OPIS PRZEDMIOTÓW REALIZOWANYCH W KATEDRZE MIKROBIOLOGII ŚRODOWISKOWEJ STUDIA STACJONARNE PIERWSZEGO STOPNIA - INŻYNIERSKIE Mikrobiologia Rola mikrobiologii. Świat mikroorganizmów: wirusy, bakterie, archebakterie, grzyby, niektóre glony i pierwotniaki. Prokariota i Eukariota różnice w budowie komórki. Morfologia i fizjologia mikroorganizmów. Metabolizm drobnoustrojów. Rola drobnoustrojów w obiegu pierwiastków. Metody stosowane w badaniach drobnoustrojów. Mikrobiologia środowisk naturalnych Badania mikrobiologiczne środowisk naturalnych: wód, powietrza i gleb, metodami hodowlanymi i mikroskopowymi. Zasady oceny jakości wód, powietrza i gleby według kryteriów mikrobiologicznych. Źródła zanieczyszczeń mikrobiologicznych środowisk naturalnych. Drobnoustroje chorobotwórcze w środowiskach naturalnych. Ekologia mikroorganizmów Zasady i metody izolacji i identyfikacji mikroorganizmów. Bioróżnorodność mikroorganizmów w ekosystemach naturalnych. Przeżywalność i aktywność metaboliczna drobnoustrojów. Wzajemne oddziaływania pomiędzy mikroorganizmami i między mikroorganizmami a organizmami wyższymi.
Seminaria dyplomowe (III rok) Zapoznanie studentów ze stanem wiedzy i dorobkiem innych autorów w zakresie danego problemu. Nabycie umiejętności korzystania z literatury fachowej oraz opanowanie podstawowych zasad techniki pisania prac dyplomowych. Seminaria dyplomowe (IV rok) Struktura i plan pracy dyplomowej. Nauka prezentowania przeglądu literatury, wyników i wniosków. Przygotowanie do obrony pracy dyplomowej. STUDIA STACJONARNE DRUGIEGO STOPNIA MAGISTERSKIE Drobnoustroje w biotechnologii Rola drobnoustrojów w wybranych działach biotechnologii ze szczególnym uwzględnieniem ochrony środowisk naturalnych. Wyodrębnienie, selekcja i praktyczne wykorzystanie korzystnych szczepów izolowanych z różnych środowisk. Korzystny i szkodliwy wpływ drobnoustrojów na procesy biotechnologiczne. Bioremediacje, biosynteza związków oraz społeczne skutki zdobyczy biotechnologii z udziałem mikroorganizmów. Mikrobiologia wód Mikroflora zasiedlająca różne typy rezerwuarów wód. Mikrobiologiczne aspekty zanieczyszczeń zbiorników wodnych. Sposoby oczyszczania wód powierzchniowych i uzdatniania wód przeznaczonych do konsumpcji.
STUDIA NIESTACJONARNE PIERWSZEGO STOPNIA INŻYNIERSKIE Mikrobiologia Rola mikrobiologii. Świat mikroorganizmów: wirusy, bakterie, archebakterie, grzyby, niektóre glony i pierwotniaki. Prokariota i Eukariota różnice w budowie komórki. Morfologia i fizjologia mikroorganizmów. Metabolizm drobnoustrojów. Rola drobnoustrojów w obiegu pierwiastków. Metody stosowane w badaniach drobnoustrojów. STUDIA NIESTACJONARNE DRUGIEGO STOPNIA MAGISTERSKIE Proseminaria (rok I) Zapoznanie studentów z tematyką prac dyplomowych realizowanych w Katedrze, związanych z kierunkiem kształcenia ochrona środowiska. Rodzaje i formy prac dyplomowych magisterskich. Seminaria magisterskie (rok I i II) Zasady konstrukcji prac dyplomowych. Technika i forma tekstu pracy. Prezentacje własnych prac. PRZEDMIOTY DO WYBORU Drobnoustroje środowisk naturalnych Rola i znaczenie drobnoustrojów w środowiskach naturalnych. Bioróżnorodność mikroorganizmów w środowiskach naturalnych. Ekologia mikroorganizmów. Procesy samooczyszczania środowisk z udziałem mikroorganizmów.
Mikrobiologia sanitarna Treści przedmiotu mikrobiologii sanitarnej pozwolą na poznanie zagrożeń epidemiologicznych i ich źródeł oraz dróg szerzenia się chorób wywołanych przez drobnoustroje patogenne i potencjalnie patogenne Studenci poznają metody izolacji i identyfikacji bakterii wskaźnikowych oraz chorobotwórczych z różnych środowisk, a także czynniki wpływające na ich eliminację. Mikrobiologia molekularna Poznanie i praktyczne wykonanie analiz mikrobiologicznych z zastosowaniem wybranych metod biologii molekularnej. Skład ilościowy i struktura gatunkowa populacji mikroorganizmów w próbach środowiskowych bez konieczności stosowania metod hodowlanych. Przygotowanie i wykonanie mikrobiologicznych analiz z różnych materiałów: ryby, pasza, woda, gleba, powietrze, osady denne, osady ściekowe i ścieki, w oparciu o nowoczesne metody badawcze. Genetyka bakterii Poznanie podstawowych pojęć, praw i mechanizmów genetyki organizmów prokariotycznych ze wskazaniem na te szczególnie przydatne w ujęciu mikrobiologii środowiskowej. Kluczowe zagadnienia struktury i funkcji materiału genetycznego bakterii środowiskowych. Wymiana materiału genetycznego pomiędzy mikroorganizmami. Podstawowe i nowe metody biologii molekularnej w genetyce. Genomika bakterii Poznanie struktury genomów bakteryjnych - mapy genetyczne, fizyczne. Molekularne podstawy zróżnicowania genetycznego bakterii i analiza funkcji genów bakteryjnych. Organizacji genomów archebakterii
i eubakerii oraz analiza zmienności w populacjach tych drobnoustrojów. Wprowadzenie do zagadnień proteomiki, transkryptomiki, metaboleomiki i bioinformatyki bakterii.