POTENCJAŁ BADAWCZY INSTYTUTU BOTANIKI im. W. SZAFERA POLSKIEJ AKADEMII NAUK

Transkrypt

1 POTENCJAŁ BADAWCZY INSTYTUTU BOTANIKI im. W. SZAFERA POLSKIEJ AKADEMII NAUK Warszawa 2017 Fot. Marcin Zięba (Polish-Swiss Research Programme)

2 to nowoczesna placówka naukowa prowadzącą badania z zakresu: ekologii teoretycznej i stosowanej; badań genetycznych, w tym analiz filogenetycznych i filogeograficznych; systematyki ewolucyjnej; geobotaniki; fitogeografii; taksonomii roślin naczyniowych, mszaków, glonów, grzybów, porostów i śluzowców; różnorodności flor współczesnych i kopalnych.

3 Profil badań Kryminalistyka Analityka chemiczna Biotechnologia & Life Science Inżynieria i ochrona środowiska wpływ zanieczyszczeń powietrza na środowisko; biologia i ekologia organizmów w terenach obciążonych metalami ciężkimi; renaturyzacja obszarów zdegradowanych; struktura bioróżnorodności i dynamika jej zmian w czasie i przestrzeni; badania nad taksonomią, florystyką i biogeografią różnych grup organizmów.

4 Oferta IB PAN specjalistyczne analizy chemiczne z zakresu ekotoksykologii cieczy (wody płynące, opady atmosferyczne) oraz ciał stałych (składu chemicznego roślin i innych organizmów); analizy i ekspertyzy z zakresu biologicznej oceny czystości wód; specjalistyczne badania z zastosowaniem laboratoryjnych analiz zmienności DNA w próbach roślin i grzybów z populacji dzikich i hodowlanych, a także kultur tkankowych; ekspertyzy mykologiczne pomieszczeń mieszkalnych i użytkowych, materiałów budowlanych; ocena obecności i uszkodzeń wywołanych przez grzyby w zabytkach kultury pomniki, elewacje, obrazy olejne, gwasze, akwarele, tkaniny; badania z zastosowaniem analizy pyłkowej i analizy szczątków makroskopowych wspomagające procesy identyfikacji, znajdujące zastosowanie w kryminalistyce..

5 Stacja terenowa Zakładu Ekologii IB PAN Doskonale wyposażone pracownie: laboratorium chromatograficzne; laboratorium spektrofotometrii; laboratorium analiz siarki i węgla; laboratorium analiz azotu i inne; i inne umożliwiające wykonywanie specjalistycznych analiz chemicznych z zakresu ekotoksykologii na poziomie światowym.

6 Aparatura badawcza dostępna w Stacji Chromatograf gradientowy Dionex-500 i automatyczny ekstraktor prób ASE Chromatograf gazowy 3900 Saturn 2100T GC/MS firmy Varian z detektorem masowym typu pułapka jonowa Varian 280FS Zeeman Spektrofotometr absorpcji atomowej Analizator LECO AMA 254 Analizator firmy LECO RC 612

7 Przykładowe projekty Zmienność stechiometrii pierwiastków w mchu Pleurozium schreberi w dużej skali przestrzennej (Polska) w warunkach zróżnicowanej antropopresji Effects of heavy metal deposition in Poland using bryophytes as bioindicators

8 Przykładowe projekty Adaptation of Arabidopsis halleri to metal-polluted soils: linking environmental, genomic, and phenotypic information Poznanie genetycznych i fizjologicznych podstaw tolerancji i hiperakumulacji metali ciężkich u roślin

9 Pracownia Analiz Molekularnych sekwencjonowanie regionów DNA metodą Sangera; klasyczne genotypowanie osobników (metoda AFLP Amplified Fragment Length Polymorphism); sekwencjonowanie i genotypowanie masowe DNA w oparciu o sekwencjonowanie NGS. Elektroferogramy sekwencjonowania metodą Sangera Analizy profilów restrykcyjnych DNA Fragment matrycy genotypowania AFLP Fragment matrycy sekwencjonowania NGS Warszawa r.

10 Przykładowe projekty DRYADE: The fate of ecological interactions in a changing climate: using next-generation sequencing technologies to unravel adaptive and historical processes in a community of interrelated arctic-alpine organisms ( ) Ewolucja i historyczna dynamika zasięgów lądowej bioty Antarktyki w świetle szczegółowych analiz filogeograficznych endemicznych gatunków mchów ( ) Warszawa r.

11 Aparatura badawcza dostępna w Pracowni kompletna platforma laboratoryjna do analiz z wykorzystaniem klasycznego sekwencjonowania i genotypowania; kompletna platforma laboratoryjna do analiz z wykorzystaniem sekwencjonowania nowej generacji (NGS) z odrębnym zapleczem do analiz DNA zdegradowanego (próby muzealne i środowiskowe). Automatyczny sekwenator 8-kapilarowy ABI 3500 Sekwenator NGS Illumina Miseq TapeStation 4200 aparat do precyzyjnego ilościowego i jakościowego profilowania próbki DNA Ultrasonikator Covaris aparat do precyzyjnej fragmentacji cząsteczek DNA Pippin Prep aparat do precyzyjnego frakcjonowania DNA

12 Tissue Lyser aparat do homogenizacji materiału biologicznego Termocyklery Veriti (Life Technologies) i Nexus (Eppendorf) aparaty do kierunkowej amplifikacji DNA FireReader UVITEC Cambridge system do archiwizacji i analizy danych z żeli elektroforetycznych