologii. Typy mikroskopów używanych na ćwiczeniach: świetlny, z ciemnym polem widzenia, fluorescencyjny. Morfologia bakterii. Metody barwienia preparatów mikroskopowych: barwienie proste, złożone, pozytywne, negatywne, negatywno-pozytywne. Sporządzanie i oglądanie w mikroskopie świetlnym preparatów z hodowli bakterii, barwienie metodą Grama (Staphylococcus sp., Bacillus sp, Escherichia coli) Demonstracja gotowych preparatów z bakterii w mikroskopie świetlnym, w ciemnym polu i fluorescencyjnym. ĆWICZENIE 2 (12.X 16.X. 2015) TEMAT: ZIARNIAKI GRAM-DODATNIE: GRONKOWCE I PACIORKOWCE Charakterystyka i chorobotwórczość Staphylococcus aureus, Staph.epidermidis, Staph.saprophyticus. Charakterystyka i chorobotwórczość Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae, Str.pneumoniae, Str. z gr. orale, Enterococcus sp. Demonstracja hodowli na agarze z krwią, opis morfologii kolonii, rodzaje hemolizy. Demonstracja gotowych preparatów z omawianych bakterii w mikroskopie świetlnym. Testy identyfikacyjne dla gronkowców: wytwarzanie katalazy, CF (wykonanie), wrażliwość na nowobiocynę i furazolidon, test koagulazowy (demonstracja), ID32 Staph do odczytu, Crystal GP - demonstracja. Testy identyfikacyjne dla paciorkowców: wrażliwość na bacytracynę i optochinę, szereg biochemiczny dla enterokoków, wykrywanie antygenów grupowych (demonstracja Slidex Strepto Kit), Api20Strep do odczytu, Crystal GP -demonstracja

3 ĆWICZENIE 3 (19.X 23.X. 2015) TEMAT: ZIARNIAKI GRAM-UJEMNE (NEISSERIA). GRAM-UJEMNE PAŁECZKI MAŁE: HAEMOPHILUS, BORDETELLA, BRUCELLA Charakterystyka i chorobotwórczość rodzaju Neisseria i Moraxella Charakterystyka i chorobotwórczość Gram(-) pałeczek małych: Haemophilus, Bordetella, Brucella Aktualny kalendarz szczepień dotyczący bakterii Neisseria, Bordetella, Haemophilus Omówienie testu z czynnikami wzrostowymi BX i BV dla Haemophilus influenzae Demonstracja hodowli bakterii na podłożach Neisseria i Moraxella na Agarze z krwią, Haemophilus na podłożu Cassmana (podłoże czekoladowe) Demonstracja testów identyfikacyjnych: Crystal NH, Api NH do identyfikacji Neisseria meningitidis i Haemophilus influenzae Różnicowanie Moraxella catarrhalis od szczepów Neisseria wchodzących w skład flory fizjologicznej górnych dróg oddechowych test BC na agarze Muller-Hintona (MH). Oglądanie gotowych preparatów ĆWICZENIE 4 (26.X 30.X. 2015) TEMAT: GRAM-UJEMNE PAŁECZKI FERMENTUJĄCE: ENTEROBACTERIACEAE Charakterystyka i chorobotwórczość pałeczek rodziny Enterobacteriaceae: Salmonella, Shigella, Escherichia coli, Proteus, Klebsiella, Enterobacter. Demonstracja hodowli bakterii na podłożach wybiórczych: Mac Conkey a i SS (Enterobacteriaceae) Morfologia kolonii pałeczek Gram-ujemnych Enterobacteriaceae na wybranych podłożach. Demonstracja gotowych preparatów bakteryjnych w mikroskopie świetlnym. Identyfikacja Gram-ujemnych pałeczek- odczyt testów ID32GN, demonstracja Crystal ENF. ĆWICZENIE 5 (02.XI 06.XI. 2015) + KOLOKWIUM 1 (z ćwiczeń 1 4) TEMAT: GRAM-UJEMNE PAŁECZKI NIEFERMENTUJĄCE: PSEUDOMONAS, ACINETOBACTER ORAZ GRAM-UJEMNE PAŁECZKI BEZWZGLĘDNIE BEZTLENOWE: BACTEROIDES, PORPHYROMONAS, PREVOTELLA Charakterystyka i chorobotwórczość pałeczek niefermentujacych: Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Stenotrophomonas maltophilia. Charakterystyka i chorobotwórczość Gram-ujemnych bakterii bezwzględnie beztlenowych (Prevotella, Porphyromonas, Bacteroides, Fusobacterium). Demonstracja hodowli bakterii tlenowych i beztlenowych na podłożach wybiórczych: agar Muller- Hintona (MH), Mac Conkey a (MC) i Schaedler a obserwacja morfologii kolonii Demonstracja gotowych preparatów bakteryjnych w mikroskopie świetlnym. Identyfikacja Gram-ujemnych pałeczek niefermentujących: odczyt testów ID32GN i Crystal ENF. Test na wytwarzanie oksydazy (metodą paskową!) i barwników dla G(-) pałeczek niefermentujących. Demonstracja i identyfikacja Gram-ujemnych pałeczek bezwzględnie beztlenowych: odczyt testów API 20 A dla Bacteroides fragilis, demonstracja testu Crystal ANR

4 ĆWICZENIE 6 (09.XI 13.XI. 2015) TEMAT: BAKTERIE SPIRALNE: TREPONEMA, BORRELIA, LEPTOSPIRA, VIBRIO, HELICOBACTER, CAMPYLOBACTER Charakterystyka i chorobotwórczość Treponema pallidum, Leptospira, Vibrio, Borrelia recurrentis, Borrelia burgdorferi, Campylobacter jejuni, Helicobacter pylori. Demonstracja bezpośredniego preparatu bioptatu z żołądka z Helicobacter pylori. Demonstracja hodowli Campylobacter i Helicobacter. Oglądanie gotowych preparatów z Campylobacter i Helicobacter. Demonstracja preparatu srebrzonego z Treponema pallidum Demonstracja Leptospira w mikroskopie z ciemnym polem widzenia. ĆWICZENIE 7 (16.XI 20.XI. 2015) TEMAT: PRĄTKI Mycobacteriun, PROMIENIOWCE Actinomyces, Nocardia, MACZUGOWCE Corynebacterium. Charakterystyka i chorobotwórczość maczugowców Corynebacterium diphtheriae. Szczepionka DPT (diphtheria, pertussis, tetanus). Podział taksonomiczny prątków Charakterystyka i chorobotwórczość Mycobacterium tuberculosis oraz mykobakterii MOTT. Postacie kliniczne gruźlicy, diagnostyka, szczepienia (BCG), próby tuberkulinowe Odporność śródzakaźna fenomen Kocha Charakterystyka i chorobotwórczość Actinomyces spp. i Nocardia spp. Demonstracja hodowli i gotowych preparatów: Corynebacterium. Demonstracja hodowli i gotowych preparatów Actinomyces spp. i Nocardia spp. Testy identyfikacyjne dla maczugowców (ApiCoryne), dla promieniowców (API 20A). Demonstracja hodowli prątków na podłożu Loewensteina-Jensena: Mycobacterium smegmatis, Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium tuberculosis Oglądanie preparatów plwociny od chorego prątkującego barwionych metodą Ziehl-Neelsena (czynnik wiązkowy cord factor). Oznaczanie wrażliwości prątków na tuberkulostatyki demonstracja antybiogramu. ĆWICZENIE 8 (23.XI 27.XI. 2015) TEMAT: STERYLIZACJA i DEZYNFEKCJA MYCIE RĄK. POBIERANIE WYMAZÓW DO ĆWICZEŃ Z FLORY FIZJOLOGICZNEJ. Omówienie metod sterylizacji i dezynfekcji oraz preparatów stosowanych w antyseptyce. Doświadczenie: higieniczne mycie rąk (mycie + jednokrotna dezynfekcja) - jedna płytka agarowa dla zespołu dwóch studentów. Pobieranie wymazów do ćwiczeń z flory fizjologicznej: wymaz z nosa, gardła, ucha, spojówki oka, skóry suchej i wilgotnej

5 ĆWICZENIE 9 (30.XI 04.XII. 2015) TEMAT: FLORA FIZJOLOGICZNA Omówienie roli flory endogennej człowieka. Chorobotwórczość i anatomiczne rozmieszczenie flory fizjologicznej człowieka. Omówienie pojęć: kolonizacja, nosicielstwo, zakażenie oportunistyczne. Ocena skuteczności higienicznego mycia rąk odczyt doświadczenia Morfologia kolonii stanowiących florę fizjologiczną różnych miejsc: opis morfologii, wykonanie i oglądanie barwionych preparatów różnych typów drobnoustrojów. ĆWICZENIE 10 (07.XII 11.XII. 2015) + KOLOKWIUM 2 ( z ćwiczeń 5-9) TEMAT: LASECZKI. Charakterystyka i chorobotwórczość laseczek: Bacillus anthracis, Clostridium tetani, Clostridium difficile, Clostridium botulinum, Clostridium perfringens. Schemat profilaktyki pre- i poekspozycyjnej przy podejrzeniu tężca. Demonstracja hodowli laseczek beztlenowych na podłożach wybiórczych: Agar Schaedler a z krwią, bulion tioglikolanowy. Demonstracja hodowli Bacillus subtilis na Agarze zwykłym. Morfologia kolonii laseczek na wybranych podłożach. Demonstracja gotowych preparatów bakteryjnych w mikroskopie świetlnym. Demonstracja testów identyfikacyjnych dla bakterii beztlenowych - odczyt testów API 20A, demonstracja Crystal ANR. ĆWICZENIE 11 (14.XII 18.XII. 2015) TEMAT: PODSTAWY DIAGNOSTYKI CHORÓB GRZYBICZYCH. Omówienie najczęściej występujących przypadków grzybic miejscowych i układowych oraz czynników etiologicznych (Candida, Cryptococcus, Aspergillus). Omówienie pobierania, przesyłania i zasad hodowli grzybów chorobotwórczych. Charakterystyka najważniejszych grup leków przeciwgrzybiczych: polieny (nystatyna, natamycyna, amfoteryczna B), imidazole, triazole, antymetabolity (5-fluorocytozyna), echinokandyny. Identyfikacja grzybów drożdżopodobnych: - obserwacja morfologii hodowli na podłożu Sabouraud a i Chromagar Candida, - obserwacja blastospor i artrospor w preparatach barwionych metodą Grama, - odczyt testu filamentacji (wykonanie preparatów natywnych), - obserwacja charakterystycznych struktur (chlamydospor) w mikrohodowli, - odczyt testu ID 32 C. - demonstracja ustalenia wartości MIC dla Candida - E-test Grzyby pleśniowe i dermatofity: - obserwacja morfologii hodowli Aspergillus i Penicillium na podłożu Czapka, - obserwacja gotowych preparatów dermatofitów w laktofenolu (Trichophyton, Epidermophyton, Microsporum)

6 ĆWICZENIE 12 (04.I 08.I. 2016) TEMAT: ANTYBIOTYKI część I. MECHANIZMY DZIAŁANIA ANTYBIOTYKÓW Charakterystyka najważniejszych grup antybiotyków (mechanizm i sposób działania, spektrum przeciwbakteryjne, farmakokinetyka: antybiotyki beta-laktamowe, aminoglikozydy, makrolidy, ketolidy, linkozamidy, glikopeptydy, fluorochinolony, sulfonamidy, tetracykliny, tigecyklina, polimyksyny (kolistyna), oksazolidynony (linezolid),. Metody oznaczania wrażliwości bakterii na antybiotyki - Metoda dyfuzyjno-krążkowa - Metoda seryjnych rozcieńczeń w podłożu bulionowym MH oznaczanie MIC i MBC leku (demonstracja) - Metoda E-testów oznaczanie MIC leku - Metoda rozcieńczenia leku w pożywce Loewensteina Jensena dla prątków gruźlicy demonstracja Wykonanie antybiogramu metodą dyfuzyjno-krążkową dla wybranych szczepów bakterii: - Staphylococcus aureus MRSA z ropy zakażenie rany poopreacyjnej - Enterococcus HLAR z moczu zakażenie układu moczowego - Klebsiella pneumoniae ESBL+ z plwociny zapalenie płuc ĆWICZENIE 13 (11.I 15.I. 2016) TEMAT: ANTYBIOTYKI część II. MECHANIZMY OPORNOŚCI BAKTERII Omówienie wybranych mechanizmów oporności bakterii na antybiotyki: MRS, MLS B, VISA, VRSA, HLAR, VRE, MBL, ESBL, KPC Odczyt i interpretacja antybiogramów z poprzedniego ćwiczenia. Odczyt antybiogramów przygotowanych metodą ATB dla różnych szczepów bakterii. Wykonanie testu z cefinazą wykrywanie beta-laktamaz u Moraxella. Demonstracja antybiogramów z różnymi mechanizmami oporności bakterii: MRSA, MLS b, ESBL Demonstracja e-testu: VRE Demonstracja testu z kwasem boronowym: MBL Wrocław, Kierownik Katedry i Zakładu Mikrobiologii, prof. dr hab. Grażyna Gościniak Adiunkt Dydaktyczny, dr n med. Katarzyna Jermakow Starszy technik analityki med. Agnieszka Sarna - 6 -

7 Wrocław, PROGRAM ĆWICZEŃ Z MIKROBIOLOGII DLA STUDENTÓW II ROKU WYDZIAŁU LEKARSKIEGO W ROKU AKADEMICKIM 2015/2016 semestr letni Ćwiczenia z mikrobiologii odbywają się w sali ćwiczeń Katedry i Zakładu Mikrobiologii Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu WYKŁADY: Wtorek sala wykładowa Czwartek sala wykładowa OGÓLNY PLAN ĆWICZEŃ Z MIKROBIOLOGII semestr letni 2015/2016 Semestr letni 2015/ tyg x 2 h 1 tyg x 1 h Razem 19 h Ćwiczenie 14. STD Choroby przenoszone drogą płciową Ćwiczenie KOLOKWIUM 3 (z ćw.10-13) Zakażenia górnych dróg oddechowych Ćwiczenie 16. Zakażenia dolnych dróg oddechowych Ćwiczenie 17. Zakażenia układu moczowego Ćwiczenie KOLOKWIUM 4 (z ćw.14-17) Zakażenia skóry i tkanek miękkich 15.II 19.II II 26.II II 04.III III 11.III III 18.III FERIE WIOSENNE 24.III 30. III Ćwiczenie 19. Zapalenie żołądka i jelit oraz zatrucia pokarmowe Ćwiczenie 20. Zakażenia ośrodkowego układu nerwowego Ćwiczenie 21. Bakteriemia i sepsa Ćwiczenie 22. (ćwiczenie 45-minutowe) KOLOKWIUM 5 (z ćw.18-21) Ćwiczenie 23. EGZAMIN PRAKTYCZNY SESJA LETNIA 04.IV 08.IV IV 15.IV IV 22.IV IV 29.IV V 13.V VI 03.VII

8 ĆWICZENIE 14 (15.II 19.II. 2016) TEMAT: CHOROBY PRZENOSZONE DROGĄ PŁCIOWĄ Część teoretyczna Część praktyczna ćwiczenie demonstracyjne Diagnostyka kiły: - USR i TPHA do odczytu i interpretacji - FTA-ABS i ELISA do omówienia - preparat srebrzony z tkanki mózgowej Omówienie zakażeń przenoszonych drogą płciową oraz czynników etiologicznych STD. Diagnostyka rzeżączki (GU): - hodowla gonokoków na podłożu Roiron - wykonanie testu na oksydazę - demonstracja preparatu z ropy rzeżączkowej - omówienie testu przesiewowego Gonoline Duo 2 Diagnostyka rzęsistkowicy: - demonstracja preparatu z Trichomonas vaginalis (Giemsa) Diagnostyka NGU: - hodowla Mycoplasma hominis - Mycoplasma IST-test do odczytu i interpretacji - Chlamydia trachomatis (zakażona linia komórkowa Mc Coy a - zdjęcie) Diagnostyka grzybicy dróg rodnych. - hodowla grzybów Candida na podłożu Sabourauda z antybiotykiem UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DIAGNOSTYCZNYCH DO ĆWICZENIA Z ZAKAŻEŃ GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH 1. wymaz z gardła (podejrzenie anginy) posiew na ½ AK 2. wymaz z gardła (bóle gardła) posiew na ½ AK ĆWICZENIE 15 (22.II 26.II. 2016) + KOLOKWIUM 3 (z ćwiczeń 10-13) TEMAT: ZAKAŻENIA GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH Omówienie postaci klinicznych oraz etiologii zakażeń górnych dróg oddechowych. Schemat badania mikrobiologicznego. Pobieranie i przesyłanie próbek do badania. Odczyt posiewów próbek z zakażeń górnych dróg oddechowych: 1. wymaz z gardła (angina) wykonanie preparatu mikroskopowego barwionego metodą Grama z własnego posiewu, test wrażliwości na bacytracynę (demonstracja), test do wykrywania antygenów S. pyogenes (Slidex Strepto Kit) 2. wymaz z gardła demonstarcja testu z optochiną 3. Demonstracja hodowli wybranych patogenów górnych dróg oddechowych: Staphylococcus aureus, Corynebacterium diphtheriae 4. Demonstracja bezpośredniego z wymazu z gardła chorego na anginę Plaut-Vincent a. 5. Demonstracja szybkich testów w kierunku anginy ropnej, zakażenia RSV. 6. Analiza przykładowych wyników badań mikrobiologicznych UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DIAGNOSTYCZNYCH DO ĆWICZENIA Z ZAKAŻEŃ DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH 1. plwocina (pozaszpitalne zapalenie płuc) posiew na AK, MC 2. A) wydzielina oskrzelowa (zapalenie płuc, pacjent wentylowany) posiew na ½ AK, ½ MC, ½ SAB B) krew (zapalenie płuc, pacjent wentylowany) - posiew na ½ AK, ½ MC, ½ SAB - 8 -

9 ĆWICZENIE 16 (29.II 04.III. 2016) TEMAT: ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH Omówienie postaci klinicznych oraz etiologii zakażeń dolnych dróg oddechowych. Schemat badania mikrobiologicznego. Zasady pobierania i transportu próbek z dróg oddechowych. Odczyt posiewów próbek z zakażeń dolnych dróg oddechowych: 1. plwocina (zapalenie płuc, pacjent pozaszpitalny) wykonanie preparatu barwionego metodą Grama z posiewów własnych, test z optochiną (demonstracja), antybiogram. 2. wydzielina z drzewa oskrzelowego + krew (pacjent hospitalizowany, VAP) wykonanie preparatu mikroskopowego barwionego metodą Grama z posiewów własnych, odczyt testu ID32GN, antybiogram. 3. Demonstracja szybkich testów w kierunku Legionella. 4. Analiza przykładowych wyników badań mikrobiologicznych UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DIAGNOSTYCZNYCH DO ZAKAŻEŃ UKŁADU MOCZOWEGO 1. mocz (pacjent ambulatoryjny) - Posiew ilościowy na AK, MC. 2. mocz (pacjent zacewnikowany) - Posiew ilościowy na AK, MC. ĆWICZENIE 17 (07.III 11.III. 2016) TEMAT: ZAKAŻENIA UKŁADU MOCZOWEGO Omówienie czynników etiologicznych zakażeń układu moczowego. Schemat badania mikrobiologicznego moczu. Pobieranie i przesyłanie materiałów diagnostycznych do badania zakażeń układu moczowego. Analiza przykładowych wyników badań mikrobiologicznych Odczyt posiewów materiałów diagnostycznych: materiał.1. - test ID32GN, interpretacja antybiogramu, materiał.2. - test ID32GN, interpretacja antybiogramu, demonstracja hodowli wybranych patogenów układu moczowego: E.coli, Klebsiella spp., Pseudomonas aeruginosa, Staph.epidermidis, Staph.saprophyticus, Enterococcus spp., Candida spp. demonstracja testu Golda wynik dodatni i ujemny. demonstracja posiewu moczu zanieczyszczonego demonstracja gotowych zestawów do półilościowego posiewu moczu: Uriline, Uricult. UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DIAGNOSTYCZNYCH DO ĆWICZENIA Z ZAKAŻENIA SKÓRY i TKANEK MIĘKKICH 1. wymaz z ropnia podprzeponowego (pacjent z ropniem podprzeponowym), posiew na podłoża: AK, MC, ½ agar Schaedlera z krwią (tioglikolan jałowy do demonstracji). 2. ropa z czyraka na wymazówce (pacjent z czyrakiem mnogim), posiew na podłoża: AK, MC, ½ agar Schaedlera z krwią (tioglikolan jałowy do demonstracji). 3. Wymaz z rany oparzeniowej (pacjent po rozległym oparzeniu), posiew na podłoża: AK, MC, bulion cukrowy

10 ĆWICZENIE 18 (14.III 18.III. 2016) + KOLOKWIUM 4 (z ćwiczeń 14-17) TEMAT: ZAKAŻENIA SKÓRY i TKANEK MIĘKKICH. Część teoretyczna Omówienie czynników etiologicznych zakażeń skóry i tkanek miękkich. Schemat badania mikrobiologicznego ropy. Pobieranie i przesyłanie próbek do badania. Część praktyczna Odczyt posiewów próbek ze zmian ropnych, identyfikacja szczepów, interpretacja antybiogramów. Materiał.1. odczyt API 20A; odczyt ID32GN; interpretacja antybiogramu. Materiał.2. wykonanie testu na katalazę, demonstracja testu na obecność koagulazy, odczyt ID32Staph, interpretacja antybiogramu Materiał.3. wykonanie testu na oksydazę metodą paskową (!), odczyt ID32GN, interpretacja antybiogramu. Demonstracja hodowli wybranych patogenów zakażeń skóry i tkanek miękkich: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Bacteroides fragilis. Demonstracja gotowych preparatów w/w patogenów w mikroskopie świetlnym. Analiza przykładowych wyników badań mikrobiologicznych UWAGA! ZE WZGLĘDU NA FERIE WIOSENNE MATERIAŁY DIAGNOSTYCZNE Z ZAKAŻEŃ PRZEWODU POKARMOWEGO ZOSTANĄ PRZYGOTOWANE NA KOLEJNE ĆWICZENIA ĆWICZENIE 19 (04.IV 08.IV. 2016) TEMAT: ZAPALENIE ŻOŁĄDKA I JELIT ORAZ ZATRUCIA POKARMOWE Omówienie czynników etiologicznych zakażeń przewodu pokarmowego. Schemat badania mikrobiologicznego kału. Pobieranie i przesyłanie materiałów diagnostycznych. Odczyt posiewów materiałów diagnostycznych: Materiał.1. test ID32GN, demonstracja typowania serologicznego Salmonella metodą aglutynacji szkiełkowej. Materiał.2. test ID32GN, demonstracja hodowli wybranych patogenów układu pokarmowego: Salmonella spp., Shigella spp., Escherichia coli, Yersinia enterocolitica, Campylobacter jejuni. demonstracja gotowych preparatów ww. patogenów w mikroskopie świetlnym. demonstracja testu do wykrywania rotawirusów i adenowirusów w kale: Rota-Adeno Kit. demonstracja testu kasetkowego do wykrywania toksyn Clostridium difficile w kale Analiza przykładowych wyników badań mikrobiologicznych UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DIAGNOSTYCZNYCH DO ĆWICZENIA Z ZAKAŻEŃ OUN Materiał 1. Pacjent z zapaleniem opon mózgowo-rdzeniowych: 1a) PMR na podłożu transportowo-wzrostowym Meningomedium - DEMONSTRACJA 1b) PMR w jałowej probówce (PILOTKA) studenci samodzielnie wykonują preparat bezpośredni barwiony metodą Grama 1c) krew na podłożu transportowo-wzrostowym - posiew na podłoża: ½AK, ½MC, ½Casman a. Materiał 2. Pacjent z zapaleniem opon mózgowo-rdzeniowych: 2a) PMR na podłożu transportowo-wzrostowym Meningomedium - DEMONSTRACJA

11 2b) PMR w jałowej probówce (PILOTKA) studenci samodzielnie wykonują preparat bezpośredni barwiony metodą Grama 2c) krew na podłożu transportowo-wzrostowym - posiew na podłoża: ½AK, ½MC, ½Casman a. ĆWICZENIE 20 (11.IV 15.IV.2016) TEMAT: ZAKAŻENIA OŚRODKOWEGO UKŁADU NERWOWEGO Część teoretyczna Omówienie czynników etiologicznych zakażeń OUN. Schemat badania mikrobiologicznego płynu mózgowo-rdzeniowego. Pobieranie i przesyłanie próbek PMR do badań mikrobiologicznych. Część praktyczna Odczyt posiewów próbek krwi i płynu mózgowo-rdzeniowego (!PMR posiewa sala ćwiczeń!) Barwienie i oglądanie preparatów z PMR (pilotka) z poprzedniego ćwiczenia Materiał 1. preparat mikroskopowy z posiewów własnych barwiony metodą Grama, wykonanie testu na oksydazę, odczyt testu API NH, demonstracja testu Crystal NH. Materiał 2. preparat mikroskopowy z posiewów własnych barwiony metodą Grama, demonstracja testu wrażliwości na optochinę, odczyt testu API 20 Strep, demonstracja testu Crystal GP, odczyt i interpretacja antybiogramu Demonstracja hodowli wybranych patogenów zakażeń centralnego układu nerwowego: Neisseria meningitidis(ak), Streptococcus agalactiae (AK), Escherichia coli (MC), Haemophilus influenzae (Casman), Candida albicans (SAB) Demonstracja gotowych preparatów z w/w drobnoustrojów w mikroskopie świetlnym. UWAGA! OPRACOWANIE MATERIAŁÓW DIAGNOSTYCZNYCH DO ĆWICZENIA Z ZAKAŻEŃ OGÓLNOUSTROJOWYCH (SEPSA). Materiał 1. Pacjent z podejrzeniem zakażenia krwi: krew na podłożu transportowo-wzrostowym po 24 godz. inkubacji (krew dodatnia) - posiew na podłoża AK i MC Materiał 2. Pacjent z podejrzeniem zakażenia odcewnikowego: krew na podłożu transportowowzrostowym po 24 godz. Inkubacji (krew dodatnia) - posiew na podłoża AK i MC ĆWICZENIE 21 (18.IV 22.IV. 2016) TEMAT: ZAKAŻENIA OGÓLNOUSTROJOWE - BAKTERIEMIA I SEPSA Część teoretyczna Omówienie czynników etiologicznych zakażeń ogólnoustrojowych Schemat badania mikrobiologicznego krwi - pobieranie i przesyłanie próbek do badania. Omówienie czynników ryzyka rozwinięcia się zakażenia krwi u pacjenta hospitalizowanego Część praktyczna Odczyt posiewów próbek krwi oraz interpretacja antybiogramów. Materiał 1. demonstracja testu Crystal ENF, odczyt testu ID32GN, odczyt antybiogramu Materiał 2. demonstracja Crystal GP, odczyt testu ID32Staph, odczyt antybiogramu

12 Demonstracja hodowli wybranych patogenów zakażeń ogólnoustrojowych: Streptococcus agalactiae, Streptococcus salivarius, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecalis, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter cloacae, Candida albicans Demonstracja gotowych preparatów z w/w drobnoustrojów w mikroskopie świetlnym. Demonstracja podłoży transportowo-namnażających do posiewu płynów ustrojowych. Demonstracja aparatu Bact Alert do hodowli próbek płynów ustrojowych. Analiza przykładowych wyników badań mikrobiologicznych ĆWICZENIE 22 (25.IV 29.IV. 2016) KOLOKWIUM 5 (z ćwiczeń 18-21)!!! Ćwiczenie 45-minutowe ĆWICZENIE 23 (9.V 13.V. 2016) TEMAT: EGZAMIN PRAKTYCZNY UWAGA: Materiały teoretyczne do ćwiczeń diagnostycznych znajdują się na stronie internetowej Katedry: Wrocław, Kierownik Katedry i Zakładu Mikrobiologii, prof. dr hab. Grażyna Gościniak Adiunkt Dydaktyczny, dr n med. Katarzyna Jermakow Starszy technik analityki med. Agnieszka Sarna