Poziomy transfer genów w ewolucji. Ruchome elementy genetyczne i wirusy w ewolucji genomów
|
|
- Stanisław Janowski
- 6 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Poziomy transfer genów w ewolucji Ruchome elementy genetyczne i wirusy w ewolucji genomów
2 Poziomy transfer genów (HGT) } Przepływ informacji z jednego genomu do innego } Międzygatunkowy pominięcie bariery rozrodczej } Wewnątrzgatunkowy } W obrębie komórki (np. między genomem organellum a jądra) 2
3 Ruchome elementy genetyczne } W obrębie genomu tego samego lub bliskich gatunków } transpozony i sekwencje insercyjne } plazmidy } mobilne introny } Elementy genetyczne wyspecjalizowane w kierunku mobilności } samolubne geny, pasożyty genomowe } Niekiedy o istotnej wartości adaptacyjnej dla gospodarza } przenoszenie korzystnych cech (np. oporność, infekcyjność) } dynamika genomu 3
4 Ruchome elementy genetyczne } Pomiędzy genomami różnych linii ewolucyjnych } poziomy transfer genów (HGT) } endosymbioza } Może dotyczyć dowolnych sekwencji, nie tylko wyspecjalizowanych elementów mobilnych 4
5 Ruchome elementy genetyczne } Infekcyjne wirusy } Posiadają wyspecjalizowane białka, które umożliwiają opuszczenie komórki i infekcję kolejnych 5
6 Ruchome elementy genetyczne } Granice kategorii są nieustalone } transpozony itp. mogą przenosić się między gatunkami } płynna granica między niektórymi typami wirusów i transpozonów } plazmidy i wirusy mogą mieć szeroką specyficzność gospodarza } wirusy po integracji do genomu mogą dziedziczyć się pionowo, jak inne geny (lizogenia, ERV) 6
7 Znaczenie ewolucyjne } Ewolucyjna dynamika genomu } rearanżacje } zmiany ekspresji innych genów } przenoszenie cech fenotypowych } Transfer informacji z innych lini ewolucyjnych } wspólne pule genetyczne 7
8 Oznaki międzygatunkowego HGT } Drzewo danego genu nie pasuje do drzewa filogenetycznego } Inna zawartość par GC } Inne wykorzystanie kodonów 8
9 Co jest potrzebne do HGT? } Pobranie DNA } Rekombinacja 9
10 Genomy bakterii są dynamiczne } Szczepy bakterii zaliczane do tego samego gatunku znacząco różnią się zawartością genów } Genom rdzeniowy (core genome) wspólny dla wszystkich szczepów } Pangenom zbiór wszystkich genów (nie występują jednocześnie) 10
11 Genom, pangenom 11
12 Genom i pangenom 12
13 Co to jest Escherichia coli? Dla 61 zsekwencjonowanych szczepów: } W sumie 4157 do 5315 genów w genomie szczepu } Genom rdzeniowy 933 geny } Reszta geny pomocnicze wybrane spośród ~ genów } Cały pangenom: ~ genów Zhaxybayeva & Doolittle (2011) Curr Biology 21(7): R242-R246 13
14 Poziomy przepływ genów - bakterie } U Bacteria i Archaea poziomy przepływ informacji genetycznej jest powszechny } plazmidy i ruchome elementy genetyczne } dowolne fragmenty DNA } Równowaga pomiędzy naturalnymi barierami (np. system restrykcji-modyfikacji) a systemami ułatwiającymi wymianę DNA 14
15 Mechanizmy HGT u bakterii } Transformacja } poprzez DNA } elektroporacja przez wyładowania atmosferyczne? } Koniugacja } z udziałem pili płciowych } Transdukcja } z udziałem fagów } GTA } Gene Transfer Agents wirusopodobne cząstki wytwarzane przez α-proteobakterie } Nanorurki 15
16 Mechanizmy u bakterii 16 Source: Sarah Schaack, Clément Gilbert, and Cédric Feschotte Promiscuous DNA: horizontal transfer of transposable elements and why it matters for eukaryotic evolution. Trends in Ecology & Evolution 25: p. 537.
17 Mechanizmy u bakterii 17 Source: Sarah Schaack, Clément Gilbert, and Cédric Feschotte Promiscuous DNA: horizontal transfer of transposable elements and why it matters for eukaryotic evolution. Trends in Ecology & Evolution 25: p. 537.
18 Nanorurki u bakterii Dubey & Ben-Yehuda (2011) Intercellular nanotubes mediate bacterial communication. Cell 144(4):
19 Nanorurki pomiędzy gatunkami Dubey & Ben-Yehuda (2011) Intercellular nanotubes mediate bacterial communication. Cell 144(4):
20 Transfer genów oporności 20
21 Nie tylko plazmidy wyspy genomowe 21 Juhas et al. FEMS Microbiol Rev March; 33(2):
22 Transfer genów w środowisku } Wiele przykładów intensywnie zachodzącego HGT w środowisku } Szczególnie wyraźne w środowisku morskim (ok 47% bakterii morskich może być biorcami, GTA jako jeden z głównych mechanizmów) 22
23 23
24 Znaczenie ewolucyjne HGT } W krótkiej skali czasowej ruchome elementy genetyczne mają duże znaczenie dla wielu procesów } oporność większość przypadków rozprzestrzeniania się oporności na antybiotyki w szpitalach } wirulencja i dostosowanie do gospodarza } repertuar zdolności metabolicznych } przystosowanie do warunków ekstremalnych } Thermotogales geny przystosowujące do ekstremalnych temperatur pochodzą od Archaea (~10%) i termofilnych Clostridia 24
25 Adaptacje dzięki HGT Salinibacter (Bacteria) geny umożliwiające przeżycie w warunkach wysokiego stężenia soli: } wyspa genomowa: transpozazy + geny transporterów jonów i aminokwasów } rodopsyny wykorzystanie światła do transportu protonów i jonów Uzyskane w HGT od Archaea i innych Bacteria Zhaxybayeva & Doolittle (2011) Curr Biology 21(7): R242- R246 25
26 Adaptacje dzięki HGT } Bacteroides plebeius bakteria w przewodzie pokarmowym człowieka } Niektóre szczepy zdolne do rozkładania polisacharydów pochodzących z krasnorostów } B. plebeius uzyskał geny umożliwiające rozkład tych polisacharydów w HGT od bakterii morskich } głównie szczepy izolowane od mieszkańców Japonii, brak w szczepach od mieszkańców USA Zhaxybayeva & Doolittle (2011) Curr Biology 21(7): R242- R246 26
27 Znaczenie ewolucyjne HGT } Długofalowe znaczenie w ewolucji genomów } Znaczna (do 20-25%) część genomu może pochodzić z odległych linii ewolucyjnych } U E. coli ~16 kb/milion lat 27
28 Udział HGT w ewolucji genomów bakterii Ochman et al. (2000) Lateral Gene Transfer and the nature of bacterial innovation. Nature 405:
29 Przykład HGT Gen reduktazy HMGCoA A. fulgidus nabyty od przedstawiciela Bacteria 29
30 Przepis na patogena Ochman et al. (2000) Lateral Gene Transfer and the nature of bacterial innovation. Nature 405:
31 Udział HGT w ewolucji genomów bakterii 31 Drzewo zbudowane za pomocą sekwencji białek rdzeniowych (pomarańczowe) Duża część genów MRCA utracona (szare) i zastąpiona przez pochodzące z HGT (zółte zielone) Nowe nabytki w danych liniach - niebieskie
32 HGT a LUCA } } Czy LUCA był wspólnotą prakomórek swobodnie wymieniających geny? Pojawienie się trzech linii drzewa życia indywidualizacja, redukcja HGT 32
33 A u Eukaryota? } W HGT do wielokomórkowych Eukaryota barierą jest odrębność linii płciowej } Dane bardziej fragmentaryczne (mniej znanych genomów) } Mimo to liczne znane przypadki } Endosymbioza i tranfer genów symbionta = HGT } Eukaryota powstały przez HGT } Ale nie tak powszechne jak u bakterii 33
34 HGT do genomów Eukaryota } Historycznie masowe z genomów organellarnych } Częste u Protista, zwłaszcza fagocytujących } Częste u roślin dla genomu mitochondrialnego } Częste od bakterii endosymbiotycznych/endopasożytniczych } Sporadyczne HGT Eukaryota Eukaryota 34
35 Czy mamy w genomie geny bakterii?? 35
36 Czy mamy w genomie geny bakterii? W oryginalnym artykule posługiwano się wyłącznie analizą BLAST, bez rekonstrukcji filogenetycznej. Analiza filogenetyczna sfalsyfikowała hipotezę. 36
37 Protista } Większość genomów zawiera geny pochodzenia bakteryjnego } 4% genomu orzęsków zamieszkujących żwacz u przeżuwaczy pochodzi od bakterii } Źródło fagotrofia } U Giardia, Trichomonas i Entamoeba >90 genów pochodzenia bakteryjnego } odpowiadają za przystosowanie do metabolizmu beztlenowego 37
38 Dictyostelium } 18 genów pochodzenia bakteryjnego } Związane z życiem w glebie, np. } siderofor (transport żelaza) } dipeptydazy (trawienie ścian bakteryjnych) } oporność na toksyny glebowe 38
39 HGT od bakterii endosymbiotycznych } Wollbachia i Drosophila } Kopie całego genomu Wollbachia w chromosomach owadów Hotopp et al. 2007, Science 317:
40 Guzak (Meloidogyne incognita) } Nicień pasożytujący na korzeniach roślin } W genomie 60 aktywnych transkrypcyjnie genów pochodzenia bakteryjnego } Opdowiadają za degradowanie i zmiękczanie ścian komórek roślinnych } Z pasożytniczych bakterii glebowych } Późniejsze duplikacje 40 Zhaxybayeva & Doolittle (2011) Curr Biology 21(7): R242- R246
41 Pomiędzy różnymi Eukaryota } Geny mitochondrialne u roślin } } } } liczne przypadki niedawnych transferów niekiedy na masową skalę dlaczego nie w genomach plastydowych? } kilka przypadków dlaczego nie w mitochondriach zwierząt? } opisany tylko 1 przypadek 41
42 Mitochondria roślin Flickr Gerard's World rps2 Oczekiwana Obserwowana 42
43 Mitochondria roślin 43 Bergthorsson, et al Widespread horizontal transfer of mitochondrial genes in flowering plants. Nature 424: p. 197.
44 Funkcjonalny HGT u zwierząt } Mszyce grochowe (Acyrthrosiphon pisum) } Morfy czerwone barwniki karotenoidowe } zwierzęta nie wytwarzają takich barwników Moran & Jarvik Lateral transfer of genes from fungi underlies carotenoid production in aphids. Science 328:
45 Barwniki mszyc grochowych } HGT genów odpowiadających za syntezę barwnika od grzybów } Morfa zielona mutacja utraty funkcji jednego z tych genów } Możliwe znaczenie selekcyjne } osy pasożytnicze preferują zielone mszyce Moran & Jarvik Lateral transfer of genes from fungi underlies carotenoid production in aphids. Science 328:
46 Wrotki } U wrotków Bdelloidea ~10% transkryptomu z genów pochodzących z HGT (bakterie, grzyby i glony) } } 80% z nich koduje enzymy, istotny wkład w metabolizm czy to właśnie równoważy brak procesow płciowych w tej grupie? 46 Boschetti et al. (2012) Biochemical Diversification through Foreign Gene Expression in Bdelloid Rotifers. PLoS Genet 8(11): e
47 Endosymbiozy i HGT } Powstanie komórki eukariotycznej w wyniku endosymbiozy } W dalszej ewolucji istotna rola HGT symbionta do jądra 47
48 Oddziaływania jądrowo-mitochondrialne jądro Transfer i adaptacja genów mitochondrium Ewolucja nowych funkcji Utrata genów na skutek redundancji } Proteom mitochondriów drożdży ~ białek } 8-9 kodowanych w mtdna } Ponad 150 genów w jądrze, których produkty są niezbędne do utrzymania i ekspresji mtdna 48
49 Jak mitochondria traciły swój genom Wolno żyjące bakterie genów Endopasożytnicze bakterie (Rickettsia) genów Pierwotne mitochondria (Reclinomonas) genów Mitochondria współczesne genów
50 Dlaczego mitochondria traciły geny? } Zapadka Müllera } W populacjach aseksualnych gromadzą się mutacje o niewielkiej szkodliwości } Może dojść do sytuacji, kiedy dryf będzie szybszy od doboru oczyszczającego i haplotyp o niższym dostosowaniu opanuje populację } Dojdzie do stopniowej akumulacji mutacji szkodliwych i degeneracji informacji genetycznej } Rekombinacja odtworzy oryginalny genotyp z obciążonych różnymi mutacjami
51 I jak się to odbywało } Ucieczka DNA do jądra } Przeniesienie genów do jądra za pośrednictwem RNA } Zastąpienie funkcji przez gen pochodzący z genomu gospodarza (redundancja) } Nowe funkcje gospodarza udomowienie symbionta } Zastąpienie funkcji przez gen pochodzący z innej linii } polimeraza RNA, polimeraza DNA pochodzenie fagowe
52 Skąd się bierze proteom mitochondriów? } } } Proteom mitochondrium to ok. 600 (drożdże)-1500 (ssaki) białek Geny kodowane w mtdna: 2-67, większość białek Geny kodowane w genomie jądrowym } } } } Pochodzenia eubakteryjnego (symbiont) Pochodzenia archaebakteryjnego (gospodarz) Pochodzenia wirusowego (fagowego) polimeraza RNA i DNA Nieustalonego pochodzenia
53 Ślady złożonego pochodzenia jądrowokodowanego proteomu mitochondriów } U drożdży część cytoplazmatycznych mrna podlega translacji w bezpośrednim sąsiedztwie mitochondriów } Są to głównie mrna kodujące białka mitochondrialne (choć nie wszystkie z nich) } Lokalizację wokółmitochondrialną wykazują głównie mrna genów kodujących białka mitochondrialne pochodzenia eubakteryjnego (symbionta)
54 Udomowienie symbionta - rodzina białek PPR } PentatricoPeptide Repeat } Powszechne u Eukaryota, brak u Prokaryota } Przeważnie organellarne } Zaangażowane w post-transkrypcyjne etapy ekspresji genu (splicing, stabilność, redagowanie, translacja) } Wiązanie RNA, zwykle brak aktywności enzymatycznej } Pokrewne rodziny: TPR i HAT 54
55 Białka PPR są bardzo liczne w genomach roślin 55
56 Po co ciągle utrzymywać genom mitochondrialny? } Zamrożenie przez niestandardowy kod genetyczny } Wyjaśnienie mechanistyczne } Wyjaśnienie regulacyjno-koordynacyjne } Wyjaśnienie regulacyjno-ewolucyjne
57 Wyjaśnienie mechanistyczne } Istnieją geny, które są kodowane w mtdna u wszystkich znanych organizmów } CYTB, COX1, rrna } I takie, które są kodowane w mtdna u ogromnej większości organizmów } ATP6,8,9; trna; ND1-6; COX2,3 } Kodowane białka lokalizują się w wewnętrznej błonie } Próby rekodowania genu w jądrze niekiedy skuteczne (ATP8, maturaza bi4), niekiedy nie (CYTB, ND4)
58 Wyjaśnienie mechanistyczne } W mtdna są kodowane te białka, których import do mitochondrium byłby niemożliwy, mało wydajny lub kosztowny } wykazane doświadczalnie dla CYTB } W mtdna kodowane są te białka, których obecność poza wewnętrzną błoną mitochondrium byłaby niebezpieczna dla komórki
59 Wyjaśnienie regulacyjno-koordynacyjne } W mtdna kodowane są te geny, których ekspresja powinna być bezpośrednio koordynowana w organellum } Np. regulacja transkrypcji w mtdna S. cerevisiae przez poziom ATP } Koordynacja syntezy białek i składania kompleksów w wewnętrznej błonie mitochondrium zapewnienie stechiometrii i organizacji kompleksów } fizyczny związek translacji z błoną wewnętrzną
60 Wyjaśnienie regulacyjno-ewolucyjne } Większość organizmów wyższych utrzymuje w mtdna podstawowy zestaw genów, kodujących białka wewnętrznej błony uczestniczące w oddychaniu } U jednokomórkowców skład mtdna jest bardziej zmienny, ale utrata z mtdna całych kompleksów (np. cv u Apicomplexa) zachodzi głównie u organizmów pasożytniczych } U wielokomórkowców wyewoluowały mechanizmy zapewniające dziedziczenie jednorodzicielskie } nie są homologiczne powstawały w ewolucji wiele razy
61 Wyjaśnienie regulacyjno-ewolucyjne } Utrzymywanie genów kodujących podstawowe białka kompleksów łańcucha oddechowego w wysoce zmiennym mtdna ułatwia adaptację do zmiennych wymagań energetycznych środowiska } Utrzymywanie sprzężenia tych wariantów poprzez dziedziczenie jednorodzicielskie umożliwia koewolucję i koordynację zmienności adaptacyjnej
62 Genetyczne pasożyty } Transpozony } Mobilne introny } wiele intronów typu I i II w genomach organellarnych i prokariotycznych } kodują białka } maturazy wspomagają wycinanie } endonukleazy i odwrotne transkryptazy mobilność } Wirusy } Czy tylko pasożyty? 62
63 Transpozony itp. w genomach 63
64 Innowacje ewolucyjne od transpozonów } Metylacja DNA i regulatorowe małe RNA jako obrona przed powielaniem się transpozonów } Rekombinacja między elementami powtórzonymi zwiększa dynamikę genomu } tasowanie eksonów indukowane przez transpozony LINE } Promotory transpozonów i endogennych retrowirusów mogą dawać nowe wzory ekspresji } np. odżywiać pseudogeny powstałe przez odwrotną transkrypcję 64
65 } } Geny przeciwciał? rekombinazy RAG1 i RAG2 mogą katalizować transpozycję czy pochodzą od transpozonów? 65
66 Endogenne wirusy } ERV } około 8% genomu człowieka to sekwencje pochodzenia retrowirusowego (HERV) } wszystkie niezdolne do replikacji } powstawały na różnych etapach ewolucji, w tym w niedawnej ewolucji naczelnych } czy przyczyniły się do przebiegu ewolucji? } HERV K były aktywne po oddzieleniu linii człowieka od linii szympansa, infekowały człowieka tys. lat temu 66
67 Zmartwychwstanie genu IRGM Immunity-related GTPase 67 Bekpen et al. Death and Resurrection of the Human IRGM Gene. PLoS Genet. 2009; 5(3): e
68 Innowacje ewolucyjne pochodzenia wirusowego } Łożysko ssaków } Jądro komórkowe? 68
69 ERV i łożysko } Endogenny retrowirus u ssaków } Ekspresja w układzie rozrodczym } powstają cząstki retrowirusowe } Gen env wyrażany w łożysku } glikoproteina błonowa } promuje fuzję komórek tworzenie syncytium (syncytiotrofoblast) } immunosupresja } Geny syncytyn pochodzą od env 69 Harris. Placental endogenous retrovirus (ERV): structural, functional, and evolutionary significance. (1998) BioEssays 20:
70 Syncytyny i env ERV 70 Black et al. Endogenous Retroviruses in Trophoblast Differentiation and Placental Development. (2010) American Journal of Reproductive Immunology 64:
71 Innowacje ewolucyjne pochodzenia wirusowego } Łożysko ssaków } Jądro komórkowe? 71
72 Eukariogeneza wirusowa } } 3 przodków w endosymbiozie } } } archeon cytoplazma wirus jądro bakteria mitochondria (i chloroplasty) W genomie są geny pochodzące od wszystkich 3 przodków, ale struktura jądra (otoczka) to pozostałość wirusa } } Poxviridae Mimiviridae expasy.org Wikimedia commons
73 Eukariogeneza wirusowa a płeć } Udomowiony wirus nie może wejść w cykl lityczny: } Fuzja komórek jako sposób rozprzestrzeniania się } } Współczesne wirusy (np. Poxviridae) mają w otoczce receptory dla adhezji Mechanizm rozdziału kopii potomnych analogiczny do mechanizmów partycji plazmidów
74 Eukariogeneza wirusowa a płeć } Fuzja dwóch komórek z niekompatybilnymi wirusami pochodzenie mejozy
Poziomy transfer genów w ewolucji. Ruchome elementy genetyczne i wirusy w ewolucji genomów
Poziomy transfer genów w ewolucji Ruchome elementy genetyczne i wirusy w ewolucji genomów Poziomy transfer genów (HGT, LGT) Przepływ informacji z jednego genomu do innego Międzygatunkowy pominięcie bariery
Bardziej szczegółowoPoczątki ewolucji. Historia komórek eukariotycznych i ich symbiontów
Początki ewolucji Historia komórek eukariotycznych i ich symbiontów Współczesny obraz eukariogenezy Symbioza gospodarza - Archeona i symbionta - α-proteobakterii Powstanie jądra - ochrona przed inwazyjnymi
Bardziej szczegółowoZmienność ewolucyjna. Ewolucja molekularna
Zmienność ewolucyjna Ewolucja molekularna Podobieństwo i homologia Homologia: podobieństwo wynikające ze wspólnego pochodzenia ewolucyjnego cecha odziedziczona od wspólnego przodka vs. homoplazja podobieństwo
Bardziej szczegółowoHistoria informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją).
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją). Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) 2 Cząsteczki organiczne mog y powstać w atmosferze pierwotnej
Bardziej szczegółowoZmienność ewolucyjna. Ewolucja molekularna
Zmienność ewolucyjna Ewolucja molekularna Mechanizmy ewolucji Generujące zmienność mutacje rearanżacje genomu horyzontalny transfer genów Działające na warianty wytworzone przez zmienność dobór naturalny
Bardziej szczegółowoZmienność ewolucyjna. Ewolucja molekularna
Zmienność ewolucyjna Ewolucja molekularna Mechanizmy ewolucji Generujące zmienność mutacje rearanżacje genomu horyzontalny transfer genów! Działające na warianty wytworzone przez zmienność dobór naturalny
Bardziej szczegółowoZmienność ewolucyjna. Ewolucja molekularna
Zmienność ewolucyjna Ewolucja molekularna Mechanizmy ewolucji Generujące zmienność mutacje rearanżacje genomu horyzontalny transfer genów Działające na warianty wytworzone przez zmienność dobór naturalny
Bardziej szczegółowowykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Budowa rybosomu Translacja
Bardziej szczegółowoObcy w naszych komórkach
Paweł Golik Instytut Genetyki i Biotechnologii Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski Obcy w naszych komórkach Krótka historia mitochondriów Drzewo ewolucyjne życia Eukarionty - ewolucyjna mozaika Komórka
Bardziej szczegółowoZawartość. Wstęp 1. Historia wirusologii. 2. Klasyfikacja wirusów
Zawartość 139585 Wstęp 1. Historia wirusologii 2. Klasyfikacja wirusów 3. Struktura cząstek wirusowych 3.1. Metody określania struktury cząstek wirusowych 3.2. Budowa cząstek wirusowych o strukturze helikalnej
Bardziej szczegółowoDr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
Bardziej szczegółowoProkaryota. Genetyka molekularna i genomika
Prokaryota Genetyka molekularna i genomika Literatura Allison, rozdziały 5.3, 10 Brown, rozdziały 8, 11.2, 11.3.1, 12.1, 13, Prokaryota nie są jedną grupą Carl Woese (1928-2012) Genomy bakterii i archeonów
Bardziej szczegółowoGeny i działania na nich
Metody bioinformatyki Geny i działania na nich prof. dr hab. Jan Mulawka Trzy królestwa w biologii Prokaryota organizmy, których komórki nie zawierają jądra, np. bakterie Eukaryota - organizmy, których
Bardziej szczegółowoPłeć i starzenie się. Pochodzenie i znaczenie ewolucyjne
Płeć i starzenie się Pochodzenie i znaczenie ewolucyjne Płeć Znaczenie dla ewolucji i problem pochodzenia!2 Płeć } czym jest płeć } kiedy i jak powstała } jaka jest rola płci w ewolucji!3 Czy bakterie
Bardziej szczegółowoMechanizmy zmienności ewolucyjnej. Podstawy ewolucji molekularnej.
Mechanizmy zmienności ewolucyjnej Podstawy ewolucji molekularnej. Mechanizmy ewolucji } Generujące zmienność } mutacje } rearanżacje genomu } horyzontalny transfer genów } Działające na warianty wytworzone
Bardziej szczegółowoPłeć, starzenie się, śmierć. Pochodzenie i znaczenie ewolucyjne
Płeć, starzenie się, śmierć Pochodzenie i znaczenie ewolucyjne Płeć } czym jest płeć } kiedy i jak powstała } jaka jest rola płci w ewolucji 2 Czy bakterie mają płeć? } Procesy zwane płciowymi u bakterii
Bardziej szczegółowoMożliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Transgeneza - genetycznie zmodyfikowane oraganizmy 2. Medycyna i ochrona zdrowia 3. Genomika poznawanie genomów Przełom XX i
Bardziej szczegółowoPłeć i starzenie się. Pochodzenie i znaczenie ewolucyjne
Płeć i starzenie się Pochodzenie i znaczenie ewolucyjne Płeć Znaczenie dla ewolucji i problem pochodzenia 2 Płeć } czym jest płeć } kiedy i jak powstała } jaka jest rola płci w ewolucji 3 Czy bakterie
Bardziej szczegółowoTATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
Bardziej szczegółowoWykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
Bardziej szczegółowoWARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS KOLOKWIA; 15% KOLOKWIA-MIN; 21% WEJŚCIÓWKI; 6% WEJŚCIÓWKI-MIN; 5% EGZAMIN; 27% EGZAMIN-MIN; 26% WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS kolokwium I 12% poprawa kolokwium
Bardziej szczegółowoTRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
Bardziej szczegółowoMożliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
Bardziej szczegółowowykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
Bardziej szczegółowoDNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro
DNA- kwas deoksyrybonukleinowy: DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro RNA- kwasy rybonukleinowe: RNA matrycowy (mrna) transkrybowany
Bardziej szczegółowoProkaryota. Genetyka molekularna i genomika
Prokaryota Genetyka molekularna i genomika Prokaryota nie są jedną grupą Carl Woese (1928-2012) Genomy bakterii i archeonów Od 0,5 (mykoplazmy) do ~ 5 Mb Wyjątkowo 9 Mb (Bradyrhizobium japonicum) 13 Mb
Bardziej szczegółowowykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
Bardziej szczegółowoPaweł Golik. Tom Numer 3 4 ( ) Strony
Tom 58 2009 Numer 3 4 (284 285) Strony 547 554 Paweł Golik Instytut Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski Pawińskiego 5A, 02-106 Warszawa Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
Bardziej szczegółowoEwolucjonizm NEODARWINIZM. Dr Jacek Francikowski Uniwersyteckie Towarzystwo Naukowe Uniwersytet Śląski w Katowicach
Ewolucjonizm NEODARWINIZM Dr Jacek Francikowski Uniwersyteckie Towarzystwo Naukowe Uniwersytet Śląski w Katowicach Główne paradygmaty biologii Wspólne początki życia Komórka jako podstawowo jednostka funkcjonalna
Bardziej szczegółowoWprowadzenie. DNA i białka. W uproszczeniu: program działania żywego organizmu zapisany jest w nici DNA i wykonuje się na maszynie białkowej.
Wprowadzenie DNA i białka W uproszczeniu: program działania żywego organizmu zapisany jest w nici DNA i wykonuje się na maszynie białkowej. Białka: łańcuchy złożone z aminokwasów (kilkadziesiąt kilkadziesiąt
Bardziej szczegółowoTematy- Biologia zakres rozszerzony, klasa 2TA,2TŻ-1, 2TŻ-2
Tematy- Biologia zakres rozszerzony, klasa 2TA,2TŻ-1, 2TŻ-2 Nr lekcji Temat Zakres treści 1 Zapoznanie z PSO, wymaganiami edukacyjnymi i podstawą programową PSO, wymagania edukacyjne i podstawa programowa
Bardziej szczegółowoProkaryota. Genetyka molekularna i genomika
Prokaryota Genetyka molekularna i genomika Prokaryota nie są jedną grupą Carl Woese 2 Genomy bakterii i archeonów } Od 0,5 (mykoplazmy) do ~ 5 Mb } Wyjątkowo 9 Mb (Bradyrhizobium japonicum) 13 Mb (Sorangium
Bardziej szczegółowoWYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach
WYKŁAD: Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Białka Retrowirusy Białka Klasyczny
Bardziej szczegółowopaździernika 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Bardziej szczegółowoAnalizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Bardziej szczegółowoEwolucja genów i genomów
Ewolucja genów i genomów The Revised Classification of Eukaryotes SAR Stramenopila Alveolata Rhizaria 2 Journal of Eukaryotic Microbiology Volume 59, Issue 5, pages 429-514, 28 SEP 2012 DOI: 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x
Bardziej szczegółowoNowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Bardziej szczegółowoBUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Bardziej szczegółowoSpis treści. Księgarnia PWN: Terry A. Brown - Genomy. Część 1 Jak bada się genomy 1 Rozdział 1 Genomy, transkryptomy i proteomy 3
Księgarnia PWN: Terry A. Brown - Genomy Przedmowa Przedmowa do drugiego wydania polskiego Wstęp Spis rozdziałów Skróty V VI VII XI XIX Część 1 Jak bada się genomy 1 Rozdział 1 Genomy, transkryptomy i proteomy
Bardziej szczegółowoAnalizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Bardziej szczegółowoJak działają geny. Podstawy biologii molekularnej genu
Jak działają geny Podstawy biologii molekularnej genu Uniwersalność życia Podstawowe mechanizmy są takie same u wszystkich znanych organizmów budowa DNA i RNA kod genetyczny repertuar aminokwasów budujących
Bardziej szczegółowo6. Z pięciowęglowego cukru prostego, zasady azotowej i reszty kwasu fosforowego, jest zbudowany A. nukleotyd. B. aminokwas. C. enzym. D. wielocukier.
ID Testu: F5679R8 Imię i nazwisko ucznia Klasa Data 1. Na indywidualne cechy danego osobnika ma (maja) wpływ A. wyłacznie czynniki środowiskowe. B. czynniki środowiskowe i materiał genetyczny. C. wyłacznie
Bardziej szczegółowoPodstawy biologii. Informacja genetyczna. Co to jest ewolucja.
Podstawy biologii Informacja genetyczna. Co to jest ewolucja. Materiał genetyczny Materiałem genetycznym są kwasy nukleinowe Materiałem genetycznym organizmów komórkowych jest kwas deoksyrybonukleinowy
Bardziej szczegółowoKsięgarnia PWN: B. Alberts, D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter Podstawy biologii komórki. Cz.
Księgarnia PWN: B. Alberts, D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter Podstawy biologii komórki. Cz. 1 ROZDZIAŁ 1. KOMÓRKI WPROWADZENIE 1 Jedność i różnorodność komórek 1
Bardziej szczegółowoDNA musi współdziałać z białkami!
DNA musi współdziałać z białkami! Specyficzność oddziaływań między DNA a białkami wiążącymi DNA zależy od: zmian konformacyjnych wzdłuż cząsteczki DNA zróżnicowania struktury DNA wynikającego z sekwencji
Bardziej szczegółowoBiologia molekularna wirusów. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Biologia molekularna wirusów Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Co to jest wirus? Cząsteczka złożona z kwasu nukleinowego (DNA
Bardziej szczegółowoBadanie doboru naturalnego na poziomie molekularnym
Badanie doboru naturalnego na poziomie molekularnym Podstawy ewolucji molekulanej Jak ewoluują sekwencje Zmiany genetyczne w ewolucji Mutacje tworzą nowe allele genów Inwersje zmieniają układ genów na
Bardziej szczegółowoInformacje dotyczące pracy kontrolnej
Informacje dotyczące pracy kontrolnej Słuchacze, którzy z przyczyn usprawiedliwionych nie przystąpili do pracy kontrolnej lub otrzymali z niej ocenę negatywną zobowiązani są do dnia 06 grudnia 2015 r.
Bardziej szczegółowoRozkład materiału z biologii dla klasy III AD. 7 godz / tyg rok szkolny 2016/17
Rozkład materiału z biologii dla klasy III AD zakres rozszerzony LO 7 godz / tyg rok szkolny 2016/17 Biologia na czasie 2 zakres rozszerzony nr dopuszczenia 564/2/2012 Biologia na czasie 3 zakres rozszerzony
Bardziej szczegółowoSCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA SPIS TREŚCI: I. Wprowadzenie. II. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. III. Karty pracy. 1. Karta
Bardziej szczegółowoEwolucja genów i genomów
Ewolucja genów i genomów Rozmiar genomu Eukaryota 1 pg DNA = 1Gzasad Alexandrium tamarense Około 140 chromosomów 200 pg DNA/komórkę Rośliny do 150 pg 2 Ciągła reorganizacja genomu Bloki genów zachowane
Bardziej szczegółowoEwolucja genomu organellowego na przykładzie chloroplastów. Hipotetyczne etapy transferu genów organellowych do jądra
1 Hipotezy tłumaczące pochodzenie organelli. A. Monofiletyczne A. Polifiletyczne Monofiletyczne pochodzenie organelli. Polifiletyczne pochodzenie organelli. Pierwotna endosymbioza pomiędzy jednym typem
Bardziej szczegółowoKonstrukcja wektora plazmidowego DNA do klonowania genów i/lub wektora plazmidowego do sekrecji w bakteriach mlekowych
Konstrukcja wektora plazmidowego DNA do klonowania genów i/lub wektora plazmidowego do sekrecji w bakteriach mlekowych Łukasz Tranda Promotor: doc. dr hab. Jacek Bardowski, IBB Promotor: dr hab. Edward
Bardziej szczegółowoPriony. co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski
Priony co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski Choroba Kreutzfeldta-Jakoba Pierwsze opisy pochodzą z lat 30. XX wieku Zakaźna choroba, często rodzinna
Bardziej szczegółowoZagadnienia na egzamin licencjacki, kierunek: Biologia Medyczna I st. Rok akad. 2018/2019
Zagadnienia na egzamin licencjacki, kierunek: Biologia Medyczna I st. Rok akad. 2018/2019 1. Katedra Ewolucji Molekularnej 1. Pojęcie genu i genomu u organizmów prokariotycznych i eukariotycznych 2. Znane
Bardziej szczegółowoTRANSLACJA II etap ekspresji genów
TRANSLACJA II etap ekspresji genów Tłumaczenie informacji genetycznej zawartej w mrna (po transkrypcji z DNA) na aminokwasy budujące konkretne białko. trna Operon (wg. Jacob i Monod) Zgrupowane w jednym
Bardziej szczegółowoTeoria ewolucji. Podstawowe pojęcia. Wspólne pochodzenie.
Teoria ewolucji Podstawowe pojęcia. Wspólne pochodzenie. Informacje Kontakt: Paweł Golik Instytut Genetyki i Biotechnologii, Pawińskiego 5A pgolik@igib.uw.edu.pl Informacje, materiały: http://www.igib.uw.edu.pl/
Bardziej szczegółowoEwolucja informacji genetycznej
1 Ewolucja informacji genetycznej Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) Cząsteczki organiczne mog y powstać w atmosferze pierwotnej Ziemi Oparin, Haldane Miller, 1953 Co by o najpierw?
Bardziej szczegółowoKonspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
Bardziej szczegółowoTeoria ewolucji. Podstawowe pojęcia. Wspólne pochodzenie.
Teoria ewolucji Podstawowe pojęcia. Wspólne pochodzenie. Ewolucja Znaczenie ogólne: zmiany zachodzące stopniowo w czasie W biologii ewolucja biologiczna W astronomii i kosmologii ewolucja gwiazd i wszechświata
Bardziej szczegółowoTECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA
DNA 28SRNA 18/16S RNA 5SRNA mrna Ilościowa analiza mrna aktywność genów w zależności od wybranych czynników: o rodzaju tkanki o rodzaju czynnika zewnętrznego o rodzaju upośledzenia szlaku metabolicznego
Bardziej szczegółowoFIZJOLOGIA ORGANELLI (jak działa komórka?)
Wstęp do biologii 3. FIZJOLOGIA ORGANELLI (jak działa komórka?) Jerzy Dzik Instytut Paleobiologii PAN Instytut Zoologii UW 2015 KOMÓRKA elementarnym osobnikiem wyodrębnienie błoną od środowiska przestrzenne
Bardziej szczegółowoTeoria ewolucji. Podstawy wspólne pochodzenie.
Teoria ewolucji. Podstawy wspólne pochodzenie. Ewolucja biologiczna } Znaczenie ogólne: } proces zmian informacji genetycznej (częstości i rodzaju alleli), } które to zmiany są przekazywane z pokolenia
Bardziej szczegółowoThe Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
Bardziej szczegółowoPowstanie i dzieje informacji genetycznej. Oraz (bardzo) krótka historia życia.
Powstanie i dzieje informacji genetycznej. Oraz (bardzo) krótka historia życia. Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) (A)biogeneza Ewolucja jest właściwością organizmów żywych Życie = ewolucja
Bardziej szczegółowoPowstanie i ewolucja informacji genetycznej
Powstanie i ewolucja informacji genetycznej Literatura Brown, r. 18 Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) (A)biogeneza Ewolucja jest właściwością organizmów żywych Życie = ewolucja Powstanie
Bardziej szczegółowoRUCHOME ELEMENTY GENETYCZNE. Streszczenie MOBILIZABLE GENETIC ELEMENTS. Summary
Nowiny Lekarskie 2001, 70, 8, 940 947 JAKUB KWINTKIEWICZ RUCHOME ELEMENTY GENETYCZNE Z Katedry Biologii i Ochrony Środowiska Akademii Medycznej im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu Kierownik Katedry:
Bardziej szczegółowoSKUTKI POWSTANIA JĄDRA (jak działa genom?)
Wstęp do biologii 4. SKUTKI POWSTANIA JĄDRA (jak działa genom?) Jerzy Dzik Instytut Paleobiologii PAN Instytut Zoologii UW 2015 KONSEKWENCJE eukariotyczności cytoszkielet zapewnił precyzyjny rozdział chromosomów
Bardziej szczegółowoTHE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
Bardziej szczegółowoInżynieria genetyczna- 6 ECTS. Inżynieria genetyczna. Podstawowe pojęcia Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS Część I Badanie ekspresji genów Podstawy klonowania i różnicowania transformantów Kolokwium (14pkt) Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka Kolokwium (26pkt) EGZAMIN
Bardziej szczegółowoPowstanie życia i dzieje informacji genetycznej. Oraz (bardzo) krótka historia życia.
Powstanie życia i dzieje informacji genetycznej Oraz (bardzo) krótka historia życia. Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) (A)biogeneza Ewolucja jest właściwością organizmów żywych Życie
Bardziej szczegółowoMitochondrialna Ewa;
Mitochondrialna Ewa; jej sprzymierzeńcy i wrogowie Lien Dybczyńska Zakład genetyki, Uniwersytet Warszawski 01.05.2004 Milion lat temu Ale co dalej??? I wtedy wkracza biologia molekularna Analiza różnic
Bardziej szczegółowoWPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Bardziej szczegółowoPowstanie i dzieje informacji genetycznej. Oraz (bardzo) krótka historia życia.
Powstanie i dzieje informacji genetycznej Oraz (bardzo) krótka historia życia. Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja)!2 (A)biogeneza } Ewolucja jest właściwością organizmów żywych!3! } Życie
Bardziej szczegółowoSCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Czy priony zawsze są szkodliwe? SPIS TREŚCI: Wprowadzenie. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. Karty pracy. 1.
Bardziej szczegółowoZagrożenia i ochrona przyrody
Wymagania podstawowe Uczeń: Wymagania ponadpodstawowe Uczeń: Zagrożenia i ochrona przyrody wskazuje zagrożenia atmosfery powstałe w wyniku działalności człowieka, omawia wpływ zanieczyszczeń atmosfery
Bardziej szczegółowoI BIOLOGIA JAKO NAUKA
I BIOLOGIA JAKO NAUKA Zadanie. Rozwiąż krzyżówkę, a następnie odczytaj i wyjaśnij hasło. 0. Bada skład chemiczny organizmów i zachodzące w nich reakcje.. Zajmuje się procesami dziedziczenia.. Przedmiotem
Bardziej szczegółowoRozkład materiału z biologii do klasy III.
Rozkład materiału z biologii do klasy III. L.p. Temat lekcji Treści programowe Uwagi 1. Nauka o funkcjonowaniu przyrody. 2. Genetyka nauka o dziedziczności i zmienności. -poziomy różnorodności biologicznej:
Bardziej szczegółowoSkładniki jądrowego genomu człowieka
Składniki jądrowego genomu człowieka Genom człowieka 3 000 Mpz (3x10 9, 100 cm) Geny i sekwencje związane z genami (900 Mpz, 30% g. jądrowego) DNA pozagenowy (2100 Mpz, 70%) DNA kodujący (90 Mpz ~ ok.
Bardziej szczegółowoCo to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
Bardziej szczegółowoPytania Egzamin magisterski
Pytania Egzamin magisterski Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii UG i GUMed 1. Krótko omów jakie informacje powinny być zawarte w typowych rozdziałach publikacji naukowej: Wstęp, Materiały i Metody,
Bardziej szczegółowoTranslacja i proteom komórki
Translacja i proteom komórki 1. Kod genetyczny 2. Budowa rybosomów 3. Inicjacja translacji 4. Elongacja translacji 5. Terminacja translacji 6. Potranslacyjne zmiany polipeptydów 7. Translacja a retikulum
Bardziej szczegółowoZasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny Zadanie 1 1 pkt. za prawidłowe podanie typów dla obydwu zwierząt oznaczonych literami A oraz B. A. ramienionogi, B. mięczaki A.
Bardziej szczegółowowykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Choroby genetyczne o złożonym
Bardziej szczegółowoAnalizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Bardziej szczegółowoSesja sponsorowana przez Polską Sieć Biologii Molekularnej SESJA 1 ORGANIZACJA MATERIAŁU GENETYCZNEGO WYKŁADY
Sesja sponsorowana przez Polską Sieć Biologii Molekularnej SESJA 1 ORGANIZACJA MATERIAŁU GENETYCZNEGO WYKŁADY 12 SESJA 1 WYKŁADY W01-01 ORGANIZACJA GENOMU BAKTERIOFAGA P1, IMPLIKACJE DLA PROCESU PROPAGACJI
Bardziej szczegółowoPodstawy genetyki molekularnej
Podstawy genetyki molekularnej Materiał genetyczny Materiałem genetycznym są kwasy nukleinowe Materiałem genetycznym organizmów komórkowych jest kwas deoksyrybonukleinowy (DNA) 5 DNA zbudowany jest z nukleotydów
Bardziej szczegółowoGENOM I POCHODZENIE CZŁOWIEKA. Geoff Barnard PhD MA (Theol) MIBiol
GENOM I POCHODZENIE CZŁOWIEKA Geoff Barnard PhD MA (Theol) MIBiol Do niedawna debaty dotyczące darwinizmu koncentrowały się wokół różnorodnych świadectw historycznych takich jak molekularne i strukturalne
Bardziej szczegółowoKomórka organizmy beztkankowe
Grupa a Komórka organizmy beztkankowe Poniższy test składa się z 12 zadań. Przy każdym poleceniu podano liczbę punktów możliwą do uzyskania za prawidłową odpowiedź. Za rozwiązanie całego testu możesz otrzymać
Bardziej szczegółowoPowstanie i ewolucja informacji genetycznej
Powstanie i ewolucja informacji genetycznej Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) (A)biogeneza Ewolucja jest właściwością organizmów żywych Życie = ewolucja Powstanie życia z materii nieożywionej
Bardziej szczegółowoStarzenie a ewolucja
Starzenie a ewolucja Starzenie Gromadzenie się uszkodzeń na poziomie komórek (senescencja) i organizmu w miarę upływu czasu Wzrost prawdopodobieństwa śmierci w miarę upływu czasu Czy bakterie są nieśmiertelne?
Bardziej szczegółowoTEORIA KOMÓRKI (dlaczego istnieją osobniki?)
Wstęp do biologii 2. TEORIA KOMÓRKI (dlaczego istnieją osobniki?) Jerzy Dzik Instytut Paleobiologii PAN Instytut Zoologii UW 2015 WSPÓLNE WŁAŚCIWOŚCI dzisiejszych organizmów procesy życiowe katalizowane
Bardziej szczegółowoPodstawy biologii. Informacja, struktura i metabolizm.
Podstawy biologii Informacja, struktura i metabolizm. Informacje Kontakt: Paweł Golik Instytut Genetyki i Biotechnologii, Pawińskiego 5A pgolik@igib.uw.edu.pl Informacje, materiały: http://www.igib.uw.edu.pl/
Bardziej szczegółowoPlan wykładów z genetyki ogólnej
Plan wykładów z genetyki ogólnej 01 Metody genetyki klasycznej 02 Metody analizy DNA 03 Metody analizy genomu 04 Genomy prokariontów 05 Genomy eukariontów 06 Zmienność genomów w populacjach 07 Genomy a
Bardziej szczegółowoTransport makrocząsteczek
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii, dzięki której organizm uzyskuje energię biosynteza białka i innych związków Transport
Bardziej szczegółowoEkologia molekularna. wykład 10
Ekologia molekularna wykład 10 Zasięg gatunku wykład 10/2 Środowisko Człowiek rozumny posiada bardzo szeroki zasięg występowania, nie dorównuje mu w tym względzie żaden inny ssak. Zamieszkuje on wszystkie
Bardziej szczegółowoEkspresja genu. Podstawowe mechanizmy i pojęcia
Ekspresja genu Podstawowe mechanizmy i pojęcia Ekspresja Ekspresja (wyrażanie) genu jest regulowana na wielu etapach Regulacja ekspresji jest podstawowym mechanizmem dla: adaptacji do zmiennych warunków
Bardziej szczegółowoWykład 1. Od atomów do komórek
Wykład 1. Od atomów do komórek Skład chemiczny komórek roślinnych Składniki mineralne (nieorganiczne) - popiół Substancje organiczne (sucha masa) - węglowodany - lipidy - kwasy nukleinowe - białka Woda
Bardziej szczegółowoProkariota i Eukariota
Prokariota i Eukariota W komórkach organizmów żywych ilość DNA jest zazwyczaj stała i charakterystyczna dla danego gatunku. ILOŚĆ DNA PRZYPADAJĄCA NA APARAT GENETYCZNY WZRASTA WRAZ Z BARDZIEJ FILOGENETYCZNIE
Bardziej szczegółowo