Podobne dokumenty


Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii Wydział Biologii UW.


Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii Wydział Biologii UW

Instytut Mikrobiologii

Instytut Mikrobiologii

Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii Wydział Biologii UW

ZAKŁAD WIRUSOLOGII Instytut Mikrobiologii

Zakład Mikrobiologii Stosowanej RUPA BADAWCZA FIZJOLOGIA BAKTERII

Mobilom bakterii ekstremofilnych i jego rola w adaptacji do środowisk ekstremalnych Łukasz Dziewit

ZAKŁAD WIRUSOLOGII Instytut Mikrobiologii.

Bloki licencjackie i studia magisterskie na Kierunkach: Biotechnologia, specjalność Biotechnologia roślinna oraz Genetyka

... J.~.~, J I I. .. fa)<zk.,~1;1 ;?.~~

Sesja sponsorowana przez Polską Sieć Biologii Molekularnej SESJA 1 ORGANIZACJA MATERIAŁU GENETYCZNEGO WYKŁADY

Program studiów I st. (licencjackich) na kieruneku Biotechnologia

Program studiów I st. (licencjackich) na kieruneku Biotechnologia

Strona 1 z 8. Warszawa, 17 lipca 2015 r. Załącznik nr 1.

OPIS PRZEDMIOTÓW REALIZOWANYCH W KATEDRZE MIKROBIOLOGII ŚRODOWISKOWEJ

UNIWERSYTET WARSZAWSKI. ul. ILJI MIECZNIKOWA 1, WARSZAWA

Specjalność (studia II stopnia) Oczyszczanie i analiza produktów biotechnologicznych

Promotor pracy doktorskiej: prof. dr hab. Jacek Bardowski Promotor pomocniczy: dr Urszula Zielenkiewicz

SYLABUS. Wydział Biologiczno-Rolniczy. Katedra Biochemii i Biologii Komórki

prof. dr hab. Dariusz Bartosik Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii Uniwersytet Warszawski ul. Miecznikowa Warszawa

UCHWAŁA. Warszawa 18 maja 2016 r.

Sylabus Biologia molekularna

Laboratorium Pomorskiego Parku Naukowo-Technologicznego Gdynia.

Sylabus Biologia molekularna

Techniki molekularne w mikrobiologii SYLABUS A. Informacje ogólne

Pytania Egzamin magisterski

Rok akademicki: 2014/2015 Kod: EIB BN-s Punkty ECTS: 3. Kierunek: Inżynieria Biomedyczna Specjalność: Bionanotechnologie

Plan studiów NA KIERUNKU STUDIÓW WYŻSZYCH: BIOCHEMIA II stopień

SYLABUS. Wydział Biologiczno-Rolniczy. Katedra Biochemii i Biologii Komórki

BLOK LICENCJACKI GENETYCZNY

P l a n s t u d i ó w

Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu

KARTA KURSU. Podstawy mikrobiologii i immunologii. Dr hab. Magdalena Greczek- Stachura

Biologia medyczna, materiały dla studentów

Plan studiów na kierunku studiów wyższych: BIOCHEMIA studia pierwszego stopnia, profil ogólnoakademicki

BIOTECHNOLOGIA ZAGADNIENIA EGZAMINACYJNE NA MAGISTERSKI EGZAMIN DYPLOMOWY (2017/2018)

Plan studiów na kierunku studiów wyższych: BIOCHEMIA studia pierwszego stopnia, profil ogólnoakademicki

Prof. dr hab. E. K. Jagusztyn-Krynicka UNIWERSYTET WARSZAWSKI WYDZIAŁ BIOLOGII INSTYTUT MIKROBIOLOGII ZAKŁAD GENETYKI BAKTERII

hab. Annę Krasowską, obejmującym prace nad wyjaśnieniem wpływu źródeł węgla fermentowalnych (glukoza) jak i niefermentowalnych (kwas mlekowy, kwas

Program sesji sprawozdawczej Warszawa, Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk środa.

SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA

Nowy kierunek studiów na Wydziale Nauk Biologicznych Uniwersytetu Wrocławskiego. Studia licencjackie i magisterskie

ZASADY PRZYZNAWANIA STYPENDIÓW ZA WYNIKI W NAUCE NA WYDZIALE BIOTECHNOLOGII UNIWERSYTETU WROCŁAWSKIEGO

Analiza stabilności białka DnaA Escherichia coli w regulacji inicjacji replikacji DNA

Rozkład materiału z biologii dla klasy III AD. 7 godz / tyg rok szkolny 2016/17

Mikrobiologia ogólna - opis przedmiotu

Zagadnienia na egzamin licencjacki, kierunek: Biologia Medyczna I st. Rok akad. 2018/2019

Metody inżynierii genetycznej SYLABUS A. Informacje ogólne

BIOTECHNOLOGIA MEDYCZNA

SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA

BLOK LICENCJACKI GENETYCZNY

1

Bożena Nejman-Faleńczyk

Zagadnienia na egzamin magisterski na kierunku Biologia Rok akad. 2017/2018

Wydział Biologii i Ochrony Środowiska Kierunek BIOLOGIA Specjalność Biologia Ogólna i Eksperymentalna BOE

Techniki znakowania cząsteczek biologicznych - opis przedmiotu

Uniwersytet Łódzki, Instytut Biochemii

LISTA BADAŃ PROWADZONYCH W RAMACH ELASTYCZNEGO ZAKRESU AKREDYTACJI NR 1/LEM wydanie nr 6 z dnia Technika Real - time PCR

Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19

Wzorcowe efekty kształcenia dla kierunku studiów biotechnologia studia pierwszego stopnia profil ogólnoakademicki

E f e k t y k s z t a ł c e n i a

Biologia molekularna

BIOTECHNOLOGIA I BIOLOGIA EKSPERYMENTALNA ROŚLIN

Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii

kierunek: Biologia studia stacjonarne II stopnia realizacja od roku akad. 2018/2019

Drożdże piekarskie jako organizm modelowy w genetyce

Konstrukcja wektora plazmidowego DNA do klonowania genów i/lub wektora plazmidowego do sekrecji w bakteriach mlekowych

Zagadnienia na egzamin magisterski na kierunku Biologia Rok akad. 2018/2019

PLAN STUDIÓW. Rodzaj zajęć. e-nauczanie,

Pracownicy samodzielni: dr hab. Piotr Bębas Kierownik Zakładu prof. dr hab. Krystyna Skwarło-Sońta pracownik emerytowany

Mikrobiologia SYLABUS A. Informacje ogólne

LISTA BADAŃ PROWADZONYCH W RAMACH ELASTYCZNEGO ZAKRESU AKREDYTACJI NR 1/LEM wydanie nr 7 z dnia Technika Real - time PCR

UNIWERSYTET ROLNICZY IM. HUGONA KOŁŁĄTAJA W KRAKOWIE WYDZIAŁ BIOTECHNOLOGII I OGRODNICTWA

specjalność: mikrobiologia medyczna, immunologia i diagnostyka laboratoryjna o GENETYKA*

Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19/20

Uniwersytet Łódzki, Instytut Biochemii

Zawartość. Wstęp 1. Historia wirusologii. 2. Klasyfikacja wirusów

KARTA PRZEDMIOTU. (pieczęć wydziału) Z1-PU7 WYDANIE N1 Strona 8 z 9

RUPA BADAWCZA FIZJOLOGIA BAKTERII w Zakładzie Mikrobiologii Stosowanej

KARTA KURSU. Biotechnology in Environmental Protection. Kod Punktacja ECTS* 1

Zakład Anatomii i Cytologii Roślin Instytut Biologii Eksperymentalnej i Biotechnologii Roślin Grupa badawcza: prof. dr hab. Danuta Maria Antosiewicz

1

UCHWAŁA Nr 31/2014 Senatu Uniwersytetu Wrocławskiego z dnia 26 marca 2014 r.

Możliwości i potencjalne zastosowania Zintegrowanego Systemu Analitycznego do innowacyjnych i kompleksowych badań molekularnych

l.p Nazwisko i imię Temat pracy Kierownik pracy Zakład/pracownia Opiekun UAM prof. dr hab. Artur Jarmołowski Jarmołowski dr Nina Antos- Krzemińska

KARTA PRZEDMIOTU. (pieczęć wydziału)

Jest to dziedzina biologiczna wywodząca się z biotechnologii. Bioinformatyka

Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2018/19/20/21

kierunek: Biologia studia niestacjonarne I stopnia realizacja od roku akad. 2013/2014 (I i II rok) ECTS w semestrze Przedmioty ogólne

kierunek: Biologia studia stacjonarne I stopnia realizacja od roku akad. 2014/2015 (I rok) ECTS w semestrze Przedmioty ogólne Przedmioty podstawowe

SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA (skrajne daty)

Pracownicy samodzielni: dr hab. Piotr Bębas Kierownik Zakładu dr hab. Paweł Majewski

Kierunek: Biotechnologia, rok I Rok akademicki 2016/2017

Zmień perspektywę! Zostań naukowcem!

Potencjał naukowo-badawczy Działu Genomiki i Biologii Molekularnej Zwierząt IZ PIB

Transkrypt:

Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii Wydział Biologii UW http://zgb.biol.uw.edu.pl/ kierownik: prof. dr hab. Dariusz Bartosik Pracownicy: 1) prof. dr hab. E. Katarzyna Jagusztyn-Krynicka 2) prof. dr hab. Krystyna I. Wolska 3) dr Jadwiga Baj 4) dr Łukasz Dziewit 5) dr Renata Godlewska 6) dr Anna Grudniak 7) dr Anna Łasica 8) dr Magdalena Szuplewska 9) dr Agnieszka Wyszyńska Doktoranci: 1) mgr Marcin Adamczuk 2) mgr Katarzyna Bocian 3) mgr Jakub Czarnecki 4) mgr Katarzyna Markowska 5) mgr Magdalena Grzeszczuk 6) mgr Jakub Jopek 7) mgr Patrycja Kobierecka 8) mgr Paweł Wawrzyniak 9) mgr Aleksandra Ziółkowska

Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii UW Miecznikowa 1, 02-096 Warszawa (http://zgb.biol.uw.edu.pl/) http://zgb.biol.uw.edu.pl/

Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii UW Miecznikowa 1, 02-096 Warszawa (http://zgb.biol.uw.edu.pl/) Studia licencjackie i magisterskie w ZGB W Zakładzie Genetyki Bakterii możliwe jest wykonywanie prac licencjackich eksperymentalnych bądź teoretycznych. Licencjaty stanowią małe, wyodrębnione zadania z zakresu zainteresowań poszczególnych grup badawczych. W trakcie wykonywania prac magisterskich i licencjackich studenci zapoznają się z technikami mikrobiologicznymi oraz technikami współczesnej biologii molekularnej i komórkowej. Stosują w swoich badaniach m.in.: różne metody izolacji DNA i RNA, elektroforezę DNA, elektroforezę białek (PAGE), PCR, oczyszczanie białek, Western blot, Southern blot, sekwencjonowanie DNA, analizy bioinformatyczne sekwencji, technikę ELISA, analizę oddziaływania bakterii z komórkami eukariotycznymi, eksperymenty wykorzystaniem modeli zwierzęcych. Zakład Genetyki Bakterii dysponuje 11 pracowniami, które mieszczą się na II, III i IV piętrze gmachu Wydziału Biologii (budynek A). W każdej pracowni stworzono samodzielne stanowiska pracy dla studentów.

Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii UW Miecznikowa 1, 02-096 Warszawa (http://zgb.biol.uw.edu.pl/) Prace opublikowane od 2000 roku - ponad 60 oryginalnych artykułów naukowych - 58 prac przeglądowych wyróżnienia w dorocznym konkursie Komitetu Mikrobiologii PAN na najlepszą pracę z dziedziny mikrobiologii wykonaną całkowicie w Kraju i opublikowaną w danym roku kalendarzowym (w latach 2007, 2008, 2012, 2013) nagrody Polskiego Towarzystwa Genetycznego w konkursie na najlepszą pracę wykonaną w polskich laboratoriach i opublikowaną w danym roku kalendarzowym z dziedziny mikrobiologii (nagrody przyznawane w latach 2001, 2002, 2003/2004, 2007, 2008, 2010) nagrody Polskiego Towarzystwa Mikrobiologów im. Prof. E. Mikulaszka (2005, 2010, 2012 nagrody dla dwóch zespołów ZGB, 2014)

Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii UW Miecznikowa 1, 02-096 Warszawa (http://zgb.biol.uw.edu.pl/) Aktualnie realizowane projekty badawcze - 9 grantów (MNiSW, NCN, NCBiR, FNP) Współpraca naukowa Instytut Biotechnologii i Antybiotyków, Pracownia Analizy Skażeń Środowiska WB UW, Zakład Biochemii Drobnoustrojów IBB PAN, Zakład Bakteriologii CZD; Centrum Onkologii, Instytut Żywności i Żywienia, Międzynarodowy Instytut Biologii Komórkowej i Molekularnej IBB PAN, Zakład Biochemii Roślin, Instytut Biochemii UW, Firma Nanotech, Zakład Biologii Antarktyki PAN. The Biodesign Institute (Arizona State University, USA); Faculté de Médecine (Université de la Méditerranée, Francja); Utrech Department of Infectious Diseases and Immunology (Holandia); Göttingen Genomics Laboratory (Getynga, Niemcy), Uniwersytet w Bielfield (Niemcy)

Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii UW Miecznikowa 1, 02-096 Warszawa (http://zgb.biol.uw.edu.pl/) Trzy grupy badawcze Zakładu Genetyki Bakterii : Ruchome elementy genetyczne bakterii Kontakt: prof. dr hab. D. Bartosik pok. 319aA; tel. 55 41 318, e-mail: bartosik@biol.uw.edu.pl Molekularne podstawy bakteryjnej patogenezy Kontakt: prof. dr hab. E.K. Jagusztyn- Krynicka pok. 216A; tel. 55 41 216, e-mail: kjkryn@biol.uw.edu.pl Biologiczne metody eliminacji bakterii patogennych Kontakt: prof. dr hab. K.I. Wolska pok. 302A; tel. 55 41 302, e-mail: izabelaw@biol.uw.edu.pl Planujemy przyjęcie 14 osób na licencjat (11 licencjatów eksperymentalnych, 3 teoretyczne)

Ruchome elementy genetyczne bakterii Skład grupy badawczej: prof. dr hab. D. Bartosik dr Jadwiga Baj, dr Łukasz Dziewit, dr Magdalena Szuplewska, mgr Marcin Adamczuk, mgr Jakub Czarnecki, mgr Robert Lasek, mgr Aleksandra Ziółkowska Finansowanie badań: 6 grantów NCN, NCBiR Problematyka badawcza: Identyfikacja oraz molekularna i funkcjonalna charakterystyka ruchomych elementów genetycznych bakterii, w tym: (a) plazmidów (b) elementów transpozycyjnych (IS, Tn, TMo, MITE) (c) kaset genowych integronów (d) bakteriofagów Genomika bakterii; badanie chromidów bakteryjnych; analiza globalnej regulacji ekspresji genów.

Ruchome elementy genetyczne bakterii Problematyka badawcza: Identyfikacja oraz molekularna i funkcjonalna charakterystyka ruchomych elementów genetycznych bakterii Analizy genomiczne plazmidów, transpozonów i bakteriofagów Analiza molekularna wybranych modułów genetycznych Badanie roli ruchomych elementów genetycznych w horyzontalnym transferze genów i w ewolucji genomów bakteryjnych Konstrukcja nowych narzędzi wykorzystywanych w inżynierii genetycznej, biotechnologii i bioremediacji Genomika bakterii Sekwencjonowanie DNA i ustalanie map fizycznych genomów (m.in. bakterii psychrofilnych) Identyfikacja i analiza chromidów Badanie globalnej regulacji ekspresji genów Analizy genetyczne wybranych genów i modułów genetycznych

Ruchome elementy genetyczne bakterii LICENCJAT (plany na 2015-2016) Prace eksperymentalne (6) i teoretyczne (2), będące małymi wyodrębnionymi zadaniami z zakresu naszych zainteresowań naukowych. Planowane jest przyjęcie 8 osób na licencjat, a w następnym roku prawdopodobnie 8 osób na studia magisterskie. Wybrane tematy prac licencjackich: K. BUDZIK Analiza miniaturowego plazmidu phw69v1 pochodzącego z arktycznego szczepu Variovorax sp.hw69 K. Kotecka Konstrukcja minireplikonów i charakterystyka systemów replikacyjnych wybranych plazmidów szczepów Paracoccus yeei A. CIOK Identyfikacja i charakterystyka integronów bakterii z rodzaju Pseudomonas pochodzących z kopalni miedzi Lubin Ł. KOWALSKI Identyfikacja metodami in silico i in vitro komponentów regulonu SOS Paracoccus aminophilus JCM 7686 O. WOLANIN Poszukiwanie ruchomych elementów genetycznych warunkujących horyzontalny transfer genów oporności na antybiotyki

Ruchome elementy genetyczne bakterii Wybrane publikacje z udziałem studentów z ostatnich lat: Czarnecki J., L. Dziewit, L. Kowalski, M. Ochnio, D. Bartosik. 2015. Maintenance and genetic load of plasmid pkon1 of Paracoccus kondratievae, containing a highly efficient toxin-antitoxin module of the hipab family. Plasmid doi: 10.1016/j.plasmid.2015.02.003. Dziewit L., J. Czarnecki, D. Wibberg, M. Radlinska, P. Mrozek, M. Szymczak, A. Schlüter, A. Pühler and D. Bartosik. 2014. Architecture and functions of a multipartite genome of the methylotrophic bacterium Paracoccus aminophilus JCM 7686, containing primary and secondary chromids. BMC Genomics 15:124. Maj, A., L. Dziewit, J. Czarnecki, M. Wlodarczyk, J. Baj, G. Skrzypczyk, D. Giersz, and D. Bartosik. 2013. Plasmids of carotenoid-producing Paracoccus spp. (Alphaproteobacteria) - structure, diversity and evolution. PLoS ONE 8, e80258. Dziewit, A. Pyzik, R. Matlakowska, J. Baj, M. Szuplewska and D. Bartosik. 2013. Characterization of Halomonas sp. ZM3 isolated from the Zelazny Most post-flotation waste reservoir, with a special focus on its mobile DNA. BMC Microbiology 13:59. Dziewit L., A. Cegielski, K. Romaniuk, W. Uhrynowski, A. Szych, P. Niesiobedzki, M. J. Zmuda- Baranowska, M. K. Zdanowski and D. Bartosik. 2013. Plasmid diversity in arctic strains of Psychrobacter spp. Extremophiles 17:433-444. Dziewit, L., J. Baj, M. Szuplewska, A. Maj, M. Tabin, A. Czyzkowska, G. Skrzypczyk, M. Adamczuk, T. Sitarek, P. Stawinski, A. Tudek, K. Wanasz, E. Wardal, E. Piechucka and D. Bartosik. 2012. Insights into the transposable mobilome of Paracoccus spp. (Alphaproteobacteria). PLoS ONE 7: e32277. Lasek, R., L. Dziewit and D. Bartosik. 2012. Plasmid pp62bp1 isolated from an Arctic Psychrobacter sp. strain carries two highly homologous type II restriction-modification systems and a putative organic sulfate metabolism operon. Extremophiles 16:363-376. Studenci byli współautorami licznych komunikatów na międzynarodowych i krajowych konferencjach naukowych.

Molekularne podstawy bakteryjnej patogenezy Skład grupy badawczej: prof. dr hab. K. Jagusztyn-Krynicka dr Renata Godlewska, dr Anna Łasica, dr Agnieszka Wyszyńska mgr Katarzyna Bocian, mgr Magdalena Grzeszczuk, mgr Jakub Jopek, mgr Patrycja Kobierecka Finansowanie badań: 2 granty NCN, grant FNP Problematyka badawcza: Molekularne mechanizmy patogenezy dwóch patogenów przewodu pokarmowego człowieka Campylobacter jejuni i Helicobacter pylori Molekularna i funkcjonalna charakterystyka genów kodujących czynniki wirulencji Analiza porównawcza genomów i proteomów patogenów poszukiwanie białek kandydatów do konstrukcji szczepionek oraz celów działania leków Konstrukcja rekombinowanej szczepionki dla kurcząt anty-campylobacter Potranskrypcyjna regulacja ekspresji genów (ncrna, rybo- i termoprzełączniki)

Molekularne podstawy bakteryjnej patogenezy Problematyka badawcza: Molekularna charakterystyka białek Dsb (ang. disulfide bond) Epsilonproteobacteria Analiza powiązań pomiędzy strukturą i funkcją białek Dsb Helicobacter pylori HP0231 na drodze mutagenezy specyficznej wobec miejsca. Oczyszczanie rekombinowanych białek. Testy fizjologiczne i biochemiczne. Analizy strukturalne. Identyfikacja substratów szlaku utleniania DSB mutageneza, analizy MS Analiza funkcji białka HP0377 potencjalnie bierze udział w szlaku dojrzewania cytochromu Oczyszczanie rekombinowanych białek forma dzika i zmutowane. Analiza funkcjonalna i biochemiczna białka Rozwiązanie struktury HP0377 Konstrukcja szczepionki dla kurcząt anty-campylobacter Identyfikacja epitopów białek, konstrukcja genów kodujących różne epitopy Rola cytokin w indukcji odpowiedzi odpornościowej. Różne drogi dostarczenia antygenu: awirulentna Salmonella, LAB, pęcherzyki OMV Funkcjonalna charakterystyka potencjalnych rybo- i termoprzełączników C. jejuni

Molekularne podstawy bakteryjnej patogenezy LICENCJAT (plany na 2015-2016) Prace eksperymentalne (3) i teoretyczne (1), będące małymi wyodrębnionymi zadaniami z zakresu naszych zainteresowań naukowych. Planowane jest przyjęcie 4 osób na licencjat, a w następnym roku 4 osób na studia magisterskie. Wybrane tematy prac licencjackich: A. BANAŚ Przygotowanie konstruktów do identyfikacji substratów szlaku utleniania Dsb Helicobacter pylori K. JASTRZĄB Analiza komplementacji mutacji w genie EcdsbA przez białko CLA0599 (DsbA) Campylobacter lari J. KLIM Badanie aktywności białek DsbA1 i DsbA2 Campylobacter jejuni w teście insulinowym M. KSIĄŻEK Zastosowanie genu sacb do wprowadzania nieoznakowanych mutacji do genomu Campylobacter jejuni A. WOJTANIA Fuzja translacyjna antygenu CjaA Campylobacter jejuni z C-końcem białka AcmA Lactococcus lactis zawierającym domeny LysM

Molekularne podstawy bakteryjnej patogenezy Wybrane publikacje z udziałem studentów z ostatnich lat : Dobosz A., K. M. Ostrzycka-Bocian, E. K. Jagusztyn-Krynicka. 2015. Różnorodność szlaków utleniania białek Dsb (disulfide bond) w świecie mikroorganizmów Post. Mikrobiol. 54:20-32. Kobierecka P. A., A. Wyszyńska, M. Maruszewska, A. Wojtania, J. Żylińska, J. Bardowski. E.K. Jagusztyn-Krynicka. 2014.. Lactic acid bacteria as a surface display platform for Campylobacter jejuni antigens J. Mol. Microbiol. Biotech. 25:1-10. Grabowska AD, E. Wywiał, S. Dunin-Horkawicz, A. M. Łasica, M. M. Wösten, A. Nagy-Staroń, R. Godlewska, K. Bocian-Ostrzycka, K. Pieńkowska, P. Łaniewski, J. M. Bujnicki, J. P. van Putten, E. K. Jagusztyn-Krynicka. 2014. Functional and structural analysis of Campylobacter jejuni homologues of the thiol-disulfide oxidoreductase DsbA. PLoS One 9:e106247. Roszczenko, P., K. A. Radomska, E. Wywial, J. F. Collet and E. K. Jagusztyn-Krynicka. 2012. A novel insight into the oxidoreductase activity of Helicobacter pylori HP0231 protein. PLoS One 7:e46563. Olszewska, J., E. K. Jagusztyn-Krynicka 2012 HMP (Human Microbiome Project) - mikroflora jelit oraz jej wpływ na fizjologię i zdrowie człowieka. Post. Mikrobiol. 51: 243-256 Grabowska, A. D., M. P. Wandel, A. M. Łasica, M. Nesteruk, P. Roszczenko, A. Wyszyńska, R. Godlewska, and E. K. Jagusztyn-Krynicka. 2011. Campylobacter jejuni dsb gene expression is regulated by iron in a Fur-dependent manner and by a translational coupling mechanism. BMC Microbiol. 11:166. Studenci byli współautorami kilkunastu komunikatów na międzynarodowych i krajowych konferencjach naukowych.

Biologiczne metody eliminacji bakterii patogennych Skład grupy badawczej: prof. dr hab. K. Izabela Wolska dr Anna Grudniak, mgr Katarzyna Markowska Problematyka badawcza: Metody eliminacji bakterii patogennych Badanie antybakteryjnego działania nanocząstek metali Wpływ białek szoku cieplnego na patogenność wybranych gatunków bakterii

Biologiczne metody eliminacji bakterii patogennych Problematyka badawcza: Metody eliminacji bakterii patogennych Badanie antybakteryjnego działania nanocząstek metali (a) hamowanie tworzenia biofilmów bakteryjnych przez nanocząstki srebra i złota (b) współdziałanie nanocząstek i klasycznych antybiotyków w eliminacji bakterii (c) wpływ nanocząstek srebra na osłony bakteryjne (d) zaburzenia przekazywania sygnału przez nanocząstki srebra Badanie wpływu białek opiekuńczych DnaK, DnaJ i HtpG na wybrane determinanty wirulencji bakterii patogennych: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Listeria monocytogenes

Biologiczne metody eliminacji bakterii patogennych LICENCJAT (plany na 2015-2016) Prace eksperymentalne (2), będące małymi wyodrębnionymi zadaniami z zakresu zainteresowań naukowych grupy badawczej. Planowane jest przyjęcie 2 osób na licencjat, a w następnym roku 2 osób na studia magisterskie. Wybrane tematy prac licencjackich: K. KAMIŃSKI Choroby wywołane przez bakterie patogenne rosnące w biofilmach B. MILCZAREK Działanie nanocząstek złota na biofilmy tworzone przez wybrane gatunki bakterii Z. RUDNICKA Współdziałanie nowych terapeutyków z konwencjonalnymi antybiotykami - efekt na bakterie planktoniczne i biofilmy J. WŁODKOWSKA Charakterystyka wybranych białek szoku cieplnego oraz ich wpływ na wrażliwość Escherichia coli na oksacylinę i streptomycynę A. KUCHARSKA Łączny efekt nanocząstek srebra i ampicyliny na biofilny bakteryjne

Biologiczne metody eliminacji bakterii patogennych Wybrane publikacje z udziałem studentów z ostatnich lat : Markowska K., A.M. Grudniak, K. Krawczyk, I. Wróbel, K. I. Wolska. 2014. Modulation of antibiotic resistance and induction of stress response in Pseudomonas aeruginosa by silver nanoparticles. J Med. Microbiol. 63: 849-854 Grudniak A.M., K. Pawlak, K. Bartosik, K. I. Wolska. 2013. Physiological consequences in the htpg heat shock gene of Escherichia coli. Mut Res 745-746:1-5 Kurek, A., P. Nadkowska, S. Pliszka, K. I. Wolska. 2012. Modulation of antibiotic resistance in bacterial pathogens by oleanolic acid and ursolic acid. Phytomedicine 19:515-519. Wolska K.I., K. Grześ, A. Kurek. 2012. Synergy between novel antimicrobials and conventional antibiotics and bacteriocins. Pol J Microbiol 61: 95-104. Grudniak, A. M., A. Kurek, J. Szarlak, and K. I. Wolska. 2011. Oleanolic and ursolic acids influence affect the expression of the cysteine regulon and the stress response in Escherichia coli. Curr Microbiol 62:1331-1336. Kurek, A., A. M. Grudniak, M. Szwed, A. Klicka, L. Samluk, K. I. Wolska, W. Janiszowska, and M. Popowska. 2010. Oleanolic acid and ursolic acid affect peptidoglycan metabolism in Listeria monocytogenes. Antonie Van Leeuwenhoek. 97:61-68. Wolska K.I., A.M. Grudniak, B. Fiecek,A. Kraczkiewicz-Dowjat, A. Kurek. 2010. Antibacterial activity of oleanolic and ursolic acids and their derivatives. Centr Eur J Biol 5: 543-553 Studenci byli współautorami kilkunastu komunikatów na międzynarodowych i krajowych konferencjach naukowych.

Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii UW Miecznikowa 1, 02-096 Warszawa (http://zgb.biol.uw.edu.pl/) Ruchome elementy genetyczne bakterii Kontakt: prof. dr hab. D. Bartosik pok. 319aA; tel. 55 41 318, e-mail: bartosik@biol.uw.edu,pl Molekularne podstawy bakteryjnej patogenezy Kontakt: prof. dr hab. E.K. Jagusztyn- Krynicka pok. 216A; tel. 55 41 216, e-mail: kjkryn@biol.uw.edu,pl Biologiczne metody eliminacji bakterii patogennych Kontakt: prof. dr hab. K.I. Wolska pok. 302A; tel. 55 41 302, e-mail: izabelaw@biol.uw.edu,pl Uwaga! Kandydaci zainteresowani wykonywaniem licencjatu w danej grupie badawczej powinni skontaktować się z koordynatorem grupy (nie prowadzimy scentralizowanych zapisów do Zakładu) W każdej grupie stworzona zostanie lista rankingowa studentów

Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii UW Miecznikowa 1, 02-096 Warszawa (http://zgb.biol.uw.edu.pl/) Niektóre nagrody i wyróżnienia uzyskane przez naszych licencjatów: Liczni licencjaci i magistranci uzyskali Nagrody JM Rektora UW, PTG, PTM i KM PAN za osiągnięcia naukowe, jako współautorzy publikacji powstałych w ZGB. Ponadto: Robert Lasek (2011) Artur Franczak (2011) Robert Lasek (2012) Olga Krysiak (2013) Anna Ciok (2014) laureat ogólnopolskiego konkursu na najlepszą pracę licencjacką/inżynierską wykonaną w roku akademickim 2010/2011 Złoty Medal Chemii 2011 organizowanego przez Instytut Chemii Fizycznej PAN nagroda Polskiego Towarzystwa Wspierania Osób z Nieswoistymi Zapaleniami Jelita za najlepszą pracę licencjacką beneficjent pierwszej edycji konkursu MNiSW Diamentowy Grant finalistka ogólnopolskiego konkursu na najlepszą pracę licencjacką/inżynierską wykonaną w roku akademickim 2012/2013 "Złoty Medal Chemii 2013 organizowanego przez Instytut Chemii Fizycznej PAN beneficjentka konkursu MNiSW Diamentowy Grant

Zakład Genetyki Bakterii Instytut Mikrobiologii Wydział Biologii UW Wybrane tematy prac magisterskich wykonanych w ZGB (więcej na: http://zgb.biol.uw.edu.pl/) K. DRABIK Funkcjonalna charakterystyka oksydoreduktazy Helicobacter pylori - białka HP0231 R. LASEK Analiza struktury genetycznej i funkcji chromosomu arktycznego szczepu Psychrobacter sp. DAB_AL43B A. MIKOŁAJCZUK Wstępna analiza funkcji produktu genu CLA0559 Campylobacter lari RM2100 M. MURANOWICZ Badanie oddziaływań między nanocząstkami złota a antybiotykami wobec wybranych gatunków bakterii J. OLSZEWSKA Analiza rozprzestrzenienia oraz funkcji białka Cj0092 Campylobacter jejuni K. PAWLAK Charakterystyka replikacji DNA i proteolizy w mutancie ΔhtpG Escherichia coli Ł. STYPIŃSKI Analiza systemu replikacyjnego plazmidu pigms31 archetypu nowej rodziny replikonów typu RCR M. SZYMCZAK Analiza funkcji pozachromosomowych replikonów bakterii Paracoccus aminophilus JCM 7686 I.M. WRÓBEL Efekt łącznego działania nanocząstek srebra i antybiotyków na komórki wolnożyjące oraz biofilmy wybranych gatunków bakterii patogennych