Poznań, r.

Podobne dokumenty
Lublin, r. dr hab. Magdalena Staszczak Zakład Biochemii Wydział Biologii i Biotechnologii Uniwersytet Marii Curie-Skłodowskiej Lublin

Poznań, r.

RECENZJA. Rozprawy doktorskiej mgr Mateusza Nowickiego. Ocena wybranych elementów niszy szpikowej u pacjentów poddawanych

Ocena merytoryczna pracy 2.1. Sformułowanie problemu naukowego i aktualność tematyki badań

Ocena rozprawy na stopień doktora nauk medycznych lekarz Małgorzaty Marii Skuzy

dr hab. Magdalena Arasimowicz-Jelonek, prof. nadzw. UAM Poznań,

Recenzja(rozprawy(doktorskiej(( Pana(mgr(inż.(Jacka(Mojskiego(

Do oceny przedstawiono oprawioną rozprawę doktorską zawierającą 133 strony

Ocena. rozprawy doktorskiej pani mgr Anety Spóz, zatytułowanej. Cypriniformes.

Ocena rozprawy doktorskiej. Mgr Pauliny Smyk pt.: Wpływ wybranych ksenobiotyków na zmiany parametrów

UCHWAŁA. Wniosek o wszczęcie przewodu doktorskiego

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Bartosza Rymkiewicza pt. Społeczna odpowiedzialność biznesu a dokonania przedsiębiorstwa

Polskie czasopisma leśne stan obecny i strategia rozwoju na przykładzie czasopism wydawanych przez Instytut Badawczy Leśnictwa

Rozprawy doktorskiej mgr Anny Marii Urbaniak-Brekke. pt.: Aktywność społeczności lokalnych w Polsce i Norwegii

Miejsce pracy Okres pracy Stanowisko

Prof. dr hab. Mieczysław Grzesik Instytut Ogrodnictwa Skierniewice

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Arkadiusza Płowca pod tytułem "Wpływ prebiotyków i symbiotyków podanych in ovo na zmianę ekspresji genomu kury"

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Piotra Biniarza pt. Optymalizacja produkcji, oczyszczanie i badanie właściwości biosurfaktantów

1. Podstawa prawna oraz kryteria przyjęte do oceny rozprawy doktorskiej

RECENZJA rozprawy doktorskiej mgr inż. Sebastiana Schaba pod tytułem Technologia wytwarzania granulowanych nawozów wieloskładnikowych typu NP i NPK

OCENA PRACY DOKTORSKIEJ

Ocena pracy doktorskiej mgr Magdaleny Banaś zatytułowanej: Ochronna rola chemeryny w fizjologii naskórka

OCENA ROZPRAWY DOKTORSKIEJ. pt Ocena jakości życia nosicielek mutacji genu BRCA1 po profilaktycznej operacji narządu rodnego

RECENZJA. rozprawy doktorskiej Jolanty GRZEBIELUCH nt. "Znaczenie strategii marketingowej w

steroidów, jest zaangażowana w te skomplikowane i nadal najmniej poznane procesy zachodzące na wczesnym etapie ciąży u świni.

- propozycję dyscypliny dodatkowej na egzamin doktorski; - propozycję osoby promotora i ewentualnie promotora pomocniczego.

Toruń, dnia r.

Ustawa z dnia 14 marca 2003 roku o stopniach naukowych i tytule naukowym oraz o stopniach i tytule w zakresie sztuki

Prof. dr hab. Zbigniew Adamiak Olsztyn, Katedra Chirurgii i Rentgenologii z Kliniką Wydział Medycyny Weterynaryjnej UWM Olsztyn RECENZJA

Zasady postępowania w sprawie nadawania stopnia doktora w Instytucie Chemii Organicznej PAN

Załącznik nr 1 Łódź, 21 grudnia 2016 r.

Doktorant składa wniosek o przyznanie stypendium doktoranckiego do kierownika studiów doktoranckich. RODZAJ OSIĄGNIĘĆ NAUKOWYCH

Lublin 30 lipca 2017r.

Wydział Chemii. Strona1

Zakład Chemii Bioorganicznej, Wydział Chemiczny Wrocław

dr hab. Tomasz Pawłowski, prof. ID PAN Kórnik,

Punktacja czasopism naukowych How scientific journals are pointed

Zestawienie dokumentów wymaganych do otwarcia przewodu doktorskiego na Wydziale Hodowli i Biologii Zwierząt UP w Poznaniu

Politechni <a Wrocławska

i Europejskiego Towarzystwa Kardiologicznego oraz zasad wykonywania zabiegu także od strony technicznej przydatne dla zrozumienia dalszej części

OBSZARY NAUK: PRZYRODNICZYCH, ROLNICZYCH, LEŚLNYCH I WETERYNARYJNYCH ORAZ MEDYCZNYCH, NAUK O ZDROWIU, NAUK O KULTURZE FIZYCZNEJ

UNIWERSYTET MEDYCZNY W BIAŁYMSTOKU ZAKŁAD BIOCHEMII LEKARSKIEJ

Prof. dr hab. inż. Józef Mosiej, Warszawa, Katedra Kształtowania Środowiska SGGW, Warszawa

Warszawa, r. Dr hab. n. med. Łukasz Szarpak Zakład Medycyny Ratunkowej I Wydział Lekarski Warszawski Uniwersytet Medyczny

Zasady programu małe granty finansowanego ze środków JM Rektora Uniwersytetu Śląskiego w Katowicach na Wydziale Biologii i Ochrony Środowiska

Poznań, r.

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Jarosława Błyszko

anionorodnika ponadtlenkowego, tlenku azotu czy też regulować poziom wolnego żelaza w komórce. Przykładowo, wzrost stężenia wolnego żelaza może

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Olgi Andrzejczak. pt. Badania osadu czynnego z zastosowaniem technik cyfrowej analizy obrazu mikroskopowego

2. Autor/autorzy, data wydania, tytuł, wydawca lub czasopismo, tom, strony.

Dr hab. n.med. prof. nadzw. Elżbieta Rębas Zakład Neurochemii Molekularnej Uniwersytetu Medycznego w Łodzi

Wydział Chemii. Prof. dr hab. Grzegorz Schroeder Poznań, dnia 17 grudnia 2016 r.

Tytuł rozprawy: Prof. dr hab. inż. Jerzy Michalski Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie Wydział Inżynierii Produkcji

REGULAMIN postępowania o nadanie tytułu profesora na Wydziale Budownictwa, Inżynierii Środowiska i Architektury Politechniki Rzeszowskiej

Regulamin postępowania w przewodach doktorskich w Wydziale Rehabilitacji Akademii Wychowania Fizycznego Józefa Piłsudskiego w Warszawie

Gdańsk, 10 czerwca 2016

2. Autor/autorzy, data wydania, tytuł, wydawca lub czasopismo, tom, strony. Mój wkład w powstanie tej pracy polegał na Mój udział procentowy szacuję

pasożytami a żywicielami byłaby główną siłą odpowiedzialną za ewolucję ornamentów płciowych, zgodnie z hipotezą Hamiltona i Zuk.

Recenzja opracowania M. Bryxa. pt: Rynek nieruchomości. System i funkcjonowanie.

TRYB PRZEPROWADZANIA CZYNNOŚCI W PRZEWODACH DOKTORSKICH w Instytucie Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk w Warszawie

TRYB PRZEPROWADZANIA POSTĘPOWANIA HABILITACYJNEGO W WOJSKOWYM INSTYTUCIE MEDYCZNYM

. Wykaz dorobku habilitacyjnego nauki społeczne OBSZAR NAUK SPOŁECZNYCH

WNIOSEK OSOBY FIZYCZNEJ

Wykaz dorobku habilitacyjnego nauki techniczne OBSZAR NAUK TECHNICZNYCH

R E C E N Z J A Rola wybranych elementów szlaku sygnałowego światła w regulacji kiełkowania nasion Arabidopsis thaliana I.

Recenzja mgr Anny Falkowskiej Wpływ jonów ołowiu na metabolizm glikogenu w mózgu szczurów poddanych ekspozycji pre- i neonatalnej Ocena formalna:

Uchwała nr 33/2010 Rady Wydziału Hodowli i Biologii Zwierząt

1) na Wydziale Humanistycznym studia doktoranckie w dyscyplinie: a) historia

KARTA KURSU (realizowanego w module specjalności) Biologia z ochroną i kształtowaniem środowiska

Charakterystyka izoenzymów aminotransferazy asparaginianowej z siewek pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.)

Krzysztof Jajuga Katedra Inwestycji Finansowych i Zarządzania Ryzykiem Uniwersytet Ekonomiczny we Wrocławiu NAUKI EKONOMICZNE - HABILITACJA

prof. dr hab. Zbigniew Czarnocki Warszawa, 3 lipca 2015 Uniwersytet Warszawski Wydział Chemii

TRYB PRZEPROWADZANIA CZYNNOŚCI W PRZEWODACH DOKTORSKICH w Instytucie Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk w Warszawie

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Wojciecha Rymaszewskiego pt. Analiza naturalnej zmienności w obrębie gatunku Arabidopsis thaliana

Ocena osiągnięć Dr. Adama Sieradzana w związku z ubieganiem się o nadanie stopnia naukowego doktora habilitowanego.

Wydział Studiów Edukacyjnych

Ocena. wykonanej pod kierunkiem prof. dr hab. med. Małgorzaty Polz-Docewicz

Kryteria oceny pracy doktoranta przez opiekuna naukowego

Recenzja mgr Anny ŚLIWIŃSKIEJ Ilościowa ocena obciążeń środowiskowych w procesie skojarzonego wytwarzania metanolu i energii elektrycznej

Dokumenty należy składać do Dyrektora Instytutu na 2 tygodnie przed planowanym posiedzeniem Rady Naukowej Instytutu.

Ocena Pracy Doktorskiej mgr Moniki Aleksandry Ziętarskiej

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr. inż. Michała Błasiaka pt. Wpływ egzogennej melatoniny i długości dnia na sekrecję i skład chemiczny mleka owiec

Uchwała nr 51/IX/2018 Rady Wydziału Lekarskiego Uniwersytetu Jagiellońskiego Collegium Medicum w Krakowie z dnia 20 września 2018 r.

RECENZJA ROZPRAWY DOKTORSKIEJ. lek. Hanny Czerniejewskiej Wolskiej

Uchwała nr 52/IX/2018 Rady Wydziału Lekarskiego Uniwersytetu Jagiellońskiego Collegium Medicum w Krakowie z dnia 20 września 2018 r.

Kiełkowanie przetrwalników bakterii Alicyclobacillus acidoterrestris pod wpływem różnych czynników jest procesem złożonym i mało poznanym.

1. Wybór tematu i jego uzasadnienie

Ocena pracy doktorskiej. mgr Beaty Jakusik. pt. Ocena żywienia dojelitowego według programu Fast Track u chorych

ustanowionego przez ministra właściwego do spraw nauki oraz opinię, o której mowa w art. 11 ust. 3 Ustawa 1, wykaz dorobku naukowego oraz inne

c) prace konstrukcyjne, technologiczne i projektowe charakteryzujące się nowatorskim, naukowym podejściem do problemu, zwieńczone uzyskaniem patentu

4. Tabele osiągnieć z załącznika nr 2 z 1 zostają w załączniku nr 2 przyporządkowane według następującej kolejności:

Recenzja pracy doktorskiej mgr Tomasza Świsłockiego pt. Wpływ oddziaływań dipolowych na własności spinorowego kondensatu rubidowego

5-15 pkt pkt pkt. Monografia: współautorstwo Należy podać autora/redaktora, wydawcę, numer ISBN, nakład, rok wydania, objętość. 70% pkt.

A. DOROBEK NAUKOWY POMOCNICZYCH PRACOWNIKÓW NAUKI OBJĘTY PRZEPISAMI ROZPORZĄDZEŃ MINISTRA NAUKI I SZKOLNICTWA WYŻSZEGO

RAPORT ROCZNY/KOŃCOWY 1)

Szczecin, r.

Warszawa, r.

Praca doktorska była realizowania pod kierunkiem dr hab. Ewy Adamiak prof. UWM

REGULAMIN postępowania w przewodach doktorskich prowadzonych na Wydziale Chemicznym Politechniki Rzeszowskiej

Wytyczne dla autorów publikacji w Zeszytach Naukowych Politechniki Poznańskiej seria Organizacja i Zarządzanie:

Transkrypt:

Dr hab. Iwona Morkunas, prof. nadzw. Katedra Fizjologii Roślin Wydział Ogrodnictwa i Architektury Krajobrazu Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu ul. Wołyńska 35 60-637 Poznań Poznań, 07.05.2017 r. RECENZJA rozprawy doktorskiej mgr Mateusza Labuddy pt. Ekspresja arginazy i enzymów proteolitycznych Arabidopsis thaliana w odpowiedzi na porażenie Heterodera schachtii wykonanej w Katedrze Biochemii Wydziału Rolnictwa i Biologii Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie pod kierunkiem dr hab. Jolanty Marii Dzik. Podstawę formalną wykonania recenzji stanowi pismo Dziekana Wydziału Rolnictwa i Biologii SGGW w Warszawie z dnia 9 marca 2017 r. (Rol 20/2017), powołujące się na uchwałę Rady Wydziału z dnia 9 marca 2017 r. Przedstawiona do oceny rozprawa doktorska stanowi cykl dwóch monotematycznych publikacji naukowych, które są oryginalnymi pracami, opublikowanymi w 2016 roku w zagranicznych czasopismach naukowych takich jak Plant Pathology oraz Plant Physiology and Biochemistry znajdujących się w bazie Journal Citation Reports (JCR). W skład cyklu wchodzą następujące publikacje: 1. Labudda M, Różańska E, Cieśla J, Sobczak M, Dzik JM (2016a) Arginase activity in Arabidopsis thaliana infected with Heterodera schachtii. Plant Pathology 65:1529 1538. doi:10.1111/ppa.12537, IF: 2.383 (2015); IF: 2.723 (5- letni); MNiSW: 35 (2016) 2. Labudda M, Różańska E, Szewińska J, Sobczak M, Dzik JM (2016b) Protease activity and phytocystatin expression in Arabidopsis thaliana upon Heterodera schachtii infection. Plant Physiology and Biochemistry 109:416 429. doi:10.1016/j.plaphy.2016.10.021, IF: 2.928 (2015); IF: 3.434 (5-letni); MNiSW: 35 (2016) Łączna wartość tych publikacji według kryteriów MNiSW (zgodnie z rokiem opublikowania) wynosi 70 punktów a wartość współczynnika IF według listy JCR wynosi 5,311. W wyżej wymienionych pracach Doktorant jest pierwszym autorem i Jego udział w powstaniu tych prac wynosi od 55% do 60%, co wskazuje na dominujący wkład w tworzeniu i realizacji badań. 1

Doktorant złożył oświadczenia i w każdym z nich przedstawił, że Jego wkład w powstaniu artykułów polegał na opracowaniu koncepcji badań i zaprojektowaniu doświadczeń, wykonaniu większości analiz laboratoryjnych, opracowaniu graficznym i statystycznym, interpretowaniu wyników, napisaniu artykułów oraz przygotowaniu manuskryptów do procedur wydawniczych. Współautorzy poszczególnych prac złożyli także oświadczenia, w których przedstawili swój wkład w ich powstanie. Rozprawa doktorska, której podstawą są wyżej wymienione artykuły naukowe została zatytułowana Ekspresja arginazy i enzymów proteolitycznych Arabidopsis thaliana w odpowiedzi na porażenie Heterodera schachtii, obejmuje streszczenie w języku polskim i angielskim oraz została uzupełniona komentarzem liczącym 11 stron w języku polskim, w którym Doktorant wyjaśnia problem badawczy opisany w publikacjach oraz podsumowuje najważniejsze wnioski płynące z wyżej wymienionych prac. Rozdział pierwszy wspomnianego komentarza, tj. Omówienie wyników na tle obecnego stanu wiedzy obejmuje następujące podrozdziały: Przegląd piśmiennictwa, Cel rozprawy, Wyniki, Podsumowanie. Ponadto załączono podsumowanie w języku angielskim (jest to rozdział drugi Summary i spis literatury, tj. rozdział trzeci Piśmiennictwo). Wobec powyższego wszystkie kryteria niezbędne do przedstawienia rozprawy doktorskiej zostały spełnione pod względem formalnym. Należy wspomnieć, że Doktorant w dorobku naukowym posiada także dwa inne artykuły posiadające współczynnik wpływu impact factor (IF), znajdujące się w bazie JCR, poza tymi które stanowią przedmiot rozprawy doktorskiej. Pierwszy jest to praca przeglądowa, w której Doktorant jest pierwszym autorem, opublikowana w Acta Societatis Botanicorum Poloniae (IF2015 1.213, MNiSW2016 25pkt,) i drugi oryginalna praca opublikowana w Journal of Pineal Research o wysokim wskaźniku cytowań (IF2016 9.314, MNiSW2016 40 pkt). Celem pracy było zbadanie wpływu nicienia mątwika burakowego (Heterodera schachtii) na ekspresję i aktywność arginazy oraz enzymów proteolitycznych w A. thaliana. Enzymy te pełnią istotną rolę w metabolizmie azotu, a także w odpowiedzi roślin wyższych na infekcję pasożytniczą. Postawione przez Doktoranta cele badawcze są ważne ze względu na poznanie mechanizmów obronnych roślin aktywowanych w odpowiedzi na infekcję powodowaną przez endopasożytniczego nicienia, w których istotne znaczenie mają wyżej wymienione enzymy. W reakcji katalizowanej przez arginazę poza mocznikiem powstaje ornityna, która służy jako prekursor do biosyntezy ważnych metabolitów glutaminianu, proliny i poliamin, które zaangażowane są w reakcje obronne rośliny-gospodarza w warunkach stresowych. Należy podkreślić, że poza dostarczaniem ornityny i agmatyny, L-arginina służy także jako substrat do syntezy tlenku azotu (NO), który odgrywa istotną rolę w reakcjach 2

obronnych roślin na infekcje powodowane przez czynniki biotyczne. Ponadto kolejnym celem pracy było zbadanie zmian aktywności peptydaz w A. thaliana infekowanej H. schachtii i wnioskowanie o interakcjach w badanym układzie roślina-nicień. Doświadczenia przeprowadzono na modelowym układzie doświadczalnym, gdzie korzenie roślin A. thaliana były inokulowane larwami inwazyjnymi stadium J2 mątwika burakowego H. schachtii, które po wniknięciu do korzeni żywiciela inicjują tworzenie się syncytium, hipertroficznej struktury, za pośrednictwem, której rozwijające się nicienie pobierają składniki odżywcze. Obiektem badań były zarówno korzenie jak i pędy A. thaliana, co pozwoliło na wnioskowanie o poinfekcyjnym systemicznym przesyłaniu sygnału z organu do organu, tj. z korzenia do liścia. W związku z tym, że materiał roślinny był pobierany do analiz w dniu inokulacji oraz po 3, 7 i 15 dniach od momentu inokulacji, Doktorant analizował zmiany ekspresji i aktywności tych enzymów w czasie po infekcji. Kontrolę w tych doświadczeniach stanowiły rośliny nieinokulowane zbierane w tych samych punktach czasowych. W mojej opinii badanie odpowiedzi rośliny w różnych punktach czasowych po inokulacji czynnikiem biotycznym jest niezwykle cenne, ponieważ reakcja rośliny jest często różna podczas fazy infekcji i w okresie pełnej inwazji czynnika biotycznego. Należy dodać, że w publikacjach naukowych stanowiących przedmiot rozprawy doktorskiej, zaplanowane przez Doktoranta eksperymenty i metodyka wykonanych badań jest prawidłowa. Doktorant realizował badania pod kierunkiem Pani dr hab. Jolanty Marii Dzik, która posiada doświadczenie i dorobek publikacyjny dotyczący oddziaływań roślina pasożytnicze nicienie rozpoznawalny na arenie międzynarodowej. W mojej opinii temat pracy doktorskiej mgr Mateusza Labuddy w pełni oddaje problematykę badawczą rozprawy. Poza tym cele badań postawione przez Doktoranta są interesujące i otrzymane wyniki badań nowatorskie. Ponadto wyniki prezentowanych przez Doktoranta badań są szczegółowo analizowane i szeroko dyskutowane na tle bieżącej literatury zagranicznej, stąd wartość przedstawionych badań w powyższym cyklu publikacji w mojej ocenie jest wysoka. W przedłożonych do oceny publikacjach zostały przedstawione fizjologiczno-biochemiczne i molekularne wyniki badań dotyczące odpowiedzi rzodkiewnika pospolitego (A. thaliana) na porażenie H. schachtii, jednego z najważniejszych nicieni z rolniczego punktu widzenia oraz rośliny modelowej wykorzystywanej ze względu na w pełni zsekwencjonowany genom. Wyniki prezentowane w pierwszym artykule w znacznej mierze dotyczą ekspresji i aktywności arginazy (Labudda i wsp. 2016a), natomiast w drugim aktywności enzymów proteolitycznych i ekspresji fitocystatyn 3

(inhibitorów endopeptydaz) u roślin porażonych nicieniem cystowym (Labudda i wsp. 2016b). Duża część wykonanych przez Doktoranta badań dotyczy pędów rośliny żywicielskiej A. thaliana, ponieważ skutki porażenia nicieniem cystowym w tej części rośliny są rozpoznane w mniejszym stopniu aniżeli w pierwotnym miejscu infekcji, tj. w korzeniach. W pierwszej publikacji (Labudda i wsp. 2016a), Doktorant szczegółowo przedstawia rezultaty wykonanych przez siebie analiz takich jak: aktywność arginazy (ARGAH) w pędach i korzeniach A. thaliana infekowanych H. schachtii, poziom ekspresji genów kodujących arginazę (ARGAH2) w pędach i korzeniach Arabidopsis po infekcji H. schachtii, aktywność dekarboksylazy argininowej (ADC) w korzeniach Arabidopsis infekowanych H. schachtii, aktywność i poziom ekspresji reduktazy glutationowej (GR) w pędach Arabidopsis i zawartość proliny w pędach Arabidopsis po infekcji H. schachtii. Z kolei w drugiej publikacji (Labudda i wsp. 2016b), Doktorant przedstawił wyniki zawartości białek rozpuszczalnych w korzeniach Arabidopsis po infekcji H. schachtii, aktywności proteaz, wpływu jonów wapnia (Ca 2+ ) na aktywność endopeptydazy cysteinowej, profil aktywności proteaz na zymogramie, poziom ekspresji mrna fitocystatyn w korzeniach, pędach i syncytiach, poinfekcyjną zawartość polifenolowych związków w pędach Arabidopsis, wpływ związków fenolowych na aktywność proteaz in vitro, stężenie białek karbonylowanych w pędach Arabidopsis infekowanych H. schachtii. W mojej opinii niezmiernie interesującymi wynikami tej dysertacji jest odnotowanie znaczącego obniżenia aktywności arginazy i enzymów proteolitycznych oraz ekspresji genu arginazy I w porażonych korzeniach we wszystkich badanych punktach czasowych po inokulacji. W dyskusji Doktorant uzasadnia, że obniżenie aktywności tych enzymów jest spowodowane obecnością efektorów wydzielanych przez H. schachtii, które blokują reakcje obronne rośliny-gospodarza. Z kolei wykazał także, że aktywność niskocząsteczkowych oraz zależnych od jonów wapnia endopeptydaz cysteinowych w infekowanych korzeniach była stymulowana. Ponadto analizując pędy roślin porażonych Doktorant wykazał, że ekspresja genu arginazy II była stymulowana we wczesnym czasie po inokulacji (3 i 7 dniu), zaś aktywność enzymatyczna była istotnie zwiększona jedynie w 3 dniu po infekcji. Kolejnym interesującym wynikiem było pokazanie, że aktywność proteolityczna (oznaczana z użyciem azokazeiny jako substratu) w pędach roślin porażonych była niższa w porównaniu z roślinami kontrolnymi, ale znacząco w późnym okresie po inokulacji. Ponadto bardzo wartościowym wynikiem jest pokazanie profilu proteaz na zymogramie i ujawnienie różnic w ilości izoenzymów w przypadku pędów i korzeni. 4

Następnie badając poziom ekspresji mrna roślinnych endogennych inhibitorów endopeptydaz cysteinowych (fitocystatyn) można było wnioskować o regulacji proteolizy w korzeniach i pędach A. thaliana po infekcji H. schachtii. W tych badaniach Doktorant wykazał, że ekspresja AtCYS1, AtCYS5 i AtCYS6 była stymulowana po porażeniu nicieniami. Jednak poziom ekspresji powyższych genów AtCYS był wzmagany w różnym stopniu w badanych organach roślin i w syncytiach oraz zależny od czasu po inokulacji. Powyższe zmiany uzasadniano jako niezbędne dla metabolizmu białek w roślinach porażonych nicieniami. Uważam, że są to bardzo cenne wyniki badań, pokazujące regulację aktywności proteolitycznej kompleksowo poprzez wykrycie zmian w różnych organach rośliny i różnym czasie po inokulacji. Niezależnie od powyższego pomimo, że Doktorant nie oznaczał bezpośrednio wskaźników stresu oksydacyjnego, w dysertacji pokazał także, że aktywność reduktazy glutationowej (GR), enzymu pełniącego istotną rolę w utrzymaniu statusu redoks w komórkach, poinfekcyjnie wzrastała w pędach Arabidopsis. Stwierdził także istotnie podwyższoną ekspresję mrna dla reduktazy glutationowej w 7 dniu po inokulacji w pędach roślin porażonych. Doktorant odnotował także znaczący wzrost w zawartości białek rozpuszczalnych, poziomie karbonylacji białek oraz ilości polifenoli w pędach roślin porażonych. Ważnym wynikiem tej pracy, poszerzającym poznanie mechanizmów systemicznej odpowiedzi rośliny na porażenie nicieniem było wykazanie, że kwasy fenolowe mogą uczestniczyć w regulacji aktywności endopeptydaz. W mojej opinii ważnym osiągnięciem tej pracy jest także pokazanie przez Doktoranta, że w następstwie infekcji H. schachtii wzrasta zawartość proliny w pędach (związku mogącego pełnić funkcję zmiatacza wolnych rodników i osmolitu), pomimo, że odnotował poinfekcyjnie niższą aktywność dekarboksylazy argininowej (ADC), enzymu dzielącego substrat (L-argininę) z arginazą i katalizującego reakcję do agmatyny, prekursora syntezy poliamin. Rozdział Wyniki w analizowanych publikacjach jest napisany precyzyjnie i jasno, co świadczy o umiejętności właściwej analizy wyników przez Doktoranta. Ponadto na szczególną uwagę zasługuje rozdział Dyskusja w przedstawionych do oceny publikacjach, należy podkreślić, że jest bardzo dobrze napisany, co świadczy o dobrej orientacji Doktoranta w problematyce badawczej, dobrej znajomości literatury i dojrzałości naukowej. Poza tym Konkluzje prezentowane w ocenianych artykułach jak i Podsumowanie w załączonym komentarzu są syntetyczne. Uwagi ogólne 5

Oceniając całokształt niniejszej rozprawy powinnam podkreślić, że cała rozprawa, tj. zarówno oceniane publikacje jak i komentarz uzupełniający w języku polskim, są napisane prawidłowo, przejrzyście i dobrze pod względem stylistycznym. Mam kilka pytań do Kandydata: 1. W publikowanych pracach nie podano dokładnej informacji o sposobie inokulacji korzeni, jest tylko informacja o przygotowaniu inokulum, a zatem proszę o wyjaśnienie 2. Uważam, że prowadząc badania na poziomie fizjologiczno-biochemicznym i molekularnym, warto byłoby w badaniach dotyczących inwazji czynnika biotycznego włączyć obserwacje mikroskopowe, zatem czy wykonywane były przez Doktoranta badania testowe z wykorzystaniem technik mikroskopowych? 3. Czy obserwowano symptomy chorobowe na roślinach A. thaliana po inokulacji H. schachtii? 4. Czym spowodowane jest obniżenie aktywności dekarboksylazy argininowej (ADC), pomimo wzrostu poliamin w infekowanych tkankach? 5. W związku z tym, że same nicienie wydzielają enzymy proteolityczne, można wnioskować, że aktywność tych enzymów odnotowana w tkankach roślinnych jest wypadkową aktywności rośliny-gospodarza i nicienia, zatem czy podejmowano próby doświadczalne określenia w jakim stopniu aktywność tych enzymów dotyczy rośliny gospodarza czy samego nicienia? Podsumowanie 1. Wysoko pod względem merytorycznym oceniam napisane przez mgr Mateusza Labuddę opublikowane oryginalne prace twórcze i załączony komentarz w języku polskim. Należy podkreślić, że Dyskusja wyników w ocenianych pracach jest bardzo dobrze napisana, Doktorant szczegółowo omówił uzyskane wyniki na tle dostępnych pozycji literaturowych 2. Stwierdzam, że mgr Mateusz Labudda w czasie realizacji celów pracy doktorskiej przeanalizował bogatą literaturę, co wskazuje na dobrą orientacje w problematyce badawczej 3. Uzyskane przez Doktoranta wyniki zasługują na zainteresowanie i uwagę badaczy zajmujących się tematyką dotyczącą odpowiedzi roślin na czynniki biotyczne, w tym na pasożytnicze nicienie 4. Otrzymane przez Doktoranta interesujące wyniki zostały opublikowane w prestiżowych, specjalistycznych czasopismach naukowych o stosunkowo wysokim współczynniku cytowalności, co wskazuje, że badania zostały docenione także przez Recenzentów Plant Pathology i Plant Physiology and Biochemistry 6

Uważam, że otrzymane przez mgr Mateusza Labuddę wyniki badań, stanowiące przedmiot rozprawy doktorskiej, z pewnością wniosą nowe informacje dla współczesnej biologii roślin w zakresie mechanizmów obronnych roślin aktywowanych w odpowiedzi na infekcję powodowaną przez endopasożytniczego nicienia H. schachtii, żerującego na korzeniach roślin. Dodatkowo w znaczący sposób przyczynią się do lepszego zrozumienia wzajemnych zależności między pasożytem a żywicielem. Pragnę równocześnie podkreślić, że zawarte w recenzji nieliczne komentarze i sugestie nie pomniejszają wartości merytorycznej pracy. Wnioski końcowe W mojej ocenie rozprawa mgr Mateusza Labuddy spełnia wszystkie wymagania ustawy o stopniach i tytułach naukowych. Na tej podstawie wnoszę do Rady Wydziału Rolnictwa i Biologii Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie o przyjęcie przedstawionej rozprawy doktorskiej i dopuszczenie mgr Mateusza Labuddę do dalszych etapów przewodu doktorskiego. Biorąc pod uwagę nakład pracy Doktoranta i włączenie szeregu metod badawczych do realizacji celów pracy oraz ze względu na nowatorstwo wyników badań wnioskuję o wyróżnienie pracy. Dr hab. Iwona Morkunas, prof. nadzw. 7