CV Dr Katarzyna Wyrwa E-mail: kwyr@igr.poznan.pl Telefon: (+48 61) 65 50 217 Zakład Biometrii i Bioinformatyki Zespół Ewolucji Funkcji Systemów Biologicznych Specjalizacja genomika porównawcza roślin i grzybów, filogenomika, metagenomika, bionformatyka Profil badawczy / zakres prowadzonych badań 1. Analiza scenariuszy ewolucyjnych kształtujących współczesne rośliny strączkowe. 2. Analiza metagenomu grzybowego. 3. Analiza ewolucji domen i architektury domenowej białek. Projekty badawcze krajowe i międzynarodowe 1. NCN Nr projektu: 2011/03/NZ2/01420 Tytuł projektu: Cytomolekularny wgląd w genomy Lupinus Kierownik projektu: dr inż. Karolina Leśniewska Okres realizacji: 14.08.2012-13.08.2015 Nr projektu: 2013/08/T/NZ2/00796 Tytuł projektu: Analiza genetyczno-molekularna wybranych genów uczestniczących w wiązaniu azotu atmosferycznego u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius L.) Kierownik projektu: mgr Katarzyna Wyrwa Okres realizacji: 1.10.2013 30.09.2015 2. MNiSW Nr projektu: N N301 391939 Tytuł projektu: Genom jądrowy Lupinus angustifolius L.: struktura wybranych genów, ich lokalizacja genetyczna i fizyczna oraz analiza porównawcza wybranych regionów genomu z innymi gatunkami roślin strączkowych Kierownik projektu: dr hab. Barbara Naganowska, prof. IGR Okres realizacji: 15.09.2010 14.09.2013
3. MRiRW Nr projektu: 79 Tytuł projektu: Cecha wczesności kwitnienia u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius) - podstawy genetyczne i molekularne Kierownik projektu: prof. Bogdan Wolko Okres realizacji: 2011-2013 Nr projektu: N301 084 32/3234 Tytuł projektu: Analiza struktury regionu genomu Lupinus angustifolius zawierającego gen odporności na antraknozę Kierownik projektu: prof. dr hab. Bogdan Wolko Okres realizacji: 09.05.2007-08.08.2010 Staże zagraniczne 1. 2014 - Australia, University of Western Australia, School of Plant Biology, Perth 21.07.2014 23.02.2015 2. 2011 - France, UMR CNRS 6553 Ecobio, Evolution des Génomes et Spéciation, Université de Rennes, 6.11 20.11.2011 Współpraca krajowa 1. Instytut Chemii Bioorganicznej, współpraca w ramach projektu MNiSW 2. Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Poznań, współpraca w ramach projektu MNiSW Współpraca zagraniczna 1. Uniwersytet Australii Zachodniej w Perth, Australia dr Matthew Nelson 2. Royal Botanical Gardens, Kew, Wielka Brytania dr Matthew Nelson Publikacje 1. Wyrwa K., Książkiewicz M., Szczepaniak A., Susek K., Podkowiński J., Naganowska B. 92016). Integration of Lupinus angustifolius L. (narrow-leafed lupin) genome maps and comparative mapping within legumes. Chromosome Research. 1-24. DOI: 10.1007/s10577-016-9526-8 2. Ksiażkiewicz M., Zieleziński A., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Karłowski W., Wolko B., Naganowska B. (2014), Remnants of the legume ancestral genome preserved in gene-rich regions: insights from Lupinus angustifolius physical, genetic and comparative mapping, Plant Molecular Biology Reporter 2014. 3.Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Majcherkiewicz K., Przysiecka Ł., Karłowski W., Wolko B., Naganowska B. (2013). Comparative genomics of
Lupinus angustifolius gene-rich regions: BAC library exploration, genetic mapping and cytogenetics. BMC Genomics 2013, 14:79. 4.Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Naganowska B., Wolko B. (2013), Generich regions in narrow leafed lupin (Lupinus angustifolius L.); Annual Report 2013, Polish Academy of Science, 47-49. 5.Naganowska B., Wyrwa K., Szczepaniak A., Przysiecka Ł., Książkiewicz M., Wolko B. (2011). Cytogenetic mapping a step towards an integrated genome map of Lupinus angustifolius. W: Lupin crops an opportunity for today, a promise for the future (Naganowska B., Wolko B., Kachlicki P., red.). Proc. 13th Int. Lupin Conf., 6-10 June 2011, Poznań, Poland. ISBN 978-83-61607-73-1. Institute of Plant Genetics Polish Academy of Sciences, Polish Lupin Association, ss. 62-68. 6.Wolko B., Książkiewicz M., Majcherkiewicz K., Wyrwa K. (2010). Markery STS sprzężone z genami odporności na grzyby patogeniczne u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius L.). W: Materiały IV Sympozjum Naukowego Jakość środowiska, surowców i żywności (Dubert F i in. red.) Kraków, 22-23.04.2010. ISBN 978-83-86878-26-0, ss. 169-170. Nagrody i odznaczenia 1. Stypendium na wyjazd szkoleniowy TransFormation.Doc realizowane w ramach projektu systemowego Ministra Nauki Szkolnictwa Wyższego pt. Wsparcie systemu zarządzania badaniami naukowymi i ich wynikami. Szwecja, Lund 17-30.10.2015 2. Nagroda indywidualna za osiągnięcia publikacyjne w 2014 roku przyznana przez Dyrektora Instytutu Genetyki Roślin PAN w Poznaniu. 3. Projekt nr PO KL 8.2.2/30-29-13/14 pt. "Analiza genetyczno-molekularna wybranych genów uczestniczących w wiązaniu azotu atmosferycznego u łubinu wąskolistnego (L. angustifolius L.)". Wsparcie stypendialne dla doktorantów na kierunkach uznanych za strategiczne z punktu widzenia rozwoju Wielkopolski realizowanego w latach 2013-2014 przez Wojewódzki Urząd Pracy w Poznaniu w ramach Programu Operacyjnego Kapitał Ludzki 2007-2013.
CV Dr Katarzyna Wyrwa E-mail: kwyr@igr.poznan.pl Telefon: (+48 61) 65 50 217 Department of Biometry and Bioinformatics Functional Evolution of Biological Systems Team Specialisation comparative genomics of plants and fungi, phylogenomics, metagenomics, bioinformatics Research profile 1. Analysis of evolutionary mechanisms shaping contemporary legumes. 2. Fungal metagenome analysis. 3. Analysis of domain evolution and domain architecture of proteins. National and international grants 1. National Centre of Science (NCS) grants Project no: 2011/03/NZ2/01420 Project title: Cytomolecular insight into Lupinus genomes Project leader: dr inż. Karolina Leśniewska Duration: 14.08.2012-13.08.2015 Project no: 2013/08/T/NZ2/00796 Project title: Insight into Lupinus angustifolius genome: molecular analysis of several genes involved in nitrogen fixationin narrow-leafed lupin. Project leader: mgr Katarzyna Wyrwa Duration: 1.10.2013 30.09.2015 2. Ministry of Science and Higher Education grants Project no: N N301 391939 Project title: Nuclear genome of Lupinus angustifolius L: genes structure, their physical and genetic localization and comparative analyzes with model legume plants gemomes. Project leader: prof. dr hab. Barbara Naganowska Duration: 15.09.2010 14.09.2013
3. Ministry of Agriculture and Rural Development Project no: 79 Project title: Flowering time trait in narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.) genetic and molecular background Project leader: prof. dr hab. Bogdan Wolko Duration: 2011 2013 Project no: N301 084 32/3234 Project title: Analysis of Lupinus angistifolius genome region carrying anthracnose resistance gene. Project leader: prof. dr hab. Bogdan Wolko Duration:09.05.2007-08.08.2010 International fellowships / trainings 1. 2014 - Australia, University of Western Australia, School of Plant Biology, Perth 21.07.2014 23.02.2015 2. 2011 - France, UMR CNRS 6553 Ecobio, Evolution des Génomes et Spéciation, Université de Rennes, 6.11 20.11.2011 National co-operation 1. Institute of Bioorganic Chemistry, Poznań, joint Ministry of Science and Higher Education project 2. Adam Mickiewicz University, Poznan, joint Ministry of Science and Higher Education project International co-operation 1. University of Western Australia Perth, Australia dr Matthew Nelson 2. Royal Botanical Gardens, Kew, United Kingdom dr Matthew Nelson Papers 1. Ksiażkiewicz M., Zieleziński A., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Karłowski W., Wolko B., Naganowska B. (2015) Remnants of the legume ancestral genome preserved in gene-rich regions: insights from Lupinus angustifolius physical, genetic and comparative mapping. Plant Molecular Biology Reporter 2015: 33(1). 2. Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Majcherkiewicz K., Przysiecka Ł., Karłowski W., Wolko B., Naganowska B. (2013) Comparative genomics of Lupinus angustifolius gene-rich regions: BAC library exploration, genetic mapping and cytogenetics. BMC Genomics 2013, 14:79.
3. Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Naganowska B., Wolko B. (2013) Gene-rich regions in narrow leafed lupin (Lupinus angustifolius L.). Annual Report 2013, Polish Academy of Science, 47-49. 4. Naganowska B., Wyrwa K., Szczepaniak A., Przysiecka Ł., Książkiewicz M., Wolko B. (2011) Cytogenetic mapping a step towards an integrated genome map of Lupinus angustifolius. W: Lupin crops an opportunity for today, a promise for the future (Naganowska B, Wolko B, Kachlicki P, red.). Proc. 13th Int. Lupin Conf., 6-10 June 2011, Poznań, Poland. ISBN 978-83-61607-73-1. Institute of Plant Genetics Polish Academy of Sciences, Polish Lupin Association, ss. 62-68. 5. Wolko B., Książkiewicz M., Majcherkiewicz K., Wyrwa K. (2010) Markery STS sprzężone z genami odporności na grzyby patogeniczne u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius L.). W: Materiały IV Sympozjum Naukowego Jakość środowiska, surowców i żywności (Dubert F i in. red.) Kraków, 22-23.04.2010. ISBN 978-83-86878-26-0, ss. 169-170. Awards 1. Ministry of Science and Higher Education scholarship TransFormation.Doc for two weeks training, Sweden, Lund 17-30.10.2015. 2. Director of Institute of Plant Genetics award (2014). 3. Scholarschip no PO KL 8.2.2/30-29-13/14 entitled: Insight into Lupinus angustifolius genome: molecular analysis of several genes involved in nitrogen fixationin narrowleafed lupin..