Zarządzanie populacjami zwierząt. Czynniki zaburzające równowagę Wykład 2

Podobne dokumenty
Zarządzanie populacjami zwierząt. Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT

Genetyka Populacji

2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 1 Biologia I MGR /

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI. Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt

Bliskie Spotkanie z Biologią. Genetyka populacji

2. CZYNNIKI ZABURZAJĄCE RÓWNOWAGĘ GENETYCZNĄ

1 Genetykapopulacyjna

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja

GENETYKA POPULACJI. Fot. W. Wołkow

Zarządzanie populacjami zwierząt. Efektywna wielkość populacji Wykład 3

Modelowanie ewolucji. Dobór i dryf genetyczny

PORÓWNYWANIE POPULACJI POD WZGLĘDEM STRUKTURY

Genetyka populacji. Efektywna wielkość populacji

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja

GENETYCZNE PODSTAWY ZMIENNOŚCI ORGANIZMÓW ZASADY DZIEDZICZENIA CECH PODSTAWY GENETYKI POPULACYJNEJ

Dobór naturalny. Ewolucjonizm i eugenika

Elementy teorii informacji w ewolucji

Dryf genetyczny i jego wpływ na rozkłady próbek z populacji - modele matematyczne. Adam Bobrowski, IM PAN Katowice

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf.

1 Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki. 2 Podstawowy model dziedziczenia

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja.

Ekologia molekularna. wykład 3

Dobór naturalny i dryf

Zadania maturalne z biologii - 7

Ekologia molekularna. wykład 4

Ewolucjonizm NEODARWINIZM. Dr Jacek Francikowski Uniwersyteckie Towarzystwo Naukowe Uniwersytet Śląski w Katowicach

Selekcja, dobór hodowlany. ESPZiWP

Genetyka populacyjna. Populacja

Podstawy genetyki populacji. Populacje o skończonej liczebności. Dryf. Modele wielogenowe.

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

Zadania z genetyki. Jacek Grzebyta. 21.XII.2005 version Powered by Λ. L A TEX 4 Unicode

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 4 Biologia I MGR

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT DRYF GENETYCZNY EFEKTYWNA WIELKOŚĆ POPULACJI PRZYROST INBREDU

a) Zapisz genotyp tego mężczyzny... oraz zaznacz poniżej (A, B, C lub D), jaki procent gamet tego mężczyzny będzie miało genotyp ax b.

Genetyka populacyjna

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf.

Ekologia ogólna. wykład 4. Metody molekularne Genetyka populacji

Genetyka populacyjna. Populacja

Ekologia molekularna. wykład 6

Genetyka ekologiczna i populacyjna W8

Strategie ewolucyjne zwiększające sukces reprodukcyjny krewnych kosztem własnego (Hamiliton, 1964) Dostosowanie łączne (inclusive fitness)

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja. Dobór i dryf.

Biologia medyczna, lekarski Ćwiczenie ; Ćwiczenie 19

Podstawy teorii ewolucji. Informacja i ewolucja

Podstawy genetyki populacji. Genetyka mendlowska i ewolucja

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 3 Biologia I MGR
























WSTĘP. Copyright 2011, Joanna Szyda

Podstawy teorii ewolucji. Informacja i ewolucja

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

Temat 12. Mechanizmy ewolucji

1. Analiza asocjacyjna. Cechy ciągłe. Cechy binarne. Analiza sprzężeń. Runs of homozygosity. Signatures of selection

Biologiczne podstawy ewolucji. Informacja genetyczna. Co to jest ewolucja.

Adam Łomnicki. Tom Numer 3 4 ( ) Strony Zakład Badania Ssaków PAN Białowieża adam.lomnicki@uj.edu.

Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV

Teoria ewolucji. Podstawowe pojęcia. Wspólne pochodzenie.

Zarządzanie populacjami zwierząt. Relacje między osobnikami w populacji spokrewnienie i inbred Depresja inbredowa Ocena efektów krzyżowania

Różnorodność genetyczna człowieka

GENETYKA. Genetyka. Dziedziczność przekazywanie cech rodziców potomstwu Zmienność występowanie różnic pomiędzy różnymi osobnikami tego samego gatunku

EGZAMIN DYPLOMOWY, część II, Biomatematyka

Polimorfizm genu mitochondrialnej polimerazy gamma (pol γ) w populacjach ludzkich Europy



Wprowadzenie do genetyki medycznej i sądowej

Teoria ewolucji. Dobór płciowy i krewniaczy. Adaptacje. Dryf genetyczny.

GIMNAZJUM SPRAWDZIANY SUKCES W NAUCE

Analiza sprzężeń u człowieka. Podstawy

Podstawy genetyki. ESPZiWP 2010

Zadania do cz. II (z frekwencji i prawa Hardy ego-weinberga)

Teoria ewolucji. Dobór naturalny. Dobór płciowy.

Genetyka i przyszłość człowieka

Mapowanie genów cz owieka. podstawy

Zmienność genetyczna i zysk genetyczny w hodowli selekcyjnej drzew leśnych

Różnorodność genetyczna człowieka. Ewolucja i eugenika

Analiza sprzężeń u człowieka. Podstawy

o cechach dziedziczonych decyduje środowisko, a gatunki mogą łatwo i spontanicznie przechodzić jedne w drugie

Transkrypt:

Zarządzanie oulacjami zierząt Czynniki zaburzające rónoagę Wykład

Czynniki łyające na rónoagę genetyczną oulacji - SELEKCJA Zróżnicoane radoodobieństo ozostaienia otomsta Wskaźnik rerodukcji netto R = S * B S rzeżyalność rozumiana jako frakcja genotyó, które o szystkich etaach rozoju mają szansę ozostaienia otomsta B skaźnik rozrodczości zależny od liczby otomkó Miara zględna rerodukcji netto - sółczynnik zględnego dostosoania s = 1 sółczynnik selekcji

SELEKCJA Genotyy AA Aa aa Suma Pokolenie 0 ++ =1 W = 1- s 1 Frekencja o selekcji 1 + 1 + Frekencja alleli 1 ' 1 '

Zmiana frekencji allelu ] ) (1 [ ) ( ) ( ) ( ) ( ' 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ) (1 1 )] ( ) ( [ ] [ ] ) ( [ ] ) ( [ 1 1 1 1 1 1

Zmiana frekencji alleli [ ( 1) ( 1 )] ' [ ( 1) ( 1 )] '

SELEKCJA Jeśli = 1 = to = = 0 Jeśli lub = 0 to ( ) = 0 Jeśli (ariancja) = 0 to ( ) = 0 Jeśli = = 0,5 to ( ) najiększa

Selekcja rzeci jednej z form homozygotycznych n. aa jeśli = 0 czyli s = 1 Frekencja allelu a okoleniu t zależy od numeru okolenia t i od częstości yjścioej 0 t 0 1 t Liczba okoleń otrzebna do zmiany frekencji z 0 do t : 0 t 0 0 t t N. zmiana z 0 =0,5 do t =0,05 t = (0,5-0,05)/(0,05) = 0,45/0,05 = 18

Selekcja rzeci jednej z form homozygotycznych n. aa Jeśli ( 1 ) = 1 oraz > 0 s = 1- Zmiana frekencji allelu a 1 s s Frekencja allelu a dąży do 0 Przy malejącej frekencji allelu a zmiana frekencji olniejsza \ s 0, 0,4 0,6 0,8 1 0,9 0,88 0,85 0,81 0,7 0,47 0,7 0,67 0,63 0,58 0,51 0,41 0,5 0,47 0,44 0,41 0,38 0,33 0,3 0,9 0,7 0,6 0,5 0,3 0,1 0,10 0,10 0,09 0,09 0,09

Selekcja faoryzująca heterozygoty = 1 - s 1 = 1 = 1 s Czy możlia jest zmiana frekencji alleli? Na rzykład < 0 s s Czyli (s s ) < 0 Natomiast częstość allelu a będzie zrastać (Δ > 0) jeśli yrażenie: (s - s ) > 0, znaczy będzie to tedy, gdy częstość allelu A ysoka. Zatem frekencja unkcie rónoagi e s s s W yniku takiej selekcji oulacja osiąga stan rónoagi, a frekencja unkcie rónoagi zależy od s. selekcji obu form homozygotycznych jeśli s = s to e = 0,5

Selekcja rzeci heterozygotom 1 < oraz 1 < Czy możliy jest brak zmian e frekencji alleli? Na rzykład = 0 [ ( 1) ( 1 )] ' Czyli gdy ( 1 ) + ( 1 ) = 0

Załóżmy, że 1 = 0 oraz = 0 Rónoaga będzie osiągnięta gdy = Ale kiedy zmiana częstości allelu a będzie iększa od 0? ( 1 ) + ( 1 ) > 0 > 0 > Przy iększej frekencji allelu a zmiana będzie olegała na dalszym zroście frekencji tego allelu

W yniku selekcji rzeci heterozygotom Poulacja może osiągnąć stan rónoagi genetycznej Rónoaga ta będzie miała charakter rónoagi niestabilnej Odejście od stanu rónoagi ziększona (zmniejszona) frekencja allelu będzie oodoać jej dalsze ziększanie (zmniejszanie)

Migracja 1 S 1 i m m i m i m roorcja liczebności imigrantó stosunku do oulacji zbogacanej

MIGRACJA n s 000 n m 00 m \ s 0,1 0, 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1 0,05 0,095 0,186 0,77 0,368 0,459 0,550 0,641 0,73 0,83 0,914 0,5 0,4 0,05 0,95 0,386 0,477 0,568 0,659 0,750 0,841 0,93 0,45 0,13 0,3 0,314 0,405 0,495 0,586 0,677 0,768 0,859 0,950 0,65 0,150 0,41 0,33 0,43 0,514 0,605 0,695 0,786 0,877 0,968 0,85 0,168 0,59 0,350 0,441 0,53 0,63 0,714 0,805 0,895 0,986

MIGRACJA n s 000 n m 100 m \ s 0,1 0, 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1 0,05 0,098 0,193 0,88 0,383 0,479 0,574 0,669 0,764 0,860 0,955 0,5 0,107 0,0 0,98 0,393 0,488 0,583 0,679 0,774 0,869 0,964 0,45 0,7 0,1 0,307 0,40 0,498 0,593 0,688 0,783 0,879 0,974 0,65 0,16 0,1 0,317 0,41 0,507 0,60 0,698 0,793 0,888 0,983 0,85 0,136 0,31 0,36 0,41 0,517 0,61 0,707 0,80 0,898 0,993

MUTACJA Zakładamy, że yjścioo ystęuje tylko allel A. W nastęnym okoleniu, frekencja allelu A będzie omniejszona o liczbę zmutoanych t = ; = 1* (1-u); = 0* (1- u) t t = 0* (1-u) t u \ t 1000 000 5000 10000 1 na 1000 0,3677 0,135 0,0067 0,0000 1 na 10000 0,9048 0,8187 0,6065 0,3679 1 na 100000 0,9900 0,980 0,951 0,9048 1 na 1000000 0,9990 0,9980 0,9950 0,9900

MUTACJA u temo mutacji A a v temo mutacji a A 1 u v

e u u v N - liczba okoleń na zmianę frekencji z 0 do N N ln( 0 e ) ln( u v N e ) Przykład: u = v = 10-6 e = 0,5 0 N N 0,6 0,51 30 585 0,7 0,51 995 73 0,8 0,51 3 401 197 0,9 0,51 3 688 879

Większość mutacji genó ystęuje bardzo rzadko (10-4 do 10-6 na okolenie). Jednakże naet rzy tak niskiej ojedynczej częstości, obec ogromu genó i ielu alleli, mutacje mogą torzyć zmienność. Wielkość oulacji róna jest N, mamy N koii każdego genu. N oulacja ludzi N=6 mld, a zatem N=1 mld ludzka gameta zaiera ok. 10 9 ar nukleotydó jeśli gamecie średnio 3 noe mutacje to zygocie 6 oulacji 36 mld noych form alleli, których mogło nie być e cześniejszym okoleniu.

DRYF GENETYCZNY Przyadkoe zmiany częstości alleli szczególnie ażne małych oulacjach

DRYF GENETYCZNY Wybieramy z dużej oulacji o ==0,5 da osobniki na rodzicó, radoodobieństo ybrania danej liczby alleli jednego rodzaju jest zgodny z rozkładem Bernouliego n k n k Pn ( X k), (1 ) gdy 0 1 oraz k k liczba alleli radood. 0 0,0039 0 1 1 0,0313 0,15 0,875 0,1094 0,5 0,75 3 0,188 0,375 0,65 4 0,734 0,5 0,5 5 0,188 0,65 0,375 6 0,1094 0,75 0,5 7 0,0313 0,875 0,15 8 0,0039 1 0 0,1... n

Na dzisiaj ystarczy, dziękuję