Komputerowe wspomaganie obrazowej diagnostyki medycznej (KWOD)



Podobne dokumenty
InŜynieria Biomedyczna

SIM (wykład 6) SZPITALNE SYSTEMY INFORMACYJNE (HIS RIS PACS)

Politechnika Krakowska im. Tadeusza Kościuszki. Karta przedmiotu. obowiązuje studentów rozpoczynających studia w roku akademickim 2013/2014

Obrazowanie MRI Skopia rtg Scyntygrafia PET

efekty kształcenia dla kierunku Elektronika studia stacjonarne drugiego stopnia, profil ogólnoakademicki

PRZEWODNIK PO PRZEDMIOCIE

Informatyka w medycynie Punkt widzenia kardiologa

Relacja zakresu nauk humanistyczno-społecznych z Krajową Inteligentną Specjalizacją

INNOWACYJNE ROZWIĄZANIA XXI W. SYSTEMY INFORMATYCZNE NOWEJ

PLAN STUDIÓW. efekty kształcenia

ELEKTRONICZNA PLATFORMA ZBIERANIA DANYCH RZECZYWISTYCH

Podstawowe badania obrazowe. Marcin Szulc Klinika Chorób Wewnętrznych, Nadciśnienia Tętniczego i Angiologii

Choroby wewnętrzne - pulmonologia Kod przedmiotu

PLATFORMA DO PRZETWARZANIA ZDJĘĆ TOMOGRAFII KOMPUTEROWEJ MÓZGU ORAZ ZDJĘĆ MAMMOGRAFICZNYCH WSPOMAGAJĄCA DIAGNOZOWANIE CHORÓB

Proponujemy kandydatom kształcenie w zakresie nowego programu INŻYNIERII BIOMEDYCZNEJ.

Transformacja wiedzy w budowie i eksploatacji maszyn

Październik 2013 Grupa Voxel

Egzamin / zaliczenie na ocenę*

Dziewięć dziesiątych w obliczu mechatronizacji techniki

Wykorzystanie standardów serii ISO oraz OGC dla potrzeb budowy infrastruktury danych przestrzennych

Od początku swojej działalności firma angażuje się w kolejne obszary rynku, by w krótkim czasie zyskiwać na nich status lidera.

Nakład pracy studenta bilans punktów ECTS Obciążenie studenta

Szczegółowy wykaz praktyk zawodowych Elektroradiologia II stopień.

Razem godzin w semestrze: Plan obowiązuje od roku akademickiego 2014/15 - zatwierdzono na Radzie Wydziału w dniu r.

KARTA PRAKTYK STUDENCKICH. Kierunek: Elektroradiologia Uniwersytetu Medycznego w Lublinie

Elektrofizjologiczne podstawy lokalizacji ogniska padaczkowego. Piotr Walerjan

POLITECHNIKA LUBELSKA Wydział Elektrotechniki Kierunek: INFORMATYKA II stopień niestacjonarne i Informatyki. Część wspólna dla kierunku

PROGRAM NAUCZANIA PRZEDMIOTU FAKULTATYWNEGO NA WYDZIALE LEKARSKIM I ROK AKADEMICKI 2014/2015 PRZEWODNIK DYDAKTYCZNY

Widzenie komputerowe (computer vision)

Wojewódzki Specjalistyczny Szpital Dziecięcy w Kielcach. Szpitalny System Informatyczny

Radiologia. Obrazowanie diagnostyczne

LABORATORIUM JAKO OGNIWO PROFILAKTYKI

5 Moduył do wyboru II *[zobacz opis poniżej] 4 Projektowanie i konfiguracja sieci komputerowych Z

ROZWÓJ SYSTEMÓW SZTUCZNEJ INTELIGENCJI W PERSPEKTYWIE "PRZEMYSŁ 4.0"

Zdalne monitorowanie stanu pacjenta. Michał Ciesielski Orest Hrycyna

60 60 Egzamin / zaliczenie na ocenę* 1 1,5

Warszawa, dnia 7 czerwca 2019 r. Poz Rozporządzenie. z dnia 23 maja 2019 r.

Choroby wewnętrzne - gastroenterologia Kod przedmiotu

VII. ŚWIADCZENIA MEDYCYNY NUKLEARNEJ. LP. Nazwa świadczenia gwarantowanego Warunki realizacji świadczeń

Zagadnienia: Informatyczna Platforma Fuzji Badań Obrazowych Serca 27 listopada 2015 SCO Kiece KSS JP2 Kraków

Zestaw ćwiczeń laboratoryjnych z Biofizyki dla kierunku elektroradiologia w roku akademickim 2017/2018.

Elektrofizjologiczne podstawy lokalizacji ogniska padaczkowego. Piotr Walerjan PWSIM MEDISOFT

PROGRAM STUDIÓW PODYPLOMOWYCH Z PSYCHOLOGII KLINICZNEJ 1

TECHNIK ELEKTRONIKI I INFORMATYKI MEDYCZNEJ

KARTA PRAKTYKI... imię i nazwisko studenta numer albumu rok akademicki

SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA Realizowany w roku akademickim 2016/2017

Zagadnienia egzaminacyjne INFORMATYKA. stacjonarne. I-go stopnia. (INT) Inżynieria internetowa STOPIEŃ STUDIÓW TYP STUDIÓW SPECJALNOŚĆ

Zagadnienia egzaminacyjne INFORMATYKA. Stacjonarne. I-go stopnia. (INT) Inżynieria internetowa STOPIEŃ STUDIÓW TYP STUDIÓW SPECJALNOŚĆ

S YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma cje ogólne. Radiologia stomatologiczna

Onkologia - opis przedmiotu

Wytyczne postępowania dla lekarzy POZ i lekarzy medycyny pracy w zakresie raka nerki, pęcherza moczowego i prostaty 2011

Problemy i wyzwania analizy obszaru ICT

Co to jest termografia?

Informatyka Studia II stopnia

SYLABUS x 8 x

Opis efektów kształcenia dla modułu zajęć

KRAJOWY REJESTR NOWOTWORÓW ZINTEGROWANY SYSTEM REJESTRACJI NOWOTWORÓW ZŁOŚLIWYCH W POLSCE

5 Moduył do wyboru II *[zobacz opis poniżej] 4 Projektowanie i konfiguracja sieci komputerowych Z

Zestaw ćwiczeń laboratoryjnych z Biofizyki dla kierunku Elektroradiologia w roku akademickim 2016/2017.

Zastosowanie technologii Semantic Web w regionalnej sieci telemedycznej

Szczegółowy wykaz praktyk zawodowych Elektroradiologia I stopień SUM 2018_2019. Rok Semestr Zakres praktyki Liczba godzin

Medycyna rodzinna - opis przedmiotu

PRZEWODNIK PO PRZEDMIOCIE

Komputerowa diagnoza medyczna tworzenie i interpretowanie. prof. dr hab. inż. Andrzej Walczak

Przykłady opóźnień w rozpoznaniu chorób nowotworowych u dzieci i młodzieży Analiza przyczyn i konsekwencji

Ocena i porównanie funkcjonalności aplikacji medycznych Prezentacja Platformy

Dlaczego Pomoc na Raka w ofercie AXA?

PROGRAM STAŻU SZKOLENIOWEGO DLA NAUCZYCIELI W ZAWODZIE TECHNIK ELEKTRORADIOLOG

TELEMEDYCYNA w województwie lubuskim STRATEGIA WDRAŻANIA

Radiologia. udział w ćwiczeniach 2*3 h. konsultacje - h - 15 h 9 h Bilans nakładu pracy studenta: RAZEM: przygotowanie do - h. ćwiczeń.

dokształcającego prowadzonego przez Centralny Ośrodek Koordynujący lub wojewódzki ośrodek koordynujący w latach w zakresie

Kierunek Informatyka stosowana Studia stacjonarne Studia pierwszego stopnia

Systemy Informatyki Przemysłowej

U ług u i g teleme m dyc y zne n w w regi g on o a n lne n j słu u bi b e z dr d ow o i w a Mich c ał a K o K si s ed e owsk s i

Zagadnienia: 1. Partnerzy projektu 2. Badania obrazowe serca 3. Cele 4. Techniki obrazowe serca stosowane w Projekcie 5. Rezultaty

Kurs wybieralny: Zastosowanie technik informatycznych i metod numerycznych w elektronice

Controlling operacyjny i strategiczny

Informatyka- studia I-go stopnia

INŻYNIERIA OPROGRAMOWANIA

Zatwierdzono na Radzie Wydziału w dniu 11 czerwca 2015 r.

Opis efektów kształcenia dla modułu zajęć

M1_W04 M1_W10 K_W 01 M1_W01 M1_W02 M1_W10 K_W 02 M1_W05 M1_W03 K_W 03 M1_W08 M1_W11, M1_W12 M1_W01 M1_W02 M1_W03 M1_W07 M1_W10 M1_W01 M1_W07 M1_W10

dla rozwoju Województwa Świętokrzyskiego...

Karta (sylabus) modułu/przedmiotu Transport Studia I stopnia

ZAKŁAD INŻYNIERII BIOMEDYCZNEJ

Tematyka seminariów z informatyki dla studentów I roku kierunku lekarsko-dentystycznego w roku akademickim 2017/2018.

PODSTAWY BAZ DANYCH. 19. Perspektywy baz danych. 2009/2010 Notatki do wykładu "Podstawy baz danych"

Platforma ArPACS. Razem budujemy jakość w radiologii

2012/2013. PLANY STUDIÓW stacjonarnych i niestacjonarnych I-go stopnia prowadzonych na Wydziale Elektrotechniki, Automatyki i Informatyki

Podkowiańska Wyższa Szkoła Medyczna im. Z. i J. Łyko. Syllabus przedmiotowy 2018/ /23 r.

Podkowiańska Wyższa Szkoła Medyczna im. Z. i J. Łyko. Syllabus przedmiotowy 2016/ /2019

Hurtownie danych i business intelligence. Plan na dziś : Wprowadzenie do przedmiotu

Opis efektów kształcenia dla modułu zajęć

Razem godzin w semestrze: Plan obowiązuje od roku akademickiego 2016/17 - zatwierdzono na Radzie Wydziału w dniu r.

Rok akademicki: 2014/2015 Kod: JFM s Punkty ECTS: 2. Poziom studiów: Studia I stopnia Forma i tryb studiów: -

Maria Karlińska. Paweł Masiarz. Ryszard Mężyk. Zakład Informatyki Medycznej i Telemedycyny Warszawski Uniwersytet Medyczny

Spis treści. Analiza i modelowanie_nowicki, Chomiak_Księga1.indb :03:08

Wymiana doświadczeń Maciej Garmulewicz Wydział Informacji i Współpracy z Regionami

Transkrypt:

Komputerowe wspomaganie obrazowej diagnostyki medycznej (KWOD) Artur Przelaskowski MiNI, p. 506, arturp@mini.pw.edu.pl, tel. 7821 Notatki z wykładów (rysunki w dużej części ze źródeł internetowych oraz własnych)

Organizacja Wykład podstawowy dotyczące Uwarunkowania obrazowej diagnostyki medycznej (rola, systemy, ograniczenia) Elementy teorii (informatyki) obrazów Ogólna charakterystyka systemów CAD Szczególny opis narzędzi CAD Projekt Warunki realizacji, tematyka, ocena Zaliczenie System punktowy 0-60, gdzie egzamin 50% i projekt 50% (5 pkt za wstępny opis projektu do 23.03) Skala: 31(3), 37(3.5), 43(4), 49(4.5), 55(5) Konsultacje: poniedziałek godz. 16.15-17

Literatura A.Przelaskowski i inni, Komputerowe wspomaganie obrazowej diagnostyki medycznej, http://www.ire.pw.edu.pl/~arturp/dydaktyka/kwod/kwod_beta.pdf plus inne materiały W.Birkfellner, Applied medical image processing, CRC Press, 2011 A.P.Dhawan, Medical image analysis, Wiley & Sons, 2011 A.A.Bui, R.K.Taira, Medical imaging infomatics, Springer, 2010 J.S. Suri, R.M. Rangayyan, Breast imaging, mammography and computer-aided diagnosis of breast cancer, SPIE, 2006 E.Neri, D.Caramella, C.Bartolozzi (eds), Image Processing in radiology, Springer-Verlag 2008 R.Tadeusiewicz, J.Śmietański, Pozyskiwanie obrazów medycznych oraz ich przetwarzanie, analiza, automatyczne rozpoznawanie i diagnostyczna interpretacja, Wyd Studenckiego Towarzystwa Naukowego,Kraków, 2011 Ch.Guy, D.ffytche, An introduction to the principles of medical imaging, Imperial College Press, 2008 B.Pruszyński (red.), Diagnostyka obrazowa. Podstawy teoretyczne i metodyka badańwyd Lekarskie PZWL, 2000 M.R.Ogiela, R.Tadeusiewicz, Modern computational intelligence methods for the interpretation of medical images. Studies in Computational Intelligence 84. Springer-Verlag, Berlin-Heidelberg, 2008 R.N.Strickland, Image-processing techniques for tumor detection, Marcel Dekker, Inc. 2002 K.Najarian, R.Splinter, Biomedical signal and image processing, CRC Taylor & Francis, 2006 R.R.Rangayyan, Biomedical image analysis, CRC Press, 2005 A.Meyer-Baese, Pattern recognition in medical imaging, Academic Press, 2003 M.Sonka, V.Hlavac, R. Boyle, Image processing, analysis, and machine vision, PWS Publishing 1999

Szersze tło: technika/inżynieria/informatyka w medycynie

KWOD medyczny Uwarunkowania: diagnoza w kontekście terapii, ale też profilaktyki i rehabilitacji Istota: integracja (numerycznie i koncepcyjnie) procesów pomiaru, przetwarzania i przekazania informacji Metody: systemy (urządzenia, materiały, obsługa, informatyzacja), modele (teoria, empiria, heurystyki optymalizacji), informatyka (algorytmy, protokoły, implementacje, eksperyment, kryteria użyteczności)

Wspomaganie diagnostyki obrazowej Cel: wspieranie decyzji klinicznych lekarza poprzez zwiększenie walorów użytkowych zobrazowań (lepsze systemy obrazowania) poprawę efektywności interpretacji obrazów (mniejsza czasochłonność, uproszczenie - ułatwienie, klarowność, czułość, trafność, redukcja liczby błędów) zwiększenie klinicznej skuteczności podejmowanych decyzji Narzędzia system obrazowania medycznego (urządzenie, pacjent, obsługa, warunki pomiaru) zapis informacji, problem szkodliwości i uciążliwości badania, interfejsy, adaptacja on-line warunków zobrazowań, archiwizacja i telediagnostyka, standaryzacja procedur i protokołów itd. komputerowe systemy przetwarzania archiwa, sieć i protokoły, przetwarzanie rozproszone, telekonsultacje, standaryzacja strumieni, metod obróbki, formatów danych itp., deskryptory informacji, miary jakości, źródła i zasoby wiedzy, modele wiedzy i użytkowe, modele percepcji, inteligencja obliczeniowa i semantyczna, formy interakcji procedury - protokoły badań, komunikacja człowiek-maszyna, formy i metody użytkowania, rola kliniczna, aplikacyjność

Trudna rola inżyniera Specyfika wiedza medyczna, doświadczenie modele - ontologie, taksonomie, deskryptory semantyczne Kompleksowość cechy numeryczne, HVS, problem human equation opis semantyczny, algorytmy, wiarygodne i uniwersalne kryteria optymalizacji model protokołu diagnostycznego, kliniki problemu Integracja środowisko cyfrowe, komunikacja, sieć, zasoby systemy obrazowania, standaryzacja i obiektywizacja Współpraca inżynier lekarz: dwa światy?! jak rozumieć? jak integrować? Weryfikacja eksperyment w warunkach klinicznych charakterystyka pracy klinicystów numeryczne kryteria oceny, wnioskowanie, analiza statystyczna wyników wiarygodność kliniczna nowych technologii/metod wspomagania inżynier

Podstawowe definicje - diagnostyka Diagnostyka medyczna to rozpoznawanie chorób na podstawie stwierdzonych objawów Obrazowa diagnostyka medyczna, inaczej diagnostyka obrazowa to rozpoznawanie i weryfikacja chorobowych symptomów pozyskanych z aktualnych badań obrazowych stwierdzonych na podstawie danych obrazowych pochodzących z różnych systemów obrazowania medycznego weryfikowanych z uwzględnieniem wyników innych badań oraz dostępnych zasobów wiedzy

Diagnoza szczegółowo Diagnoza, inaczej rozpoznanie, to proces potwierdzenia istnienia choroby pacjenta (i ewentualnej jej identyfikacji) lub jej zaprzeczenia na podstawie objawów stwierdzonych w badaniu podmiotowym (wywiad chorobowy) przedmiotowym (fizykalnym - oglądanie, obmacywanie, opukiwanie, osłuchiwanie) dodatkowym, tj. na podstawie wyników badań laboratoryjnych i obrazowych Prawidłowe postawienie diagnozy umożliwia zastosowanie odpowiedniego leczenia

Podstawowe definicje - obrazowanie Obrazowanie diagnostyczne w medycynie to wizualizacja narządów wewnętrznych człowieka metodami nieinwazyjnymi za pomocą specjalistycznej aparatury diagnostycznej i odpowiednich metod badawczych Obrazy medyczne ukazujące wnętrze ludzkiego ciała pełnią bardzo ważną rolę w diagnostyce pacjentów, ale też wizualizacji i ocenie ilościowej skutków stosowania terapii czy rehabilitacji

System obrazowania medycznego Służy nieinwazyjnemu zobrazowaniu struktur ukrytych (wewnętrznych) oraz zmian fizjologicznych wizualizacja w celu percepcji symptomów (analiza jakościowa, norma-anormapatologia) lokalizacja i określanie kształtu zmian (zabiegi, radioterapia) analiza ilościowa (wymiarowanie, szacowanie parametrów dynamicznych) Podstawowe elementy urządzenie obrazujące oprzyrządowanie towarzyszące (śledzenie sygnałów, stosowanie środków cieniujących, itp.) podsystem teleinformatyczny stacja diagnostyczna komputerowe narzędzia wspomagające metody: protokoły badań, konsultacje, raportowanie

Podstawowe procedury kontrola jakości dobór profilu badania akwizycja przetwarzanie wstępne rekonstrukcja System obrazowania zapis do archiwum, komunikacja przetwarzanie użytkowe modelowanie i wizualizacja medycznego analiza jakościowa i ilościowa, porównawcza Podstawowe rodzaje metod prześwietleniowe i tomograficzne statyczne i dynamiczne Morfologiczne, czynnościowe, naczyniowe kontrastowe i bezkontrastowe ogólne i celowane obciążające i nieobciążające obrazy statyczne i wideo, zorientowane przestrzennie lub nie.

Metody Modele obrazowe Charakterystyka systemów obrazowania i systemów teleinformatycznych Reprezentacje rzadkie (oszczędne, uproszczone) Semantyka, odniesienia do wiedzy medycznej oraz informacji przypadku Modele percepcji treści obrazowej Formy interpretacji obrazów, powiązania z decyzjami terapeutycznymi Proces rozumienia obrazów POSTRZEGANIE, POZNANIE, WNIOSKOWANIE Modele rozszerzeń klinicznych Reprezentacja wiedzy medycznej, w tym diagnostycznej (ontologie, taksonomie) Formy wykorzystania obrazów w procedurach klinicznych Opis działań: protokoły, schematy decyzyjne, diagramy postepowania, uwarunkowania organizacyjne itp.. Opis przypadku: historia choroby, incydentu, wyniki badań diagnostycznych

Środowisko wspomagania Schemat orientacyjny, przykładowy

PROJEKTY

Realizacja projektu Ramy czasowe plan realizacji projektu (5pkt) 23 marca zaliczenie końcowe (25pkt) koniec semestru Zespoły 3 osobowe Tematyka związana z obrazową diagnostyką medyczną Formy pomysł na wspomaganie koncepcja, metoda, algorytm, realizacja narzędzia eksperymentalna weryfikacja, porównanie, ocena przydatności klinicznej teoretyczna analiza problemu klinicznego ograniczenia, potrzeby, wyzwania Warunki konsultacje całej grupy różnicowanie wkładu indywidualnego systematyczne wyjaśnianie wszelkich problemów prawo do publicznej dyskusji efektów/sprawozdań

A. Wspomaganie informatyczne (sieć, mobilne, bazy) A1.Referencyjna baza badań obrazowych z indeksowaniem (system CBIR wspierający diagnostykę) A2.Zdalne narzędzia wspomagania (telekonsultacja, telediagnostyka, opieka domowa) określone zastosowanie A3.Wspierające aplikacje przenośne (stany nagłe, przewlekłe, grupy ryzyka itp.) A4.Wspomaganie działań nagłych (udar, zawał, wypadek) A5.Profilaktyka, zdrowy tryb życia (serce, cukrzyca, sport) A6.Testerywiedzy klinicznej - portal A7.obrazowy/biometryczny kontroler (akwizycja sygnałów)...

Schemat medycznego systemu teleinformatycznego klient (specjalista) Zlecenie badań Laboratorium Pokój diagnoz CAD Wyniki Wi-Fi Raporty Rejestracja Miesięczne raporty wewnętrzne Miesięczne raporty zarządzania Rejestracj a Pacjenci Obsługa Wyniki badań System/Baza danych Analizy Wypisy badań Eksperci CAD Centrum medyczne łącza sieciowe klient mobilny CAD Inny ośrodek (klinika, centrum badawcze) indeksowanie, przeszukiwanie Baza Referencyjna Interaktywny kodek, inteligentne protokoły transmisji

B. Wspomaganie zastosowań radiografii cyfrowej/tk B1.Doskonalenie systemów diagnostycznych radiografii cyfrowej (mammo, radiografia płuc) akwizycja, poprawa percepcji, wykrywanie obszarów zainteresowania B2.Detekcja guzów, mikrozwapnień w mammografii (możliwy MammoViewer) B3.Charakterystyka utkania i symetrii sutka parametry liczbowe B4.Wspomaganie diagnostyki chorób płuc (ocena zmian śródmiąższowych, segmentacja płuc) B5.Detekcja raka płuc (radiografia, TK) B6.Wymiarowanie struktur kostnych...

MammoViewer MammoViewer: http://www.ire.pw.edu.pl/mammoviewer/

Śródmiąższowe choroby płuc ocena zwłóknień i ch-ka progresji zmian Powstają na skutek uszkodzenia wyściółki pęcherzyków płucnych, co prowadzi do zapalenia i włóknienia śródmiąższu Poszukiwanie cech teksturowych różnicujących obecność oraz stopień zaawansowania zmian włóknistych Realizacja projektu w środowisku Matlab, wtyczek do ImageJ itp. Efekt choroby Y. Arzhaeva, D.M.J. Tax, and B. van Ginneken, Improving computer-aided diagnosis of interstitial disease in chest radiographs by combining one-class and two-class classifiers., SPIE 2006, 2006

C.Wspomaganie diagnostyki udaru mózgu C1.Segmentacja i wizualizacja 3D wybranych struktur mózgu, symptomów udaru (TK lub MRI) C2. Lokalizacja i segmentacja struktur potencjalnie udarowych (wskazówki z badania neurologicznego) C3.Wizualizacja wczesnych symptomów udaru (możliwy Monitor udaru) C4.Automatyczne rozpoznanie obszarów hipodensyjnych C5.Schematyzacja działań przedszpitalnych i szpitalnych dot. przypadków udaru C6.Optymalizacja metod rekonstrukcji CT pod kątem diagnostyki udarowej

Detekcja udaru

Postępowanie przedszpitalne w przypadku udaru

D. Wspomagania inne D1.Wizualizacja i poprawa jakości badań bronchoskopowych D2.Poprawa percepcji badań USG (prostata, sutek, tarczyca itp.) D3.Segmentacja, wizualizacja wybranych struktur w USG (serce, wątroba itp.) D4.Analiza dynamiki kontrastu w badaniach perfuzyjnych (USG, MRI itp.) D5. Analiza badań termografii sutka D6.Ocena złośliwości zmian w sonomammografii D7.Ocena złośliwości zmian w bronchoskopii

przykłady

Możliwości termografii w obrazowaniu zmian rakowych

E. Modele ścieżek kliniczych Opracowanie procedur postępowania wybranych zadań klinicznych z wykorzystaniem obrazów

Ścieżki kliniczne Kompletny plan opieki zdrowotnej pacjenta/grupy pacjentów z problemem zdrowotnym, składający się ze zbioru zintegrowanych interwencji medycznych, realizowanych według ustalonego porządku i w określonym rygorze czasowym Realizacja przez wielodyscyplinarny zespół w celu Usprawnianie procesów Badanie/symulowanie procesów Automatyzowanie procesów Sposoby modelowania (biznesowych) Perspektywa organizacji (zależności pomiędzy statycznymi elementami struktury organizacyjnej) Perspektywa danych (zasoby) Perspektywa procesów (inicjujące zdarzenia, relacje pomiędzy procesami) Perspektywa funkcji (diagram funkcji, cele funkcji) Perspektywa usługi (diagram produktu)

Narzędzia UML (unified modeling language) język służący definicji, wizualizacji, projektowaniu i dokumentacji systemów informatycznych, w tym ścieżek klinicznych w systemach informatyki medycznej Diagramy struktury (obiekty, klasy, pakiety, struktury połączone, wdrożeniowe komponenty, rozkład lokalizacji) Diagramy dynamiki (przypadki użycia, czynności, stany, interakcje sekwencje, komunikacja, sterowanie, harmonogram) Integracja UML z ontologiami (Protege) GLIF - a Language for Sharing and Executing Clinical Guidelines Model orientowany obiektowo Schemat blokowy (algorytm) z wartościami atrybutów The Arden Syntax standard for clinical decision support (pod HL7).

Poziomy realizacji Poziom A: abstrakcyjny schemat blokowy Wspiera zapis koncepcji Wykorzystywany w nawigacji, przeglądaniu, dokumentacji Poziom B: reprezentacja obliczeniowa (numeryczna, formalna) Jednoznaczne składnia wyrażeń logicznych, danych pacjenta i koncepcji medycznych Może być interpretowana i analizowane pod kątem poprawności (rodzaj, zakres i sprawdzania semantyki) Poziom C: integracja w środowisku aplikacji Odwzorowanie danych i procedur modelu w EPR

Przykład leczenie kaszlu (GLIF)

Przykłady wykorzystania standardu Arden

UWARUNKOWANIA ZASTOSOWAŃ CAD

Technika medyczna Lata osiemdziesiąte XVIII w. Jean-François Pilâtre de Rozier respirator (projekty już w XV wieku sporządził Leonardo da Vinci) 1816 R.T. Laennec - stetoskop 1895 W.K. Roentgen - promieniowanie X 1903 W. Einthoven - elektrokardiografia 1931 A. Hyman - pierwszy stymulator serca 1938 A. Fleming (Florey, Chain) penicylina 1948 prace nad USG i medycyną nuklearną 1953 J.D. Watson i F. Crock - DNA 1967 C. Barnard - transplantacja serca 1971 G. Hounsfield tomograf komputerowy 1973 P.Mansfield, P.Lauterbur zastosowanie obrazowania MRI w medycynie Lata siedemdziesiąte początki komputeryzacji, SI Lata dziewięćdziesiąte Teleinformatyka XXI w Piąta fala (podręczne komputery, łączność, integracja)...

Komputerowa inteligencja Miejsce CAD... Modele wiedzy Algorytmizacja procedur, formalizacja ścieżek klinicznych Sztuczne organy Aparatura medyczna Informatyka medyczna Obrazowanie medyczne Systemy teleinformatyczne Informatyka obrazów Inżynieria rehabilitacji Biomateriały CAD Biopomiary Biotechnologie Biosystemy Biomechanika

Sztuczne organy Inżynieria rehabilitacji Biopomiary Aparatura medyczna Biosystemy Informatyka medyczna Biomechanika Obrazowanie medyczne Biomateriały Biotechnologie (skomputeryzowane) Obrazowanie Medyczne Radiografia, Tomografia Komputerowa, Rezonans Magnetyczny, Ultrasonografia, Medycyna Nuklearna (tomografia pozytonowa PET i jednego fotonu SPECT), metody optyczne i impedancyjne)

Tomografia komputerowa Technika transmisyjna z rozkładem liniowych współczynników tłumienia uśrednionych po grubości warstwy Wykorzystanie komputerów! (tomografia skomputeryzowana) Realne 3D: obrazy przekrojów, warstwowa rekonstrukcja wolumenu

Obrazowanie ultrasonograficzne 1948 początek badań nad medyczną USG początki zastosowań już w latach 1952-1961 najpowszechniejsza, najtańsza, najmniejsza, najbezpieczniejsza, naj... Nerka in vitro Niedomykalność zastawki mitralnej

Diagnostyczna medycyna nuklearna Lata 1948-1952-1963 Źródło w rozwoju techniki jądrowej (bomba atomowa) Substancje biologicznie czynne znakowane izotopami, badanie mechanizmów metabolizmu Obrazowanie struktur silnej lub słabiej uczestniczących w metabolizmie Obrazowanie funkcji poprzez śledzenie przebiegu gromadzenia i usuwania radiofarmeceutyków Scyntygrafia, SPECT i PET (izotopy krótkożyciowe, wybrane funkcje aktywności) Podobne metody rekonstrukcji jak w CT PET

Tomografia rezonansu magnetycznego Lata 1950-1980 metoda przyszłości? magnetyczny rezonans jądrowy (NMR) - brak jonizacji Akwizycja: silne pole magnetyczne (stałe), pobudzenia elektromagnetyczne, porządkowanie jądrowych momentów magnetycznych, generacja impulsów radiowych, pomiar 1D transformacji Fourierowskich, częstotliwościowe metody rekonstrukcji (odwrotna FT) Ciągły rozwój - szybkie sekwencje pobudzające, fmri, badania dyfuzyjne, spektroskopia Metody rekonstrukcji nieco odmienne od CT

Radiografia cyfrowa Akwizycja cyfrowa macierz obrazu Wyświetlanie Ekspozycja prom. X przetwarzanie cyfrowe gromadzenie ładunku w strukturze dyskretnej konwerter: X elektrony szybkie badanie, mniejsze dawki elastyczność akwizycji i wyświetlania cyfrowe gromadzenie i przeglądanie dystrybucja wielu dokładnych kopii ilościowa ocena danych\konsultacje Archiwizacja tkanka miękka tkanka kostna

(Quasi) Cyfrowa technologia fundamentem CAD Czytnik CR Drukarka laserowa filmów Stacja robocza CR-QC Przeglądarka

Wizualizacja metody grafiki komputerowej Trójwymiarowa rekonstrukcja stawu łokciowego na podstawie obrazów tomograficznych

Wsparcie metodami grafiki 60 % wzrost skuteczności diagnozy płodowych wad rozwojowych

Synergia zobrazowań

Nadzór telemetryczny Miniaturowe aparaty do monitorowania czynności układu sercowo-krążeniowego lub składu chemicznego krwi

Teleinformatyka medyczna Obszary odosobnione (wyspy), znajdujące się w stanach klęski żywiołowej itp Urządzenie: lekki, przenośny aparat 3D USG z łączami telekomunikacyjnymi

Sztuczne organy Inżynieria rehabilitacji Biopomiary Aparatura medyczna Biosystemy Informatyka medyczna Biomechanika Obrazowanie medyczne Biomateriały Biotechnologie Informatyka medyczna Kompleksowa wiedza o pacjencie (szpitalne systemy informacyjne) Wspomaganie decyzji (elementy sztucznej inteligencji, inteligencji komputerowej) Struktury danych, funkcje, wnioskowanie - modele wiedzy, ontologie, technologie bazodanowe Teorie: sygnałów, aproksymacji, informacji, analizy harmonicznej, geometrii analitycznej. Czytnik CR Drukarka laserowa filmów tacja robocza CR-QC Przeglądarka W latach 1998-2005 wzrost ekspansji technologii komputerowych w medycynie > 400%

Szpitalne systemy informacyjne cyfrowe gromadzenie i przeglądanie dystrybucja wielu dokładnych kopii ilościowa ocena danych\konsultacje

Medycyna w Internecie Dotyczy zastosowań internetowych i globalnych technologii sieciowych wykorzystanych w medycynie i publicznej opiece zdrowotnej Informatyka medyczna Internet Podnosi poziom powszechnej wiedzy medycznej, uczy odpowiedzialności za swoje zdrowie Problemy: - jakość informacji umieszczanej w Internecie; - brak standardów; - nierówne szanse dostępu Medycyna kliniczna Terapia Diagnoza Ewidencja Epidemiologia Publiczna opieka zdrowotna Profilaktyka Medycyna socjalna Edukacja medyczna/zdrowotna Epidemiologia

Dane z raportu OECD 2012

Wspomaganie diagnozy w mammografii wykrywanie mikrozwapnień przetwarzanie obrazu

rak piersi jest najczęstszym nowotworem złośliwym u kobiet! (9.173 zachorowań w 1995 w Polsce) badanie niezwykle trudne do zdiagnozowania wartość diagnostyczna mammografii zależy silnie od aparatury i pracy techników brak standardów potrzebny drugi opiniodawca (CAD?) CAD w badaniach mammograficznych

Przykład - detekcja zmian nowotworowych Badanie z roku 1996, diagnoza: brak zmian Badanie tej samej pacjentki z roku 1998, stwierdzona obecność nowotworu

KWDM, czyli techniki komputerowe - informatyczne i teleinformatyczne - na usługach radiologii, szerzej medycyny Integracja z systemami obrazowania medycznego oraz systemami teleinformatycznymi według modeli ścieżek klinicznych Rozwój telemedycyny i medycyny internetu dzięki nowym technologiom webowym, mobilnym, obliczeniowym, archiwizacyjnym itp. - absorpcja nowych technologii i postępująca integracja Rosnąca skala zastosowań, zapotrzebowania, nowych wyzwań - redukcja czasochłonności procedur, uproszczenie, przyspieszenie, ułatwienie dostępu, upowszechnienie, dostosowanie do najnowszych technologii i nowych problemów klinicznych itp.. Większa użyteczność i niezawodność systemów poprawa wiarygodności stosowanych technologii, specyficzności, obiektywizmu, powtarzalności, adaptacji Poprawa skuteczności interpretacji badań i podejmowanych decyzji standaryzacja procedur, większe i bardziej reprezentatywne zasoby, wiarygodne modele wiedzy, różnicujące deskryptory numeryczne, skuteczne wnioskowanie współdzielenie zasobów (archiwa cyfrowe, referencyjne bazy danych, edukacja, aktualizacja wiedzy w skali świata) formalne modele wiedzy dziedzinowej na poziomie świata algorytmizacja procedur klinicznych, doskonalsze metody komputerowej reprezentacji pomiarów (efektów badań) diagnostycznych

Rozwój koncepcji wspomagania Lata 60. - systemy eksperckie SI MYCIN - regułowy system ekspertowy stworzony w latach 70. na Uniwersytecie w Stanford (napisany został w Lisp) wspomaganie diagnozy i terapii zakażeń bakteryjnych krwi (pozytywnie zweryfikowany, skuteczność wyższa od lekarzy) wiele innych.. niestety, ich zastosowanie jest ograniczone przykłady

SI w medycynie system opieki pooperacyjnej - narzędzie wspomagające decyzje w oparciu o monitorowanie symptomów i obserwację oczekiwanych zmian system ekspertowy do zarządzania systemem sztucznego oddychania dla oddziałów intensywnej opieki sterowanie i monitorowanie: sterowanie urządzeń podtrzymujących funkcje życiowe, monitorowanie stanu pacjenta i ostrzeganie w sytuacjach kryzysowych system ekspertowy do określenia składu pozajelitowego odżywiania noworodków na oddziałach intensywnej opieki planowanie diety, optymalizacja działań w trakcie przebiegu terapii prognozowanie rozwoju choroby kontrola: sprawdzanie dawek leków, możliwych interakcji leków, potencjalnych przeciwwskazań uczenie, e-edukacja rozpoznawanie, wskazywanie symptomów, klasyfikacja stanu zdrowia, zachowań człowieka, sensu wypowiedzi wspomaganie decyzji: diagnozy medyczne, zalecenia dodatkowych testów, decyzje w nagłych przypadkach, wykrywanie symptomów patologii i wzorców zmian w sygnałach EKG, EMG, EEG i innych

Analiza obrazów medycznych Początki w latach 70 - Analiza obrazów medycznych Obliczenie frakcji wyrzutowej jako klinicznie użytecznego wskaźnika - M.W. Stmuss et al., "A Scintigrapliic Method for Measuring Left Ventricular Ejection Fraction in Man Without Cardiac Catheterization," Am. J. Cardiology 28:985-991, 1971 Automatyczna lokalizacja guza - J. Sklansky, D. Ballard, "Tumor Detection in Radiographs, Computers and Biomedical Research 6(4):299-321, 1973 Gdzieś do 1984 rozpoznawanie wzorców w obrazach 2D Lata około 1985-91 metody silniej odwołujące się do modeli wiedzy, początki koncepcji CAD Lata około 1992-99 analiza obrazów 3D, analiza zintegrowana (multimodalność) XXI wiek wiele nowych wyzwań Narzędzia ANALYZE, MEDX.

Cd.. 1960-1980: odważne próby pełnej automatyzacji diagnostyki obrazowej - rozwój koncepcji ACD (automated computer diagnosis) stosowanie metod analizy obrazów rozwój metod sztucznej inteligencji - wielkie nadzieje, niestety w wielu przypadkach niespełnione wykorzystanie metod poprawy percepcji - ograniczona efektywność, chociaż potwierdzona użyteczność Lodwick G.S., Haun C.L., Smith W.E., et al. (1963) Computer diagnosis of primary bone tumor. Radiology 80:273-5 Becker H., Nettleton W., Meyers P., Sweeney J., Nice C. Jr. (1964) Digital computer determination of a medical diagnostic index directly from chest X-ray images. IEEE Trans Biomed Eng BME-11:67 72 Myers P.H. Nice C.M., Becker H.C., et al. (1964) Automated computer analysis of radiographic images. Radiology 83:1029-34 Kruger RP, Towns JR, Hall DL, et al. (1972) Automated radiographic diagnosis via feature extraction and classification of cardiac size and shape descriptors. IEEE Trans Biomed Eng BME-19(3):174-86 Kruger RP, Thompson WB, Turner AF. (1974) Computer diagnosis of pneumoconiosis (pylica). IEEE Trans Syst Man Cybernetics SMC-4(1):44-7 1966 r. po raz pierwszy sformułowano termin CAD (computer-aided diagnosis ) w pracy G.S. Lodwick: Computer-aided diagnosis in radiology. A research plan. Invest Radiol, 1(1):72-80, 1966

Historia rozwoju cd Koniec lat 80. popularyzacja koncepcji CAD (laboratorium Kurta Rossmanna na Uniwersytecie w Chicago wykorzystanie sformalizowanej wiedzy medycznej rozwój metod analizy ruchu w sekwencji obrazów, dopasowania obrazów różnej modalności, metod obiektowo-zorientowanej segmentacji rozwój metod weryfikacji narzędzi wspomagania diagnostyki (wykorzystanie krzywych ROC) lata 90.: doskonalenie i rozszerzenie obszaru zastosowań systemów CAD udoskonalenia systemów obrazowania 3W z wolumetryczną wizualizacją rozwój metod analizy danych obrazowych 3W (optymalizacja procedur decyzyjnych, fizyczne modele obrazowanych obiektów) komercyjne narzędzia CAD do mammografii pod koniec lat 90 rozwój radiologii cyfrowej - systemy radiografii cyfrowej, medyczne systemy informacyjne: standard DICOM 3.0, HL-7 rozwój teleradiologii 1998 - ImageChecker firmy R2 Technology, akceptacja FDA

Historia nowa początek XXI wieku: rozwój koncepcji CAD w postaci systemów CAD2, CADet, CADx, telecad, ICAD, CAD-CBIR nowe metody obrazowania w radiografii cyfrowej (metody dwuenergetyczne, z środkiem cieniuj., 3W, tomosynteza), tomografii CT i MRI, termografii etc. dające dodatkowe możliwości wspomagania Leksykony, ontologie, taksonomie wiedzy medycznej indeksowanie medycznej treści obrazowej po zawartości, deskryptory semantyczne, wyszukiwarki referencyjne bazy danych służących doskonaleniu CAD integracja systemów wspomagania, rozwój koncepcji PACS-CAD-CBIR, integracja IHE, XDS (Cross-Enterprise Document Sharing, IHE ułatwia dostęp do rekordu pacjenta) rozwój interfejsów człowiek-komputer, ogólniej koncepcji integracji człowiekkomputer realizacja ścieżek klinicznych z podpowiedziami i weryfikacją

KWDM - idea komputerowego wspomagania diagnostyki Stopień 1: usprawnienie pracy ekspertów (kryterium czasu, uproszczenia i obiektywizacji działań, wyłapywanie prostych błędów) Stopień 2: ekstrakcja, porządkowanie i udostępnianie danych/informacji/wiedzy celem wykorzystania wyjątkowej wiedzy i doświadczenia ekspertów Stopień 3: wiarygodne narzędzia doskonalące, kontrolujące, uzupełniające (zastępujące) zaawansowaną pracę lekarza/eksperta Stopień 4: skutki: a) sukces statystyczny, b) sukces w zakresie indywidualnego leczenia pacjenta, b) sukces w dużej skali: przesunięcie granic medycznej niemożności, powszechnej dostępności oraz standaryzacji (obiektywizacji) usług na wysokim poziomie sztuka szansą, nie normą!

Rozwój CAD B. van Ginneken, C.M. Schaefer-Prokop, M. Prokop, Computer-aided diagnosis: how to move from the laboratory to the clinic, Radiology 261(3):719-32, 2011

Ale są problemy... Obrysy lekarzy Wskazania automatyczne jelito rozdęte powietrzem wypycha przeponę do góry B. van Ginneken, C.M. Schaefer-Prokop, M. Prokop, Computer-aided diagnosis: how to move from the laboratory to the clinic, Radiology 261(3):719-32, 2011

Sugestie radiologów/ekspertów medycznych względem CAD Wystarczająca wydajność (wąskie gardło wielu systemów CAD) Nieprzedłużanie czasu diagnozy Pełna integracja z procedurami diagnostycznymi Prawnie dopuszczalne (odpowiednie uregulowania prawne) Opłacalność Możliwe kierunki rozwoju Rozszerzenie tradycyjnego paradygmatu drugiej oceny (second look) Nadzieje: tworzenie publicznie dostępnych baz danych/platform/środowisk umożliwiających optymalizację, integrację i weryfikację metod/narzędzi wspomagania