Piotr Dziubecki Piotr Grabowski, Tomasz Kuczyński Tomasz Piontek, Dawid Szejnfeld, PCSS



Podobne dokumenty
Zasady_Funkcjonowania.odt 1.2 Zespół Planowania Strategicznego. Cyfronet, ICM, WCSS, PCSS, TASK,

PLGrid: informatyczne usługi i narzędzia wsparcia w nauce

Wprowadzenie do użytkowania infrastruktury PL Grid. Bartosz Bosak Piotr Kopta Tomasz Piontek

Równoległe aplikacje duŝej skali w środowisku PL-Grid. Kick-off PL-GRID Kraków, kwietnia 2009

Infrastruktura PLGrid

Infrastruktura PLGrid dla młodych naukowców

Infrastruktura gridowa

Infrastruktura PLGrid Nowa jakość usług informatycznych dla Polskiej Nauki

Infrastruktura PLGrid Nowa jakość usług informatycznych dla Polskiej Nauki

Usługi i narzędzia QCG

Infrastruktura PLGrid dla młodych polskich naukowców

Infrastruktura PLGrid Nowa jakość usług informatycznych w służbie nauki

Infrastruktura PLGrid Nowa jakość usług informatycznych w służbie nauki

Infrastruktura PLGrid (nie tylko) dla młodych naukowców

Klaster obliczeniowy

Bartosz Bosak Piotr Kopta Tomasz Piontek

Program Obliczeń Wielkich Wyzwań Nauki i Techniki (POWIEW)

Infrastruktura PLGrid Nowa jakość usług informatycznych dla Polskiej Nauki

INTERNET - Wrocław Usługi bezpieczeństwa w rozproszonych strukturach obliczeniowych typu grid

Uslugi chmurowe dla nauki na podstawie BonFIRE

Laboratorium Chmur obliczeniowych. Paweł Świątek, Łukasz Falas, Patryk Schauer, Radosław Adamkiewicz

REGULAMIN DOSTĘPU DO PANELU KLIENTA KLIENT.SYSTEM3.PL

SUPERKOMPUTER OKEANOS BADAWCZE GRANTY OBLICZENIOWEWE

Nowe aplikacje i usługi w środowisku Grid

Szczegółowe warunki korzystania z bloków RIPE Wersja z dnia 11/02/2011 DEFINICJE ARTYKUŁ 2. Warunki korzystania z usługi

Zasoby i usługi Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego

Infrastruktura PLGrid Usługi dla chemii obliczeniowej

REGULAMIN KORZYSTANIA Z SERWISU INTERNETOWEGO Lloyd Properties sp. z o.o.

OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA

Nowocześnie zaprojektowana e-usługa - studium przypadku

Założenia i stan realizacji projektu epuap2

Usługi przechowywania danych KMD/PLATON-U4 dla bibliotek cyfrowych. Maciej Brzeźniak, Norbert Meyer, Rafał Mikołajczak, Maciej Stroiński

Zastosowanie oprogramowania Proficy (ifix, Historian oraz Plant Applications) w laboratoryjnym stanowisku monitoringu systemów produkcyjnych in-line

Architektury i protokoły dla budowania systemów wiedzy - zadania PCSS w projekcie SYNAT

Skalowalna Platforma dla eksperymentów dużej skali typu Data Farming z wykorzystaniem środowisk organizacyjnie rozproszonych

edistro.pl Spis treści

Niezawodne usługi outsourcingowe na przykładzie usług kampusowych i Krajowego Magazynu Danych w sieci PIONIER

Regulamin korzystania z Platformy DEKRA echeck. Postanowienia ogólne. Warunki techniczne

SCENARIUSZE ĆWICZEŃ DLA UŻYTKOWNIKÓW WEWNĘTRZNYCH SYSTEMU INFORMATYCZNEGO NAWIKUS

KULTURA W SIECI KURS REALIZOWANY W RAMACH GRANTU PRZYZNANEGO ZE ŚRODKÓW UE PROGRAM OPERACYJNY POLSKA CYFROWA DZIAŁANIE 3.1

SPIS TREŚCI Błąd! Nie zdefiniowano zakładki.

Budowa uniwersalnej architektury dla Laboratorium Wirtualnego

REGULAMIN PORTALU INFORMACYJNEGO SĄDU REJONOWEGO POZNAŃ GRUNWALD I JEŻYCE W POZNANIU

Internetowa ogólnopolska baza informatycznych projektów badawczych otwartej innowacji Platforma współpracy SPINACZ 1/46

Rozwój polskich bibliotek cyfrowych. Tomasz Parkoła Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe

USŁUGI HIGH PERFORMANCE COMPUTING (HPC) DLA FIRM. Juliusz Pukacki,PCSS

str. 1 Informacja o zmianie treści specyfikacji istotnych warunków zamówienia Oświęcim, dnia r.

MODUŁ NAUCZYCIEL - INSTRUKCJA OBSŁUGI

Współpraca nauki z przemysłem ICT na przykładzie Wielkopolskiego Centrum Zaawansowanych Technologii Informacyjnych Maciej Stroiński


Praca dyplomowa. Program do monitorowania i diagnostyki działania sieci CAN. Temat pracy: Temat Gdańsk Autor: Łukasz Olejarz

Infrastruktura PL-LAB2020

Zmiany w zakresie obsługi niepublicznych papierów wartościowych. Spotkanie

POLITYKA PRYWATNOŚCI SERWISU ELASTYCZNAPRACA.COM. 1. Informacje ogólne. 2. Zakres działania serwisu. 3. Informacja o plikach cookies.

Zasady korzystania z PL-LAB2020. Piotr Krawiec Instytut Łączności

Virtual Grid Resource Management System with Virtualization Technology

Bezpieczne strony WWW dla edukacji, organizacji non-profit i uŝytkowników indywidualnych.

Struktura prezentacji

Modernizacja Systemu Informacji Oświatowej

DOTACJE NA INNOWACJE

System INTEGRYB jako zintegrowane repozytorium danych umożliwiające zaawansowaną analitykę badawczą

Dyrektor ACK Cyfronet AGH. z dnia 2 października 2017 roku w sprawie zmian organizacyjnych

GRIDY OBLICZENIOWE. Piotr Majkowski

INSTRUKCJA OBSŁUGI APLIKACJI CENTRALNEGO SYSTEMU TELEINFORMATYCZNEGO SL 2014

ECDL ZARZĄDZANIE PROJEKTAMI

Instrukcja użytkownika Internetowej Platformy Edukacyjnej UPRP

Obsługa niepublicznych papierów wartościowych w systemie depozytowym KDPW. Seminarium dyskusyjne z TFI

Załącznik nr 1 do Zapytania ofertowego: Opis przedmiotu zamówienia

Tworzenie i obsługa wirtualnego laboratorium komputerowego

INŻYNIERIA OPROGRAMOWANIA

Regulamin korzystania z usługi e-booking TRUCK

FurryOwl - Regulamin

1.2 Prawa dostępu - Role

Zarządzaj projektami efektywnie i na wysokim poziomie. Enovatio Projects SYSTEM ZARZĄDZANIA PROJEKTAMI

Zapraszamy na 20 minutową prezentację na temat integracji systemów Kambit (Windykator + Softlex) z portalem dlugi.info

Badania poziomu bezpieczeństwa portalu dostępowego do infrastruktury projektu PL-Grid

Podstawowe zasady działania systemu antyplagiatowego OSA oraz przesyłania obronionych prac do ORPD w kontekście współpracy z systemem Dziekanat

"System CC1 jak zbudować prywatną chmurę obliczeniową w jedno popołudnie. M. Witek, M. Zdybał w imieniu CC1

Rejestracja użytkownika


Logowanie do systemu SL2014

Kraków, r. Baza Usług Rozwojowych zasady funkcjonowania i korzyści dla Podmiotów Świadczących Usługi Rozwojowe oraz Przedsiębiorców

SCENARIUSZE ĆWICZEŃ DLA UŻYTKOWNIKÓW ZEWNĘTRZNYCH SYSTEMU INFORMATYCZNEGO NAWIKUS

Rozwiązanie GIS dla mniejszego. miasta: model Miasta Stalowa Wola. Janusz JEśAK. Jacek SOBOTKA. Instytut Rozwoju Miast. ESRI Polska Sp. z o. o.

Geneza Projektu Leśne Centrum Informacji Ryszard Szczygieł Pełnomocnik Dyrektora IBL ds. projektu LCI Instytut Badawczy Leśnictwa

Federacja Bibliotek Cyfrowych w sieci PIONIER

wykłady, warsztaty, projekty, konferencje, seminaria, konkursy.

Specyfikacja Modułu Kampanii i Płatności

Zmodernizowany System Informacji Oświatowej. Spotkanie informacyjne dla dyrektorów szkół i placówek oświatowych

Polityka Prywatności Konkursu. Lotostory

Architektury usług internetowych. Tomasz Boiński Mariusz Matuszek

Rola polskich bibliotek cyfrowych w zapewnianiu otwartego dostępu

RODZIC W INTERNECIE KURS REALIZOWANY W RAMACH GRANTU PRZYZNANEGO ZE ŚRODKÓW UE PROGRAM OPERACYJNY POLSKA CYFROWA DZIAŁANIE 3.1

ZAPYTANIE OFERTOWE nr 1/2017

IMP PAN. Zaplecze obliczeniowe Centrum Zaawansowanych Technologii AERONET. Dolina Lotnicza

OnePlace - INSTRUKCJA OFERENTA

WINDOWS Instalacja serwera WWW na systemie Windows XP, 7, 8.

Wspomaganie zarządzania zbiornikami zaporowymi

Transkrypt:

Polska Infrastruktura Informatycznego Wspomagania Nauki w Europejskiej Przestrzeni Badawczej Wprowadzenie do użytkowaania infrastruktury PL-Grid Dedykowane rozwiązania portalowe i usługi PL-Grid dla nanotechnologii Piotr Dziubecki Piotr Grabowski, Tomasz Kuczyński Tomasz Piontek, Dawid Szejnfeld, PCSS Gdańsk, 5 lipca 2011

Plan wykładu Wprowadzenie Projekt PL-GRID, Projekt Vine Toolkit i jego dziedzinowe zastosowania w postaci portali : Nano Gateway, Structure Builder, Namd, NWChem 2

HPC - po co i dlaczego? 3

Co to jest klaster? Sieć komputerowa System kolejkowy 4

GRID Klaster klastrów SIEĆ 5

PL-GRID 6

Projekt PL-Grid Informacje podstawowe Nazwa projektu: Polska Infrastruktura Informatycznego Wspomagania Nauki w Europejskiej Przestrzeni Badawczej PL-Grid" Okres realizacji: 01.01.2009 r. 31.12.2011 r. Wartość projektu: 83 257 494,53 zł. Wartość dofinansowania: 79 984 613,38 zł w tym udział UE: 67 986 921,37 zł. Beneficjentem jest Akademickie Centrum Komputerowe 7

Projekt PL-Grid - Cele Celem projektu jest dostarczanie polskiej społeczności naukowej usług informatycznych opartych na gridowych klastrach komputerowych, służących e-science w różnych dziedzinach; infrastruktura musi być kompatybilna i interoperabilna z gridem europejskim i światowym. W wyniku projektu powstanie otwarta ogólnopolska infrastruktura gridowa wspierająca uprawianie nauki w sposób umożliwiający integrację danych doświadczalnych i wyników zaawansowanych symulacji komputerowych, przy czym badania będą mogły być prowadzone przez geograficznie rozproszone zespoły. Podstawowym celem projektu jest uzyskanie znaczącego wzrostu udostępnianej mocy obliczeniowej ok. 215 TFLOPS ( ~ 5000 procesorów każdy po 4-6 core'ów ) oraz pamięci dyskowej o ok. 2500 TB, a także zbudowanie systemu gridowego umożliwiającego efektywne i innowacyjne wykorzystywanie powstałej infrastruktury sprzętowej. 8

Projekt PL-Grid - Partnerzy 9

Projekt PL-Grid - struktura Zadanie 4: Rozwój oprogramowania gridowego i narzędzi użytkownika 10

Ile to kosztuje? Dostęp do infrastruktury gridowej oferowanej w ramach projektu PL-Grid jest darmowy dla naukowców i wszystkich osób prowadzących działalność naukową, związaną z uczelnią lub instytutem naukowym w Polsce. 11

Od czego zacząć? Regulamin użytkownika Infrastruktury PL-Grid Użytkownikiem infrastruktury PL-Grid może być każda osoba prowadząca badania naukowe, związana z jednostką naukową w rozumieniu ustawy z dnia 8 października 2004 r. o zasadach finansowania nauki. Z konta dostępowego do infrastruktury ma prawo korzystać wyłącznie właściciel tego konta. Zabronione jest udostępnianie konta osobom trzecim. Użytkownik jest uprawniony do korzystania z zasobów infrastruktury PL-Grid jedynie w celu wykonywania obliczeń oraz przechowywania danych zgodnie z zadeklarowanym tematem badań. Zabrania się wykorzystywania zasobów niezgodnie z prawem oraz wszelkich działań umyślnych, które mogą zakłócić poprawne funkcjonowanie infrastruktury. Użytkownik jest zobligowany do załączenia informacji o wykorzystaniu infrastruktury PL-Grid w publikacjach, które powstały w oparciu o wyniki uzyskane przy użyciu tej infrastruktury. Użytkownik ma obowiązek raportowania wszystkich takich publikacji poprzez funkcjonalność udostępnianą w Portalu Operacyjnym, w celu rozliczenia grantu, nie rzadziej niż co rok. Brak wypełnienia obowiązku rozliczenia użycia zasobów może spowodować zawieszenie usług. 12

Od czego zacząć? Zasady funkcjonowania infrastruktury PL-Grid Aby zostać użytkownikiem infrastruktury PL-Grid należy dokonać rejestracji w portalu PL-Grid. W trakcie procesu rejestracji wymagana jest akceptacja regulaminu używania infrastruktury oraz określenie dziedziny i tematyki badań. W wyniku rejestracji nadawany jest użytkownikowi identyfikator PL-Grid, który jednoznacznie identyfikuje użytkownika w infrastrukturze. W procesie rejestracji użytkownika dane weryfikowane są przez operatora Centrum Operacyjnego PL-Grid z wykorzystaniem bazy danych: "Ludzie nauki" dostarczanej przez Ośrodek Przetwarzania Informacji (zwanej dalej bazą OPI). Użytkownik musi potwierdzić wprowadzone dane poprzez odpowiedź na e-mail wysłany przez operatora na adres zarejestrowany w bazie OPI. Osoby niezarejestrowane w OPI (doktoranci, studenci) lub osoby, których dane w bazie OPI są niekompletne bądź nieaktualne, zobowiązane są wskazać opiekuna naukowego, którego dane w OPI są aktualne i który spełnia warunki określone dla użytkownika infrastruktury PL-Grid. Opiekun naukowy potwierdza autentyczność danych osobowych i związek z działalnością naukową wykonywaną za jego wiedzą. Opiekun naukowy nie jest prawnie odpowiedzialny za niezgodne z prawem działania potwierdzonego przez niego użytkownika. Potwierdzenie użytkownika przez opiekuna naukowego jest traktowane jako potwierdzenie tożsamości użytkownika i jego udziału w pracach naukowych. 13

https://portal.plgrid.pl 14

Dostęp do zasobów 15

Dostęp do zasobów i granty obliczeniowe Aby uzyskać dostęp do zasobów (będąc już zarejestrowanym użytkownikiem PLGridu) należy ubiegać się o uaktywnienie wybranych usług dostępowych PL-Grid. Przydział zasobów dla użytkownika poprzez którąkolwiek z usług dostępowych jest bezpłatny i realizowany w oparciu o granty obliczeniowe PL-Grid. Procedura przydzielania takiego grantu jest prowadzona przez Centrum Operacyjne PL-Grid. Wyróżniamy dwa rodzaje grantów obliczeniowych: - podstawowy grant PL-Grid uzyskiwany automatycznie po uruchomieniu pierwszej usługi dostępowej; daje on prawo do używania ograniczonej puli zasobów, której parametry są określone w Portalu Użytkowników; parametry podstawowego grantu PL-Grid mogą być zmieniane przez Centrum Operacyjne po stosownej informacji przesłanej do użytkownika i zmiany takie nie wymagają jego zgody, - właściwy grant PL-Grid użytkownik lub grupa użytkowników może uzyskać prawo do używania rozszerzonych zasobów poprzez złożenie wniosku o taki grant w Portalu Użytkowników; opis grantu musi zawierać uzasadnienie merytoryczne i techniczną specyfikację potrzebnych usług i zasobów, a także wymagane parametry ich jakości; uzgodnione z użytkownikiem parametry właściwego grantu PL-Grid nie mogą być zmienione bez jego zgody. Rozszerzone zasoby są dostępne jedynie dla użytkownika lub grupy, dla której zostały przyznane. 16

PL-Grid strona projektu www.plgrid.pl 17

PL-Grid Projekt ankieta www.plgrid.pl/ankieta 18

PL-Grid Projekt ankieta www.plgrid.pl/ankieta 19

Vine Toolkit Architektura systemu Technologie Aplikacje dziedzinowe: NAMD, Abinit, NWChem, Quantum ESPRESSO.. Adobe Flex / BlazeDS Portal Java / Portlets Vine Toolkit framework Java / Web Services Zasoby obliczeniowe ( systemy kolejkowe, klastry, gridy ), rozproszone repozytoria danych. Web Services / kod wykonywalny

Vine Toolkit Nanotechnology Gateway Zarządzanie plikami Zarządzanie certyfikatami Zarządzanie aplikacjami w portalu Aplikacja do łączenia się z zasobem po ssh ( konsola z poziomu portalu ) Aplikacje dziedzinowe Prosty dostęp do systemu, rejestracja przez portal, Facebook, Google, konta demo.. 21

Vine Toolkit Nanotechnology Gateway Aplikacja Abinit Wyznaczenie minimalnej energii całkowitej układu Współpraca PCSS z WFT PP (zespół Prof. R. Czajki) Symulacje dużej skali bazujące na Density Functional Theory (DFT) oraz Many-Body Perturbation Theory Aby ukryć skomplikowane scenariusze użycia narzędzi w trybie command-line stworzyliśmy zaawansowane interfejsy WWW pozwalające na łatwy dostęp do zasobów i wyników. Użyte technologie pozwoliły na opracowanie zaawansowanych narzędzi do bezpośredniej analizy wyników w postaci dynamicznych wykresów oraz graficznej reprezentacji danych. Zintegrowaliśmy oferowane narzędzia w jednym całość oszczędzając czas użytkownika, który może dowolnie zarządzać i przetwarzać swoje dane z poziomu portalu. Portal uzupełniliśmy o aplikacje do łączenia się z kontem użytkownika przez SSH dla użytkowników preferująca zaawansowany dostęp do zasobów. 22

Nanotechnology Gateway

Nanotechnology Gateway

Nanotechnology Gateway Space group client pozwala tworzyć modele struktur wielocząsteczkowych na podstawie kilku zadanych atomów i jednej z 230 zdefiniowanych grup symetrii. Structure editor umożliwia graficzną edycję powyższego modelu (dodawanie/usuwanie atomów itp.)

Nanotechnology Gateway Górny wykres, zbieżność obliczeń dla danego podzadania. Dolny wykres, minimalna energia całkowita.

Nanotechnology Gateway Wykres gęstości stanów. Generowane są również wykresy struktur pasmowych.

NWChem

NWChem

NWChem

Portal demo Zapraszamy do naszego portalu, gdzie bez żadnych formalności można otrzymać testowe konto: http://elder20.man.poznan.pl

Portal demo Użytkownik po przyznaniu konta ma dostęp do testowej infrastruktury oraz zestawu aplikacji przedstawionych na poprzednich slajdach demonstrujących możliwości oprogramowania Vine Toolkit Dla użytkowników serwisów społecznościowych przewidzieliśmy dwie dodatkowe drogi rejestracji i testowania naszych aplikacji: Udostępnienie narzędzi z poziomu Facebook'a : http://elder20.man.poznan.pl/widget/web/vine/fbapplication/-/vinefbapp_war_vin efbappportlet_instance_dd3s/ Narzędzia dla użytkowników posiadających dostęp do igoogle: http://elder20.man.poznan.pl/widget/web/vine/googleapplication/-/vinegoogleapp_ WAR_VineGoogleAppportlet_INSTANCE_7dZe 32

Dziękuje za uwagę! Zapraszamy do stoiska PL-Grid Przydatne linki: http://www.plgrid.pl http://vinetoolkit.org http://www.youtube.com/user/vinetoolkit http://elder20.man.poznan.pl http://www.man.poznan.pl deepres@man.poznan.pl 33