PIERWOTNIAKI W BADANIACH BIOCHEMICZNYCH I GENETYCZNYCH. b o n s 1963, 1965) doprowadziły do ustalenia, że

Podobne dokumenty
CYTOSZKIELET CYTOSZKIELET Cytoplazma podstawowa (macierz cytoplazmatyczna) Komórka eukariotyczna. cytoplazma + jądro komórkowe.

Komórka eukariotyczna organizacja

Komórka eukariotyczna organizacja

CYTOSZKIELET CYTOSZKIELET

CYTOSZKIELET. Mikrotubule. podjednostki strukturalne. 450 aminokwasów. 13 (11-16) 55kDa i 53kDa strukturalna polarność

Kosm os. PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika. Tom 50, 2001 Numer 3 (252) Strony

Filamenty aktynowe ORGANIZACJA CYTOPLAZMY. komórki CHO (Chinese hamster ovary cells ) Hoechst jądra, BOPIPY TR-X phallacidin filamenty aktynowe

Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany

października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II

Składniki cytoszkieletu. Szkielet komórki

Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad

Czy żywność GMO jest bezpieczna?

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

Wprowadzenie do biologii molekularnej.

WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE. Ewa Waszkowska ekspert UPRP

Nowoczesne systemy ekspresji genów

Transport makrocząsteczek

Cytoplazma. Cytoplazma. cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma. cytoplazma organelle podstawowa (cytozol) Kompleksy białkowe (+RNA)

Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją).

Wykład 14 Biosynteza białek

Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP

Kosm os PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH

Kosm os PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH

błona zewnętrzna błona wewnętrzna (tworzy grzebienie lamelarne lub tubularne) przestrzeń międzybłonowa macierz Błona wewnętrzna: Macierz:

DNA musi współdziałać z białkami!

Recenzja pracy doktorskiej Mgr Natalii Sawki. gatunków zespołu Paramecium aurelia

Cytoplazma. podstawowa (cytozol) Cytoplazma podstawowa (macierz cytoplazmatyczna)

Opis zakładanych efektów kształcenia OPIS ZAKŁADANYCH EFEKTÓW KSZTAŁCENIA

Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej

Zakład Mikrobiologii Stosowanej RUPA BADAWCZA FIZJOLOGIA BAKTERII

KARTA KURSU. Biotechnology in Environmental Protection. Kod Punktacja ECTS* 1

Sylabus Biologia molekularna

Udział jonów wapnia w regulacji oddziaływań aktyny z miozyną

Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19/20

BIOLOGIA KOMÓRKI. Ocena końcowa z kursu będzie liczona jako: 20% oceny z ćwiczeń 80% oceny z egzaminu

1

Sylabus Biologia molekularna

Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu

Część II: Ruch w układach biologicznych. Biofizyka II przedmiot obieralny Materiały pomocnicze do wykładów prof. dr hab. inż.

1. Biotechnologia i inżynieria genetyczna zagadnienia wstępne 13

Podział komórkowy u bakterii

THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE

Rola białek z rodziny Rho w kontroli migracji komórek pełzających

Rozkład materiału z biologii dla klasy III AD. 7 godz / tyg rok szkolny 2016/17

Rzęski, wici - budowa Mikrotubule. rozmieszczenie organelli. Stabilne mikrotubule szkielet rzęsek i wici

Drożdże piekarskie jako organizm modelowy w genetyce

Hormony Gruczoły dokrewne

The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna

PLAN STUDIÓW. Rodzaj zajęć. e-nauczanie,

SPEKTROSKOPIA MRJ BIAŁEK MIĘŚNIOWYCH

WITAMY NA KURSIE HISTOLOGII

ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI

Komórka eukariotyczna

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg

Efekty kształcenia dla kierunku studiów biotechnologia i ich odniesienie do efektów obszarowych

Public gene expression data repositoris

Transport makrocząsteczek (białek)

3. Podstawy genetyki S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Nazwa modułu. Kod F3/A. Podstawy genetyki. modułu

FIZJOLOGIA ORGANELLI (jak działa komórka?)

Wykład 1. Od atomów do komórek

Rok akademicki: 2014/2015 Kod: EIB BN-s Punkty ECTS: 3. Kierunek: Inżynieria Biomedyczna Specjalność: Bionanotechnologie

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna

etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy

biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski

UCHWAŁA Nr 31/2014 Senatu Uniwersytetu Wrocławskiego z dnia 26 marca 2014 r.

Geny i działania na nich

Transport pęcherzykowy i plazmodesmy

FIZJOLOGIA ORGANELLI (jak działa komórka?)

Ruch zwiększa recykling komórkowy Natura i wychowanie

SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA

Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski. Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul.

Wzorcowe efekty kształcenia dla kierunku studiów biotechnologia studia pierwszego stopnia profil ogólnoakademicki

Dominika Stelmach Gr. 10B2

Efekty kształcenia dla kierunku Biologia

Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF

Bioinformatyka wykład 9

Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca

Nukleotydy w układach biologicznych

Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19

POZIOMY WYMAGAŃ EDUKACYJNYCH Z BIOLOGII DLA UCZNIÓW Z UPOŚLEDZENIEM W STOPNIU LEKKIM

Inżynieria genetyczna- 6 ECTS. Inżynieria genetyczna. Podstawowe pojęcia Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka

cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Jądro komórkowe

Budowa i funkcje komórek nerwowych

Podziały komórkowe cz. I

UNIWERSYTET ROLNICZY IM. HUGONA KOŁŁĄTAJA W KRAKOWIE WYDZIAŁ BIOTECHNOLOGII I OGRODNICTWA

Podstawy biologii. Informacja, struktura i metabolizm.

SYLABUS. Wydział Biologiczno-Rolniczy. Katedra Biochemii i Biologii Komórki

Numer 4 (253) Strony PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika

Tom 50, 2001 Numer 3 (252) Strony reoblemy NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika

Biologia molekularna

Diagnostyka neurofibromatozy typu I,

PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)

SYLABUS. DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA (skrajne daty)

S YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma c j e ogólne

[2ZPK/KII] Inżynieria genetyczna w kosmetologii

Zagadnienia seminaryjne w semestrze letnim I Błony biologiczne

Informacje ogólne. Wydział PUM. Specjalność - jednolite magisterskie * I stopnia X II stopnia. Poziom studiów

Transkrypt:

Kosm os Tom 49, 2000 Numer 4 (249) Strony 583-587 PROBLEMY NAUKBIÓLOGICZNYĆH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika Ma r ia J o l a n t a R ę d o w ic z Zakład Biochemii Mięśni Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego Pasteura 3, 02-093 Warszawa e-mail: jolanta@nencki.gov.pl PIERWOTNIAKI W BADANIACH BIOCHEMICZNYCH I GENETYCZNYCH W dobie najnowszych osiągnięć genetyki i biologii molekularnej, gdy klonuje się ssaki, gdy jesteśmy już prawie o krok od rozszyfrowania ludzkiego genomu, można by pytać o potrzebę badań nad organizmami jednokomórkowymi. Należy zdawać sobie jednak sprawę, że, poza aspektem poznawczym, klinicznym (pierwotniaki wciąż są przyczyną wielu chorób ludzi i zwierząt) i ewolucyjnym, badania nad organizmami jednokomórkowymi dostarczały, i wciąż dostarczają, wielu nowych informacji przyczyniających się do postępu wiedzy o organizmach wyższych. Szczególnie istotne są, moim zdaniem, badania prowadzone na przedstawicielach kilku gatunków z królestwa Protozoa, a mianowicie Tetrahymena pyriformis lub Tetrahymena thermophila (gromada orzęsków), Acanthamoeba castellanii (gromada korzenionóżek) oraz Dietystelium diseoideum (gromada śluzowców). W niniejszym artykule postaram się omówić najważniejsze osiągnięcia wynikające z badań nad tymi organizmami oraz ich wkład w rozwój nauk biologicznych. Z racji swoich zainteresowań skupię się głównie na badaniach dotyczących cytoszkieletu komórkowego1. Orzęski Tetrahymena thermophila i T. pyriformis to organizmy, których badanie przyczyniło się i wciąż przyczynia, między innymi do poznania budowy i funkcji mikrotubul oraz układu białek z nimi związanych. Już w końcu lat 50. zaobserwowano, a po wprowadzeniu do mikroskopii elektronowej w latach 60. techniki utrwalania z zastosowaniem glutaraldehydu potwierdzono, że rzęski Tetrahymena posiadają stałą strukturę widoczne są w nich cylindry - czne elementy o średnicy około 30 nm, zwane mikro tub ulami, ułożone jako 9 parna obwodzie rzęski, a dodatkowe 2 pojedyncze mikrotubule znajdują się w jej środku (patrz art. Fa b c z a k i Fabc zak w tym numerze KOSMOSU). Mikrotubule, jak się potem okazało, obecne są we wszystkich komórkach eukariotycznych (O lm s t e d i B o r isy 1973, B ray 1992). Badania biochemiczne nad mikrotubulami rzęskowymi, zapoczątkowane już w końcu lat 50. (C h ild 1959), kontynuowane między innymi przez Gibbonsa (G ib b o n s 1963, 1965) doprowadziły do ustalenia, że podstawowym składnikiem mikrotubul jest tubulina, białko występujące tu w dwóch izoformach a i (3, o masach cząsteczkowych około 55 kda. Natomiast po raz pierwszy tubulinę wyizolowano z mózgu świni, jako białko wiążące kolchicynę (W eisen ber g i współaut. 1966). Wiadomo obecnie, że białko to, podobnie jak aktyna, obecne jest we wszystkich rodzajach komórek eukariotycznych i pełni kluczową rolę między innymi w procesach podziału komórkowego, ruchu rzęskowego i wiciowego, wewnątrzkomórkowego transportu organelli czy też przekazywania sygnałów nerwowych (B ray 1992). W 1963 r. G ibb o n s stwierdził, że obecne w rzęskach Tetrahymena struktury wystające z mikrotubul, tworzące tak zwane ramionka mikrotubuli, wykazują zdolność do hydrolizy ATP (G ib b o n s 1963), co zainspirowało go do poszukiwania białka odpowiedzialnego za to zjawisko. We współpracy z Rowe wyizolował on z rzęsek i scharakteryzował to zupełnie dotąd nieznane białko, które nazwał dyneiną (od dynę siła) (G ib b o n s i R o w e 1965). Dyneina, podobnie jak tubulina i aktyna, obecna jest we wszystkich rodzajach komórek eukariotycznych. Występuje ona w formie rzęskowej lub Zainteresowanych cytoszkieletem informuję, że pod redakcją dr Roberta Makucha i moją przygotowywany jest numer KOSMOSU poświęcony temu zagadnieniu. Numer ten powinien ukazać się w pierwszej połowie roku 2001.

584 M aria J olanta R ędowicz cytoplazmatycznej (B r a y 1992, H ir o k a w a 1998), a jej wielkość i skład podjednostkowy zależy od formy występowania. Jest to olbrzymie białko, jego masa cząsteczkowa wynosi od 1000 do 2000 kda. Dyneina w pełni zasługuje na swoją nazwę, gdyż jest białkiem motoiycznym, zdolnym (dzięki energii uzyskanej wskutek hydrolizy ATP) bądź do generowania ruchu rzęsek, bądź do przemieszczania organelli wzdłuż mikrotubul w kierunku tak zwanego końca minus mikrotubuli, czyli do środka komórki. Poznanie motoru związanego z układem mikrotubul, jak się początkowo wydawało obecnego tylko u orzęsków, zainspirowało wielu badaczy do poszukiwania białek motorycznych obecnych w innych komórkach, zwłaszcza w neuronach. W 1974 r. dwie grupy jednocześnie doniosły o znalezieniu dyneiny w mózgu (B u r n s i P o l l a r d 1974, G a sk in i współaut. 1974), stanowiącej formę cytoplazmatyczną tego białka. W 1985 r. dwie niezależne grupy zaprezentowały wyniki świadczące o obecności w aksonie olbrzymim mątwy (V a le i współaut. 1985) i cytoplazmie jaj konika morskiego ( S c h o o l e y i współaut. 1985) innego białka, o masie cząsteczkowej około 400 kda, wykazującego zdolność do hydrolizowania ATP i wiązania mikrotubul. Białko to, nazwane kinezyną, jest białkiem motorycznym, występującym we wszystkich komórkach eukariotycznych (także, podobnie jak inne białko motoryczna miozyna, w wielu izoformach) i uczestniczącym w niektórych istotnych procesach komórkowych (H iro k a w a 1998). Tak więc, badania nad małym, ruchliwym orzęskiem przyczyniły się do poznania struktury i składu mikrotubul oraz do odkrycia i dokładnego zbadania nowych białek motoiycznych dyneiny i kinezyny. Pierwotniaki nadal są obiektem wielu badań, prowadzonych również metodami genetycznymi, umożliwiających poznanie, między innymi, mechanizmu procesów ruchu rzęskowego i wiciowego, charakterystycznego również dla wielu komórek tkankowych, jak na przykład rzęski płuc czy wici plemników ( G a e r t i g 2000). Pisząc o Tetrahymena thermophila należy również pamiętać, że badania nad kwasami nukleinowymi z tego organizmu doprowadziły na początku lat 80. do poznania nowych funkcji RNA. W laboratorium Thomasa R. Cecha wykazano, że wyizolowane z orzęska rrna genów makronuklearnych zachowuje się jak enzym potrafi ciąć samo siebie i ponownie łączyć powstałe fragmenty ( K r u g e r i współaut 1982). Zjawisko to, występujące jak się potem okazało powszechnie w komórkach eukariotycznych, nazwane samousuwaniem się intronów (ang. intron self-spłicing), przyczyniło się nie tylko do poznania funkcji RNA, ale także do wyjaśnienia mechanizmu ekspresji genów. Jego odkrywca, dr T. R. Cech został za te badania uhonorowany (wspólnie z Samuelem Altmanem) w 1989 r. nagrodą Nobla w dziedzinie chemii. Acanthamoeba castellanii to wolnożyjąca w glebie ameba, która w sprzyjających warunkach może stać się groźnym patogenem. Opisano przypadki zapalenia mózgu, zapalenia płuc i utraty wzroku spowodowane przez tę amebę. Wśród naukowców organizm ten znany jest jednak głównie jako obiekt badań biochemicznych nad aparatem kurczliwym. Z niego to bowiem Pollard i Korn w 1973 r. ( P o l l a r d i K o r n 1973) wyizolowali białko o masie cząsteczkowej około 160 kda posiadające właściwości enzymatyczne, charakterystyczne dla poznanego dużo wcześniej mięśniowego białka motoiycznego miozyny (masa cząsteczkowa około 500 kda). To amebowe białko, poza typową dla izoformy miozyny mięśniowej zdolnością do wiązania aktyny przyczyniającą się do wzrostu hydrolizy ATP, wykazywało szereg cech odmiennych. Okazało się, że jest to cząsteczka monomeiyczna, zawierająca tylko jeden łańcuch lekki, nie tworząca filamentów charakterystycznych dla miozyny mięśniowej. Późniejsze badania niezależnych już grup Korna i Pollarda (patrz S e l l e r s 1999) dostarczyły dowodów, że białko to zawiera w swojej części karboksylowej, zwanej ogonkiem, dodatkowe miejsce wiązania aktyny oraz miejsce wiązania lipidów. Okazało się też, że jego aktywność enzymatyczna jest regulowana poprzez fosfoiylację reszty treoninowej lub serynowej w rejonie ciężkiego łańcucha, zwanym główką lub domeną motoiyczną, spełniającym funkcje enzymatyczne tego białka ( B r z e s k a i K o r n 1996). Dość dużo czasu upłynęło zanim inni badacze zaakceptowali to białko jako nową, odmienną izoformę miozyny pochodzącej z Acanthamoeba. O ile bowiem zaakceptowano możliwość istnienia w amebach izoformy miozyny zbliżonej do miozyny mięśniowej, o tyle nie przyjmowano do wiadomości obecności innej, odmiennej jej izoformy. Podejrzewano wręcz, że autorzy izolowali po prostu proteolityczny fragment amebowej izoformy miozyny, podobnej do miozyny występującej w mięśniach szkieletowych. Dopiero otrzymanie w końcu lat 70. tej akceptowalnej izoformy miozyny (M a r u t a i K o r n 1977, P o l l a r d i współaut. 1978), a także wykazanie, że obie izoformy miozyny występujące w amebie są kodowane przez odmienne geny (H a m m er i współaut. 1986), położyło kres wątpliwościom. Wykazano ponadto, że ta nietypowa izoforma (według dzisiejszej nomenklatu

Pierwotniaki w badanich biochemicznych i genetycznych 585 ry zwana miozyną I, zaś izoforma mięśniowa to miozyna II) występuj e w amebie w trzech odmianach: A, B, C. Badania nad miozynami amebowymi zapoczątkowały nowy okres w badaniach nad miozyną. Stosując między innymi metody biologii molekularnej oraz techniki biochemiczne lub immunologiczne wykryto olbrzymią różnorodność wśród izoform miozyny; miozyny te na podstawie różnic w sekwencji tak zwanej domeny motorycznej zostały podzielone na co najmniej 15 klas (rodzin) ( S e l l e r s 1999). Okazało się na przykład, że odkryta w Acanthamoeba nowa miozyna, sklasyfikowana jako należąca do klasy IV, jest jak dotychczas jedynym przedstawicielem tej rodziny ( H o r o w i t z i H a m m e r 1990). Obecnie wiadomo, że miozyny występują we wszystkich komórkach eukariotycznych; co więcej, zaobserwować można w jednej komórce (np. w Dictyostelium) obecność genów kodujących aż dwanaście izoform miozyny (O is h i i współaut. 2000). Wiadomo też, że miozyny są odpowiedzialne za wiele kluczowych dla życia komórki procesów takich jak: endo- i egzocytoza, transport organelli, cytokineza czy też lokomocja komórek, a także współuczestniczą nie tylko w generowaniu skurczu mięśnia (miozyna II), ale również są zaangażowane w procesy słyszenia (miozyna VI, VIIA i XV) lub widzenia (przedstawiciel miozyny III u Drosophila i Limulus) ( S e l l e r s 1999). I kto by przypuszczał, że wszystko zaczęło się od kontrowersyjnego odkrycia przez Pollarda i Korna dziwnej izoformy miozyny w małej amebie. Badania nad miozyną I Acanthamoeba przyczyniły się także do poznania mechanizmu fosforylacji ciężkiego łańcucha miozyny w obrębie główki. Ten rodzaj fosforylacji zaobserwowano u większości dotąd poznanych izoform miozyny I, a także u izoform miozyny VI (B r z e s k a i K o r n 1996). Okazało się także, że kinaza ciężkiego łańcucha miozyny I z Acanthamoeba należy do nowopoznanej rodziny kinaz PAK, regulowanych przez białka z rodziny Rho. Kinazy te między innymi regulują fosforylację lekkiego łańcucha miozyny niemięśniowej lub z mięśni gładkich, a więc izoforma amebowa PAK jest być może unikalną wśród tej rodziny kinaz ( B r z e sk a i współaut. 1999). W Acanthamoeba wykryto też nowe białka regulujące proces polimeryzacji aktyny, na przykład aktobindynę (L a m b o o y i KORN 1986) i aktoforynę ( C o o p e r i współaut. 1986). Ostatnio wykazano, po raz pierwszy właśnie w Acanthamoeba, że polimeryzacja aktyny jest regulowana poprzez kompleks białek Arp2/3 i WASP, przez białko cdc42, należące do rodziny tak zwanych małych GTPaz z rodziny Rho (M u llin s i P o l l a r d 1999). Acanthamoeba, z racji łatwości i niskich kosztów otrzymania dużej ilości materiału doświadczalnego (z około 80 1 hodowli płynnej można w odpowiednich warunkach otrzymać nawet i 1 kg komórek), umożliwia prowadzenie badań metodami biochemicznymi (B a in e s i K o r n 1994). Z kolei, intensywne badania genetyczne były, i nadal są, prowadzone na innym przedstawicielu pierwotniaków, Dictyostelium diseoideum. Należący do gromady śluzowców (Mycetozoa) D. diseoideum jest organizmem, który przechodzi przez cykl rozwoju prowadzący do wytwarzania spor. Cykl ten został dobrze poznany i wykorzystywany jest w laboratoriach naukowych. Amebowe formy śluzowca hodowane na podłożu stałym w warunkach głodzenia (ang. starvation) wydzielają zewnątrzkomórkowy camp, który powoduje spontaniczne łączenie się ameb w wielojądrowe struktury zwane plazmodiami, przechodzące następnie w stadium pełzakowate, z którego powstają sporangia (ang. fruiting bodies) produkujące zarodniki. Cykl ten, przy utrzymywaniu właściwych parametrów gęstości komórek, temperatury i wilgotności powietrza, trwa około 24 godzin i jest powtarzalny z marginesem błędu około 1 godziny. To, oraz fakt, że organizm ten występuje podczas cyklu rozwojowego jako haploid, a także tania i efektywna hodowla spowodowały, że Dictyostelium stało się modelowym obiektem badań genetycznych. Badania nad jego genomem, składającym się z około 40 000 kilozasad, doprowadziły do stworzenia warunków rutynowej transformacji komórek i ekspresji egzogennych białek w tym organizmie, a także możliwości badania roli tych białek w procesie rozwojowym, ruchliwości komórkowej czy też endo- lub egzocytozie ( D e v r e o t e s 1989). W komórkach śluzowca białka podlegają, podobnie jak w komórkach wyższych Eukaryota, procesom postranslacyjnej modyfikacji, na przykład glikozylacji. Wykorzystując więc dostępne komercyjnie plazmidy zdolne do transformowania D. diseoideum, zawierające umożliwiający selekcję transformantów gen oporności na neomycynę, wbudowany w gen promotora aktyny, opracowano metody umożliwiające ekspresję funkcjonalnych białek zarówno egzo-, jak i endogennych. Z komórek śluzowca udało się, stosując techniki rekombinacyjne, otrzymać między innymi lucyferazę ze świetlika (robaczka świętojańskiego), glukoronidazę s sączą, receptor (3-adrenergiczny z chomika oraz ssacze izoformy białka Ras, a także, po zablokowaniu endo

586 M aria J olanta Rędow icz gennych genów, takie białka jak podjednostki a l i a2 heterotrimeiycznego białka G, fosfodiesterazę, białko Ras, białko RacE, a także szereg izoform miozyny i jej fragmentów ( D e v r e o t e s 1989, S e l l e r s 1999, O is h i i współaut. 2000). Blokowanie genów kodujących endogenne białka umożliwia także tworzenie nowych szczepów śluzowca, w których dane białko nie podlega ekspresji, co pozwala na bezpośrednie i szybkie zbadanie jego funkcji w warunkach in vivo (D e v r e o t e s 1989). Ponadto fakt, że komórki śluzowca można transformować egzogennym cdna i otrzymywać w nich funkcjonalne białka, umożliwił tworzenie mutantów tych białek i poznanie ich funkcji w komórce i/lub roli w cyklu rozwojowym tego organizmu. Niewątpliwie przyczyniło się to do postępu w badaniach nad strukturą i funkcją, między innymi, profiliny (L e e i współaut. 2000) i innych białek wiążących aktynę (P o n t e i współaut. 2000), RacE ( L a r o c h e l l e i współaut. 2000) czy też izoform miozyny ( S e l l e r s 1999, O is h i i współaut. 2000). Jak już wcześniej wspomniałam, miozyny występują w przyrodzie w postaci różnorodnych izoform, różniących się nie tylko składem aminokwasowym, strukturą trzecio- lub czwartorzędową, ale również funkcją pełnioną w komórce. Badania genetyczne nad miozyną Dictyostelium zapoczątkowane w 1987 r. przez Spudicha (D e lo z a n n e i S p u d ic h, 1987), doprowadziły z jednej strony, do poznania szeregu nowych jej izoform oraz ich fragmentów/domen, a z drugiej, do poznania ich roli w tym organizmie. Dotychczas w Dictyostelium poznano całkowite sekwencje genów kodujących dziesięć izoform miozyny (jednego przedstawiciela klasy II; sześć izoform klasy I; przedstawiciela klasy VII, przedstawiciela klasy V lub XI oraz przedstawiciela nowopoznanej izoformy miozyn y MyoM, którego sekwencja wskazuje, iż jest to izoforma otwierająca nową klasę miozyn) oraz część sekwencji genów kodujących MyoF i MyoH (O ish i i współaut. 2000). Udało się także wykazać, że na przykład miozyna II (ta przypominająca miozynę mięśniową) jest niezbędna w procesach cytokinezy oraz rozwoju i migracji komórek; izoformy miozyny I, współdziałając ze sobą, odgrywają rolę w procesach ruchliwości komórek, poprzez udział w wewnątrzkomórkowym transporcie organelli, w endo- i egzocytozie; miozyna VII jest zaangażowana w procesie fagocytozy; zaś nowa miozyna MyoM może uczestniczyć w procesie makropinocytozy ( S e l l e r s 1999, O ish i 2000). Stosując mutanty udało się na przykład zbadać in vivo rolę fosforylacji ciężkiego łańcucha miozyny II, rolę łańcuchów lekkich miozyny II w cyklu rozwojowym Dietyostelium, a także poznać sekwencje istotne dla generacji ruchu w domenie motorycznej miozyny, nie tylko śluzowca ( S e l l e r s 1999). Dictyostelium, chociaż to pierwotniak, jest organizmem chętnie wykorzystywanym w laboratoriach badawczych zajmujących się problemami dotyczącymi organizmów wyższych. Dużo taniej, łatwiej i szybciej jest przecież, o ile to oczywiście moż*liwe, wstępnie sprawdzić funkcje danego białka wykorzystując ten organizm, niż otrzymać stabilną linię zwierząt transgenicznych. Nie zapominajmy też o tym, że unika się problemów związanych z rosnącymi w siłę obrońcami praw zwierząt. Praca z pierwotniakami nie powoduje bowiem protestów z ich strony. Mam nadzieję, że przy pomocy przedstawionych przeze mnie, fragmentaiycznych przecież, danych wykazałam celowość prowadzenia badań nad pierwotniakami, kryjącymi w sobie wiele możliwości i tajemnic, któiych poznanie może pomóc w zrozumieniu ogólnych zasad rządzących całym światem istot żywych. PROTOZOA IN BIOCHEMICAL AND GENETIC STUDIES SOME ASPECTS OF THE PROBLEM S u m m ary This essay describes the significance of biochemical and genetic studies on representatives of the Protozoan kingdom, which contribute to the general knowledge of living organisms. In particular, studies on Tetrahymena species, Acanthamoeba castellanii and Dictyostelium discoideum have been briefly depicted. Studies on the structure of Tertahymena cilia aided in the detailed characterization of microtubules and its components, and revealed the novel microtubule-based motor proteins dynein and kinesin. The intron self-splicing mechanism was found for the first time in rrna of macronuclear genes of T. thermophila. A. castellanii has been explored as a model for biochemical studies of actin-based cytoskeleton, which resulted in the discovery of several novel proteins, including novel myosin isoforms. The latter led to finding of diverse multiisoform myosin superfamily. Since slime mold D. discoideum during its life cycle exists as a haploid, it has served as a model for intensive genetic studies. For example expression of different myosin isoforms and their subunits helped in the understanding of their roles in vivo.

Pierwotniaki w badanich biochemicznych i genetycznych 587 LITERATURA B a in e s I. C,, K o r n E. D,, 1994. Acanthamoeba castellanii: a model system fo r correlative biochemical and cell biological studies. [W:] Cell Biology. C e l is J.E. (red.) Academic Press, San Diego, CA, 1, 405-411. B ray D., 1992. Cell Movements. Garland Publishing Inc., New York & London. B r z e s k a H., K o r n E. D., 1996. Regulation o f class I and clas II myosins by heavy chain phosphorylation. J. Biol. Chem. 271, 16983-16986. B r z e s k a H., Y o u n g R., K n a u s U., K o r n E. D., 1999. Myosin I heavy chain kinase: cloning o f the fu ll length gene and acidic lipid-dependent activation by Rac and Cdc42. Proc. Naatl Acad. Sci. USA 96, 394-399. B u r n s R. G., P o l l a r d T. D., 1974. A dynein-like protein from brain. FEBS Lett. 40, 274-280. C h ild F. M., 1959. The characterization o f the cilia o f Tetrahymena pyriformis. Exp. Cell Res. 18, 258-267. C o o p e r J. A., B l u m J. D., W il l ia m s R. C. J R., P o l l a r d T. D., 1986. Purification and characterization o f actophorin, a new 15,000-dalton actin-binding protein from Acanthamoeba castellanii. J Biol. Chem. 261, 477-485. D e l o z a n n e A., S p u d ic h J. A., 1987. Disruption o f the Dictyostelium myosin heavy chain gene by homologous recombination. Science 236, 1086-1091. D e v r e o t e s P., 1989. Dictyostelium discoideum: a model system fo r cell-cell interactions in development. Science 245, 1054-1061. G a e r t ig J., 2000. Molecular mechanisms o f microtubular assembly in Tetrahymena. J. Eukaryot. Microbiol. 47, 185-190. G a s k in F., K r a m e r S. B., C a n t o r C. R., A d e l s t e in R., S h e l a n - s k i M. L., 1974. A dynein-like protein associated with neurotubules. FEBS Lett. 40, 281-286. G ib b o n s L R., 1963. Studies on the protein components of cilia from Tetrahymena pyriformis. Proc. Natl Acad. Sci. USA 50, 1002-1010. G ib b o n s I. R., 1965. Chemical dissection o f cilia. Arch. Biol. (Liege) 76, 317-352. G ib b o n s I. R., R o w e A. J., 1965. Dynein: a protein with adenosine triphosphatase activity from cilia. Science 149, 424-425. H a m m e r J., K o r n E. D., Pa t t e r s o n B. M., 1986. Isolation o f non-muscle myosin heavy chain gene from Acanthamoeba. J. Biol. Chem. 261, 1949-1956. H ir o k a w a N., 1998. Kinesin and dynein superfamily proteins and the mechanism o f organelle transport. Science 279, 519-526. H o r o w it z J. A, H a m m e r J. A.IIL, 1990. A new Acanthamoeba myosin heavy chain. J. Biol. Chem. 265, 20646-20652. K r u g e r K., G r a b o w s k i P. J., Z a u g A. J., S a n d s J., G o t t s c h l in g D. E., C e c h T. R., 1982. Self-splicing RNA: autoexcision and autocyclization o f the ribosomal RNA intervening sequence o f Tetrahymena. Cell 31, 147-157. L am boo y P. K., K orn E. D., 1986. Purification and characterization o f actobindin, a new actin monomer binding protein from Acanthamoeba castellanii. J. Biol. Chem. 261, 17150-17155. L a r o c h e l l e D. A., G e r a l d N., D e l o z a n n e A., 2000. Molecular analysis ofracefunction in Dictyostelium Microsc. Res. Tech. 49, 145-151. L e e S. S, K a r a k e s is o g l o u I., N o e g e l A., R ie g e r D., S c h l e ic h e r M., 2000. Dissection o f functional domains by expression o f point-mutated profilins in Dictyostelium mutants. Eur. J. Cell Biol. 79, 92-103. M a r u t a H., K o r n E.D., 1977. Acanthamoeba myosin II. J. Biol. Chem. 252, 6501-6509. M u l l in s R. D., P o l l a r d T. D. 1999. Rho-family GTPases require thearp2/3 complex to stimulate actin polymerization in Acanthamoeba extracts. Curr. Biol. 9, 405-415. O ish i N., A d a c h i H., S u t o c h K., 2000. Novel Dictyostelium myosin, MyoM, has a putative RhoGEF domain. FEBS Lett. 474, 16-22. O l m s t e d J. B., B o r is y G. G., 1973. Microtubules. A n n. Rev. Biochem. 42, 507-540. P ollard T. D., K o rn, E. D., 1973. Isolation from Acanthamoeba castellanii o f an enzyme similar to muscle myosin. J. Biol. Chem. 248, 4682-4690. P o l l a r d T. D, S t a f f o r d W. F. Ill, P o r t e r M. E., 1978. Characterization o f a second myosin from Acanthamoeba castellanii. J. Biol Chem. 253, 4798-4808. P o n t e E., R iv e r o F., F e c h h e im e r M., N o e g e l A., B o z z a r o S., 2000. Severe developmental defects in Dictyostelium null mutants fo r actin-binding proteins. Mech. Develop. 91, 153-161. S c h o l e y J. M., P o r t e r M. J., G r is s o m P. M., M c in t o s h J. R., 1985. Identification o f kinesin in sea urchin eggs, and evidence fo r its localization in the mitotic spindle. Nature 318, 483-486. S e l l e r s J. R., 1999. Myosin. Protein Profile. Oxford University Press, Oxford. V a l e R. D., R e e s e T. S., S h e e t z M. P., 1985. Identification o f novel force-generating protein, kinesin, involved in microtubule-based motility. Cell 42, 39-50. W e is e n b e r g R. C., B o r is y G. G., T a y l o r E. W., 1966. The colchicin-binding protein o f mammalian brain and its relation to microtubules. Biochemistry 7, 4466-4472.