PLGrid: informatyczne usługi i narzędzia wsparcia w nauce

Transkrypt

1 PLGrid: informatyczne usługi i narzędzia wsparcia w nauce Maciej Czuchry, Mariola Czuchry ACK Cyfronet AGH Wydział Rolniczo-Ekonomiczny, UR Kraków

2 Plan prezentacji Infrastruktura PLGrid Oferta Wsparcie użytkowników Dostęp do usług Podsumowanie Kontakt

3 ACK Cyfronet AGH Działalność Centrum Komputery Dużej Mocy (HPC) Miejska Sieć Komputerowa (MAN) Oprogramowanie specjalistyczne Badania naukowe Organizacja konferencji naukowych Cracow Grid Workshop KU KDM e-nauczanie

4 Dziedzinowe Usługi Nowej Generacji w Infrastrukturze PLGrid dla Polskiej Nauki Centrum Kompetencji w Zakresie Rozproszonych Infrastruktur Obliczeniowych Typu Gridowego - PLGridCore

5 Infrastruktura PLGrid Konsorcjum polskich Centrów Komputerowych Akademickie Centrum Komputerowe CYFRONET AGH w Krakowie (koordynator, Centrum Operacyjne) Centrum Informatyczne Trójmiejskiej Akademickiej Sieci Komputerowej Poznańskie Centrum Superkomputerowo Sieciowe w Poznaniu Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego w Warszawie Wrocławskie Centrum Sieciowo - Superkomputerowe we Wrocławiu

6 Oferta > 588 TFLOPS rdzeni TB RAM 5.8 PB dysków > 350 aplikacji

7 Oferta Narzędzia pracy zespołowej

8 Oferta Oprogramowanie Biologia: AutoDock/AutoGrid, BLAST, Clustal, CPMD, Gromacs, NAMD Chemia kwantowa: ADF, Amber, CFOUR, Dalton, GAMESS, Gaussian, Molpro, MOPAC, NWChem, Siesta, TURBOMOLE Fizyka: ANSYS Fluent, Abaqus, Meep, OpenFOAM, ROOT, Geant Obliczenia matematyczne i symulacje: MATLAB (Simulink), R (Bioconductor), Wolfram Mathematica Możliwość wykorzystania własnych licencji Możliwość instalacji dowolnego oprogramowania

9 Przykłady - Grid Life Science Tematyka: Dotyczy żywych organizmów, w tym ludzi, zwierząt oraz roślin Do tej grupy zalicza się: biologię, biotechnologię, biomedycynę, bioinformatykę, genomikę, proteomikę, farmację Usługi Platform integromicznych analiz danych z mikromacierzy DNA Środowisko Galaxy GeneSpring GX Grupy użytkowników Pracownicy naukowi, doktoranci i studenci kierunków BIO-INFO Biolodzy molekularni i bioinformatycy Lekarze i genetycy

10 Przykłady - Grid Ekologia Tematyka: w całości poświęcona ekologii Usługi Obserwacje fenologiczne Ciągły zautomatyzowany monitoring wybranych ekosystemów Obserwacja pojawów i zmian faz fenologicznych Obserwacje nasion Ciągły monitoring warunków w przechowalniach nasion System informowania użytkowników o wykrywanych anomaliach Obserwacje meteorologiczne (tło dla obserwacji fenologicznych)

11 Wsparcie użytkowników Szkolenia zdalne - lub z trenerem - informacje na Podręcznik Użytkownika Dostępny online Forum użytkowników Konsultacje z ekspertami Za pośrednictwem Helpdesk PLGrid: helpdesk@plgrid.pl

12 Dostęp do zasobów Dostęp do zasobów oferowanych w Infrastrukturze PLGrid jest nieodpłatny dla naukowców i wszystkich osób prowadzących działalność naukową, związaną z uczelnią lub instytutem naukowym w Polsce: pracownicy naukowi i dydaktyczni współpracownicy polscy i zagraniczni doktoranci studenci w ramach prac dyplomowych osoby uczestniczące w badaniach naukowych zespoły naukowe Rozliczeniem są publikacje, w których powinny znaleźć się podziękowania: Praca została wykonana z wykorzystaniem Infrastruktury PL Grid. lub This research was supported in part by PL Grid Infrastructure.

13 Dostęp do zasobów Rejestracja elektroniczna przez Portal Użytkownika PLGrid ( Dwa rodzaje kont: opiekun naukowy i podopieczny Granty osobiste i właściwe Zespoły naukowe

14 Podsumowanie Zalety: Nieodpłatny dostęp do zasobów Rozbudowane narzędzia wsparcia Szybka i prosta rejestracja Duży wybór aplikacji Gwarancja otrzymania zasobów Skrócenie czasu oczekiwania na wyniki Dopasowanie zasobów do własnych potrzeb Usprawnienie pracy także zespołowej Konsultacje z ekspertami Konkurs na najlepszą pracę doktorską 2015 zrealizowaną przy wykorzystaniu zasobów ACK Cyfronet AGH Szczegóły na stronie Ogłoszenie wyników w trakcie Dnia Otwartego CYFRONETu

15 Kontakt Helpdesk PLGrid